07/03/2012

BIOMOLCULAS: Aminocidos e Peptdeos

Disciplina: Bioqumica Prof. MSc. Danielle Ayr Tavares de Almeida 2012

Polmeros biolgicos
Muitas molculas biolgicas so macromolculas (polmeros) de alto peso molecular montados a partir de precursores mais simples. A sntese de macromolculas a atividade que mais consome energia das clulas. MONMEROS POLMEROS

EXEMPLO: EXEMPLO:

1. cidos nuclicos: polinucleotdeos (DNA e RNA) nuclicos: 2. Polissacardeos: (formado por acares) Polissacardeos: 3. Protenas: peptdeos (formado por aminocidos) biomolculas Protenas: aminocidos) mais importantes nos seres vivos. So polmeros formadas por vivos. unidades monomricas. monomricas.

Aminocidos (AA)
So os blocos (unidades monomricas, monmeros, tijolos) que constituem as protenas Funes biolgicas:
Estrutura celular Hormnios. Receptores de protenas e hormnios. Transporte de metablitos e ons. Atividade enzimtica. Imunidade. Gliconeognese no jejum e diabetes.

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Estrutura geral dos AA de ocorrncia biolgica

Grupamento amino Grupamento carboxilato (cido carboxlico)

Hidrognio Grupamento R, ou cadeia lateral Essa parte que define as propriedades cada aminocido de acordo com suas caractersticas de estrutura, tamanho, caga eltrica , solubilidade

Isomeria dos AA
Carbono quiral

COOH C R H

H2N

Carbono quiral ou carbono assimtrico tomo de C que se liga quatro ligantes diferentes (radicais, grupos funcionais, etc.) = C sempre saturado

Isomeria dos AA
Uma vasta maioria dos - aminocidos possuem carbono

na configurao L

COOH H C NH2
D-Aminocido

COOH H2N C
L-Aminocido

Formam dois Estreo ismeros (enantimeros): L Levorrotatrio (esquerda) D Destrorrotatrio (direita)

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Isomeria dos AA

Isomeria dos AA
B A D
Centro quiral

A C

Observaes importantes: Os aminocidos nas molculas proticas so sempre L-estereismeros Os D aminocidos foram encontrados apenas em pequenos peptdeos de parede celular bacteriana e alguns peptdeos que tm funo antibitica.

Estrutura e propriedades dos AA

At pouco tempo conheciam-se 20 aminocidos: Todos os 20 -aminocidos; Para 19 dos 20, o grupo -amino primrio; para prolina secundrio; Com exceo da glicina, o carbono de cada um um centro assimtrico; Atualmente mais dois aminocidos foram adicionados lista: Selenocistena e Selenometionina. Excees:
prolina glicina

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NOVOS

Selenometionina

Selenocistena

Smbolos dos Aminocidos

A B C D E F G H I K L Ala Alanina Asx Asparagina ou Aspartato Cis ouCys Cistena Asp Aspartato (cido aspartico) Glu Glutamato (cido glutmico) Fen ou Phe Fenilalanina Gli ou Gly Glicina His Histidina Ile Isoleucina Lis ou Lys Lisina Leu Leucina

Smbolos dos Aminocidos

M Met N Asn P Pro Q Gln R Arg S Ser T Tre ou Thr V Val W Trp Y Tir ou Tyr Z Glx Metionina Asparagina Prolina Glutamina (Glutamida) Arginina Serina Treonina Valina Triptofano (Triptofana) Tirosina Glutamina ou Glutamato

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Nomes dos aminocidos

Asparagina foi o primeiro encontrada em aspargos, Glutamato no glten de trigo;
Asparagina Aspargo

Tirosina foi isolada pela primeira vez do queijo (seu nome derivado do grego tyros , "queijo");
Tirosina

Glutamato

trigo

queijo Glicina (glykos grego, "doce") assim chamada devido ao seu sabor doce.

Classificao dos Aminocidos

QUANTO POLARIDADE DE SEU GRUPAMENTO R Quando em soluo aquosa de pH neutro plasma sanguneo e espao intracelular Grupos R apolares hidrofbicos Grupos R polares no carregados Grupos R polares carregados cidos Grupos R polares carregados bsicos

Classificao dos aminocidos

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Apolares (hidrofbicos)
alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, e metionina

Apolares (hidrofbicos)
fenilalanina e triptofano

Polares - no Ionizados
serina, treonina e tirosina

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Polares - no Ionizados
asparagina, glutamina, cistena e glicina

Polares - bsicos
lisina, arginina, histidina.

Polares - cidos
cido glutmico e cido asprtico

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AA NOVOS
Selenocistena Cistena HS

Aminocido polar sem carga Presente em muitas enzimas.

AA NOVOS
Selenometionina Metionina

Aminocido apolar No sintetizado por animais superiores, mas sim por plantas

Classificao dos Aminocidos

Essenciais - so aqueles que no podem ser sintetizados pelos animais.

No essenciais - so aqueles que podem ser sintetizados pelos animais. So de 10 a 12 AAs encontrados em suas protenas.

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Classificao dos Aminocidos

O homem sintetiza 10 dos 22 AA. Os 12 AA que ele no sintetiza so denominados AA essenciais devem ser suplementados na dieta. Se 1 ou mais dos AA essenciais no for administrado o homem degrada suas protenas corporais para obter os AA que necessita Plantas e bactrias so capazes de sintetizar todos os AA todos os AA so no essenciais. Classificar um aminocido em no essencial ou essencial depende da espcie estudada;

Classificao dos Aminocidos

ESSENCIAIS Arginina Histidina Isoleusina Leusina Lisina Meteonina Fenilalanina Treonina Triptofano Valina NO ESSENCIAIS Alanina Aspartato Asparagina Cistena Glutamato Glutamina Glicina Prolina Serina Tirosina

Classificao dos Aminocidos

QUANTO AO DESTINO NO METABOLISMO ANIMAL Glucognicos (podem ser transformados em glicose) alanina, arginina, metionina, cistena, cistina, histidina, treonina e valina. Glucocetognicos (podem se transformar em glicose ou em corpos cetnicos) fenilalanina, tirosina e triptofano, isoleucina e lisina Cetognicos (podem se transformar em corpos cetnicos) leucina

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Caractersticas fisico-qumicas dos AA

So todos compostos slidos, cristalinos e que se fundem a alta temperatura PF e PE altos (caractersticas dos sais) Incolores sabor adocicado, alguns inspidos, outros amargos; Com exceo da glicina, que solvel em gua, os demais apresentam solubilidade varivel e insolveis em solventes orgnicos; Em solues aquosas caracterstica cida (carboxila) e bsica (amino); Interao intramolecular "sal interno":

Caractersticas fisico-qumicas dos AA

Carter anftero - reagem tanto em cidos quanto em bases, produzindo sais :

Caractersticas fisico-qumicas dos AA

ON DIPOLAR Tambm chamado de zwitterion

O aminocido pode agir como cido (doador de prtons) O aminocido pode agir como base (receptor de prtons)

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Caractersticas fisico-qumicas dos AA

ON DIPOLAR
Doador de H+

Aceptor de H+ Substncia anfotrica,ou anflito, ou anfiprtico, ou anftero

IONIZAO DE AA
pH cido pH Neutro pH Bsico

[H+]

[OH-]

Titulao de um Aminocido
De forma geral, ao fazer a titulao de um AA com uma base, iniciando-se em pH=1 observa-se que o pH da soluo aumenta at aproximadamente pH=2 quando o grupamento COOH comea a liberar ons H+ para o meio, formando gua.

COOH COOH H- C - NH3+ + OHR

pK1

COOH- C - NH3+ R
on dipolar

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Titulao de um Aminocido
Continuando a adio de base o pH ir progressivamente se elevando at que o grupo NH3+ tenha condies de liberar seu on H+, o que ocorre prximo ao pH 9 .

on dipolar

H2O COOH-C-NH3+ + OHR pK2

COOH-C-NH2 R

Titulao de um Aminocido
COOH COOCOOH H- C - NH3+ H-C-NH3+ pK1 CH3 CH3
Regio de tamponamento devida ao grupo -COOH

pK2

COOH-C-NH2 CH3

Regio de tamponamento devida ao grupo -NH2

+H N 3

COOH COOCOO+ H N - C- H C -H H2N- C- H 3 pK2 R pK1 R R A+ Forma AIsoeltrica

pKa dos AA

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Aminocido Glicina Alanina Valina Leucina Isoleucina Prolina Fenilalanina Tirosina Triptofano Serina Treonina Cistena Metionina Asparagina Glutamina Aspartato Glutamato Lisina Arginina Histidina

pK1 (COOH) 2,34 2,34 2,32 2,36 2,36 1,99 1,83 2,20 2,38 2,21 2,11 1,96 2,28 2,02 2,17 1,88 2,19 2,18 2,17 1,82

pK2 (NH3+) 9,60 9,69 9,62 9,60 9,68 10,96 9,13 9,11 9,39 9,15 9,62 8,18 9,21 8,80 9,13 9,60 9,67 8,95 9,04 9,17

pKr (grupo R)

pI 5,97 6,01 5,97 5,98 6,02 6,48 5,48

Ocorrncia nas protenas (%) 7,5 9,0 6,9 7,5 4,6 4,6 3,5 3,5 1,1 7,1 6,0 2,8 1,7 4,4 3,9 5,5 6,2 7,0 4,7 2,1

10,07 13,60 13,60 10,28

5,66 5,89 5,68 5,87 5,07 5,74 5,41 5,65

3,65 4,25 10,53 12,48 6,00

2,77 3,22 9,74 10,76 7,59

Ponto Isoeltrico
o pH especfico, onde os aminocidos no tem carga efetiva e portanto, no se deslocam em um Campo Eltricop (igual cargas positivas e negativas) Encontra-se eletricamente neutro on dipolar ou zwitterion Clculo do PI baseia-se nas formas de dissociao do aminocido utilizando a mdia dos pK dos grupos dissociveis
(se forem somente dois grupos no haver ambigidade).

Curva de titulao da glicina

1+ 0 1Dois patamares de tamponamento, um para cada grupamento ativo do ponto de vista cido-base: uma amina e uma carboxila. Em pH extremamente baixo temos a predominncia da forma totalmente protonada Em pH 2.34 ( pH =pKa temos a carboxila semititulada e quantidades equimolares das espcies negativa e neutra. Em pH 5,97 a carboxila est totalmente titulada, a espcie zwiterinica a predominante Informaes obtidas com a curva de titulao: Dois patamares de tamponamento Valores de pK1 e pK2 Espcies envolvidas e suas cargas eltricas

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Curva de titulao do glutamato

1+ 0 12-

Quantos patamares? Quais os valores de pKs?

R: trs

Quais as espcies (os estados de protonao do glutamato) envolvidas? Quais as cargas lquidas de cada espcie?

Curva de titulao da histidina

Curva de titulao do aminocido histidina

pI

pI = pK2 + pKR = 7,59 2

Cdigo deCdigo molecular trs letrasuma letra

Propriedades qumicas e convenes pK da relacionadas aos aminocidos Peso pK do cadeia carboxilato

pK da lateral amina

!!!?? !!!??

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O que Ponto isoeltrico?

Propriedades qumicas e convenes pI ndice de relacionadas aos aminocidos (cont.) Ponto hidrofobi
Ponto isoeltrico o valor de pH no qual a soma total das cargas de uma molcula (carga lquida) igual pI > 7 a zero bsicos

isoeltrico Frequencia (%) cidade

O que ndice de pI < 7 hidrofobicidade? simplesmente uma cidos estatstica que mostra o uma escala terica que procura estimar se das cadeias percentual com que laterais dos aminocios vo procurar ambientes aquosos cada aminocido (como o citoplasma) ou lipdicos (como as membranas aparece num universo celulares). Valores negativos indicam hidrofilicidade, de 1500 protenas enquanto valores positivos indicam hidrofobiciadade. seqenciadas Pode ser usado para estimar como uma protena de membrana se insere na bicamada lipdica

Ligaes Peptdicas
Ligao de um cido carboxlico de um aminocido com o radical amina do outro aminocido Forma dipeptdios, tripeptdios, polipeptdios, e quando o peso molecular atinge 10.000 passam a se chamar protenas

Ligao peptdica

Reao de condensao

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Classificao dos Peptdeos

So classificados de acordo com o nmero de resduos de AA na cadeia: Dipeptdeos 2 resduos de AA. Tripeptdeos 3 resduos de AA. Tetrapeptdeos 4 resduos de AA. Pentapeptdeos 5 resduos de AA. Oligopeptdeos uns poucos resduos de AA. Polipeptdeos - so polmeros lineares de at 40 resduos de AA. Protenas - mais de 40 resduos de AA.

Peptdeos de importncia biolgica

Os menores peptdeos podem ter efeitos biolgicos importantes. Ex: Aspartame - L-aspartil-L-fenilalanil metil ster, adoante artificial. Hormnios so peptdeos pequenos: Ocitocina (estimula contrao uterina), Bradicinina (inibe inflamao dos tecidos), Tirotropina (hormnio da hipfise). Insulina e Glucagon (hormnios pancreticos). Corticotropina (estimula crtex adrenal).

Peptdeos
Em condies bioqumicas padro o equilbrio favorece a formao de aminocidos em vez de dipeptdeos. Para deslocar a reao no sentido de polimerizao necessrio ativar o cido carboxlico. Mais aminocidos podem ser adicionados de forma parecida formando tri-, tetra-, pentapeptdeos e assim por diante... As protenas so polmeros lineares de centenas a milhares de aminocidos

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Exemplo de peptdios
Cadeias laterais Seril-glicil-tyrosil-alanil-leucina SerGlyTyrAlaLeu Amino Ligaes peptdicas terminal Carboxi terminal

A nomenclatura comea pela ponta amino-terminal (escrita esquerda) Embora a hidrlise das ligaes peptdicas seja uma reao exergnica (favorvel termodinamicamente) ela ocorre lentamente devido sua alta energia de ativao. Isso quer dizer que as ligaes peptdicas so bem estveis, apresentam uma meia-vida de sete anos na maioria das condies fisiolgicas.

Sentido de crescimento da cadeia polipeptidica

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Composio de aminocidos de duas protenas

Nveis na estrutura de protenas

Estrutura primria seqncia de aminocidos unidos por ligaes peptdicas e inclui todas as pontes dissulfeto. Estrutura secndria padres em hlice, folhas, e alas freqentemente assumidos Estrutura terciria como os blocos (domnios) de estrutura secundria se agrupam para formar monomros Estrutura quaternria como os monomros se agrupam para formar oligomros

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