br
LIGAO GENTICA
INTRODUO
Segundo o que se convencionou chamar de primeira lei de MENDEL, os pares de genes alelos se separam (ou segregam-se) durante a formao dos gametas. Ao estudar dois loci concomitantemente, MENDEL observou que a segregao dos alelos de um locus no interferia na segregao dos alelos do outro, fato este que mais tarde passou a ser chamado de segunda lei de MENDEL ou lei da segregao independente. O que ser aqui apresentado demonstra que este segundo caso freqentemente no verdadeiro. Inicialmente, foram cruzados indivduos que diferiam entre si, por dois caracteres; os indivduos da gerao F1 foram cruzados entre si e a gerao F2 foi ento analisada. Representando dois pares quaisquer de genes por Aa e Bb, o primeiro cruzamento feito entre dois indivduos provenientes de linhagens "puras" e so, por isso, homozigotos; um deles apresenta o fentipo AB e o outro, ab. Este cruzamento pode ser assim representado:
MACHO GENTIPOS FENTIPOS AABB AB FMEA aabb ab GERAO F1 AaBb AB
Todos os indivduos pertencentes gerao F1 so duplo heterozigotos e cada um deles poder produzir quatro tipos de gametas: AB, Ab, aB e ab. Desta maneira, se dois indivduos F1 forem cruzados entre si produziro os descendentes apresentados no Quadro 1. QUADRO 1. Gentipos possveis na descendncia de um cruzamento entre dois indivduos duplo heterozigotos ( AaBb x AaBb). GAMETAS FEMININOS AB Ab aB ab AB AABB AABb AaBB AaBb GAMETAS MASCULINOS Ab aB AABb AaBB AAbb AaBb AaBb aaBB Aabb aaBb ab AaBb Aabb aaBb aabb
A anlise do Quadro 1 mostra que do cruzamento entre dois duplo heterozigotos podem ser produzidos l6 tipos de descendentes. Vrios deles apresentam gentipos iguais entre si e, desta maneira, so encontradas 9 classes genotpicas e apenas 4 classes fenotpicas, como demonstrado no Quadro 2.
QUADRO 2. Freqncias das classes genotpicas e fenotpicas na descendncia de um cruzamento entre duplo heterozigotos (AaBb x AaB).
CLASSES GENOTPICAS TIPO AABB AABb AaBB AaBb AAbb Aabb aaBb aaBB aabb FREQNCIAS 1/16 2/16 2/16 4/16 1/16 2/16 2/16 1/16 1/16
AB
9/16
Ab
3/16
aB
3/16
ab
1/16
Espera-se a produo de quatro classes fenotpicas na proporo 9:3:3:1, desde que os genes A e B sejam independentes entre si. Caso no o sejam, as freqncias observadas sero diferentes. Aps estudar vrias caractersticas de ervilhas e observar a proporo 9:3:3:1 entre as vrias classes fenotpicas em F2, MENDEL concluiu que os genes segregavam independentemente entre si (SEGUNDA LEI DE MENDEL). Entretanto, h um mtodo de cruzamento bem mais simples, elaborado por MORGAN, que consiste em cruzar indivduos que diferem entre si por dois caracteres (AABB X aabb) obtendo a gerao F1 (todos AaBb) da qual indivduos so cruzados com portadores dos caracteres condicionados pelos alelos recessivos, isto , com duplo homozigotos recessivos (aabb). O resultado (F2) apresentando no Quadro 3. Pelo Quadro 3, v-se que os fentipos dos indivduos produzidos pelo cruzamento do F1 com o duplo recessivo corresponde constituio gentica dos gametas produzidos pelo heterozigoto. Dessa forma, as freqncias das classes fenotpicas obtidas nesse cruzamento correspondem s freqncias dos tipos de gametas produzidos pelo heterozigoto. Se esses dois pares de genes segregam independentemente, a freqncia de cada c;asse fenotpica igual a 25%, ou seja, tem-se a proporo 1:1:1:1. Caso contrrio, tais propores no sero observadas.
MAPA GENTICO
Entretanto, h uma discrepncia entre as medidas: a distncia de A a C (45,0) calculada pela freqncia de recombinantes entre esses genes menor do que a soma das distncia A-B e B-C, (36,6 + 10,7 = 47,4). Esta discrepncia no acidental: devida ocorrncia de dupla recombinao entre A e C, isto , ocorreu uma permuta entre os loci A e B e, ao mesmo tempo, uma quebra entre os loci B e C, seguida de outra troca. Esta dupla troca recoloca os genes A e C na associao parental. O efeito resultante da dupla recombinao entre dois genes quaisquer fazer com que paream mais prximos um do outro do que realmente esto. Na construo de mapas genticos, sempre prefervel considerar a soma das distncia curtas como a melhor estimativa da distncia entre genes largamente separados. No exemplo dado, a dupla recombinao faz os genes A e C parecerem mais prximos um do outro. As duas ltimas classes fenotpicas (AbC e aBc com freqncias de 0,5% e 0,7%, respectivamente) so resultantes de dupla recombinao entre A e C; portanto, deveriam ser considerados duplamente na terceira coluna com freqncia de 1% e 1,4%, respectivamente. Isto resultaria no clculo exato da distncia entre A e C que seria igual 47,4 unidades. Esta distncia exatamente igual distncia no mapa, obtida pela adio das freqncias observadas entre A e B e entre B e C. Em concluso: Quanto mais prximos os genes esto entre si, menor a chance de permuta entre eles e, conseqentemente, menor ser a freqncia de recombinao. Portanto, o grau de ligao entre dois genes pode ser representado pela proporo de descendentes recombinantes.
INTERFERNCIA
A relao entre a permuta simples e a dupla pode ser considerada como um problema de probabilidade. Se considerarmos cada permuta como ocorrendo independentemente uma da outra, a probabilidade de que ocorra uma permuta dupla o produto das freqncias das permutas simples. No caso acima discutido, a chance de uma permuta dupla 3,9% (isto , 0,367 x 0,107). Entretanto, o exame dos dados mostrou que h apenas 1,2% de duplo recombinantes. Isso indica que a ocorrncia de uma permuta inibe a ocorrncia de outra em regio prxima, diminuindo a freqncia de permutas duplas para aquela regio do cromossomo. H tambm um tipo oposto de interferncia: no fungo Aspergillus, em bacterifagos, em Neurospora, algumas bactrias, etc. h regies pequenas
COMPRIMENTO TOTAL
Se considerarmos todos os loci de um dado cromossomo e somarmos as distncias entre eles, obteremos o comprimento total daquele cromossomo e, bvio, se somarmos os comprimentos de cada cromossomo, teremos o comprimento total do mapa gentico. claro que o "tamanho" assim calculado do cromossomo poder ser maior do que 50 unidades; entretanto se aquele cromossomo apresentar invariavelmente um nico quiasma na meiose, o seu "comprimento gentico" ser de, no mximo, 50 unidades, mesmo que somemos todas as distncias entre todos os loci daquele cromossomo. Se um cromossomo apresenta sempre dois quiasmas, o comprimento ser de 100 unidades e assim por diante. Deste modo, temos duas maneiras diferentes de calcular o "comprimento gentico total" de uma espcie: uma delas pela soma das distncia entre todos os loci conhecidos e a outra pela contagem do nmero total de quiasmas por clula. O mapa gentico dos dez cromossomos do milho indica um comprimento total de cerca de ll00 unidades e a freqncia de quiasmas em clulas em meiose de aproximadamente 27 o que indica um comprimento de l350 unidades. A discrepncia no surpreendente e est na direo certa. Na espcie, humana, com 23 pares de cromossomos, a freqncia total de quiasmas parece ser cerca de 55 o que sugere um comprimento total de mapa de aproximadamente 2750 cM.
Nos anos recentes , uma grande variedade de tcnicas de laboratrio forneceu grande quantidade de informao sobre a localizao gnica no homem (Francke, 1983). Entretanto, a anlise de heredogramas sempre ser de utilidade, particularmente na localizao dos genes que determinam caractersticas que no se expressam em clulas em cultura e para medir a distncia entre os loci. Muito j foi escrito sobre a anlise de heredogramas em estudos de ligao gentica e exposies detalhadas podem ser encontradas em Edwards (1971), Renwick (1971) e Smith (1968). Um introduo ao assunto, particularmente fcil de ser lida pode ser encontrada em Blood Groups in Man (Race & Sanger, 1975). O mtodo adotado para a determinao da ligao a estimativa por mxima verosimilhana da frao de recombinantes (usualmente referida como ) baseada na probabilidade relativa (Pr) de que ocorra a famlia sob estudo. Este valor obtido calculando-se a probabilidade de se obter as vrias combinaes possveis do carter em questo, assumindo-se que no haja ligao ( = 0 ,5) e comparando-se com os valores obtidos variando-se o valor desde de 0,00 at 0,50, isto :
PR = P(famlia, dado = 0 at 0,5)/ P(f amlia, dado = 0,5)
Por convenincia, PR freqentemente expresso como seu logaritmo. O logaritmo decimal (log 10) da probabilidade relativa chamado log of the odds ou lod score (Morton, 1955). A estimativa de por mxima verosimilhana pode ser obtida colocando-se em um grfico a soma dos lod scores (ou as probabilidades relativas) para todas as famlias estudadas contra vrios valores de (de 0,00 a 0,50): o valor de correspondente ao pico da curva. Os loci localizados no mesmo cromossomo so chamados sintnicos e os loci sintnicos que exibem uma frao de recombinantes menor do que 50% ( < 0,50) so ditos ligados.
Ligao autossmica.
Famlias com trs geraes.
1 III Secretor
No secretor No secretor
Secretor No secretor
Secretor
Nesta situao, a frao de recombinantes 1/6 ou 0,17. De fato, o estudo de um grande nmero de famlias nas quais puderam ser estudados o carter secretor e a distrofia miotnica revelou um valor de prximo a 0,07. Famlias com duas geraes. Quando esto disponveis informaes de apenas duas geraes de uma famlia, a medida da ligao um pouco mais complexa e exige alguns recursos matemticos para sua determinao. Se G e g so alelos do locus principal (no caso, a doena) e T e t so alelos do locus teste (marcador gentico), ento se um indivduo com o gentipo GT/gt (isto , em acoplamento) pode produzir quatro tipos possveis de gameta: dois no recombinantes (GT e gt) e dois recombinantes (Gt e gT). Se a freqncia de recombinantes , tem-se que:
freqncia de gametas no recombinantes = 1-
Se estes dois loci no estiverem no mesmo cromossomo (isto , no forem sintnicos) ou se estiverem no mesmo cromossomo mas muito distantes entre si ( >0,5), haver igual nmero dos quatro tipos de gametas. Consideremos agora uma famlia na qual o grupo sangneo Lutheran e o carter secretor estejam segregando. Os alelos Lutheran so Lua e Lub, sendo o primeiro dominante (veja Figura 2).
I Lu a Secretor Lu b No secretor
3 II b Lu No secretor
1 a Lu Secretor
1 b Lu Secretor
Neste heredograma, a me deve ter o gentipo Lub se/Lubse e o pai deve ser Lua Se/Lubse ou Lua se/LubSe; se o pai tiver o primeiro gentipo, as quatro primeiras crianas sero consideradas no recombinantes (Figura.3). Neste caso, tem-se as seguintes probabilidades:
3 crianas Lub se/Lubse = ((1- )/2)3 1 criana Lub se/LuaSe = (1- )/2 1 criana Lub se/LubSe = /2
Portanto, a probabilidade de que uma famlia deste tipo exista, dado que o pai tem o gentipo Lua Se/Lubse , ser de:
= ((1- )/2)3 (1- )/2 /2 = (1- )4/32
I a b Lu Se / Lu se b b Lu se / Lu se
II
3 b b Lu se / Lu se
1 b a Lu se / Lu Se
1 b b Lu se / Lu Se Recombinantes
No recombinantes
Figura 3. Gentipos da famlia da famlia da fig.2, considerando um dos gentipos possiveis para o pai.
Consideremos agora a outra possibilidade, isto , quando o pai tem o gentipo Luase/LubSe. Aqui, as primeiras quatro crianas so todas recombinantes e a ltima, no recombinante (Fig.4).
I a b Lu se / Lu Se b b Lu se / Lu se
II
3 b b Lu se / Lu se
1 b a Lu se / Lu Se
1 b b Lu se / Lu Se No recombinante
Recombinantes
Figura 4. Gentipos da famlia da famlia da fig.2, considerando o outro gentipo possvel para o pai.
Portanto, a probabilidade de que esta famlia exista, dado que o pai tem o gentipo Lua se/LubSe :
( /2)3 /2 (1- ) /2 = 4 (1- )/32
Neste ponto, o que se tem de decidir qual a probabilidade de se obter os fentipos observados nas crianas sob duas condies diferentes: os genes do pai esto em fase de acoplamento ou repulso. Desde que o acoplamento e a repulso so igualmente provveis, a probabilidade de que exista uma dada famlia como esta dada pela mdia aritmtica entre os dois valores obtidos considerando-se, primeiro, o acoplamento e, depois, a repulso:
P = 1/2 {[ (1- ) /32]+[
4 4
(1- )/32]}
Se for assumido = 0,2, tem-se: P0,2 = 0,001 300 E se for assumido = 0,5: P0,5 = 0,000 976 Portanto, a razo entre as probabilidades (PR), quando = 0,2, ser: = 0,001 300/0,000 976 = 1,3320 Este procedimento ento repetido variando-se de 0,0 a 0,5 , obtendo-se os valores da tabela abaixo:
Grupo sangneo Lutheran / carter secretor:probabilidades relativas e lod scores para diferentes valores de . Freqncias de Recombinantes Probabilidade Relativa lod score 0,0 - ... 0,1 0,022 0,2 0,124 0,3 0,095 0,4 0,031 0,5 0,00
= 0,21
0,10
0,20
0,30
0,40
0,50
Frao de recombinao
Figura 5. Probabilidades relativas de ligao para diversos valores da frao de recombinantes.
QUESTES
1. Em quatro cruzamentos distintos, a fmea duplo heterozigota (AaBb) e o macho, duplo recessivol; foram produzidos os seguintes descendentes, respectivamente: (a) 139 AaBb, 149 aabb, 29 Aabb, 28 aaBb; (b) 103 AaBb, 95 aabb, 79 Aabb, 75 aaBb; (c) 27 AaBb, 29 aabb, 243 Aabb, 247 aaBb; (d) 65 AaBb, 70 aabb, 409 Aabb, 405 aaBb. Para cada um dos cruzamentos, pergunta-se: (a) quais so os gentipos dos pais, (b) qual a distncia em centiMorgans (cM) entre os locos A e B e (c) qual a freqncia de crossing over entre estes locos? 2. Detectou-se 21% de recombinantes entre dois locos; suponha que 150 ovcitos primrios fossem selecionados para estudo da freqncia de quiasmas nesta regio do cromossomo. Em quantos ovcitos seria observado A B C D E um quiasma entre tais genes? B 25 C 1 26 3. As distncias entre seis locos so mostradas D 19 6 20 no quadro ao lado. Faa um mapa gentico que inclua E 7 32 6 26 todos estes genes. F 20 5 21 1 27
I
1 2 3
II
1 2 3 4 5 6 7
III
1 2 3
= daltnico
= hemoflico
4. O diagrama ao lado mostra um heredograma humano onde o pai no aparece, mas considera-se que tenha fentipo normal. Os genes da hemofilia (h) e do daltonismo (d) so recessivos e ligados ao sexo. Dentro das possibilidades, determine os gentipos para cada um dos indivduos representados no heredograma.
5. A presena de um dos antgenos Rh na superfcie das hemcias (Rh positivo) do sangue humano produzido pelo gene dominante D, as clulas Rh-negativas so produzidas pelo gentipo recessivo dd. Os eritrcitos de forma oval (eliptocitose ou ovalocitose) so causados pelo gene dominante E; seu alelo recessivo e produz a hemcia normal. Ambos os genes esto ligados com uma distncia aproximada de 20 centiMorgans em um dos autossomos. Um homem portador de eliptocitose, filho de me homozigota Rhpositivo e eritrcitos normais e de pai Rh-negativo e heterozigoto para eliptocitose, se casa com uma mulher Rh-negativo normal. (a) Qual a probabilidade de que seu primeiro