Modul 10 Biselmol-Rekgenmik 2022

Analisis Hasil Sanger Sequencing

WORKSHEET MODUL 10 BISELMOL-REKGENMIK 2022

ANALISIS HASIL SANGER SEQUENCING

Nama : Daniar Abdurrahman

NIM : 10420003
Kelompok :1
Asisten :

Isilah lembar kerja berikut sesuai ketentuan yang diminta. Kerjakan secara mandiri dan
jujur! Jika hasil yang anda tampilkan merupakan hasil yang tidak original, nilai anda
akan dikurangi tanpa pemberitahuan terlebih dahulu. Worksheet harus dikumpulkan
hari Senin 21 Maret 2022 pukul 16:10 di Ms Teams.
Format penamaan file worksheet: MODUL 10 BISELREKGEN_NAMA
LENGKAP_KELOMPOK X

1. Triming dan reverse complement menggunakan BioEdit

a. Lampirkan tangkapan layar bagian awal dan akhir elektroferogram primer
forward sebelum dan setelah dilakukan trimming
Sebelum trimming:

Setelah trimming:
 Modul 10 Biselmol-Rekgenmik 2022
Analisis Hasil Sanger Sequencing

b. Lampirkan tangkapan layar bagian awal dan akhir elektroferogram primer

reverse sebelum dan setelah dilakukan trimming
Sebelum trimming:

Setelah trimming:

c. Lampirkan tangkapan layar hasil sekuensing primer reverse sebelum dan

setelah dilakukan reverse complement.
Sebelum reverse complement:

Setelah reverse complement:

 Modul 10 Biselmol-Rekgenmik 2022
Analisis Hasil Sanger Sequencing

d. Jelaskan secara singkat mengapa perlu dilakukan trimming bagian awal dan
akhir elektroferogram

2. Pembuatan sekuens contig

a. Lampirkan tangkapan layar jendela sekuens contig di BioEdit

3. Anotasi sekuens menggunakan BLAST

a. Lampirkan tangkapan layar hasil blastn yang menampilkan Description, Max
Score, Total Score, Query Cover, E-value, Percent Identity, dan Accession
Number.

b. Apakah hasil blastn sesuai dengan yang diharapkan? Jika tidak sesuai yang
diharapkan, apa yang dapat menyebabkan didapatkannya hasil tersebut?
(Kaitkan dengan proses kloning gen yang dilakukan di praktikum ini - isolasi
RNA, sintesis cDNA, PCR, restriksi, ligasi, transformasi, screening transforman,
isolasi plasmid)