Anda di halaman 1dari 7

Base excision repair Basis tumpang tindih perbaikan eksisi dengan perbaikan langsung, dan merupakan multiple step

sistem yang melibatkan beberapa peserta. Ini target Adduct dasar "nonbulky", seperti yang dihasilkan oleh metilasi, oksidasi, reduksi, atau fragmentasi dari basa oleh radiasi pengion atau kerusakan oksidatif. Pelepasan bebas dari dikatalisis basa DNA oleh DNA glycosylases adalah fitur utama perbaikan eksisi basa. Setelah penghapusan yang dimodifikasi, rusak, atau terfragmentasi dasar oleh DNA glycosylase, sepasang menoreh APE yang 3 '(AP liase) dan 5' (AP hidrolase) ke situs apurinic. DNA polimerase mengisi dimulai pada kesenjangan 3'OH terbuka, dan DNA ligase segel nickname.

Ada lima baik ditandai glycosylases DNA manusia dengan substrat yang berbeda tapi kadang-kadang tumpang tindih spesifisitas (lihat Tabel II). Semua glycosylases relatif kecil, monomer protein yang tidak memerlukan kofaktor baik untuk pengakuan lesi DNA atau mereka enzim kegiatan. Karena sifat ukuran dan kimia dasar kerusakan beragam, adalah wajar untuk menganggap bahwa mungkin ada DNA tambahan akan glycosylases belum diidentifikasi.
ekspresi dari beberapa glycosylases adalah sel siklus-tergantung atau perkembangan diatur [Dehazya dan Sirover, 1986; Dingin dan Sirover, 1990; Meyer-Siegler et al, 1992;. Mansur et al, 1993.]. Ada sedikit bukti yang menunjukkan bahwa mereka adalah disebabkan oleh penghinaan genotoksik yang relevan. Oleh karena itu, mungkin bahwa glycosylases tersedia dalam inti sebelum kerusakan DNA terjadi, dan bertindak dengan cara pencegahan. Hal ini juga menunjukkan bahwa mungkin glycosylases inisiasi faktor-faktor di jalur BER. Pengetahuan tentang transkripsi mengatur faktor gen ini masih kurang. Ada sedikit informasi pada hubungan antara DNA glycosylase kekurangan dan penyakit manusia. awal informasi tentang enzim manusia diperoleh dari perbandingan klon cDNA yang homolog manusia terhadap dikenal enzim bakteri atau ragi, bukan dari manusia memperbaiki kekurangan sindrom. Telah diusulkan bahwa genom manusia menopang ribuan "hits" per hari, perbaikan yang melibatkan glycosylases DNA. Kegagalan BER jalur secara dramatis meningkatkan mutasi pada E. coli [Duncan dan Weiss, 1982], ragi [Impellizzeri et al., 1991],

dan hewan pengerat [Klungland et al., 1995]. Hal ini wajar untuk berhipotesis bahwa DNA kekurangan glycosylase mungkin predisposisi faktor untuk penyakit manusia, termasuk kanker. mutasi penyaringan gen pada pasien sehat dan kanker populasi adalah pendekatan logis untuk menguji hipotesis ini Para apurinic / apyrimidinic situs yang dihasilkan dari DNA glycosylase kegiatan adalah lesi DNA noninformative mirip dengan AP situs yang dibentuk oleh depurination spontan atau depyrimidination DNA. Lesi ini biasanya dihapus oleh dua kelas endonuklease. Kelas I enzim membelah ikatan 3 'pada gula abasic sementara kelas II enzim membelah 5 'obligasi. Semua kelas tahu aku enzim glycosylase / AP lyases, seperti 8-oxoguanine DNA glycosylase dan thymine glikol DNA glycosylase. Pada manusia, hanya satu kelas II AP endonuklease, sebuah homolog struktural dan fungsional dari E. coli exonuclease III, telah diteliti dengan baik [Demple dan Harrison, 1994]. Manusia APE memiliki sebuah novel N-terminus yang dapat dan dengan demikian mengurangi mengaktifkan faktor transkripsi Fos dan Jun [Walker et al, 1993;. Xanthoudakis et al, 1994.], Meningkatkan aktivitas pengikatan dimer DNA. Namun, saat ini pengetahuan tentang enzim ini masih terbatas pada biokimia studi. Mutasi APE manusia telah diidentifikasi dalam pasien yang menderita amyotrophic lateral sclerosis, tetapi hubungan kausal, jika ada, antara mutasi dan Penyakit tidak jelas [Olkowski, 1998].

Basis eksisi menghasilkan kesenjangan 3-4 urutan nukleotida atau "Patch." Kerusakan-inducible DNA polimerase (Pol ) secara optimal cocok untuk mengisi sedemikian "sangat singkat" patch [Randahl et al, 1988.]. Seperti banyak enzim perbaikan DNA lainnya, Pol adalah multifungsi. Hal ini juga terlibat di dalam sel siklus penangkapan [Shadan dan Villarreal, 1996] dan diferensiasi sel [Shadan dan Villarreal, 1996]. Tumor mempromosikan efek dari mutasi pol [Dobashi et al, 1994, 1995.; Matsuzaki et al, 1996.] Mungkin mencerminkan keterlibatan dalam lainnya

TABEL II. Enzim Perbaikan eksisi Basis Manusia enzim Ukuran & gen lokasi E. coli

homolog S. cere. homolog Rodent Fungsi homolog Associated Referensi penyakit hOgg1 (8-oxoguanine DNA glycosylase) 39KDa 3p25/26 FPG (fungsional analog) MutY yOgg1 mOgg1 Cukai 8-oxoguanine dari DNA, beta-liase kegiatan yang nick 39 lesi. Lebih aktif pada 8-oxodG dipasangkan dengan dC dT atau dibandingkan dengan dG, dan tidak aktif terhadap 8-oxodG dipasangkan dengan dA Kanker paru-paru, hilangnya satu alel mengarah ke mengurangi BER. [1] Timin glikol DNA glycosylase 60kDa 16p13.2-.3 Endonuklease III Timin redoxyendonuclease glikol DNA glycosylase UV endonuklease I dan II Siaran timin glikol dari DNA yang rusak melalui N-glycosylase aktivitas dan dikaitkan dengan endonuklease kegiatan yang menengahi fosfodiester obligasi pembelahan di situs timin glikol dan apurinic situs [2] Urasil DNA glycosylase 33.8-25.8kDa 12q23-q24.1 Urasil DNA glycosylase Urasil DNA glycosylase Urasil DNA glycosylase Mengikat urasil membalik keluar dari dupleks DNA, rilis bebas urasil dari DNA dan eksisi inisiat dasar

perbaikan; Bentuk UDG / GAPDH (gliseraldehida-3fosfat dehidrogenase), yang mengikat tetraphosphate diadenosine (Ap4A) dan mengatur sel pertumbuhan Bloom sindrom [3] Hydroxymethyluracil DNA glycosylase Tidak Hydroxymethyluracil Tidak ada DNA glycosylase Menghilangkan hydroxymethyluracil, sebuah thyminederived utama Lesi DNA yang dihasilkan oleh radiasi pengion dan oksidatif kerusakan Aktivitas berkurang Werner sindrom [4] MPG (Nmethylpurine DNA glycosylase) 33kDa 16p13.3 Tagi dan TagII (Fungsional analog) MPG MPG beberapa Menghapus N-alkylpurine adduct, hipoksantin, siklik ethenoadducts dari adenin, guanin dan sitosin dan 8-oxoguanine dari DNA [5] APE (apurinic endonuklease, HAP1, APEX, REF1) 36kDa 14q11.2-14q12 ExoA (S.pneu.) exonuclease III (E. coli) Perbaikan kerusakan alkilasi APE, membuat tunggal-untai istirahat di apurinic situs dalam DNA Amyotrophic lateral sclerosis? [6] XRCC1 (X-ray perbaikan salib melengkapi,

kelompok 1) 70kDa 19q13.2 XRCC1 Single-untai memecah protein yang mengikat, berinteraksi dengan DNA ligase III [7] Pol b (DNA poloymerase b) 39kDa 8p11-12 PolB kesenjangan DNA-enzim mengisi [8] DNA ligase Saya 102kDa 19q13.3 DNA ligase DNA ligase CDC9 Saya Berpartisipasi dalam perbaikan eksisi basa DNA dan DNA replikasi T-sel leukemia akut, Bloom syndrome, Anemia Fanconi [9] DNA ligase II Berasal dari DNA ligase III oleh proteolitik yang mekanisme DNA ligase III a / b 103kDa (a) 96kDa (b) 17q11-12 DNA ligase III bentuk-bentuk kompleks dengan istirahat tunggal untai DNA perbaikan protein XRCC1 b tidak berinteraksi dengan XRCC1, hanya dinyatakan dalam laki-laki kuman sel meiosis, menunjukkan peran untuk ini isoform dalam rekombinasi meiosis DNA ligase IV 96kDa 13q33-34 Tidak jelas. Protein dimurnikan bergabung tunggal-untai istirahat dalam polydeoxynucleotide ganda terdampar di reaksi ATP-dependent 1] Bessho dkk, 1993;. Tchou et al, 1993;. Demple dan Harrison, 1994; Laval, 1994; Nash et al, 1997;. Radicella et al, 1997;. Roldan-Arjona et al, 1997;. Rosenquist et al., 1997. [2] Lee et al, 1987;. Kim dan Linn, 1989; Demple dan Harrison, 1994; Hilbert et al, 1997.. [3] Stich, 1975; Duncan dan Weiss, 1982; Vollberg et al, 1987;. Dinginkan dan Sirover, 1990; Impellizzeri et al, 1991;. Meyer-Siegler et al, 1991, 1992;. Mansur et al, 1993. ; Mitra dan Kaina, 1993; Muller dan Caradonna, 1993. [4] Boorstein et al, 1989;. Ganguly dan Duker, 1992; Engelward et al, 1996, 1997.. [5] Dehazya dan Sirover, 1986; Cool dan Sirover, 1990; Bessho et al, 1993;. Mitra dan Kaina,

1993; Dosanjh et al, 1994;. Saparbaev dan Laval, 1994; Klungland et al, 1995;. Engelward et al, 1996, 1997.; Penyanyi dan Hang, 1997. [6] Walker et al, 1993;. Demple dan Harrison, 1994; Xanthoudakis et al, 1994;. Grombacher et al, 1996;. Olkowski, 1998. [7] Cappelli dkk, 1997.. [8] Randahl et al, 1988;. Englander dan Wilson, 1992; Dobashi et al, 1994, 1995;. Gu et al, 1994;. Grombacher et al, 1996;. Matsuzaki et al, 1996;. Narayan dkk. , 1996; Shadan dan Villarreal, 1996; Tomkinson dan Mackey, 1998. [9] Schwaiger dkk, 1982;. Chan et al, 1987;. Rusquet et al, 1988;. Mezzina et al, 1989;. Vilpo dan Vilpo, 1989; Barnes et al, 1990;.. Lasko et al, 1990 ; Tomkinson et al, 1991;. Wajib, 1994; Wang et al,. 1994; Wei et al, 1995;. Bentley et al, 1996;. Cappelli et al, 1997;. Critchlow et al, 1997;. Teo dan Jackson, 1997; Tomkinson dan Mackey, 1998.
selular proses (misalnya, diferensiasi sel) di samping Perbaikan DNA [Shadan dan Villarreal, 1996]. Alkylating agen, seperti MNNG, menginduksi ekspresi pol. Upregulation ini memerlukan fosforilasi dari cAMP respon elemen (CRE) di promotor pol [Englander dan Wilson, 1992; Narayan et al, 1996].. Hal ini tidak jelas apakah itu adalah agen alkilasi itu sendiri atau peristiwa lain dalam jalur perbaikan yang memicu fosforilasi CRE oleh protein kinase dan, karenanya, meningkatkan transkripsi pol . Kami menduga bahwa cacat dari komponen intermediate antara kerusakan alkilasi dan induksi pol harus memiliki dampak yang sama pada sel-sel dalam hal kepekaan terhadap alkilasi kerusakan dan kerentanan kanker. investigasi dalam jalur yang diatur akan sangat informatif. Langkah terakhir dari BER, menyegel oleh DNA ligase nick, adalah umum untuk kedua dasar dan perbaikan eksisi nukleotida (APM). Sel mamalia mengandung beberapa ligases DNA (DNA ligase I, II, III, dan IV). Kecuali untuk DNA ligase II, yang berasal dari DNA ligase III dengan mekanisme proteolitik, yang ligases dikodekan oleh gen yang berbeda [Tomkinson dan Mackey, 1998]. Mereka menampilkan urutan dilestarikan di situs aktif, yang memiliki residu lisin yang luar biasa reaktif penting untuk fungsi enzim, menunjukkan evolusi yang umum asal [Tomkinson et al, 1991;. Wang et al, 1994.]. Namun, mereka memiliki spesifisitas substrat yang berbeda dan fungsi dalam keadaan yang berbeda (Tabel II). DNA ligase III dan IV yang terlibat dalam perbaikan DNA untai istirahat oleh bergaul dengan XRCC1 dan XRCC4, masing-masing. yang sangat langka genetik penyakit yang ditemukan pada pasien tunggal

yang disajikan dengan gejala hypogemmaglobulinaemia memberikan bukti langsung untuk hubungan antara poli (ADP-ribosa) polimerase dan DNA ligase saya [Wajib, 1994] dan mengungkapkan keterlibatan enzim ini di eksisi DNA perbaikan.

DNA ligase kelainan telah dikaitkan dengan luas berbagai gangguan manusia. Sebagai contoh, akut lymphoblastic leukemia (ALL) sel menunjukkan yang luar biasa pengurangan aktivitas DNA ligase [Rusquet et al, 1988.], yang berkorelasi dengan kehadiran istirahat DNA dalam leukemia sel. Pada anemia Fanconi (FA), DNA ligase adalah juga kekurangan [Schwaiger et al, 1982.]. Sel baris dari Pasien sindrom Bloom dilaporkan telah mengurangi DNA ligase Aku aktivitas [Chan et al., 1987] dan / atau urasil-DNA glycosylase aktivitas, tetapi eksperimen lainnya telah menghasilkan hasil yang bertentangan [Mezzina et al, 1989;. Vilpo dan Vilpo, 1989; Lasko et al, 1990].. Mutasi pada gen DNA ligase tidak konsisten terdeteksi dalam penyakit ini, menunjukkan mungkin peran regulasi epigenetik kegiatan ligase. Ada indikasi bahwa beberapa glycosylases tumpang tindih kekhususan tidak penting untuk perkembangan normal [Engelward et al, 1996., 1997]. Sebaliknya, cacat pada komponen langkah-langkah terakhir dari BER, seperti Pol [Gu et al., 1994] dan ligase [Bentley et al., 1996], tidak kompatibel dengan perkembangan yang normal pada tikus.
Hewan model BERexploiting KO lengkap gen yang terakhir adalah tidak mungkin layak, tapi spesifik jaringan KO menggunakan rekombinase sistem [Gu et al, 1994;. Agah et al, 1997.], kemungkinan akan informatif.