Ecosistemas 18 (1): 10-16. Enero 2009.

http://www.revistaecosistemas.net/articulo.asp?Id=591 REVISIONES

La huella gentica de la seleccin natural

F. Perfectti 1 , F.X. Pic 2 , J.M. Gmez 3
(1) Departamento de Gentica. Universidad de Granada, E-18071 Granada, Espaa. (2) Estacin Biolgica de Doana (CSIC). Pabelln del Per, E-41013 Sevilla, Espaa. (3) Departamento de Ecologa, Universidad de Granada, E-18071 Granada, Espaa.

Recibido el 5 de enero de 2009, aceptado el 27 de enero de 2009.

Perfectti, F., Pic, F.X., Gmez, J.M. (2009). La huella gentica de la seleccin natural. Ecosistemas 18(1):10-16. La seleccin natural es un proceso biolgico que constituye uno de los principales motores de cambio evolutivo, y el origen de las adaptaciones fenotpicas. La seleccin que acta sobre una determinada poblacin se puede detectar ecolgicamente cuantificando a nivel intrapoblacional la relacin existente entre el fenotipo de los individuos y su xito reproductivo diferencial. Sin embargo, detectar la actuacin de la seleccin pretrita es imposible usando una aproximacin exclusivamente ecolgica. Para afrontar este problema, durante los ltimos 40 aos se han desarrollado una serie de mtodos moleculares que infieren la actuacin de la seleccin. Un primer grupo de pruebas usa como modelo nulo la teora cuasi neutral de la evolucin molecular, y asumen que ha ocurrido seleccin cuando el resultado difiere significativamente de lo esperable segn evolucin neutral. Algunos tests, como por ejemplo la D de Tajima, la relacin d d , o las pruebas
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de MK o HKA, pueden determinar incluso el tipo de seleccin operante. Sin embargo, raramente pueden cuantificar la intensidad de seleccin. Este inconveniente es exitosamente superado por el anlisis de la seleccin basada en Campos Aleatorios de Poisson (PRF). Un segundo grupo de pruebas usa como mtodo para inferir la accin pretrita de la seleccin natural la comparacin entre la cantidad de diferenciacin gentica en caracteres cuantitativos (Q ) y la cantidad de diferenciacin gentica neutra (F ). Finalmente, unos de los ms
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recientes y prometedores mtodos que se estn desarrollando para el estudio de la seleccin natural est relacionado con el avance tan espectacular que est registrando en la actualidad la genmica. An estamos lejos de saber la verdadera utilidad de esta herramienta para el estudio de la seleccin natural en poblaciones naturales, pero el pronstico es bastante esperanzador. Palabras clave: seleccin natural, deriva gentica, evolucin neutral, genmica. Perfectti, F., Pic, F.X., Gmez, J.M. (2009). Genetic evidences of natural selection. Ecosistemas 18(1):10-16. Natural selection is one of the main factors driving the evolutionary process and the only one leading to adaptations. Selection acting on a population can be detected by quantifying the relationship between individual phenotype and relative fitness. However, detecting the effect of past selection is not possible by only using an ecological approach. To cope with this issue, several molecular evolutionary genetics methods have been developed during the last 40 years. A first group of tests use the quasi neutral theory of molecular evolution as null model, and assume the occurrence of selection when the observed outcome significantly departs from the expectations under neutral evolution. Some tests, such as Tajimas D, d /d ratio, MK test or HKA test, can determine the kind of selection acting on populations, but are
N S

unable to quantify its intensity. The analysis of selection based on Poisson Random Fields (PRF) overcomes this caveat. A second group of analyses infer selection by comparing the amount of genetic variation in quantitative traits (Q ) against the amount of neutral genetic
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variation (F ). Lastly, one of the most recent and promising methods to explore natural selection is related with the superb advance in
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genomics. Although we are still far from fully appreciate the importance of this tool, we believe that the use of the genomics will produce a qualitative enhancement in our understanding of the importance of natural selection in the wild. Key words: natural selection, genetic drift, neutral evolution, genomics.

El grado de diferenciacin y divergencia entre poblaciones o especies relacionadas, que pueden observarse y cuantificarse a nivel cuantitativo y molecular, puede ser explicado por seleccin natural y/o deriva gentica. Podemos decir que ambos procesos operan simultneamente en todas las poblaciones aunque la importancia relativa de cada uno de ellos puede variar de una manera substancial. Tradicionalmente, entender bien los procesos que determinan la diferenciacin poblacional y el peso que la seleccin natural puede tener frente a la deriva gentica en dichos procesos ha sido de capital importancia para la biologa evolutiva. La forma habitual para un eclogo de detectar un evento de seleccin es establecer una relacin estadstica entre un rasgo fenotpico y la eficacia biolgica, caracterizando as un suceso de seleccin fenotpica. La propia naturaleza de esta forma de proceder implica que hay que cazar los eventos de seleccin en el momento en que la seleccin natural est operando. Sin embargo, hay otra aproximacin basada en el anlisis de secuencias que busca las seales dejadas por la

Ecosistemas no se hace responsable del uso indebido de material sujeto a derecho de autor. ISSN 1697-2473.

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seleccin natural en los genomas de los organismos. Esta aproximacin est basada en la historia de acumulacin de substituciones en los linajes y no es una aproximacin contempornea, a diferencia de la aproximacin ecolgica basada en la asociacin fenotipo-eficacia biolgica. Adems, y a diferencia de ciertas interpretaciones seleccionistas, tampoco se trata de inferir seleccin a partir de un modelo de optimizacin que prejuzga que hay adaptacin, sino ms bien justamente lo contrario: a partir de modelos que consideran la evolucin neutral como la hiptesis nula, determinar qu desviaciones frente al modelo neutral ofrecen pistas para establecer los eventos de seleccin.

Detectando la huella gentica de la seleccin natural.

La hiptesis nula: teora cuasi neutral de la evolucin molecular. Kimura (1968) y King y Jukes (1969) desarrollaron la teora neutral de la evolucin molecular, pasando de una interpretacin seleccionista de la evolucin a una donde la mayor parte del cambio en las secuencias era no adaptativo y debido a la mutacin. La probabilidad de reemplazo de un nucletido por otro en una secuencia solo dependera de la tasa de mutacin, jugando la seleccin un papel minoritario y reservado a la eliminacin de las variantes deletreas. Una importante revisin de la teora fue propuesta por Tomoko Ohta (1973; 1992), que introdujo la teora casi neutral de la evolucin molecular, donde se considera que la evolucin de mutaciones ligeramente deletreas o ligeramente beneficiosas, casi-neutrales, va a depender fundamentalmente de la tasa de mutacin, de los coeficientes de seleccin y del tamao poblacional. As, en linajes evolutivos con tamaos pequeos de poblacin es posible encontrar un mayor nmero de cambios no neutrales, ligeramente deletreos, mantenidos a baja frecuencia o incluso fijados por deriva gentica. A partir de este modelo terico de evolucin de secuencias se puede tener una hiptesis nula con la que comparar un juego de secuencias obtenidas, ya sea de poblaciones de una misma especie, o ms comnmente de especies diferentes pero con un ancestro comn no muy lejano. Las desviaciones frente a este modelo pueden ser interpretadas como claros indicios de eventos de seleccin positiva (s>0) o, ms frecuentemente, como evidencias de seleccin purificadora (s<0), aunque la seleccin equilibradora, o balanceada, u otros procesos demogrficos tambin pueden ser detectados (Figura 1). A continuacin haremos un repaso a los estadsticos ms utilizados para demostrar desviaciones frente a la hiptesis nula de neutralidad.

Figura 1. Esquema mostrando los efectos de diversos tipos de seleccin en la diversidad nucleotdica intra- e inter-especfica (Nielsen 2005).

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D de Tajima y sus derivados Estos estadsticos se han desarrollado para determinar si el espectro de frecuencias de los polimorfismos encontrados en un juego de secuencias es explicable bajo la hiptesis de evolucin puramente neutral. El estadstico D (Tajima 1989) compara dos estimas de la cantidad de variacin gentica () de un grupo de secuencias. La primera es obtenida a partir del nmero total de sitios polimrficos en la muestra de secuencias y la segunda como la proporcin de diferencias nucleotdicas entre las secuencias comparadas dos a dos. Ambas estimas deben ser iguales bajo una situacin de evolucin neutral (no seleccin, no recombinacin, no subdivisin poblacional, no cambios en el tamao poblacional). D se basa en la diferencia entre ambas estimas y tiene media cero y desviacin 1. Si se detectan desviaciones significativas, ests son indicadoras de no neutralidad, pero el factor concreto que las explica puede ser difcil de distinguir. As, por ejemplo, valores positivos de D pueden indicar seleccin positiva, seleccin equilibradora o bien una reduccin del tamao poblacional. Otros tests han incorporado informacin filogentica (por ejemplo una especie outgroup) para intentar estimar la direccin de los cambios y as tener una mayor potencia para detectar desviaciones frente a la hiptesis nula. El test de Fu y Li (Fu y Li 1993) es parecido al anterior en que tambin calcula un estadstico D como la diferencia de dos estimas de . Este test est basado en que diferentes tipos de mutaciones se acumulan de forma diferente en una filogenia. As, las mutaciones puramente neutrales pueden acumularse a lo largo de toda la filogenia, pero las mutaciones ligeramente deletreas lo harn nicamente en las ramas externas, o lo que es lo mismo, son ms recientes, puesto que la seleccin habr tenido ms tiempo para eliminar las mutaciones deletreas que aparecieron hace ms tiempo. Fay y Wu (2000) tambin desarrollaron un test basado en que el espectro de frecuencias esperado bajo condiciones de neutralidad debe estar enriquecido en mutaciones a baja frecuencia, siendo las mutaciones en alta frecuencia raras. Este test, que tambin requiere de informacin filogentica, es especialmente sensible a los arrastres o barridos selectivos. Hay que tener en cuenta que un evento de seleccin positiva eliminar polimorfismo no solo en la posicin responsable (el nucletido concreto), sino en una amplia regin de posiciones ligadas. As, un arrastre selectivo elimina variacin muy rpidamente, pero tambin puede llevar a las variantes neutrales ligadas a tener frecuencias altas, dejando una seal que puede ser detectada por estos tests. Deteccin de la seleccin usando dN/dS Cuando se dispone de secuencias de genes codificadores de protenas, a stas se les pueden aplicar una serie de pruebas estadsticas muy tiles para valorar la importancia de la seleccin en la evolucin de dichas secuencias. Quizs la ms conocida y usada sea la razn dN/dS (Kimura 1977). Esta razn compara la tasa de substituciones no sinnimas por sitio no sinnimo (dN) con la tasa de substituciones sinnimas por sitio sinnimo(dS). Habitualmente no se conoce el tiempo de divergencia entre las dos secuencias a comparar, y por tanto las tasas de cambio, y por ello se suelen utilizar las proporciones de substituciones no sinnimas (por sitio no sinnimo) y substituciones sinnimas (por sitio sinnimo). La interpretacin de la razn dN/dS es directa asumiendo que las substituciones sinnimas no se producen por seleccin y slo reflejan la tasa neutral de substitucin. As, dN/dS = 1 sera un indicador de evolucin neutral y, por contra, valores superiores a la unidad indicaran seleccin positiva y valores inferiores seleccin purificadora. En la prctica, la estima de estos parmetros puede complicarse si la divergencia entre las secuencias ha sido grande. Adems, ciertas substituciones sinnimas podran no ser neutrales y ser consecuencia de seleccin positiva. Hay ejemplos de que ciertas substituciones sinnimas pueden afectar a la estabilidad del mRNA o a la mecnica del splicing o que incluso manifiesten cierta seleccin para minimizar los errores de traduccin (Chamary y Hurst 2005; Parmley et al. 2006; Pal et al. 2006; Drummond y Wilke 2008). Las estimas genmicas de este parmetro varan ampliamente entre grupos. As para Drosophila se reportan valores bajos (indicando una, altamente eficaz, seleccin purificadora) mientras que para mamferos aparecen valores ms altos que pueden indicar que la seleccin purificadora no es tan efectiva, posiblemente debido a un tpico pequeo tamao poblacional. Conviene recordar aqu que la seleccin purificadora ser muy efectiva solo si |s| >> 1/4Ne y que, por tanto, en poblaciones pequeas pueden fijarse mutaciones ligeramente deletreas nicamente por deriva gentica (Ohta 1987; Bromham y Penny 2003) Prueba de MK McDonald y Kreitman (1991) idearon un test que compara el polimorfismo intraespecfico con la divergencia interespecfica. El test se utiliza para comparar secuencias codificadoras de protenas de dos especies muy emparentadas. Para ello se se construye una tabla de doble entrada donde se evala el nmero de sitios polimrficos sinnimos (PS) y no sinnimos (PN), y el nmero de substituciones fijas sinnimas (DS) y no sinnimas (DN). Si la evolucin es puramente neutral PN/PS= DN /DS. Sin embargo, si estas razones no son iguales, cabe asumir seleccin purificadora (si PN/PS>DN/DS) o positiva (si

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PN/PS< DN/DS). Desgraciadamente, factores demogrficos, como una expansin poblacional reciente, pueden producir una seal similar a la accin de la seleccin, complicando la interpretacin del test. Prueba de HKA La prueba de Hudson-Kreitman-Aguad (HKA, Hudson et al. 1987) utiliza secuencias de varios loci de especies altamente emparentadas, y pone a prueba la hiptesis neutral de que la divergencia (interespecfica) y el polimorfismo (intraespecfico) deben ser similares para cada locus. Se determinan tericamente los valores de polimorfismo esperado en dos especies (o poblaciones) y el grado de divergencia esperado entre las dos especies y se comparan con los valores observados. Las desviaciones sern indicativas de que otros procesos adicionales a la deriva han afectado la evolucin de esas secuencias. Puesto que la prueba se basa en obtener unos valores tericos de polimorfismo y divergencia, este test es sensible a factores demogrficos no contemplados en el modelo. Una ventaja de esta prueba es que es posible aplicarla a secuencias no codificadoras. Anlisis de la seleccin basada en campos aleatorios de Poisson Las pruebas estadsticas anteriormente comentadas pueden determinar si las desviaciones frente a la hiptesis nula de evolucin neutral son significativas e incluso el tipo de seleccin operante, pero ms raramente determinan la intensidad de la seleccin. Sawyer y Hartl (1992) desarrollaron, a partir del modelo de evolucin de Wright-Fisher, un marco terico para estimar analticamente la intensidad de la seleccin que afecta a una serie de variantes nucleotdicas: el modelo PRF (Poisson Random Field). Bajo una serie de asunciones (principalmente que las mutaciones surgen al azar en un curso temporal que sigue una distribucin de Poisson, que cada mutacin aparece en una posicin diferente y que no hay ligamiento) es posible obtener estimas de la intensidad de seleccin. La potencia de esta aproximacin es mayor cuando se utilizan datos de mltiples loci no ligados, como, por ejemplo, SNPs (polimorfismos de un solo nucletido en su acrnimo en ingls) repartidos por todo el genoma. Esta aproximacin se ha utilizado, por ejemplo, para cuantificar el papel de la seleccin en Drosophila y Arabidopsis (Bustamante et al. 2002), encontrando que en Arabidopsis se han acumulado mutaciones ligeramente deletreas, posiblemente debido a su sistema de cruzamiento principalmente autgamo. La unin de aproximaciones basadas en PRF con simulaciones por ordenador de procesos demogrficos es actualmente la estrategia mas completa para obtener informacin de la historia evolutiva de las poblaciones. La aplicacin de los mtodos ABC (approximate bayesian computation; Pritchard et al. 1999; Beaumont et al. 2002), junto con modelos PRF y la tecnologa de secuenciacin masiva de 2 y 3 generacin, proporcionar una visin ms realista del papel de la seleccin natural en el proceso evolutivo. Diversos programas informticos pueden ser muy tiles para dilucidar qu papel ha jugando la seleccin en el modelado de la diversidad nucleotdica. DnaSP (http://www.ub.es/dnasp/), VariScan (http://www.ub.es/softevol/variscan/), MEGA (http://www.megasoftware.net/), PAML (http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html), MKPRF (http://cbsuapps.tc.cornell.edu/mkprf.aspx) son, por citar unos pocos, programas muy utilizados para realizar varios de los tests anteriormente comentados.

Inferencia funcional y diversidad neutral

Con el avance de las tcnicas moleculares que permiten comprender la base gentica de la variabilidad de caracteres cuantitativos, el inters por determinar el papel de la seleccin natural y la deriva gentica en el proceso de diferenciacin poblacional se ha intensificado. No obstante, todava estamos lejos de poder identificar ntidamente los genes que determinan caracteres cuantitativos de inters evolutivo y si la diferenciacin poblacional en estos genes es debida a procesos selectivos o a procesos puramente demogrficos, como la deriva gentica. Por esta razn, la comparacin entre la cantidad de diferenciacin gentica en caracteres cuantitativos (QST ) y la cantidad de diferenciacin gentica neutra (FST ) representa un mtodo apropiado para analizar el papel de la seleccin natural frente al de los procesos demogrficos en la diferenciacin poblacional de caracteres cuantitativos de inters evolutivo. Cuando se comparan los ndices QST y FST se pueden obtener tres resultados. Primero, que QST > FST . En este caso la diferenciacin poblacional en caracteres cuantitativos es mayor que la diferenciacin gentica neutra (en funcin solamente de la deriva gentica) y se asume que la seleccin natural direccional, que favorece a distintos fenotipos en distintas poblaciones, es la responsable de la diferenciacin poblacional. Segundo, que QST < FST . En este caso la diferenciacin observada es menor que la que explica la diferenciacin gentica neutra y una explicacin podra ser la seleccin estabilizadora, que favorece a los fenotipos ms cercanos al promedio poblacional de manera que tiene un efecto homogeneizador. Finalmente, la tercera posibilidad es que QST FST . En este caso la cantidad de diferenciacin debida a

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procesos demogrficos iguala a la diferenciacin poblacional en caracteres cuantitativos pero no se puede decir que la deriva gentica sea la nica causa de dicha diferenciacin. Para estimar la cantidad de diferenciacin gentica en caracteres cuantitativos (QST ), lo ms comn es estimar los componentes de varianza entre y dentro de poblaciones mediante un anlisis de la varianza (ANOVA) tpico. En funcin del tipo de organismo de estudio y del grado de manipulacin que estos permitan, los valores de QST se pueden estimar a partir de datos puramente fenotpicos de poblaciones silvestres o de experimentos en condiciones controladas. En el primer caso, los QST resultantes no permiten separar los componentes genticos de los meramente ambientales, mientras que en el segundo caso los QST se basan en los componentes genticos solamente. En funcin del tipo de experimento, incluso es posible separar los efectos aditivos de los no aditivos, como los efectos maternos. Para estimar la cantidad de diferenciacin gentica neutra (FST ) se pueden utilizar distintos marcadores moleculares neutros cuya variacin entre y dentro de poblaciones se puede analizar mediante un anlisis de varianza molecular (AMOVA). Como en cualquier otra aproximacin experimental, hay que tener en cuenta los principales problemas o limitaciones a la hora de comparar los valores de QST y FST . En el caso de los QST , los principales problemas son dos. El primero reside en cmo se estima la diferenciacin gentica en los caracteres cuantitativos de inters. Todo lo que no sea varianza gentica aditiva (en particular, la varianza fenotpica debida a la respuesta plstica a distintos ambientes y la varianza debida a efectos maternos) puede enmascarar la verdadera divergencia poblacional en caracteres cuantitativos. El otro gran problema est en que generalmente la precisin y las propiedades estadsticas del ndice QST son bajas a no ser que se use un nmero elevado de poblaciones (la precisin del ndice QST mejora sensiblemente cuando el nmero de poblaciones se aproxima a 20). Las caractersticas del organismo de estudio van a permitir disear experimentos que incluyan un nmero alto de poblaciones y que estimen solamente los componentes de varianza gentica aditiva para estimar la diferenciacin poblacional de caracteres cuantitativos. En el caso de los FST , las estimas de diferenciacin gentica neutra dependern del grado de polimorfismo de los marcadores que se utilicen. Cuanto mayor sea el polimorfismo de los marcadores menor ser el grado de diferenciacin poblacional gentica neutra. Otro factor a tener en cuenta es que en la mayora de casos se ignora, aunque se acabe asumiendo, si los marcadores estn ligados a loci que s estn bajo seleccin o si las condiciones de equilibrio que se asumen para estimar los FST no se cumplen. Finalmente, las tasas de mutacin intrnsecas a cada tipo de marcador tambin pueden afectar los FST , que nada tienen que ver con la interpretacin puramente demogrfica del ndice FST . A pesar de estas limitaciones, que siempre hay que tener en cuenta a la hora de disear un experimento para comparar valores de QST y FST , los estudios de diferenciacin poblacional para determinar el peso de la seleccin natural o de la deriva gentica son claves para el avance de la biologa evolutiva. Las estimas de QST deben nutrirse de mltiples experimentos y observaciones de poblaciones naturales que al final nos permitan cuantificar y entender el grado de diferenciacin poblacional en caracteres cuantitativos. Por otro lado, las estimas de FST deben hacerse en base a una comparacin entre tipos de marcadores para estimar el sesgo intrnseco a la naturaleza de cada tipo de marcador. No obstante, los avances en el campo de la genmica, que permiten trabajar a nivel de genoma incluyendo regiones genmicas codificantes, reguladoras y estructurales, van a cambiar definitivamente el concepto de la diferenciacin poblacional gentica neutra basado en los valores de FST .

Anlisis genmico para el estudio del efecto de la seleccin

Gracias al avance de los ltimos aos que se ha experimentado en tres campos de investigacin (biomedicina, genmica funcional aplicada a la agricultura y gentica de poblaciones humanas), ha quedado patente la necesidad de desarrollar una lnea de investigacin en la que la genmica (y las dems -micas -ver Cieslak y Ribera 2009-) se aplique sistemticamente al campo de la biologa evolutiva. El principal objetivo es el de determinar el significado funcional de la variacin gentica que presentan las poblaciones de los organismos en sus ambientes naturales as como identificar los procesos evolutivos que generan o mantienen dicha variacin. En este caso, la variacin gentica no hace referencia solamente a regiones neutras, sino que tiene que ver con la variacin a nivel genmico con especial nfasis en aquellas regiones que pueden incluir genes de inters evolutivo. De todos modos, las tcnicas que se desarrollan para estudiar dicha variacin gentica acaban generando marcadores con carcter funcional (regiones reguladoras de genes y regiones codificantes de protenas) pero tambin neutro (regiones genmicas estructurales). Una de las consecuencias inmediatas de esta aproximacin es que se pueden evitar las limitaciones severas que aparecen cuando se trabaja con un nmero reducido de marcadores supuestamente neutros para contestar a preguntas evolutivas.

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Los estudios de genmica funcional aplicada a la biologa evolutiva pivotan alrededor de los anlisis de asociacin entre la variacin de caracteres cuantitativos de posible inters evolutivo y la variacin genmica que presente el organismo de estudio. Para poder trabajar a nivel genmico se tienen que desarrollar un gran nmero de marcadores que cubran todas las regiones genmicas. Dos de las aproximaciones ms comunes para la obtencin de dichos marcadores incluyen, por una parte el desarrollo de SNPs (polimorfismos de un solo nucletido en su acrnimo en ingls), y por otra el desarrollo de ESTs (marcadores de secuencia expresada en su acrnimo en ingls). Los SNPs son los polimorfismos ms comunes que determinan la variacin gentica de un organismo. Por ejemplo, aproximadamente el 90% de la variacin gentica en humanos se debe a polimorfismos de tipo SNP. Dado su gran nmero, podemos obtener SNPs en distintas regiones de un gen (SNPs funcionales) y en regiones genmicas estructurales (SNPs presuntamente no funcionales). En el caso de los ESTs, dado que se obtienen mediante la secuenciacin de ARNm clonado, estos marcadores representan porciones de genes expresados y su carcter es mucho ms funcional. A fecha de hoy y para un gran nmero de organismos representantes de toda la diversidad biolgica, existen inmensas libreras de SNPs y ESTs (con miles o cientos de miles de marcadores en muchos casos) que sirven de base para el desarrollo de la genmica funcional aplicada a la biologa evolutiva. A parte de la naturaleza y cantidad de marcadores distribuidos por todo el genoma del organismo de estudio, sigue siendo capital tener un buen diseo experimental (que siempre que sea posible debe incluir el seguimiento de poblaciones de campo y la manipulacin de poblaciones experimentales en condiciones controladas) para cuantificar la variacin gentica de caracteres cuantitativos de inters evolutivo. El reto ahora es el de desarrollar anlisis de asociacin entre caracteres cuantitativos y marcadores moleculares que nos permitan detectar las regiones genmicas responsables de la variacin gentica cuantitativa. Los mtodos estadsticos para dichos anlisis de asociacin estn en pleno desarrollo pues requieren en muchos casos el uso de herramientas como la biocomputacin que permite trabajar con miles de marcadores a la vez. Los principales problemas a los que hay que hacer frente y que pueden sesgar los resultados de los anlisis de asociacin son la deteccin de falsos negativos/positivos (intrnsecos al uso de un nmero muy grande de marcadores), el grado de ligamiento entre marcadores muy relacionado con los grupos de ligamiento, y/o la estructura geogrfica de la variacin gentica que presentan los datos como resultado de la historia de las poblaciones de estudio. El desarrollo de proyectos de genmica funcional aplicados a la biologa evolutiva requiere un cambio de mentalidad en todos los sentidos, incluyendo cuestiones meramente metodolgicas, de formacin de nuevos profesionales, y otras de tipo ms econmico y de estrategia pues, en el caso de trabajar con especies no modelo, la inversin inicial puede ser importante. Ese es el cambio ms importante que hay que hacer: decidir cmo y cuando invertir los recursos para generar herramientas que luego permitan responder a preguntas mucho ms ambiciosas dentro del campo de la biologa evolutiva. El 1 de febrero de 1898, Hermon Bumpus recibi 136 gorriones recolectados tras una glida tormenta que azoto Rhode Island (USA). Casi la mitad de ellos sobrevivi y Bumpus estudi las caractersticas fsicas de todos ellos para analizar que rasgos haban intervenido en la supervivencia frente al fro (Bumpus 1899). Este trabajo se convirti en un clsico de las estimas de seleccin natural y todava esos datos son analizados de diferentes formas (eg, Pugesek y Tomer 1996). Es posible imaginar que gran informacin podra haber obtenido Hermus Bumpus de haber dispuesto de herramientas como la tecnologa de secuenciacin masiva y las aproximaciones tericas y computacionales de la moderna teora de evolucin molecular. Con estos desarrollos, el papel de la seleccin natural en la evolucin de las poblaciones pronto podr ser valorado de forma precisa para muchos organismos, pasando de simples aproximaciones al papel de los diferentes procesos evolutivos a tener estimas robustas de su importancia en la historia evolutiva de las especies.

Referencias
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