LAPORAN PRAKTIKUM MATA KULIAH

BIOTEKNOLOGI PETERNAKAN

“Desain Primer Sus Scrofa (Gen Myostatin (MSTN))”

Disusun Oleh :
Suhada Fajar Abdillah 191510102030

Dosen Pendamping :
Himmatul Khasanah, S.Pt., M.Si

PROGRAM STUDI PETERNAKAN

FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS JEMBER
KEMENTRIAN PENDIDIKAN DAN KEBUDAYAAN
SEPTEMBER , 2021
GEN MYOSTATIN (MSTN) SUS SCROFA
 Langkah-langkah dalam menentukan desinn primer dari gen MSTN (Myostatin)
pada sus scorfa adalah sebagai berikut:
1. Buka aplikasi pencarian seperti chrome, kemudian ketik NCBI pada kolom
pencarian dan klik enter

2. Ketika pada sampai beranda NCBI ubah all databases menjadi gene, kemudian
ketikkan MSTN Sus Scrofa

3. Klik gene yang bernama MSTN, kemudian pilih FASTA

4. Kemudian copy semua sequence yang telah muncul

5. Buka software NCBI kemudian pilih “BLAST”

6. Pilih Opsi “PRIMER BLAST”
7. Kemudian paste sequence yang telah dicopy pada kolom yang telah disediakan
& isi forwad primer – reverse primer dengan 117-217

8. Pada kolom ORGANISM tuliskan Sus scrofa (taxid:9823)

9. Kemudian pada PRIMER PAIR 1 copy “forward primer”

10. Kemudian pada PRIMER PAIR 1 copy “reverse primer”

11. Buka link dibawah ini :
https://www.bioinformatics.org/sms2/pcr_primer_stats.html

Kemudian submit gen pada tanda “>” dengan menuliskan MSTN antara F & R,
kemudian paste sequence yang telah di copy dan klik submit

12. Kemudian akan muncul primer stats result yang diinginkan

 Hasil yang diperoleh dari praktikum design primer yang dapat diaplikasikan
pada DNA dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) adalah
MSTN-F dan MSTN R sama-sama diperoleh basic TM 54C sehingga belum dikatakan
stabil, dikarenakan batas normalnya berkisar 55-60C. GC content yang diperoleh dari
MSTN-F & MSTN-R 41.67 % & 55 %, pada MSTN R dapat dikatakan stabil
dikarenakan dibawah 5 c dari TM.