PLASMID DAN EPISOME SEBAGAI MATERI GENETIK

Resume

Disusun untuk Memenuhi Tugas Matakuliah Genetika Lanjut

yang dibina oleh Prof. Dr. A.D. Corebima, M.Pd

Oleh:
Dasriani / 170341864573
Kelas A

PENDIDIKAN BIOLOGI
PASCASARJANA
UNIVERSITAS NEGERI MALANG
Februari 2018
 Plasmid dan Episome
Materi genetik pada bakteri yang terdapat dalam satu kromosom utama
dengan beberapa molekul DNA ekstrakromosomal disebut plasmid. Plasmid
merupakan unsur genetik yang dapat bereplikasi secara independen dari
kromosom utama dalam keadaan ekstrakromosomal. Kebanyakan plasmid yang
terdapat di inang, tidak diperlukan untuk kelangsungan hidup sel. Namun, pada
kondisi tertentu, seperti adanya antibiotik, plasmid akan diperlukan jika plasmid
itu membawa gen yang resisten terhadap antibiotik (Snustad, 2012). Terdapat tiga
tipe plasmid pada E.coli, yaitu :
1. F dan F’ plasmid, faktor fertilisasi konjugasi, Plasmid F ini juga dikenal
dengan plasmid konjugatif karena dapat ditransfer dari satu sel ke sel yang
lain atau dapat menggabungkan dirinya ke dalam kromosom.
2. R plasmid disebut juga RTF atau Resisten Transfer Factor plasmid yang
membawa beberapa gen untuk resistensi terhadap antibiotik
3. Col plasmid disebut juga colicinogenic, plasmid yang mengkode untuk
colisin, protein yang membunuh secara sensitive sel E.coli.(Gardner,
1991).
Sebagian besar plasmid R terdiri dari dua komponen: resistansi faktor
transfer (RTF) dan satu atau lebih r-determinan [Gambar 6-11 (b)]. RTF
mengkodekan informasi genetik yang penting mentransfer plasmid antar bakteri,
dan r-determinan adalah gen yang memberi perlawanan terhadap antibiotik atau
logam berat seperti merkuri. Sementara RTF sangat mirip dalam berbagai Plasmid
dari spesies bakteri yang berbeda, ada variasi yang luas di r-determinan, masing-
masing spesifik untuk ketahanan terhadap satu kelas antibiotik Penentu dengan
ketahanan terhadap tetrasiklin, streptomisin, ampisilin, sulfanilamida, kanamisin,
atau kloramfenikol adalah yang paling sering ditemui. Terkadang plasmid
mengandung banyak r-determinan, memberikan perlawanan ke beberapa
antibiotik [Gambar 6-11 (b)].
 (Sumber: Klug, W. S et.al, 2012)

Plasmid dapat diklasifikasikan menurut informasi genetik yang ditentukan

oleh DNA mereka. Plasmid faktor F memberi kesuburan dan mengandung gen
penting untuk pembentukan pilus seks, dimana konjugasi dan rekombinasi genetik
berikutnya bergantung (Klug W.S et al, 2012).
Terdapat sekitar 25 gen untuk plasmid F, sebagian besar diperlukan untuk
memproduksi pili seks. Ahli genetika menggunakan simbol F+ untuk menyatakan
sel yang mengandung plasmid F (sel jantan). Kondisi F+ dapat diwariskan:
plasmid F bereplikasi dengan DNA kromosom, dan pembelahan satu sel F+
menghasilkan dua keturunan yang semuanya F+. Sel-sel yang tidak memiliki
faktor F diberi simbol F- yang berfungsi sebagai resipien DNA (sel betina) selama
konjugasi. Kondisi F+ adalah kondisi yang dapat mengubah F- menjadi F+ ,
ketika kedua sel berkonjugasi. Plasmid F bereplikasi di sel jantan dan salinannya
ditransfer ke sel betina melalui saluran konjugasi yang menghubungkan sel-sel
tersebut. Pada perkawinan F+ dan F-, hanya sebuah plasmid F yang ditransfer. Sel
yang dilengkapi dengan faktor F dalam kromosomnya disebut Hfr (high frequency
of recombination). Sel Hrf berfungsi sebagai sel jantan selama konjugasi,
mereplikasi faktor F dan mentransfer salinannya ke F- pasangannya (Campbell,
2002).
 Beberapa plasmid membantu sel inang dengan kemampuan untuk
konjugasi. Semua plasmid F+, beberapa plasmid R dan beberapa plasmid Col
memiliki fungsi sebagai plasmid konjugatif. Beberapa plasmid R dan Col yang
lainnya disebut nonkonjugatif karena tidak dapat membantu sel berkonjugasi.
Beberapa plasmid R yang konjugatif berperan dalam penyebaran gen antibiotik
dan gen yang resisten terhadap obat melalui bakteri patogen.
François Jacob dan Elie Wollman pada tahun 1958 mengakui bahwa faktor
F dan unsur-unsur genetik tertentu memiliki sifat unik dan disebut sebagai
episome. Episome merupakan unsur genetik yang tidak penting bagi inang dan
yang dapat meniru, baik secara mandiri ataupun diintegrasikan (disisipkan secara
kovalen) ke dalam kromosom bakteri inang. Istilah plasmid dan episom bukanlah
merupakan sinonim. Banyak plasmid tidak terdapat bagian-bagian yang
terintegrasi dan begitu pula episome. Demikian pula, banyak kromosom fag
lisogenik, seperti genom fag, adalah episomes tetapi bukan plasmid (Snustad,
2012).
Kemampuan episomes untuk memasukkan diri ke kromosom tergantung
pada keberadaan sekuens DNA pendek yang disebut urutan penyisipan (atau
elemen IS). Unsur-unsur IS hadir baik pada episomes maupun pada kromosom
bakteri. Urutan pendek ini (dari sekitar 800 sampai sekitar 1400 pasang nukleotida
panjang) yang transposabel; yaitu, mereka dapat berpindah dari satu kromosom ke
kromosom yang berbeda. Selain itu, elemen IS memediasi rekombinasi antara
unsur-unsur genetik nonhomolog. Peran elemen IS dalam memediasi integrasi
episome didokumentasikan dengan baik dalam kasus faktor F
di E. coli . Persilangan antara elemen IS dalam faktor F dan kromosom bakteri
menghasilkan Hfr dengan asal-usul dan arah transfer selama konjugasi (Snustad,
2012).
Gambar 1 Elemen IS menengahi integrasi faktor F. ( a ) Sebuah peta singkat tentang struktur
faktor F di E. coli galur K12, dengan jarak yang diberikan dalam kilobases (1000 pasang
nukleotida). Lokasi gen yang diperlukan untuk transfer konjugatif (gen tra), replikasi (gen rep),
dan penghambatan pertumbuhan fag (gen phi) akan ditampilkan, bersama dengan posisi tiga
elemen IS. Panah menunjukkan elemen IS spesifik yang dimediasi integrasi faktor F selama
pembentukan strain Hfr yang ditunjukkan. ( b ) Rekombinasi antara elemen IS menyisipkan faktor
F ke dalam kromosom bakteri, menghasilkan Hfr.

Sexduction adalah pemindahan faktor F’ ke sel resipien (F -), prosesnya sama

dengan mekanisme pemindahan faktor F ke persilangan F’xF - dengan satu
perbedaan penting: gen bakteri tergabung ke faktor F ditransfer ke sel penerima
pada frekuensi yang jauh lebih tinggi. Faktor F merupakan sesuatu yang berharga
untuk studi genetik; faktor F dapat digunakan untuk memproduksi diploid parsial
yang membawa dua salinan gen atau kumpulan gen terkait. Dengan demikian,
sexduction dapat digunakan untuk menentukan hubungan dominasi antara alel dan
melakukan tes genetik lainnya yang memerlukan dua salinan gen di sel yang
sama.
 1. Faktor F melingkar keluar dari kromosom dengan gen thr dan leu di
putaran
2. Sebuah crossover mengeluarkan faktor F yang membawa gen thr dan leu,
menghasilkan F 'thr leu.

Gambar 2: Pembentukan faktor F’, Eksisi faktor F dari kromosom Hfr menghasilkan
faktor F yang membawa gen thr dan gen leu E.coli dan dinamai F’ thr leu.

Daftar Rujukan
Campbell, Neil dkk , 2002. Biologi Edisi Kelima Jilid I. Jakarta Erlangga.

Gardner, Eldon John dkk. 1991. Principles Of Genetics Eighth Edition. John
Wiley & Sons: New York

Klug, W. S., Cummings, M. R., Spencer, C. A., dan Palladino, M. A. 2012.

Concepts of Genetics, Tenth Edition. California: Pearson Education, Inc.

Snustad, D. P. dan Simmons, M. J. 2012. Principles of Genetics Sixth Edition.

New York : John Wiley & Sons, Inc.
Pertanyaan dan Jawaban
1. Mengapa Plasmid berguna dalam kondisi yang lingkungan yang sulit?
Jawaban: Plasmid mampu melakukan bentuk pertahanan diri pada plasmid-
plasmid tertentu, misalnya R plasmid yang mengandung gen yang resisten
terhadap antibiotik, sehingga ketika antibiotik menghambat pertumbuhan
perkembangan bakteri inang, R plasmid akan resisten terhadap antibioti,
disamping itu pula bagi R plasmid yang konjugatif akan menambah
kecepatan penyebaran gen resisten antibiotik ke sel-sel lainnya. Akibatnya R
plasmid ini menjadi masalah kesehatan, karena bagi bakteri patogen proses
penghambatan patogenetik bakteri akan terhambat akibat plasmid R ini.
2. Bagaimanakah cara plasmid dan episom memperbanyak diri (replikasi)?
Jawaban: Plasmid memiliki bentuk sirkular dan melakukan replikasi sendiri.
Plasmid berada di dalam sel dan replikasinya seperti replikasi DNA seluler.
Plasmid merupakan DNA yang membawa sejumlah gen. sedikit berbeda
dengan plasmid, episom merupakan materi genetik ektra kromosomal yang
dapat menyisip pada kromosom utama sel induk. Secara struktur episom
bergabung dan menyatu dengan kromosom sel induk. Ilustrasi struktur
plasmid dan episom dapat dilihat pada gambar berikut.