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Biochimie
(vie)
La biochimie est la science qui tudie les constituants chimiques des cellules vivantes et les ractions qui les transforment
Structure des composs organiques: Glucides Lipides Protides Nuclosides et nuclotides Enzymologie
Objectifs: Citer les lments chimiques composant lorganisme Identifier les lments existant en faible quantit (oligolments) et numrer leur rle physiologique Citer les substances minrales composant lorganisme Identifier ltat de leau, son rle et son bilan dans lorganisme
Lorganisme se compose: - dlments reprsents en quantit importante - dlments prsents en faible quantit = oligo-lments peu
O C H N Ca P K S
b
Cl Na Mg I F Fe Zn Br
99,9%
Al Si Cu Mn B Se Co
0,002 Mo
Macro-lments Oligo-lments
Composs organiques
Composs organiques
Composs inorganiques
2. APERU SUR LES SUBSTANCES MINERALES ET LEAU 2.1- substances minrales se trouvent sous 3 tats: Etat solide:
cristallis, non ionis: os et dents
En solution:
ions
2.1.1- Sels minraux solides non ioniss Os: phosphate tricalcique: mlange dapatites 3(PO4)2Ca3 X2 Ca Carbono apatite Hydroxyl apatite
de formule gnrale: 3(PO4)2Ca3 CO3 Ca: 3(PO4)2Ca3 (OH)2 Ca: 3(PO4)2Ca3 F2 Ca:
Fluoro apatite
Anions: Cl(chlorures) HCO3- (bicarbonates) PO4H2 ROPO3H(phosphates et ester phosphoriques) SO42- et ROSO-3 (sulfates et ester sulfuriques)
- et
Na+, Ca2+ et Cl- sont des ions du milieu extracellulaire K+, Mg2+ et les PO4H2- sont des ions intracellulaires
2.1.3- Bilan des substances minrales Apports: se font entirement par lalimentation
Leau apporte: sels alcalins (NaCl, KCl) bicarbonate de Ca et de Mg traces de fer, diode et de fluor Vgtaux, farines: Phosphates Potassium Magnesium Lait: Elimination: Urines, selles et sueur Cu et Zn: la peau, les ongles et les cheveux
2.2- Leau
Constituant le plus abondant de la matire vivante sa proportion varie chez lhomme entre 58 et 66% du poids du corps Existe au moins sous 2 formes: eau libre ou circulante eau lie, fixe aux protines
Ractif:
utilis pour lorganisme pour de nombreuses ractions chimiques, apporte lO2 et H
boissons et aliments: environ 2 l/j provenant de loxydation dans lorganisme de composs hydrogns: environ 0,4 l/j Glucose + 6O2 Elimination: - urines 0,8-1,2 l/j - matires fcales 0,1 l/j - vapeur deau exhale par la respiration: 0,4-0,5 l/j - sueur - vapeur deau limine par la peau: 0,4-0,7 l/j
avec la to
6CO2 + 6H2O
2.2.3- Rpartition
- Compartiment extracellulaire: renferme le 1/3 de leau totale (17-20 % du poids du corps) - liquide interstitiel: 11 15 % du poids du corps - plasma sanguin: 5% du poids du corps - Compartiment intracellulaire: renferme les 2/3 de leau totale (40- 45 % du poids du corps)
Les changes entre le milieu intra et extracellulaire sont lis lquilibre en ions Na+ et Cl-. Le rein joue un rle important dans cette rgulation
Composs organiques
Glucides: source dnergie importante pour lorganisme, le glucose est laliment principal des cellules source dnergie forment les membranes
Lipides:
Protines: constituants principaux des tres vivants supports de la plupart des activits biologiques Acides nucliques: contenant linformation gntique de la cellule
Ces composs sont appels galement mtabolites , ils sont destins subir un mtabolisme
Glucides
Hydrates de carbone : Cn(H2O)n rle source dnergie directe Ex: glucose rserve dnergie glycogne (animaux) amidon on distingue - Oses ou sucres simples - Osides composs de deux ou plusieurs oses Oligosides : 2 - 10 oses Polyosides : > 10 oses (vgtaux)
Chapitre 1: Objectifs
OSES ET DERIVS
Reconnatre les diffrents oses ainsi que leur filiation tablir leur structure linaire et cyclique Retrouver leurs proprits physiques, chimiques et biologiques.
1- OSES
1.1- Dfinition: caractriss par la coexistence dans la mme molcule: - dune fonction rductrice: aldhyde ou ctone - de plusieurs fonctions alcools 1 CH2OH Fonction rductrice
H H H O
f.alc 1aire
2C
H H
1C 2C 3C
OH OH
3C: triose 4C: ttrose 5C: pentose 6C: hexose 7C: heptose
3C 4C
OH OH
f.alc 2aire
CH2OH
CH2OH
ctose
Exemples: f. ctone et 6C: f. aldhyde et 5C:
aldose
ctohexose aldopentose
1.2- Isomrie
1.2.1- Oses simples: trioses
CHO H
CH2OH
* C
CH2OH
OH
CH2OH
miroir
CHO
CHO
CH 2OH
OH H
OH H
CH2OH
D- glycraldhyde
L- glycraldhyde
Ces 2 composs ont les mme proprits physiques et chimiques sauf le pouvoir rotatoire. Ils devient la lumire polarise dun angle gal mais en sens inverse: Inverses optiques ou nantiomres
La structure des autres aldoses nombre plus levs datomes de C drive de celle du glycraldhyde. D-glycraldhyde L-glycraldhyde Oses de la srie D Oses de la srie L
La structure des autres ctoses nombre plus lev datomes de C drive du dihydroxyactone
Chaque C supplmentaire est aussi asymtrique et donne lieu 2 composs appels pimres
CHO H C OH
CH2OH
D-glycraldehyde
CHO
OH H OH
H H
C C
OH OH
CHO H H H C C C OH OH OH
CHO OH OH H C C C H H
CH2OH
D-throse
H OH H
C C C
OH H H
C C C
H OH OH
CH2OH
D-rythose
OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CHO H OH H H C C C C OH H OH OH
CH2OH
D- lyxose
H OH OH H
CHO C C C C OH H H OH
D- xylose
OH OH H H
D- arabinose
CHO C C C C H H OH OH
D- ribose
CH2OH
CH2OH
CH2OH
1.2.2.2- Ctoses
CH2OH C O
H
CH2OH C C O OH
CH2OH
Dihydroxyactone
CH2OH C OH H
CH2OH C OH OH H C C C O H H OH
CH2OH
CH2OH C H C C O OH OH
CH2OH C O OH OH OH
D-rythrulose
O H C C
H
OH
CH2OH
CH2OH C H OH H C C C O OH H OH
CH2OH C OH H H C C C O H OH OH
CH2OH
D-xylulose
D-ribulose
H H H C C C
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
D-tagatose
D-sorbose
D-fructose
D-allulose
Cest la position du OH voisin de la fonction alcool primaire qui dtermine lappartenance la srie D ou L
1 CHO
H OH H H
5C
H
6 CH2OH
H
2C 3C 4C 5C
OH H OH OH
OH
OH
4 3
OH C H
1C
+H2O
2C
OH
6 CH2OH 5C
H
OH
OH H
4C
OH
H OH H
1C
OH
-H2O 6 5C
CH2OH O
3C
H
2C
OH
5C
H OH
OH
4C
OH
4C
OH
H OH H
1C
H
3C
H
2C
OH
OH
3 C
H
2C
OH
D-glucose
D-glucose
1CHO
H OH H H
2C 3C 4C 5C
OH H OH OH
6CH2OH
O H OH
5
OH
5
OH
O H
anomres 5C*
4
OH
1
H
4
OH
1
OH
3
H
2
OH
3
H
2
OH
-D glucose
-D glucose
1.2.3.2- Preuves de la structure cyclique des oses (arguments de Tollens) Le pouvoir rotatoire dun ose plus lev que celui des acides correspondants
CHO H OH H H COOH OH H OH OH H OH H H
COOH H OH H H
*C *C *C *C
*C *C *C *C
OH H OH OH
*C *C *C *C
OH H OH OH
CH2OH
CH2OH
COOH
glucose
CH2OH H
Ac. gluconique
O H H
Ac. glucarique
5*
OH
* 4
OH
*
H
OH
OH
OH
O R C H
O R R
H 2O
2R-OH
R C OH H
R C
aldhyde
OH
O R C H
2H2O
O H
actal
O R
H 2O
R-OH
R C OH H
R C
glucose
H 2O
OH H
Glucose + alcool
Les formes et diffrent par leurs pouvoir rotatoire -D glucose : + 113o + 52o -D glucose : + 18,7o quilibre
mutarotation
glucose 36%
glucose 64%
1.2.3.3- Position du pont oxydique le pont entre C1-C5 cycle pyranique (6 sommets) 1 CHO
H OH H H
2C 3C 4C 5C
2
OH H OH OH
6 CH2OH 5 4
OH OH O OH
5 1 4
CHOH O OH
1 2
OH OH
2
OH
6 CH OH
D-glucose
Formes pyraniques et furaniques des aldopentoses et des ctohexoses 1CHO pont entre C1-C5 pont entre C1-C4 H 2C OH OH H 5CH2OH OH O H 5 O 3C H OH 4 H 1 H H H 4 1 H 4 3 2 H H OH C H H OH OH OH 2 3 5 CH2OH OH OH -D ribofuranose D-Ribose -D ribopyranose 1 CH2OH 2C
OH H H O
H
6
H H
O OH
6 CH2OH
O
1 CH2OH
OH
C C
H OH
4 5
5
OH
2
CH2OH
5
H
2
OH
4
OH
OH
3 1
H
4
OH
3
H
6 CH2OH D-fructose
-D fructopyranose
-D fructofuranose
Pour nommer un ose, on doit donner lanomrie ( ou ), la srie (D ou L), le nom de lose et la forme cyclique (pyranique ou furanique) Ex: -D glucopyranose -D fructofuranose
Fonction rductrice 6 CH2OH
O H OH
6 CH2OH
H
5
OH
4
OH
1
H
5
H
2
OH
3
H
2
OH
4
OH
3
H
-D glucopyranose
-D fructofuranose
1.2.3.4- Forme bateau et forme chaise du cycle pyranique Le cycle pyranique nest pas plan. encombrement strique
H CH2OH OH H OH OH H H OH
OH H OH H CH2OH O H H OH H
OH
TP
OH
H OH H H
C C C C
OH H OH OH
H
I2 + H 2O
H OH H
C C C C
OH H OH OH
+ 2HI
CH2OH
CH2OH
1.4.1.3- Oxydation enzymatique Dans lorganisme, oxydation de la fonction rductrice par la glucose 6P dshydrognase G6P dshydrognase 6CH2O
H P O H H
H OH CH2O P O H O
1 COOH
H
2C 3 4
C C
OH H OH OH
5
OH
H 2O
OH H H
4
OH
3
H
1
OH
OH
2
OH
5C
2
OH
G6P
6P glucunolactone
H C H OH H H C C C C
OH C
OH H OH OH
HNO3
H OH H
H
C C C
C C
OH H OH
OH
CH2OH
OH
D-glucose aldose
H C H OH H H C C C C
H C H C C C C C O
OH H OH OH
OH H OH OH
Br ou
OH
enzyme
H H
CH2OH
OH
glucose aldoses
1.4.2- Rduction
H C H OH H H C C C C
CH2OH H C C C C OH H OH OH
OH H OH OH
OH H H
CH2OH
CH2OH
(adjuvants)
NH2
Adnine
N N
N NH2
N H
H2 O
HO O H H OH H H OH OH
HO O H H OH H H OH
ribose Adnosine
1.4.4- Action dans les protines Les aldoses et les ctoses ragissent chaud avec les fonctions amines des protines = raction de Maillard
CH2OH O C
CH2OH
Protine-CH2-N
OH OH
C C C R OH OH
Protine..CH2-NH2 +
H H
C C R
H2 O
H H
Liaison -osidique
O O CH3 H H
CH3OH HCl
H OH OH H
OH
-D glucose -D glucose
-D mthylglucoside -D-mthylglucoside
Glucosidase Glucosidase
OH OH P O H O
OH
6 5
OH
P O
6
CH2 O H H OH
CH2 O H H
OH
2
OH P O OH
4
OH
OH
1
OH
4
OH
3
H
2
OH
3 1 2 CH
H O
glucose-6P
1.4.7- Epimrisation et isomrisation Alcool dilu Epimrisation D-glucose isomrisation D-fructose Dans lorganisme Glucose Glucose pimrase isomrase Galactose Fructose D-mannose
pimrase
galactosmie congnitale
(troubles mentaux irrversibles et dnutrition)
HCOH
H H H C C C OH OH OH
HCOH
- 3H2O
HCH CH CHO
O
OH OH
CHO
CH2OH
furfural
TP
1.4.9- Analyse des oses Peut se faire par chromatographie sur couche mince ou par chromatographie en phase gazeuse Chromatographie sur couche mince (CCM) papier colonne
GFM
Solvant organique
Injection doses
GFM
Gaz entraneur
2 C 3 C 4 CH
2
OH OH OH P O OH
1.5.3- Pentoses 1.5.3.1- D-ribose: existe dans les nuclotides et les acides nucliques. les esters P: ribose 5P, ribose 3P ont une grande importance biologique
H O
1C
H H H
2 3 4
OH OH OH
5 4
H H
OH O H
3
OH
2 H OH
5 CH2OH
D-ribofuranose
HO O H H OH H OH
1
H
ADN
2
H
2- dsoxyribose
1.5.3.2- Ribulose
1 CH2OH 2C
H H O OH OH
3C 4C
5CH2OH
1.5.4- Hexoses 1.5.4.1- D-glucose trs rpandu ltat libre ou combin, chez les vgtaux et les animaux forme combine: lamidon, cellulose et glycogne forme libre: principal aliment de la plupart des cellules le sang renferme 1,1 g/l (glycmie) son oxydation produit de lnergie 1 CHO 2C 3C 4C 5C 6CH2OH
OH H OH OH
H
Hyperglycmie: diabte
dans la cellule il est sous forme dester phosphorique: G1P, G6P, G1-6 diP
6CH2OH
O H H
H OH H H
5
OH
H OH
O H
OH
4
OH
1
OH
1
H
3
H
2
OH
OH H OH
6 CH2OH
-D glucopyranose
-D glucopyranose
1.5.4.2- D-galactose le plus rpandu aprs le glucose se trouve dans: - les osides comme le lactose du lait - les polyosides - htrosides - glycoprotines 1
H OH OH H CHO C C C C OH H H OH
2 3 4 5
6 CH2OH
1.5.4.3- D-mannose dans les vgtaux: sous forme de mannane (polymre de mannose) chez lhomme: cest un constituant de glycoprotines
1
OH OH H H
CHO C C C C H H OH OH
2 3 4 5
6 CH2OH
1.5.4.4- D-fructose ou lvulose se trouve dans :- fruits - miel (50% fructose 50% glucose) - chez lhomme , il est retrouv dans les secrtions sminales (aliment nergtique des spermatozodes)
1 2
OH H H
CH2OH
6 CH2OH
C C C C O
1 CH2OH
O OH
3 4 5 6
5
H
H H
2
OH
4
OH
3
H
OH OH
CH2OH
-D fructofuranose
1 2
CH3-COOH
OH
OH
H2O
OH NH CO CH3
N-actyl glucosamine
2.1.2- D-galactosamine
6 CH2OH
OH
CH2OH
OH
5
OH
OH
O OH
OH
CH3-COOH 2 H2 O
NH CO
1 2
NH2
CH3
galactosamine
N-actyl galactosamine
6 CH2OH 6CH2OH
COOH
5
OH
5
O OH
OH
4
H C
1 2
NH CO CH3
+4
OH
OH
1 H2 O
OH COOH C
3
CH3
CH3
2
NH CO CH3
H
Ac. lactique
N actyl D-glucosamine Ac. N actyl muramique Se trouve dans la paroi des bactries
1 COOH
O H H NH2
2C 3C 4C 5C 6C 7C 8C
H OH H H OH
CH3
OH
+
H C NH2 OH H H C C C C H H OH OH O
NH2
6
H 7 OH C H C OH
OH
2 3 1COOH
OH
9CH2OH
9 CH2OH
4
OH
Ac neuraminique
CH2OH
D-mannosamine
nexiste pas ltat libre, mais actyl sur le NH2 ou sur un OH, ce qui conduit divers acides sialiques.
Les acides sialiques sont des constituants des membranes cellulaires et jouent un rle fondamental dans la pntration des virus dans les cellules
H C OH CH2OH COOH
OH
2.3- Acides uroniques Rsultent de loxydation de la fonction alcool primaire des oses
COOH O OH OH
OH OH
2.4- Acide L-ascorbique ou Vit C Se forme partir de lacide glucuronique + H2 CH2OH H O CH2OH
C
CH2OH H C C C O C CO OH H OH OH
H
H OH H H C C C C OH
C C C C
OH H OH OH
C C
OH H OH OH
OH
H
- H2
H
OH
H 2O
H O H
C C CO
H
OH
COOH COOH
Ac. glucuronique
Ac. gulonique
Ac. Lgulonolactone
Ac. L-ascorbique
CH2OH
OH O O C
C O
+2H
C C C OH
Dficience
Chapitre 2:
Objectifs:
OSIDES
Etablir la structure des diholosides simples Retrouver leurs proprits biologiques Etablir la structure des polyholosides ainsi que leurs proprits . biologiques
1- DEFINITION
Hydrolyse un ou plusieurs oses
Lorsquils contiennent 2 10 molcules dose : oligosides Quand ils sont forms par lunion dune grande quantit de molcules doses: polyholosides ou polyosides.
2.1- Diholosides On distingue: - Osidosides, rsulte de la liaison par les 2 fonctions rductrices Diholoside non rducteur Ex: le saccharose - Osidose, la liaison se fait par la fonction hmiactalique de lun avec la fonction alcoolique de lautre Diholoside rducteur Ex: le lactose et le maltose
2.1.1- Diholosides non rducteurs Saccharose: extrait de la canne sucre et de la betterave soluble dans leau par hydrolyse donne glucose + fructose Glucopyranose
O OH OH
6 CH2OH 5 4
1 2
OH O
Saccharase intestinale
1-2 Fructosidase
6 CH2OH
O
5 4
H OH
OH
2 1
CH2OH
2.1.2- Diholosides rducteurs 2.1.2.1- Lactose: se trouve dans le lait des mammifres 71 g/l lait de femme - 48 g/l lait de vache
CH2OH CH2OH
1-4
OH OH O O
1 2
OH
OH
1 2
OH OH
galactopyranose
glucopyranose
Galactose + glucose: la liaison se fait entre C1 du galactopyranose et C4 du glucopyranose Hydrolysable par la lactase intestinale lactose + H2O galactosidase = galactosidase galactose + glucose
1-4 1 2
O
OH
1 2
OH OH
OH
glucopyranose
glucopyranose
2 glucoses lis par une liaison 1- 4 Hydrolysable par la maltase (enzyme intestinale) = glucosidase
L enzyme qui permet lhydrolyse dun diholoside est spcifique de la configuration anomrique du groupement rducteur impliqu dans la liaison osidique. Pour hydrolyser un diholoside, on fait appel lactivit spcifique de certaines enzymes: -glucosidase -glucosidase -galactosidase -galactosidase -glucoside -glucoside -galactoside -galactoside
2.2- Oligosides Par hydrolyse donnent 2 10 molcules doses ou drivs doses Le lait de femme est riche en oligosides drivs du lactose 2.3- Polyosides polyholosides = polysaccharides = glycannes
chanes de molcules doses: linaires ou ramifies 2.3.1- Amidon Vgtaux: principale rserve glucidique. grains de bl, mas, riz, pomme de terre etc. - Insoluble dans leau froide - dans leau chaude - amidon + iode empois damidon coloration bleue
Lamidon est form de 2 substances diffrentes: Amylose: 15 30% et Amylopectine ou isoamylose 70 85%
a- Amylose Enchanement linaire dD-glucose unis par des liaisons 1- 4 200 3000 rsidus de glucose par molcule damylose.
CH2OH O OH O OH
CH2OH O
CH2OH O
CH2OH
CH2OH O OH O O OH
CH2OH O OH O OH
1
O
OH OH
1 4
O
1-4
OH O
OH OH
OH
Amylose
amylase
polymres
maltose
maltase intestin
glucose
(salive, pancras)
b- isoamylose ou amylopectine Enchanement dD-glucose unis par des liaisons 1- 4, avec des ramifications par des liaisons 1- 6
CH2OH O OH O OH CH2OH
6 CH OH
2
1-4
1
O
1
O
O OH
OH
1
OH O
OH
1-6
CH2OH O OH OH OH O
CH2OH O
6 1
O OH
CH2 O
OH
OH
1
O OH
Isoamylose
amylase
maltose + isomaltose
glucose
2.3.2- Glycogne Glucide de rserve des tissus animaux Existe dans le foie, muscle et coeur
a) proprits Soluble dans leau, insoluble dans lalcool Glycogne + iode coloration brun acajou
b) Structure Form par la condensation dunits de D-glucose unis par des liaisons 1- 4 avec des ramifications 1- 6. Le glycogne est fortement branch
Structure arborescente
1 6
glucose
1 6
1 6
Isoamylose
Structure ramifie
glycogne
Structure arborescente
2.3.3- Cellulose
H
Liaison hydrogne 6
CH2OH
4
O OH
5
H H
3
OH O
OH
2
H
1
O
3
H
2
OH
1
H
4
H
H O
1-4
CH2OH
D glucopyranose
D glucopyranose
Longue chane (100 200) de D-glucose unis par des liaisons 1-4 Constitue la paroi des cellules vgtales, substance de soutien nest pas attaque par les sucs digestifs de lhomme
Absence de la glucosidase
2.3.4- Dextranes
Produit chez certains microorganismes, PM lev Condensation de D-glucose, unis par des liaisons 1- 6 Utilis comme agent de substitution du plasma sanguin
Ce sont de longues chanes de diholosides polycondenss portant des sites anioniques (COO- et SO3-) qui sont des agents de fixation des cations
2.3.5.1- Acide hyaluronique Humeur vitre, peau, liquide synovial Constitu par la polymrisation dun diholoside de base:
COOH O O OH
1-3 1
O OH OH
CH2OH O
1- 4 1
O
COOH O OH O OH
CH2OH O
3
NH CO CH3 OH
Il est hydrolys par plusieurs enzymes: hyaluronidases fixe leau : fixe jusqu 10 000 fois son propre volume deau
2.3.5.2- Condrotine et chondrotine sulfates La condrotine ne diffre de lac hyaluronique que par la prsence de galactosamine au lieu du glucosamine
.(Ac. D-glucuronique N actyl D-galactosamine).
chondrotine sulfates
COOH O O OH O OH
SO3 - 6
1-3
SO3 O
SO3 COOH O O
CH2O
SO3 O
OH O
NH CO CH3
OH
2.3.5.3- Dermatane sulfate Peau, tendons Polymrisation de lac L-iduronique (= pimre de lacide glucuronique en C5) et du N actyl galactosamine sulfat en C4
1-3
O O COOH OH O OH
SO3 CH2OH O O
1- 4
O O COOH OH O NH CO CH3 OH
SO3 - CH OH 2
O O
L-iduronique
2.3.5.4- Keratane sulfate Cartilage costaux, disques intervertbraux Polymrisation de N actyl lactosamine sulfat en C6 sur la N actyl glucosamine
SO3 O OH O OH OH CH2OH O
1-3
O OH O
CH2OH O
1- 4
O
CH2O
NH
CO
CH3
D-Galactose
2.3.5.5- Hparine Secrte par les mastocytes du tissu conjonctif, prsente dans le foie, muscle et poumons
glucosamine
sulfat en C2 et C6
Ac glucuronique
sulfat en C2 une fois/2
3- HETEROSIDES
oses + compos non glucidique Trs rpandus chez les vgtaux Un grand nombre dhtrosides ont des proprits pharmacologiques et sont utiliss en thrapeutique
Exemple:
On peut extraire de la digitale (une plante) un htroside a proprits cardiotoniques Sa partie non glucidique = un driv de strol
LES LIPIDES
1- DEFINITION
Composs organiques - insolubles dans leau , - solubles dans les solvants organiques (alcool, chloroforme, ther, benzne..)
Lipides sont forms de 2 parties: Acide gras (Ag) Alcool ou alcool amin
Certaines substances sont classes avec les lipides cause de leur solubilit dans les solvants organiques (= substances liposolubles): alcool gras, carotnes et vitamines A, D, K et E On va tudier successivement: Les Ag et leur drivs Les alcools et alcools amins constituants des lipides Les diffrents lipides
CHAPITRE 3:
Objectifs Retrouver la nomenclature des acides gras saturs et insaturs Citer leurs proprits chimiques et biologiques Enumrer les diffrents drivs dous de proprits physiologiques
1- DEFINITION
COOH Nombre pair datome de C > ou gal 4 Saturs ou insaturs
exemple CH3-CH2-(CH2)14-CH2-COOH Nom usuel: acide starique Nom chimique: acide octadcanoque 18C COOH satur
OH
C18:0
CH3
18
2- Formule gnrale
CnH2nO2
beurre
huiles et graisses
cires
3- LES ACIDES GRAS NON SATURS OU INSATURS Nomenclature Cn: x yz Cn: xyz ou n = nombre de C x = nombre de // y,z, position de // par rapport COOH y,z, position de // par rapport CH3 3.1- Acides monothniques 3.1.1- Ac. Olique
OH O
C18: 19 1 2
CH3
ou C18: 19
18
Sries dacides gras sont dfinies par la position de la 1re double liaisons par rapport au CH3 terminal
Si la 1re // est situe aprs le 3 C: srie n-3 ou srie linolnique Si la 1re // est situe aprs le 6 C: srie n-6 ou srie linolique Si la 1re // est situe aprs le 7 C: srie n-7 ou srie palmitolique Si la 1re // est situe aprs le 9 C: srie n-9 ou srie olique
9
H H
C18: 2 9,12 1
O
C18: 2 6,9
12
CH3
18
Ag essentiel ou indispensable Se trouve dans les huiles vgtales Lac linolique est lorigine des prostaglandines
OH
9
H H
12
18 dsaturation
H
CH3
9
H H
6 1
OH O
Ac. Arachidonique 8 5 1
COOH CH3
12
H
18
CH3
11
20
C18: 3 6, 9, 12
C18: 3 6,9,12
OH
9
H H
1
O
12 15
H H
Ag essentiel ou indispensable
CH3
18
Non indispensable
Non indispensable
OH CH 3 CH 3 CH 3
OH
OH
Acide chaulmoogrique
Acide hydrocarpique
- action sur le muscle utrin et muscles lisses - action cardiovasculaire - action sur la lipolyse - action sur le SNC - stimulent la raction inflammatoire - action sur la production de la douleur et de la fivre
5.2.1- Structure de base: drive de lacide prostanoque 3 1 7 5 COOH 9 2 8 6 4 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 qui diffrent par - la nature des substituants 20
CH3
5.2.2- drivs
4 groupes de PG: E, F, A et B
- le nombre et la position des // PGE: fonction ctone en C9, OH en C11 et en C15 PGE1: contient en plus 1double liaison (13-14) PGE2: contient en plus 2 doubles liaisons (5-6) (13-14) PGE3: contient en plus 3 doubles liaisons (5-6) (13-14) (17-18) PGF: a chaque PGE correspond une PGF avec un OH en C9 PGA: le cycle pentagonal est insatur entre C10 et C11 PGB: Insatur entre C8 et C12
5.2.3- Synthse
11
COOH
1
CH3
14
20
Oxydation
COOH
1
O
9 15 11
OH CH 3
10
20
Cellules endothliales des vaisseaux sanguins Prostacyclines (vasodilatateur et inhibiteur de lagrgation plaquettaire)
PGH2
PG
5
O
1 2
COOH OH
1COOH
9 10 11
OH
8 15 13
OH CH3
9 10 20 11
OH
8 15
OH CH3
20
PGE2
PGF2
Ctone en 9 OH en 11 et 15
Rles biologiques des Ag - Energtique - Constituant des lipides (rserve ou membranaires) - Prcurseurs de substances de grande importance biologique (PG, prostacyclines et thromboxanes)
6- PROPRIETS DES AG
6.1- Proprits physiques 6.1.1- Solubilit Insolubles dans leau Solubles dans les solvants organiques 6.1.2- Formation de sels
Sels de mtaux lourds: Ca, Mg, Pb, Cu, Zn insolubles dans leau Sels alcalins: Na+, K+, NH4+: solubles dans leau = savons R-COOH + Na+ + OHAg insoluble dans leau R-COO- Na+ + H2O sel dag = Savon soluble dans leau
Savon
COO-
Na+
Ple hydrophile
Amphipathique ou amphilyophile
micelle
eau eau Les savons sont mulsionnants pour les lipides huile - Rle des savons de mnage - Rle des sels biliaires dans la digestion
colonne
Gaz entraneur
6.2- Proprits chimiques (dues aux // des Ag insaturs) 6.2.1- Isomrisation Liaisons Cis
OH
Liquide to ordinaire
H
Chauffage Ac nitreux
H OH
18
CH3
1
O
6.2.2- Migration de la double liaison 180o, 1h -CH=CH-CH2-CH=CH-CH2 malonique KOH conjugue -CH=CH-CH=CH-
6.2.3- Action des halognes Les ag insaturs fixent le Brome ou liode ( -CH2-CH=CH-CH2I2
indice diode)
-CH2-CH-CH-CH2I I
6.2.4- Rduction Les Ag insaturs peuvent fixer lhydrogne en prsence de catalyseurs -CH=CH-CH2-CH=CH-CH2liquide to ambiante
R-CH=CH-(CH2)n-COOH + 2O2
R-COOH + COOH-(CH2)n-COOH 6.2.5.2- Oxydation lair ou auto oxydation R-CH=CH-R-COOH O2 R-CHO R-CH-CH-R-COOH o-o catalyseur Peroxyde 2 aldhydes (odeur rance) + OHC-R-COOH
Antioxydants: Vit E
toxiques
Les Ag insaturs soxydent lair, on obtient des peroxydes (formes actives de loxygne), qui catalysent leur propre formation (autooxydation). Les peroxydes se transforment en 2 aldhydes odeur rance.
Chapitre 4: ALCOOLS ET ALCOOLS AMINS CONSTITUANTS DES LIPIDES 1- ALCOOLS SOLUBLES DANS LEAU 1.1- Glycrol
1.1.1- Structure
OH
1CH2OH 2 3
C CH2OH H
1.1.2- Proprits chimiques a- En prsence dun acide: monoester, diester ou triester Si lacide est un Ag: glycride
CH2OH R CO O C CH2OH H
R CO O CH2O C CH2OH CO H R R CO O CH2O C CH2O CO H CO R R
2-monoglycride
1,2-diglycride
triglycride
1.2- Inositol
OH H OH OH H
OH OH H H OH
1
H
Existe ltat libre dans les tissus vgtaux et animaux Inositol 1-2 phosphate cyclique joue un rle de messager physiologique dans certaines cellules nerveuses
1.3- Ethanolamine
H OH-CH2-CH2-NH2 + H 2O CH2OH-CH2- N+ H H OH-
- Oxydation de la choline
OH C- CH2- N+ O OHCH3 CH3 CH3
btaine
actylcholine
1.5- Sphingosine
OH
18
CH3
1 3
OH
4 5
H
2
NH2
1 3
OH
18
6
(CH2)11 CH2
4 5
H
CH3
NH2
OH CH3
Ex: cholestrol 24 23 25
CH3
22 20 17 16
18 CH 13 14 8 7 6
27
1 2 3
OH
CH3
9 10 5
26 15
C27 avec un OH en C3: (fonction alcool) Une // en 5-6 CH3 en 10 et 13 Une chane latrale en C17 Strol + Ag: stride
CHAPITRE 5: Objectifs
Retrouver la structure et le rle des glycrides, phospholipides et sphingolipides Retrouver la filiation des strols, des hormones strodes, et de la vitamine D Reconnatre la structure et les proprits biologiques des hormones strodes, mles, femelles et corticosurrnaliennes
LIPIDES COMPLEXES
glycrophosphatides (Phospholipides PL) acides phosphatidiques lcithines cphalines sphingolipides ISOPRENOIDES alcool = sphingosine
Rle des lipides: Structure des membranes cellulaires (PL) Rserve dnergie (TG) Prcurseurs de substance de grande importance biologique (vit D, prostaglandines, hormones strodes.)
CO H
R R CO O
CH2O C CH2O
CO H CO
2C 3 CH OH
R CO
C CH2OH
2- monoglycride
1,2- diglycride
TG
1.1.2- TG
constituent - les lipides du tissu adipeux - les graisses et les huiles vgtales lipides de rserve 1.1.2.1- Proprits physiques -insolubles dans leau, -solubles dans le benzne, chloroforme et ther Les TG Ag saturs sont solides to ambiante Les TG Ag non saturs sont liquides to ambiante 1.1.2.2- Proprits chimiques a- Indice diode Quantit (en g) diode fixe par 100g de graisse en solution chloroformique
Ag
+ 3 KOH
CHOH CH2OH
+ 3 R-COOK savon
TG
Glycrol
Indice de saponification = le nombre de mg de potasse qui entre en raction pour former des savons partir de 1g de graisse ou dhuile tudie Lindice de saponification (IS) renseigne sur la longueur de la chane des ag IS beurre:225 (ag courtes chanes) IS huile dolive: 185 (ag longues chanes)
c- hydrolyse enzymatique
TG
lipases digestives
Ag Diglycrides monoglycrides
Ac. palmitique
CH3
Palmitate de ctyle
CH3
CH3 CH3
+
OH
cholestrol -H2O
CH3 CH3 CH3 CH3
CH3
CH2-(CH2)14-CO
R CO R CO
O O
CH2
2 CH
OH
3 CH2
O OH
Existe dans plusieurs cellules vgtales et animales Jouent un rle mtabolique important Prcurseurs des TG, lcithines cphalines
O P O CH2 CH CH2 O O CO CO R3 R4
R2 CO
Ac. phosphatidique
glycrol
Ac. phosphatidique
2.1.2.2- Phosphatidylinositols
R1 CO R2 OH OH H OH OH H H H H OH O CO O P OH
O O O
CH2 CH CH2
Ac. phosphatidique
inositol
Phosphatidylinositol
R2 CO
Ac. phosphatidique
choline
Prsents: dans tous les tissus animaux et vgtaux plasma et la bile jaune doeuf
Le dipalmityllcithine existe dans les poumons: Agent tensioactif trs efficace : empche les surfaces internes des poumons dadhrer entre elles
cest un surfactant
Son absence dans les poumons denfants prmaturs problmes respiratoires
Phosphatidyl-ethanolamine
NH2
thanolamine
R1 CO R2 CO
O O
Phosphatidyl-serine
NH2
COOH
serine Prsentes avec les lcithines dans tous les tissus animaux et vgtaux
R CO R CO R CO
O O O
CH2 CH CH2
TG
lipides neutres
hydrophobe
R1 CO R2 CO O O CH2 CH CH2 O OH P O
R1 CO O O CH2 CH CH2 O OH P O O
hydrophile
PL
CH3 O CH2 CH2
+
Membranes cellulaires
CH3 CH3
R2 CO
CH2
CH2
NH3+
amphotres
R1
CO
O O
R2 CO
Les phospholipides sont associes des strols et des protines avec lesquelles ils forment les structures membranaires
face extracellulaire
face intracellulaire
A2
A2: coupe lAg R2, donne lysolcithine Phospholipases: C: donne un glycride + phosphocholine D: Ac phosphatidique + choline
2.2- Sphingolipides
Lipides amphipathiques Trs abondantes dans le systme nerveux central des mammifres
Lipides complexes:
alcool = sphingosine
OH H
1 3
OH
18
6
(CH2)11 CH2
4 5
H
CH3
sphingosine
NH2
Sphingosine
Liaison amide
CH3 (CH2)11 CH2 H OH NH CO
Ag
R
Les cramides existent dans les tissus animaux Ac. lignocrique C24:0 LAg peut tre: Ac. hydrolignocrique Ac. nervonique C24:115
2.2.2- Sphingomylines
O-
Phosphorylcholine
O
Sphingosine
H O P O CH3 (CH2)11 CH2 H OH NH CO CH2 CH2 N
+
Ac. lignocrique
(CH2)22 CH3
Sphingomyline Lac. lignocrique peut tre remplac par lac palmitique ou starique Existent dans: SNC: gaine de myline Les membranes cellulaires Les lipoprotines plasmatiques
cramide
H
OH OH
1 2
NH OH
galactose
CH3
(CH2)11
CH2 H OH
CO
(CH2)22 CH3
galactosylcramide Existe essentiellement dans le cerveau en petite quantit dans les autres tissus
b- Glucosylcramide Existe en petite quantit dans le cerveau et en grande quantit dans les autres tissus et dans le plasma c- Crbrosulfatides = sulfatides Galactosylcramide dont une fonction OH en C3 du galactose est estrifie par lacide sulfurique
OH H O O OH
1
NH
SO4--O
2
CH3 (CH2)11 CH2 H OH OH
CO
(CH2)22 CH3
2.2.3.2- Oligosido cramides neutres Ce sont des sphingo-glycolipides neutres, renfermant plusieurs molcules doses (galactose, glucose, osamines actyles etc) lis un cramide. cramide
H CH3 (CH2)11 CH2 H OH O
oligosides
Gal Nacety
Glu
NH CO (CH2)22 CH3
Gal
Glu
Gal
2.2.3.3- Gangliosides Sphingo-glycolipides acides, caractriss par la prsence dacide Nactyl neuraminique (NANA).
O H
1
CH3 (CH2)11 CH2 H OH NH
4
CO
N-acetylgalactosamine
Les oligoglycolipides et Les ganglyosides Trs nombreux: plus de 100 espces Rle dans: - la reconnaissance cellulaire - les communications intercellulaires. - dtermination de lappartenance au groupe sanguin A, B, AB ou O.
Les isoprnodes diffrent par le nombre de molcules disoprne, ils peuvent tre linaires ou cycliques
CH3
17
CH3
13 D 16
CH3 CH3
CH3 CH3
10
OH
10
OH
27 C 19
CH3
24 20
CH3 CH3
18 CH
27
1 3
OH
9 7 6
26
Driv 3 OH
- Coprostrol obtenu par rduction de la double liaison (5-6) du cholestrol 2 isomres prsents dans les matires fcales - 7 dshydrocholestrol
prcurseur de la vit D
prcurseur de la vit D
3.1.3- Proprits physiques des strols Insolubles dans leau 3.1.4- Proprits chimiques des strols a- Formation dester esters = strol + acide strides = strol + Ag b- Indice diode est dautant plus lev que les doubles liaisons sont nombreuses
c- Ractions colores
Raction de Liebermann
Coloration verte
lipoprotines
LP
cholestrol
Protines (apoprotines)
a- localisation
Forms dans le foie partir du cholestrol, stocks dans la vsicule biliaire
b- Structure
CH3 OH CH3 CH3
24
OH
12
1 3 7
OH
OH
position 3
Dans la bile les acides biliaires sont lis ou conjugus au Glycocolle ou la taurine qui permettent leur solubilisation
c- Rles Jouent un rle important dans la digestion des graisses, comme les savons forment des micelles avec les lipides alimentaires
25
CH3
CH3
27
1 3
26 5 7 6
UV
CH3 CH3
25
CH3
CH3
OH
1
OH OH
1,25 dihydroxycalcifrol
3
OH
1 2
3.1.6.3- Hormones strodes Isols des corticosurrnales, testicules, ovaires et placenta On distingue 3 noyaux fabriqus partir du cholestrol
18 CH3 12 11 1 2 3 4 5 6 18 CH3 19 CH3 10 9 8 14 15 7 13 17 16 19CH3 18 CH3
Oestrane (18C)
Androstane (19C)
20 21
CH3
Prgnane (21C)
CH3
CH3
17
CH3
CH3
17
3
O
3 4
H
OH
5
H
3.1.6.3.2- Hormones ovariennes et placentaires dites femelles 2 groupes dhormones sont secrtes par les ovaires a- Oestrognes noyau aromatique drivent du noyau oestrane C18
CH3 OH
CH3
17
17
3
OH
3
OH
-oestradiol
CH3
17 16
OH
3
OH
Oestriol
b- Hormones lutales:
CH3 CH3 CH3
CH3 CH3
OH
OH
CH3 OH CH3
O
CH3
OH
OH CH3
Anti-inflammatoires
Aldostrone (minralocorticode)
OH OH O O
CH3
Aldostrone 18,11-hemiacetal de 11, 21diOH3,20 dioxo-4- pregnne 18 al Assure la rgulation du mtabolisme de leau et des sels minraux dans lorganisme au niveau des tubules rnaux
3 carotnes , et
CH3
CH3
CH3 CH3
CH3
-carotne
CH3 CH3
CH3
CH3
CH3
CH3 CH3
CH3 CH3
CH3
CH3
CH3
-carotne
CH3
CH3
CH3 CH3
CH3
CH3 CH3
CH3
CH3
CH3
-carotne
Carotnes = provitamine A Intestin foie 3.2.2- Vitamine A = axrophtol ou rtinol = alcool polythnique a- Structure Alcool primaire + cycle ionone Vit A
-ionone
CH3 CH3 CH3
5 4 3 2 6 1
7 8
CH3 CH3
9 10
11
13 12 14
15
OH
b- Proprits liquide jaune oxydable lair saccumule dans le foie c- rles physiologiques - Intervient dans la synthse des glycoprotines - Facteur de croissance - Ncessaire la dshydrognation des strols - Rle dans la vision Sa carence provoque - Un arrt de croissance - Manifestations oculaires: hmralopie
3.2.3- Vitamine K
O
antihmorragique
CH3 CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
antioxydant
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3