Reacciones

del

grupo

amino

En cuanto a las reacciones del grupo amino, es muy interesante la reaccin con el reactivo de Sanger para secuenciar, ya que si tenemos el 2,4-dinitrofenil-pptido y lo hidrolizamos por hidrlisis cida, se hidrolizarn todos los enlaces peptdicos y obtendremos el dinitrofenil del primer aminocido de la secuencia, el NH2 terminal, ms el resto de los aminocidos disgregados en el medio. Con esta reaccin Sanger consigui secuenciar la insulina. En esta reaccin, el ncleo coloreado de dinitrobenceno se une al tomo de nitrgeno del aminocido para producir un derivado amarillo, el derivado 2,4-dinitrofenil o DNPaminocido. El compuesto DNFB reaccionara con el grupo amino libre del extremo amino de un polipptido, as como tambin con los grupos amino de los aminocidos libres. El enlace C N que se forma es por lo general mucho ms estable que un enlace peptdico. De esta forma, haciendo reaccionar una protena nativa o un polipptido intacto con el DNFB, hidrolizando la protena en acido y aislando los DNPaminocidos coloreados, puede identificarse el grupo amino terminal del aminocido en una cadena polipeptdica. El grupo amino-terminal de la lisina y algunos otros grupos funcionales de las cadenas laterales tambin reaccionaran con el DNFB. Sin embargo, despus de la hidrlisis, solo el derivado del grupo amino terminal del aminocido original tendr su grupo -amino bloqueado; asimismo, tales DNP-aminocidos pueden separarse de otros derivados DNP mediante procedimientos de extraccin simples. Con cualquiera de los variados mtodos cromatograficos se podr identificar a los DNP--aminocidos

SECUENCIACIN DE SANGER

SECUENCIACIN DE EDMAN

Especificidad de algunos mtodos de fragmentacin de la cadena polipeptdica

Tratamiento Tripsina Punto de corte Lys, Arg ( C )

Quimotripsina
Proteasa V8 Endoproteinasa Lys C Bromuro de cianogeno (CNBr) Pepsina Proteasa Asp N

Tyr,Phe,Trp ( C )
Asp, Glu ( C ) Lys ( C ) Met ( C ) Tyr, Phe, Trp (N) Asp, Glu (N)

SNTESIS DE PROTENAS EN LAS CLULAS las protenas se sintetizan en los ribosomas a partir de la informacin contenida en los RNA mensajeros (Proceso de Traduccin). Cada tres bases del ARNm codifica para un Aa concreto Las cadenas polipeptdicas se van plegando a medida que se sintetizan hasta adoptar espontneamente la forma o configuracin espacial ms estable (estado de mnima energa libre). Despus de separarse de los ribosomas el polipeptido puede sufrir distintas transformaciones (Proceso de Maduracin) hasta dar lugar a la protena funcional. DOGMA DE LA BIOLOGA MOLECULAR La secuencia de aminocidos de una protena est codificada por la secuencia de bases de un gen concreto (regin especfica del ADN). Un cambio en la secuencia de bases del gen (mutacin) puede provocar un cambio en por lo menos un Aa de la cadena polipeptdica; esto puede provocar que el plegamiento de la protena no sea el adecuado lo que impedir que la protena sea funcional. La organizacin tridimensional o espacial de las protenas se denomina CONFORMACIN NATIVA ESENCIAL PARA CUMPLIR CON LA FUNCIN BIOLOGICA.

ESTRUCTURA PRIMARIA

ESTRUCTURA SECUNDARIA

HOJA PLEGADA BETA

ALFA HELICE

ESTRUCTURA CUATERNARIA

ESTRUCTURA TERCIARIA