HAIasli Sbaju

Etiologi Infeksi Saluran Pernafasan Akut Pada Bayi

Studi Kohort Kelahiran Calon Pro
Prawin Kumar, MD,* Guruprasad R. Medigeshi, PhD,† Wisnu S. Mishra, MSc,* Mojahidul Islam, MSc,*
Shivani Randev, MD,* Aparna Mukherjee, MD,* Rama Chaudhry, MD,‡ Arti Kapil, MD ,‡ Kana Ram Jat, MD,*
Rakesh Lodha, MD,* dan Sushil K. Kabra, MD*

Latar belakang: Studi tentang etiologi Infeksi Saluran Pernapasan Akut (ISPA)
pada bayi masih kurang. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk
mendokumentasikan kejadian dan etiologi ISPA pada bayi, variabilitas
musiman dan hubungan profil klinis dengan etiologi.
Metode: Sebuah kelompok kelahiran diikuti untuk tahun pertama kehidupan; untuk
setiap episode ISPA, aspirasi nasofaring dikumpulkan untuk mengidentifikasi virus
pernapasan penyebab menggunakan uji reaksi berantai polimerase real-time
multipleks. Untuk infeksi saluran pernapasan bawah, kultur darah, prokalsitonin
serum, antibodi serum terhadapmikoplasma dan Klamidia dan kencing
Streptococcus pneumoniae antigen juga diuji.
Hasil: Sebanyak 503 episode ISPA didokumentasikan pada 310 bayi
dengan tingkat kejadian 1,8 episode per bayi per tahun. Dari jumlah
tersebut, sampel diproses dalam 395 episode (infeksi saluran
pernapasan atas: 377; infeksi saluran pernapasan bawah: 18). Satu
atau lebih virus terdeteksi dalam 250 (63,3%) episode dan koinfeksi
virus dalam 72 (18,2%) episode. Rhinovirus adalah virus yang paling
umum [105 (42%)] diikuti oleh virus pernapasan syncytial [50 (20%)],
virus parainfluenza [42 (16,8%)] dan coronavirus [44 (17,6%)]. Pada
infeksi saluran pernapasan bawah, infeksi virus terdeteksi pada 12
(66,7%) episode, infeksi bakteri pada 17 (94,4%) episode dan infeksi
campuran bakteri-virus pada 8 (44,4%) episode. Insiden puncak
virus diamati selama Februari-Maret dan September-November.
Kesimpulan: Dalam kohort bayi ini, kejadian ISPA adalah 1,8 episode per
tahun per bayi; 95% adalah infeksi saluran pernapasan atas. Virus
diidentifikasi dalam 63,3% episode, dan virus yang paling umum terdeteksi
adalah rhinovirus, virus pernapasan syncytial dan virus parainfluenza.
bahwa ISPA merupakan 20% -40% dari semua pasien rawat jalan dan 12% -35% dari
kunjungan rawat inap di rumah sakit.4 ISPA memiliki beban ekonomi yang sangat besar baik
bagi keluarga maupun masyarakat, terutama di negara berkembang.5
Beberapa penelitian menunjukkan bahwa virus adalah penyebab
paling umum ISPA pada anak kecil.3,4,6 Lebih dari 200 virus telah
diketahui terkait dengan ISPA dan jumlah ini meningkat setiap tahun.7,8
Secara klinis, biasanya sulit untuk membedakan secara akurat antara
etiologi yang berbeda, yang menyebabkan penggunaan antibiotik yang
tidak tepat bahkan di pusat kesehatan terbaik.
Diagnosis etiologi ISPA merupakan tantangan karena
terbatasnya ketersediaan pemeriksaan noninvasif hingga saat ini.9
Selama 2 dekade terakhir, serologi dan isolasi virus menjadi andalan
penyelidikan untuk mendeteksi virus. Dengan munculnya metode
molekuler seperti multiplex real-time polymerase chain reaction (RT-
PCR), sekarang dimungkinkan untuk mengidentifikasi sejumlah patogen
pada sampel tunggal.9,10 Teknologi ini dapat membantu dalam
memperkirakan pola epidemiologi ISPA secara akurat; itu juga dapat
meningkatkan penggunaan antibiotik secara bijaksana dan mencegah
resistensi antibiotik dalam jangka panjang.
Sebagian besar penelitian yang tersedia tentang etiologi
ISPA berasal dari negara maju, terutama berfokus pada deteksi
virus dan termasuk anak-anak hingga usia 5 tahun. Studi tentang
pola epidemiologi dan etiologi ISPA pada bayi dari negara
berkembang seperti India masih kurang. Tujuan dari penelitian ini
adalah untuk mengetahui kejadian dan etiologi ISPA pada bayi,
variabilitas musiman dan hubungan profil klinis dengan etiologi.

Kata Kunci: infeksi saluran pernapasan akut, etiologi, bayi, pneumonia (

MATERIAL DAN METODE
Pediatr Menginfeksi Dis J 2017;36:25–30)
Desain Studi dan Izin Etis
Studi kohort prospektif ini dilakukan di Department of
Pediatrics, All India Institute of Medical Sciences (AIIMS), New Delhi,

SEBUAH
penyebab kematianinfeksidan kesakitan
saluran akibat
pernapasan penyakit
lucu menular
(ISPA) terus di
menjadi
India dari Agustus 2012 hingga Desember 2014. Sebagian dari
investigasi dilakukan di Translational Health Science and
anak-anak terkemuka di dunia.1 Menurut perkiraan World Health
Technology Institute (THSTI), Faridabad , India. Penelitian ini telah
Organization, pada tahun 2012, secara global 15% dari 6,5 juta kematian pada
disetujui oleh komite etik institut dari kedua institut tersebut.
anak <5 tahun disebabkan oleh ISPA. Di India, 14% dari 1,4 juta kematian pada
Informed consent tertulis diperoleh dari orang tua atau wali.
kelompok usia ini pada tahun 2012 disebabkan oleh ISPA.2

Anak-anak dengan ISPA berkontribusi pada sebagian besar konsultasi dan rawat
inap di fasilitas perawatan kesehatan.3 Sebuah studi dari India melaporkan
Diterima untuk publikasi 27 September 2016.
Dari *Department of Pediatrics, All India Institute of Medical Sciences,
Delhi, India; Department of Biotechnology, Vaccine and Infectious Disease
Research Center, Translational Health Science and Technology Institute
(THSTI), Faridabad, India; dan Department of Microbiology, All India
Institute of Medical Sciences, New Delhi, India.
Studi ini didanai oleh Departemen Bioteknologi, Pemerintah India. Penulis tidak
memiliki konflik kepentingan untuk diungkapkan.
Alamat korespondensi: Sushil K. Kabra, MD, Pediatric Pulmonology
Divisi, Departemen Pediatri, Institut Ilmu Kedokteran Seluruh India, Ansari
Nagar, New Delhi 110029, India. Email: skkabra@hotmail.com. Hak Cipta © 2016
Wolters Kluwer Health, Inc. Semua hak dilindungi undang-undang. ISSN:
0891-3668/17/3601-0025
DOI: 10.1097/INF.0000000000001359
Populasi Studi
Semua neonatus yang lahir di rumah sakit selama masa
penelitian disaring untuk kelayakan dalam penelitian ini. Kriteria inklusi
adalah cukup bulan, sesuai untuk bayi usia kehamilan dengan periode
perinatal lancar. Adanya kelainan kongenital dan penolakan persetujuan
merupakan kriteria eksklusi. Bayi yang terdaftar diperiksa secara klinis
dan pengukuran antropometri dicatat pada saat pendaftaran. Mereka
diikuti secara teratur selama 1 tahun dan orang tua diminta untuk
berkonsultasi segera untuk setiap gejala pernapasan. Salah satu staf
peneliti menanyakan secara berkala (2-4 mingguan) melalui telepon
tentang adanya gejala pernapasan. Jika bayi mengalami gejala
pernapasan atau keluhan lain, orang tua disarankan untuk datang ke
rumah sakit. Kunjungan rumah dilakukan jika keluarga tidak bisa
dihubungi.

Jurnal Penyakit Menular Anak • Volume 36, Nomor 1, Januari 2017 www.pidj.com | 25

Hak Cipta © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Dilarang mereproduksi artikel ini secara tidak sah.
Kumar dkk Jurnal Penyakit Menular Pediatrik • Jilid 36, Nomor 1, Januari 2017

definisi
ISPA: Adanya pilek atau batuk dengan atau tanpa demam, napas
cepat atau kesulitan bernapas.11
Infeksi saluran pernapasan atas (ISK): ISPA dengan tidak adanya pernapasan cepat
untuk usia seperti yang didefinisikan oleh Organisasi Kesehatan Dunia.11
Infeksi saluran pernapasan bawah (LRTI): ISPA dengan pernapasan
cepat untuk usia seperti yang didefinisikan oleh Organisasi Kesehatan Dunia
(laju pernapasan, <2 bulan: >60/menit; 2-12 bulan: >50/menit).11
Pengambilan Sampel Mikrobiologis
Bayi dengan gejala pernapasan menjadi sasaran evaluasi
klinis. Berdasarkan kriteria yang disebutkan di atas, diagnosis URTI
atau LRTI dibuat, dan sampel mikrobiologi yang telah ditentukan
diambil dan dianalisis (Tabel 1).
Aspirasi Nasofaring
Aspirasi nasofaring (NPA) dikumpulkan dengan memasukkan selang
makanan (5 atau 6 Fr) secara perlahan ke dalam ruang nasofaring posterior melalui
salah satu lubang hidung dengan bayi dalam posisi terlentang dan menerapkan
tekanan isap rendah dengan jarum suntik sekali pakai 10 mL. Cairan yang diaspirasi
dicampur dengan normal saline hingga mencapai volume 3mL dan disimpan pada
suhu -80 °C hingga digunakan lebih lanjut.
Multipleks RT-PCR
RNA/DNA virus dari sampel NPA yang disentrifugasi
diekstraksi dengan kit spin virus QIAampMiniElute sesuai dengan
instruksi pabrik (QIAGEN, Limburg, Belanda). Bahan yang
diekstraksi dianalisis dengan uji PCR real-time multipleks untuk
deteksi kualitatif 21 patogen pernapasan sesuai dengan instruksi
pabrik (Diagnostik Jalur Cepat, Junglinster, Luksemburg). Patogen
pernapasan (20 virus dan 1 bakteri atipikal) yang terdeteksi adalah
sebagai berikut: influenzaA, influenzaA (H1N1) swl, influenza B;
coronaviruses (CoV) NL63, 229E, OC43 dan HKU1; parainfluenza
(PIV) 1, 2, 3 dan 4; human metapneumovirus (HMPV) A dan B;
rhinovirus (RV); virus pernapasan syncytial (RSV) A dan B;
adenovirus (AV); enterovirus (EV); virus parecho (PV); bocavirus
(BoV) danMycoplasma pneumoniae.12
tidak ada pertumbuhan yang diamati setelah 72 jam. Uji prokalsitonin
(PCT) dilakukan pada sampel serum menggunakan kit VIDAS BRAHMS
PCT (BioMerieux SA, Marcy-l'Etoile, Prancis); Nilai PCT >0,5ng/mL
dianggap positif (menunjukkan infeksi bakteri) sesuai dengan instruksi
pabrik. Kultur NPA dilakukan dalam kaldu organisme mirip
pleuropneumonia (mikoplasma) dan agar organisme mirip
pleuropneumonia (mikoplasma) dan diamati selama 21 hari untuk
pertumbuhan bakteri.mikoplasma. EUROIMMUN (Lubeck, Jerman)
enzymlinked immunosorbent assay kits digunakan untuk serologi untuk:
mikoplasma dan Klamidia (imunoglobulin G dan imunoglobulinM). PCR
juga dilakukan untuk mendeteksiP1 gen dari M.pneumonia. Urine diuji
untuk Streptococcus pneumoniae antigen dengan uji cepat— BinaxNOW
S. pneumoniaeKartu Antigen (Alere, Irlandia).
Analisis statistik
Data dikelola dalam Microsoft Access dan dianalisis
menggunakan STATA v.12 (StataCorp, College Station, TX). Data tentang
etiologi dianalisis menggunakan statistik deskriptif, dan hasilnya
dinyatakan sebagai angka dan proporsi.
HASIL
Sebanyak 310 bayi baru lahir [169 (54,5%) anak laki-laki]
terdaftar setelah skrining dari 3421 neonatus. Rata-rata (standar
deviasi) usia kehamilan dan berat lahir neonatus yang terdaftar
adalah 268 (22) hari dan 2648 (690) g, masing-masing. Rangkuman
karakteristik demografi disajikan pada Tabel 2.
Kejadian ISPA
Bayi yang terdaftar dalam penelitian ini memiliki rata-rata (standar
deviasi) tindak lanjut 11,5 (1,2) bulan. Sebanyak 503 episode ISPA adalah
MEJA 2. Karakteristik Demografis Terdaftar
Neonatus (n = 310)
Karakteristik Nilai*

Investigasi lainnya Jenis kelamin

Laki-laki 169 (54,5)

Pada anak-anak dengan diagnosis klinis LRTI, kultur darah
Wanita 141(45.5)
dilakukan, dan untuk tujuan ini, 1mL darah dikumpulkan dalam kondisi Antropometri, mean (SD)
aseptik dalam botol kultur darah yang berisi 10mL kaldu BH1 (Diffco, Berat lahir (g) 2648.2 (689.2)
Durham, NC) dan segera diangkut ke laboratorium mikrobiologi, di Panjang (cm) 47.7 (6.4)
mana itu disimpan dalam inkubator pada 37 ° C. Pada 24 jam inkubasi, Kehamilan, mean (SD), d 267.9 (22.6)
Cara melahirkan
subkultur dilakukan pada media agar darah domba (BioMerieux,
vagina 179 (58,9)
Durham, NC) dan MacConkey (HiMedia, Mumbai, India) dan diulang operasi caesar 101 (33.2)
pada 48 dan 72 jam. Kultur dilaporkan negatif jika Instrumental 24 (7.9)

Ibu Ayah
Usia orang tua, rata-rata (SD), 26,5 (3,9) 30.5 (4.3)
TABEL 1. Mikrobiologi Work-u p untuk Episode ISPA tahun Tingkat pendidikan orang
tua Sarjana 157 (50,6) 158 (50,9)
Diagnosa Klinis Lulus 102 (32,9) 120 (38.8)
Pascasarjana 51 (16,5) 32 (10.3)
Sampel/Investigasi URTI LRTI Jumlah anggota keluarga di 5.3 (2.8)
rumah, rata-rata (SD)
NPA Akomodasi hidup
Virus (RT-PCR) ✓ ✓ perkotaan 296 (96.1)
Mycoplasma pneumoniae ✓ Pedesaan 12 (3.9)
Semua darah Merokok di rumah 93 (30)
Kultur bakteri dan serum ✓ Hewan peliharaan di rumah 37 (12.3)
sensitivitas Riwayat keluarga alergi 144 (46,5)
Serologi untuk mikoplasma dan ✓ apapun Asma 82 (26,5)
Chlamydophila pneumoniae Rinitis alergi 99 (31.9)
prokalsitonin ✓ Dermatitis atopik 32 (10.3)
Air seni
* Nilai dinyatakan dalam n (%), kecuali ditentukan lain. SD
Streptococcus pneumoniae antigen ✓
menunjukkan standar deviasi.

26 | www.pidj.com © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Semua hak dilindungi undang-undang.

Hak Cipta © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Dilarang mereproduksi artikel ini secara tidak sah.
Jurnal Penyakit Menular Pediatrik • Jilid 36, Nomor 1, Januari 2017 Etiologi Infeksi Saluran Pernafasan Akut Pada Bayi

didokumentasikan pada tahun pertama pada 310 bayi yang terdaftar dengan menunjukkan variasi musiman yang jelas: pertama pada Februari–Maret dan
tingkat kejadian 1,8 episode per bayi per tahun. URTI didokumentasikan di kedua pada September–November. PIV juga menunjukkan 2 puncak: puncak
476 (94,6%) dan LRTI di 27 (5,4%) dengan tingkat kejadian URTI dan LRTI pertama pada bulan Maret dan puncak kedua pada bulan Juli–September,
masing-masing 1,7 dan 0,1 episode per bayi per tahun. Dari 503 episode ISPA, sedangkan virus influenza (IV) lebih sering diamati pada bulan Juli. HCoV juga
sampel mikrobiologi dianalisis dalam 395 episode, yang meliputi 377 (95,4%) menunjukkan 2 puncak pada Maret–April dan September–Oktober. HMPV
episode ISPA dan 18 (4,6%) episode LRTI. biasanya ditemukan pada Januari-Maret. Variabilitas musiman virus umum
dirangkum dalam Gambar 2.
Virus dan ISPA
Sebanyak 329 virus terdeteksi pada 250 (63,3%) episode Karakteristik Klinis ISPA
ISPA: 312 (94,8%) virus dari 238 URTI dan 17 (5,2%) virus dari 12 Usia rata-rata (standar deviasi) pada saat episode ISPA
episode LRTI. Virus tunggal terdeteksi pada 178 (45,1%) episode pertama adalah 6 (3) bulan, dan jumlah episode maksimum diamati
ISPA, sedangkan 2 dan 3 virus diidentifikasi masing-masing pada 65 pada bayi berusia 6 bulan [60 (15,2%)]. Dalam 6 bulan pertama
(16,4%) dan 7 (1,8%) episode. kehidupan, 240 (60,8%) episode ISPA didokumentasikan; 109
RV adalah virus yang paling umum terdeteksi pada 105 (42%) episode (27,6%) episode terjadi pada 3 bulan pertama dan 46 (11,7%) pada
ISPA (dari 250) diikuti oleh RSV pada 50 (20%), PIV pada 42 (16,8%), CoV bulan pertama kehidupan.
manusia (HCoV) pada 44 (17,6%). Subtipe HKU adalah HCoV paling umum
yang terdeteksi pada 16 (6,4%) episode, sedangkan serotipe 3 adalah PIV Jenis Virus pada Berbagai Usia
paling umum yang terdeteksi pada 27 (10,8%) episode. Rangkuman proporsi Virus terdeteksi pada lebih dari setengah episode ISPA [144
berbagai virus yang terdeteksi disajikan pada Tabel 3. (57,6%)] yang terjadi pada usia <6 bulan. RV adalah virus yang
Koinfeksi dengan 2 atau lebih virus diamati pada 72 paling umum sepanjang masa bayi kecuali pada kelompok usia 9-12
(18,2%) episode ISPA; 2 virus terdeteksi dalam 65 (16,4%) bulan di mana RSV adalah virus yang paling umum terdeteksi. Virus
episode dan 3 virus dalam 7 (1,8%) episode. RV adalah virus umum lainnya yang terdeteksi adalah RSV, PIV, HCoV dan HMPV
paling umum di antara virus koinfeksi yang terdeteksi pada 26 pada kelompok usia 3-6 bulan, sedangkan IV, HBoV dan EV lebih
(36,1%) episode ISPA koinfeksi. Virus pernapasan seperti AV, sering terdeteksi pada kelompok usia 6-9 bulan (Tabel 4).
Human Bocavirus (HBoV) dan PV lebih sering terdeteksi pada
episode ISPA yang koinfeksi. Fitur Klinis
Rhinorrhea adalah gejala yang paling umum, diamati pada 372
Variabilitas Musiman ARI (94,8%) episode ISPA diikuti oleh batuk pada 320 (81%), demam pada
Episode ISPA diamati sepanjang tahun dengan 2 puncak: puncak 140 (35,4%), kesulitan bernapas pada 19 (4,8%) dan kesulitan makan
pertama pada Februari-Maret dan puncak kedua pada Oktober-November pada 28 (7,1%). ) dari episode. Sebanyak 105 (26,6%) episode memiliki 1
(Gbr. 1). Episode ISPA paling sering terjadi pada bulan Maret [60 (15,2%)] dan atau lebih gejala terkait lainnya seperti diare, muntah, gatal telinga atau
paling jarang terjadi pada bulan Juni [15 (3,8%)]. ruam kulit. Tidak ada perbedaan yang signifikan dalam durasi gejala
dengan jenis virus yang berbeda (data tidak ditampilkan).
Variabilitas Musiman dari Virus yang Terdeteksi
Episode RV terdeteksi sepanjang tahun dengan 2 puncak: puncak
Infeksi Saluran Pernapasan Bawah
pertama pada bulan Maret dan puncak kedua pada Juli–Oktober. RSV Dari 503 episode ISPA, 27 (5,4%) didiagnosis sebagai LRTI
berdasarkan kriteria klinis; sampel yang dikumpulkan diproses dan
dianalisis dalam 18 (4,6%) episode. LRTI paling sering didiagnosis pada
usia> 6 bulan [14 (77,8%)] dan hanya 1 kasus (5,6%) yang
TABEL 3. Proporsi Berbagai Virus didokumentasikan dalam 3 bulan pertama. Dibandingkan dengan URTI,
Terdeteksi dalam 250 Episode ISPA durasi demam rata-rata (standar deviasi) memanjang secara signifikan
pada 310 Bayi pada LRTI [LRTI: 5 (1,6) hari; URTI: 2,6 (1,4) hari;P < 0,001]. Virus
terdeteksi dalam 12 (66,7%) episode LRTI di mana RSV adalah yang
Proporsi dari paling umum [5 (27,8%)] diikuti oleh RV dalam 4 (22,2%) episode. Agen
Jenis Virus Virus* n (%)
etiologi untuk LRTI ditunjukkan pada Tabel 5. Koinfeksi virus terdeteksi
RV 105 (42) dalam 3 (16,7%) episode di mana RV paling umum diikuti oleh HBoV.
RSV A dan B 50 (20) LRTI dikaitkan dengan pneumonia mikoplasma, pneumonia klamidia
PIV 42 (16.8) dan pneumonia streptokokus dalam 1 (5,6%), 3 (16,7%) dan 7 (38,9%)
PIV 4 10 (4)
episode, masing-masing (Tabel 4). Enam episode LRTI memiliki bukti
PIV 3 27 (10.8)
PIV 2 2 (0.8) tidak langsung dari infeksi bakteri (peningkatan PCT), meskipun tidak
PIV 1 3 (1.2) ada organisme yang diisolasi.
HCoV 44 (17,6)
HCoV 43 11 (4.4) Koinfeksi Virus–Bakteri
HCoV 63 12 (4.8)
Dalam 8 (44,4%) episode LRTI, virus campuran dan
HCoV HKU 16 (6.4)
HCoV 229 5 (2)
infeksi bakteri diamati di mana RSV adalah virus yang paling
HMPV 23 (9.2) sering terdeteksi [4 (22,2%)].
IV 16 (6.4)
IV A 11 (4.4) Hasil dari ARI
IV A H1N1 2 (0.8) Bayi membutuhkan rawat inap di 13 (3,3%) episode
IV B 3 (1.2)
EV 14 (5.6)
dengan tingkat kejadian 0,04 per bayi per tahun; sisa episode
HBoV 19 (7.6) dikelola secara rawat jalan. Virus terdeteksi di semua kasus
AV 11 (4.4) rawat inap di mana RV adalah yang paling umum, terdeteksi di
PV 5 (2) 7 (53,8%) episode diikuti oleh RSV di 6 (46,2%) episode.
Total 329 Koinfeksi virus diamati pada 7 (53,8%) episode di mana RSV
* Dalam 72 episode, lebih dari 1 virus diidentifikasi. diisolasi dari 3 (23,1%) episode.

© 2016Wolters Kluwer Health, Inc. Semua hak dilindungi undang-undang. www.pidj.com | 27

Hak Cipta © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Dilarang mereproduksi artikel ini secara tidak sah.
Kumar dkk Jurnal Penyakit Menular Pediatrik • Jilid 36, Nomor 1, Januari 2017

GAMBAR 1. episode ISPA di

bulan yang berbeda.

GAMBAR 2. Variasi musiman

virus umum.

DISKUSI
TABEL 4. Jenis Virus Dengan Usia
Kami mengamati 503 episode ISPA pada 310 bayi yang diikuti selama
0–3 bln 3–6 bln 6–9 bln 9–12 bln 1 tahun, dengan tingkat kejadian 1,8 episode per bayi per tahun. Angka
Usia kejadian URTI dan LRTI adalah 1,7 dan 0,1 episode per bayi per tahun. Hampir
Grup (bln) N (%) N (%) N (%) N (%) 95% dari episode ISPA adalah URTI. Bukti yang tersedia tentang etiologi ISPA
pada anak-anak sangat heterogen dalam literatur karena sebagian besar
RV 26 (10.4) 22 (8.8) 20 (8.0) 11(4.4) penelitian juga memasukkan anak di luar masa bayi, tetapi dalam penelitian
RSV 10 (4.0) 12 (4.8) 9 (3.6) 12 (4.8)
ini, kami hanya memasukkan bayi hingga usia 1 tahun. Demikian pula,
PIV 6 (2.4) 12 (4.8) 11 (4.4) 8 (3.2)
CoV 6 (2.4) 16 (6.4) 9 (3.6) 2 (0.8) beberapa penelitian berasal dari daerah pedesaan, sementara yang lain hanya
IV 3 (1.2) 4 (1.6) 5 (2.0) 3 (1.2) dari penduduk perkotaan.13–15
HMPV 5 (2.0) 12 (4.8) 3 (1.2) 0 Penelitian yang dilakukan pada anak <5 tahun dari pedesaan
EV 2 (0.8) 3 (1.2) 4 (1.6) 3 (1.2)
Bangladesh memperkirakan kejadian 5,5 episode ISPA per anak per
HBoV 2 (0.8) 1 (0,4) 3 (1.2) 2 (0.8)
tahun.13 Chhabra dkk14 dari India telah mengamati tingkat kejadian
2,5 episode ISPA per anak per tahun dimana 87,5% episode
Dalam kohort ini, 3 kematian dilaporkan: 2 di rumah (1 memiliki adalah ISPA dan 12,5% adalah LRTI pada anak <5 tahun.
penyakit metabolik dan 1 memiliki penyakit jantung bawaan—keduanya Meskipun episode ISPA dalam penelitian ini didokumentasikan
didiagnosis setelah pendaftaran selama masa tindak lanjut) dan 1 di rumah sepanjang masa bayi, usia rata-rata pada episode ISPA pertama adalah 6
sakit (diakui karena demam dan hepatosplenomegali pada usia 5 bulan). Tak (3) bulan. Studi kohort kelahiran berbasis masyarakat dari Swiss juga
satu pun dari kematian dinilai terkait dengan ISPA. mengamati bahwa usia rata-rata ISPA adalah 6 (kisaran, 0,5-12) bulan.15

28 | www.pidj.com © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Semua hak dilindungi undang-undang.

Hak Cipta © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Dilarang mereproduksi artikel ini secara tidak sah.
Jurnal Penyakit Menular Pediatrik • Jilid 36, Nomor 1, Januari 2017 Etiologi Infeksi Saluran Pernafasan Akut Pada Bayi

13 18
diikuti oleh PIV terutama pada <3 bulan, sedangkan Lu et al dari China
TABEL 5. Etiologi Episode LRTI (n = 18) telah mengamati bahwa RV adalah virus yang paling umum
bertanggung jawab untuk ISPA diikuti oleh PIV dan RSV pada usia <6
Proporsi Total
bulan, yang serupa dengan penelitian ini. Studi lain dari Filipina
Etiologi LRTI n (%) n (%) dilakukan pada infeksi saluran pernapasan serius pada usia <90 hari, EV
terdeteksi pada 22%, RSV pada 17% dan RV pada 10% kasus.36
Virus (RT-PCR) 12 (66.7)
Studi ini menambah wawasan yang berguna tentang pola musiman
RSV 5 (27.8)
kejadian infeksi virus pada bayi di India utara. India adalah negara tropis dan
RV 2 (11.2)
PIV 1 (5.6) memiliki iklim yang beragam saat kita bergerak dari utara ke selatan dan
HCoV 1 (5.6) timur ke barat.37 Beberapa penelitian dari negara tropis telah melaporkan
IV 1 (5.6) bahwa ISPA virus terjadi sepanjang tahun, sementara penelitian lain
HMPV 1 (5.6) menunjukkan variasi musiman yang jelas.15,24,38 Dalam penelitian ini, kami
EV 1 (5.6) mengamati bahwa ada 2 puncak ISPA: puncak pertama pada bulan Februari-
Bakteri 17 (94.4)
Maret dan puncak kedua pada bulan September-November. Variasi musiman
Streptokokus pneumonia
juga telah dilaporkan untuk berbagai virus.15,24,38
Kultur darah 1 (5.6) 7 (38.9)
Antigen urin 6 (33.3) Penelitian ini juga memberikan informasi penting mengenai
Mycoplasma pneumoniae profil klinis episode ISPA pada bayi. Pilek adalah gejala yang paling
IgM 1 (5.6) 1 (5.6)
umum diamati pada episode ISPA diikuti oleh batuk dan demam.
IgG Tidak ada

PCR Tidak ada

Budaya Tidak ada
Chlamydophila pneumoniae
IgM 1 (5.6) 3 (16.7)
IgG 2 (11.1)
Bukti tidak langsung
Prokalsitonin (>0,5ng/mL) 6 (33,3%)
Dalam 8 episode LRTI, bukti koinfeksi bakteri-virus terdeteksi.
Virus merupakan penyebab ISPA yang paling umum dalam penelitian
ini, terdeteksi pada 63,3% episode. Tingkat deteksi ini sebanding dengan
penelitian lain yang telah menggunakan RT-PCR, dan bervariasi dari 45%
hingga 79%.9,15–17 Tingkat deteksi virus tergantung pada usia, jenis ISPA (URTI
vs LRTI), tingkat keparahan episode dan kebutuhan rawat inap. Tingkat
deteksi virus yang lebih tinggi telah dilaporkan di antara penyakit serius dan
yang membutuhkan rawat inap.9,15,18–20
Jenis virus penyebab ISPA bervariasi di berbagai wilayah geografis.9,13,15,21
Dalam penelitian ini, RV adalah virus yang paling sering menyebabkan ISPA selama
masa bayi, diikuti oleh RSV, PIV dan CoV. Studi berbasis komunitas baru-baru ini
pada anak-anak dari Swedia, Swiss, Brasil, dan Madagaskar juga mengamati bahwa
RV adalah virus paling umum yang menyebabkan ISPA.9,15,21–23 Dalam penelitian dari
Kenya dan Madagaskar, RSV terdeteksi sebagai virus paling umum yang
menyebabkan ISPA pada bayi.24,25 Sebuah studi prospektif dari Cina menunjukkan
bahwa IV adalah virus yang paling umum (19,4%) menyebabkan URTI, diikuti oleh
PIV (10,8%) dan RV (10,5%).18
Sebuah studi oleh Chonmaitree et al26 dari Galveston, TX telah menemukan bahwa
AV adalah virus yang paling umum untuk URTI pada usia <3 tahun.
Baru-baru ini, beberapa virus baru seperti HCoV, HMPV dan
HBoV telah dilaporkan dalam berbagai penelitian dalam etiologi ISPA.
18,27–30 Dalam penelitian ini, HCoV, HMPV dan HBoV terdeteksi pada
17,6%, 9,2% dan 7,6% dari episode ISPA, masing-masing. Peran
EV sebagai etiologi ISPA semakin diakui25,31,32; dalam kelompok
Meskipun kami tidak mengamati perbedaan yang signifikan dalam
durasi rata-rata gejala ini di antara virus, kami mendokumentasikan
bahwa infeksi RSV bertanggung jawab atas episode ISPA yang lebih
parah yang mengarah ke LRTI. Sebuah penelitian dari Swiss dan Korea
juga mengamati bahwa anak-anak dengan infeksi RSV lebih parah. sakit
dan memiliki gejala yang lebih parah,15,39 sementara penelitian lain telah
mengamati bahwa HMPV dikaitkan dengan penyakit parah.9,40,41
Dalam penelitian ini, RSV (27,8%) adalah virus yang paling umum
menyebabkan LRTI. Penelitian lain juga melaporkan RSV sebagai virus paling
umum yang terlibat dalam LRTI pada bayi.39,42–44Kami mengamati bukti infeksi
bakteri pada 94,4% episode LRTI, di mana bakteri atipikal terdeteksi pada
22,2% (M. pneumoniae di 5,5% dan Chlamydophila pneumoniae dalam 16,7%)
episode. Ada kekurangan penelitian yang menyelidiki etiologi bakteri ISPA
pada bayi. Sebuah penelitian dari Madagaskar pada anak-anak <5 tahun
diamatiM. pneumoniae di 1,7% dan C. pneumonia di 0,7% dari ISPA.25 Peneliti
lain telah mendokumentasikan bahwa prevalensi bakteri atipikal pada ISPA
bervariasi dengan usia.45,46 Pada 8 (44,4%) episode LRTI, terdapat bukti infeksi
campuran bakteri dan virus. Penelitian lain juga menunjukkan bukti infeksi
virus dan bakteri campuran dalam proporsi yang berbeda.18,47Sebuah studi
dari Kenya mendokumentasikan infeksi campuran pada 21,8% ISPA.24
Presentasi klinis antara URTI dan LRTI hampir serupa kecuali
durasi demam rata-rata, yang lebih lama pada kelompok LRTI (P<
0,001). Hoffmann dkk25 juga mengamati bahwa kejadian demam
lebih tinggi pada kelompok LRTI. Rawat inap diperlukan hanya 3,3%
dari episode ISPA dimana 27,8% adalah LRTI. Regamey dkk15 telah
mengamati 2% rawat inap dalam studi kohort kelahiran mereka.
KETERBATASAN
Salah satu keterbatasan penelitian ini adalah bahwa beberapa ISPA
mungkin tidak dilaporkan oleh orang tua. Karena tidak ada kelompok kontrol dalam

kami, EV terdeteksi pada 5,6% episode. penelitian ini, kami tidak dapat menyimpulkan apakah semua virus yang terdeteksi

Ada beberapa laporan koinfeksi virus pada ISPA mulai dari adalah agen penyebab atau hanya dalam keadaan pembawa. Ini adalah penelitian

13% hingga 28%.15,23,33,34 Kami juga mengamati koinfeksi virus di berbasis rumah sakit. Kami hanya dapat menguji 395 usapan nasofaring berturut-

18,3% episode ISPA sebagai 2 virus dalam 16,5% dan 3 virus dalam 1,8% turut untuk isolasi virus karena dana yang terbatas.

episode. Sebuah studi kohort kelahiran berbasis komunitas dari Swiss oleh
Regamey et al15 pada tahun 2008 juga diamati koinfeksi virus sebagai 2 virus
dalam 15 (17%) kasus dan 3 virus dalam 3 (3%) kasus. RV lagi-lagi virus paling
umum yang terkait dengan koinfeksi. Kami mengamati bahwa virus
pernapasan langka seperti AV, HBoV dan PV umumnya dikaitkan sebagai virus
koinfeksi. Peran HBoV sebagai patogen pernapasan utama diperdebatkan
sejak pertama kali ditemukan oleh Allander et al30
pada tahun 2005, dan telah sering dilaporkan sebagai virus koinfeksi.35
RV adalah virus yang paling umum terdeteksi pada semua kelompok
umur kecuali usia 9-12 bulan. Sebuah studi berbasis populasi dari Bangladesh
telah melaporkan bahwa RSV umum terjadi sepanjang masa bayi
Kekuatan penelitian ini meliputi desain kohort kelahiran yang kuat,
ukuran sampel yang besar, tindak lanjut yang cermat dan penggunaan uji RT-
PCR multipleks yang sensitif.
KESIMPULAN
Dalam studi kohort kelahiran prospektif ini, kami mengamati bahwa
ISPA merupakan masalah yang signifikan pada masa bayi dan sebagian besar
episodenya adalah ISPA. Virus adalah penyebab paling umum dari ISPA, RV
menjadi penyebab paling umum. RSV adalah virus yang paling umum
terdeteksi di LRTI. Dua puncak musiman terlihat pada sebagian besar virus.

© 2016Wolters Kluwer Health, Inc. Semua hak dilindungi undang-undang. www.pidj.com | 29

Hak Cipta © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Dilarang mereproduksi artikel ini secara tidak sah.
Kumar dkk Jurnal Penyakit Menular Pediatrik • Jilid 36, Nomor 1, Januari 2017
REFERENSI
1. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO). Pedoman WHO untuk Pencegahan
dan Pengendalian Infeksi Infeksi Saluran Pernafasan Akut Rawan Epidemi
dan Pandemi. Jenewa, Swiss: WHO; 2014.
2. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO). Penyebab Mortalitas dan Mortalitas Spesifik
dalam Statistik Kesehatan Dunia. Jenewa, Swiss: WHO; 2014.
3. Berman S. Epidemiologi infeksi saluran pernapasan akut pada anak di
negara berkembang. Rev Infect Dis. 1991;13(suppl 6):S454–S462.
4. Manmohan BSK. Infeksi saluran pernapasan akut.Pediatri India. 1984; 21:1–3.
5. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO). Laporan Kesehatan Dunia 2004:
Mengubah Sejarah [sumber daya elektronik]. Jenewa, Swiss: WHO; 2004.
6. Hayden FG. Ancaman virus pernapasan.Curr Opin Menginfeksi Dis. 2006;19: 169–
178.
7. Mackie PL. Klasifikasi virus yang menginfeksi saluran pernapasan.
Pediatr Respir Pdt. 2003;4:84–90.
8. Melnick JL. Taksonomi virus. Dalam: Lannette EM, Balows A, Hausler J Jr.,
Shadowy HJ (eds).Manual Mikrobiologi Klinik. Washington, DC:
Masyarakat Amerika untuk Mikrobiologi; 1985:694–700.
9. Rhedin S, Lindstrand A, Rotzén-Östlund M, dkk. Utilitas klinis PCR untuk
virus umum pada penyakit pernapasan akut.Pediatri. 2014;133: e538–
e545.
10. Sakthivel SK, Whitaker B, Lu X, dkk. Perbandingan diagnostik jalur cepat patogen
pernapasan multiplex real time RT-PCR assay dengan assay singleplex in-house
untuk deteksi komprehensif virus pernapasan manusia.
Metode J Virol. 2012;185:259–266.
11. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO). Buku saku WHO tentang perawatan rumah sakit
untuk anak-anak. Dalam: Pedoman Penatalaksanaan Penyakit Umum pada Anak.
2013:76.
12. Diagnosis Jalur Cepat. Patogen Pernapasan FTD 21 Manual. FTD; 2013:v6.
13. Nasreen S, Luby SP, BrooksWA, dkk. Insiden berdasarkan populasi dari infeksi
virus pernapasan akut yang parah di antara anak-anak berusia <5 tahun di
pedesaan Bangladesh, Juni-Oktober 2010.PLoS Satu. 2014;9:e89978.
14. Chhabra P, Garg S, Mittal SK, dkk. Besarnya infeksi saluran pernapasan
akut pada balita.Pediatri India. 1993;30:1315–1319.
15. Regamey N, Kaiser L, Roiha HL, dkk; Kelompok Penelitian Pernafasan Anak Swiss.
Etiologi virus dari infeksi saluran pernapasan akut dengan batuk pada masa
bayi: studi kohort kelahiran berbasis komunitas.Pediatr Infeksi Dis J.
2008;27:100–105.
16. Elnifro EM, Ashshi AM, Cooper RJ, dkk. Multiplex PCR: optimasi dan aplikasi
dalam virologi diagnostik.Clin Mikrobiol Rev. 2000; 13:559–570.
17. Jansen RR, Schinkel J, Koekkoek S, dkk. Pengembangan dan evaluasi uji PCR
multipleks waktu nyata empat tabung yang mencakup empat belas virus
pernapasan, dan perbandingan dengan rekan target tunggal yang sesuai.J Clin
Virol. 2011;51:179–185.
18. Lu Y, Wang S, Zhang L, dkk. Epidemiologi virus pernapasan manusia pada anak-
anak dengan infeksi saluran pernapasan akut di Jinan, Cina.Clin Dev Immunol.
2013;2013:210490.
19. van Gageldonk-Lafeber AB, Heijnen ML, Bartelds AI, dkk. Sebuah studi kasus-
kontrol infeksi saluran pernapasan akut pada pasien praktek umum di Belanda.
Clin Menginfeksi Dis. 2005;41:490–497.
20. van der Zalm MM, van Ewijk BE, Wilbrink B, dkk. Patogen pernapasan pada
anak-anak dengan dan tanpa gejala pernapasan.J Pediatr.
2009;154:396–400, 400.e1.
21. Ahmed JA, Katz MA, Auko E, dkk. Epidemiologi infeksi virus pernapasan di dua
kamp pengungsi jangka panjang di Kenya, 2007-2010.BMC Infeksi Dis.
2012;12:7.
22. Kusel MM, de Klerk NH, Holt PG, dkk. Peran virus pernapasan pada penyakit saluran
pernapasan atas dan bawah akut pada tahun pertama kehidupan: studi kohort
kelahiran.Pediatr Infeksi Dis J. 2006;25:680–686.
23. Souza LS, Ramos EA, Carvalho FM, dkk. Infeksi pernapasan virus pada anak-anak
yang menghadiri penitipan anak di perkotaan Brasil Timur Laut.Pediatr
Pulmonol. 2003;35:184–191.
24. Matu M, Kikuvi G, Wanzala P, dkk. Etiologi infeksi pernapasan akut pada
anak di bawah lima tahun di Nakuru, Kenya.J Microbiol Exp.
2014;1:00021.
30 | www.pidj.com
Hak Cipta © 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Dilarang mereproduksi artikel ini secara tidak sah.
25. Hoffmann J, Rabezanahary H, Randriamarotia M, dkk. Etiologi virus dan bakteri
atipikal dari infeksi saluran pernapasan akut pada anak di bawah 5 tahun yang
tinggal di daerah tropis pedesaan Madagaskar.PLoS Satu. 2012;7:e43666.
26. Chonmaitree T, Revai K, Grady JJ, dkk. Infeksi saluran pernapasan atas
virus dan komplikasi otitis media pada anak kecil.Clin Menginfeksi Dis.
2008;46:815–823.
27. van der Hoek L, Ihorst G, Sure K, dkk. Beban penyakit akibat infeksi human
coronavirus NL63 dan periodisitas infeksi.J Clin Virol.
2010;48:104–108.
28. Woo PC, Lau SK, Chu CM, dkk. Karakterisasi dan urutan genom lengkap
dari novel coronavirus, coronavirus HKU1, dari pasien dengan pneumonia.
J Viral. 2005;79:884–895.
29. van den Hoogen BG, de Jong JC, Groen J, dkk. Sebuah pneumovirus manusia yang
baru ditemukan diisolasi dari anak-anak dengan penyakit saluran pernapasan.
Nat Med. 2001; 7:719–724.
30. Allander T, Tammi MT, Eriksson M, dkk. Kloning parvovirus manusia dengan
skrining molekuler sampel saluran pernapasan.Proc Natl Acad Sci US A.
2005;102: 12891–12896.
31. Hable KA, O'Connell EJ, Herrmann EC Jr. Grup B coxsackieviruses sebagai
virus pernapasan. Mayo Clinic Proc. 1970;45:170–176.
32. Portes SA, Da Silva EE, Siqueira MM, dkk. Enterovirus diisolasi dari pasien
dengan infeksi saluran pernapasan akut selama tujuh tahun di Rio de
Janeiro (1985-1991).Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 1998;40:337–342.
33. Bonzel L, Tenenbaum T, Schroten H, dkk. Deteksi koinfeksi virus yang sering pada
anak-anak yang dirawat di rumah sakit dengan infeksi saluran pernapasan akut
menggunakan reaksi berantai polimerase waktu nyata.Pediatr Infeksi Dis J.
2008;27:589–594.
34. Tecu C, Mihai ME, Alexandrescu VI, dkk. Infeksi virus tunggal dan multipatogen
pada anak rawat inap dengan infeksi saluran pernapasan akut.Roum Arch
Microbiol Immunol. 2013;72:242–249.
35. Schildgen O, MüllerA, Allander T, dkk. Bocavirus manusia: penumpang atau patogen
pada infeksi saluran pernapasan akut?ClinMicrobiol Rev. 2008;21:291–304.
36. Gatchalian SR, Quiambao BP, Morelos AM, dkk. Bakteri dan virus etiologi
infeksi serius pada bayi Filipina yang sangat muda.Pediatr Infeksi Dis J.
1999;18(suppl 10):S50–S55.
37. Singh AK, Jain A, Jain B, dkk. Etiologi virus penyakit saluran pernapasan
bawah akut pada pasien anak yang dirawat di rumah sakit tersier: studi
prospektif satu tahun.Mikrobiol J Med India. 2014;32:13–18.
38. Chan PW, Chew FT, Tan TN, dkk. Variasi musiman dalam infeksi dada virus syncyt-
ial pernapasan di daerah tropis.Pediatr Pulmonol. 2002;34:47–51.
39. Lim JS, Woo SI, Kwon HI, dkk. Karakteristik klinis infeksi saluran
pernapasan bawah akut akibat 13 virus pernapasan terdeteksi oleh
multipleks PCR pada anak-anak.Korea J Pediatr. 2010;53:373–379.
40. Mathisen M, Strand TA, Sharma BN, dkk. Virus RNA pada pneumonia masa kanak-
kanak yang didapat masyarakat di semi-perkotaan Nepal; sebuah studi cross-
sectional.BMC Med. 2009;7:35.
41. Edwards KM, ZhuY, Griffin MR, dkk; Jaringan Pengawasan Vaksin Baru.
Beban infeksi metapneumovirus manusia pada anak kecil.N Engl J Med.
2013;368:633–643.
42. LiuWK, LiuQ, ChenDH, dkk. Epidemiologi infeksi saluran pernapasan akut pada
anak-anak di Guangzhou: studi tiga tahun.PLoS Satu. 2014;9:e96674.
43. JainA, Pande A, Misra PK, dkk. Sebuah studi rumah sakit India tentang virus penyebab
infeksi saluran pernapasan akut pada anak-anak.Mikrobiol J Med. 1991;35:219–223.
44. Feng L, Lai S, Li F, dkk. [Etiologi virus pasien pneumonia rawat inap berusia
kurang dari lima tahun di enam provinsi, 2009-2012].Zhonghua Liu Xing
Bing Xue Za Zhi. 2014;35:646–649.
45. Bezerra PG, Britto MC, Correia JB, dkk. Deteksi virus dan bakteri atipikal pada
infeksi saluran pernapasan akut pada anak di bawah lima tahun.PLoS Satu.
2011;6:e18928.
46. Saikku P, Ruutu P, Leinonen M, dkk. Mycoplasma pneumoniae dan
Chlamydia trachomatis pada infeksi saluran pernapasan bawah akut pada anak-anak
Filipina. Am J Trop Med Hyg. 1993;49:88–92.
47. Capelastegui A, Espaa PP, Bilbao A, dkk; Kelompok Studi Poblasional
Pneumonia (PSoP). Etiologi pneumonia yang didapat masyarakat dalam
studi berbasis populasi: hubungan antara etiologi dan karakteristik
pasien, proses perawatan, evolusi klinis, dan hasil.BMC Infeksi Dis.
2012;12:134.
© 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. Semua hak dilindungi undang-undang.