BIOKIMIA METABOLISME

Minda Azhar

Metabolisme dan siklus energi

Metabolisme karbohidrat
Fotosintesis
Metabolisme lipid
Metabolisme asam amino
Metabolisme nukleotida
Metabolisme terintegrasi
Penyakit genetik karbohidrat, asam amino, protein dan lipid

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 1

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 2
Tiga tahap utama
metabolisme

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 3

Tahap utama respirasi sel

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 4

 Tahap utama respirasi sel

• Glukosa (dibahas pada topik ini) ?

• Asam lemak ?
• Asam amino ?

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 5

 Glukosa, sangat penting

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 6

 Jalur utama pemanfaatan glukosa

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 7

 Kenalkah anda persamaan reaksi ini ?
Energi yang dilepaskan 2840 kJ/mol

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 8

 Tahap utama oksidasi glukosa
Tahap 1.
Glukosa diubah ke asetil-CoA

Tahap 2.
Asetil-CoA memasuki siklus Krebs

Tahap 3.
Transfer elektron dan fosforilasi oksidatif
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 9
 Oksidasi glukosa
• Jalur glikolisis
Persamaan reaksi total

• Piruvat dikonversi menjadi asetil-CoA

• Asetil-CoA memasuki siklus Krebs

Persamaan reaksi total

• Transfer elektron ke molekul oksigen membentuk H2O,

menghasilkan
Metabolisme karbohidrat
ATP Minda Azhar 10
 Tiga kemungkinan jalur piruvat

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 11

 Tiga jalur
penting setelah
glikolisis

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 12

 Jika tidak ada oksigen
(anaerob)

• Piruvat dikonversi ke laktat

• Piruvat dikonversi ke etanol

Persamaan reaksi total

Fermentasi laktat

Fermentasi alkohol

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 13

 Siklus Cori

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 14

 Jalur glikolisis
(Jalur Embden-Meyerhof)

Glikolisis merupakan lintas pusat katabolisme

glukosa pada hampir semua organisme baik
dalam hewan, tumbuhan maupun di dalam
banyak mikroorganisme.

Glikolisis merupakan lintas/jalur katabolik

yang paling primitif

Jalur glikolisis yang lengkap diselesaikan

sekitar tahun 1930-an.

Sebagian besar jalur glikolisis adalah

kontribusi dari penelitian yang dilakukan oleh
Gustav Embden, Otto Meyerhof,
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 15
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 16
 Jalur glikolisis dan
jalur glukoneogenesis

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 17

 Regulasi
jalur glikolisis dan
jalur glukoneogenesis

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 18

 Metabolisme fruktosa

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 19

 Metabolisme galaktosa

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 20

 Metabolisme manosa

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 21

Konversi piruvat menjadi asetil-CoA

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 22

Konversi piruvat menjadi asetil-CoA

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 23

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 24
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 25
Siklus TCA

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 26

 Regulasi
siklus TCA

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 27

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 28
 Fosforilasi Oksidatif
• Disebut juga: rantai pernafasan

• Puncak metabolisme yang menghasilkan energi pada

organisme aerob

• Proses pembentukan ATP dari ADP dan Pi sebagai akibat

aliran elektron melalui rangkaian reaksi transport
elektron dari NADH/FADH2 ke molekul O2

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 29

 Fosforilasi oksidatif
• Reaksi redoks (reduksi-oksidasi)
• Terjadi di membran-dalam mitokhondria
• Terjadi aliran elektron: dari NADH/FADH2 ke O2
• Akibatnya proton dipompa ke luar matrix mitokondria
• Akibat selanjutnya ada gradien pH dan potensial listrik
transmembran
• ATP dibentuk dari aliran proton balik

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 30

 Seberapa besar
mitokondria ?

Ndak jauh bedalah

dengan ukuran E.coli

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 31

 Mitokondria adalah pabrik energi

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 32

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 33
 Rantai transpor elektron

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 34

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 35
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 36
 Kompleks I
4 proton dipompa ke luar

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 37

 Kompleks II
Tidak ada proton dipompa

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 38

 Kompleks III
4 proton dipompa ke luar

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 39

 Siklus Q pada kompleks III

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 40

 Kompleks IV
2 proton dipompa ke luar

½O2 = 2 proton dipompa

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 41

 NADH + 11H+(N) + ½O2 → NAD+ + 10H+(P) + H2O

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 42

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 43
 ATP sintase

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 44

Subunit F1

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 45

 Model sintesis ATP

O (open, konformasi buka)

L (loose, konformasi longgar)
T (tight, konformasi ketat)

Perubahan ketiga konformasi ini sebagai

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 46
akibat perputaran subunit γ pada kepala
 Rasio P/O atau rasio P/2e-

• Berapa elektron mengalir pada Complex I, II, III dan IV

kalau donor elektron NADH ?
• Berapa elektron mengalir pada complex II, III dan IV
kalau donor elektron FADH2 ?
• Berapa proton dipompa kalau donor elektron NADH ?
• Berapa proton dipompa kalau donor elektron FADH2 ?
• Berapa proton yang masuk ke matrix melalui ATP
syhthase untuk sintesa 1 molekul ATP ?

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 47

 Rasio P/O atau rasio P/2e-
(perbandingan ATP terhadap ½O2)

• 1 NADH → 10 proton dipompa = 10/4 ATP

(rasio P/O = 2,5)
• 1 FADH2 → 6 proton dipompa = 6/4 ATP
(rasio P/O = 1,5)

Jadi 1 mol NADH = 2,5 mol ATP

1 mol FADH2 = 1,5 mol ATP

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 48

 NADH dihasilkan dimanakah?

• Siklus Krebs., terjadi dimana ?

• Jalur Glikolisis, terjadi dimana?

Bagaimana NADH pada sitosol mencapai membran

dalam mitokondria ?

“sistem penghantaran NADH”

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 49

 Sistem pengantaran NADH
di hati, ginjal, dan jantung

Sistem malat-aspartat

1 mol NADH (sitosol) =

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 50
2,5 mol ATP
Sistem pengantaran NADH
di otot rangka dan otak

Sistem gliserol-3-fosfat

1 mol NADH (sitosol) =

1,5 mol ATP

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 51

 Contoh perhitungan ATP

1 mol glukosa jika dibakar sempurna akan menghasilkan 30 atau 32 mol ATP
tergantung organ yang melakukan glikolisis

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 52

 Inhibisi dan uncoupling

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 53

 Pengendalian jalur produksi ATP

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 54

 Metabolisme Glikogen

Apa kaitan jalur glikolisis dan

jalur pentosa phosphate?

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 55

 Apa beda amilopektin dengan glikogen?

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 56

 Glikogenolisis (Degradasi glikogen)

Langkah-langkah degradasi glikogen sebagai berikut:

1. Enzim glycogen phosphorylase mengkatalisis degradasi glikogen pada
ujung pereduksi polimer glikogen menghasilkan Glucose 1-phosphate
(Gambar 2.41).
2. Enzim α(1→6) glycosidase yang dinamakan juga debranching enzyme
menghidrolisis ikatan α(1→6) glycosidic pada titik cabang
menghasilkan satu molekul glukosa (Gambar 2.42).
3. Glucose 1-phosphate dikonversi ke glucose 6-phosphate oleh
phosphoglucomutase (Gambar 2.43). Glucose 6-phosphate dapat
memasuki jalur glikolisis. Sebagai alternatif, pada hati dan ginjal glucose
1-phosphate didephosphorilasi untuk ditansport memasuki aliran darah.

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 57

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 58
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 59
Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 60
 Glikogenesis (Sintesa glikogen)

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 61

 Jalur pentosa fospat
Skema pemotongan rangka karbon pada jalur pentosa fosfat

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 62

 Jalur lengkap pentosa mempunyai dua tahap yaitu
tahap oksidatif dan tahap non-oksidatif

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 63

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 64
 Animasi sistem transport elektron dan sintesa ATP dapat dilihat
pada web http://highered.mcgraw-hill.com/olc/dl/120071/ bio11.swf.

http://www.dnatube.com/video/104/ATP-synthase-structure-and-
mechanism

http://www.youtube.com/watch?v=PjdPTY1wHdQ

http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/atpsynt
hase.html

Metabolisme karbohidrat Minda Azhar 65