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1. NO TODOS LOS SISTEMAS ESTN NECESARIAMENTE REGULADOS Todo el control bsicamente en bacteria es una regulacin muy estricta que tiene que haber en los sistemas enzimticos, y esto principalmente porque las clulas bacterianas tienen que responder rpidamente a los cambios del medio; y por lo tanto, si cambia un metabolito, el sistema tiene que estar constantemente regulado, y por eso, existe la estructura del opern. De todas maneras, la actividad de las enzimas puede ser regulada por feedback, pero eso es otra cosa. Los genes a travs de la transcripcin, que es lo que estamos viendo, o bien la traduccin, asumen la regulacin especfica para las enzimas que son ms relevantes, sin embargo, hay un entre un 60 y un 80 % de genes que no estn regulados, eso es muy importante porque los genes no estn regulados en el sentido estricto, ya que hay una regulacin dependiendo de la calidad del promotor. Si yo necesito de una protena siempre, como por ejemplo las protenas (algo), que son protenas de mantencin, esas protenas pueden estar bajo un promotor dbil, y su expresin va a ser baja, pero siempre van a estar presentes; pero cuando falla la regulacin, la sntesis constitutiva demuestra que la sntesis es mxima para un sistema que no debera expresarse. Enzimas de las clulas que necesitan estar constantemente siendo expresadas, como por ejemplo las de la gliclisis, no se pueden dar el lujo de tener una regulacin, ya que sta ltima implica la mnima transcripcin o transcripcin cero, y si en un momento cualquiera se necesitan, habra que activar el sistema, por lo tanto, no tienen regulacin. Pero otros genes por ejemplo, involucrados en metabolismo de la lactosa, son regulados como les dije, cundo una bacteria se va a encontrar con lactosa como nica fuente de carbono?, esto a menos que yo, la tenga en el laboratorio en tales condiciones. 2. LA REGULACIN ES SOBRE LA TRANSCRIPCIN, POR LO TANTO, LA TRANSCRIPCIN ES LO QUE DEFINE LA VIDA Si se tiene un sistema que expresa RNA, quiere decir que est vivo, esa es la nueva concepcin. Por ejemplo, si se tiene una espora, y sta no tiene ninguna seal de vida, pero si se le hace una extraccin de RNA, se encontrar que est llena de ste, ya que funciona con una especificidad altsima. 3. DOS CONTROLES GENTICOS MEDIANTE LOS CUALES SE REGULA LA TRANSCRIPCIN, Y POR LO TANTO, LA SNTESIS: LA INDUCCIN Y LA REPRESIN La induccin, en donde se abren genes que estn cerrados, y la represin, en donde se cierran genes que estn abiertos Concepto de Temporalidad. Cmo funciona la represin? Se inhibe la expresin gnica, a menudo en respuesta a un exceso de un producto terminal, por lo tanto, estamos hablando que est directamente relacionada con lo que es anabolismo y cierra la sntesis de la/las enzima/s. Esto se regula por protenas llamadas represoras, las que impiden que la

RNA polimerasa inicie la transcripcin, por lo tanto, la calidad de los promotores es muy importante en un opern. Los genes represibles son transcritos hasta que stos son reprimidos, por eso esto de que se abre y se cierra tiene que entenderse desde el concepto de la temporalidad (porque en un momento, se tiene un sistema abierto que no se sabe si est siendo inducido, o si hay una falta de represin, o si es sntesis constitutiva).

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Los genes de un opern permiten diferentes alternativas de regulacin, y no siempre tiene que estar el promotor, y el operador, todo en la misma hebra. Cmo funciona la induccin? Activa genes que estn cerrados, y por lo tanto, se necesita de un inductor; nuevamente podemos ver como un determinado juega un rol en el que abre o cierra un sistema gentico. La sntesis de aquellas enzimas que se inducen se conocen como enzimas inducibles. Pero, insisto, si uno se va a la gliclisis, no hay una regulacin estricta, por lo tanto, los sistemas podramos decir que estn con una regulacin positiva, pero no responden a ningn metabolito para subir el nivel de induccin o cerrarlo. La positividad siempre indica que hay transcripcin. 4. OPERN: PROMOTOR, OPERADOR, GENES ESTRUCTURALES Y ALGUIEN QUE LOS REGULE Por lo tanto, mltiples genes estn puestos en la misma orientacin y estn generando un sistema continuo de DNA. Los genes en un opern son transcritos en un solo transcripto, por eso la transcripcin policistrnica es lo que caracteriza al concepto de opern, existen operones en un sistema eucarionte? En principio, no. Por qu? Porque en eucarionte la transcripcin es monocistrnica, por lo tanto, la regulacin tiene que estar asociada a cada gen, y no a grupos de genes. El trmino opern no slo incluye los genes, sino tambin los sitios, se tiene un sitio promotor que es el ms importante, por lo tanto, si ustedes quieren genticamente un orden de jerarqua, sin promotor no hay regulacin. Despus viene en importancia, el sitio operador, y los sitios son cis-dominantes. El 27% de los genes de EColi estn en operones, por eso es bueno entender que NO todo el sistema se regula por opern. * Cualquiera de los operones que tienen que ver con la sntesis de Aa funcionan de la misma forma. 5. OPERN LAC Se tiene dentro de los genes estructurales la beta-galactosidasa, la permeasa que es la que permite introducir la lactosa a la clula siempre y cuando sea activada por un grupo acetilo, que lo hace la galactosido-transacetilasa (representada por el gen a); y el gen i, que es un represor, y es el que permite que se regule el sistema. 6. LA AUTORREGULACIN DE LOS GENES REGULADORES ES MUY IMPORTANTE

Porque si yo estoy diciendo que el 27% de los genes de EColi estn organizados en operones, eso significa que cada opern, tiene a su vez, a lo menos, un gen regulador, y ste ltimo tiene normalmente, o un mensaje monocistrnico, o es parte de uno policistrnico, por eso la regulacin puede incidir en cul es la disponibilidad del producto de un gen regulador, dependiendo si hay efecto polar o no, y si esto est regulado. Los sistemas ms simples son los que yo les estoy poniendo como ejemplo, pero tambin existen sistemas que son mucho ms complejos y dependen de la disponibilidad de los productos, la calidad de los promotores, y tambin de la competencia que existe sobre un sistema.

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*Ejemplo de un opern que no les voy a exigir que sepan: Lamda lamda es un fago, que destruye una bacteria si entra en la fase ltica, pero tambin puede ir a la fase lisognica, entonces, qu sucede en la fase lisognica? el fago tiene que incorporarse y mantenerse reprimido, pero cuando hay condiciones adecuadas, el sistema se expresa y entra a la lisis, por lo tanto, secuencialmente va expresando genes, primero los genes que le permiten salir, luego los genes que le permiten replicar, luego todos los genes que le permiten generar todas las protenas que necesita para generar ms partculas virales, y finalmente los del ensamblaje, para terminar con la lisis. Todo va por etapas, por lo tanto, hay una regulacin muy estricta, qu tipo de regulacin hay? Negativa, hasta que se active el sistema en donde empiezan a haber, en un momento dado, sistemas positivos y negativos. Lamda tiene 50000 nucletidos, y tiene una regin inicial de regulacin, y sta tiene dos genes que son los responsables cuando el sistema entra, de regular o la lisis o la lisogenia, porque el virus entra y tiene que tomar una decisin, en base a como considera que est el ambiente (si est espectacularlisis, si est ms o menoslisogenia), y eso entonces, tiene dos genes que estn en hebras contrarias, uno es el gen CI (represor, responsable de la lisogenia), y el otro es el gen CRO (responsable de la lisis). Lo importante es que la estructura que presentan, ya que tienen una regin en comn en la que hay tres operadores llamados: OR1, OR2, OR3. La organizacin permite que el sistema sea eficiente, por qu? Porque ambas protenas estn presentes, y compiten por estos sitios, pero CRO tiene mayor afinidad por OR3, y CI tiene mayor afinidad por OR1, entonces cuando gana uno, ste bloquea la expresin del otro y viceversa. Normalmente qu es lo que hay, ms lisis o ms lisogenia? Lisis, por lo tanto, el promotor de CRO es ms fuerte que el promotor de CI. Cuando hay CRO, ste se une a OR3, bloquea la expresin de CI y por lo tanto, activa una serie de circuitos para permitir que secuencialmente se d la lisis. Pero qu sucede cuando hay una condicin metablica desfavorable? CI es capaz de ganarle a CRO y unirse al sitio OR1 (ya que la organizacin del tetrmero CI es mucho ms eficiente que la de CRO), y CRO deja de sintetizarse, y por lo tanto, CI acta como represor, se une a ese sitio, bloqueando toda la zona, y limitando la posibilidad de la lisis. CI es

termosensible, entonces cuando la condicin metablica mejora, sube la t, al suceder esto, se degrada CI, ganando CRO y el sistema entra en lisis. Aqu se tiene una regulacin simple, en la que por competencia, calidad de promotores y por condiciones de cada una de las protenas, pueda organizarse un sistema que permite tener dos fenotipos alternativos: la lisis y la lisogenia. *Regulacin complejaorganizando estructuralmente los genes y sus sitios de una manera alternativa. *Simpleza del sistema en una misma hebra est todo, el gen regulador (gen i), el sitio promotor, despus el sitio operador Ejemplo: opern LAC

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Otro ejemplo: La regulacin de la polimerasa III de eucarionte, que normalmente regula los RNA pequeos, resulta ser, que la regulacin est en la mitad de los genes, porque se une en este sector un represor, e impide que se expresen los genes, entonces, es otra modalidad de organizar el sistema. En este caso la regin operadora es parte de los genes, entonces la capacidad de codificacin va a estar definida en cmo lo interpretemos nosotros. *Simpleza cada gen tiene su espacio en la misma hebra. *Opern complejo en un m.o. tiene todos los elementos que constituyen un opern, es decir, genes y sitios; ahora, la forma de cmo estn organizados, va a depender de cmo va a ser la regulacin, en base a los requerimientos que tienen los genes estructurales que estn involucrados. 7. EFECTO GLUCOSA Si yo tengo el opern lactosa como modelo, al igual que una serie de otros operones que estn sujetos a lo que es la represin por catabolito. Le pongo glucosa a una bacteria, y sta empieza a usar la glucosa porque lo ms simple que hay, sta entra rpidamente, una vez que es fosforilada, y comienza la degradacin. Muchos operones responden al efecto glucosa y a qu se debe esto? En el sitio promotor, en el que hay un -10, un -35; pero tambin los operones que son sensibles al efecto glucosa, en el -80 tienen la capacidad de responder a un efecto regulatorio del promotor, hacindolo ms, menos fuerte. Entonces no es que la regulacin sea la primaria, sino que en un momento determinado el sistema que se regula por inducibilidad en este caso, que tiene un promotor fuerte, ese promotor fuerte en un momento dado, puede ser modulado. Cmo? porque resulta que en el -80 existe una protena CRP, o tambin conocida como CAP; esta protena depende del AMP cclico, y cuando ste est presente, forman un complejo, y como complejo es capaz de actuar positivamente sobre el -80, elevando el nivel de expresin de este promotor.

Cmo se regula el opern LAC? ste es inducible negativo, en la expresin de sus genes, pero modulado positivamente en su promotor. Por qu? Porque cuando est el complejo CRP-AMP cclico, es capaz de elevar la expresin, pero qu sucede cuando hay activacin del opern LAC? Cuando hay activacin del opern LAC, se produce glucosa+ galactosa, por lo tanto, la glucosa inhibe la formacin del AMP cclico, ya que inhibe a la adenilato ciclasa. Al inhibir la adenilato ciclasa, baja el nivel de AMP cclico, al bajar este nivel, no hay disponibilidad de AMPc para formar complejo con CRP, y el promotor vuelve a su nivel normal. Entonces, se fijan, que en un mismo sistema tan simple, regula la calidad de sus transcriptos, porque siempre tiende a hacerlo lo ms estrictamente necesario posible, sin que haya gasto; y cada sistema puede tener sobre l, una regulacin ms.. El opern ms simple que se conoce tiene una regulacin adicional. Cuando la lactosa est presente, y la glucosa tambin lo est, el opern lactosa va atener una transcripcin menor. 8. OPERN ARGININA Es un opern reversible, que tiene tres genes estructurales c, b y h, que codifican enzimas en el patrn biosinttico que lleva a la generacin de arginina. (ver alguna de las presentaciones).

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*Comparativamente los 5000 genes que haba en bacteria, haca pensar, con la soberbia humana, de que nosotros tenamos que tener por lo menos 100 veces ms, alrededor de 500000 genes, ahora estamos igual que las moscas con 32000 genes Concepto: uno no necesita tener en un sistema biolgico, muchos genes para ser ms eficiente, porque la organizacin de stos, puede hacer que prime la calidad versus cantidad, y esto se demuestra. Muchas protenas que son estrictamente necesarias en el sistema, y que tienen que tener una regulacin muy estricta, esa regulacin no necesariamente, est dada por su sntesis. La regulacin en bacteria es muy importante, porque uno puede demostrar como controlar las condiciones de crecimiento en un determinado momento, ya que las condiciones de crecimiento en una bacteria estn dadas por lo que uno le ponga, y hay que pensar que hoy en da el concepto es: viable no cultivable esto significa que millones de millones de m.o que todava no podemos hacer crecer, pero sabemos que transcriben, por lo tanto, estn vivos. Viables, no cultivables, hasta que encontremos las condiciones para cultivar, y eso significa que los viables cultivables no son ms all del 1% de todos los m.o que existen. El que no crezcan, a lo mejor quiere decir, que tienen un sistema de regulacin alternativo por qu? porque la idea es que las bacterias no crezcan; si uno a una bacteria no le pone las condiciones adecuadas, no crecen.

Los factores de elongacin en la biosntesis proteica, son las protenas ms abundantes de todos los sistemas, pero de qu dependen que existan estas protenas? de una regulacin estricta de la transcripcin, para que den los mensajes. Asociacin de los conceptos de regulacin gnica y regulacin metablica, esta relacin depende de por lo menos 7 procesos. La sntesis del transcripto primario, y eso es de lo que habla la regulacin gnica, ahora si ste es activo, inactivo, si est maduro o no, ese es otro cuento. La sntesis es la que se regula genticamente. Porque en el procesamiento hay degradacin, por lo que la vida media de los mensajes y la vida media de las protenas, es la que define en un momento dado, quin gana. Ejemplo de la lisis lisogenia, se dijo que lo que prevalece es la lisis por qu? porque el sistema es ms eficiente, ya que CRO es ms eficiente que CI. Cmo se regulan muchos de los factores de elongacin? Por fosforilacin. 9. MODIFICACIN POST- TRADUCCIONAL Un ejemplo de esto es la ubiquitinacin, es un mecanismo de regulacin de las protenas, es una modificacin post- traduccional de las protenas. Si uno le pone ubiquitina a algunas protenas, las activa, y si se la pone a otras, las inactiva. Se dieron cuenta que las protenas, independiente de su vida media, tenan que ser degradadas, y hay todo un sistema que se conoce como el proteosoma, en donde las protenas son degrdadas. Cmo van esas protenas all? Cuando se le ponen ciertos residuos de ubiquitina. Una protena que est destinada a ir al sistema proteosomal, se sobreubiquitina, para la degradacin. La regulacin por ubiquitinacin puede tener diferentes modalidades, en diferentes tiempos, y dependiendo de las concentraciones, por lo tanto, el blanco de las protenas y su transporte es muy importante tambin.

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*La regulacin es nica y exclusivamente para dar el transcripto. La regulacin tiene un sentido funcional acorde al comportamiento que van a tener, al promedio de vida y al destino de cada una de estas protenas. *Genes de mantencin si tomo una EColi y una clula diferenciada humana, y hago un mapa bidimensional de sus protenas, voy a encontrar que hay muchas protenas que son comunes (ser un alto porcentaje), porque son lo que se llaman los house-keeping genes, es decir, las protenas de mantencin, que mantienen la casa funcionando por decirlo as. Y stas asociadas a las mayores vas metablica, son expresadas a un nivel constate, y por lo tanto, muchos de ellos tienen una expresin constitutiva, por que se requieren en grandes cantidades y siempre. (refuerzo de la idea de que no necesariamente todos los genes tienen que estar asociados a operones en bacterias, y en trminos genricos, hay una gran transversalidad respecto a la calidad de algunos genes que cumplen los mismos roles dentro de varios sistemas). *Quiero que recuerden de la regulacin positiva y de la regulacin negativa.

En la regulacin negativa, un sistema activo es inactivado por un metabolito. En la regulacin positiva, un metabolito, en un momento dado, favorece que exista transcripcin. 10. CMO UN SISTEMA QUE ES ESENCIALMENTE NEGATIVO, PUEDE PASAR A SER POSITIVO, O VICEVERSA? EJEMPLO DEL OPERN ARABINOSA El opern arabinosa es un sistema inducible pero positivo por qu? porque los genes estructurales que lo componen tienen que ver con un metabolismo que va ms all de la arabinosa, ya que participa en la va de las pentosas. Por lo tanto, cualquier intermediario en un catabolismo de una fuente de carbono, puede ser ocupado por estas enzimas, por lo que se requiere un nivel basal de expresin. Cuando no hay arabinosa como nica fuente de carbono, cmo funciona el sistema? funciona positivamente, es decir, la transcripcin es basal. Es suficiente para responder si yo le pongo arabinosa como nica fuente de C? No, porque la arabinosa acta como un inductor y eleva el nivel de la transcripcin al mximo. Pero, qu sucede cuando se genera mucha degradacin de arabinosa? Hay mucho subproducto que genera un aviso que dice que paren la degradacin, y el sistema se vuelve negativo. Cmo funciona esto? Opern Arabinosa Los tres genes estructurales constituyen lo conocido como BAD (lo malo), tiene tres genes el araB, araAy araD. La organizacin es ms compleja porque se tiene que los genes estructurales estn en una hebra que es la Watson, y el ara C que es el gen regulador est en la otra hebra, en la Crick. Por lo tanto, la presencia y sntesis de araC, es crucial para que exista regulacin, porque esto va a tener que hacer una accin trans sobre los sitios. El sistema es sensible a glucosa, por lo que tiene una regulacin adicional. Y adems tiene un promotor en cada hebra; y entonces la regulacin est dada por tres sitios, y esos tres sitios se llaman araO1, araO2 y ara i porque es el que induce la sntesis. Se tiene promotores y sitios operadores que diferencialmente van a ser reconocidos. Aqu la regulacin es ms estricta porque hay competencia por los sitios.

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El producto del gen regulador tiene una gran afinidad por araO1 pero no se puede unir, sin embargo, esa afinidad y esa incapacidad de unirse, al tratar una y otra vez de unirse, genera la activacin parcial del promotor BAD y hay sntesis basal, en ausencia de arabinosa. Cmo es el producto del gen regulador? El producto del gen regulador es parcialmente activo, porque es incapaz de dar una seal mxima de activacin o de represin. Entonces, la primera afinidad del producto del gen regulador es por araO1 para dar sntesis basal. Independiente que el producto del gen

regulador araC, no se una al sitio operador araO1, ste siempre va a estar protegiendo esa regin y tratando de unirse, lo genera la suficiente distorsin del sistema, como para que por reverberacin se active el promotor, y se d la transcripcin basal. Sin embargo existe un sitio operador llamado araO2, por el cual el producto del gen regulador tiene afinidad, pero tiene afinidad nica y exclusivamente, cuando araO1 est imposibilitado de ser reconocido por este producto del gen regulador araC. Cuando hay arabinosa, la arabinosa tiene una alta afinidad por el producto del gen regulador araC, y al formar un complejo activo con arabinosa, eso hace que se una a ara i, y al unirse a ara i incrementa significativamente, la transcripcin de los genes estructurales. Cmo es la regulacin en trminos simples? En ausencia de arabinosa, tiene que haber producto C, y ste es capaz de activar parcialmente a araO1, para que exista transcripcin basal de los genes estructurales. En presencia de arabinosa, se va a formar un complejo araC- arabinosa, ya que ahora va a desconocer a araO1, y va a ir hacia ara i, lo que va a generar una activacin mxima de este promotor y la transcripcin va a ser mxima. Mientras ms arabinosa entra, mayor produccin de araC hay, y mayor formacin de complejo, por lo tanto, mayor transcripcin de los genes estructurales (mayor activacin del sistema que est inducido totalmente). Pero, qu sucede cuando se acaba la arabinosa? (recuerden que araC es el gen regulador, y que C es el producto del gen regulador) Cuando se acaba la arabinosa, se tendr un alto nivel de araC (porque est inducido cada vez ms), se acab la arabinosa, y este producto C va a tratar de unirse a araO1; ya no va a estar disponible ara i, y eso hace que se tienda a unir a araO2. Al unirse a araO2 debido a que la concentracin del producto C es muy alta, y por lo tanto tiene disponibilidad para unirse al sitio araO2, se forma un complejo entre C-araO2, el cual se une al sitio araO1 (quedan unidos los dos sitios), formando un verdadero pinche, (todo esto por el exceso de araC), cerrando la capacidad de expresin de ambos, transformando al sistema en negativo (temporalmente).

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Pero cul es la gracia de todo esto? araC tiene una vida media corta, por lo tanto se empieza a degradar el exceso de araC, y se pierde la autorregulacin que tena al estar bloqueando el sitio, y el sistema vuelve a ser positivo (el sistema vuelve a abrirse, y cuando vuelve a abrirse vuelve ala regulacin normal).

Pero aqu tambin tenemos sobre ella, sobre estos mismos sitios, que permiten el abre y cierre, el complejo CAP-AMP cclico, que dependiendo de la concentracin de glucosa, dependiendo del metabolismo de carbono que est involucrado, va a permitir o no que exista una mayor o menor expresin del opern ARA. Complejidad del sistemaindica que pueden haber diferentes niveles de expresin diferencial de los sistemas. Sistema inducible Negativo LAC i + sistema activo i - sntesis constitutiva ara i *Esto se debe a la presencia de sitios alternativos. C - inactivo Terminologa: i producto del gen regulador i C producto del gen regulador araC * Parcialmente activo no genera la respuesta que uno esperara en un sistema inducible solo, pero de todas formas, esa parcialidad, depende de los sitios que estn involucrados. La presencia de sitios alternativos, ofrece ventajas para que tenga un comportamiento variable, dependiendo de las condiciones metablicas del sistema. 11. MUTANTES DEL PRODUCTO DEL GEN REGULADOR Qu pasa cuando yo tengo una mutante en el producto del gen regulador del opern lactosa? Ocurre la sntesis constitutiva una mutante en el producto del gen regulador tiene una expresin que va a tender a desregular el sistema, porque l normalmente tiene que ser activo (este trmino hace referencia a que es un sistema activo, en el sentido de que el producto del gen regulador est bloqueando el sitio operador). Cmo es una mutante C - ? Inactivo, el sistema sera ara menos, porque el producto C se necesita. En un sistema inducible negativo por ejemplo, la carencia del producto del gen regulador da sntesis constitutiva; y en el caso de un sistema inducible positivo la carencia del producto del gen regulador, hace que el sistema no funcione Por qu? porque este producto es necesario para activar araO1 para que d la sntesis basal, es necesario para que en presencia de arabinosa pueda formar el complejo y activar ara i, y es necesario porque solo en exceso pueda bloquear su propia sntesis, unindose a araO2, para luego como complejo unirse a araO1 y generar el pinche que bloquea el sistema, transformndolo temporalmente en un sistema negativo. Sistema inducible Positivo ARA Cparcialmente activo com araO1 C activo sobre araO2 Cinductor ms la arabinosa sobre

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*Muy importante entenderlo que significa un mecanismo positivo o negativo, dependiendo de la inducibilidad o represibilidad, y de los sitios disponibles para que pueda haber interaccin y regular diferencialmente el sistema. Si el sistema depende de la glucosa, en trminos genricos, como el elemento crucial en lo que significa catabolismo de carbono, que como adems tiene la regulacin por el -80 de cada uno de los promotores, el sistema va a estar entre que se abre y cierra todo el rato, salvo que, le pongamos arabinosa como nica fuente de carbono, situacin en la que se abrir absolutamente, para luego cerrarse y tener un tiempo de recuperacin para poder volver al sistema normal. Y esto a qu se debe? a la actividad diferencial que tiene el producto C sobre diferentes sitios y su vida media corta. Qu sucede si yo tengo una mutante en el procuro C que tiene una larga vida media? El sistema sera Ara menos, porque si tiene una vida media larga, y tengo mucha concentracin, en algn momento se va a unir donde tenga que hacerlo y bloquear su propia sntesis, por lo tanto, esto generar problemas. Repasemos: (en conclusin) La regulacin depende de los productos de los genes reguladores y de la calidad de los mismos, eso hace que tengan un comportamiento diferencial dependiendo de los sitios (1 o ms) que le permitan tener una expresin diferencial. 12. ATENUACIN Operones asociados a las vas anablicasdirectamente relacionados con la Biosntesis de aminocidos, y que tienen una capacidad de autoregularse, mediado por el proceso que se llama atenuacin. Cmo es el sistema que regula la biosntesis de un aminocido? Represible negativo qu significa eso? hay un gen regulador, y hay un sitio operador. El sistema se abre o se cierra por qu? el producto del gen regulador es inactivo, en ausencia del aminocido va a haber sntesis mxima, y en presencia de un exceso de aminocido, una de las molculas que queda por ah del Aa, se une al producto del gen regulador y bloquea el sitio operador. Pero por qu esto no es suficiente para mantener una regulacin adecuada que haga que no se malgaste energa? Porque el sistema cuando est abierto va a empezar a transcribir en forma mxima, porque este promotor es fuerte, por lo tanto, la transcripcin de todos los genes estructurales va a ser altsima. y para qu voy a generar aminocido, si en un momento puede que me llegue algo que contenga el aminocido? Entonces hay que tener un mecanismo, para cuando est abierto el sistema, pueda modular y hacer que la transcripcin sea la estrictamente necesaria. Cmo la regulacin de un opern represible es negativa? Esencialmente de un producto del gen regulador con un metabolito, y su interaccin permite que se cierre o se abra este sistema. Qu pasa cuando el sistema est abierto? Para evitar que transcriba el exceso, tiene un

mecanismo adicional de regulacin slo cuando el sistema est abierto, que se conoce como atenuacin.

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Esta regulacin tiende a atenuar la transcripcin, cuando sta est ocurriendo cmo lo logra? Despus del gen operador (est todo en la misma hebra tambin), hay una regin codificable que se llama pptido leader por qu? porque es el primero que se transcribe en el mensaje pentacistrnico, que me dar la expresin de los genes estructurales; pero tambin es el primero que se traduce porque tiene capacidad de codificacin. Esta capacidad de codificacin hace que, en la mitad o cercana a la regin del pptido leader, que es un pptido chiquitito (comparado con las tremendas protenas que son cada uno de los genes estructurales) tiene una regin sensora o atenuadora, que representa un nmero de codones que vaya acorde a los requerimientos que la clula tiene en relacin a este aminocido. El triptfano es el aminocido que tiene menor representacin en cualquier protena, de cualquier organismo vivo, por lo tanto, no todas las protenas tienen triptfano, y aquellas que lo tienen, presentan a lo ms uno. La regin atenuadora del opern triptfano, tiene dos seguidos eso qu significa? que para un pptido chiquitito, el tener dos triptfanos seguidos es un exceso. En este sistema se tienen dos elementos importantes, la secuencia leader, que es un mensaje inicial en el policistrnico que codifica un pptido leader, cuya codificacin va a estar asociada a la atenuacin. Cmo funciona esto? El sistema abierto, empieza a transcribir cmo es el promotor? fuerte, por lo tanto, empieza a generar un mensaje; una vez que la polimerasa avanza se puede generar otro mensaje, y continuar as, teniendo mltiples mensajes, y cada uno de ellos se empieza a traducir (recordar que en bacteria la transcripcin est acoplada a la traduccin). Si se empieza a traducir, cada monosoma que vaya avanzando en el pptido leader, va a llegar a esta regin, y si el sistema est abierto pasa a uno y lo llena, si llega a poner el segundo (triptfano) en este pptido chiquitito, significa que hay exceso de triptfano; y el mensaje que va formndose, toma una estructura secundaria tal, que hace que la polimerasa se caiga, en eso consiste la atenuacin. Entonces, cada mensaje q se est formando, mientras se est formando, se est traduciendo su pptido leader, y dependiendo con la velocidad que pase o no sobre la regin atenuadora, va a permitir q ese mensaje termine, o que se interrumpa antes. De nuevo, se los ejemplifiqu el otro da con lo que significaba la formacin de melanina, el producto final, si es que est, es el que va a regular, sino, quedan todos los sistemas intermediarios sin que exista la generacin del producto final. Entonces, si no hay trmino de la transcripcin, eso significa que el mensaje que permiti que se sintetizaran todas las protenas, no fue capaz de pasar esta regin, significaba que se necesitaba el Aa y por lo tanto, voy a tener una concentracin de Aa acorde a los requerimientos del momento. Cmo funciona la atenuacin? (de nuevo xDDD)

Co transcripcin traduccin, la traduccin del pptido leader indica que la pasada de los monosomas por la regin atenuadora, va a favorecer o no, que termine la transcripcin de ese mismo mensaje policistrnico. Sin embargo, qu sucede si verdaderamente hay falta del Aa? Cada uno de estos empieza a traducirse, mientras la polimerasa sigue avanzando, llega a esta regin, y el monosoma espera, espera, espera, y sino, se disocia; esto permite que se forme una estructura secundaria, que favorece el trmino de la transcripcin. Si por X motivo se gener triptfano, por degradacin de protenas, lo tom del medio, una cierta cantidad (que

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si fuera mucha, se cierra el sistema), el sistema sigue abierto, y el monosoma de cada mensaje, y cada uno de los monosomas sobre ese mensaje, van a llegar a la regin atenuadora y van a pasar relativamente rpido; si pasan rpido, se forma una estructura secundaria alternativa, que hace que los mensajes no se terminen de generar y por lo tanto, se atena el sistema y no hay produccin del Aa. Primera regulacin del sistemala regulacin real es por represin, negativa producto de un gen regulador inactivo, activado por un exceso de metabolitoel sistema de cierra. Qu sucede cuando est abierto? la estructura del sistema, involucra un regulador adicionalpptido leader (pptido chiquitito), que tiene una seal atenuadora, que representa un exceso para una protena del Aa en cuestin. esto hace que cada vez que se est traduciendo, para completar el mensaje policistrnico, cada uno de ellos acta como un regulador, dependiendo si pasa o no pasa esta regin, dando estructuras secundarias del mensaje, que ayuda a que se caiga la polimerasa y por ende, se termine la produccin del producto final que es el Aa. La atenuacin acta con el sistema ya sea abierto o cerrado. Cuando los niveles de triptfano son altos, se traduce esa regin, por lo tanto significa que hay exceso, y forma una estructura determinada, permitiendo que la polimerasa se caiga. Sin embargo, cuando en la misma regin, el sistema no alcanza a pasar, porque el nivel de triptfano es bajo, se forma una estructura alternativa. Conclusin: Un sistema gentico se regula cualitativamente, por inducibilidad o represibilidad, dependiendo si est asociado a vas anablicas o vas catablicas. Sin embargo, hay que ponerle una componente cuantitativa, esa componente cuantitativa me habla de lo positivo y de lo negativo. Cmo hay un trmino genrico de la regulacin? Tiende a ser negativa, es decir, transcripcin cero, a lo que cueste cmo nos acercamos a esto? teniendo sistemas positivos y negativos en equilibrio, como el opern arabinosa, o teniendo sistemas que atenan la expresin, una vez que est abierto el sistema. Cada uno de ellos, tiene elementos que le permiten hacer esta regulacin, el opern arabinosa pasa de positivo a negativo, porque tiene ms de un sitio alternativo de unin del producto del gen regulador (lo que le confiere gran importancia a este producto); y los sistemas represibles negativos, que estn asociados a vas anablicas, tienen la secuencia leader

que permite que el sistema se atene cuando est abierto, y mientras sigue abierto.