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N dordre 2006INSAL0070

Anne 2006

Thse

Elastographie ultrasonore tridimensionnelle : de lestimation des dformations au module dYoung des tissus biologiques

prsente devant

LInstitut National des Sciences Appliques de Lyon


octobre 2006 pour obtenir

le grade de docteur
Spcialit : Images et Systemes

Ecole doctorale : LECTRONIQUE, LECTROTECHNIQUE, AUTOMATIQUE

par Ghada SAID

Jury Directeur Examinateur Examinateur Rapporteur Rapporteur Directeur M. M. M. M. M. M. BASSET Olivier LAFON Cyril MENSAH Serge POURCELOT Landre TASU Jean Pierre VRAY Didier Professeur Charg de recherche Inserm, HDR Matre de confrences, HDR Professeur Professeur Professeur

LISTE DES FIGURES ......................................................................................................................................... 7 INTRODUCTION GENERALE ....................................................................................................................... 11 CHAPITRE 1 1.1 1.2 ELASTOGRAPHIE: ASPECTS MECANIQUES ............................................................... 13 RESUME ...................................................................................................................................................... 13 LOIS DE LA MECANIQUE EN PETITES DEFORMATIONS .................................................................................. 13 1.2.1. Contraintes .................................................................................................................................... 13 1.2.2. Dplacements et dformations ...................................................................................................... 15 1.2.3. Tenseurs dlasticit...................................................................................................................... 16 1.2.4. Loi de Hooke................................................................................................................................. 17 1.3 PROPRIETES DES TISSUS BIOLOGIQUES ET LEURS APROXIMATIONS ............................................................. 19 1.3.1. Viscolasticit ............................................................................................................................... 20 1.3.2. Linarit ........................................................................................................................................ 21 1.3.3. Anisotropie.................................................................................................................................... 21 1.4 2.1 2.2 MODELE DU SOLIDE ELASTIQUE, LINEAIRE ET ISOTROPE ............................................................................ 22 ELASTOGRAPHIE: ASPECTS ULTRASONORES.......................................................... 25 MOTIVATIONS CLINIQUES ........................................................................................................................... 25 PRINCIPE DE LECHOGRAPHIE ..................................................................................................................... 26 2.2.1. Diffrents modes d'imagerie.......................................................................................................... 26 2.2.2. La rsolution.................................................................................................................................. 27 2.2.3. Le balayage ................................................................................................................................... 28 2.3 TECHNIQUES DE LELASTOGRAPHIE ............................................................................................................ 28 2.3.1. Estimation de llasticit par compression dynamique ................................................................. 28 2.3.2. Estimation de llasticit par compression statique....................................................................... 29 2.4 METHODE DE MESURE DE LA DEFORMATION AXIALE .................................................................................. 30 2.4.1. Mthodes de mesure du gradient du retard temporel .................................................................... 30 2.4.2. Mthodes bases sur lestimation du facteur dchelle ................................................................. 31 2.4.3. Mthodes dans le domaine frquentiel .......................................................................................... 32 2.5 ESTIMATION DE LA DEFORMATION LATERALE ............................................................................................ 33 2.5.1. Les mthodes rayons multiples................................................................................................... 33 2.5.2. Les mthodes de phase latrale ..................................................................................................... 33 2.5.3. Les mthodes de mise en correspondance..................................................................................... 34 2.6 RECONSTRUCTION DU MODULE DELASTICITE ........................................................................................... 35 2.6.1. Une mthode analytique................................................................................................................ 35 2.6.2. Equations de base de l'lasticit .................................................................................................... 36 2.6.3. Diffrentes approches de rsolution du problme ......................................................................... 37 2.7 3.1 3.2 CONCLUSION .............................................................................................................................................. 38 LES METHODES MISES EN UVRE............................................................................... 41 RESUME ...................................................................................................................................................... 41 RECONSTRUCTION DU MODULE DYOUNG .................................................................................................. 42

CHAPITRE 2

CHAPITRE 3

3.3

ESTIMATION DE LA DEFORMATION AXIALE:................................................................................................ 45 3.3.1. Calcul des facteurs dchelle locaux ............................................................................................. 46 3.3.2. Calcul de la dformation ............................................................................................................... 47 3.3.3. Fentrage adaptatif ........................................................................................................................ 47

3.4

CARACTERISATION DE LESTIMATION DE LA DEFORMATION : .................................................................... 48 3.4.1. Le rapport signal sur bruit ............................................................................................................. 48 3.4.2. Le contraste ................................................................................................................................... 48

3.5

ESTIMATION DES DEPLACEMENTS LATERAUX ............................................................................................. 49 3.5.1. tirement des signaux RF dans la direction axiale........................................................................ 50 3.5.2. Interpolation dans la direction latrale .......................................................................................... 50 3.5.3. Intercorrlation entre les signaux avant et aprs compression tirs et interpols. ....................... 51

3.6 3.7

AMELIORATION DE LESTIMATION DES DEPLACEMENTS LATERAUX ........................................................... 52 ADAPTATION A LA GEOMETRIE SECTORIELLE ............................................................................................. 54 3.7.1. Estimation des dplacements angulaires. ...................................................................................... 54 3.7.2. Calcul des dplacements axiaux et latraux .................................................................................. 55

3.8 4.1 4.2

CONCLUSION .............................................................................................................................................. 55 VALIDATION DES METHODES........................................................................................ 57 RESUME ...................................................................................................................................................... 57 SIMULATIONS ............................................................................................................................................. 58 4.2.1. Modlisation par lments finis .................................................................................................... 58 4.2.2. Simulation des images chographiques......................................................................................... 59 4.2.3. Evaluation de lalgorithme en simulation...................................................................................... 60 4.2.4. Etude de linfluence de la focalisation de la sonde sur lestimation des dplacements latraux en simulation .................................................................................................................................................. 66

CHAPITRE 4

4.3

EXPERIMENTATIONS ................................................................................................................................... 68 4.3.1. Matriaux du fantme test ........................................................................................................... 68 4.3.2. Cas dune sonde linaire ............................................................................................................... 71 4.3.3. Cas dune sonde sectorielle ........................................................................................................... 76

4.4 5.1 5.2 5.3 5.4 5.5

CONCLUSION .............................................................................................................................................. 80 EXTENSION EN 3D............................................................................................................... 83


RESUME ...................................................................................................................................................... 83

CHAPITRE 5

ACQUISITION DES DONNEES RF EN 3D ....................................................................................................... 83


RECONSTRUCTION DU MODULE DYOUNG : EXTENSION EN 3D................................................................... 85 SIMULATION ............................................................................................................................................... 87

EXPERIMENTATION ..................................................................................................................................... 88 5.5.1. Dispositif et gomtrie dacquisition ............................................................................................ 88 5.5.2. Calcul des dplacements axiaux, latraux et azimutaux................................................................ 89 5.5.3. Rsultats exprimentaux ............................................................................................................... 90

5.6

CONCLUSION .............................................................................................................................................. 99

CONCLUSION GENERALE ET PERSPECTIVES ..................................................................................... 101

ANNEXE A-PROJECTION DES DEPLACEMETNS DANS UN REPERE CARTESIEN...................... 103 ANNEXE B-LISTE DES PUBLICATIONS ................................................................................................... 104 BIBLIOGRAPHIE............................................................................................................................................ 105

LISTE DES FIGURES


Figure 1-1 Dfinition de la contrainte s'exprimant comme la force par unit de surface exerce par la matire situe du ct de la normale sur la matire situe de l'autre ct..................... 14 Figure 1-2 Prsentation des neuf composantes de la contrainte. 11, 22 et 33 sont les composantes normales et les autres composantes sont les contraintes tangentielles ou de cisaillement............................................................................................................................... 14 Figure 1-3 Evolution de et en fonction du coefficient de Poisson [FUNG-93]................. 19 Figure 1-4 Exemple dune courbe de relaxation [FUNG-93] .................................................. 21 Figure 1-5 Variation du module dYoung pour diffrentes valeurs de la contrainte applique pour deux types de tissus. Un tissu dur, en trait plein, et un tissu mou, en pointill. A droite sont reprsents les fantmes avant et aprs dformation. La couche molle subit une dformation de 8% et la couche dure de 4% [EMEL-98]. ....................................................... 22 Figure 2-1 Fantme en ponge avec une inclusion rigide en son centre. (a) Image chographique. (b) Elastogramme correspondant [BRUS-00]. ............................................... 26 Figure 2-2 Image chographique dun foetus de 27 semaines. (http://www.medical.philips.com)............................................................................................ 27 Figure 2-3 Milieu sollicit avec une onde impulsionnelle. On distingue les dplacements dus une onde de compression P et une onde de cisaillement S [CATH-99]................................ 29 Figure 2-4 (a) Image RF obtenue en simulation avec le formateur de voies dcrit dans [LIEB05a]. (b) Profil axial (profil blanc). (c) Profil latral (profil noir). On voit apparatre des oscillations dans la rponse impulsionnelle latrale. ............................................................... 34 Figure 3-1 Fantme numrique avec une inclusion rigide en son centre. (a) Dformation axiale. (b) Cartographie du module dYoung........................................................................... 42 Figure 3-2 Principe destimation des dformations axiales par la mthode du facteur dchelle. Le signal avant compression est divis en p fentres temporelles de longueur L. Le signal post-compression est divis en fentres dont la taille dpend des facteurs dchelle trouvs prcdemment.............................................................................................................. 47 Figure 3-3 Observation locale des signaux RF avant et aprs compression 2 cm de profondeur pour un fantme inhomogne. (a) Avec tirement local. (b) Avec tirement global. .................................................................................................................................................. 50 Figure 3-4. Principe de la mthode destimation des dplacements latraux. y1 et y2 sont deux signaux RF contigus pr comprims. x1 et x2 sont des signaux RF post comprims et tirs localement . z1 et z2 sont des signaux RF interpols partir des signaux post comprims originaux x1 et x2. Le signal de la fentre ti est intercorrl avec les signaux des fentres tij. Le maximum de la fonction dintercorrlation donne le dplacement latral dL. ........................ 51 Figure 3-5: Interpolation parabolique des maximum des fonctions dintercorrlation. Le dplacement latral estim nest plus dL mais dL. ................................................................. 52 Figure 3-6 Dplacements latraux en mm estims sur un fantme avec inclusion et obtenus avec linterpolation de 8 lignes RF intermdiaires entre chaque paire de signaux RF post comprims. (a) Sans interpolation parabolique des coefficients dintercorrlation. (b) Avec

interpolation. (c) Profils de dplacement latral obtenus avec interpolation parabolique (en rouge) et sans interpolation (en bleu). (Dimension des images en mm). ................................ 53 Figure 3-7 Gomtrie de l'acquisition: (a) linaire, (b) sectorielle. ......................................... 54 Une fois les dplacements radiaux et angulaires calculs, il est intressant de calculer les dplacements dans le repre cartsien, appels dplacements axiaux et latraux. Pour calculer ces dplacements il faut projeter les dplacements radiaux et angulaires dans un repre cartsien (Figure 3-8). Les quations de projection pour une ligne sont les suivantes:........... 55 Figure 3-9. ux et uz sont les dplacements dans un repre cartsien. ua et ur sont les dplacements dans un repre polaire........................................................................................ 55 Figure 4-1 Les tapes principales du processus de construction du module dYoung en simulation. ................................................................................................................................ 58 Figure 4-2 Cube de 50x50x50 mm3 avec en son centre une inclusion cylindrique plus rigide de 20 mm de diamtre, maill avec Femlab............................................................................. 60 Figure 4-3 Dplacements axiaux en mm et dformation en % du fantme avec une inclusion cylindrique deux fois plus rigide en son centre suite lapplication de 3% de dformation. (a) Carte de dplacements de rfrence fournie par Femlab. (b) Dplacement estim par intgration des dformations. (c) Dformation thorique de rfrence fournie par Femlab. (d) Dformation estime par la mthode du facteur dchelle. (Dimensions des images en mm). 62 Figure 4-4 Dplacements latraux en mm du fantme numrique avec une inclusion cylindrique deux fois plus rigide en son centre suite lapplication de 3% de dformation. (a) Carte des dplacements thorique de rfrence fournie par Femlab. (b) Dplacements estims par traitement des images RF. (c) Profils des dplacements latraux au niveau de linclusion (profondeur 25 mm). Profil de rfrence en bleu, profil des dplacements estims en rouge. (Dimensions des images en mm). ............................................................................................ 64 Figure 4-5 Dformation latrale en % du fantme avec une inclusion cylindrique deux fois plus rigide en son centre suite lapplication de 3% de dformation. (a) Dformation thorique de rfrence fournie par Femlab. (b) Dformation. (c) Profils moyens (10 lignes au niveau de linclusion) des dplacements latraux (les dplacements de rfrence sont en bleu) dans linclusion. (Dimensions des images en mm). ................................................................. 65 Figure 4-6 (a) Cartographie reconstruite du module d'Young en kPa du fantme avec en son centre une inclusion cylindrique de module dYoung 100kPa deux fois plus rigide que le milieu englobant. (b) Image chographique (sonogramme) correspondante simule avec FIELD partir du fantme numrique. (Dimensions des images en mm). ............................. 66 Figure 4-7 Enveloppes des rponses impulsionnelles dun fantme de dix diffuseurs ponctuels, obtenues pour deux distances de focalisation simple en mission. (a) A 20 mm. (b) A 40 mm................................................................................................................................... 66 Figure 4-8 Observation locale de la tache produite par un diffuseur 20 mm de profondeur. (a) Image produite pour une distance focale de 20 mm.(b) Image produite pour une distance focale de 40 mm. ...................................................................................................................... 67 Figure 4-9 Dformations latrales du fantme avec une inclusion rigide en son centre subissant 3% de dformation. (a) Focale en mission 20 mm de profondeur. (b) Focale en mission 40 mm de profondeur. (Dimension de limage en mm) ......................................... 67 Figure 4-10 Dformations axiales du fantme avec une inclusion rigide en son centre subissant 3% de dformation. (a) Focale en mission 20 mm de profondeur. (b) Focale en mission 40 mm de profondeur. (Dimensions des images en mm)....................................... 68 8

Figure 4-11 Gomtrie du fantme. Linclusion cylindrique est plus rigide que le milieu englobant. ................................................................................................................................. 71 Figure 4-12 (a) Banc de mesure. (b) Sonde chographique B&K 3535. et systme de fixation. .................................................................................................................................................. 72 Figure 4-13 Dplacements et dformations axiaux du fantme en cryogel avec une inclusion rigide. (a) Image du dplacement en mm. (b) Image de la dformation en %. (Dimensions en mm). ......................................................................................................................................... 73 Figure 4-14 Dplacements et dformations latraux du fantme en cryogel avec une inclusion rigide. (a) Image du dplacement en mm. (b) Image de la dformation en %. (Dimensions des images en mm). ........................................................................................................................ 74 Figure 4-15 (a) Cartographie du module dYoung (en kPa) du fantme en cryogel. (b) Sonogramme correspondant. (c) Profil de module dYoung 15mm de profondeur. (Dimensions des images en mm) ............................................................................................. 74 Figure 4-16 Sonde et systme de compression utiliss pour lacquisition des donnes sur un morceau de viande bovine dans lequel une inclusion dagar a t injecte pour simuler une inclusion. .................................................................................................................................. 75 Figure 4-17 Rsultats in vitro sur un morceau de viande bovine comportant une inclusion en agar plus rigide. (a) Dformation axiale en %. (b) Sonogramme correspondant. (c) Profil moyen de la dformation axiale sur 10 lignes au niveau de linclusion. (Dimensions des images 30x30mm). ................................................................................................................... 76 Figure 4-18 (a) Echographe Kretz Voluson 530D. (b) Sonde et systme de fixation.............. 77 Figure 4-19 Image chographique du fantme avec une inclusion cylindrique en son centre acquise avec une sonde sectorielle. Linclusion nest pas visible sur limage chographique.78 Figure 4-20 Dplacements en mm estims sur le fantme suite lapplication de 1.5% de dformation. (a) Dplacements radiaux. (b) Dplacements angulaire. (Dimensions des images en mm)...................................................................................................................................... 79 Figure 4-21 Dplacements en mm estims sur le fantme suite lapplication de 1.5% de dformation. (a) Dplacements axiaux. (b) Dplacements latraux. (Dimensions des images en mm)...................................................................................................................................... 79 Figure 4-22 (a) Cartographie du module dYoung (en kPa) du fantme en cryogel avec une inclusion cylindrique plus rigide en son centre. (b) Profil moyen du module dYoung au niveau de linclusion. ............................................................................................................... 80 Figure 5-1 Acquisition dun volume par translation dune sonde 1D linaire. (a) Volume obtenu avec une sonde linaire. (b) Volume obtenu avec une sonde sectorielle. .................... 84 Figure 5-2 Acquisition dun volume par rotation dune sonde 1D linaire. (a) Volume obtenu avec une sonde linaire. (b) Volume obtenu avec une sonde sectorielle. ................................ 84 Figure 5-3 (a) Fantme cubique de 55x30x55 mm avec inclusion cylindrique rigide en son centre. (b) Dplacement axial. (c) Dplacement latral. (d) Dplacement azimutal. .............. 87 Figure 5-4 Sonde endovaginale S-VDW5-8B permetant lacquisition de volumes dimage. . 88 Figure 5-5 Gomtrie de lacquisition. r, a, s dsignent les directions radiale, angulaire et sectorielle respectivement. est langle de balayage de la barrette sectorielle. est langle de balayage dans le plan image. z, x, y dsignent les directions axiale, latrale et azimutale respectivement.......................................................................................................................... 89

Figure 5-6 (a) Dformation radiale estime dans le plan mdian du volume. (b) Image chographique correspondante(c) Dformation radiale moyenne et cart type estime en fonction du numro du plan dans le volume, dans linclusion (en bleu) et lextrieur de linclusion (en rouge), (d) Contraste (CNRe) calcul en fonction du numro du plan dans le volume (e) Rapport signal sur bruit (SNRe) calcul en fonction du numro du plan dans le volume (f) Dformation radiale reconstruite dans un plan perpendiculaire au plan de limage. (Les dimensions des images sont en mm et les dformations sont en %)................................ 92 Figure 5-7 (a) Dplacements radiaux dans le plan mdian du volume. (b) Dplacements radiaux dans un plan 15o du plan mdian. (c) Dplacements axiaux dans le plan mdian du volume. (d) Dplacements axiaux dans un plan 12 mm du plan mdian du volume. (e) Carte de dplacements de rfrence fournie par Femlab du plan correspondant. (f) Profils des dplacements axiaux 48 mm de profondeur. Profil de rfrence en bleu, profil estim en rouge. (Les dimensions et les dplacements sont donns en mm) ........................................... 93 Figure 5-8 (a) Dplacements angulaires dans le plan mdian du volume. (b) Dplacements angulaire dans un plan 15o du plan mdian. (c) Dplacements latraux dans le plan mdian du volume. (d) Dplacements latraux dans un plan 15o du plan mdian du volume. (e) Carte de dplacements latraux de rfrence fournie par Femlab du plan mdian. (f) Profils des dplacements latraux 48 mm de profondeur. Profil de rfrence en bleu, profil estim en rouge. (Les dimensions et les dplacements sont donns en mm) ...................................... 95 Figure 5-9 (a) Dplacements sectoriels estims dans le plan mdian du volume. (b) Dplacements sectoriels estims dans un plan 15o du plan mdian. (c) Dplacements azimutaux dans le plan mdian du volume. (d) Dplacements azimutaux dans un plan 15o du plan mdian du volume. (e) Carte de dplacements de rfrence fournie par Femlab du plan mdian. (f) Profils des dplacements azimutaux 48 mm de profondeur. Profil de rfrence en bleu, profil estim en rouge. (Les dimensions et les dplacements sont donns en mm) ... 96 Figure 5-10 (a) Dformation axiale estime dans le plan mdian du volume. (b) Dformation de rfrence dans le plan correspondant (c) Moyenne et cart type de la dformation axiale estime dans linclusion (en bleu) et lextrieur de linclusion (en rouge) en fonction du numro du plan dans le volume (d) Contraste (CNRe) en fonction du numro du plan dans le volume (e) Rapport signal sur bruit (SNRe) en fonction du numro du plan dans le volume. 97 Figure 5-11 (a) Dformation latrale estime (b) Dformation latrale de rfrence fournie par Femlab. (Les dformations sont en %, les dimensions sont en mm) ....................................... 98 Figure 5-12(a) Dformation azimutale estime. (b) Dformation azimutale de rfrence. (Les dformations sont en %, les dimensions sont en mm) ............................................................. 98 Figure 5-13 (a) Module dYoung reconstruit (en kPa) du fantme en cryogel avec inclusion cylindrique plus rigide en son centre. (b) Moyennes et cart type du module dYoung dans linclusion (profil bleu), lextrieur de linclusion (profil rouge) en fonction du numro du plan du volume. (Les dimensions sont en mm)........................................................................ 99 Figure 5-14 (a) Dans le plan image, r, a et x dsignent les directions radiale, angulaire, et latrale respectivement, z dnote le mdian, est langle de la ligne RF courante par apport laxe z. (b) Dans le plan perpendiculaire au plan image, s, z et y dsignent les directions sectorielle, axiale et azimutale respectivement, est langle courante de balayage volumique. ................................................................................................................................................ 103

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INTRODUCTION GENERALE

La caractrisation des tissus prsente un intrt fondamental en diagnostic mdical. Depuis les vingt dernires annes, la communaut scientifique sintresse une nouvelle mthode dimagerie mdicale, il sagit de llastographie ultrasonore. Cest une mthode dimagerie mdicale base sur lchographie et dont le but est de fournir une image des caractristiques lastiques du milieu. Cette technique, encore rcente, et qui fait lobjet de nombreux programme de recherche, viendra en complment de lchographie conventionnelle qui est notamment largement utilis pour dtecter des tumeurs et des kystes dans les tissus biologiques. Pourtant toutes les tumeurs ne sont pas malignes. Par exemple le fibrome et le carcinome infiltrant, le cancer le plus frquent du sein, sont durs mais seul le dernier est malin. Etant donn que ni la mammographie ni l'chographie ne permettent toujours pas d'estimer la bnignit ou la malignit de la tumeur, une ponction peut tre ncessaire pour dterminer la nature du nodule sachant que dans 90% des cas il sagit dun nodule bnin. Cet acte est coteux et pnible pour le patient. Les changements dlasticit dans les tissus biologiques sont gnralement lis des processus pathologiques. A titre dexemple, certaines tumeurs cancreuses du sein ou de la prostate se dveloppent sous forme de nodules plus rigides que les tissus sains environnants. En effet, il a t montr que ces nodules ont un module dYoung beaucoup plus lev que les tissus englobants [KROU-98]. Dautres maladies au contraire rduisent llasticit des tissus atteints comme la cirrhose du foie. Enfin dautres maladies, comme la plaque dathrosclrose, impliquent le dpt de lipides et/ou de collagne sur les parois vasculaires rsultant en une augmentation ou une diminution de leur lasticit. Un examen mdical simple utilis en premire intention sur les organes accessibles pour la dtection des nodules rigides est la palpation, cest--dire lexamen manuel des variations dlasticit au sein des tissus. Cest le cas pour la dtection des cancers du sein, de la thyrode ou bien de la prostate. Toutefois lefficacit de la palpation reste limite la dtection danomalies superficielles et de taille relativement importante, autrement dit un stade dj avanc de la maladie. De plus, la palpation nest pas capable de donner une information quantitative. Base sur les mmes principes que la palpation, llastographie tudie localement le comportement lastique (la dformation) dun milieu sous laction dune contrainte. Cette tude repose sur l'analyse des signaux ultrasonores radiofrquences (RF) acquis avant et aprs application de la contrainte, ou acquis pour diffrents niveaux de contrainte. Les techniques actuelles d'lastographie ultrasonore consistent gnralement fournir une image de dformation axiale des tissus lorsquils subissent une compression axiale. Or les dformations au sein de lobjet soumis une telle compression se font en 3D. De plus, dans les applications cliniques une mesure quantitative de la rigidit des tissus comme le module dYoung est fortement souhaitable pour la dtection, la quantification et la classification des lsions selon leur caractre bnin ou malin.

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Lobjectif de ce travail de thse est de proposer une estimation 3D des dplacements et des dformations ainsi que la reconstruction du module dYoung. Le manuscrit est organis de la manire suivante: Dans le chapitre 1, les notions de base de la mcanique permettant de comprendre le comportement dun solide lastique linaire soumis une contrainte externe sont rappeles. Il y est prsent les notions de tenseur de contrainte et de dformation, ainsi que la loi de Hooke gnralise qui relie ces deux dernires grandeurs. Les proprits mcaniques des tissus biologiques et les hypothses qui conduisent un modle solide lastique linaire et isotrope sont galement discutes. Dans le chapitre 2 nous prsentons diffrentes techniques de traitement du signal et de limage qui ont dj t dcrites dans la littrature pour lestimation du champ de dplacements et de dformations dans les directions axiales et latrales. Deux mthodes de reconstruction du module dYoung sont galement prsentes dans ce chapitre: la mthode base sur la rsolution de lquation de lquilibre et la mthode qui minimise une fonction derreur issus de la comparaison des mesures exprimentales et des donnes de simulation. Le chapitre 3 est consacr la description des techniques de traitement du signal que nous avons mises en uvre pour lestimation des dplacements et des dformations en 2D ainsi que la reconstruction du module dYoung. La mthode destimation de la dformation axiale est base sur une estimation locale et adaptative des facteurs dchelle. Pour les dplacements latraux, une mthode base sur la corrlation et linterpolation des signaux RF a t mise en oeuvre. La mthode de reconstruction du module dYoung ncessite la connaissance a priori de la valeur du module dYoung en surface de lobjet comprim ainsi que les dplacements axiaux et latraux du milieu qui subit la compression. Le chapitre 4 prsente une validation des algorithmes mis en uvre pour l'estimation des dformations axiales et latrales ainsi que la reconstruction du module d'Young. Des rsultats sont prsents partir dimages chographiques radiofrquence (RF) simules. Les simulations des images chographiques ont t ralises l'aide du logiciel FIELD dvelopp par Jorgen Jensen [JENS-92]. Une validation exprimentale est galement prsente. Elle a t ralise avec un fantme en cryogel contenant en son centre, une inclusion cylindrique plus rigide. Deux chographes sont utiliss pour les acquisitions avec une sonde sectorielle et une sonde linaire. Les rsultats sont compars avec un modle dlments finis soumis un champ de dformation. Des rsultats d'estimation axiale sur des tissus biologiques sont galement prsents. Des rsultats exprimentaux de lestimation des dplacements et des dformations axiaux, latraux et azimutaux dans tous les plans du volume imag sont prsents dans le chapitre 5. Pour lacquisition des donnes en 3D, une sonde sectorielle balayage volumique sectorielle a t utilise. La reconstruction du module dYoung dans tous les plans du volume, partir des dplacements et des dformations axiaux et latraux est finalement prsente.

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CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

CHAPITRE 1
ELASTOGRAPHIE: ASPECTS MCANIQUES

1.1

RESUME

Llastographie est une modalit dimagerie de llasticit des tissus, ou plus prcisment du comportement lastique des tissus soumis une contrainte. Cette mthode sappuie sur la thorie de la mcanique des milieux lastiques. Dans ce chapitre nous rappelons les notions de tenseur de contrainte et de dformation, ainsi que la loi de Hooke gnralise qui relie ces deux grandeurs par lintermdiaire des 81 composantes du tenseur dlasticit. Celles-ci reprsentent les proprits lastiques du milieu. Les hypothses permettant de rduire le nombre de constantes de 81 2 et les constantes de Lam (,) sont alors exposes de mme que le module dYoung et le cfficient de Poisson (E,) qui sont plus frquemment utiliss en biomcanique. Les proprits mcaniques des tissus biologiques et les hypothses qui conduisent un modle solide lastique linaire et isotrope sont galement discutes [FUNG93], [LAND-90].

1.2

LOIS DE LA MECANIQUE EN PETITES DEFORMATIONS Contraintes

1.2.1.

Dans un corps non dform la disposition des molcules correspond son tat dquilibre thermique. Dans ces conditions, toutes les parties du corps sont galement en quilibre entre elles. Cela signifie que si lon considre un volume quelconque lintrieur du corps, la rsultante de toutes les forces exerces sur ce volume de la part des autres parties est nulle. Aprs dformation, la disposition des molcules change et le corps se trouve cart de ltat dquilibre initial. Il en rsulte lapparition de forces qui tendent faire revenir le corps ltat dquilibre. Ces forces internes qui prennent naissance par suite de la dformation sont appeles contraintes internes. Si le corps nest pas dform, les contraintes sont nulles. Les forces extrieures, ncessaires pour dformer le corps, sont exerces sur sa surface, par effet mcanique, ou en son cur, par un champ de force (tel le champ de pesanteur). Les contraintes ont la dimension dune pression. En revanche, la diffrence dune pression (exclusivement normale) elles ont une composante normale et une composante tangentielle. Imaginons une facette de surface dS dans un milieu continu (Figure 1-1). La partie de ce milieu situe dun ct de dS exerce sur lautre partie une force df. Les interactions entre les

13

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

deux parties du milieu tant courte distance, on dfinit le vecteur contrainte en un point O de cette surface comme la limite :

= lim

dS 0

df dS

1.1

Au point O, la normale la surface est dfinie par le vecteur unitaire n, oriente vers lextrieur de la partie du milieu qui subit la contrainte.

(2)
Contrainte tangentielle

Contrainte normale

n o dS

(1)

Figure 1-1 Dfinition de la contrainte s'exprimant comme la force par unit de surface exerce par la matire situe du ct de la normale sur la matire situe de l'autre ct
33 3 31 13 12
n3

32

23 2
22 21

11
n2

n1

Figure 1-2 Prsentation des neuf composantes de la contrainte. 11, 22 et 33 sont les composantes normales et les autres composantes sont les contraintes tangentielles ou de cisaillement Pour une description complte de la contrainte, toutes ses composantes doivent tre considres. Considrons un lment de volume reprsent par un cube. Daprs la premire condition dquilibre, l'action et la raction des forces avec lesquelles les diverses parties du volume considr agissent les unes sur les autres se neutralisent mutuellement. Il en rsulte que les contraintes agissant sur ce volume sont entirement dtermines par 3 vecteurs contraintes 1, 2 et 3, s'exerant sur 3 faces perpendiculaires (Figure 1-2). En projetant ces vecteurs contraintes sur les axes dfinissant l'espace, il en dcoule que la contrainte est dcrite par 9 composantes formant un tenseur. La projection du vecteur contrainte sur la normale n est appele contrainte normale, et celles sur les autres axes, contraintes tangentielles ou de

14

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

cisaillement. La contrainte interne se prsente dans ce cas comme tant un tenseur de 9 lments :
11 12 13 = 21 22 23 31 32 33

1.2

Les contraintes 11,22 et 33 sont les contraintes normales et les autres composantes sont les contraintes de cisaillement La condition d'quilibre impose que les moments des forces agissant sur les surfaces sont nuls et par consquence, le tenseur de contrainte est symtrique (ij=ji) ce qui rduit le nombre de composantes six.
11 12 13 = 12 22 23 13 23 33

1.3

1.2.2.

Dplacements et dformations

Sous leffet des forces appliques, les corps solides se dforment dune manire plus au moins importante. Cest dire que chaque point du solide subit un dplacement. Ce dplacement est dfini comme la diffrence entre la position initiale et la position finale. Considrons deux points infiniment voisins P et Q quelconques du corps. Les coordonnes de ces points dans le repre (O, n1 , n2 , n3 ) sont notes P(x1,x2,x3) et Q(x1+dx1,x2+dx2,x3+dx3). La distance entre ces deux points est donc:
dl = dx12 + dx 2 2 + dx3 2

1.4

Aprs la dformation chaque point a subi un dplacement. Le vecteur du ( P, Q) donn par lquation 1.5, mesure la variation du dplacement entre les points P et Q.
du ( P, Q) = u ( P ) u (Q)

1.5

La distance entre les deux points devient :


dl ' = (dx1 + du1 ) 2 + (dx 2 + du 2 ) 2 + (dx3 + du 3 ) 2

1.6

Soit en utilisant la convention de sommation d'Einstein1

Cette notation dsigne une sommation sur les indices qui sont rpts dans un mme monme de l'galit. Ainsi l'quation 1.7 est quivalente : dl'=dl+2du1.dx1+2du2.dx2+2du3.dx3+du1+du2+du3

15

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

dl '2 = dl + 2du i .dxi + du i

1.7

O i=j=k=1,2,3. La dcomposition de la drive totale en fonction des diffrentes variables scrit : u dui = i dx j x j

1.8

Lquation 1.7 devient alors :


u u j u k u k dx dx + dl '2 = dl 2 + i + x j xi x j xi i j

1.9

Par dfinition la dformation est la diffrence entre la distance finale et la distance initiale, cest dire le terme : 1 u ij = i +
2 x j

u j xi

u k u k x j xi

1.10

La dformation est une grandeur sans dimension, elle reprsente en fait un taux de dplacement. Physiquement le terme ij correspond au dplacement dans la direction xi d'une surface perpendiculaire xj. Gnralement les valeurs des dplacements sont petites et donc le terme d'ordre 2 est ngligeable. L'expression de la dformation devient alors:
ij = i + 2 x j xi 1 u u j 1.11

Ce tenseur est symtrique. Le tenseur de dformation est donc entirement dfini par 6 composantes :
11 = 12 13

12 13 22 23 23 33

1.12

Les termes diagonaux qui ont le mme indice rpt deux fois, correspondent aux dformations de compression et dilatation. Les termes indices croiss de la matrice de dformation sont ceux qui correspondent un cisaillement pur.

1.2.3.

Tenseurs dlasticit

Les proprits mcaniques d'un milieu sont entirement dfinies par la relation liant contraintes et dformations. Aucun modle mathmatique simple ne peut tre utilis pour

16

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

dcrire le comportement mcanique de la large varit de matriaux existants. Plusieurs simplifications sont requises pour avoir un modle facile utiliser. Trois modles sont habituellement considrs suivant la nature du milieu. Il sagit du fluide non visqueux, du fluide visqueux newtonien et du solide lastique de Hooke. Cest ce dernier modle qui est considr dans le cas de llastographie quasi-statique mme si, compar ce modle, la plupart des matriaux biologiques prsentent en toute rigueur un comportement mcanique plus complexe.

1.2.4.

Loi de Hooke

Lexprience montre que lorsque la dformation dun solide lastique est petite, elle dpend linairement de la contrainte : cest la loi de Hooke. En d'autres termes il existe un tenseur Cijkl, tel que:
ij = Cijkl kl

1.13

Cette relation est la loi de Hooke gnralise. O ij est le tenseur de contrainte, kl est le tenseur de dformation et Cijkl est le tenseur dlasticit qui caractrise les proprits mcaniques des matriaux. Il est quivalant une pression et est donn en Pascal. Comme ij est symtrique en i,j , Cijkl est symtrique en i,j, i. e. : {i, j , k , l} { ,2,3} 1
4

C ijkl = C jikl

1.14

De la mme faon Cijkl est symtrique en k,l puisque kl est symtrique, i.e. : {i, j , k , l} { ,2,3} 1
4

C ijkl = C jilk

1.15

En consquence seulement 6x6=36 composantes dlasticits indpendantes sont ncessaires pour dfinir les proprits lastiques et linaires des matriaux (1.16) :
C1111 C 2211 C = 3311 C 2311 C 1311 C 1211 C1122 C 2222 C 3322 C 2322 C1322 C1222 C1133 C 2233 C 3333 C 2333 C1333 C1233 C1123 C 2223 C 3323 C 2323 C1323 C1223 C1113 C 2213 C 3313 C 2313 C1313 C1213 C1112 C 2212 C 3312 C 2312 C1312 C1212

C ijkl

1.16

De plus, daprs la relation de Maxwell, dans le cas des milieux isothermes, le tenseur Cijkl est symtrique. Ce qui permet de reprsenter ce tenseur par une matrice symtrique, donc avec 21 composantes indpendantes (quation.1.17).

17

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

C1111 C1122 C 1133 Cijkl = C1123 C1113 C 1112

C1122 C 2222 C 2233 C 2223 C 2213 C 2212

C1133 C 2233 C3333 C3323 C3313 C3312

C1123 C 2223 C3323 C 2323 C 2313 C 2312

C1113 C 2213 C3313 C 2313 C1313 C1312

C1112 C 2212 C3312 C 2312 C1312 C1212

1.17

Dans un solide isotrope, les proprits mcaniques sont indpendantes de l'orientation. Sous cette hypothse, seulement deux constantes indpendantes (,), appels constantes de Lam, sont requises pour dcrire les proprits des matriaux (quation 1.18).

ij = ii ij + 2 ij
O ij est le symbole de Kronecker donn par :

1.18

ij =

1, si i = j 0, si i j

1.19

reprsente le coefficient d'lasticit de compression et le coefficient d'lasticit de cisaillement. Lexpression de 1.8 sous forme matricielle donne :
11 + 2 22 33 = 23 0 13 0 0 12

+ 2 + 2
0 0 0 0 0 0

0 0 0

0 0 0 0

0 0

0 11 0 22 0 33 0 2 23 0 213 212

1.20

Le comportement mcanique d'un solide lastique, linaire et isotrope est donc entirement dcrit par la seule connaissance de et . Les proprits dlasticit peuvent aussi tre dfinies partir de deux coefficients, le module d'Young (E) et le coefficient de Poisson () qui ont une signification plus pratique. Le coefficient de Poisson est sans dimension, il ne peut pas dpasser la valeur 0.5, qui correspond au cas dun solide incompressible, cest dire que le volume dplac dans une direction se retrouve totalement dans les autres directions. Le module dYoung a la dimension dune pression. Dans le cas o la contrainte est applique suivant l'axe x1, le module dYoung est dfini par lquation
E=

11 11

1.21

, , E et sont lies par des quations (1.22) et (1.23):

18

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES E (1 + )(1 2 ) E = 2(1 + )

1.22 1.23

Figure 1-3 Evolution de et en fonction du coefficient de Poisson [FUNG-93]

La Figure 1-3 reprsente lvolution des constantes de Lam lorsque varie entre 0 et 0.5 pour un module dYoung donn. On note que tend vers linfini pour les matriaux incompressible (=0.5). La relation de Hooke avec le module dYoung et le coefficient de Poisson scrit :

ij =

E E kk ij + ij (1 + )(1 2 ) (1 + )

1.24

1.3 PROPRIETES DES TISSUS BIOLOGIQUES ET LEURS APROXIMATIONS


Les tissus biologiques sont des matriaux complexes tudier car ils sont composs de divers lments. La composition de ces lments est difficilement quantifiable car elle dpend de chaque individu et de ltat pathologique du tissu. De plus la mesure des caractristiques mcaniques des tissus est en gnral effectue ex vivo ce qui ne correspond pas forcment leur tat in vivo. Peu dtudes ont t consacres la caractrisation des tissus biologiques. Ces quelques tudes ont montr deux proprits importantes concernant l'lasticit des tissus mous biologiques. La premire est que la gamme de valeurs du module dlasticit pour ce type de tissu est trs vaste, entre 1 kPa et 1000 kPa. La deuxime proprit est la corrlation entre le module dlasticit et ltat pathologique des tissus (Tableau 1-1). D'aprs le tableau, il apparat clairement que le module d'Young des tissus mous biologiques couvre une large gamme de valeurs. Il dpend pour un mme tissu de l'amplitude de la compression utilise pour l'valuer. On notera galement les variations importantes de module d'Young entre tissus sains et pathologiques, en particulier pour les fortes compressions. On note galement linfluence de compressions successives sur la valeur du module dlasticit.

19

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

Tissus de sein Type de tissu Normal graisseux Normal glandulaire Tissu fibreux Carcinme Carcinme infiltrant Tissus de prostate Type de tissu Normal antrieur Normal postrieur Cancer

Module d'lasticit du tissu (kPa) 5% prcompression 20% prcompression Frquence de charge (Hz) Frquence de charge (Hz) 0.1 1.0 4.0 0.1 1.0 4.0 187 197 2212 208 206 246 2814 3311 3514 4815 5719 6617 9634 10731 11628 21887 23260 24485 228 254 265 29167 30158 30778 10632 9333 11243 558180 490112 460178 Module d'lasticit du tissu (kPa) 5% prcompression 20% prcompression Frquence de charge (Hz) 0.1 1.0 4.0 5514 6217 5919 6219 6917 6518 9619 10020 9918 Frquence de charge (Hz) 0.1 1.0 4.0 6015 6318 6316 6814 7014 7111 23034 22132 24188

Tableau 1-1 Moyennes et cart-types du module d'lasticit du sein et de la prostate, normal et pathologique pour diffrentes frquences et diffrents niveaux de prcompression [KROU-98].

Au del des variations observes dans le module dYoung de diffrents tissus, les variations mises en vidence sur un mme tissu diffrentes prcompressions et diffrentes frquences de sollicitation peuvent sexpliquer par la non linarit, la viscolasticit et lanisotropie des tissus.

1.3.1.

Viscolasticit

Les tissus biologiques peuvent tre considrs comme des milieux viscolastiques, cest-dire quils possdent les proprits visqueuses dun fluide et les proprits dlasticit dun solide. Les trois phnomnes qui caractrisent les matriaux viscoplastiques sont la relaxation, le fluage et lhystrsis.
La relaxation : Si un corps viscoplastique subit une dformation et quensuite la dformation est garde constante, les contraintes produites dans la matire diminuent avec le temps. Sur la Figure 1-4 lchantillon a t mis sous tension avec un taux de dformation de 1.27 cm/min jusqu' obtention d'une tension T1. Puis la tension a t stabilise afin de conserver une dformation constante. Nous pouvons observer que les contraintes correspondantes induites dans le corps diminuent avec le temps [FUNG-93] Le fluage : Si ce corps est contraint et quensuite la contrainte est maintenue constante, la matire continue se dformer. Lhystrsis: Ce phnomne signifie que les tissus soumis une pression cyclique, rpondent diffremment la charge et la dcharge

20

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

Force mN

80 70 60 50 40 30 20 10 0 0

T1

0.5

1.5

2.5

3.5

temps (min.)

Figure 1-4 Exemple dune courbe de relaxation [FUNG-93]

1.3.2.

Linarit

De manire gnrale, les tissus biologiques ont un comportement lastique non linaire, c'est dire que la contrainte et la dformation ne sont pas lies par une unique valeur, le module d'Young. Cela sexplique par le fait que les constantes lastiques changent en fonction de lamplitude de la pression applique. La courbe de la dformation en fonction de la contrainte nest pas une droite pente constante mais plutt une parabole. Emelianov et al. [EMEL-98] ont montr cette non linarit en comparant lvolution du module dYoung dun fantme en deux couches lorsque la force applique augmente. Les rsultats obtenus montrent que les tissus paraissent dautant plus durs que lamplitude de la pression applique est leve (Figure 1-5).

1.3.3.

Anisotropie

Un milieu anisotrope est un milieu qui prsente des directions privilgies de dformation lorsquil est soumis une contrainte. Dans certains tissus mous biologiques, il existe des proprits danisotropie plus ou moins accentues selon quils prsentent ou non une structure particulire. Les muscles par exemple, se comportent diffremment selon que la direction de la contrainte applique est dans le sens des fibres musculaires ou non. En conclusion, les tissus biologiques ont un comportement mcanique non linaire caractris par des proprits de viscolasticit tels que l'hystrsis, la relaxation et le fluage. Ils sont de plus, d'une manire gnrale non-isotropes. Toutefois il est indispensable de sappuyer sur un modle mcanique simple pour caractriser les proprits dlasticit des milieux biologiques. Pour utiliser le modle du solide lastique, linaire et isotrope (ou solide lastique de Hooke) certaines hypothses doivent tre faites pour pouvoir dcrire le comportement mcanique des tissus biologiques.

21

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

Figure 1-5 Variation du module dYoung pour diffrentes valeurs de la contrainte applique pour deux types de tissus. Un tissu dur, en trait plein, et un tissu mou, en pointill. A droite sont reprsents les fantmes avant et aprs dformation. La couche molle subit une dformation de 8% et la couche dure de 4% [EMEL-98].

1.4

MODELE DU SOLIDE ELASTIQUE, LINEAIRE ET ISOTROPE

Sous certaines hypothses et conditions exprimentales, le modle du solide lastique, linaire et isotrope peut tre utilis pour dcrire le comportement mcanique des tissus mous biologiques
Isotropie : Mme si les tissus biologiques sont en gnral considrs comme des matriaux anisotropes, beaucoup de tissus et organes tudis en lastographie ce jour peuvent tre considrs localement comme des corps isotropes, quil sagisse du sein, de la prostate ou du foie [ERKA-98]. Cette hypothse est gnralement vrifie pour les tissus homognes ou des tissus qui ne prsentent pas une structure particulire en fibres. Les fantmes utiliss dans le cadre de ce travail satisfont cette hypothse. Linarit : la caractristique de non-linarit dans des tissus homognes lastiques peut tre nglige dans le cadre des petites dformations. Pour les tissus htrognes, cela reste moins vrai, puisqu'une dformation globale faible peut engendrer des dformations locales importantes, au niveau des zones molles. La pertinence de cette observation est accentue par la vaste tendue de la gamme possible des valeurs dlasticit dans un corps, qui peut couvrir diffrents ordres de grandeurs. Heureusement, la non-linarit de la plupart des tissus est telle quelle induit moins de dformation des niveaux de contraintes plus leves. Ceci rsulte en une rduction apparente de la gamme dynamique dlasticit dans les tissus htrognes, ce qui ne prsente pas un frein absolu pour l'lastographie {BRUSSEAU, 2000 #60}. En pratique, lestimation des caractristiques de llasticit sera ralise en petite dformation. Viscolasticit : En pratique, pour ngliger cet effet, dans le cas de pression statique, il faut attendre que le corps ait atteint son tat dquilibre au bout dun temps de stabilisation [CESP-93]. En cas de pression dynamique la viscolasticit est un paramtre quil faut prendre en compte, ou qui peut tre mesur. En cas de pression cyclique le comportement des tissus reste le mme chaque cycle. Pour les expriences ralises dans le cadre de ce travail, nous avons pris la prcaution dattendre quelques secondes aprs compression pour effectuer les acquisitions.

22

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

C'est dans le cadre des hypothses dcrites ci-dessus que nous allons utiliser le modle du solide lastique linaire et isotrope.

23

CHAPITRE 1 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS MECANIQUES

24

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

CHAPITRE 2
ELASTOGRAPHIE: ASPECTS ULTRASONORES

2.1

MOTIVATIONS CLINIQUES

La caractrisation tissulaire prsente un intrt fondamental en diagnostic clinique. Son objectif est de discriminer, au sein des tissus biologiques, les zones saines des zones pathologiques. On observe que les processus pathologiques entranent souvent un changement dans llasticit des tissus. Par exemple, certaines tumeurs cancreuses comme le carcinome, qui est la forme la plus courante du cancer du sein, se prsentent sous la forme de nodules beaucoup plus rigides que les tissus sains environnants. Les maladies diffuses, telles que la cirrhose du foie sont connues pour rduire de manire significative llasticit du tissu. Enfin pour dautres maladies, comme lathrosclrose, le risque de rupture de la plaque est fortement li la diffrence dlasticit entre la plaque et lartre elle-mme. La palpation reste lune des plus anciennes pratiques pour dtecter la prsence danormalits dans le corps humain. Cest lexamen manuel des variations dlasticit au sein des tissus. Toutefois lefficacit de la palpation reste limite la dtection danormalits peu profondes et de taille assez importante, cest dire un stade avanc de la maladie. Paralllement, limagerie chographique du corps humain fournit des informations anatomiques pertinentes mais reste limite car elle ne donne pas dinformation directe sur llasticit des tissus. Ainsi depuis 1991, une nouvelle technique ultrasonore est apparue dans le but dtudier les proprits lastiques des tissus biologiques [OPHI-91]. Il sagit de llastographie. Llastographie est une modalit dimagerie ultrasonore capable de fournir une cartographie des proprits mcaniques des sujets imags. Son principe de base est dvaluer les dformations ou les dplacements locaux engendrs dans le milieu par lapplication dune contrainte. Ltude repose sur lanalyse des signaux ultrasonores radiofrquences RF, ou des images chographiques, acquis avant et aprs application de la contrainte, ou pour diffrents niveaux de contrainte. Les images du dplacement ou de la dformation mesurs au sein du milieu tudi, peuvent tre directement interprtes. Elles donnent en effet une information sur la duret relative locale du milieu : un milieu dur se dforme moins quun milieu mou. Toutefois une image quantitative, reprsentative dun paramtre absolu tel que le module dYoung constituerait une information plus complte et plus simple interprter pour le mdecin.

25

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Pour montrer lintrt de llastographie, nous prenons lexemple dun fantme en ponge comportant une inclusion rigide en son centre. La Figure 2-1 montre limage chographique du fantme ainsi que llastogramme correspondant. Alors que linclusion est visible sur limage obtenue par lastographie elle ne lest pas sur limage chographique classique. Linformation complmentaire apporte par llastographie peut donc permettre un meilleur diagnostic.

(a)

(b)

Figure 2-1 Fantme en ponge avec une inclusion rigide en son centre. (a) Image chographique. (b) Elastogramme correspondant {BRUSSEAU, 2000 #60}.

2.2

PRINCIPE DE LECHOGRAPHIE

Le principe de lchographie est bas sur la dtermination de lamplitude et du retard dun signal ultrasonore rflchi par un milieu, pour en reprsenter sa structure. Typiquement, londe ultrasonore est assimile une onde mcanique plane. Lorsque cette onde rencontre une interface ou une inhomognit de trs grande dimension par rapport la longueur donde, une partie de londe incidente est rflchie dans le milieu et lautre partie est transmise. Ce phnomne obit aux lois physiques de la rflexion et de la rfraction, identiques celles de loptique. Le transducteur metteur est excit priodiquement par une impulsion lectrique. Une onde acoustique est alors engendre et va interagir avec le milieu dans lequel elle se propage. Des ondes de rflexion et de diffusion se forment. La portion de cette onde, rflchie et rtrodiffuse dans la direction du transducteur rcepteur est traduit par celui ci en un signal lectrique : c'est le signal radio-frquence (RF). Le signal RF est alors trait pour extraire les informations ncessaires la cration dune image chographique.

2.2.1.

Diffrents modes d'imagerie

Mode A (amplitude) : Il consiste afficher l'amplitude du signal recueilli par la sonde en fonction de la profondeur. Un seul faisceau ultrasonore de direction constante est utilis. Mode M ou TM (temps-mouvement) : La mme ligne dexploration est image successivement. Ce mode permet d'observer l'volution temporelle d'un signal de type A.

26

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Mode C (profondeur constante) : Il fournit des images bidimensionnelles profondeur constante, cest dire dans un plan perpendiculaire la direction de propagation des ondes. Mode B (brillance) : Cest le mode le plus utilis en chographie Il s'agit de reprsenter l'intensit du signal par la brillance d'un point sur l'cran. Plus le point est brillant, plus la rflexion des ultrasons est importante et donc, plus l'cho est intense. Une application trs largement rpandue de ce mode dimagerie est le suivi obsttrique. La Figure 2-2 montre une image chographique (mode B) dun foetus de 27 semaines. Llastographie permet de construire des images paramtriques qui sapparentent limagerie en mode B.

Figure 2-2 Image chographique (http://www.medical.philips.com).

dun

foetus

de

27

semaines.

2.2.2.

La rsolution

En chographie mode B, on peut dfinir trois types de rsolution : la rsolution axiale, la rsolution latrale et la rsolution azimutale. La rsolution axiale est dfinie comme linverse de la distance minimale perceptible par le systme dimagerie entre deux structures rflchissantes suffisamment proches lune de lautre dans des plans perpendiculaires la direction de propagation des ultrasons. Elle dpend essentiellement de la frquence des ultrasons. Plus la frquence est leve, plus la longueur d'onde est petite et meilleure est la rsolution axiale. Les rsolutions latrale et azimutale sont dfinies par la capacit de la sonde distinguer deux structures proches situes dans le mme plan, perpendiculaire laxe du faisceau. Elles dpendent de la gomtrie du transducteur, de la frquence utilise et de la focalisation du faisceau. Dans le cas o lexploration ultrasonore est effectue par une sonde 1D (image mode 27

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

B standard), la rsolution latrale est dfinie dans le plan de limage et la rsolution azimutale dans la direction perpendiculaire.

2.2.3.

Le balayage

Pour pouvoir crer une image bidimensionnelle, on effectue un balayage des lignes ultrasonores. Deux types de balayage peuvent tre raliss : des balayages linaires ou sectoriels. Le balayage linaire est ralis par une sonde dite linaire dont tous les lments sont aligns dans le mme plan, le faisceau ultrasonore est toujours perpendiculaire ce plan. Cette technique est utilise pour examiner un champ de 3 12cm, au del, les sondes deviennent trop volumineuses, cest pourquoi des sondes balayage sectoriel ont t dveloppes. Le balayage sectoriel peut tre ralis en utilisant le principe du balayage linaire le long dun barreau convexe de transducteurs. Le faisceau ultrasonore peut tre orient pour explorer un secteur angulaire (Figure 2-2). La focalisation est absolument ncessaire pour compenser la divergence naturelle des ultrasons, tant donne la forme de la sonde. Lorsque le milieu explor et la sonde sont parfaitement immobiles, deux ralisations de tirs ultrasonores vont donner deux signaux parfaitement identiques. En revanche, ds qu'un faible mouvement se produit au sein du tissu, le speckle acoustique se modifie. Suivre les modifications du speckle acoustique au cours du temps va donc permettre de remonter aux dplacements de matire dans le milieu. Cest sur ce principe que reposent les mthodes destimation de mouvement (et donc de dformation) dans les tissus biologiques.

2.3

TECHNIQUES DE LELASTOGRAPHIE

Diffrentes mthodes ont t proposes pour estimer les proprits mcaniques des tissus. Ces mthodes diffrent les unes des autres par : - La nature de la compression qui induit la dformation : compression dynamique ou statique; - La technique de traitement du signal utilise pour estimer la dformation. Dans les paragraphes suivants nous allons prsenter les diffrentes mthodes existantes pour comprimer le milieu ainsi que les mthodes principales dcrites dans la littrature pour lestimation de la dformation axiale, latrale et azimutale, ainsi que les mthodes de construction du module dYoung.

2.3.1.

Estimation de llasticit par compression dynamique

Cette technique aussi appele sonolasticit a t dveloppe par Lerner et al. [LERN-90]. Elle consiste exciter le milieu avec une onde de faible frquence (20-1000 Hz) et tudier les mouvements rsultants en effectuant une analyse Doppler. Tous les tissus vibrent du fait 28

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

de lexcitation avec londe basse frquence mais les zones rigides vibrent diffremment des tissus environnants. Lerner et Parker ont appliqu cette technique divers organes. Les contraintes de cette mthode sont celles lies lutilisation du Doppler, le dplacement dtectable nexcde pas /4. En 1999, Stefan Catheline et al. [CATH-99] proposent dutiliser les ondes de cisaillement pour estimer llasticit. Lide consiste mesurer llasticit des tissus en sollicitant le milieu non plus de manire monochromatique comme en sonolastographie, mais de manire impulsionnelle. Cette technique permet de sparer londe de compression P, qui se propage quasiment instantanment, de londe de cisaillement S qui est moins rapide (Figure 2-3). En estimant localement la vitesse de londe de cisaillement Cs il est possible de remonter llasticit des tissus en utilisant la relation suivante :
2 = Cs

2.1

avec la masse volumique.

Figure 2-3 Milieu sollicit avec une onde impulsionnelle. On distingue les dplacements dus une onde de compression P et une onde de cisaillement S [CATH-99].

2.3.2.

Estimation de llasticit par compression statique

Le principe de base a t dcrit par Ophir et al. [OPHI-91]. Le dplacement suivant laxe est estim par intercorrlation des signaux RF acquis avant et aprs compression. La premire acquisition est ralise sans compression des tissus, puis la deuxime acquisition est faite sur lchantillon comprim dune longueur dz. Le deuxime signal a donc une dure plus courte de 2dz/c, c tant la vitesse du son dans le milieu, suppose constante. Le dcalage temporel se rpartit le long du trajet de londe ultrasonore selon llasticit des milieux traverss.

29

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

2.4

METHODE DE MESURE DE LA DEFORMATION AXIALE

Il existe principalement deux types dapproche dans le domaine temporel pour estimer les dformations au sein des signaux, celles bases sur lestimation de dcalages temporels locaux, encore appeles mthodes du gradient, et celles bases sur lvaluation de facteurs dchelles locaux. Dautres approches sappuient sur une analyse frquentielle des signaux pour effectuer des mesures similaires celles ralises dans le domaine temporel.

2.4.1.

Mthodes de mesure du gradient du retard temporel

Dans le cadre des petites dformations et pour une analyse sur des petites rgions, le signal aprs compression peut tre considr comme une version simplement dcale dans le temps du signal avant compression. Le principe de base de cette mthode consiste subdiviser les signaux RF avant et aprs compression en fentres de courte dure pour pouvoir prendre en compte les diffrentes zones traverses. Le retard temporel entre deux fentres correspondantes avant et aprs compression est calcul comme la position du maximum de la fonction dintercorrlation (qui est une mesure de la similarit entre deux signaux dcals). La relation entre les signaux avant et aprs compression est donne simplement par lquation (2.2.) suivante :

s 2 (t ) = s1 (t + i )
s1 : segment du signal avant compression s2 : segment du signal aprs compression i : dcalage sur la fentre i

2.2

Le processus est rpt pour chaque fentre, le long du signal RF, et fournit un profil des dplacements axiaux. Le dcalage peut galement tre estim comme le zro de la phase de la fonction de corrlation des signaux complexes associs. Les algorithmes qui estiment le dcalage partir de la phase de lintercorrlation du signal dmodul sont plus rapides que les mthodes de recherche du maximum dintercorrlation du signal RF [PESA-99], [LUBI-99]. En effet il existe des mthodes rapides tel que la mthode de Newton pour trouver la valeur pour laquelle une fonction sannule alors quune mthode pas pas est ncessaire pour dterminer le maximum de la fonction. Cette optimisation sur le temps de calcul a permis dimplanter un module dlastographie temps rel sur un chographe [PESA-00], avec des rsultats obtenus essentiellement sur la prostate. La dformation axiale est donne par le gradient du dplacement sur deux fentres conscutives dcales dun pas temporel T (quation 2.3).

2 1
T

2.3

30

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Linconvnient majeur de cette technique est le bruit induit par loprateur du gradient. Plusieurs mthodes ont t proposes pour rduire le bruit en ralisant une opration de filtrage sur la carte des dplacements [ODON-94], [KALL-97]. Il est possible damliorer l'estimation en tirant temporellement le signal aprs compression avant d'effectuer l'estimation des dcalages temporels [ALAM-97], [KONO-98]. Cet tirement amliore la corrlation entre les signaux acquis avant et aprs compression. Cette opration a deux limites fondamentales. La premire est quil faut avoir une connaissance a priori de l'amplitude de la dformation. La seconde est que le facteur d'tirement dpend de l'amplitude de la dformation locale et ne peut donc tre constant le long du signal, sauf dans un milieu homogne, ce qui n'est pas le cas pour les tissus biologiques. La dcorrlation des signaux avant et aprs compression constitue un problme dans lestimation des dplacements partir des donnes RF. Bai et al. [BAI-99] proposent de nutiliser que certaines parties des signaux, celles qui subissent le moins de distorsion pour faire les calculs. Ils ont remarqu que la distorsion qui apparat suite la compression nest pas la mme sur tout le signal. Ils dfinissent deux rgions quils appellent zone centrale (o lamplitude du signal RF est plus importante) et zone de bordure (o lamplitude du signal RF est plus faible). Ils montrent que la zone de bordure est plus affecte par la dcorrlation. Ils dfinissent ensuite des critres pour pouvoir slectionner les zones les moins dcorrles pour neffectuer le calcul que sur ces dernires. Les rsultats prsents entranent une diminution des erreurs destimation. Alam en 2004 a propos une mthode qui semble robuste et rapide [ALAM-04]. Cette mthode prsente lavantage de la rapidit de ltirement global et la robustesse de ltirement adaptatif. Plusieurs images de dformation ont t produites en faisant un tirement global avec plusieurs facteurs dtirement. Pour produire une seule image de dformation, les valeurs des dformations qui correspondent au maximum de corrlation sont slectionnes. Afin dobtenir une prcision destimation sub-pixellique, une interpolation parabolique ou en cosinus peut tre ralise autour du maximum de la fonction dintercorrlation [CESP-95], [ALAM-00].

2.4.2.

Mthodes bases sur lestimation du facteur dchelle

Le principe de la mthode des facteurs dchelle consiste considrer le signal dform (cas dune compression) comme un signal la fois compress et dcal temporellement. La relation entre le signal comprim s2 et le signal non comprim s1 peut scrire comme suit :

s 2 (t ) = s1 (t / + t 0 )

2.4

avec t0 le dcalage temporel et le facteur dchelle estimer. La dformation locale est calcule directement partir du facteur dchelle estim par la relation : = 1 2.5

31

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Lalgorithme de calcul par facteurs dchelle consiste subdiviser les signaux RF pr et postcompresss en N fentres temporelles de largeur L. Ensuite, en faisant varier ltirement temporel appliqu la fentre danalyse, la recherche du maximum de corrlation permet de dterminer les dformations locales du milieu. Lutilisation dun tirement temporel du signal aprs compression amliore la corrlation entre les signaux avant et aprs compression, ce qui augmente de manire consquente le rapport signal bruit. Une premire tude mene par Alam et al. [ALAM-98] a montr que l'utilisation des facteurs d'chelles locaux conduisait une mthode beaucoup plus robuste devant le bruit de dcorrlation. Bilgen et al. [BILG-99] ont dvelopp une mthode base sur le mme principe. La diffrence est que ces facteurs d'chelle sont estims par une approche type ondelettes. La transformation en ondelettes permet d'obtenir une reprsentation du signal dite temps-chelle. Le facteur d'chelle, ainsi que le dcalage temporel sont estims comme le maximum de la reprsentation temps-chelle. E. Brusseau a dvelopp un algorithme bas sur cette mthode qui propose un dplacement adaptatif des fentres de calcul {BRUSSEAU, 2000 #21}. En effet pour des tissus htrognes, les dformations tant diffrentes il ne faut donc pas dplacer la fentre de calcul sur le signal comprim dune valeur fixe pour le comparer la zone correspondante. Une explication dtaille de cette mthode sera prsente dans le troisime chapitre. Fromageau et Delachartre ont dvelopp un estimateur de retard et de facteur dchelle bas sur la recherche de lannulation de la phase complexe de lintercorrlation des signaux [FROM-03]. Les apports par rapport aux estimateurs prcdents sont une unification de la mthode de calcul du dplacement et du facteur dchelle. Une comparaison des deux types dalgorithmes [ALAM-98] (mthode du gradient et mthode du facteur dchelle) montre que cette dernire mthode est plus robuste. Elle produit des images de dformation moins bruites et permet une plus grande compression de lobjet teste. Linconvnient majeur de cette mthode est le temps de calcul relativement long, ainsi quune faible fiabilit pour les petites dformations: infrieure 1%, lorsque la distorsion des signaux est faible.

2.4.3.

Mthodes dans le domaine frquentiel

La compression des signaux RF dans le domaine temporel se traduit par un dcalage spectral dans le domaine frquentiel. Des estimateurs spectraux ont t proposs en lastographie. La dformation peut tre estime partir de la mesure du dcalage frquentiel [KONO-99]. Si f e1 et f e2 sont les frquences centrales du spectre des diffuseurs avant et aprs compression, la dformation s peut tre exprime de la manire suivante :
f f e1 s = e2 f e1

2.6

32

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Un autre estimateur de la dformation utilisant lintercorrlation spectrale entre les spectres de puissance avant et aprs compression est propos. Il semble plus prcis pour des faibles contraintes [VARG-00]. Dans le cas de petites dformations, ces estimateurs savrent moins prcis que les estimateurs conventionnels dvelopps dans le domaine temporel. Mais ils sont plus robustes la dcorrlation. Ils reprsentent donc une alternative aux estimateurs conventionnels dans les environnements bruits (par exemple pour un faible rapport signal sur bruit ou pour une dcorrlation induite par une dformation excessive).

2.5

ESTIMATION DE LA DEFORMATION LATERALE

Toutes les mthodes dcrites prcdemment valuent le dplacement dans la direction axiale. Pourtant, le mouvement des tissus produit lors dune compression axiale est un mouvement 3D. Les mouvements latraux et azimutaux sont la premire cause de dcorrlation entre les signaux avant et aprs compression. Cest pour cela que plusieurs mthodes ont t prsentes dans la littrature, pour lestimation des dplacements en 2D et en 3D. Puisque la plupart des systmes dimagerie ultrasonore fournissent des donnes 2D, on trouve principalement des tudes en lastographie qui se limitent lestimation des dplacements en 2D (axial et latral). Trois approches principales pour lestimation du dplacement latral peuvent tre distingues: Lapproche de rayons multiples, lapproche dite de phase latrale et lapproche de mise en correspondance.

2.5.1.

Les mthodes rayons multiples

Dans les mthodes rayons multiples, une mme partie du milieu est image sous diffrents angles de tir. On effectue ensuite des estimations 1D le long de chaque angle de tir, et linformation issue de chaque estimation est combine avec celle des autres angles pour projeter le dplacement total sur les deux axes principaux de limage ultrasonore. Cest la mthode utilise par Tanter et al. [TANT-02]. Des validations exprimentales sur des fantmes homognes ont montr le potentiel de cette mthode. Nitta et Shina [NITT-00], [NITA-98] ont propos une mthode que lon peut classer comme une mthode de rayons multiples. Ils ont dvelopp pour cela une sonde 2D annulaire spcifique. Leur mthode est base sur lestimation du retard de phase, en chaque point de la sonde, entre lcho gnr par un diffuseur, avant et aprs dformation.

2.5.2.

Les mthodes de phase latrale

Le but de ces mthodes est de pouvoir utiliser dans la direction latrale des estimateurs habituellement utiliss en axial. Une notion de phase, du mme type que celle qui existe pour les signaux Radio Frquences (RF) composant les colonnes des images ultrasonore conventionnelles est introduite dans la direction latrale de limage. 33

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Chen et al. proposent dintroduire une phase latrale synthtique dans des images chographiques [CHEN-04]. Ils appliquent ensuite dans la direction latrale une mthode similaire la mthode du passage de la phase par zro, pour lestimation des dplacements latraux. Cet algorithme a t test en simulation et sur des donnes cardiaques exprimentales. Les rsultats montrent que la mthode amliore la prcision de lestimation latrale surtout pour des faibles dformations (<1%). Une formation de voies particulire est employe par H. Liebgott et al. [LIEB-05b] afin dobtenir pour la direction latrale de limage RF le mme type de signaux RF axiaux permettant lutilisation des estimateurs habituellement utiliss en axial. La Figure 2-4 montre les profils axiaux et latraux dune image RF.
Depth in mm 20 20.5 21

(b)

(a)

-1.5

-1

-0.5

0.5

1.5

(c)

-1.5

-1

-0.5

0 0.5 Lateral position in mm

1.5

Figure 2-4 (a) Image RF obtenue en simulation avec le formateur de voies dcrit dans [LIEB-05a]. (b) Profil axial (profil blanc). (c) Profil latral (profil noir). On voit apparatre des oscillations dans la rponse impulsionnelle latrale.

2.5.3.

Les mthodes de mise en correspondance

Ces mthodes sont les plus largement utilises pour lestimation du dplacement latral. Leur principe est de slectionner un motif dans une image de dpart et de retrouver sa position dans limage du milieu dform en comparant le motif initial un certain nombre de motifs dans une rgion dintrt de la deuxime image. Plusieurs paramtres peuvent affecter la performance de lalgorithme de mise en correspondance. Le principal paramtre est la ressemblance entre le motif original et le motif dans limage dforme. Les critres les plus utiliss dans la littrature pour quantifier la ressemblance sont la somme des diffrences absolues [CHAT-98] et la corrlation [BOHS-00], [KONO-98]. Lautre paramtre est le type de donnes utilises. Ramamurthy et Trahey [RAMA-91] ont montr que les estimations bases sur des donnes RF, sont plus prcises que celles bases sur les enveloppes. En effet les signaux RF sont porteurs notamment, des informations de phase, qui sont des informations relatives la position des diffuseurs et donc leur dplacement ventuel. Il s'avre que ce type d'information est perdu au niveau des signaux enveloppe, lorsqu'il s'agit de faibles dplacements.

34

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

En raison du faible chantillonnage dans la direction latrale par rapport la direction axiale plusieurs mthodes ont t proposes pour estimer un dplacement infrieur la distance inter-lment de la sonde chographique. E. Konofagou propose de rsoudre le problme par linterpolation dun grand nombre de lignes entre deux lignes de tir relles [KONO-98]. Cette mthode sera dcrite dans le chapitre 3. Un nouveau modle numrique de traitement 2D des donnes RF pour lestimation de la dformation axiale et latrale a t propos rcemment par E. Brusseau [BRUS-05]. Ce modle itratif et adaptatif, intgrant une stratgie de minimisation sous contrainte permet lestimation des dformations sans limite de rsolution.

2.6

RECONSTRUCTION DU MODULE DELASTICITE

Etant donn que le module d'Young des tissus biologiques dpend de leur tat pathologique [KROU-98], plusieurs mthodes ont t proposes, notamment pour dterminer le type de tumeur dtecte lchographie en construisant le module dlasticit .

2.6.1.

Une mthode analytique

Une premire approche consiste convertir limage de contrainte directement en image du module dYoung en utilisant la loi de Hooke. Pourtant une quantification prcise du module dYoung en utilisant cette approche nest faisable que si toutes les composantes de la contrainte interne sont connues. Cela reprsente une limitation majeure tant donn que la contrainte ne peut pas tre mesure au sein des tissus. Limage de la contrainte interne des tissus ne peut tre traduite en image du module dYoung que si la contrainte est uniforme. En pratique cela nest pas toujours vrai cause de la concentration de la contrainte dans certaines zones et de sa dcroissance avec la profondeur [OPHI-91]. Plusieurs modles analytiques ont t proposs pour compenser la concentration de la contrainte et sa dcroissance. Ponnekanti et al. [PONN-92] proposent une expression analytique de la contrainte en fonction de la position axiale (quation 2.7), pour un milieu lastique, semi-infini et homogne, dform l'aide d'un compresseur circulaire de rayon a :
1 (z) = (0) 1 2 1.5 (1 + (a / z) )

2.7

o (z) est la contrainte axiale, (0) la contrainte uniformment distribue la surface de contact du compresseur, i.e. z = 0, a le rayon du compresseur et z l'axe longitudinal. Cette expression a le mrite d'tre simple, cependant elle est mise en dfaut lorsque le champ de contrainte nest pas uniforme dans un milieu non homogne. C'est pourquoi d'autres quipes se sont intresses plus amplement aux mthodes de reconstruction du module d'Young, en repartant des quations de base de l'lasticit.

35

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

2.6.2.

Equations de base de l'lasticit

Les mthodes de reconstruction, utilises en lastographie, reposent sur l'utilisation des quations de base de l'lasticit pour un milieu lastique continu linaire et isotrope. Certaines relations dcrites dans le chapitre 1, sont reprises ci-dessous. L'quilibre d'un tel milieu s'crit, suivant la seconde loi de Newton (quation 2.8):

ij x j

+ fi = 0

2.8

Avec fi, force par unit de volume agissant sur le milieu considr dans la direction xi. Cette force peut tre nglige. i, j =x,y,z. Daprs la loi de Hooke, la relation de la contrainte dun milieu lastique, continu, linaire, isotrope et compressible est donne par lquation suivante

ij = ij kk + 2 ij

2.9

avec kk = xx + yy + zz . et sont les coefficients de Lam ij est le symbole de Kroneker (quation 1.19). En remplaant ij donne en 2.9 dans 2.8 on obtient
2 ij + ij kk + f i = 0 x j

2.10

Comme on a vu dans le chapitre 1, le tenseur de dformation dans le cadre des petites dformations a pour expression: 1 u u j ij = i + 2.11 2 x j xi En remplaant lquation 2.11 dans l'quation 2.10 on obtient :
u u i u j + ) + ij k + f i = 0 ( x j x j x i x k

2.12

Soit en fonction du module d'Young et du coefficient de Poisson


x j E u j u u E ( i + )+ ij k + f i = 0 (1 + )(1 2 ) x k 2(1 + ) x j xi

2.13

E (1 + )(1 2)

2.14

36

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

E 2(1 + )

2.15

La problmatique consiste donc dterminer E connaissant le champ de dplacement u. Pour des milieux incompressibles l'quation 2.9 est simplifie quelque peu, puisque nous savons que, dans ce cas, la divergence du dplacement (qui dtermine la variation de volume au cours de la dformation) est nulle. Elle devient alors :

ij = p ij + 2 ij
Avec
p=
div ( u ) 0

2.16

lim

[div(u )]

2.17 2.18

div(u ) = xx + yy + zz = 0 p est la pression statique interne.

Notons que pour un milieu lastique, continu, linaire, isotrope et incompressible le module de cisaillement suffit pour dcrire le comportement mcanique du milieu du fait quil est proportionnel au module dYoung (E=3). Deux types de mthodes ont t proposs pour la rsolution du problme.

2.6.3.

Diffrentes approches de rsolution du problme

La premire approche consiste rsoudre lquation de lquilibre. Pour un milieu incompressible il sagit dliminer le terme de pression p dans cette quation. Cette construction requiert la connaissance des dplacements au sein des tissus et les conditions aux limites. Une valeur constante est donne au coefficient de Poisson. Ce principe est utilis dans la mthode propose par Skovoroda et al en 1995 [SKOV-95] pour construire le module dYoung. Les auteurs utilisent le principe de la continuit de la dformation pour trouver une relation thorique dcrivant la contrainte. Ils font lhypothse dun milieu lastique, continu, linaire, isotrope et incompressible. Ils liminent analytiquement la pression statique p dans lquation dquilibre. Des artefacts ont t observs dans les images reconstruites localises en haut et en bas du fantme. La mme quipe en 1999 [SKOV-99] utilise la mme mthode de reconstruction du module dYoung dans le cadre des grandes dformations. Ils introduisent une relation non linaire entre la dformation et la contrainte et lquation de lquilibre met en jeu des drives spatiales des dplacements dordre lev. Nitta en 2000 [NITT-00] propose une mthode de construction du module dYoung partir des dplacements en 3D. Il fait lhypothse dun milieu linaire, isotrope, lastique et compressible. Cette mthode a le mrite dtre simple mais elle ncessite la connaissance a priori du module dYoung en surface. Cette mthode sera dtaille dans le chapitre 3.

37

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

La deuxime approche est itrative. Elle consiste minimiser une fonction derreur jusqu' obtention du critre darrt souhait. En 2000 Doyley et al. [DOYL-00] proposent une technique de reconstruction inverse base sur une mthode dlments finis et un schma itratif de Newton Raphson. La technique consiste estimer la distribution du module d'Young E qui minimise l'erreur (E ) , au sens des moindres carrs, entre les distributions de dplacements estime et simule.

(E) = U (E) U

2.19

Avec U le champ de dplacement estim et U(E) le champ de dplacement mesurs. Cette minimisation est rpte plusieurs fois jusqu' ce que le critre souhait soit atteint. Ils ont montr que la construction du module dYoung est fortement compromise si lerreur dans lestimation des dplacements est significative. Le mme principe est utilis par Aglyamov et al. [AGLY-04] pour la construction du module dlasticit des veines profondes contenant des thromboses. Seuls les dplacements dans le plan de limage ont t considrs. Harrigan et Konofagou [HARR-04] proposent une estimation du module dlasticit partir dune technique de minimisation dune fonction cot. Cette mthode consiste estimer la distribution du module d'Young qui minimise l'erreur, au sens des moindres carrs, entre les distributions de dplacements estime et simule. Cette technique, inspire de la mthode dveloppe par Kallel en 1995 [KALL-95] est cependant plus simple et plus robuste. En conclusion, diffrentes mthodes ont t proposes pour reconstruire la distribution de l'lasticit des milieux biologiques. Elles reposent sur l'utilisation des quations physiques de base relatives l'lasticit et sur l'utilisation de l'estimation du champ de dplacement. L'estimation prcise du champ de dplacement est donc un lment cl en lastographie puisqu'il intervient directement pour l'estimation de la dformation et galement pour la reconstruction du module lastique.

2.7

CONCLUSION

Dans ce chapitre nous avons prsent diffrentes techniques de traitement du signal utilises en lastographie ultrasonore. Lobjectif de ces mthodes est lestimation prcise du champ de dplacements et de dformations suite lapplication dune contrainte. Les premires approches dveloppes se limitent la mesure du dplacement principal dans la direction axiale. Cette mesure sappuie sur la comparaison des signaux avant et aprs compression par lestimation conjointe dun retard et dun facteur dchelle. Etant donn que la dformation engendre par une compression a des effets en 3D, des mthodes de mesures des dplacements perpendiculaires la direction axiale, dans la direction latrale, ont t proposes. Toutefois, compte tenu de la moindre rsolution des donnes ultrasonores dans ce plan, lestimation prcise des dformations savre dlicate.

38

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

Laccs aux dplacements et aux dformations en 3D, permet denvisager la quantification de llasticit des tissus par le biais du module dYoung. Parmi les mthodes prsentes, celles que nous avons retenues et mises en uvre dans notre travail, sont dcrites en dtail dans le chapitre III. Lestimation des dplacements en 3D est ncessaire la reconstruction du module dYoung quelle que soit la mthode utilise. Deux mthodes ont t mises en vidence : la mthode base sur la rsolution de lquation de lquilibre et la mthode qui minimise une fonction derreur.

39

CHAPITRE 2 ELASTOGRAPHIE : ASPECTS ULTRASONORES

40

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

CHAPITRE 3
LES MTHODES MISES EN UVRE

3.1

RESUME

Ce chapitre est consacr la description des techniques de traitement du signal que nous avons mises en uvre pour lestimation des dplacements en 3D ainsi que pour la reconstruction du module dYoung. Les techniques actuelles d'lastographie ultrasonore consistent gnralement fournir une simple image de dformation axiale des tissus lorsquils subissent une compression axiale. Or les dformations au sein de lobjet, suite une telle compression, se font en 3D. De plus, dans les applications cliniques une mesure quantitative de la rigidit des tissus comme le module dYoung est fortement souhaitable pour la dtection, la quantification et la classification des lsions selon leur caractre bnin ou malin. En considrant les tissus biologiques soumis une compression statique, comme un milieu isotrope, quasi incompressible, linaire et lastique et en supposant le coefficient de Poisson constant dans le milieu, les proprits mcaniques des tissus peuvent tre dcrites par le seul module dYoung. Ce chapitre est organis de la manire suivante: dans un premier temps nous exposons la mthode qui nous a permis la reconstruction du module dYoung. Cette mthode repose sur lestimation des dplacements locaux 2D dans le plan de limage, dplacements axiaux et latraux et sur la connaissance a priori de la valeur du module dYoung en surface de lobjet comprim. La prise en compte des dplacements azimutaux dans la troisime direction pour la reconstruction du module dYoung sera prsente dans le chapitre 5. Ensuite, nous dcrivons les techniques de traitement de signal que nous avons utilises pour estimer les dplacements axiaux et latraux (ou azimutaux). Les variables x, y et z dsignent les directions latrale, azimutale et axiale respectivement. Lestimation des dplacements est ralise par la comparaison des signaux ultrasonores obtenus avant et aprs compression. La mthode destimation du dplacement axial est base sur une estimation locale et adaptative des facteurs dchelle. Pour les dplacements latraux, une mthode base sur la corrlation et linterpolation des signaux RF a t mise en oeuvre. Enfin, nous prsentons les adaptations ncessaires dans le cas de lacquisition sectorielle 2D. Nous affecterons les variables r et a aux directions radiale et angulaire respectivement.

41

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

3.2

RECONSTRUCTION DU MODULE DYOUNG

Les images des dplacements et des dformations au sein des tissus prsentent des informations relatives llasticit de leur structure interne. Cependant linterprtation de ces images peut tre difficile pour des structures mcaniques complexes. Pour simplifier linterprtation de ces images et fournir une image quantitative de llasticit des tissus, plusieurs approches ont t explores pour reconstruire le module dlasticit [SKOV-99]. Dans le but dillustrer la diffrence entre une image de dformation et une cartographie de module dYoung, nous avons simul un fantme par lments finis comportant une inclusion cylindrique en son centre plus rigide que le milieu environnant et subissant une compression axiale. La Figure 3-1 montre limage de la dformation axiale thorique du fantme ainsi que son module dYoung. Nous constatons que la dformation du milieu extrieur de linclusion nest pas uniforme alors quil sagit dun milieu homogne (Figure 3-1-a). En effet cela est d la juxtaposition des deux rgions de rigidits diffrentes. La cartographie du module dYoung quant elle, prsente deux rgions homognes. Cette reprsentation, en plus de son aspect quantitatif, facilite linterprtation du rsultat. En faisant lhypothse que le tissu est isotrope, linaire et lastique sous une dformation statique et que le coefficient de Poisson est constant travers le milieu, les proprits lastiques du milieu peuvent tre dcrites par le seul module dYoung E [NITT-00]. La mthode que nous avons implante dans le cadre de cette thse pour la reconstruction de la cartographie du module dYoung, a t propose par Nitta en 2000 [NITT-00]. Elle est base sur la mesure locale des dplacements 3D (dans les directions axiales, latrales et azimutales) des tissus soumis une contrainte mcanique (compression) et ncessite la connaissance de la valeur du module dYoung en surface de la rgion explore.

(a)

(b)

Figure 3-1 Fantme numrique avec une inclusion rigide en son centre. (a) Dformation axiale. (b) Cartographie du module dYoung.

Cette mthode se droule en deux tapes: - La premire tape consiste calculer les champs de dplacements. Nous avons pour cela mis en uvre des mthodes bases sur la corrlation des signaux.

42

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

- La deuxime tape est la reconstruction du module d'Young partir des dplacements estims dans la premire tape et de la connaissance a priori du module dYoung en surface du tissu. Nous nous sommes limits dans un premier temps la prise en compte des dplacements en 2D (les dplacements dans le plan de l'image). Le tenseur de contrainte d'un solide linaire, lastique, isotrope et compressible, en fonction du module dYoung E et du coefficient de Poisson donn par lquation 1.24 est rappel ici :

ij =

E ij E kk ij + (1 + )(1 2 ) (1 + )

3.1

ij est le symbole de Kronecker (ij = 1 si i = j) et i,j = x,z o x et z dsignent les directions latrale et axiale respectivement. ij est le tenseur de dformation. kk = zz + xx .
En gnral, la distribution de la contrainte sous laction dune compression est inconnue. Cest pourquoi lquation de lquilibre doit tre introduite. Cette quation est donne par:

ij x j

+ fi = 0

3.2

O fi reprsente la force interne du corps exerce en chaque point du solide (par exemple la pesanteur). Dans notre application nous supposons que fi est nulle. Notons que cette force, dans certaines applications, nest pas ngligeable notamment dans le cas dune contraction musculaire. En ngligeant fi et la dformation selon y et en prenant i=x, j=z, lquation de lquilibre devient alors : xx xz + =0 3.3 x z
zz zx + =0 3.4 z x En introduisant lquation (3.1) en (3.3) et (3.4), il dcoule les quations (3.5) et (3.6) suivantes: 1 E (l kk + xx ) + 1 E ( xz ) = (l kk + xx + xz ) 3.5 E x E z x x z

O l =

1 2

1 E (l kk + zz ) + 1 E ( zx ) = (l kk + zz + xz ) E x E z x x z

3.6

En considrant que les dformations peuvent tre estimes, il reste alors deux quations avec 1 E 1 E et . deux inconnues E z E x

43

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE kk xx xz + + ) , (l kk + zz ) , (l kk + zz + xz ) , x x z x x z respectivement A(xx,zz), B(xx,zz), C(xx,zz), D(xx,zz), les quations du systme (3.5) et (3.6) peuvent tre crites comme suit : En notant

(l kk + xx ) ,

(l

A( xx , zz ) ( xz )

1 E 1 E + ( xz ) = B( xx , zz ) E x E z

3.7

1 E 1 E + C ( xx , zz ) = D( xx , zz ) E z E x

3.8

En dveloppant les quations 3.7et 3.8, nous trouvons:


1 E ( zx ) D( xx , zz ) B ( xx , zz ).C ( xx , zz ) = E x ( zx )( xz )C ( xx , zz ). A( xx , zz ) 1 E ( zx ) B( xx , zz ) D( xx , zz ). A( xx , zz ) = E z ( zx )( xz )C ( xx , zz ). A( xx , zz )

3.9

3.10

Or

(ln E ) 1 E = et le dveloppement donn en (3.11) amne la relation 3.12 pour la z E z distribution du module dYoung.

z0

(ln E ) dz = z

z0

1 E dz E z

ln E ( z ) ln E ( z 0) =

z0

1 E dz E z

3.11

z 1 E E ( z ) = exp dz + ln( E ( z 0) z 0 E z

z 1 E E ( z ) = E ( z 0) exp dz z0 E z

3.12

Daprs lquation (3.12) seule la connaissance du module dYoung en surface, E(z0) est requise comme condition aux limites pour remonter au module dYoung, dans ce processus de reconstruction. Notons que le module dYoung peut tre galement calcul partir de lquation (3.13).

44

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

x 1 E E ( x) = E ( x0) exp dx x0 E x O E(x0) est le module dYoung sur la surface de lobjet perpendiculaire x et donn par lquation 3.9 Dans les applications que nous allons dcrire, E(z0) gale E(x0).

3.13

1 E est E x

3.3

ESTIMATION DE LA DEFORMATION AXIALE:

La plupart des techniques utilises en lastographie pour l'estimation de la dformation axiale, considrent le mouvement local, au sein des tissus, comme un simple dcalage. Ce dplacement est calcul comme la position du maximum de la fonction de corrlation entre des signaux acquis avant et aprs compression. Ces mthodes sont prcises pour de petites dformations (< 2%), mais elles chouent rapidement pour de plus grandes dformations. En effet, la compression physique de la cible induit, en plus du dcalage une variation de forme au sein des signaux. Par consquent, le signal aprs compression, peut tre considr comme une version comprime et dcale dans le temps du signal avant compression. Il est donc plus judicieux de chercher estimer une dilatation plutt quun simple dplacement. Afin de compenser la diffrence de longueur entre les signaux issus de la mme rgion avant et aprs compression, un tirement local du signal post compression doit tre appliqu de manire ce que les signaux avant et aprs compression aient la mme longueur. La mthode que nous avons utilise pour lestimation de la dformation axiale est base sur ce principe. Lestimation de la dformation axiale se fait en 3 tapes: - Premire tape: estimation locale du facteur dchelle par analyse de la phase de la fonction de corrlation complexe entre les signaux avant et aprs compression. -Deuxime tape: estimation directe de la dformation partir du facteur dchelle. -Troisime tape: dplacement adaptatif de la fentre d'tude entre les signaux avant et aprs compression, afin de travailler avec des segments de signaux correspondant la mme zone tissulaire. Le caractre local de l'analyse est pris en compte en subdivisant le signal original en segments et en effectuant l'estimation sur chaque segment. La troncature est ralise en appliquant une fentre temporelle rectangulaire sur les signaux.

45

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

3.3.1.

Calcul des facteurs dchelle locaux

Soient s1 et s2 les signaux ultrasonores RF acquis avant et aprs compression respectivement, et subdiviss en P fentres temporelles (Figure 3-2). Sur chaque fentre, la relation entre s1 et s2 est donne par:
s 2 (t ) = s1 (t )

3.14

est le facteur d'chelle estimer qui traduit la dformation du signal. Le facteur est considr constant sur la fentre d'tude. Puisque le retard variable induit par le facteur d'chelle est directement reli la phase des signaux, il apparat adquat d'utiliser l'information provenant de la phase des signaux. La fonction d'intercorrlation conventionnelle normalise prsente un maximum gal 1 quand les signaux prsentent un dcalage nul, ce qui correspond galement au zro de la phase de la fonction d'intercorrlation complexe des signaux analytiques associs. L'expression de la fonction complexe d'intercorrlation est la suivante :
~ , ~ ( ) = 1 ~ (t )~ * (t )dt s1 s 2 s1 s2 T
0 T

3.15

Avec ~1 et ~2 , signaux analytiques associs respectivement aux signaux s1 et s2 et T est la s s longueur de la fentre d'tude. On dfinit une fonction () telle que : T 1 ( ) = arg( ~1 (t )~2* ( t )dt ) s s T 0

3.16

Lorsque prend la valeur = 1/, lquation 3.16 exprime alors lintercorrlation maximale et la fonction () sannule. Les facteurs d'chelle locaux sont valus de faon itrative en tirant le signal aprs compression jusqu' atteindre le zro de . Le zro est obtenu par dichotomie. Cette technique consiste raliser l'encadrement du zro de la fonction et rduire l'intervalle considr jusqu' atteindre la valeur recherche. Au dpart, un intervalle de valeurs de contenant le zro de la phase, est donn comme condition initiale. Le signe de la phase va par consquent changer sur cet intervalle. Lintervalle est ensuite rduit itrativement de faon toujours conserver un changement de signe de la phase sur lintervalle. Cette mthode offre l'avantage de converger rapidement vers la solution.

46

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

T1

Tp

Signal avant compression


profondeur

= L1
1

= Lp
p

Signal aprs compression


profondeur

L1

Lp

Figure 3-2 Principe destimation des dformations axiales par la mthode du facteur dchelle. Le signal avant compression est divis en p fentres temporelles de longueur L. Le signal post-compression est divis en fentres dont la taille dpend des facteurs dchelle trouvs prcdemment

3.3.2.

Calcul de la dformation

Connaissant le facteur de compression , la dformation se dduit simplement partir de la formule. 1 = 1 = 1 3.17

Une fois la dformation estime, la fentre de calcul est dplace conformment la premire tape, et le processus itratif continu jusqu ce que la fin du signal soit atteinte.

3.3.3.

Fentrage adaptatif

Pour des tissus non homognes, les dformations ne sont pas constantes. Il ne faut donc pas dplacer la fentre de calcul sur le signal comprim dune valeur fixe pour le comparer la zone correspondante sur le signal non dform. Le principe de base du fentrage adaptatif consiste dplacer la fentre de calcul dun pas constant sur le signal original et d'un pas dpendant de la dformation prcdente sur le signal dform
47

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

d i = idT d 'i = d 'i 1 +


me

dT

3.18

i 1

di est le dbut du signal pour la i fentre de calcul du signal avant compression d 'i est le dbut du signal pour la ime fentre de calcul du signal aprs compression d est le pas de dplacement de la fentre sur le signal avant compression

La position de la nouvelle fentre est donc dtermine par les valeurs trouves prcdemment. Plus la dformation est importante plus le dplacement relatif augmente. A lissue de cette tape les signaux au dbut des fentres pr et post compression correspondent la mme rgion.

3.4 CARACTERISATION DE LESTIMATION DE LA DEFORMATION :


La performance de lestimation de dformation en lastographie peut tre quantifie en utilisant habituellement deux paramtres qui sont le rapport signal sur bruit est le contraste.

3.4.1.

Le rapport signal sur bruit

Le rapport signal sur bruit en lastographie est dfini comme le rapport de la dformation moyenne dans une rgion suppose homogne, a, sur lcart type a (quation 3.19).[CESP93] SNRe=

a a

3.19

Le SNRe permet dvaluer la mesure de la dformation dans une rgion homogne.

3.4.2.

Le contraste

Le contraste entre deux zones dun lastogramme est une mesure relative qui tient compte des dformations mesures dans les deux milieux ainsi que des variances de ces dformations. Il est calcul comme suit [BILG-99]: CNRe= 2( i a ) 2 3.20

i2 + a2

Avec i la dformation moyenne dans linclusion, a la dformation moyenne du milieu environnant, i et a les cart-types associs. Le CNRe permet dvaluer la capacit distinguer deux zones homognes dlasticit diffrente.

48

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

3.5

ESTIMATION DES DEPLACEMENTS LATERAUX

Le dplacement des rflecteurs ultrasonores au sein dun tissu qui subit une compression axiale se fait en 3D. Le fait de ne prendre en compte que les dplacements axiaux pour calculer llastogramme comme dans la plupart des mthodes dcrites dans la littrature amne deux remarques: - llastogramme axial ne traduit quune partie des proprits mcaniques des tissus. - les mouvements latraux et azimutaux causent une dcorrlation des signaux avant et aprs compression et limitent la prcision de lestimation de la dformation axiale. Rappelons que la mthode dcrite prcdemment pour la reconstruction du module d'Young, ncessite une estimation des dplacements dans les trois directions. Il est donc important destimer les dplacements dans les trois directions : axiale (le long du faisceau ultrasonore), latrale (perpendiculaire la direction axiale et dans le plan de limage), et azimutale (perpendiculaire au plan de limage). A partir de ces dplacements, nous pouvons calculer les dformations correspondantes pour dcrire compltement le tenseur de dformation 3D, dfini dans le chapitre 2 et rappel ci-dessous :
zz zx zy = xz xx xy yz yx yy

3.21

O 1 u ij = i +
2 x j

u j xi

3.22

xi, xj dnotent les coordonnes dans les directions axiale, latrale et azimutale. ui le dplacement dans la direction i. Dans ce paragraphe nous prsenterons un algorithme destimation du dplacement latral (ou azimutal) bas sur la corrlation et linterpolation des signaux RF, dvelopp par Konofagou et al. [KONO-98]. Nous dcrirons galement nos contributions lamlioration de cette mthode. Lalgorithme de suivi des dplacements latraux se fait en trois tapes - tirement des signaux RF dans la direction axiale. - Interpolation des signaux RF intermdiaires entre les signaux post comprims dans la direction latrale. - Intercorrlation entre les signaux avant compression et les signaux aprs compression tirs et interpols.

49

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

3.5.1.

tirement des signaux RF dans la direction axiale

A la place de l'tirement global des signaux RF dforms propos par Konofagou [KONO98], nous tirons localement les lignes post comprimes partir facteurs d'chelle locaux qui ont servi l'estimation des dformations axiales, comme dcrit en 2.1. Le but est qu'une ligne tire prsente la meilleur corrlation avec la ligne prcomprime correspondante. La Figure 3-3 montre que ltirement local du signal aprs compression augmente dune manire vidente la ressemblance et donc la corrlation entre les signaux avant et aprs compression par rapport ltirement global.
6
6

Amplitude

Amplitude

-2

-2

-4

-4

-6 0

2.033 2.067 2.1

2.13

2.167 2.2

2.23

2.267 2.3

-6 0

2.033 2.067 2.1

2.13

2.167 2.2

2.23

2.267 2.3

Profondeur en cm

Profondeur en cm

(a)

(b)

Figure 3-3 Observation locale des signaux RF avant et aprs compression 2 cm de profondeur pour un fantme inhomogne. (a) Avec tirement local. (b) Avec tirement global.

3.5.2.

Interpolation dans la direction latrale

En pratique, les systmes dimagerie ultrasonores sont quips de transducteurs qui possdent un nombre de canaux relativement faible. Compte tenu des faibles dplacements latraux observs, lchantillonnage dans la direction latrale est donc insuffisante pour estimer les dplacements latraux avec prcision. Pour saffranchir de cette limitation, il est ncessaire dinterpoler des lignes supplmentaires entre les signaux RF aprs compression, ce qui permet destimer des valeurs de dplacements latraux infrieures lespacement entre deux canaux. Prenons lexemple de deux paires de signaux RF avant et aprs compression (y1,y2) (Figure 3-4). Aprs avoir tir axialement, les signaux post comprims comme expliqu dans la premire tape, on gnre n lignes RF (les lignes dnotes zn sur la Figure 3-4) entre les deux signaux aprs compression ( x1 et x 2 ). Une interpolation linaire, dcrite par lquation 3.23 a t effectue:

50

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

z nj =

a a x1 j + 1 x 2 j d d

3.23

o z nj est le jime chantillon de la nime lignes RF gnres, x1 j est le jime chantillon de la ligne x1 , x 2 j est le jime chantillon de la ligne x 2 , a est la distance entre deux lignes interpoles ( x1 j et z1 j ) et d est la distance entre deux lignes RF adjacentes. La coordonne latrale des chantillons gnrs par linterpolation est gale a dans lquation prcdente alors que la coordonne axiale est la mme que celle des lignes RF dorigine utilises pour linterpolation. Linterpolation se fait toujours entre deux lignes adjacentes. Dautres types dinterpolation comme linterpolation cubique peuvent tre utilises mais nos tudes ont pu montrer que lapport ntait pas significatif par rapport une interpolation linaire simple.

Figure 3-4. Principe de la mthode destimation des dplacements latraux. y1 et y2 sont deux signaux RF contigus pr comprims. x1 et x2 sont des signaux RF post comprims et tirs localement . z1 et z2 sont des signaux RF interpols partir des signaux post comprims originaux x1 et x2. Le signal de la fentre ti est intercorrl avec les signaux des fentres tij. Le maximum de la fonction dintercorrlation donne le dplacement latral dL.

3.5.3. Intercorrlation entre les signaux avant et aprs compression tirs et interpols.
Il s'agit de dterminer dans le voisinage dune ligne prcomprime la portion de ligne post comprime interpole la plus ressemblante. Ainsi pour chaque fentre axiale i, lintercorrlation entre les signaux avant compression et les signaux aprs compression interpols et tirs voisins est calcule. Le nombre de fentres adjacentes explores latralement est fix au cas par cas selon le milieu et les contraintes mises en jeu. Le dplacement latral dL est indiqu par la localisation du maximum des maximums des fonctions dintercorrlation entre les signaux avant et aprs compression sur la fentre dtude (quation 3.24) dL= j a 3.24

51

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

O j est lindice de la ligne retenue par rapport la ligne yi en test et a est la distance entre deux lignes interpoles. Une fois le dplacement latral estim, la fentre dtude est dplace axialement dun pas constant sur les deux signaux pr et post comprims.

3.6 AMELIORATION DE LESTIMATION DES DEPLACEMENTS LATERAUX


La prcision de l'estimation du dplacement latral est limite par le nombre de lignes RF interpoles latralement. Pour amliorer cette prcision, nous avons propos l'interpolation parabolique de la fonction dfinie par les maximums des fonctions dintercorrlation. Cette mthode consiste modliser cette fonction autour de son maximum par une parabole comme illustr sur la Figure 3-5. Une interpolation parabolique effectue partir des valeurs de coefficient de corrlation les plus leves (1 2 et 3 dans l'exemple) est effectue. Le dplacement latral n'est plus alors indiqu par 2 mais par m , le maximum de la fonction parabolique.
Coefficients d'intercorrlation m 2 3

1 Dplacement latral dL dL'

Figure 3-5: Interpolation parabolique des maximum des fonctions dintercorrlation. Le dplacement latral estim nest plus dL mais dL.

Cette mesure de dplacement latral base sur une interpolation parabolique contourne la limitation impose par le pas entre les lignes RF interpoles. Elle permet en plus de diminuer le nombre de lignes interpoler entre les lignes RF aprs compression rduisant ainsi le temps de calcul des dplacements latraux. Pour montrer les avantages de cette mthode dinterpolation nous prenons lexemple dun fantme numrique dcrit par lments finis qui prsente une inclusion rigide en son centre. Il sagit dun cube de 5x5x5 cm3. Une compression de 3% a t applique sur la face suprieure du fantme provoquant un maximum de dplacement latral de 0.1 cm. Les dplacements latraux sont calculs par la mthode dcrite prcdemment, avec et sans interpolation parabolique des maximums des coefficients d'intercorrlation entre les signaux avant et aprs compression. Pour le calcul du dplacement latral, une interpolation linaire de 8 lignes RF intermdiaires entre des signaux RF pr comprims adjacents a t effectue. Limage RF du fantme est constitue de 88 lignes, et la rsolution latrale sans interpolation parabolique est 52

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

donc de 0.07mm. Quant aux dplacements latraux calculs en utilisant linterpolation parabolique, ils ne sont pas limits par la distance entre deux lignes interpoles savoir 0.07 mm. La Figure 3-6 montre que les dplacements calculs sans interpolation parabolique sont moins prcis que ceux estims avec interpolation. En traant les profils de dplacements latraux au niveau de linclusion (Figure 3-6-c) nous constatons que les valeurs que peuvent prendre les dplacements latraux calculs sans interpolation parabolique (ligne bleue) sont des multiples de 0.07mm alors que les dplacements latraux calculs avec interpolation parabolique (ligne rouge) peuvent prendre nimporte quelle valeur. Lerreur moyenne sur la totalit de limage de dplacements estims avec interpolation parabolique par rapport la carte de dplacements thoriques est de 2% alors que celui de limage de dplacements estims sans interpolation parabolique est de 4%.
0.5
5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20

0.5 5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.4 0.3 0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4 -0.5

0.4 0.3 0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4 -0.5

(a)
0.5 0.4 0.3

(b)

Dplacements (mm)

0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4

-20

-10

10

20

Largeur du fantme (mm)

(c)
Figure 3-6 Dplacements latraux en mm estims sur un fantme avec inclusion et obtenus avec linterpolation de 8 lignes RF intermdiaires entre chaque paire de signaux RF post comprims. (a) Sans interpolation parabolique des coefficients dintercorrlation. (b) Avec interpolation. (c) Profils de dplacement latral obtenus avec interpolation parabolique (en rouge) et sans interpolation (en bleu). (Dimension des images en mm).

53

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

3.7

ADAPTATION A LA GEOMETRIE SECTORIELLE

Dans le chapitre 4 nous utiliserons une sonde sectorielle en simulation et en validation exprimentale. Cette gomtrie particulire dacquisition ncessite des adaptations que nous prsentons ci-dessous. Dans le cas de lutilisation d'une sonde linaire, les lignes RF sont parallles l'axe de compression. Il est donc tout fait logique de parler de dplacements axiaux pour les dplacements estims le long des lignes donc dans l'axe de compression. On parle galement de dplacements latraux pour les dplacements perpendiculaires aux prcdents (Figure 3-7a). A terme, ce sont donc ces dplacements dans la direction de l'axe de la contrainte et la direction perpendiculaire que l'on cherchera estimer dans le cas d'acquisition avec une sonde sectorielle. Pour ne pas faire de confusion, on qualifiera donc de dplacements radiaux ur les dplacements le long des lignes RF et de dplacements angulaires ua ceux qui leur sont perpendiculaires (Figure 3-7-b). On notera r et a les directions radiale et angulaire respectivement.

3.7.1.

Estimation des dplacements angulaires.

Ce que l'on obtient quand on recherche la ligne interpole la plus ressemblante est en fait son indice par rapport la ligne de rfrence et non directement la distance cette ligne. Dans le cas d'une sonde linaire, la distance est constante entre les lignes interpoles donc le dplacement est rapidement retrouv. Dans une configuration sectorielle, il s'agit de l'angle d entre deux lignes interpoles qui est constant. La relation permettant de calculer le dplacement angulaire est alors la suivante :

- u a : dplacement angulaire - i : indice de la ligne par rapport la ligne de rfrence - d : angle entre deux lignes interpoles - R : rayon, o distance entre la fentre dtude axiale et le centre de convergence de la sonde

u a = i d R

3.25

compression

compression

x z
uz
(a)

ux ur ua
(b)

Figure 3-7 Gomtrie de l'acquisition: (a) linaire, (b) sectorielle.

54

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

3.7.2.

Calcul des dplacements axiaux et latraux

Une fois les dplacements radiaux et angulaires calculs, il est intressant de calculer les dplacements dans le repre cartsien, appels dplacements axiaux et latraux. Pour calculer ces dplacements il faut projeter les dplacements radiaux et angulaires dans un repre cartsien (Figure 3-8). Les quations de projection pour une ligne sont les suivantes:

u x = u r sin u a cos u z = u r cos + u a sin

3.26

O u z , u x , u r et u a sont les dplacements axiaux, latraux, radiaux et angulaires respectivement. est l'angle de la ligne par rapport la verticale dans le sens inverse du sens trigonomtrique.

ux

ur

uz

ua

Figure 3-9. ux et uz sont les dplacements dans un repre cartsien. ua et ur sont les dplacements dans un repre polaire.

3.8

CONCLUSION

Nous avons prsent dans ce chapitre les techniques de traitement du signal que nous avons mis en uvre pour lestimation des dplacements et des dformations en 2D ainsi que la reconstruction du module dYoung. La mthode de reconstruction du module dYoung prsente repose sur lestimation des dplacements locaux 2D, (axiaux et latraux) et sur la connaissance a priori de la valeur du module dYoung en surface de lobjet comprim. Nous avons fait lhypothse que les tissus sont isotropes, quasi incompressibles, linaires et lastiques et que le coefficient de Poisson est constant dans le milieu. Lestimation des dplacements est ralise par la comparaison des signaux ultrasonores obtenus avant et aprs compression. La mthode destimation de dformation axiale est base sur une estimation locale et adaptative des facteurs dchelle. Pour les dplacements latraux, une mthode base sur la corrlation et linterpolation des signaux RF a t mise en oeuvre.

55

CHAPITRE 3 LES METHODES MISES EN UVRE

Pour amliorer la prcision de lestimation des dplacements latraux, nous avons propos l'interpolation parabolique des maximums des fonctions dintercorrlation. Nous avons montr que cette interpolation diminue lerreur dans lestimation des dplacements latraux. Enfin nous avons prsent les quations de projection des dplacements radiaux et angulaires dans un repre cartsien pour calculer les dplacements axiaux et latraux. Ce changement de repre est ncessaire pour la comparaison avec les donns thoriques ainsi que pour la reconstruction du module dYoung.

56

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

CHAPITRE 4
VALIDATION DES MTHODES

4.1

RESUME

Ce chapitre prsente la validation de l'algorithme que nous avons mis en uvre pour l'estimation des dformations et des dplacements axiaux et latraux ainsi que la reconstruction du module d'Young partir de ces dformations et de ces dplacements. La phase d'valuation est base dune part sur des simulations et dautre part sur des mesures exprimentales. Dans un premier temps nous avons simul un fantme cubique avec en son centre une inclusion cylindrique deux fois plus rigide que le milieu englobant. En simulation, lhypothse dune contrainte plane a t faite pour viter tout mouvement hors le plan de limage. Seules les deux directions correspondant au plan de limage sont considres. Une sonde linaire similaire la sonde exprimentale a t simule. Les simulations des images chographiques ont t ralises l'aide du logiciel FIELD dvelopp par Jorgen Jensen [JENS-92] et spcifiquement destin la simulation d'images ultrasonores. Ce programme permet le calcul des signaux RF ncessaires aux algorithmes destimation de la dformation. La modlisation du comportement mcanique a t ralise avec le logiciel d'lments finis FEMLAB. Des rsultats obtenus sur un fantme de simulation en utilisant une sonde linaire sont prsents. Une validation exprimentale est galement prsente. Elle a t ralise avec un fantme en cryogel comportant en son centre une inclusion cylindrique plus rigide. Deux chographes ont t utiliss pour imager le fantme: lun utilisant une sonde linaire et l'autre une sonde sectorielle. Enfin, dans le but d'aller vers une application mdicale, des rsultats d'estimation axiale sur des tissus biologiques sont prsents. Il s'agit d'un morceau de viande de buf dans lequel une inclusion dagar dure est injecte. Les rsultats exprimentaux et de simulation avec une sonde linaire ont t prsents dans deux congrs [SAID-05 b, SAID-05 a].

57

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

4.2

SIMULATIONS

Nous avons test tout dabord notre algorithme sur un fantme numrique. Nous avons fait lhypothse dune contrainte plane. Seules les directions latrale et axiale ont t considres. Une sonde linaire correspondant la sonde exprimentales a t utilise. Le processus se dcompose selon les tapes suivantes (Figure 4-1): - Fantme numrique avant compression. Construction du modle numrique en utilisant le logiciel dlments finis FEMLAB. Ce modle possde les caractristiques du fantme physique utilis dans la partie exprimentale. - Fantme numrique aprs compression. Modlisation du comportement mcanique du fantme suite lapplication dune contrainte en utilisant le logiciel dlments finis FEMLAB - Production des images radiofrquence (RF) en utilisant le logiciel FIELD. Ce logiciel dvelopp par Jorgen Jensen [JENS-92], permet de calculer des signaux RF, quelles que soient les caractristiques de la sonde considre. - Estimation des champs des dplacements puis le module dYoung du fantme.
Fantme numrique avant compression (FEMLab) Image RF du fantme avant compression (FIELD)

Modle numrique de compression (FEMLab)

Estimation des champs de dplacements et de dformations

Construction du module dYoung

Fantme numrique aprs compression (FEMLab)

Image RF du fantme aprs compression (FIELD)

Figure 4-1 Les tapes principales du processus de construction du module dYoung en simulation.

4.2.1.

Modlisation par lments finis

La modlisation par lments finis t ralise avec le logiciel FEMLAB. Ce logiciel permet de rsoudre un grand nombre de problmes scientifiques relatif la mcanique des milieux et bass sur des quations aux drives partielles. Il permet de modliser des phnomnes

58

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

physiques sur des objets de formes gomtriques libres. Nous exposons quelques rgles de calcul du logiciel que nous avons utilis pour la simulation. La premire tape pour une analyse par lments finis est le maillage, cest dire la partition du volume dtude en petits lments de forme simple. Dans le cas dun problme en 3 dimensions les lments constituant le modle sont des ttradres. Cela permet dexprimer un champ local en fonction de ses valeurs aux nuds. Le logiciel complte le maillage par des noeuds supplmentaires en utilisant des fonctions dinterpolation. Les quations de comportement et les conditions aux limites sont ainsi discrtises, cest dire que lon ne calcule que les valeurs aux noeuds du maillage. Le problme se ramne alors un systme dquations qui permet de trouver une solution discrte. Lorsquune contrainte est applique sur lobjet test, le problme rsoudre consiste calculer le dplacement de tous les nuds constituant le modle.

4.2.2.

Simulation des images chographiques

Pour obtenir les images RF, un autre type de simulation est requis, le calcul du champ acoustique rflchi par un groupe de diffuseurs. Nous avons pour cela utilis le logiciel FIELD Ce logiciel est spcifiquement ddi au calcul du champ de pression acoustique en tout point de lespace. Il permet de simuler diffrents types de sonde, diffrentes stratgies de tir et dexcitation dun transducteur ultrasonore pour imager un fantme numrique 2D ou 3D. Le principe utilis par ce logiciel pour gnrer les signaux RF est dcrit ci-aprs. Pour simuler des images ultrasonores, les tissus sont modliss par un ensemble fini de rflecteurs qui vont interagir avec les ondes acoustiques gnres par la sonde. La sonde, ellemme est modlise par sa rponse impulsionnelle. Les signaux ultrasonores RF rsultent donc de la sommation des rponses des diffuseurs qui interagissent avec les ondes ultrasonores. Le processus de formation du signal cho peut tre modlis par des produits de convolution. Cest le principe adopt dans FIELD, o la rponse dun diffuseur plac la position r en fonction du temps est [JENS-97] donne par lquation 4.1:

s (r , t ) = p(t ) m(r ) htr (r , t )


t r

4.1

O : p(t ) est la rponse impulsionnelle de la sonde qui inclut lexcitation du transducteur et la rponse impulsionnelle lectromcanique durant la transmission et la rception de londe ultrasonore. m(r ) reprsente la force de diffusion acoustique du diffuseur. htr (r , t ) est la rponse impulsionnelle spatiotemporelle en mission et en rception. Elle correspond la rponse dun rflecteur ponctuel soumis un signal impulsionnel. Le signal RF rsultant de lexploration dun tissu compos de n diffuseurs situs la position ri peut tre obtenu en sommant toutes les contributions des diffuseurs (quation 4.2 )

59

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

s (t ) = s (ri , t )
i =1

4.2

4.2.3.

Evaluation de lalgorithme en simulation

Nous allons prsenter dans ce qui suit les rsultats obtenus sur un fantme numrique de simulation dcrit ci-dessous en utilisant une sonde linaire simule avec FIELD II. Le post traitement de la simulation par lments finis permet de visualiser entre autre les dformations axiale, latrale et azimutale et les dplacements correspondants qui nous servent de rfrence.

4.2.3.1. Le fantme numrique


Pour valider notre algorithme, nous avons simul un cube de 50x50x50 mm3 prsentant une inclusion cylindrique rigide de 20 mm de diamtre en son centre (Figure 4-2). Le module dYoung E de linclusion tait de 100 kPa et celui du milieu englobant tait de 50 kPa. Le coefficient de poisson tait de 0.45. Cette valeur est habituellement admise pour les tissus mous, milieu quasi incompressible. La masse volumique a t choisie gale celle du fantme acoustique = 1030 kg/m3. Aprs le calcul du dplacement par lments finis, les coordonnes des nuds du maillage avant et aprs dformation sont exportes pour le calcul des images chographiques.

Figure 4-2 Cube de 50x50x50 mm3 avec en son centre une inclusion cylindrique plus rigide de 20 mm de diamtre, maill avec Femlab.

Considrant une cellule de rsolution de taille (0.1x1.4x1.4 mm3) pour une mission 3 MHz, le modle numrique ralis avec Femlab comporte 6 nuds par cellule de rsolution. Des

60

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

diffuseurs supplmentaires sont ajouts de manire alatoire, pour obtenir dix rflecteurs par cellule de rsolution. Ce qui est admis comme suffisant pour simuler un speckle totalement dvelopp [THIJ-03]. Chaque lment du maillage en 3D est un ttradre. Pour ajouter un diffuseur de manire alatoire lintrieur de llment du maillage, un poids, compris entre 0 et 1, est affect selon une loi de probabilit uniforme chacun des quatre sommets. La position du diffuseur est alors calcule comme le barycentre des 4 sommets de llment avec le poids qui leur est affect. Aprs la dformation, les nouvelles positions des nuds sont donnes par le logiciel dlments finis Femlab. Pour ajouter des diffuseurs supplmentaires aprs compression, les mmes poids sont utiliss avant et aprs dformation, et ainsi assurer un dplacement du diffuseur conforme aux lments finis. Les volumes des lments du maillage du fantme numrique fournis par Femlab ne sont pas gaux. Pour assurer une distribution homogne des diffuseurs, il faut prendre en compte le volume de chaque lment pour estimer le nombre de diffuseurs y ajouter. Pour valuer le nombre de points ajouter dans chaque lment on calcule tout dabord le nombre moyen de diffuseurs N ajouter dans le volume total V du fantme numrique. La densit globale de diffuseurs est alors N/V. Le nombre de diffuseurs Ni ajouter dans chaque lment de volume Vi est alors (quation 4.3 )
Ni = N Vi V

4.3

4.2.3.2. Paramtres de simulation


La simulation des images chographiques avant et aprs compression a t ralise avec le logiciel Field II. La sonde simule est une barrette linaire dont les paramtres sont prsents dans le Tableau 4-1. L'impulsion d'mission est une sinusode pondre par une fentre de Hanning avec une bande passante -6 dB gale 60%. Nous avons utilis une focalisation unique en mission et 4 focales en rception aux profondeurs, 10 mm, 20 mm, 30 mm et 40 mm. Leffet de ces types de focalisation sera discut plus loin. Les paramtres de la simulation ont t choisis de manire sapprocher le plus possible des conditions exprimentales savoir une sonde linaire permettant dimager un fantme de 50 mm. Frquence centrale de la sonde 3 MHz

Frquence dchantillonnage 100 MHz Nombre d'lments de la sonde 196 lments Nombre d'lments actifs 64 lments Largeur des lments 0,49 mm Longueur des lments 5 mm Distance entre lments 0.005 mm Nombre de lignes de tir 88 lignes Apodisation avec une fentre hanning Taille totale de la sonde 96 mm
Tableau 4-1 Paramtres caractristiques de la sonde linaire utiliss en simulation.

61

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

4.2.3.3. Rsultats
La face suprieure du fantme numrique a t charge avec une charge de 1.5 kPa ce qui a provoqu une dformation denviron 3%. Nous avons impos des dplacements nuls selon la direction y (azimutale) pour viter toute contrainte hors du plan de limage. La dformation axiale a t calcule par lestimation des facteurs dchelles locaux entre les signaux RF avant et aprs compression. Une fentre de 3 mm avec un recouvrement de 80% a t utilise. Un filtre mdian de taille 3x3 a t appliqu sur l'image de dformation axiale.
1.2 5 10 15 20 25 30 0.4 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.2 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.2 0.6 1 5 10 15 20 25 30 0.4 0.6 1 1.2

0.8

0.8

(a)
2.8 5 10 15 20 2.2 25 30 35 40 1.6 45 1.4 -20 -10 0 10 20 2 2.6

(b)
2.8 5 10 15 20 2.2 25 30 35 40 1.6 45 1.4 -20 -10 0 10 20 2 2.6

2.4

2.4

1.8

1.8

(c)

(d)

Figure 4-3 Dplacements axiaux en mm et dformation en % du fantme avec une inclusion cylindrique deux fois plus rigide en son centre suite lapplication de 3% de dformation. (a) Carte de dplacements de rfrence fournie par Femlab. (b) Dplacement estim par intgration des dformations. (c) Dformation thorique de rfrence fournie par Femlab. (d) Dformation estime par la mthode du facteur dchelle. (Dimensions des images en mm).

Pour valider lalgorithme de calcul des dformations axiales nous avons compar les rsultats des estimations de dplacement et de dformation avec les donnes thoriques de rfrence fournies par le logiciel dlments finis Femlab (Figure 4-3). Les rsultats montrent que les dformations axiales sont trs proches de la thorie. Le SNRe et le CNRe ont t calculs selon les quations (3.19), (3.20) dans deux rgions dont la position est prcise par des carrs blancs (Figure 4-3). Les rsultats sont rassembls dans le Tableau 4-2. Nous constatons que le

62

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

rapport signal sur bruit (SNRe) dans linclusion est moins lev que celui dans le milieu environnant. On peut noter galement quil y a un trs bon contraste entre linclusion et le milieu environnant. Les dplacements axiaux calculs partir de cette dformation par intgration, montre une valeur maximum de dplacement de 1.2 mm ce qui correspond bien au dplacement appliqu.
SNRe dans linclusion 43

SNRe dans le milieu englobant 61 CNRe 90

Tableau 4-2 Valeurs des rapports signal sur bruit (SNRe) dans linclusion et le milieu englobant ainsi que le contraste (CNRe).

Pour calculer les dplacements latraux, 16 lignes RF intermdiaires ont t gnres, entre deux signaux radiofrquence contigus obtenus aprs compression. Rappelons que les signaux RF aprs compression sont tout dabord tirs localement avec le facteur dchelle obtenu avec lalgorithme destimation des dplacements axiaux. Une interpolation linaire a t utilise, comme nous lavons expliqu dans le chapitre 3. Aucune amlioration na t prouve dans lestimation des dplacements latraux au-del de ce nombre de lignes. La mme taille de fentre, utilise pour lestimation des dformations axiales, a t dplace latralement, avec le mme recouvrement, pour le calcul des dplacements latraux. Un filtre mdian de taille 3x3 a t appliqu sur limage des dplacements latraux pour rduire les fluctuations. La Figure 4-4 montre que les dplacements latraux thoriques et ceux estims sont en accord. Toutefois, la faible rsolution des images dans la direction latrale entrane, malgr linterpolation de 16 lignes intermdiaires, une rsolution bien moindre pour les dplacements dans la direction latrale que dans la direction axiale. La prsence de linclusion est peine perceptible sur limage des dplacements latraux. Les profils de dplacements latraux au niveau de linclusion sont prsents sur la Figure 4-4c. Le profil des dplacements latraux thoriques est en bleu et celui des dplacements latraux estims est en rouge. Les valeurs estimes sont trs proches de la thorie. Les dplacements latraux montrent une plus grande variabilit que les dplacements axiaux, cest galement une consquence de la mauvaise rsolution dans cette direction.

63

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

0.5 5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.4 0.3 0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4 -0.5
5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20

0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4 -0.5

(a)
Dplacements latraux (mm)
0.05 0.04 0.03 0.02 0.01 0

(b)

-0.01 -0.02 -0.03 -0.04 -0.05 -25

-20

-15

-10

-5

10

15

20

25

Largeur du fantme (mm)

(c) Figure 4-4 Dplacements latraux en mm du fantme numrique avec une inclusion cylindrique deux fois plus rigide en son centre suite lapplication de 3% de dformation. (a) Carte des dplacements thorique de rfrence fournie par Femlab. (b) Dplacements estims par traitement des images RF. (c) Profils des dplacements latraux au niveau de linclusion (profondeur 25 mm). Profil de rfrence en bleu, profil des dplacements estims en rouge. (Dimensions des images en mm). La dformation latrale a t calcule en utilisant un estimateur optimale au sens des moindres carrs [KALL-97]. Le principe de base consiste modliser les dplacements par un segment de droite sur une petite zone partir des points de mesure. La pente de ce segment, qui sadapte au mieux aux points de mesure, reprsente la dformation, est alors estime. Ceci prsente lavantage, par rapport la mthode du gradient, de rduire le bruit li lopration de drivation. La taille de la fentre glissante utilise pour le calcul des dformations latrales a t fixe 30 lignes RF. Cest lquivalent de 17 mm. Cette taille leve rduit la largeur de limage de dformation de 17 mm (Figure 4-5-b). La taille de la fentre de calcul a t dfinie en fonction du profil des dplacements au niveau de linclusion (Figure 4-4-c). Dun point de vu qualitatif, nous constatons que les valeurs de dformation estimes sont en gnral dans la mme gamme que les valeurs thoriques (Figure 4-5) avec une lgre sousestimation. Nous pouvons noter galement labsence des zones de concentration de la

64

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

contrainte qui sont lies la juxtaposition de deux rgions de rigidit diffrente. Nous avons constat que cette estimation dpend de la focalisation du champ acoustique dfini par Field, comme nous lexpliquons dans le paragraphe suivant.
5 2.2 10 2 15 20 25 30 1.4 35 40 45 -10 0 10 1.2
35 40 45 -10 0 10 1.2 15 10 2 5 2.2

1.8

20 25 30

1.8

1.6

1.6

1.4

(a)
2.2 2

(b)

Dformation (%)

1.8 1.6 1.4 1.2 1 0.8 0.6 -15 -10 -5 0 5 10 15

Largeur du fantome (mm)

(c)
Figure 4-5 Dformation latrale en % du fantme avec une inclusion cylindrique deux fois plus rigide en son centre suite lapplication de 3% de dformation. (a) Dformation thorique de rfrence fournie par Femlab. (b) Dformation. (c) Profils moyens (10 lignes au niveau de linclusion) des dplacements latraux (les dplacements de rfrence sont en bleu) dans linclusion. (Dimensions des images en mm).

A partir des dplacements et des dformations axiaux et latraux, le module dYoung du fantme a t calcul. La cartographie du module dYoung obtenue montre une localisation prcise des deux milieux (Figure 4-6). Les modules dYoung des deux milieux sont dans un rapport de 1.84 ce qui est lgrement infrieur au valeur thorique savoir 2. Alors que l'inclusion n'est pas visible sur l'image chographique, elle l'est trs clairement sur l'image du module d'Young.

65

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

5 10 15

90 80 70 60

5 10 15 20

20 50 25 40 30 35 40 30 20 10 0 -10 -5 0 5 10

25 30 35 40

-10

-5

10

(a)

(b)

Figure 4-6 (a) Cartographie reconstruite du module d'Young en kPa du fantme avec en son centre une inclusion cylindrique de module dYoung 100kPa deux fois plus rigide que le milieu englobant. (b) Image chographique (sonogramme) correspondante simule avec FIELD partir du fantme numrique. (Dimensions des images en mm).

4.2.4. Etude de linfluence de la focalisation de la sonde sur lestimation des dplacements latraux en simulation
Pour illustrer l'effet de la focalisation, nous avons gnr un fantme de dix diffuseurs ponctuels repartis suivant l'axe vertical sur 50 mm. La largeur de limage tait de 20 mm. La rsolution latrale qui dpend directement de la largeur du faisceau ultrasonore est dfinie par la taille de la tache produite par un diffuseur ponctuel sur l'image enveloppe. La Figure 4-7 prsente lenveloppe des rponses impulsionnelles pour deux distances de focalisation simple en mission : 20 mm et 40 mm de la sonde.

0
Distance axial [mm]

10 20 30 40 -10 0 10

50 -10 0 1 -1 10 Distance latrale [mm] (a)

Distance latrale [mm] (b)

Figure 4-7 Enveloppes des rponses impulsionnelles dun fantme de dix diffuseurs ponctuels, obtenues pour deux distances de focalisation simple en mission. (a) A 20 mm. (b) A 40 mm.

66

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

En observant localement la rponse impulsionnelle 20 mm de profondeur sur les images produites avec les deux distances de focalisation nous constatons clairement que la largeur de la tache la focale (Figure 4-8 a) est plus troite que la largeur de la tache en dehors de la focale (Figure 4-8 b).
Distance axial [mm]
18 20 22 24 -8 -6 -4 -2 0 2 4 6 8
-8 -6 -4 -2 0 2 4 6 8

Distance Latral [mm]

Distance latral [mm]

(a)

(b)

Figure 4-8 Observation locale de la tache produite par un diffuseur 20 mm de profondeur. (a) Image produite pour une distance focale de 20 mm.(b) Image produite pour une distance focale de 40 mm.

Pour pouvoir illustrer linfluence de la largeur de la rponse impulsionnelle sur lestimation des dplacements axiaux et latraux, nous avons appliqu lalgorithme aux images RF produites avec deux distances de focalisation diffrentes. La Figure 4-9 reprsente la dformation latrale pour des taches focales situes 20 mm et 40 mm de la surface suprieur du fantme. Sur la deuxime image (Figure 4-9-b), les valeurs de dformation latrale 40 mm de profondeur, cest dire la focale, sont correctes. Alors quelles ne le sont pas sur la premire image (Figure 4-9-a) qui a la focale 20 mm de profondeur. Le cercle indique la position de linclusion.
5 2.2 10 2 15 20 25 30 1.4 35 40 45 -15 1.2
35 40 1.2 15 10 2 5 2.2

1.8

20 25 30

1.8

1.6

1.6

1.4

-10

-5

10

-10

10

(a)

(b)

Figure 4-9 Dformations latrales du fantme avec une inclusion rigide en son centre subissant 3% de dformation. (a) Focale en mission 20 mm de profondeur. (b) Focale en mission 40 mm de profondeur. (Dimension de limage en mm)

La carte des dformations axiales a galement t calcule pour les deux focales diffrentes. Nous navons pas obtenu de diffrence notable (Figure 4-10). Dans la suite, on considrera que la focalisation ninfluence pas lestimation de la dformation axiale.

67

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

2.8 5 10 15 20 2.2 25 30 35 40 1.6 45 1.4 -20 -10 0 10 20 -20 -10 0 10 20 45 2 25 30 35 40 2.6 5 10 15 20

2.8

2.6

2.4

2.4

2.2

1.8

1.8

1.6

1.4

(a)

(b)

Figure 4-10 Dformations axiales du fantme avec une inclusion rigide en son centre subissant 3% de dformation. (a) Focale en mission 20 mm de profondeur. (b) Focale en mission 40 mm de profondeur. (Dimensions des images en mm).

Il est donc prfrable pour l'estimation des dplacements latraux d'avoir une rponse impulsionnelle troite et constante avec la profondeur. Toutefois, une focalisation en tous les points de limage n'est ralisable quen simulation. Il faut donc dans la mesure du possible placer lobjet de sorte avoir la rgion dintrt la distance focale.

4.3

EXPERIMENTATIONS

Apres avoir valid en simulation les mthodes que nous avons dveloppes, nous allons maintenant comparer avec les images exprimentales acquises avec des chographes cliniques. Deux chographes seront utiliss : - Un chographe clinique sonde linaire (B&K 3535) - Un chographe clinique sonde sectorielle (Kretz Voluson ) Les deux chographes ont t adapts au laboratoire pour permettre lacquisition des signaux RF. Pour une validation quantitative de la mthode de reconstruction du module d'Young, nous avons conu des fantmes pour lesquels nous matrisons la gomtrie et llasticit.

4.3.1.

Matriaux du fantme test

Diffrents types de matriaux peuvent tre utiliss pour raliser des fantmes pour l'lastographie. Cependant, puisque notre objectif final est de reconstruire le module d'Young des tissus biologiques mous, il est fondamental d'utiliser des objets tests qui imitent le tissu. Pour l'lastographie, ces objets tests ont des proprits acoustiques et lastiques proches de celles des tissus biologiques. Les exigences pour ces matriaux sont de deux sortes :

68

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

Proprits acoustiques : Puisque le principal composant des tissus biologiques mous est l'eau, les exigences porteront sur : - une densit proche de 1 g/cm3 - une vitesse des ultrasons dans la gamme 1500 1600 m/s - une attnuation en fonction de la frquence proche de 0.5 dB/cm/MHz. Proprits mcaniques: A cause de la grande variabilit de l'lasticit au sein des tissus biologiques mous, aucune contrainte particulire n'est impose pour la valeur du module dYoung du matriau. Il doit simplement se situer dans la gamme [1kPa 1000kPa]. D'autre part, ce matriau doit tre quasi incompressible. Ces proprits mcaniques et acoustiques doivent tre stables avec le temps et la temprature, et ajustable pour obtenir un contraste satisfaisant. Les fantmes les plus utiles sont ceux dont les proprits acoustiques et mcaniques peuvent tre matrises sparment pendant la fabrication. On peut par ce moyen crer des fantmes avec des proprits acoustiques homognes mais avec des rgions dlasticits diffrentes. Ceux-ci sont particulirement adapts l'lastographie. Les gels base d'eau contenant de la glatine et/ou de l'Agar ont t largement utiliss pour simuler les tissus dans un grand nombre d'applications ultrasonores visant caractriser les tissus [KORT-97]. Ils possdent la plupart des caractristiques ncessaires pour les expriences lastographiques mais leur inconvnient majeur est qu'ils se conservent mal et qu'ils ne rsistent pas aux importantes pressions [RYAN-97]. Pour ces raisons nous avons opt pour un autre type de matriau. Il s'agit du cryogel dalcool de polyvinyl (PVA cryogel).

4.3.1.1. Le PVA Cryogel


Le PVA cryogel se prsente comme une solution visqueuse qui acquiert sa duret avec un nombre croissant de cycles de conglation/dconglation. Il est ainsi possible de crer des rgions de rigidit diffrente en variant le nombre de cycles de conglation/dconglation subit par chaque rgion. Le cryogel est un matriau dj utilis pour raliser des fantmes dartre en IRM [CHU-97] et en chographie car ses proprits acoustiques sont trs similaires celles des tissus biologiques (Tableau 4-3). Vitesse du son Densit Attenuation Impedance acoustique [1540 m/s - 1580 m/s] 1.03 g/cm3 3.0 dB/cm at 5 MHz 1,6x106 kg/m/s

Tableau 4-3 Proprits acoustiques du PVA cryogel.

J. Fromageau et al [FROM-03] ont fait une tude des proprits mcaniques du cryogel pour valider son intrt pour la fabrication dobjets tests en lastographie. Les modules dYoung ont t mesurs sur sept chantillons. Sur une colonne de pression, les chantillons cylindriques de PVA-cryogel sont comprims, et la mesure du dplacement en fonction de la charge applique par la cellule permet dobtenir la courbe dformation-contrainte dont la pente est le module dYoung. Les modules dYoung sont galement estims en calculant les lastogrammes sur des cylindres creux de cryogel. En utilisant les proprits gomtriques du 69

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

cylindre et les conditions aux limites exprimentales, le champ de contrainte thorique dans le fantme a t dduit. La valeur du module dYoung est alors obtenue partir des lastogrammes estims et du champ de contrainte thorique. nombre de cycles de conglation/dcong lation 5 cycles (-32oC) 4 cycles (-20oC) 3 cycles (-20oC) 2 cycles (-32oC) 2 cycles (-20oC) Modules dYoung mthode ultrasonore 89.1kPa 61.0kPa 55.3kPa 51.2kPa 42.8kPa Modules dYoung mthode cellule de pression 84.6kPa 66.4kPa 59.4kPa 57.3kPa 44.8kPa Coefficients de Poisson 0.48 0.03 0.43 0.02 0.45 0.03 0.42 0.02 NC

Tableau 4-4 Module dYoung et coefficient du Poisson du cryogel estim avec la cellule de pression et par les mthodes dlastographie ultrasonore. Daprs [FROM-03].

Les valeurs des modules dYoung trouves selon les deux mthodes varient dans une gamme de 40 90 kPa, en fonction du nombre de cycles de conglation-dconglation (Tableau 4-4). Notons que ces valeurs sont dans la gamme de celles observes sur les tissus biologiques mous. Une estimation du coefficient de Poisson est galement ralise en estimant la variation de volume des chantillons cylindriques sous contrainte. Le coefficient de Poisson moyen des chantillons est estim 0,45.

4.3.1.2. Caractrisation mcanique du fantme test


Lvaluation de la mthode a t ralise sur un fantme en cryogel de 60x40x30 mm avec une inclusion cylindrique plus rigide que le milieu englobant (Figure 4-11). Linclusion avait 10 mm de diamtre. Il est noter que lors de la fabrication du fantme, des diffuseurs acoustiques ont t ajouts. La concentration de ces diffuseurs est la mme dans les deux zones de manire obtenir un fantme aux proprits acoustiques identiques. Nous avons utilis de la poudre dalumine 1% de concentration en masse. Pour la ralisation du fantme, linclusion rigide seule subit 2 cycles de conglation. Le milieu englobant est ensuite moul autour de linclusion et lensemble subit nouveau 3 cycles du conglation. Les cycles conglation-dconglation effectus avaient les caractristiques suivantes : Conglation : environ 14 h Dconglation : environ 10 h Temprature du conglateur : environ 20C Pour la caractrisation mcanique du fantme, nous avons utilis un logiciel spcifique ICASOFT (Laboratoire LaMCoS l'INSA de Lyon). Ce logiciel permet la mesure de module dYoung en surface de lobjet en test. Le fantme est recouvert dun motif alatoire projet sur la surface tudier. Le fantme est alors soumis un cycle de compression / dcompression. Un capteur de force est intgr afin de relever leffort appliqu au fantme. Durant le cycle de compression/dcompression, le fantme est rgulirement photographi par une camra numrique. La dformation en surface est calcule par analyse dimages. En faisant le rapport entre leffort par unit de surface (la contrainte) et la dformation on calcule

70

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

le module dYoung. Une prdformation de 10% a t applique sur le fantme, pour lexploitation des mesures avec ICASOFT. Les tests ont montr que le module dYoung de linclusion slevait 160 Kpa environ et celui du milieu englobant 50 Kpa environ.
Inclusion 10 mm

30 mm

50 mm 60 mm

Figure 4-11 Gomtrie du fantme. Linclusion cylindrique est plus rigide que le milieu englobant.

4.3.2.

Cas dune sonde linaire

4.3.2.1.

Dispositif dacquisition

Le systme exprimental consiste en un chographe (B&K 3535) et en un dispositif mcanique permettant dappliquer une contrainte mcanique introduisant des dformations au sein des objets tests. Cette compression, pilote par lordinateur, permet de dplacer un bras verticalement sur une course de 50 mm environ. Le plus petit pas de dplacement autoris par le systme est de 0.5m. Faute de plaque transparente aux ultrasons, la compression est effectue avec la sonde elle mme, immobilise dans un support en PVC et fixe sur le bras mobile (Figure 4-1). Le transducteur utilis est une barrette linaire focalise de frquence centrale 7 MHz. Il est compos de 128 lments dont 32 lments sont activs simultanment (dimension de chaque lment : 0.35 x 5 mm, distance entre deux lments : 0.035 mm). La frquence dchantillonnage tait de 50 MHz. Le fantme utilis pour lacquisition des images RF est plac sous la sonde chographique. Entre deux images, le fantme est compress de 3 % environ de sa hauteur, soit 1 mm. Lchographe est rgl avec une focalisation simple, au centre de limage, positionn au centre de linclusion.

71

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

(b)

(a)
Figure 4-12 (a) Banc de mesure. (b) Sonde chographique B&K 3535. et systme de fixation.

4.3.2.2. Rsultats sur le fantme en cryogel


Une interpolation linaire entre les chantillons des signaux RF est ralise pour obtenir un chantillonnage 250 MHz. Pour le calcul de la dformation axiale par la mthode du facteur dchelle, une fentre de 3 mm avec un recouvrement de 80% a t utilise. Les mmes paramtres ont t utiliss pour le calcul des dplacements latraux. La Figure 4-13 montre lestimation des dplacements et des dformations axiaux. Limage de la dformation axiale permet de voir clairement linclusion (qui nest pas tout fait centre). Notons la prsence des zones de concentration de la dformation autour de linclusion lie la juxtaposition des deux rgions de rigidit diffrente. Les dplacements axiaux calculs partir de cette dformation par intgration, montre une valeur maximum de dplacement de 1mm. Cette valeur correspond bien au dplacement de 1 mm appliqu sur la face suprieure du fantme. Le SNRe et le CNRe ont t calculs selon les quations (3-19) et (3-20) dans deux rgions dont la position est prcise par des carrs blancs (Figure 4-13). Les rsultats sont rassembls dans le Tableau 4-2. Nous constatons que le rapport signal sur bruit SNRe

72

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

dans linclusion est moins lev que celui dans le milieu englobant. On peut noter galement quil y a un trs bon contraste entre linclusion et le milieu englobant.
5 10 15 20 25 -30 -20 -10 0 10 20 30 0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0
6 5 5 10 4 15 3 20 25 -30 -20 -10 0 10 20 30 2 1

(a) (b) Figure 4-13 Dplacements et dformations axiaux du fantme en cryogel avec une inclusion rigide. (a) Image du dplacement en mm. (b) Image de la dformation en %. (Dimensions en mm). Pour calculer les dplacements latraux, 16 lignes RF intermdiaires ont t gnres, entre deux signaux radiofrquence contigus obtenus aprs compression et tirs localement selon lalgorithme du facteur dchelle. Une interpolation linaire a t utilise. La mme fentre que celle utilise pour lestimation des dformations axiales, a t dplace latralement, avec le mme recouvrement. Un filtre mdian de taille 3x3 a t appliqu sur limage de dplacement latral pour rduire le bruit. La dformation latrale a t calcule en utilisant le mme estimateur que pour les images de simulation. La taille de la fentre de calcul utilise pour le calcul des dformations latrales est de 30 lignes RF. Limage des dplacements latraux est plus difficile interprter car les valeurs des dplacements latraux, comme attendu sont moins leves que celles des dplacements axiaux (Figure 4-14). La rpartition des valeurs est cohrente avec des dplacements ngatifs sur la partie gauche et positifs sur la partie droite. Les deux rgions du fantme sont visibles sur limage de dformation latrale mme si le contour de linclusion nest pas trs prcis.
SNRe dans linclusion 57

SNRe dans le milieu englobant 65 CNRe 98

Tableau 4-5 Valeurs des rapports signal sur bruit SNRe dans linclusion et le milieu englobant ainsi que le contraste CNRe.

Pour tenter dobtenir des valeurs de dplacements plus importantes, une compression plus importante a t applique sur le fantme mais les rsultats, notamment axiaux, taient mdiocres. En effet, vu que le fantme est en 3 dimensions, la dformation azimutale (normale au plan de limage) nest plus ngligeable si la compression est trop importante. Les diffuseurs peuvent alors sortir du plan de limage et on obtient une dcorrlation trop importante entre les signaux avant et aprs compression. Il est donc ncessaire de se limiter des faibles dformations (3% maximum).

73

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

5 10 15 20 25 -30 -20 -10 0 10 20

0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4

2.5 5 10 15 20 25 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20 2 1.5 1 0.5 0

(a)

(b)

Figure 4-14 Dplacements et dformations latraux du fantme en cryogel avec une inclusion rigide. (a) Image du dplacement en mm. (b) Image de la dformation en %. (Dimensions des images en mm).

A partir des dplacements et dformations axiaux et latraux, le module dYoung du fantme a t calcul en utilisant la mthode dcrite dans chapitre III. Alors que linclusion ntait pas visible sur le sonogramme, elle est mise en vidence sur limage de module dYoung (Figure 4-15).
5 100 90 10 80 70 15 60 50 20 40 30 25 20 10 -15 -10 -5 0 5 10 15 0

10

15

20

25

-15

-10

-5

10

15

(a)
110 100

(b)

Module d'Young (kPa)

90 80 70 60 50 40 30 20 -15

-10

-5

10

15

Largeur du fantome (mm)

Figure 4-15 (a) Cartographie du module dYoung (en kPa) du fantme en cryogel. (b) Sonogramme correspondant. (c) Profil de module dYoung 15mm de profondeur. (Dimensions des images en mm)

Notons tout de mme que le contour de linclusion nest pas trs prcis. Dautre part le module dYoung de linclusion est sous estim. Alors que le module dYoung de linclusion, mesur avec le logiciel ICASOFT tait de 160 kPa, la valeur estime avec les images ultrasonores est denviron 100 kPa. Le rapport entre le module dYoung moyen de linclusion

74

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

et celui du milieu englobant est de 2.86. Cela peut tre expliqu par le fait que seuls les dplacements en 2D ont t pris en compte alors que le phnomne est en 3D avec des dplacements dans le plan azimutal (perpendiculaire au plan de limage).

4.3.2.3. Rsultats sur tissus biologiques


Dans le but d'aller vers une application mdicale, la mthode d'estimation axiale a t teste sur des tissus biologiques. Il s'agit d'un morceau de viande de buf dans lequel nous avons inject, laide d'une seringue, une solution d'agar. Cette dernire se solidifie rapidement aprs son injection pour former une inclusion presque sphrique plus rigide que la viande qui l'entoure. Des diffuseurs acoustiques ont t ajouts la solution dagar lors de la prparation de linclusion pour avoir un cho suffisamment important dans cette zone. Pour faciliter le durcissement de l'agar, le morceau de viande a t plac au rfrigrateur plusieurs heures avant l'injection. Le but de cette exprience tait de sapprocher de la configuration de certains cancers (sein, thyrode) qui prsente une inclusion rigide inclue dans un tissu mou.

Figure 4-16 Sonde et systme de compression utiliss pour lacquisition des donnes sur un morceau de viande bovine dans lequel une inclusion dagar a t injecte pour simuler une inclusion.

L'chographe B&K 3535 a t utilis pour acqurir les images chographiques avant et aprs compression. La compression a t applique l'aide de la sonde elle mme (Figure 4-16). La hauteur de lchantillon tait de 30 mm environ. 1% de dformation y tait applique. La mthode du facteur dchelle a t utilise pour calculer la dformation axiale. Une fentre de 3mm avec recouvrement de 80% a t utilise. Un filtre mdian 3x3 a t appliqu sur l'image de dformation pour rduire le bruit Sur l'image de la dformation axiale, l'inclusion en agar se prsente comme une structure plus rigide que le milieu englobant (Figure 4-17). Le profil moyen de dformation sur dix lignes au niveau de l'inclusion met en vidence les deux rgions de rigidit diffrente. Alors que l'inclusion est peine visible sur l'image chographique elle est mise en vidence sur l'image de dformation.

75

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

2.5

1.5

0.5

(a)
3 2.5

(b)

Dformation (%)

1.5

0.5

3 mm

(c)
Figure 4-17 Rsultats in vitro sur un morceau de viande bovine comportant une inclusion en agar plus rigide. (a) Dformation axiale en %. (b) Sonogramme correspondant. (c) Profil moyen de la dformation axiale sur 10 lignes au niveau de linclusion. (Dimensions des images 30x30mm).

4.3.3.

Cas dune sonde sectorielle

Aprs avoir valid les mthodes mises en uvre sur des images exprimentales acquises par un chographe sonde linaire, nous prsenterons dans la suite les rsultats obtenus partir des images exprimentales acquises avec un chographe sonde sectorielle.

4.3.3.1. Le dispositif dacquisition


Lchographe utilis est un chographe Kretz Voluson 530D sonde sectorielle qui permet des acquisitions 2D/3D. Les acquisitions 3D seront discutes dans le cinquime chapitre. Cet chographe a t modifi en chographe de recherche. En effet, une carte lectronique a t conue Creatis [MARI-05] pour permettre dacqurir les signaux chographiques et les transfrer sur ordinateur. Cette carte donne accs aux signaux RF, c'est--dire aux signaux

76

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

bruts dlivrs par la barrette du transducteur. Il est possible dacqurir des images RF 2D mais galement des volumes de donnes RF (3D). Le transducteur utilis est une barrette convexe focalise, de frquence centrale 7 MHz. Il est compos de 256 lments. La frquence dchantillonnage maximum est de 27 MHz. Le fantme en test a t comprim avec la sonde elle mme. Cette compression est pilote par lordinateur. Pour fixer la sonde sur le bras mobile et comprimer uniformment le fantme dans la direction verticale, un support a t ralis. La sonde doit tre compltement immobilise dans le support car la manipulation ne tolre aucun mouvement de celle-ci lors de la compression. En effet, les algorithmes choueront rapidement si la sonde a boug ou s'est dsaxe pendant la manipulation. D'autre part, pour tre uniforme, la compression doit tre applique au minimum sur une zone de 5 cm par 5 cm ce qui correspond la taille de notre fantme. La gomtrie de la sonde ne permettant pas une immobilisation simple (forme cylindrique), le choix a t fait de raliser ce support dans un bloc de PVC de base carre de 5 cm de ct. Le fantme utilis pour la cration des images RF est plac sous la sonde chographique. Entre deux images, le fantme a t comprim de 1.5 % environ de sa hauteur, soit 0.5 mm. Lchographe est rgl avec une focalisation simple, au centre de limage.

(b)

(a)
Figure 4-18 (a) Echographe Kretz Voluson 530D. (b) Sonde et systme de fixation.

77

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

4.3.3.2. Rsultats
Le mme fantme qui a t utilis pour lacquisition des images chographiques avec une sonde linaire est maintenant utilis pour lacquisition des images chographiques avec une sonde sectorielle. Il sagit dun paralllpipde de 60x50x30 mm. Il contient une inclusion cylindrique de 10 mm de diamtre. Le module dYoung de linclusion slve 160 KPa et celui de milieu englobant est de 50 kPa. Limage chographique du fantme acquise avec notre systme de compression est reprsente sur la Figure 4-19. On s'aperoit tout de suite que la compression n'est pas totalement uniforme car la sonde dpasse lgrement la plaque de compression et appuie sur le fantme. Rentrer un peu la sonde dans le support pour rduire ce problme reviendrait rduire l'angle d'ouverture. Dans le cas prsent, l'angle d'ouverture exploitable est de 110 alors que langle douverture maximum de la sonde est de 149. Il sagit l dun compromis acceptable. Pour pallier la faible frquence dchantillonnage (27 MHz), une interpolation base sur la transforme de Fourier des signaux RF avant et aprs compression a t applique. La frquence dchantillonage passe ainsi de 27MHz 135 MHz.

10 20 30 40 -40 -30 -20 -10 0 10 20 30 40

240 220 200 180 160 140 120 100 80

Figure 4-19 Image chographique du fantme avec une inclusion cylindrique en son centre acquise avec une sonde sectorielle. Linclusion nest pas visible sur limage chographique.

Pour le calcul de la dformation radiale par la mthode du facteur dchelle, une fentre de 3 mm avec un recouvrement de 80% a t utilise. En intgrant la dformation radiale, les dplacements radiaux ont t calculs. Pour calculer les dplacements angulaires 16 lignes RF intermdiaires ont t gnres entre deux signaux radiofrquence contigus obtenus aprs compression et tirement local. Une interpolation linaire a t utilise. La mme taille de fentre que celle utilise pour lestimation des dformations radiales, a t dplace latralement, avec le mme recouvrement, pour le calcul des dplacements angulaires. Un filtre mdian de taille 3x3 a t appliqu sur limage de dplacement angulaire pour rduire les fluctuations.

78

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

0.5 5 10 15 20 25 30 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20 5 10 15 20 25 30 0.4 0.3 0.2 0.1 0 -0.1 -0.2 -0.3 -0.4 -0.5 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20

(a)

(b)

Figure 4-20 Dplacements en mm estims sur le fantme suite lapplication de 1.5% de dformation. (a) Dplacements radiaux. (b) Dplacements angulaire. (Dimensions des images en mm)

La Figure 4-20 montre lestimation des dplacements radiaux et angulaires. Notons qu partir dun certain angle douverture, lestimation des dplacements radiaux et angulaires choue compltement. Langle limite est 70o dans notre cas. Dans le reste de limage l'estimation des dplacements radiaux semble visuellement tout fait cohrente par rapport sa rpartition. Les dplacements angulaires sont trs bruits et moins uniformes que dans la direction axiale mais restent tout fait cohrents. On observe bien des dplacements qui tendent repousser le milieu vers lextrieur quand la compression sexerce de haut en bas. La Figure 4-21 reprsente les dplacements axiaux et latraux calculs partir des dplacements radiaux et angulaires selon les quations (3-36). Les dplacements axiaux calculs montrent une valeur maximum de dplacement de 0.5 mm. Cette valeur correspond bien au dplacement appliqu sur la face suprieure du fantme. Les dplacements latraux sont quant eux relativement bruits. Cela peut tre expliqu par la gomtrie particulire de la sonde savoir une gomtrie cylindrique qui na pas provoqu une compression uniforme.
0.4

0.5 5 10 15 20 25 30 0.4
10 5

0.3 0.2 0.1

0.3

15 20 25 30

0 -0.1 -0.2

0.2

0.1

-0.3 -0.4 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20

0 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20

(a)

(b)

Figure 4-21 Dplacements en mm estims sur le fantme suite lapplication de 1.5% de dformation. (a) Dplacements axiaux. (b) Dplacements latraux. (Dimensions des images en mm)

A partir des dplacements axiaux et latraux, en se limitant un angle douverture de 70o, la cartographie du module dYoung du fantme a t reconstruite selon la mthode dcrite dans le troisime chapitre. Alors que linclusion ntait pas visible sur le sonogramme, elle est mise en vidence sur limage de module dYoung (Figure 4-22). Un profil de la cartographie du

79

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

module dYoung au niveau de linclusion (Figure 4-22 b) montre une valeur maximum de 85 KPa.
100
90

5 80 70 10 60 15 50 40 20 30 20 25 10 0

Module dYoung (kPa)

90

80 70 60 50 40 30 20 10 0

-10

-5

10

10

15

20 2

25

(a)

Profondeur (mm) (b)

Figure 4-22 (a) Cartographie du module dYoung (en kPa) du fantme en cryogel avec une inclusion cylindrique plus rigide en son centre. (b) Profil moyen du module dYoung au niveau de linclusion.

Cette sous estimation du module dYoung peut tre explique par le fait que seuls les dplacements en 2D ont t pris en compte. Notons la prsence des taches aberrantes dans le milieu englobant l'inclusion. Cela peut tre expliqu par les fluctuations observes sur l'estimation des dplacements, surtout latraux.

4.4

CONCLUSION

Dans ce chapitre la faisabilit de la reconstruction dune cartographie du module d'Young partir des dplacements axiaux et latraux a t montre. Nous nous sommes limits dans ce chapitre lestimation des dplacements en 2D (dans le plan de limage). La mthode a t valide dans un premier temps en simulation en utilisant une sonde linaire puis avec une sonde sectorielle. En simulation, les rsultats montrent une localisation prcise de deux milieux constituant le fantme. Les valeurs du module dYoung sont lgrement sous estimes. Les cartes de dplacements et de dformations latraux et axiaux sont en accord avec les valeurs thoriques calcules par Femlab. Aprs avoir valid les mthodes mises en uvre en simulation, nous les avons valides en exprimentation en utilisant deux types de sonde ultrasonore clinique (linaire et sectorielle). Les rsultats en gomtrie linaire et sectorielle ont montr que le module d'Young de l'inclusion est toujours sous estim. Cela peut tre expliqu par le fait que les dplacements dans la direction perpendiculaire au plan de limage ne sont pas pris en compte. Nanmoins les deux rgions aux proprits mcaniques diffrentes qui ne sont pas discernables sur l'image chographique conventionnelle, sont clairement mises en vidence sur l'lastogramme mme si la gomtrie de l'inclusion apparat un peu dforme.

80

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

Notons que dans le cas de figure dacquisition sectorielle, la zone exploite est rduite. En fait lestimation des dplacements radiaux et angulaires choue pour des angles levs car les signaux avant et aprs compression sont dcorrls. La qualit de la cartographie du module dYoung dpend essentiellement de la qualit des dplacements latraux et axiaux qui ont servi sa reconstruction. La prise en compte des dplacements en 3D est ncessaire pour une reconstruction plus prcise du module dYoung. Nous avons montr leffet de la distance de la focalisation sur lestimation des dplacements latraux et axiaux. Il a t montr que la largeur de la rponse impulsionnelle dgrade lestimation des dformations latrales. Il est alors prfrable pour l'estimation des dplacements latraux d'avoir une rponse impulsionnelle troite et constante avec la profondeur. Enfin dans le but d'aller vers une application mdicale, la mthode d'estimation axiale a t teste sur des tissus biologiques. Alors que l'inclusion est peine visible sur l'image chographique elle est mise en vidence sur l'image de dformation axiale.

81

CHAPITRE 4 VALIDATION DES METHODES

82

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

CHAPITRE 5
EXTENSION EN 3D

5.1

RESUME

Aprs avoir valid l'algorithme que nous avons mis en uvre pour l'estimation des dplacements en 2D ainsi que la reconstruction du module d'Young nous prsenterons dans ce chapitre une validation exprimentale de lalgorithme en 3D. Pour avoir accs aux dplacements en 3D, des acquisitions de signaux RF en 3D ont t effectus en utilisant lchographe numrique (Kretz Voluson 530D) sonde sectorielle 1D en rotation. Lorsque les diffrents plans sont acquis par rotation de la sonde sectorielle, les chantillons sont acquis suivant une gomtrie sphrique. Le fantme utilis pour la validation est un fantme en cryogel contenant en son centre, une inclusion cylindrique plus rigide. Une des difficults rencontres repose sur le fait que la direction (axiale) de la compression est distincte des directions de propagation (radiale) des ondes ultrasonores mises par la sonde sectorielle 3D. Lestimation des dplacements sera tout dabord ralise dans les plans images (dplacements radiaux et angulaires) puis les dplacements seront estims dans les plans perpendiculaires (dplacements sectoriels). Ces dplacements sont ensuite projets dans un repre cartsien pour calculer les dplacements axiaux, latraux et azimutaux. A partir de lensemble de ces dplacements le module dYoung est calcul. Ces travaux concernant lestimation des dplacements en 3D ont t publis dans la revue Ultrasonics [SAID-06]

5.2

ACQUISITION DES DONNEES RF EN 3D

La plupart des mthodes prsentes dans la littrature pour lestimation des dplacements se limitent aux directions axiale et latrale, cest dire dans le plan de limage. Pourtant, le dplacement au sein des tissus subissant une compression axiale, se fait en 3D. Cela peut tre expliqu par le fait que laccs aux donnes 3D lheure actuelle reste trs difficile. Certaines quipes ont estim les dplacements en 3D en simulation [KONO-00]. Les recherches menes actuellement en matire dacquisition 3D tendent dvelopper des barrettes dlments pizo-lectriques deux dimensions. Encore au stade exprimental, elles permettent dimager un volume sans mouvement du capteur. Ces barrettes sont cependant trs difficiles mettre en oeuvre et cbler. Actuellement les acquisitions 3D sont ralises plan

83

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

par plan avec des barrettes classiques, linaires ou sectorielles. Ces mesures peuvent tre effectues de plusieurs manires, mais les plus courantes se font par translation ou par rotation du capteur ou du faisceau ultrasonore. Lorsque la sonde est dplace en translation, les donnes mesures correspondent une gomtrie cartsienne si la sonde est linaire, et une gomtrie cylindrique si la sonde utilise est sectorielle (Figure 5-1)

(a)

(b)

Figure 5-1 Acquisition dun volume par translation dune sonde 1D linaire. (a) Volume obtenu avec une sonde linaire. (b) Volume obtenu avec une sonde sectorielle.

Lorsque les diffrents plans sont acquis par rotation de la sonde ou du capteur, les donnes mesures correspondent une gomtrie cylindrique si la sonde est linaire et sphrique si la sonde est sectorielle (Figure 5-2).

(a)

(b)

Figure 5-2 Acquisition dun volume par rotation dune sonde 1D linaire. (a) Volume obtenu avec une sonde linaire. (b) Volume obtenu avec une sonde sectorielle.

84

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

La solution la plus adapte dans le cas de llastographie est dacqurir les donnes par rotation du capteur tout en gardant la sonde immobile. Le volume 3D est constitu de C coupes 2D, chacune tant forme par L lignes ultrasonores RF. Les lignes ultrasonores numrises contiennent S chantillons. Chaque volume de donnes ultrasonores est ainsi constitu de CxLxS chantillons.

5.3 RECONSTRUCTION DU MODULE DYOUNG : EXTENSION EN 3D


Nous avons prsent dans le chapitre 3 une mthode de reconstruction du module dYoung. Elle est base sur la reconstruction d'une cartographie du module dYoung partir de la mesure locale des dplacements 3D (dans les directions axiales, latrales et azimutales) des tissus soumis une contrainte mcanique (compression). Une connaissance a priori du module dYoung en surface de lobjet en test est ncessaire. Dans le chapitre 3, seuls des dplacements dans deux directions ont t pris en compte dans le processus de reconstruction du module dYoung. Dans ce paragraphe nous prsentons la mthode de reconstruction de module dYoung partir des dplacements dans les trois directions : axiale, latrale et azimutale. Le tenseur de contrainte d'un solide linaire, lastique, isotrope et quasi incompressible, en fonction du module dYoung E et du coefficient de Poisson a t prsent dans le chapitre 1 et est rappel en 5.1 :

ij =

E ij E ij ij + (1 + )(1 2 ) (1 + )

5.1

ij est le symbole de Kronecker (ij= 1 si i = j) et i,j = x,y,z o x ,y et z dsigne les direction latrale, azimutale et axiale respectivement. ij est le tenseur de dformation. En repartant de lquation de lquilibre (2.8) en prenant en compte les trois directions et en ngligeant les forces internes, nous retrouvons les quations dquilibres suivantes xx xy xz + + =0 x y z yx x + yy y + yz z =0 5.2

5.3

zx zy zz + + =0 x y z

5.4

En introduisant lquation (5.1) dans les quations (5.2) (5.3) et (5.4), on dduit les quations suivantes:

85

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D
1 E (l kk + xx ) + 1 E ( xz ) + 1 E ( xy ) = (l kk + xx + xz + xy ) E x E z E y y x x z 1 E 1 E 1 E (l kk + yy ) = (l kk + yy + yz + yx ) ( yx ) + ( yz ) + E x E z E y x z y y 1 E 1 E (l kk + zz ) + 1 E ( zy ) = (l kk + zz + zx + zy ) ( zx ) + E x E z E y y z z x

5.5

5.6

5.7

O l =

Soit donc rsoudre trois quations avec trois inconnues

1 E 1 E 1 E , . et E x E z E y Ces quations peuvent tre assimiles au systme dquation suivant :

1 2

et kk = zz + xx + yy .

a1 x + b1 y + c1 z = d1 a 2 x + b2 y + c 2 z = d 2 a3 x + b3 y + c3 z = d 3
La mthode de Cramer peut tre utilise pour rsoudre ce systme linaire dquations, alors 1 E est donne par: E z
kk xx xz xy + + + ) x x z y yy yz yx (l kk + + + ) y y z x zy (l kk + zz + zx + ) z z x y (l (l kk + xx )

5.8

xz yz

xy
(l kk + yy )

1 E = E z

(l kk + zz )

zy

5.9

xz yz
(l kk + zz )

xy
(l kk + yy )

yx zx

zy

Comme expliqu dans le chapitre 3 et selon les dveloppements donns en (3.11), on obtient lexpression (5.10) pour la distribution du module dYoung est trouv.

z 1 E E ( z ) = E ( z 0 ) exp dz z0 E z

5.10

E(z0) est le module dYoung en surface dont on doit connatre une estimation pour lancer le processus itratif de calcul du module dYoung le long de la direction z.

86

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

De la mme manire nous pouvons calculer le module dYoung le long de la direction x et y.

5.4

SIMULATION
1 0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0

(a)
0.15 0.1 0.05 0 -0.05 -0.1

(b)
0.25 0.2 0.15 0.1 0.05 0 -0.05 -0.1 -0.15 -0.2 -0.25

(c)

(d)

Figure 5-3 (a) Fantme cubique de 55x30x55 mm avec inclusion cylindrique rigide en son centre. (b) Dplacement axial. (c) Dplacement latral. (d) Dplacement azimutal.

Afin de confronter les rsultats issus de nos mesures avec une rfrence, nous avons construit un fantme numrique dont la gomtrie est similaire celle du fantme physique en cryogel. Les cartes de dplacements et de dformations au sein du modle sont calcules avec le logiciel Femlab. Le fantme simul a les mmes dimensions que le fantme en cryogel utilis pour les validations exprimentales. Il sagit dun cube de 55x30x55 mm3 avec en son centre une inclusion cylindrique plus rigide, de 10 mm de diamtre (Figure 5-3 a). Nous avons choisi pour le coefficient de poisson, une valeur habituellement admise pour les tissus mous, milieu

87

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D quasi incompressible, soit = 0.45. La masse volumique tait de 1030 kg/m3. Le module dYoung de linclusion tait de 90 kPa et celui du milieu environnant tait de 40 kPa. Un dplacement de 1 mm a t appliqu sur la face suprieure du fantme. Les cartes des dplacements axiaux, latraux et azimutaux pour le plan mdian du fantme, donns directement par Femlab, sont prsentes sur la Figure 5-3. Nous pouvons constater quune compression axiale de 1mm entrane une dilatation maximale du fantme dans la direction latrale de 0.3 mm et de 0.5 mm dans la direction azimutale.

5.5

EXPERIMENTATION Dispositif et gomtrie dacquisition

5.5.1.

Le mme systme exprimental que celui utilis pour les acquisitions sectorielles 2D a t utilis pour les acquisitions des donnes en 3D. Il consiste en lchographe numrique (Kretz Voluson 530D) sonde sectorielle 1D qui permet des acquisitions 2D/3D et en un dispositif mcanique permettant dappliquer une compression, guide par lordinateur, introduisant des dformations au sein des objets en test. La compression est effectue avec la sonde elle mme, immobilise dans un support en PVC et fixe sur le bras mobile. La sonde endovaginale S-VDW5-8B (Figure 5-4), a t utilise. Elle permet une acquisition volumique tout en laissant la sonde immobile. La barrette dlments de la sonde balaye la zone dintrt sur un angle volumique comme illustr par la Figure 5-5. Une image sectorielle est acquise pour chaque position de la barrette lintrieur de la sonde. Cette mthode dacquisition est bien adapte llastographie car il ny a pas de mouvement du fantme au cours de lacquisition des diffrents plans image qui composent le volume. Chaque chantillon du volume acquis est localis par trois cordonnes : deux angles et une distance : langle, langle, et la profondeur P. Langle correspond langle de balayage volumique de la sonde, langle est langle de balayage dans le plan de limage et P est la profondeur sur la ligne dexploration (Figure 5-5). Les valeurs maximales de ces trois paramtres sont rglables sur lchographe. En raison de la taille limite de la mmoire de la carte dacquisition nous avons choisi comme compromis, les valeurs suivants : angle m de 30o, angle de balayage volumique m de 50o et une profondeur Pm de 50 mm.

Figure 5-4 Sonde endovaginale S-VDW5-8B permetant lacquisition de volumes dimage.

88

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

m x

s r
a

Figure 5-5 Gomtrie de lacquisition. r, a, s dsignent les directions radiale, angulaire et sectorielle respectivement. est langle de balayage de la barrette sectorielle. est langle de balayage dans le plan image. z, x, y dsignent les directions axiale, latrale et azimutale respectivement.

La compression axiale est applique suivant laxe z et la direction de propagation des faisceaux ultrasonores est radiale. Or cette gomtrie dacquisition particulire entrane, pour des angles de tirs importants, une dcorrlation entre les signaux avant et aprs compression. Nous notons ur , ua et us les dplacements dans les diffrentes directions que nous appelons radiale r (le longs des faisceaux ultrasonores), angulaires a (perpendiculaire la direction radiale dans le plan de limage) et sectorielle s (perpendiculaire au plan de limage). z, x, y dsignent les directions axiale, latrale et azimutale respectivement.

5.5.2.

Calcul des dplacements axiaux, latraux et azimutaux

Une fois les dplacements radiaux, angulaires et sectoriels calculs selon les mthodes dcrites dans le chapitre 3, il est ncessaire de calculer les dplacements dans le repre cartsien, appels dplacements axiaux, latraux et azimutaux, pour la reconstruction du module dYoung. La projection des dplacements radiaux, angulaires et sectoriels dans un repre cartsien se fait en deux tapes. Nous projetons dabord les dplacements dans le plan de limage. Les rsultats de la projection sont ensuite projets dans le plan ozy (voir Annexe A). Les quations de projections sont donnes en 5.11.

u x sin u y = cos sin u cos cos z

cos sin sin sin cos

0 u r cos .u a sin u s

5.11

89

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

5.5.3.

Rsultats exprimentaux

Le fantme utilis pour les validations exprimentales est un paralllpipde en cryogel (polyvinyl alcohol (PVA)) de 55x30x55 mm3. Il contient en son centre, une inclusion cylindrique de 10 mm de diamtre. Linclusion a subi 5 cycles de conglation/dconglation alors que le milieu englobant en a subi 2. Selon le tableau (4-4), le module dYoung de linclusion est donc de 90 kPa, et celui du milieu englobant est de 40 kPa. Le fantme utilis pour lacquisition des images RF est plac sous la sonde chographique. Entre deux acquisition dun volume, le fantme est compress de 2 % environ de sa hauteur, soit 1 mm. Lchographe est rgl avec une focalisation simple, au centre de limage, positionne au niveau de linclusion. La dformation radiale a t calcule par lestimation des facteurs dchelle locaux entre les signaux RF avant et aprs compression. Une fentre de 3 mm avec un recouvrement de 80% a t utilise. Les dplacements radiaux ont t calculs en intgrant les dformations radiales. Pour calculer les dplacements angulaires, 16 lignes RF intermdiaires ont t gnres, entre deux signaux radiofrquence contigus obtenus aprs compression et tirs, localement selon lalgorithme du facteur dchelle. Une interpolation linaire a t utilise. Une fentre de la mme taille que celle utilise pour lestimation des dformations radiales a t dplace latralement pour le calcul des dplacements angulaires. Un filtre mdian de taille 3x3 a t appliqu sur limage de dplacement angulaire pour rduire le nombre de points aberrants. Pour le calcul des dplacements sectoriels nous avons construit des plans perpendiculaires aux plans image, appels plans sectoriels partir des signaux RF composant les plans image. Chaque plan sectoriel contient les lignes portant le mme numro sur tous les plans image. Lalgorithme de calcul des dplacements latraux a t appliqu aux plans sectoriels pour calculer les dplacements sectoriels. 16 lignes RF intermdiaires ont t interpoles entre deux signaux radiofrquence contigus obtenus aprs compression et tirement local selon lalgorithme du facteur dchelle. Une interpolation linaire a t utilise. Une fentre de la mme taille que celle utilise pour lestimation des dformations radiales a t utilise pour le calcul des dplacements sectoriels. Un filtre mdian de taille 3x3 a t appliqu sur limage de dplacement sectoriel. A partir des dplacements radiaux, angulaires et sectoriels, les dplacements axiaux, latraux et azimutaux ont t calculs selon les quations (5.11). Les dformations axiale, latrale et azimutale ont t calcules en utilisant un estimateur au sens des moindres carrs [KALL-97], partir des dplacements axiaux, latraux et azimutaux. La taille de la fentre glissante utilise pour le calcul des dformations latrale et azimutale tait de 20 lignes. Le mme estimateur a t utilis pour calculer la dformation axiale partir de deux mesures conscutives de dplacements. Dans ce qui suit nous prsentons les rsultats obtenus sur le fantme en cryogel. Les triangles superposs sur les images de rfrence fournies par Femlab (Figure 5-7e, 5.10e, Figure 5-9e) reprsentent les rgions rellement images avec la sonde sectorielle et correspondent aux rsultats exprimentaux. Les carrs superposs sur la Figure 5-6-a reprsentent les deux rgions qui ont servi calculer le CNRe et le SNRe et la moyenne et lcart type des dformations et du module dYoung.

90

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

La Figure 5-6-a montre lestimation des dformations radiales dans le plan mdian du volume. Limage de la dformation radiale permet de voir clairement linclusion contrairement limage chographique (Figure 5-6-b). Afin dvaluer la variabilit des estimations locales de dformation, la moyenne et lcart type de mesures lintrieur dune petite zone suppose homogne sont calculs et prsents en fonction du numro du plan image. Les deux rgions slectionnes prsentent des dformations trs diffrentes et voluent de faon continue sur les plans conscutifs. Les moyennes et lcart type des dformations radiales prsentes sur la Figure 5-6-c montrent une augmentation de la dformation au centre du volume. De mme des mesures de contraste entre deux zones de dformation diffrente (CNRe) et de rapport signal bruit (SNRe) lintrieur de ces deux zones sont calcules et prsentes en fonction du numro du plan image selon les quations ( 3-19, 3-20). Le contraste entre linclusion et le milieu englobant (CNRe) montre comme attendu une augmentation au centre du volume (Figure 5-6-d) et prsente une valeur moyenne de 100. La Figure 5-6-e. montre que le rapport signal sur bruit (SNRe) a tendance augmenter autour du plan mdian. Il est noter que le SNRe est moins lev dans linclusion que dans le milieu englobant. Ces diffrentes mesures confirment que lorsquon sloigne du plan mdian, la dformation radiale est estime avec moins de prcision du fait que la dcorrlation des signaux avant et aprs compression axiale augmente en sloignant du centre du volume. Toutefois llastographie 3D permet la visualisation des plans de dformation qui ne sont pas accessibles dans llastographie 2D comme le montre la Figure 5-6-f. Cette figure prsente une image de dformation radiale dans le plan sectoriel mdian, plan perpendiculaire au plan image dorigine. La Figure 5-7 montre les cartes de dplacements radiaux et axiaux dans le plan mdian du volume, puis dans un plan 12 mm du plan mdian. La carte des dplacements axiaux de rfrence fournie par Femlab correspondant au plan mdian ainsi quau profil des dplacements axiaux 48 mm de profondeur. L'estimation des dplacements radiaux est visuellement cohrente par rapport sa rpartition. En effet, le dplacement radial augmente avec la profondeur et il est dautant moins important que les diffuseurs sont loigns du centre. L'estimation des dplacements axiaux est visuellement cohrente par apport sa rpartition. Le dplacement axial augmente avec la profondeur et ne varie pas selon la direction latrale. On note que la carte des dplacements axiaux prs du bord est plus bruite. Les profils de dplacements montrent que les dplacements axiaux sont en accord avec la rfrence Femlab avec une lgre surestimation.

91

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

2.5 5 10 15 20 25 30 35 40 45 -10 -5 0 5 10 0 0.5 1 1.5 2


5 10 15 20 25 30 35 40 45 -10 -5 0 5 10 240 220 200 180 160 140 120 100 80

(a)
2.6 2.4 2.2
200 250

(b)

Dformation (%)

1.6 1.4 1.2 1 0.8 0.6

CNRe
0 10 20 30 40 50 60

1.8

150

100

50

10

20

30

40

50

60

Numro du plan

Numro du plan

(c)
50 45 40 35 30
20 5 10 15

(d)
2.5

SNRe

1.5

25
25

20
30

15
35

10
40

0.5

5
45

10

20

30

40

50

60

Numro du plan

-20

-10

10

20

(e) (f) Figure 5-6 (a) Dformation radiale estime dans le plan mdian du volume. (b) Image chographique correspondante(c) Dformation radiale moyenne et cart type estime en fonction du numro du plan dans le volume, dans linclusion (en bleu) et lextrieur de linclusion (en rouge), (d) Contraste (CNRe) calcul en fonction du numro du plan dans le volume (e) Rapport signal sur bruit (SNRe) calcul en fonction du numro du plan dans le volume (f) Dformation radiale reconstruite dans un plan perpendiculaire au plan de limage. (Les dimensions des images sont en mm et les dformations sont en %).

92

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

0.9 5 10 15 20 0.5 25 0.4 30 0.3 35 0.2 40 0.1 45 0.8 0.7 0.6

0.8 5 10 0.6 15 0.5 20 25 30 35 40 0.1 45 0.4 0.3 0.2 0.7

(a)
5 10 15 20 25

-10

-5

10

0 0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4

(b)
5 10 15 20 25 30

-10

-5

10

0
0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3

30 0.3 35 0.2 40 0.1 45

35 0.2 40 0.1 45
-10 -5 0 5 10 0

(c)

(d)
1 0.9

-10

-5

10

0.9 5 10 15 20 0.5 25 0.4 30 0.3 35 0.2 40 0.1 45


0.2 0.1 0 -15

0.8
0.8

0.7 0.6

Dplacement (mm)

0.7 0.6 0.5 0.4 0.3

(e)

-10

-5

10

(f)

-7.5

7.5

15

Position latrale (mm)

Figure 5-7 (a) Dplacements radiaux dans le plan mdian du volume. (b) Dplacements radiaux dans un plan 15o du plan mdian. (c) Dplacements axiaux dans le plan mdian du volume. (d) Dplacements axiaux dans un plan 12 mm du plan mdian du volume. (e) Carte de dplacements de rfrence fournie par Femlab du plan correspondant. (f) Profils des dplacements axiaux 48 mm de profondeur. Profil de rfrence en bleu, profil estim en rouge. (Les dimensions et les dplacements sont donns en mm)

93

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

La Figure 5-8 montre les dplacements angulaires et latraux dans le plan mdian du volume, dans un plan 15o du plan mdian et la carte des dplacements latraux de rfrence fournie par Femlab correspondant au plan mdian ainsi quun profil des dplacements latraux 48 mm de profondeur. L encore, l'estimation des dplacements angulaires et latraux est visuellement cohrente par rapport sa rpartition. En effet les dplacements sont dautant plus importants en valeur absolue que les diffuseurs sont loigns du centre. On note que la carte des dplacements latraux prs du bord est plus bruite. Les profils de dplacements montrent que les dplacements latraux sont assez largement surestims (en valeur absolue) la profondeur de 48 mm. La Figure 5-9 montre les cartes des dplacements sectoriels et azimutaux dans le plan mdian du volume, dans un plan 15o du plan mdian et la carte des dplacements azimutaux de rfrence fournie par Femlab correspondant au plan mdian ainsi quau profil des dplacements azimutaux 48 mm de profondeur. L'estimation des dplacements sectoriels est visuellement cohrente par apport sa rpartition. En effet les dplacements sont dautant plus importants que les diffuseurs sont loigns du centre. Les dplacements azimutaux estims sont en gnral en accord avec la rfrence Femlab except dans une rgion en amont de linclusion qui prsente les valeurs de dplacements non cohrentes vis--vis de leurs rpartitions. Les profils de dplacements au plus bas du fantme montrent que les dplacements azimutaux sont en gnral en accord avec la rfrence Femlab mais fortement bruits. La carte des dformations axiales dans le plan mdian du volume, compare la carte de dformation de rfrence fournie par Femlab montre que les valeurs de dformation estimes sont en gnral dans la mme gamme que les valeurs thoriques (Figure 5-10-a, b). La moyenne et lcart type des dformations axiales calculs sur une petite zone suppose homogne est prsentes sur la Figure 5-6-c montrent que lcart type est dautant plus important que lon sloigne du centre de volume. On note une augmentation de la dformation au environ du plan mdian. Le contraste entre linclusion et le milieu englobant (CNRe) en fonction du numro du plan image dans le volume montre, comme attendu, une augmentation de la dformation autour du plan mdian (Figure 5-10-d). On note que le contraste est fortement dgrad dans les plans les plus proches du bord du volume. En effet, tant donn que les dplacements angulaires et sectoriels qui ont servi au calcul de dplacements axiaux sont trs bruits dans les plans proches du bord, ils laissent linclusion noye dans du bruit ce qui rend sa dtection dlicate. La Figure 5-10-e montre que le rapport signal sur bruit (SNRe) augmente dans les plans proches de laxe central du volume. Notons que le SNRe est moins lev dans linclusion que dans le milieu englobant.

94

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

5 10 15

0.3

5 10 15

0.3

0.2

0.2

0.1 20 25 30 35 -0.2 40 45 -0.3 -10 -5 0 5 10


0.15 5 0.1 10 15 20 25 30 -0.05 35 40 45 -0.1
35 40 45 10 5
40 45 20

0.1

25 30 35

-0.1

-0.1

-0.2

-0.3 -10 -5 0 5 10

(a)

(b)

0.15

0.1

0.05

15 20

0.05

25 30

-0.05

-0.1

(c)
5

-10

-5

10
0.15
0.8

(d)
0.1
0.6

-10

-5

10

Dplacements (mm)

10 15 20 25 30 -0.05 35 40 45 -10 -5 0 5 10 -0.1 0 0.05

0.4

0.2

-0.2

-0.4

(e)

(f)

-0.6 -15

-7.5

7.5

15

Position latrale (mm)

Figure 5-8 (a) Dplacements angulaires dans le plan mdian du volume. (b) Dplacements angulaire dans un plan 15o du plan mdian. (c) Dplacements latraux dans le plan mdian du volume. (d) Dplacements latraux dans un plan 15o du plan mdian du volume. (e) Carte de dplacements latraux de rfrence fournie par Femlab du plan mdian. (f) Profils des dplacements latraux 48 mm de profondeur. Profil de rfrence en bleu, profil estim en rouge. (Les dimensions et les dplacements sont donns en mm)

95

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

5 10 15

0.3

5 10 15

0.3

0.2

0.2

0.1 20 25 30 35 -0.2 40 45 -20 -10 0 10 20 -0.3 0

0.1 20 25 30 35 -0.2 40 45 -20 -10 0 10 20 -0.3 0

-0.1

-0.1

(a)
5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.2 0.15 0.1 0.05 0 -0.05 -0.1 -0.15 -0.2

(b)
5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.2 0.15 0.1 0.05 0 -0.05 -0.1 -0.15 -0.2

(c)
5 10 15 20 25 30 35 40 45 -20 -10 0 10 20 0.2 0.15 0.1 0.05 0 -0.05 -0.1 -0.15

(d)
0.3 0.2

Dplacements (mm)

0.1

-0.1

-0.2

-0.3

-0.2
-0.4 -22 -11 0 11 22

(e)

(f)

Positions azimutale (mm)

Figure 5-9 (a) Dplacements sectoriels estims dans le plan mdian du volume. (b) Dplacements sectoriels estims dans un plan 15o du plan mdian. (c) Dplacements azimutaux dans le plan mdian du volume. (d) Dplacements azimutaux dans un plan 15o du plan mdian du volume. (e) Carte de dplacements de rfrence fournie par Femlab du plan mdian. (f) Profils des dplacements azimutaux 48 mm de profondeur. Profil de rfrence en bleu, profil estim en rouge. (Les dimensions et les dplacements sont donns en mm)

96

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

2.5 5 10 15 20 25 30 35 40 45 -10 -5 0 5 10 0 0.5 1 1.5 2


5 10 15 20 25 1.6 30 1.5 35 40 45 -10 -5 0 5 10 1.4 1.3 1.2 2.1 2 1.9 1.8 1.7

(a)
5
140 120

(b)

Dformation (%)

100

CNRe
0 10 20 30 40 50 60

80

60

1
40

20

-1

10

20

30

40

50

60

Numro du plan

Numro du plan

(c)
50 45 40 35 30 25 20 15 10 5 0

(d)

SNRe

10

20

30

40

50

60

Numro du plan

(e) Figure 5-10 (a) Dformation axiale estime dans le plan mdian du volume. (b) Dformation de rfrence dans le plan correspondant (c) Moyenne et cart type de la dformation axiale estime dans linclusion (en bleu) et lextrieur de linclusion (en rouge) en fonction du numro du plan dans le volume (d) Contraste (CNRe) en fonction du numro du plan dans le volume (e) Rapport signal sur bruit (SNRe) en fonction du numro du plan dans le volume.

97

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

5 5 10 15 20 25 30 35 40 45 -5 0 5 4.5 4 3.5 3 2.5 2 1.5 1

1.2 5 1.1 10 1 15 0.9 20 25 30 35 40 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4 -10 -5 0 5 10

0.5

45
0

(a)

(b)

Figure 5-11 (a) Dformation latrale estime (b) Dformation latrale de rfrence fournie par Femlab. (Les dformations sont en %, les dimensions sont en mm)

Dun point de vu qualitatif, nous constatons que les valeurs de dformation latrale estimes sont en gnral dans la mme gamme que les valeurs thoriques except dans la partie infrieure du fantme (Figure 5-11). Nous constatons la prsence de linclusion avec toutefois des contours dforms. La Figure 5-12 montre une carte de dformation azimutale dans le plan mdian et celle de rfrence Femlab. On peut constater une zone aberrante de dformation ngative en haut du fantme. Le milieu du fantme qui correspond linclusion prsente des faibles dformations. La partie infrieure du fantme prsente des dformations globalement cohrentes avec la rfrence Femlab mais reste trs bruite.

1 5 0.8 10 0.6 15 20 25 30 35 40 45 -10 -5 0 5 10 0.4 0.2 0 -0.2 -0.4 -0.6 -0.8

5 10 15 20 25 30 35 40 45
-1

1.1

0.9

0.8

0.7

0.6

0 -20 -10 0 10 20

(a)

(b)

Figure 5-12(a) Dformation azimutale estime. (b) Dformation azimutale de rfrence. (Les dformations sont en %, les dimensions sont en mm)

Cette zone de dformations azimutales ngatives ne nous a pas permis de reconstruire le module dYoung partir des dformations axiale, latrale et azimutale. Nous nous sommes donc limits la reconstruction du module dYoung partir des dplacements et dformations axiaux et latraux. (Figure 5-13). La cartographie du module dYoung obtenue montre une bonne localisation des deux milieux. Les valeurs moyennes du module dYoung et lcart type en fonction du numro du plan du volume, lintrieur et lextrieur de linclusion,

98

CHAPITRE 5 EXTENSION 3D

montrent que la valeur moyenne de module dYoung dans linclusion varie sensiblement dun plan un autre entre 60 et 80 kPa; lextrieur de linclusion entre 30 et 40 kPa. Ces valeurs sont proches des vraies valeurs, savoir 40 kPa pour le milieu englobant et 90 kPa pour linclusion.
100 5 10 15 20 25 30 35 40 10 45 0 -5 0 5 90 80 70 60 50 40 30 20 110 100

Module d'Young (kPa)

90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 20 25 30 35 40

Numro du plan

(a)

(b)

Figure 5-13 (a) Module dYoung reconstruit (en kPa) du fantme en cryogel avec inclusion cylindrique plus rigide en son centre. (b) Moyennes et cart type du module dYoung dans linclusion (profil bleu), lextrieur de linclusion (profil rouge) en fonction du numro du plan du volume. (Les dimensions sont en mm)

5.6

CONCLUSION

Dans ce chapitre la faisabilit de la reconstruction dune cartographie 3D du module d'Young partir des dplacements axiaux et latraux dans une gomtrie sectorielle a t montre. La carte de dformation radiale permet de voir clairement linclusion, contrairement limage chographique, dans tous les plans du volume. Les dformations axiales sont en gnral dans la mme gamme que les valeurs thoriques fournies par Femlab surtout dans le plan mdian. On note que le contraste est fortement dgrad dans les plans les plus proches du bord du volume. En effet, tant donn que les dplacements angulaires et sectoriels qui ont servi au calcul de dplacements axiaux sont trs bruits dans les plans proches du bord, ils laissent linclusion noye dans du bruit ce qui rend sa dtection dlicate. Les valeurs de dformation latrale estimes sont en gnral dans la mme gamme que les valeurs thoriques exceptes dans la partie infrieure du fantme. La carte de dformation laisse apparatre linclusion avec des contours dforms. En gnral tous les dplacements estims sont cohrents par rapport leur rpartition spatial et sont en accord avec la rfrence Femlab. Les diffrentes mesures confirment que lorsquon sloigne du plan mdian, lestimation devient moins prcise du fait que la dcorrlation des signaux avant et aprs compression axiale augmente en sloignant du centre du volume. On note que les dplacements latraux et surtout azimutaux sont fortement bruits. Les valeurs du module dYoung calculs a partir des dplacements axiaux et latraux dans tous les plans image du volume varie sensiblement dun plan un autre mais reste en gnral proches des valeurs thoriques. 99

100

CONCLUSION GENERALE ET PERSPECTIVES

Les techniques actuelles d'lastographie ultrasonore consistent gnralement fournir une image de dformation axiale des tissus lorsquils subissent une compression axiale. Or les dformations au sein de lobjet soumis une telle compression se font en 3D. De plus, dans les applications cliniques une mesure quantitative de la rigidit des tissus comme le module dYoung est fortement souhaitable pour la dtection, la quantification et la classification des lsions selon leur caractre bnin ou malin. Lobjectif de ce travail de thse tait destimer les dplacements et les dformations en 3D ainsi que la reconstruction du module dYoung. Dans un premier temps, nous avons mis en uvre des techniques de traitement du signal pour lestimation des dplacements et des dformations en 2D. La mthode destimation de la dformation axiale est base sur une estimation locale et adaptative des facteurs dchelle. Pour les dplacements latraux, une mthode base sur la corrlation et linterpolation des signaux RF a t mise en oeuvre. La mthode de reconstruction du module dYoung ncessite la connaissance a priori de la valeur du module dYoung en surface de lobjet comprim ainsi que les dplacements axiaux et latraux du milieu qui subit la compression. Une validation en simulation sur fantme dlments finis et une validation exprimentale sur un fantme en cryogel ont t ralises. Ces fantmes comportaient une inclusion cylindrique rigide en leur centre. Deux types de sondes exprimentales ont t utilises: une sonde linaire et une autre sectorielle. Les rsultats ont montr une localisation prcise des deux milieux constituant le fantme. Les cartes de dplacements et de dformations latraux et axiaux sont en accord avec les valeurs thoriques calcules par Femlab. Nous avons mis en vidence que la reconstruction du module dYoung dpend fortement de la qualit des dplacements latraux et axiaux qui ont servi sa reconstruction et que la prise en compte des dplacements en 3D tait ncessaire pour une reconstruction plus prcise du module dYoung. Le formalisme dvelopp a t tendu au 3D et le chapitre 5 a t consacr la validation exprimentale en 3D. Pour avoir accs aux dplacements en 3D, des acquisitions de signaux RF en 3D ont t effectues en utilisant un chographe numrique (Kretz Voluson 530D) sonde sectorielle 1D en rotation. Ladaptation technique de cet chographe pour permettre lacquisition des signaux RF a t ralise au laboratoire. Cette acquisition est la plus adapte dans le cas de llastographie car la sonde reste immobile durant lacquisition du volume. Nanmoins cette gomtrie dacquisition particulire entrane, pour des angles de tirs importants, une dcorrlation entre les signaux avant et aprs compression. La plus grande difficult rencontre reposait sur le fait que la direction (axiale) de la compression tait distincte des directions de propagation (radiale) des ondes ultrasonores mises par la sonde sectorielle.

101

Les rsultats ont montr quen gnral tous les dplacements estims taient cohrents par rapport leur rpartition spatiale et taient en accord avec la rfrence Femlab. Les diffrentes mesures ont confirm que lorsquon sloigne du plan mdian, lestimation devient moins prcise du fait que la dcorrlation des signaux avant et aprs compression. Une premire cartographie 3D du module dYoung a t calcule sur les donnes exprimentales, donnant ainsi une estimation quantitative en 3D du module dlasticit. Dans le cadre de ce travail, les dplacements axiaux, latraux et azimutaux ont t estims sparment. En guise de perspectives, il semble quune amlioration notable pourrait tre apporte en proposant un estimateur 3D non sparable du dplacement. Cet estimateur prendra en compte dune part la grande diffrence dchantillonnage spatial des donnes RF dans chacune des dimensions de lespace et dautre part la gomtrie dacquisition avec une sonde sectorielle balayage qui notre avis est trs bien adapte llastographie 3D.

102

ANNEXE A-PROJECTION DES DEPLACEMETNS DANS UN REPERE CARTESIEN


La projection des dplacements radiaux (ur), angulaires (ua) et sectoriels (us) dans un repre cartsien (x y z) se fait en deux tapes. Nous projetons dabord les dplacements dans le plan image oxz . oz dnote le mdian du plan image. Les rsultats de la projection sont donns dans lquation (5.12).

r z
(a)

z
(b)

Figure 5-14 (a) Dans le plan image, r, a et x dsignent les directions radiale, angulaire, et latrale respectivement, z dnote le mdian, est langle de la ligne RF courante par apport laxe z. (b) Dans le plan perpendiculaire au plan image, s, z et y dsignent les directions sectorielle, axiale et azimutale respectivement, est langle courante de balayage volumique.

u z = u r cos + u a sin u x = u r sin + u a cos

5.12

est langle de la ligne RF courante par apport laxe oz dans le plan image, oxz.. Ces dplacements sont ensuite projets dans le plan ozy (quation 5.13). u z = u z sin + u s cos u y = u z sin + u s cos 5.13

est langle de uz courante par apport laxe oz dans le plan perpendiculaire limage, ozy. En remplaant uz donn par 5.12 en 5.13 nous retrouvons la matrice de projection (quation 5.14) u x sin u y = cos sin u cos cos z cos sin sin sin cos 0 u r cos .u a sin u s

5.14

uz, ux,uy sont les dplacements axiaux, latraux et azimutaux.

103

ANNEXE B-LISTE DES PUBLICATIONS


Revue internationale avec comit de lecture

1/ G. SAID, O. Basset, J.M Mari, C. Cachard, E. Brusseau, D. Vray, Experimental three dimensional strain estimation from ultrasonic sectorial data, Ultrasonics, 2006, in press

Publications dans des confrences avec actes

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