Laporan kasus sangat berguna dalam mempelajari kemanjuran dan toksisitas banyak obat dan

dapat mewakili petunjuk pertama dalam identifikasi penyakit baru, intervensi baru atau efek
samping yang sebelumnya tidak diketahui. Laporan kasus dapat bersifat retrospektif (sangat
sulit diperoleh karena sebagian besar praktisi jamu tidak mencatat) atau prospektif (mungkin
lebih mudah dicapai dengan berkoordinasi dengan sejumlah praktisi jamu tertentu). Uji klinis
acak (dengan yang double-blind menjadi standar emas) adalah ukuran akhir kemanjuran dalam
pengobatan konvensional, tetapi hampir tidak dapat digunakan dalam kasus obat herbal.

Data retrospektif mungkin sulit untuk dikompilasi, tetapi pengumpulan data prospektif akan
mudah diterapkan dengan memanfaatkan praktisi jamu. Data yang dianalisis secara ilmiah dari
rangkaian kasus dapat memberikan validitas ilmiah dan etika yang memadai. Namun, mungkin
diperlukan perubahan paradigma dalam pemahaman evaluasi obat seperti yang digarisbawahi
oleh WHO dengan mempertimbangkan klaim etnobotani, informasi anekdot, studi laboratorium
dan studi observasional.

Ada banyak variabel dalam memproduksi obat herbal dengan menggunakan bahan tanaman
tunggal atau ganda. Variabel-variabel tersebut meliputi identitas tumbuhan, bagian-bagiannya,
asal usul, substitusi, prosedur ekstraksi, dan kondisi iklim tumbuh tumbuhan. Studi produk
herbal tidak dapat dianggap valid secara ilmiah jika produk tersebut belum disahkan dan
dikarakterisasi untuk memastikan reproduktifitas.

Uni Eropa mengkategorikan senyawa-senyawa tersebut sebagai senyawa yang memiliki khasiat
yang terbukti, yang cenderung memiliki aktivitas dan yang tidak aktif. Standarisasi obat herbal
dapat dilakukan dengan mengikuti keberadaan senyawa aktif atau senyawa apa pun yang ada
dalam jumlah yang mudah diidentifikasi, tetapi mungkin memiliki aktivitas biologis atau tidak.
Senyawa ini dikenal sebagai senyawa penanda. Variasi senyawa penanda sering ditemukan
dalam penelitian kuantitatif. Mengingat meningkatnya penggunaan obat herbal, ada kebutuhan
mendesak dan persyaratan ilmiah untuk melakukan penelitian mendalam tentang fitomedika.

Ekstrak yang diperoleh dengan metode apapun akan menjadi campuran kompleks dari banyak
senyawa. Campuran kompleks ekstrak dari produk herbal mungkin mengandung senyawa
organik seperti asam lemak, sterol, alkaloid, flavonoid, saponin, glikosida, tanin, lignan, terpen,
peptida dan karbohidrat, dan menentukan komponen bioaktif sangat sulit. Berbagai metode
kromatografi digunakan untuk memisahkan senyawa individu, diikuti dengan penyaringan
biologis. TLC, HPLC dan NMR sering digunakan untuk merekam sidik jari konstituen kimia.
NMR, LC-MS-MS biasanya cukup untuk mengidentifikasi dan mengkarakterisasi senyawa yang
diisolasi.

Selain itu, percobaan farmakologis dengan senyawa terisolasi tunggal versus ekstrak asli atau
fraksi ekstrak telah mengkonfirmasi bahwa senyawa fenolik dan terpenoid dapat memberikan
efek farmakologis polivalen. Ini mungkin menjelaskan efek sinergis dan aktivitas ekstrak yang
lebih baik daripada senyawa tunggal yang diisolasi. Konsep bahwa ekstrak tanaman yang
dimurnikan secara keseluruhan atau sebagian menawarkan keunggulan dibandingkan bahan
tunggal yang diisolasi mendasari filosofi pengobatan herbal.
Baru-baru ini, teknik resolusi tinggi lainnya mulai digunakan di beberapa laboratorium canggih
untuk memvalidasi identitas senyawa individu. AAS biasanya digunakan untuk menentukan
unsur logam. Penggunaan metode berdasarkan plasma digabungkan secara induktif telah
membuat identifikasi senyawa logam lebih mudah. Kendalanya adalah di sebagian besar negara
berkembang, biaya analisis dan standardisasi masih terlalu tinggi. Instrumen, infrastruktur,
keahlian dan sumber daya manusia menjadi kendala dalam teknologi standarisasi.

Pengetahuan pengobatan herbal tersebar di masyarakat, keluarga, suku dan praktisi lokal.
Dengan pengaruh modernisasi dan globalisasi, banyak dari pengetahuan ini dapat dengan cepat
hilang kecuali didokumentasikan lebih awal dan dapat diakses oleh semua orang. Sistem
pengobatan herbal yang mapan, seperti Ayurveda, Unani dan TCM memiliki buku dan
farmakope yang terdokumentasi dengan baik. Namun, situasi di tempat lain tidak
didokumentasikan dengan cara yang sama. Selain itu, obat yang diberikan oleh praktisi medis
pribumi seringkali tidak mengikuti protokol yang tersedia.

Masalah utama pengembangan obat herbal yang dapat diterima oleh komunitas dan masyarakat
ilmiah modern adalah kerahasiaan pengetahuan medis tradisional yang dipegang oleh individu,
keluarga, suku, dan komunitas. Mereka takut bahwa pengetahuan mereka akan dicuri dan
digunakan untuk keuntungan finansial. Mereka mungkin diyakinkan dengan menunjukkan
bahwa bahan tanaman mereka dapat ditingkatkan dengan bioteknologi. Kebetulan, sebagian
besar sumber daya hayati yang tidak dievaluasi berada di negara-negara berkembang dan
pengetahuan tradisional mereka dengan cepat hilang karena eksploitasi berlebihan dan perubahan
gaya hidup.