Abordagens e Mtodos Estatsticos em Ecologia

Por que no apenas mtodos estatsticos? Existe mais de um abordagem aos mtodos estatsticos A estatstica tem um papel fundamental na produo do conhecimento cientfico. Qual?

Prof. Marcus Vincius Vieira - Instituto de Biologia UFRJ

 Variao na natureza e em experimentos cuidadosos e controlados:

Indivduos Locais Tempo
O objetivo da estatstica dizer-nos o quanto devemos ficar surpresos com os nossos resultados (George Estabrook, University of Michigan).

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 Exemplo comum: h uma hiptese a ser testada e coletam-se dados para test-la (ou mais corretamente, falsificar uma hiptese nula). Embabas (gnero Cecropia) e formigas associadas: relao seria mutualstica, as formigas protegendo a planta contra herbvoros.
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Abordagem de hiptese nula

A presena de herbivoria nas folhas foi avaliada em embabas (Cecropia pachystachia) com e sem formigas, e foram encontrados os seguintes resultados: Com formigas Praticamente ausente Com herbivoria 34 72 Sem formigas 4 12

Os resultados apiam a hiptese, ou melhor, falsificam a hiptese nula de no haver diferenas reais entre ter formigas ou no?
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 Podemos determinar a chance de obter estes resultados dada a hiptese nula. A frequncia de obter estes resultados devido a processos aleatrios definida como a probabilidade de obter os resultados dada a hiptese nula. No caso anterior, esta probabilidade de 0,19. Podemos dizer ento que a hiptese nula correta?

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Outra abordagem: hipteses mltiplas

A herbivoria em embabas pode ser afetada tambm pela distncia borda da mata ou da trilha. Hiptese 2: Prxima borda da mata ou trilha Praticamente ausente Com herbivoria 6 71 Interior da mata

32 13

Pode ainda ser afeta pela idade da planta, ou por uma combinao destes fatores. Quantas hipteses formuladas a priori podemos ter?
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 Podemos calcular a chance ento de cada uma destas hipteses ser verdadeira, considerando os resultados obtidos. um raciocnio inverso: considerando os dados (no a hiptese nula), qual a chance de cada uma das hipteses alternativas ser verdadeira? Para diferenciar de probabilidade como definida antes, vamos chamar esta chance de verossimilhana (likelihood). Segundo um critrio definido, podemos ento ordenar as hipteses em termos de seu ajuste aos dados e dizer quais as mais apoiadas.
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 Dentro de cada uma destas duas abordagens podem haver formas diferentes para estimar as probabilidades dos valores observados segundo uma hiptese nula (1. abordagem), ou a verossimilhana (likelihood) de cada hiptese aos dados obtidos.

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 De onde vem a abordagem tradicional da estatstica, de teste de hipteses atravs da tentativa de falsificao de uma hiptese nula? O mtodo cientfico, ou mais precisamente, o mtodo hipotticodedutivo da cincia.

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 O que um mtodo cientfico?

Mtodos cientficos: combinaes de raciocnio indutivo e dedutivo

Um mtodo que compare e decida entre hipteses (no teorias!) baseando-se em observaes e previses baseadas nas hipteses. No h apenas um nico mtodo de fazer isso.
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 Deduo: parte do geral para o especfico.

Em cincia, parte afirmaes ou teorias gerais para formular hipteses especficas para uma situao.

Induo: parte do especfico para o geral. Na sua forma mais simples, a partir do acmulo de observaes em casos especficos formula-se uma hiptese geral para explicar os dados. Seria o Inducionismo de Francis Bacon (1561-1626).
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 Deduo: 1. Todas as aranhas papa-moscas e saltadoras pertencem famlia Salticidae. 2. Coletei uma aranha saltadora. 3. Esta aranha da famlia Salticidae. Induo: 1. Todas estas 25 aranhas so da famlia Salticidae. 2. Todas estas 25 aranhas so papa-moscas e saltadoras. 3. Todas as aranhas papa-moscas e saltadoras pertencem famlia Salticidae.

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 Alguns filsofos definem deduo como inferncia certa, e induo como inferncia provvel. Concordam?
A deduo para ser inferncia certa assume que a afirmao totalmente confirmada e sem excees, o que em geral no verdade. Se a inferncia feita a partir de uma afirmao ou teoria bem estabelecida, a deduo ser mais restrita, em geral a um sistema ou organismo especfico de estudo. A induo pode gerar novas afirmaes ou teorias mais amplas.
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Os mtodos estatsticos so indutivos ou dedutivos?

Podem ser ambos, mas quando h um teste de hiptese baseado em hiptese nula e alternativa, o tradicional hipottico-dedutivo Quando estimamos parmetros de um modelo a partir dos dados, estamos fazendo induo.
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O mtodo indutivo de Francis Bacon

Enfatizava que a hiptese deveria ser sugerida, ou mais corretamente, implicada a partir dos dados. A partir da hiptese assim gerada seriam feitas previses a serem testadas com novos dados (deduo!). Caso as previses fossem corretas, a hiptese seria corroborada; caso no, a hiptese tinha que ser modificada para acomodar as novas observaes, e novas dados eram coletados para testar novas previses. Este ciclo de hiptese-previso-observao repetido e a cada ciclo a hiptese ser torna mais verdadeira, ou geral. Assim, uma caracterstica do inducionismo de Bacon trabalhar com uma nica hiptese, que muda continuamente com novas observaes.
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O mtodo hipotticodedutivo de Karl Popper

nfase na deduo como mtodo cientfico se inicia partir de Isaac Newton e outros cientistas do sc. XVII Atinge seu maior status atual com os trabalhos do filsofo Kark Popper e do crculo de Vienna em torno de 1935, formulando o mtodo hipottico-dedutivo. Talvez a maior inovao de Popper tenha sido a formulao de hipteses mltiplas como passo inicial da investigao cientfica. Estas hipteses seriam todas elaboradas para explicar observaes iniciais, sendo testveis e gerando previses distintas umas das outras. Haveria ento tentativas de falsific-las atravs de experimentos que permitiriam testar suas previses. Apenas as que sobrevivessem ao teste (no falsificadas) seriam mantidas.
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Quais a limitaes dos mtodos indutivo e hipottico-dedutivo?

preciso haver uma hiptese correta entre as alternativas, isto , uma no-falsificvel. No mtodo indutivo pode-se comear com hipteses incorretas, que sero alteradas com novas observaes. As hipteses tm efeitos distintos. No possvel testar hipteses como efeitos redundantes em algum grau. Com a induo possvel incorporar efeitos mltiplos numa hiptese complexa.
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 O teste de hipteses a partir da tentativa de falsificao de hipteses nulas a implementao do mtodo hipotticodedutivo de Popper. De forma geral, a hiptese nula uma hiptese estatstica, que tentamos refutar, ou melhor, falsificar. Idealmente, deve haver apenas uma hiptese alternativa, que seria ento aceita. Se houver mais de uma hiptese, estas devem fazer previses distintas sobre os resultados, permitindo falsificar todas menos a verdadeira.
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 isto o que acontece?

Em geral, so necessrios novos experimentos, com delineamentos distintos, para distinguir cada uma (cada experimento com uma hiptese nula).

O que implica dizer que um valor de P significativo?

que a probabilidade dos resultados ocorrerem dada a hiptese nula menor que o valor arbitrado (em geral 0,05). Que a hiptese nula foi falsificada pelos resultados. Se houver mais de uma hiptese alternativa ter que haver algum critrio para decidir entre elas (frequentemente no possvel sem novos experimentos)
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 E que um valor de P no significativo?

que a probabilidade dos resultados ocorrerem dada a hiptese nula maior que o valor arbitrado, em geral 0,05. Que a hiptese nula verdadeira?

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Mtodos cientficos e a construo de teorias cientficas

Teorias no sentido cientfico so um conjunto de conceitos e relaes entre eles, construdos a partir de mtodos cientficos, que fornecem uma explicao para um conjunto de fenmenos. Hipteses so explicaes possveis para fenmenos especficos. Podem ser geradas a partir de teorias ou conhecimento emprico, mas para serem cientficas precisam ser testveis com um mtodo cientfico. Uma rea de conhecimento para ser chamada de cientfica precisa de dois elementos bsicos: usar um mtodo cientfico e ter teorias construdas para explicar os fenmenos. Usar mtodos cientficos para decidir entre hipteses uma atividade cientfica, mas para ser parte de uma cincia preciso que as hipteses sejam geradas a partir Prof. Marcus Vincius Vieira - Instituto de Biologia UFRJ de um corpo terico.

 Uma teoria pode ser testada com um nico experimento ou observao?

Diferena entre mtodo cientfico e mtodo de construo de uma teoria cientfica

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 Thomas Kuhn (1922-1966) a cincia e suas teorias no so construdas segundo as prescries do crculo de Vienna. O corpo terico no pode ser testado por experimentos ou observaes simples, que mesmo que estejam discordando do corpo terico podem ser acomodadas. Constituiria um paradigma, um conjunto de premissas que seriam feitas para a construo de hipteses. S quando o conjunto e observaes conflitantes e a comunidade cientfica como um grupo social estivessem prontos, haveria substituio do corpo terico por um novo, resultando em revolues cientficas.

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Imre Lakatos (1922-1974)

Lgica semelhante a de Thomas Kuhn, mas definindo a atividade cientfica atravs de Programas de Pesquisa Cientficos

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 Onde se encaixa a estatstica contempornea neste contexto? Estatstica frequentista e alternativas:

Seleo de modelos Estatstica Bayesiana
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Probabilidade eEstatstica
Estatstica necessriadevido existnciade variaonanatureza,entreindivduos,entrelocais,e notempo,mesmosobasmesmascondiese tratamentoexperimental. Estavariaogeraincertezaquantoaumresultado oupreviso.Senohouvessevariaosaberamos exatamenteoqueaconteceriaenoprecisaramos deestatstica. Comomedirprobabilidade?

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Eventos eresultados
Aprobabilidade deumevento nico:captura depresas por plantas carnvoras Evento processo simplesem que h umincio efim bem definidos Exemplo:
Plantas carnvoras:apenas alguns dosinsetos que visitam aplanta caem em sua armadilha.Comoestimar aprobabilidade deum inseto que visita aplanta cair em sua armadilha? Evento visita aplanta Resultados possveis captura ou fuga (resultado discreto)

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 Oresultado discreto porque podemos designar um nmero inteiro positivo para cada um:1 captura;2 fuga. Oconjunto detodos os possveis resultados oespao amostral. Nocaso,oespao amostral umconjunto discreto. Cada inseto que visita aplanta consiste em uma tentativa ou replica. Oconjunto dereplicasformaumexperimento (nosentido estatstico,mais amplo).

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 Visitas(=tentativas)=3000 Capturas=30 Probabilidadequeuminsetovisitandoaplantaseja capturado:30/3000=0.01 Estaprobabilidadenoentanto, limitadaaoespao amostral analisado. Comopodemostornaroresultadomaisgeral?Como inferirseestaaprobabilidaderealnapopulaocomoum todo? Delinearumexperimentoparainferira probabilidadenapopulaoqueuminsetovisitandouma plantasejacapturado

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Problemascomadefiniode probabilidade
Restrita formacomodeterminamos, medimosoevento Ex.:sensoresnasfacesdamoeda Plantascarnvoras:variaoentre indivduos,tiposdepresas,poca,etc.

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Matemtica das Probabilidades

Definindooespaoamostral Visita={(Captura),(Fuga)} Primeiroaxiomadeprobabilidade: Axioma1:Asomadetodasasprobabilidades deresultadosdentrodeumespaoamostral = 1,0 Oseventostmquesermutuamente exclusivos eoespaoamostral completo (exhuastive) paraquesejaverdadeiro
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Besourodemanchas laranjas(hipottico):
aolongodavidatemapenasduasproles, digamosaeb a=primeiraproleb=segundafeira Comorepresentaroespaoamostral daaptido destebesouro? ={a,b } Digamosqueaebpodemser2,3ou4 Comoseriaoespaoamostral ento?

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 {(2,2),(2,3),(2,4),(3,2),(3,3),(3,4),(4,2),(4,3), (4,4)}

Assumindoqueaprobabilidadedecadaum igual eseguindooAxioma1,qualaprobabilidade decadaresultado?

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EventoscomplexosxeventoscompartilhadosouAdio xmultiplicaodeprobabilidades
Eventos complexos:Evento Xpode serresultado doEvento A ou Evento Bou Evento C Portanto,oEvento Xpoder ocorrer demais deuma formaou caminho Ex.Besouros demanchas laranjas (Gotteli &Ellison).Nmero totaldefilhotes ao longo da vida,sendo que temapenas duas proles (litters),comummnimo de2eummximo de4 filhotes por prole. Qual aprobabilidade deter umsucesso reprodutivo ao longo da vida de6filhotes?(5min.para resolver)
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 {(2,4),(3,3),(4,2)}
6 proles
(2,2) (2,3) (2,4) (3,3) (4,3) (3,2) (4,4) (3,4)

Aptido

(4,2)

6 proles um subconjunto prprio do conjunto Aptido 6 proles Aptido

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Eventos complexos
Segundoaxiomadeprobabilidade: Axioma2:aprobabilidadedeumevento complexo igual somadas probabilidadesdosresultadosque compemesteevento. Oevento6prolesaolongodavida complexo.
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Eventos compartilhados ou simultneos

Qualaprobabilidadedeocorrnciado EventoAeEventoBeEventoC? Probabilidadesimultneadedoisoumais eventos. SEFOREMINDEPENDENTES,PREMISSA CRUCIAL,bastamultiplicarsuas probabilidades.
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Eventos independentes
Doiseventossoindependentesseoresultadodeum eventono afetadopeloresultadodooutro. Ex.Qualaprobabilidadedeumindivduodobesouroter prolesde2e4filhotesaolongodavida?Bastamultiplicar aprobabilidadedeterumaprimeiraprolede2peladeter umaprolede4nasegunda. Sendo1/3cadauma(DiagramadeVenn),ento1/9. Seforemindependentes,amultiplicao igual interseoentredoisconjuntosdeeventos: P(A B)=P(A).P(B)

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 {(2,4),(3,3),(4,2)}
6 proles
(2,2) (2,3) (2,4) (3,3) (4,3) (3,2) (4,4) (3,4)

Aptido

(4,2)

6 proles um subconjunto prprio do conjunto Aptido 6 proles Aptido

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Asclepias elargartas deborboletas Monaca

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 P(R)=0,20 P(no R)=1 P(R)=0,80 P(C)=0,70 P(no C)=1 P(C)=0,30 Todas asplantas elagartas podem dispersar e alcanar todas asmanchas dehabitat, independentemente uma da outra. Populaes locais deAsclepias sempre persistem na ausncia delagartas, mas quando lagartas esto presentes s populaes resistentes persistem.
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Probabilidades deeventos compartilhados (mas independentes!)

Evento compartilhado Clculo [1 - P(R)] x [1 - P(C)] = (1,0 - 0,2) x (1,0 - 0,7) = 0,24 [1 - P(R)] x [P(C)] = (1,0 - 0,2) x (0,7) = 0,56 [P(R)] x [1 - P(C)] = (0,2) x (1,0 - 0,7) = 0,06 [P(R)] x [P(C)] = (0,2) x (0,7) = 0,14

Asclepias
presente ?

Lagartas presentes ?

Populao suscetvel e nenhuma lagarta Populao suscetvel e lagartas presentes Populao resistente e nenhuma lagarta Populao resistente lagartas presentes

Sim

No

No

Sim

Sim

No

Sim

Sim

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 Quatroeventoscompartilhados.Formam umconjuntofechado? 0,24+0,56+0,06+0,14=1,00 Qualaprobabilidadedepersistnciade Asclepias comestasprobabilidades? 0,24+0,06+0,14=0,44

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Regrasparacombinarconjuntosdeeventos complexosecompartilhados
Retornandoaobesourodemanchaslaranjas:duasproles aolongodavida,mas Eseonmerodefilhotesdasegundaproletemalguma relaocomonmeroproduzidonaprimeiraprole? Istomudariaaprobabilidadedeobter6prolesaolongo davida? Suponhaqueoespaoamostral contenhadoiseventos:
besourosquetenhamexatamentedoisfilhotesnaprimeiraprole Besourosquetenhamquatrofilhotesnasegundaprole

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Aptido ={(2,2)(2,3)(2,4)(3,2)(3,3)(3,4)(4,2)(4,3)(4,4)} F={1a.Prole com2filhotes} S=(2a.Prole com4filhotes} F S=? F S=? F ={(2,2)(2,3)(2,4)} S={(2,4)(3,4)(4,4)} F S={(2,2)(2,3)(2,4)(3,4)4,4)} F S={(2,4)}
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c F

=complemento deF

Fc ={(3,2)(3,3)(3,4)(4,2)(4,3)(4,4)} Diagrama deVenn

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Probabilidades deeventos combinados ou simultneos

P(AB)=P(A)+P(B) P(AB) P(6proles)=3/9=1/3 6proles ={(2,4),(3,3),(4,2)} P(6proles |1a.Prole =2)=? (6proles |1a.Prole =2)={(2,4)} P(6proles |1a.Prole =2)=1/3
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Probabilidades condicionais
P(A|B) P(A|B)=P(AB)/P(B) P(AB)=P(A|B)xP(B)= =P(B|A)xP(A)
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Teorema deBayes

P(B)=P(BA)+P(BAc) P(B)=P(B|A).P(A)+P(B|Ac). P(Ac)

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Vis da moeda favorecendo Cara Cara 0 1 2 3 4 5 0,1 0,59 0,33 0,07 0,01 0,00 0,00 0,3 0,17 0,36 0,31 0,13 0,03 0,00 0,5 0,03 0,16 0,31 0,31 0,16 0,03 0,7 0,00 0,03 0,13 0,31 0,36 0,17 0,9 0,00 0,00 0,01 0,07 0,33 0,59

http://www.rasch.org/rmt/rmt1237.htm

Suponha que em 5 jogadas da moeda foram obtidas 5 caras. Qual o deve ser o vis da moeda?
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O ambiente R de programao
Um conjunto integrado de ferramentas de software para manipulao de dados, clculos e apresentao grfica. O R no um software do tipo aplicativo, a preocupao no com amigabilidade, mas com flexibilidade e capacidade de manipulao de dados e realizao de anlises. Notar que na definio no se usou o termo Estatstica. Embora a maioria das pessoas usem o R como um software estatsticos, seus definidores (Venables et al., 2007) preferem defin-lo como um ambiente onde muitas tcnicas estatsticas, clssicas e modernas, podem ser implementadas. Algumas dessas tcnicas esto implementadas no ambiente bsico do R (R base), mas muitas esto implementadas em pacotes adicionais (packages).
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