CLASIFICACIN DE LOS MTODOS DE IDENTIFICACIN MICROBIANA Los mtodos ms utilizados para la identificacin microbiana, los podemos clasificar en:

1. Mtodos basados en criterios morfolgicos 2. Mtodos basados en tincin diferencial 3. Mtodos basados en pruebas bioqumicas 4. Mtodos basados en tipificacin con fagos 5. Mtodos basados en pruebas serolgicas 6. Mtodos basados en deteccin molecular En la mayora de los casos la identificacin no se realiza con base a un solo mtodo, sino a la combinacin de ms de uno. Ejemplo: identificacin de bacterias con base a criterios morfolgicos, tincin diferencial, pruebas bioqumicas y serolgicas. Antes de proceder a discutir los mtodos que se han enumerado, es importante hacer nfasis que para cada uno de ellos se requiere disponer de una muestra. Cuando se requiere identificar un agente que est causando una determinada patologa, la muestra debe proceder del sitio donde el microorganismo est causando el dao, o donde se multiplica. Algunos ejemplos de muestras que se utilizan en microbiologa clnica tenemos: heces, orina, hisopado farngeo, lquido cefalorraqudeo, sangre, lgrimas, semen, fluido vaginal, etc. Tambin pueden utilizarse tejidos. Para aplicar algunos mtodos se requiere aislar en forma pura el microorganismo de la muestra, pero para otros no se requiere realizar dicho aislamiento. Con fines de control de calidad de medicamentos, cosmticos y alimentos, la muestra a ser analizada, puede ser un producto en proceso o terminado. La comparacin de las secuencias de los ARNr 16S (o de los genes que los codifican) permite establecer las relaciones filogenticas existentes entre los organismos procariotas. Este hecho ha tenido una enorme repercusin en taxonoma bacteriana, dando lugar al sistema de clasificacin vigente y permitiendo la identificacin rpida y precisa de las bacterias. En microbiologa clnica la identificacin molecular basada en el ADNr 16S se utiliza fundamentalmente para bacterias cuya identificacin mediante otro tipo de tcnicas resulta imposible, difcil o requiere mucho tiempo. La amplificacin del gen, para su posterior secuenciacin, parte preferentemente de ADN extrado de un cultivo puro de la bacteria, pero tambin puede conseguirse directamente de una muestra clnica. Esto ltimo ha conducido al descubrimiento de nuevos agentes patgenos. Teniendo en cuenta su potencialidad, a medida que los recursos tcnicos aumenten y el precio se haga ms competitivo, la identificacin bacteriana basada en el ADNr 16S encontrar probablemente una aplicacin ms amplia en el laboratorio de microbiologa clnica.