UNIDAD 1

INTRODUCCIN A LA BIOLOGA

La ciencia y el mtodo cientfico

La ciencia constituye un intento lgico, objetivo y repetible de comprender las Pgina fuerzas y principios que operan en el universo, no es dogmtico y debe Pgina | | entenderse como un proceso que avanza probando y evaluando. 1 1 El mtodo cientfico est sustentado por dos pilares fundamentales. La reproducibilidad ( la capacidad de repetir un determinado experimento en cualquier lugar y por cualquier persona) La falsabilidad (que toda proposicin cientfica tiene que ser susceptible de ser falsada) Para considerar un conocimiento como cientfico, es necesario seguir el mtodo cientfico, cuyas etapas incluyen: Observacin: se define el problema que se desea explicar, se recolectan y clasifican los datos que aportan al hecho. Hiptesis: una o ms explicaciones o suposiones de las causas que producen el fenmeno el fenmeno observado. Experimentacin: intentos controlados de comprobar una o ms hiptesis. Conclusin: la hiptesis es aceptada, modificadas o rechazadas.

Microbiologa y su relacin con las ciencias

La microbiologa es la rama de la biologa dedicada al estudio de los microorganismos (mikros pequeo, bios, vida y logos, estudio), tambin conocidos como microbios. Estos son un grupo amplio y diverso de organismos microscpicos que existen como clulas aisladas o asociadas, tambin incluye el estudio de virus (no celulares).Trata la diversidad microbiana y de la evolucin, de cmo surgieron las diferentes clases de microorganismos (MO) y porque. Los MO pueden ser eucariotas o procariotas, influyen en todas las formas vivas de la Tierra por lo que la Microbiologa tiene una gran trascendencia y gira en torno a 2 temas fundamentales: Como ciencia biolgica bsica; proporciona herramientas de investigacin, para estudiar la naturaleza de los procesos vitales. Como ciencia biolgica aplicada, trata de muchos problemas prcticos importantes en la medicina (enfermedades), agricultura (fertilidad del suelo), y en la industria (produccin de queso o cerveza)

Historia de la Microbiologa
Robert Hooke :describi el cuerpo fructfero de mohos Antonie Van Leeuwenhoek: Es la primera persona en ver y describir microorganismos con detalles construyendo sus propios microscopios. La microbiologa no se desarrollo como ciencia sino hasta el siglo XIX, que las mejoras en microscopa permitieron una mejor observacin de las bacterias y se idearon tcnicas bsicas de laboratorio para su estudio. Lzaro Spallanzari: Intenta probar la falsedad de la Generacin Espontnea de los M.O

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Louis Pasteur: Demuestra la falsedad de la teora de la Generacin Espontnea de los M.O mediante el experimento con matraces cuello de cisne. Tambin dise mtodos para la conservacin de los alimentos (pasteurizacin) y vacunas contra varias enfermedades como el carbunco, el clera aviar y la rabia. Ferdinand Cohn: Fundador de la bacteriologa. Describe las endoesporas bacterianas y su resistencia al calor. Fue el primero en formular un esquema para la clasificacin taxonmica de las bacterias. Robert Koch: Fue uno de los primeros cientficos en concentrarse en la obtencin de cultivos puros de bacterias, lo cual le permiti aislar y describir varias especies nuevas de bacterias, entre ellas el agente causal de la tuberculosis. Es especialmente conocido por su contribucin a la teora de los grmenes de la enfermedad, donde, mediante la aplicacin de los llamados postulados de Koch, logr demostrar que enfermedades especficas estn causadas por M.O patognicos especficos. Los postulados de Koch son: I. El organismo debe estar siempre presente en los animales que sufran de la enfermedad y no en individuos sanos. II. El organismo debe cultivarse en cultivo axnico o puro fuera del cuerpo del animal. III. Cuando dicho cultivo se inocula a un animal susceptible, debe iniciar en el los sntomas caractersticos de la enfermedad. IV. El organismo debe aislarse nuevamente de estos animales experimentales y cultivarse nuevamente en el laboratorio, mostrando luego las mismas propiedades que el organismo original.

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Louis Pasteur (1822-1895) y Robert Koch (1843-1910) fueron contemporneos de Cohn y son considerados como los fundadores de la microbiologa mdica sin embargo sus trabajos no reflejaron fielmente la autntica diversidad del mundo microbiano, dado su enfoque exclusivo en M.Os de relevancia mdica. Dicha diversidad no fue revelada hasta ms tarde, con el trabajo de Martinus Beijerinck (1851-1931) y Sergei Winogradsky (1856-1953). Martinus Beijerinck hizo dos grandes contribuciones a la microbiologa: el descubrimiento de los virus y el desarrollo de tcnicas de cultivo microbiolgico. Mientras que su trabajo con el virus del mosaico del tabaco estableci los principios bsicos de la virologa, fue su desarrollo de nuevos mtodos de cultivo el que tuvo mayor impacto inmediato, pues permiti el cultivo de una gran variedad de microbios que hasta ese momento no haban podido ser aislados. Sergei Winogradsky fue el primero en desarrollar el concepto de quimiolitotrofa (utilizacin de compuestos inorgnicos reducidos para el metabolismo respiratorio) y de este modo revelar el papel esencial que los microorganismos juegan en los procesos geoqumicos. Fue el responsable del aislamiento y descripcin por vez primera tanto de las bacterias nitrificantes como de las fijadoras de nitrgeno. Alexander Fleming: Descubre la penicilina. James Watson, Francis Crick, Rosalind Franklin: Estructura del ADN

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Sindney Breiter, Francois Jacob, Mathew Meselson: ARN mensajero y ribosomas como lugar de sntesis de protenas. Howad Temin, David Baltimore, Renata Dulbeca: Descubrimiento de retrovirus y transcriptasa inversa. Pgina | Pgina | La 3 3

posicin de los microorganismos en la naturaleza

En la naturaleza, las clulas viven asociadas a otros en conjunto, llamadas poblacin. El lugar donde vive una poblacin microbiana en un determinado ambiente se denomina hbitat. Las poblaciones microbianas raramente viven solas en la naturaleza, cuando se relacionan con otras llamadas comunidades microbianas. La composicin de una comunidad microbiana en un hbitat concreto est determinada en gran parte por las caractersticas fsicas y qumicas del medio. La importancia de la vida microbiana: las clulas procariotas constituyen la mayor porcin de biomasa de la Tierra y son reservas de nutrientes esenciales para la vida. Tras el descubrimiento de los M.Os, los naturalistas de la poca intentaron encuadrarlos dentro de los 2 grandes reinos conocidos hasta entonces: animales y plantas. A finales del siglo XVII, las algas y hongos quedaron en el reino Plantae, mientras que las llamadas infusorias se encuadraron en el reino Animalia. As a mediados del siglo XIX, Heackel propone un famoso rbol filogentico y ordena al mundo de los organismos (conocidos hasta el momento) en tres grupos o reinos: Animales, Plantas y Protistas. Los Protistas incluyen aquellos seres vivos sencillos, sean o no fotosintticos o inmviles, donde se incluan a los Protozoos, Algas, Hongos y Mneras (Nombre con que se design un M.O que fue considerado, errneamente, como carente de ncleo). La denominacin microorganismos hace referencia a las reducidas dimensiones de los organismos citados y por su significado corresponde a la denominacin de Protistas. A mediados del siglo XX, las tcnicas de microscopias electrnicas y bioqumicas demuestran la gran diferencia de las bacterias respecto del resto de los organismos, tal que en 1977 Carl Woese propuso una categora superior al reino: Dominio, reconociendo 3 linajes evolutivos; ARCHEA, BACTERIA Y EUKARIA. Las caractersticas para separar estos dominios son: el tipo de clula, compuestos que forman las membranas y estructura del ADN.

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Los microorganismos como plantas benficas

Si bien los M.Os se presentan como perjudiciales en otros campos de la naturaleza, su papel benfico supera con creces al anterior. La utilizacin de stos ha llevado a que tales ocupen lugares fijos en las economas domsticas e industrias abarcando variadsimos procesos: Procesos microbiolgicos clsicos: La fermentacin controlada hizo de los M.Os son las plantas de cultivo ms antiguas considerando algunos ejemplos como: elaboracin de cerveza, vino y pan (mediante levaduras), as como preparacin de productos lcteos (con bacterias del cido lctico), as como la elaboracin de vinagre (con bacterias de cido actico). Tambin se han introducido los M.Os en procesos de obtencin de compuestos puros (etanol, cido lctico, cido ctrico que necesita la industria alimenticia). Produccin de antibiticos: La penicilina y otros productos de excrecin de hongo, actinomicetos y bacterias, han iniciado una nueva poca en la teraputica mdica y la industria farmacutica. Nuevos procesos microbiolgicos: Por ejemplo en la catlisis de procesos parciales de largas cadenas sintticas. Las transformaciones microbianas superan a las qumicas en especificidad y rendimiento. A partir de cultivos de M.Os se obtienen diversas enzimas de aplicacin industrial. Situacin exclusiva de los M.Os: Los M.Os ocupan una posicin monoplica en el ennoblecimiento de materias primas no convencionales como petrleo, gas natural y carbn, en tanto, slo pueden ser utilizados por los M.Os y ser transformados en material celular (biomasa) o en productos intermedios, que son excretados por la clula. Tecnologa gentica: Es posible sintetizar hormonas, antgenos, anticuerpos y otras protenas con ayuda de las bacterias. ARBOL FILOGENETICO UNIVERSAL La enorme tarea de clasificar, determinar e intercambiar informacin acerca de la vasta diversidad de organismos, implica que los bilogos han de disponer de un sistema de clasificacin que les permita nombrar y agrupar a las especies descriptas de una manera lgica, objetiva, econmica y no

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redundante. A esta tarea se la ha denominado sistemtica. Luego puede definirse a la sistemtica como la bsqueda del orden en medio de la diversidad. El rea del conocimiento encargada de establecer las reglas de una clasificacin es la taxonoma. De este modo, la sistemtica biolgica utiliza la taxononoma para establecer una clasificacin. Pgina | Pgina | La clasificacin debe representar en buena medida la filogenia de todos los seres vivos que han surgido en este planeta. La filogenia de un grupo de 5 5 especies cualesquiera puede representarse en forma de rbol ramificado. Este tipo de diagrama representa una hiptesis de las relaciones de ancestralidad y descendencia de las especies que contiene. Con el desarrollo del microscopio se descubrieron una gran cantidad de microorganismos y su clasificacin se haca cada vez ms necesaria que llevaron a algunos cientficos a la construccin de un rbol filogentico nico en el cual se diferencian tres linajes evolutivos principales. Se propuso entonces la categora de dominio para cada uno de estos linajes, o grupos monofilticos, y los denomin Bacteria, Archaea y Eucarya. Desde esta perspectiva consideramos al trmino dominio como un nuevo taxn filogentico que incluye tres lneas primarias, y en lnea descendente seis reinos: I-Moneras, II-Arqueobacterias, III-Protistas, IV- Fungi, V-Plantae, VIAnimalia. En realidad al rbol Filogentico Universal (elaborado por Carl Woese) cabria agregarle: del mundo celular ya que no incluye a virus, viriones 1, etc. Se representa en este esquema una raz nica que tiene su base en LUCA (Last Universal Cellular Ancestor), si bien podra representarse un conjunto de races o nube difusa para representar a la Comunidad ancestral comn de clulas primitivas a partir de la cual divergieron ramas que dieron origen a los tres dominios actuales y adems surcar la grfica con enlaces transversales entre ramas para indicar la existencia de una transferencia horizontal de genes. "Si nunca hubiera habido ninguna transferencia lateral gentica, todos estos rboles genticos individuales tendran la misma topologa (el mismo orden de ramificacin), y los genes ancestrales en la raz de cada rbol habran estado presentes en el ltimo antepasado comn universal, una nica clula antigua

Viriones (plural de virin): virus desarrollado.

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Construccin del rbol filogentico: La construccin de rboles filogenticos se realiza mediante el uso de programas para alinear secuencias. Luego, la longitud de las lneas entre organismos es proporcional a la distancia evolutiva. La distancia evolutiva se correlaciona en trminos del grado de divergencia entre secuencias de igual longitud (nmero de bases). Pgina | Pgina | La similitud de secuencias implica similitud en los genes. 6 6

Dominio y Reinos

Bacteria, Archea y Eukarya son los tres dominios en que los organismos vivos pueden ser divididos. Tanto Archea como Bacteria son procariontes, pero difieren gentica y bioqumicamente en mayor medida que lo que lo hacen Archea y Eukarya, los que constituyen en resto del mundo. Debido al tiempo remoto en que estos linajes divergieron, a las importantes diferencias entre las tres clases de organismos y sobre todo a ciertas semejanzas entre los distintos grupos, muchos bilogos concuerdan en que tiene sentido tratar a estos tres grupos como dominios, una categora taxonmica superior al reino. Las Bacterias son M.Os unicelulares que presentan un tamao de algunos micrmetros de largo (entre 0,5 y 5 m) y diversas formas incluyendo esferas, barras y espirales. Generalmente poseen una pared celular similar a la de plantas u hongos, pero compuesta por peptidoglicanos. Muchos antibiticos son efectivos slo contra las bacterias ya que inhiben la formacin de esta pared celular. Muchas bacterias disponen de cilios o flagelos y son mviles. Las Archaea son M.Os unicelulares. Al igual que las bacterias, las Archaea carecen de ncleo y son por tanto procariontes. Sin embargo, las diferencias a nivel molecular entre Archaeas y Bacterias son tan fundamentales que se las clasifica en grupos distintos. De hecho se considera que las archaea estn filogenticamente ms prximas a los eucariontes que a las bacterias. Se caracterizan por ser altamente resistentes a condiciones ambientales extremas de gran salinidad y elevadas temperaturas y acidez.

Las Eukarya es el dominio de organismos celulares con ncleo verdadero. Estos organismos constan de una o ms clulas eucariotas, abarcando desde organismos unicelulares hasta verdaderos pluricelulares en los cuales las diferentes clulas se especializan para diferentes tareas y que, en general, no pueden sobrevivir de forma aislada. Pertenecen al dominio Eukarya animales, plantas, hongos, as como varios grupos denominados colectivamente protistas. Todos ellos presentan semejanzas a nivel molecular (estructura de los lpidos, protenas y genoma) y comparten un origen comn. REINO PROTISTA: los protistas se definen como aquellos organismos eucariotas que NO son animales, plantas y hongos (son organismos unicelulares, sin embargo cuando se incluyeron a las grandes algas marinas se rebautizo a PROTOCTISTAS). Es el reino de mayor diversidad, incluye

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auttrofos fotosintticos, hetertrofos, parsitos y saprfagos. Se encuentran algas, euglenoides, ciliados, protozoarios y flagelados. REINO FUNGI: son organismos eucariotas, hetertrofos no fotosintticos, formadores de esporas y carentes de movimientos en todas las fases de su ciclo de vida, poseen paredes celulares y absorben su alimento por digestin Pgina | Pgina | enzimtica externa. Incluyen en su mayors organismos pluricelulares, pero tambin a levaduras, y en gral poseen clulas con ms de un ncleo. Desde el 7 7 punto de vista ecolgico resultan importantes como descomponedores de materia y recicladores de nutrientes. Desde el punto de vista econmico nos proveen alimento (pan, vino, quesos); antibiticos (penicilina) y por otro lado parasitan animales, granosetc, produciendo prdidas millonarias. REINO PLANTAE: Incluye los musgos, helechos, conferas y plantas con flores. La principal caracteistica del reino es la presencia de clorofila, con la cual capturan la luz, produciendo compuestos carbonados, por esta caracterstica son auttrofos. Desde el punto de vista ecologa los integrantes de este reino, en unin a los fotosintetizadores de Moneras y Protoctistas Archea, Bacteria y Eukarya de hoy son producto de miles de millones de aos de seleccin natural y deriva gnica y estn altamente adaptados a los ambientes actuales. Introduccin a la evolucin por seleccin natural. Charles Darwin percibi el mecanismo general en virtud del cual se produce la evolucin. El concepto original acerca de cmo ocurre la evolucin se funda en cinco premisas: Los organismos engendran organismos similares; en otras palabras, hay estabilidad en el proceso de la reproduccin. En la mayora de las especies, el nmero de individuos que sobreviven y se reproducen en cada generacin es pequeo en comparacin con el nmero total producido inicialmente. En cualquier poblacin dada ocurren variaciones aleatorias entre los organismos individuales, algunas de las cuales son hereditarias, es decir, que no son producidas por el ambiente. La interaccin entre estas variaciones hereditarias, surgidas al azar, y las caractersticas del ambiente determinan en grado significativo cules son los individuos que sobrevivirn y se reproducirn y cules no. Algunas variaciones permiten que los individuos produzcan ms descendencia que otros. Darwin llam a estas caractersticas variaciones favorables y propuso que las variaciones favorables heredadas tienden a hacerse cada vez ms comunes de una generacin a otra. Este es el proceso al que Darwin llam seleccin natural. Dado un tiempo suficiente, la seleccin natural lleva a la acumulacin de cambios que provocan diferencias entre grupos de organismos. Formalmente, la seleccin natural se define segn: Proceso de interaccin entre los organismos y su ambiente que resulta en una tasa de reproduccin diferencial de los diferentes genotipos presentes en la poblacin; puede dar como resultado cambios en las frecuencias relativas de los alelos y genotipos de la poblacin, o sea, producir evolucin.