Anda di halaman 1dari 10

12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama

Halaman 1

Lihat metadata, kutipan, dan makalah serupa di core.ac.uk dipersembahkan oleh INTI
disediakan oleh Repositorio Digital de la Universidad Nacional de Córdoba

Discovery by Serendipity: konteks baru untuk yang lama


teka-teki

Pio Garcia

Universidad Nacional de Córdoba

Abstrak. Dalam beberapa tahun terakhir telah terjadi peningkatan besar dalam
pengembangan metode komputasi untuk kimia kombinatorial yang diterapkan pada
penemuan obat. Pendekatan penemuan obat ini kadang-kadang disebut pendekatan "rasional".
cara" untuk mengelola fenomena terkenal dalam kimia: kebetulan
penemuan. Secara tradisional, penemuan kebetulan dipahami sebagai kebetulan
temuan yang dibuat ketika penemu sedang mencari sesuatu yang lain. Ini
pola kebetulan 'tradisional' tampaknya merupakan karakterisasi yang baik dari
penemuan di mana "keberuntungan" memainkan peran kunci. Dalam pengertian ini, beberapa kegagalan awal dalam
kimia kombinatorial sering dikaitkan dengan apropriasi naif dari a
"model kebetulan" untuk penemuan ("kesalahan kebetulan"). Dalam makalah ini kami
cobalah untuk mengevaluasi pernyataan ini dengan mengkritik fondasinya. Ini akan disarankan
bahwa pengertian serendipity memiliki aspek yang berbeda dan kritik terhadap
upaya pertama dapat dipahami sebagai "kesalahan kebetulan". Kami akan menyarankan
bahwa strategi "kebetulan", semacam pencarian buta, kadang-kadang dapat dilihat sebagai
"bagian asli" dari praktik ilmiah. Sebuah diskusi akan terjadi tentang bagaimana ini
karakterisasi dapat memberi kita pemahaman yang lebih baik tentang beberapa aspek
penemuan kebetulan.

pengantar

Sejak 1980-an pendekatan baru yang disebut "kimia kombinatorial" telah digunakan untuk
mensintesis dan menyaring senyawa baru. Pendekatan ini dipandang sebagai alat yang menjanjikan
untuk mengembangkan senyawa baru dan juga untuk menemukan obat baru. Sebenarnya,
"kimia kombinatorial" adalah istilah umum yang digunakan untuk merujuk pada teknik yang berbeda dan
prosedur yang menggunakan semacam strategi "kekuatan kasar" untuk menghasilkan atau menyaring
senyawa kimia.
Mempertimbangkan dampak besar yang dimiliki pendekatan ini pada 1990-an, sekarang menjadi hal yang umum
untuk membaca ulasan kritis yang mengadopsi perspektif sejarah tentang kesalahan dan kekurangan dalam
pendekatan kimia kombinatorial pertama. Dengan mengkritik upaya pertama ini beberapa
peneliti bermaksud untuk memperbaiki 'kesalahan' sebelumnya yang diduga; yang sebagian besar
tampaknya termasuk penggunaan "pendekatan kebetulan" . 1

1
Ada beberapa kritik yang berkaitan dengan pendekatan kombinatorial keseluruhan dan tidak hanya untuk
pendekatan pertama, yang tidak dipertimbangkan di sini. Misalnya, Horrobin [7] telah menyarankan bahwa
pendekatan "buatan", atau in vitro , kimia kombinatorial tidak memperhitungkan
kompleksitas situasi in vivo . Dalam kimia kombinatorial, protein dipelajari sebagai:

Halaman 2
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 1/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama

Rupanya, ulasan itu menyiratkan bahwa kebetulan entah bagaimana mewakili


bagian irasional dari proses penemuan. Gagasan kasar ini tidak asing dalam filsafat
salah satu. Penemuan-penemuan kebetulan sebagian besar merupakan bagian dari catatan sejarah, bukan
daripada rekonstruksi filosofis.
Namun, dalam makalah ini kami akan berpendapat bahwa kebetulan lebih dari sekadar
bagian irasional dari penemuan ilmiah tertentu. Tidak dapat disangkal bahwa ada
aspek "kebetulan" dalam kebetulan yang kadang-kadang mungkin penting, namun itu
bukan aspek yang dianggap ahli kimia kombinatorial sebagai "kesalahan kebetulan".
Kata serendipity—termasuk dalam ungkapan “kesalahan kebetulan”—adalah
sebenarnya digunakan oleh para ilmuwan sendiri untuk merujuk pada "pendekatan pertama" dalam
kimia kombinatorial. Ungkapan "kesalahan kebetulan" diciptakan oleh mereka
ilmuwan sebagai cara untuk menggambarkan kesalahan utama yang dilakukan oleh peneliti pertama dalam
kimia kombinatorial.
Pada bagian pertama makalah ini kita akan menganalisis pengertian kebetulan melalui
kasus sejarah skematis untuk kemudian mengidentifikasi apa yang dimaksud dengan sisi "irasional" dari
kebetulan oleh para peneliti kimia kombinatorial. Di bagian kedua, kami
akan menyajikan beberapa bukti mengenai awal mula kimia kombinatorial dan
alasan yang mengarah pada karakterisasi parsial dari aktivitas metodologisnya di
istilah "kebetulan". Akhirnya, kami akan menjelaskan bagaimana beberapa aspek kebetulan
digunakan sebagai strategi dalam praktik ilmiah.

Apa itu serendipity?

Meskipun sains pada dasarnya dianggap sebagai usaha rasional, ada beberapa
catatan sejarah penemuan ilmiah di mana peran penting tampaknya dimainkan
oleh "kebetulan" atau oleh keadaan yang tidak disengaja. “Temuan bahagia” itu umumnya
disebut penemuan oleh 'Serendipity'.
Ada beberapa laporan tentang kebetulan: beberapa dari sudut pandang sejarah [20],
yang lain dari sudut pandang filosofis [12], dan yang lain dari kombinasi
perspektif [19]. Tetapi jika kita mencoba untuk mendapatkan karakterisasi praktik ilmiah, itu adalah
baik untuk memulai dengan melihat beberapa contoh.
Cerita tentang penemuan secara kebetulan telah sering dilaporkan dalam kimia
dan biokimia. Contoh yang sering dikutip adalah dari karya Pasteur di
kiralitas . Pada tahun 1848 di awal karirnya, Pasteur mencoba memecahkan masalah yang
Eilhard Mitscherlich telah memperhatikan: garam asam tartarat yang terbentuk dalam tong anggur adalah—
aktif secara optik (dekstrorotatori), sedangkan garam asam rasemat ditemukan pada tahap lain
dari proses fermentasi dan dengan komposisi yang sama secara optik tidak aktif [6].
Pasteur memeriksa di bawah mikroskop sampel garam asam rasemat dan dia melihat dua
jenis kristal dengan bentuk serupa tetapi tidak dapat ditumpangkan. Dia memisahkan kristal
di kiri dan kanan dengan pinset. Solusi dari setiap jenis kristal memutar
cahaya dalam arah yang berlawanan, dextrorotatory dan levorotatory.
Akun yang sangat skematis ini adalah deskripsi penelitian normal dan reguler. Tetapi
Pasteur sendiri kemudian mengenali karakter kebetulan dari penemuan ini karena

kristal atau dalam larutan berair dan bukan dalam membran lipid ( kondisi in vivo ), jadi beberapa
hits dapat ditemukan melalui kimia kombinatorial yang tidak akan efektif in vivo .

halaman 3

Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama 3

dari beberapa keadaan yang memungkinkan. Garam natrium amonium rasemat

https://translate.googleusercontent.com/translate_f 2/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama
asammekanis
cara hampir satu-satunya
[20]. Hal ini garam dari asam inibahwa
juga menunjukkan dengan
zatkristal yang dapathanya
ini mengkristal dimanipulasi
pada dalam a
suhu di bawah 26 o Celcius, dan malam sebelum pengamatan Pasteur dia telah pergi
sampel asam rasemat di jendela yang terbuka. Dalam hal ini, kebetulan dipahami
terutama melalui keadaan kebetulan yang mengelilinginya. Akun anekdotal
penemuan kebetulan menekankan ide ini. Dari perspektif ini, kebetulan adalah
hanya nama lain untuk 'temuan biasa' dan hanya bisa dijelaskan oleh sejarah atau
akun sosiologis.
Namun, ada aspek lain yang harus dipertimbangkan di luar keadaan yang tidak disengaja
dalam penemuan-penemuan yang kebetulan. Pasteur memperhatikan sesuatu yang dimiliki ahli kimia sebelumnya
diabaikan. Kedua aspek, keadaan yang tidak disengaja dan kebijaksanaan, dapat diringkas
oleh diktum terkenal Pasteur : “di bidang pengamatan, kesempatan hanya menguntungkan a
mempersiapkan pikiran”. Dalam ketegangan antara "kebetulan" dan "pikiran yang siap", yang terakhir adalah
dianggap sebagai sisi rasional dari penemuan kebetulan.
Penemuan obat-obatan baru adalah sumber yang baik dari banyak contoh "siap"
pikiran". Mungkin contoh yang paling terkenal dari penemuan obat kebetulan adalah
penisilin. Penemuan itu dibuat oleh Sir Alexander Fleming ketika dia menyadari bahwa a
sampel yang terkontaminasi dalam cawan Petri bisa menjadi sesuatu selain kesalahan. dia adalah
di tengah penelitian tentang influenza ketika dia melihat kultur Staphylococcus
bakteri yang tidak sengaja terkontaminasi oleh jamur. Alih-alih membuang sampel,
dia melakukan beberapa penelitian. Ketika Roberts [20] menceritakan kembali kisah ini, dia menunjukkan bahwa
Pengalaman Fleming sebelumnya dengan lisozim bisa jadi penting dalam pengalamannya
keputusan untuk melakukan penelitian tentang hidangan itu . Moral dari cerita ini tampaknya adalah
2

pentingnya "persepsi terampil ". Jelas bahwa penemuan Fleming adalah


dikelilingi oleh kecelakaan "bahagia", tetapi juga benar bahwa pencapaian ini mungkin terjadi
karena "pikiran yang disiapkan" dengan baik .
Dua karakterisasi terakhir, di sisi lain, tidak menghabiskan kebetulan
arti. Kasus asam salisilat yang pertama kali disintesis untuk infeksi tanpa
keberhasilan dan kemudian dimodifikasi dan digunakan untuk rasa sakit dan demam kadang-kadang dikutip; NS
Kasus minoxidil juga dilaporkan, yang terutama digunakan untuk tekanan darah tinggi, ketika
kegunaannya sebagai bantuan untuk pertumbuhan rambut secara tidak sengaja ditemukan. Dalam situasi-situasi tersebut,
serendipity dianggap sebagai aplikasi obat yang diketahui sebelumnya tanpa disadari. A
pola yang sangat mirip ditemukan dengan penemuan sintesis urea. Pada tahun 1828 Friedrich
Wöhler mencoba menyiapkan amonium sianat murni dari kalium sianat dan
amonium sulfat, tetapi yang diperolehnya adalah kristal putih yang sebenarnya adalah urea.
Beginilah cara Wöhler mensintesis senyawa organik, urea, di laboratoriumnya untuk
pertama kali. Dia mencari satu hal dan mendapatkan sesuatu yang berbeda. di semua
kasus-kasus yang menekankan "pikiran yang siap", kebetulan dilihat sebagai semacam pencarian,
yang bukan hanya arti lain dari serendipity, tetapi arti aslinya.
Penemuan kebetulan secara tradisional dipahami sebagai penemuan yang tidak disengaja
ketika penemu sedang menyelidiki sesuatu yang lain. Dari sumber ini, kebetulan
Penemuan biasanya digambarkan sebagai mencari satu hal dan menemukan yang lain. Ini
dapat disebut sebagai pola penemuan kebetulan yang 'tradisional' dan tampaknya

2
Tetapi dalam kata-kata Fleming sendiri, pengalaman sebelumnya ini dapat dilihat sebagai alasan untuk
membuang sampel tersebut.

halaman 4

arti “asli”. Seperti yang diketahui secara luas, kata "Serendipity" berasal dari Horace
Surat Walpole ditulis pada tanggal 28 Januari 1754. Dalam surat ini, Walpole mengutip sebuah "konyol" lama
dongeng” tentang tiga pangeran Serendip yang membuat penemuan melalui
"kecelakaan dan kebijaksanaan hal-hal yang mereka tidak mencari" [19]. Walpole
menyebut penemuan-penemuan semacam ini "contoh kecerdasan yang tidak disengaja " yang menyoroti
disengaja Temuan: “tidak ada penemuan hal Anda sedang mencari datang di bawah ini
deskripsi” (hal.2).
Dari contoh-contoh ini kita dapat melihat bahwa serendipity tidak mengacu pada yang sederhana
fenomena tetapi untuk aspek yang berbeda dari berbagai penemuan di luar kebetulan
keadaan. Setidaknya ada empat 'aspek' kebetulan: (a) kebetulan
keadaan, (b) semacam pencarian (c) "pikiran yang siap" atau "kecerdasan" dan (d) menemukan
sesuatu yang tidak dicari. Seperti yang telah kita lihat, aspek (d) adalah yang asli,
namun, kebetulan tampaknya didefinisikan dengan mengacu pada kasus-kasus historis – dalam sebuah
cara indeksikal - dan oleh karena itu aspek (a), (b) dan (c) dapat dianggap sebagai
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 3/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama
bagian "asli" dari gagasan itu. Tapi ternyata, tiga aspek pertama ini harus dilihat
sebagai pelengkap. Tak satu pun dari mereka secara individu dapat melambangkan penemuan dengan kebetulan,
seperti halnya untuk aspek (d). Dengan cara ini, aspek (a), (b) dan (c) hanya dapat mengacu pada
kebetulan ketika mereka digabungkan satu sama lain. Mencirikan pengertian
kebetulan dalam hal "aspek" memungkinkan kita untuk membedakan berbagai penemuan
kasus. Seperti yang ditunjukkan oleh contoh, apa yang membedakan satu kasus kebetulan dari
yang lain, kadang-kadang, adalah ada atau tidak adanya satu aspek, dan di sisi lain
relevansi aspek yang terlibat. Tetapi dalam bentuk apa pun tampak jelas bahwa gagasan tentang
serendipity tidak boleh dibatasi dalam arti (d). Ini benar-benar penting
aspek gagasan kebetulan—dan dalam pengertian genetik "yang asli". Tetapi
menolak aspek serendipity orang lain tampaknya mengarah pada hilangnya deskriptif
kapasitas penemuan sejarah. Ini mungkin konsekuensi dari fakta bahwa
gagasan kebetulan telah dibangun dengan menunjukkan kasus-kasus paradigmatik.
Dari aspek-aspek yang mencirikan pengertian kebetulan, (b) semacam pencarian, (c)
pikiran yang siap dan (d) perspektif tradisional tampaknya sangat relevan untuk mengatasi
masalah yang kita hadapi dalam kimia kombinatorial. Dengan tujuan untuk mencapai
visi yang memadai untuk memahami penemuan, dapat berguna untuk
melihat aspek-aspek ini dalam hal pemecahan masalah. Perbedaan antara aspek
serendipity dapat diartikulasikan dengan metafora pemecahan masalah yang banyak digunakan. A
aktivitas pemecahan masalah dapat diwakili oleh metafora "kepuasan" dan dalam bentuk lain
kasus dengan metafora "pencarian". Pada metafora pertama terlihat aktivitas pemecahan masalah
sebagai proses mempersempit himpunan asli melalui kepuasan didefinisikan
kendala. Dengan metafora kedua, aktivitas pemecahan masalah dipahami sebagai
gerakan dalam ruang masalah mencari keadaan solusi. Pemecahan masalah yang sama
tugas dapat dijelaskan oleh kedua metafora meskipun mereka tidak menekankan fitur yang sama
dari kegiatan pemecahan masalah.
Kami menyarankan bahwa pendekatan "pikiran yang siap" mendukung metafora "kepuasan"
dan "jenis pencarian" atau "perspektif tradisional", menekankan tugas menemukan
sesuatu yang kebetulan, dapat dipahami sebagai mendukung metafora "pencarian".
Dari pembahasan sebelumnya tidak secara langsung terlihat aspek kebetulan yang mana
dirujuk ketika para peneliti mengatakan bahwa "pergantian rasional" kimia kombinatorial
dapat dipahami sebagai 'keberangkatan' dari kebetulan.

halaman 5

Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama 5

Kimia kombinatorial dan kebetulan: pendekatan pertama

Metode kombinatorial dalam kimia biasanya terkait dengan teknik dan perangkat untuk
mensintesis sejumlah besar senyawa dan untuk menyaring bahan yang dihasilkan.
Pendekatan metodologis pertama disebut sintesis kombinatorial dan yang kedua adalah
disebut penyaringan throughput tinggi. Lebih khusus lagi, menurut Valerie Gillet,
sintesis kombinatorial “mengacu pada sintesis sejumlah besar senyawa dalam
paralel di mana molekul produk terbentuk sebagai kombinasi reagen yang tersedia atau
blok bangunan” [17] (hal. 617); penyaringan throughput tinggi "adalah proses otomatis"
dimana sejumlah besar senyawa (10 4 – 10 5 ) dengan cepat disaring untuk biologis
aktivitas” [17] (hal. 617).
Teknik kimia kombinatorial kadang-kadang digunakan untuk mengembangkan materi baru
atau untuk menemukan sifat baru dari bahan yang sudah dikenal, seperti polimer [20],
tetapi mereka terutama digunakan untuk penemuan dan pengembangan obat. Karya Merrifield
pada sintesis fase padat yang dilakukan pada awal tahun 1960-an sering disebut
sebagai salah satu asal mula sintesis kombinatorial [18]. Hari ini, ada juga solusi-
pendekatan fase untuk sintesis peptida yang memiliki keunggulan lain dan masalah lain [3].
Meski begitu, pekerjaan Merrifield tetap penting karena mewakili langkah pertama yang diambil
menuju otomatisasi seluruh proses sintetis. Otomatisasi, bersama dengan lainnya
kondisi seperti miniaturisasi, adalah bagian dari apa yang kita sebut "pendekatan pertama" di
sintesis kombinatorial . Dengan teknik ini, Merrifield mencoba mengatasi
3

"batas praktis" waktu dan hasil dalam sintesis polipeptida dengan mengusulkan a
metode "kesederhanaan dan efisiensi terbesar" [18] (hal. 178).
Pendekatan dalam sintesis kombinatorial ini, lebih dari sekedar metodologi baru,
merupakan otomatisasi metodologi tradisional dengan bantuan baru
teknik. Untuk memperkuat poin ini, kami dapat mengutip para peneliti di bidang ini bahwa

https://translate.googleusercontent.com/translate_f 4/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama
menjelaskan perbedaan antara pendekatan klasik dan pendekatan kombinatorial
oleh jenis proses yang terlibat ketika seorang ahli kimia mensintesis senyawa. pertama
kasus – pendekatan klasik- ahli kimia biasanya menggunakan proses serial dan yang kedua
huruf ahli kimia menggunakan otomatis dan paralel proses [3].
"Pendekatan pertama" terutama bergantung pada teknik dan perangkat yang memungkinkan untuk
keluaran yang lebih besar dan lebih cepat dari senyawa yang berguna, meninggalkan pertanyaan terbuka mengenai
pembatasan pencarian. Oleh karena itu, "pendekatan pertama" menggunakan pendekatan tak terbatas atau semacam
pencarian buta yang sangat kuat . Proses ini buta dalam arti dapat dianggap
proses "menghasilkan-dan-menguji- semua " dan dengan demikian kadang-kadang dibandingkan dengan kebetulan
berarti memperoleh senyawa atau obat baru.
Hal ini sangat umum bagi para ilmuwan untuk menggambarkan metodologi yang digunakan dalam "pertama"
pendekatan" dalam hal "kebetulan". Kimia kombinatorial dan HTS dengan demikian akan menjadi
"metode 'brute-force' murni berbasis kebetulan" (4). Tampaknya normal, oleh karena itu,
bahwa para ilmuwan yang terlibat dalam mengembangkan metode ini menggambarkan "pertama"
pendekatan" dalam hal kebetulan.
Rupanya, intuisi di balik "pendekatan pertama" adalah kebetulan itu, dipahami dalam
cara ini, dapat dianggap sebagai mesin dalam proses penemuan obat . Sebagai
konsekuensinya, pendapat pada waktu itu adalah bahwa "hanya meningkatkan throughput akan"
cukup untuk meningkatkan peluang menemukan senyawa bioaktif baru” [17] (hal. 617).
3
Judul artikel pertama ini adalah: “Sintesis Peptida Otomatis: peptida fase padat
sintesis, metode sintetik yang sederhana dan cepat, kini telah diotomatisasi” [18].

halaman 6

Terlebih lagi, aspek pencarian tidak terbatas atau buta dari "pendekatan pertama" adalah
dianggap sebagai metodologi yang tidak tepat untuk apa yang oleh beberapa orang disebut "the
giliran rasional" dalam kimia kombinatorial. Dan, terkadang, penilaian ini terhadap
"pendekatan pertama" disajikan dalam istilah "kebetulan". Singkatnya, "pendekatan pertama"
tidak memadai karena mengasumsikan jenis metodologi yang terkait dengan penemuan oleh
"keberuntungan".
Jadi, dalam skrining High-throughput Huser dalam penemuan obat [10], misalnya, a
strategi yang ditunjuk sebagai "kebetulan sistematis" disajikan untuk menemukan secara metodis
-- tidak lagi hanya dengan coba-coba -- "atribut samping potensial dari molekul kecil"
HTS "hits" dan senyawa lanjutan" [10] hal.318). Kubinyi juga mengatakan itu
“Sementara sintesis pertama dari perpustakaan besar peptida, turunan peptida,
peptoid, dan peptidomimetik lainnya kurang lebih mengikuti prinsip Swift a
kombinasi acak dari blok bangunan, desain perpustakaan terfokus sekarang ada di
depan” [13].
Pertanyaan kemudian muncul apakah penggunaan kata serendipity adalah
memadai untuk mencirikan "pendekatan pertama" dan, dalam arti negatif, yang berikutnya
perubahan metodologi. Seseorang dapat membuat kasus bahwa penggunaan kata ini
kebetulan hanyalah metafora — atau bahkan retoris — dan akibatnya tidak
berbicara banyak tentang perubahan metodologis ini.

"Pergantian rasional" dalam kimia kombinatorial

Hubungan negatif antara investasi ekonomi dan "pendekatan pertama"


hasilnya tidak diharapkan. Dari kegagalan praktis ini beberapa ahli kimia memperoleh lebih banyak
kritik umum kimia kombinatorial: "Segera menjadi jelas bahwa 'make-
pendekatan dan-uji-semua' tidak praktis dan tidak mungkin” [17] (hal. 617). NS
"kemustahilan" yang termasuk dalam "pendekatan pertama" dilihat di sini sebagai akibat wajar sederhana dari
sifat kombinatorial mereka. Ada contoh yang sangat sederhana yang digunakan untuk menunjukkan
masalah kombinatorial. Bahkan dengan perpustakaan sederhana dengan tiga komponen diamina,
ada 10 12 produk potensial menggunakan reagen yang tersedia secara komersial.
Banyak literatur ada tentang perubahan kimia kombinatorial dari tahun 1990-an
perspektif, yang biasanya diringkas sebagai pemahaman yang lebih "rasional" dari
tugas kimia kombinatorial; kami menyebut perubahan ini "giliran rasional" dalam kombinatorial
kimia. "Pergantian rasional" ini dapat dipahami dengan mengamati bagaimana intuitif dan
gagasan luas "desain" digunakan dalam kimia kombinatorial. Dengan menyiratkan sebuah
aspek disengaja dan direncanakan, gagasan desain ini memiliki makna rasional yang jelas.
Salah satu contoh yang paling banyak dikutip dari gagasan desain yang digunakan oleh "putaran rasional" adalah

https://translate.googleusercontent.com/translate_f 5/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama
desain obat berbasis struktur [21], di mana metode kombinatorial untuk memodifikasi dan
meningkatkan lead obat digunakan: "desain obat berbasis struktur didukung oleh komputer"
program untuk superposisi otomatis (penyelarasan) molekul, untuk fleksibel
docking ligan dan untuk desain ligan de novo yang sesuai dengan bentuk situs pengikatan
dan saling melengkapi dari sifat fisikokimia mereka” [13] (hal. 9)
Jenis "desain" lain yang termasuk dalam kimia kombinatorial baru ini adalah perpustakaan
desain, baik fisik maupun virtual. Mempertimbangkan kemungkinan besar ruang kimia, itu adalah

halaman 7

Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama 7

umum untuk membuat pilihan senyawa untuk penyaringan. Di antara metode yang digunakan
untuk tugas ini semacam seleksi "keragaman" sangat umum [13] (hal 87).
Akhirnya, tanda lain dari giliran "rasional" adalah pendekatan in silico untuk kombinatorial
kimia. Menggunakan komputer dalam kimia kombinatorial lebih menyederhanakan
otomatisasi dimaksudkan terkait dengan sintesis kombinatorial sebelumnya dan juga dibuat
eksplisit beberapa pengetahuan tentang representasi senyawa dan properti yang relevan.
Dengan strategi komputasi, pemilihan sebelumnya dibuat dari senyawa yang
akan disintesis. Pemilihan tergantung pada tujuan percobaan. Di dalam
kasus penemuan obat, dengan mempertimbangkan sifat-sifat seperti penyerapan, metabolisme,
ekskresi atau versi aturan lima Lipinski, biasanya dianggap sebagai awal yang baik
titik. Dalam istilah yang lebih umum, penyaringan virtual, atau penyaringan in silico , "mengacu pada"
penggunaan teknik komputasi untuk memilih senyawa, baik dari perpustakaan yang ada…
atau dari perpustakaan virtual yang mewakili senyawa yang berpotensi dibuat
melalui sintesis kombinatorial” [17] (hal. 618).
Pendekatan "rasional" untuk kimia kombinatorial seperti yang diwakili oleh berbeda
teknik, mengasumsikan perspektif yang bergerak menjauh dari pencarian tak terbatas,
sedangkan "pendekatan pertama" dalam kimia kombinatorial mengidentifikasi kebetulan dengan
pencarian tidak terbatas atau buta. Penilaian negatif dari "pendekatan pertama" tersirat
oleh "perputaran rasional" menunjukkan bahwa aspek kebetulan yang dipertimbangkan di sini juga bukan
terkait dengan keadaan atau "pikiran yang siap", tetapi untuk jenis pencarian tertentu.
Akibatnya, jika kita menghubungkan metafora yang kita usulkan sebelumnya – kepuasan
dan cari – menurut diktum Pasteur, hasilnya tampaknya adalah metafora kepuasan
berada di sisi rasionalitas dan metafora pencarian mewakili bagian irasional dari
keberuntungan.
Ini mengarah pada dua pertanyaan: yang pertama terkait dengan apakah gagasan tentang
"kesalahan kebetulan", seperti yang diartikulasikan oleh mereka yang mengkritik "pendekatan pertama" di
kimia kombinatorial, digunakan dalam arti metaforis atau dapat digunakan sebagai
penerapan konsep serendipity yang akurat. Pertanyaan kedua adalah apakah
jenis pencarian tertentu yang tampaknya mencirikan "pendekatan pertama" selalu merupakan
strategi irasional.
Terkait dengan pertanyaan pertama: jika, seperti yang telah kita lihat, salah satu aspek yang melaluinya
gagasan kebetulan dapat dilihat adalah pencarian buta — dalam hubungannya dengan yang lain
aspek — kemudian atribusi istilah "kebetulan" oleh mereka yang mengkritik yang pertama
maksud dalam kimia kombinatorial tampaknya merupakan penggunaan yang tepat dari konsep kebetulan.
Kemungkinan penggunaan ini dilatarbelakangi oleh banyaknya kasus obat baru
penemuan di mana aspek "acak" terlibat; meskipun demikian, jika analisis kami tentang
gagasan kebetulan itu benar, maka semacam "pencarian buta" harus dipertimbangkan dan
aspek sebenarnya dari kebetulan. Di sisi lain, pertanyaan tentang evaluasi
pencarian buta "pendekatan pertama" membutuhkan analisis terpisah.

"Kesalahan kebetulan" dipertimbangkan kembali: pencarian buta

Evaluasi negatif giliran rasional dari "pendekatan pertama" tampaknya termotivasi dalam
prinsip dengan pertanyaan praktis: investasi ekonomi yang dibuat dalam penelitian ini
program tidak memberikan hasil yang diharapkan. Selanjutnya, munculnya baru

https://translate.googleusercontent.com/translate_f 6/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama

halaman 8

teknik untuk penemuan obat yang mengadopsi pendekatan desain yang digunakan kombinatorial
prosedur kimia, namun dalam batasan yang sangat berbeda. Tapi bisakah kita?
menggeneralisasi pertimbangan ini?
Di sini diasumsikan bahwa segala jenis pencarian buta selalu tidak rasional dan bahwa
sains sebenarnya adalah usaha yang rasional. Tapi asumsi sebelumnya tentang buta
pencarian dapat dikurangi dengan mempertimbangkan konteks kreatif dan mempertimbangkan
praktik ilmiah.
Pertama, dapat dikatakan, mengikuti Donald Campbell [5], bahwa semacam pencarian buta
adalah strategi yang baik ketika kita berhadapan dengan kreativitas. Ada diskusi klasik
dalam pemecahan masalah tentang bagaimana mendapatkan kebaruan asli sebagai solusi untuk masalah jika
definisi masalah melibatkan deskripsi tujuan yang sudah diketahui –
Paradoks Meno klasik. Pencarian "tidak terarah" atau buta adalah jawaban untuk ini
paradoks yang diajukan oleh beberapa filsuf karena solusi untuk suatu masalah bukanlah
perlu diantisipasi dan, setidaknya pada prinsipnya, bidang penemuan obat adalah milik
dalam konteks kreativitas. Kedua, tampaknya dalam praktik ilmiah terkadang
semacam pencarian buta bisa menjadi strategi asli. Temuan "mengejutkan" dalam sains adalah
biasanya digambarkan sebagai kebetulan karena "kebutaan" diasumsikan dalam
reaksi psikologis penemunya. Faktanya, para peneliti dalam psikologi kognitif
mengusulkan heuristik "kejutan" untuk memodelkan fitur pemecahan masalah ini. Kita dapat
memahami strategi ini sebagai cara untuk menemukan solusi. Misalnya, menurut
Serratosa [23], di bidang sintesis kimia ada ruang untuk temuan yang tidak direncanakan,
dan Woodward berbicara tentang “mengambil keuntungan dari kejutan yang mungkin terjadi
selama pelaksanaan sintesis” [23] (hlm. 74). Namun, cara penyajian ini
"kebutaan" mengaburkan perbedaan antara kepuasan dan metafora pencarian
dijelaskan sebelumnya. Jika perbedaan ini penting, maka kita harus membedakan antara
temuan buta dan pencarian buta. Akibatnya, kutipan di atas tentang
sintesis kimia harus dianggap sebagai semacam penemuan buta tetapi bukan sebagai semacam
pencarian buta. Tampaknya perbedaan utama di sini bukanlah konteks terstruktur di mana
penelitian dilakukan, tetapi strategi tertentu yang digunakan dalam beberapa tahap penelitian. Kita
dapat mempertimbangkan beberapa keadaan sintesis glutamin atau penemuan ornitin
cyle yang dibuat oleh Krebs, sebagai contoh pencarian buta.
Psikolog kognitif telah mempelajari penemuan-penemuan oleh Krebs dan membuat
rekonstruksi komputasi. Dalam beberapa rekonstruksi, strategi awal adalah
digambarkan sebagai "luas-pertama" dan kemudian setelah penemuan sebagai "kedalaman-pertama" [13], menggunakan
ide pemecahan masalah sebagai pencarian di pohon contoh. Pencarian jenis pertama,
"breadth-first" biasanya berguna ketika kita tidak memiliki banyak informasi yang relevan
tentang tempat (di dalam "pohon") di mana solusinya. Oleh karena itu, ini adalah semacam
pencarian tidak terbatas . Di sisi lain, pencarian "dibatasi" ke salah satu dari
"cabang" pohon ketika ada indikasi positif bahwa solusinya ada di
beberapa simpul di bawah cabang itu.
Seperti yang telah ditunjukkan oleh Frederick Holmes, Krebs tidak memiliki pengetahuan yang relevan
tentang bagaimana seharusnya mekanisme metabolisme perantara. Saat itu, ada
adalah teori tentang operasi metabolisme antara [9] yang bisa memiliki
menarik ilmuwan yang lebih terlatih. Namun demikian, Krebs tidak memiliki cukup
pengetahuan untuk melihat keanggunan teori-teori tersebut [8]. “Setelah kurang dari satu tahun
pelatihan sistematis dalam kimia, ia tidak memiliki pengetahuan yang luas tentang

halaman 9

https://translate.googleusercontent.com/translate_f 7/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama

Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama 9

sifat dan reaksi senyawa organik yang diperlukan untuk menalar secara mendalam tentang
langkah-langkah metabolisme yang paling mungkin, berdasarkan teori, terjadi. Jika dia
kurangnya pengetahuan ahli dalam reaksi organik membuatnya sulit untuk memilih
kemungkinan teoretis yang paling menjanjikan sebelumnya, itu membebaskannya pada saat yang sama dari
beberapa bias yang dibangun ke dalam kerangka konseptual di mana orang lain beroperasi.
Dia menjadi pemindai investigasi, menatap bolak-balik melintasi eksperimennya
cakrawala untuk efek yang tidak biasa” [8] (hal. 273).
Oleh karena itu, beberapa tahap pencarian Krebs dapat digambarkan sebagai "buta" atau
“tidak dibatasi” oleh pengetahuan sebelumnya. Pencarian harus mendekati lengkap – dalam a
pengertian pragmatis- jika kita tidak memiliki petunjuk tentang sifat atau tempat di mana solusinya
adalah. Pencarian yang nyaris tidak dipandu seperti itu bisa sangat sensitif terhadap hasil anomali apa pun:
Pendekatannya adalah salah satu pencarian coba-coba, mencoba banyak hal karena dia tidak
habiskan banyak waktu untuk berolahraga terlebih dahulu, mana yang memiliki peluang terbaik untuk
kesuksesan...; karena itu, dalam arti tertentu, dipaksakan padanya oleh ketidakhadiran dalam repertoarnya, dari
strategi heuristik cukup untuk membimbingnya lebih langsung menuju solusi untuk nya
masalah” [8] (hal. 272).
Jika pertimbangan ini benar, maka kita harus lebih berhati-hati ketika kita
mengevaluasi pencarian buta atau tidak terbatas. Kita harus menekankan bahwa strategi tersebut adalah
diterapkan dalam konteks ilmiah yang sangat terbatas dan jika strategi ini berhasil dalam
lingkungan ilmiah, dalam parameter ilmiah normal, kami akan menganggapnya sebagai
heuristik daripada aturan algoritmik.

Kata-kata terakhir

Kami memulai makalah ini dengan mendefinisikan "giliran rasional" dalam kimia kombinatorial sebagai
keberangkatan dari kebetulan. Dalam pengertian ini, upaya pertama dalam sintesis kombinatorial
dipandang sebagai semacam pendekatan "irasional" atau "kebetulan". Ini membawa kita ke
pertanyaan apakah penggunaan kata serendipity benar atau tidak atau jika, pada
sebaliknya, itu hanya metafora dan ketika berbicara tentang kebetulan, kita bisa
mengacu pada berbagai aspek penemuan. Mempertimbangkan kritik yang dibuat oleh
"giliran rasional" dalam kimia kombinatorial, kami mengidentifikasi pendekatan kebetulan
tersirat dalam "upaya pertama" sebagai jenis "pencarian buta". Dengan cara ini,
"kesalahan kebetulan" dalam upaya pertama dalam sintesis kombinatorial adalah kesalahan buta atau
pencarian tidak terbatas. Kami mencoba, kemudian, untuk melemahkan penegasan bahwa pencarian buta adalah
selalu irasional dengan menunjukkan bagaimana pencarian semacam ini bisa menjadi strategi yang baik dalam
konteks kreatif dan dalam konteks ilmiah tertentu.
Beberapa orang mungkin mengatakan bahwa gagasan kebetulan adalah atau terdiri dari cara-cara "kebetulan" untuk
menemukan sesuatu, jadi keseluruhan proyek mencari semacam "rasionalitas" di sini adalah
menyesatkan. Namun, kami mencoba menunjukkan kebetulan itu, selama itu didefinisikan dalam
cara pamer, memiliki arti yang berbeda, dan ketika digambarkan sebagai "kebetulan"
kesalahan" dalam kimia kombinatorial adalah pencarian buta dan bukan keadaan yang tidak disengaja
atau bahkan menyiapkan pikiran. Dalam pengertian ini, kita dapat menganggap penggunaan gagasan tersebut sebagai asli
kebetulan oleh mereka yang mengkritik "pendekatan pertama". Khususnya, penggunaan
kebetulan tampaknya sah mengingat jenis pencarian tertentu yang akan
merupakan "bagian kebetulan dari beberapa penemuan". Kami menegaskan bahwa penelitian

halaman 10

10

dilakukan oleh maksud pertama dalam kimia kombinatorial tidak—dengan cara apa pun—
hanya pencarian buta. Label “kesalahan kebetulan” ini, dan implikasi negatifnya,
hanya muncul dalam konteks kontras yang digunakan oleh mereka yang melakukan lebih banyak
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 8/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama
pencarian canggih melalui apa yang disebut "giliran rasional".
Pertanyaan tentang apa yang termasuk dalam pengertian kebetulan—dan apa itu
harus mencakup—dapat diperdebatkan. Saya telah menyarankan itu untuk tujuan melestarikan
kapasitas deskriptif dalam kaitannya dengan kasus-kasus historis, mereka harus mencakup aspek-aspek
disajikan. Namun, aspek-aspek itu saja tidak cukup untuk memberi label sesuatu sebagai
kebetulan. Meskipun demikian masalahnya sekarang dapat dipertimbangkan dalam kaitannya dengan apa yang
ekspresi "kesalahan kebetulan" meliputi. Apa yang tampaknya telah dilakukan para ilmuwan
mengambil aspek yang pasti asli dari gagasan kebetulan- pencarian buta- dan
mengisolasinya untuk membuat referensi ke strategi metodologis. Dalam pengertian ini,
diskusi tentang ungkapan "kesalahan kebetulan" tampaknya dibenarkan secara metodologis
ketentuan. Namun, masalah ini harus dipertimbangkan dengan independensi tertentu dari
yang mengacu pada kemungkinan memulihkan jenis pencarian buta tertentu di dalam
praktik ilmiah, dan dengan cara ini kita memiliki cukup untuk mengevaluasi jangkauan yang tepat dari
kritik dari mereka yang bekerja di kimia kombinatorial4.

Pengakuan
Saya ingin mengucapkan terima kasih kepada dua wasit anonim dan terutama kepada editor untuk mereka
komentar bermanfaat dan bijaksana pada versi sebelumnya dari makalah ini.
Saya juga ingin mengucapkan terima kasih kepada FONCYT atas hibah penelitian yang mendukung pekerjaan
makalah ini, serta Secyt (Universidad Nacional de Cordoba).

Referensi :

4
Dapat dikatakan juga bahwa jika kita memahami hubungan antara 'irasional' dan
'rasional' diasumsikan oleh "giliran rasional" dalam kimia kombinatorial sebagai kontinum, maka kita
hanya bisa berbicara tentang strategi "kurang rasional" dan bukan tentang strategi "irasional". Di sana
juga merupakan versi yang lebih radikal dari kritik ini. Pembahasan dalam kimia kombinatorial adalah
bukan tentang rasionalitas tetapi tentang "efektif" atau "tidak efektif", jadi giliran rasional harus
ditafsirkan secara pragmatis, bukan secara “epistemis”. Referensi umum untuk
jumlah uang yang diinvestasikan dalam teknik dan perangkat tersebut sebagai dukungan parameter yang relevan
pandangan terakhir ini. Namun demikian, menurut contoh, poin utamanya bukan tentang
rasionalitas itu sendiri: ini tentang strategi mana yang boleh kita gunakan dan apakah atau tidak
mencari dengan cara 'buta' adalah pilihan yang bijaksana. Bisa juga dikatakan bahwa pencarian buta untuk
penemuan obat adalah strategi yang baik hanya jika obat didistribusikan secara homogen dalam
ruang yang akan dicari. Asumsi terakhir ini tampaknya salah, jadi pencarian buta hanya akan
menjadi buang-buang waktu. Namun, kami tidak menganggap bahwa "strategi buta" dapat dianggap sebagai
strategi reguler. Jika ada hubungan antara kebetulan dan kreativitas, maka kita harus
berasumsi bahwa pencarian buta bukanlah jalan yang umum. Akibatnya, kami tidak dapat merekomendasikan a
pencarian buta untuk penelitian normal, tetapi kita dapat menggunakannya sebagai penjelasan untuk beberapa dan
peristiwa yang sangat langka dalam sains.

halaman 11

Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama 11

1. Bayley, M. Gillet, V. dan Willett, P. Analisis Komputasi Molekuler


Keanekaragaman untuk Penemuan Obat, RECOMB, ACM (1999).
2. Bajorath , J. (sunting) Kemoinformatika: Konsep, Metode, dan Alat untuk Obat
Penemuan, Vol. 275. Humana Press, 2004
3. Stan; Marijke Dreef-Tromp; Hermkens, de Man; Survei Ottenheijm pada Solid-
Fase Reaksi Organik dalam Jung, G (1999).
4. Bleicher, H. Konrad, dkk. Generasi Hit dan Pemimpin: Melampaui Throughput Tinggi
Penyaringan. Ulasan Alam, Penemuan Obat. 2003 Mei:(2), 369-378.
5. Campbell, D. "Evolusi Epistemologi." Dalam Filosofi Karl R. Popper
diedit oleh PA Schilpp, 412-463. LaSalle, IL: Pengadilan Terbuka. (1974).
6. García, P. "Interaksi antara Sejarah Sains dan Komputasi Otomatis
Discovery: A Two Way Road", dalam "Aspek interdisipliner Manusia-Mesin
Ko-eksistensi dan Kerjasama" (Prosiding) Marik, V.; Jacovkis, P;
Stepanokova, O.; Klema, J. (sunting), Universitas Teknik Ceko, Praha (2005).
7. Hoffmann, R. Sama dan Tidak Sama, Columbia University Press, Baru
York, (1995).
8. Holmes, F., Hans Krebs: Pembentukan Kehidupan Ilmiah 1900-1933, Vol. 1.
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 9/10
12/8/21, 9:28 AM Discovery by Serendipity: konteks baru untuk teka-teki lama

Pers Universitas Oxford, Oxford. (1991).


9. Horrobin, D. Inovasi dalam industri farmasi, JR Soc Med; 93: 341-345.
(2000).
10. Huser, J. Skrining throughput tinggi dalam penemuan obat Weinheim : Wiley-VCH,
c2006. (Seri: Metode dan prinsip dalam kimia obat; v. 35)
11. Jung, G. "Kombinatorial Kimia", Wiley-VCH, Verlag (1999).
12. Kantorovich, A. Penemuan ilmiah: logika dan mengutak-atik. Albany: Negara Bagian
Pers Universitas New York. (1993).
13. Kubinyi H. Peluang berpihak pada pikiran yang siap — dari kebetulan hingga obat rasional
desain. J. Penerimaan Sinyal Transduksi Res. 1999; 19:15-39.
14. Kulkarni, D.; Simon, HA “Proses penemuan ilmiah: Strategi
eksperimen” Ilmu Kognitif , 12, 139-175. (1988).
15. Lamb, C. dan Perun, Thomas J., (editor), Desain Obat Bertarget Asam Nukleat,
M. Dekker, New York, (1992).
16. Leach, A.; Hann, M. Dunia perpustakaan virtual in silico, DDT Vol. 5, Tidak 8,
Agustus (2000).
17. Leach, A; Gillet, V. “Pengantar Kemoinformatika”, Kluwer Academic
Penerbit (2003).
18. Merrifield, Sintesis Peptida Otomatis: sintesis peptida fase padat, a
metode sintetis sederhana dan cepat, kini telah otomatis, Science, vol. 150
(Okt. 8) hlm. 178-185. (1965).
19. Merton, R., dan Barber, E. Perjalanan dan Petualangan Serendipity: Sebuah Studi di
Semantik Sosiologi dan Sosiologi Ilmu. Princeton, NJ: Princeton
Pers Universitas, (2004).
20. Roberts, R. Serendipity: Penemuan yang Tidak Disengaja dalam Sains, New York: Wiley,
(1989).
21. Salemme FR, Spurlino J, Bone R. Serendipity memenuhi presisi: integrasi
desain obat berbasis struktur dan kimia kombinatorial untuk obat yang efisien
penemuan. Struktur . (1997) 15 Maret;5(3):319-24.
22. Sanders, J. "Perpustakaan polimer yang diperoleh dengan teknik kombinatorial mempercepat"
dan meningkatkan desain dan pengujian material baru” Institut Georgia
Teknologi, (2004).
23. Serratosa, F. dan Xicart, J. Kimia Organik dalam Aksi (Studi dalam Organik
Kimia), Elsevier Science, (1996).

halaman 12

12

24. Van Andel, P. "Anatomi temuan yang tidak dicari: kebetulan: asal, sejarah,
domain, tradisi, penampilan, pola, dan kemampuan program." British Journal
untuk Filsafat Ilmu, 1994, 45(2), 631-648.

https://translate.googleusercontent.com/translate_f 10/10

Anda mungkin juga menyukai