GENETIQUE

Facult de Mdecine
Anne Prparatoire 2010-2011

Programme de Gntique
Proprits fondamentales du matriel gntique; Nature et structure du matriel gntique;
Nature du matriel gntique Structure des acides nucliques: ADN et ARN;

Lois de transmission des caractres hrditaires;

Consquences gntiques de la miose et cycles chromosomiques; exemple cycle haplobintique Transmission des caractres hrditaires chez les diplodes: monohybridisme et dihybridisme; Transmission dallles multiples; Transmission des caractres hrditaires lis au sexe.

Gntique
Dfinition: Science de lhrdit; elle a pour objet ltude de la transmission des caractres hrditaires au cours de gnrations successives. La gntique cherche rpondre aux trois questions suivantes: 1- Quelle est la nature du matriel gntique transmis aux descendants ? 2- Comment ce matriel est-il transfr dune gnration la suivante ? 3- Par quel processus assure-t-il la ralisation matrielle des caractres envisags ? La gntique comprend plusieurs branches: 1- Gntique formelle ou la gntique de transmission: tude des modes de transmission des caractres hrditaires dune gnration une autre partir de la ralisation des croisements entre deux individus appartenant une mme espce;

2- Gntique molculaire: Cest ltude de la structure et

la fonction des gnes.

3-Gntique des populations:: Elle tudie la structure des diffrents types des populations au niveau gntique et leurs variations ventuelles au cours des gnrations successives; on peut dcouvrir des mutations (10-8); 4-Gntique microbienne : Elle traite les mcanismes

et les processus gntiques des micro-organismes ;

5- Cytogntique : Cest une science hybride qui fait le lien entre des vnements cellulaires principalement ceux des chromosomes et des phnomnes gntiques. Elle tudie les diffrentes variations caryotypiques

6- Gntique volutive : Elle concerne ltude de lvolution des caractres hrditaires au niveau des espces. Elle cherche comprendre lorigine de la diversit du monde vivant (Biodiversit) .

Des sous branches existent:

- Gntique Quantitative, qui concerne ltude des caractres quantitatifs ou mesurables tel que: le poids, la taille Ces caractres sont contrls par plusieurs gnes (caractres polygniques). Ils sont influenc par le milieu. P=G + E - Gntique Humaine: tude des caractres hrditaires chez lhomme; elle est devenue une gntique mdicale.

Mthodes Gntiques:
1- Hybridation: ralisation des croisements entre individus dune mme espce, utilise par la gntique classique; 2-Cytogntique: ralisation des caryotypes (formule chromosomique des cellules dun tre vivant); 3-Mthodes statistiques: utilises par la gntique des populations, pour tudier des lois de lhrdit et de la variation; 4- Mthode biochimique: elle permet de sparer les allles dun individu htrozygote partir dune technique de sparation : llectrophorse. A partir de cette technique, on peut sparer les allles HbA et Hbs pour un individu htrozygote: HbA/Hbs 5-Mthode de Pdigre: elle est base sur lanalyse des arbres gnalogiques pour tudier les caractres hrditaires chez lhomme.

Exemple dun arbre gnalogique

Premier exemple: une maladie autosomique rcessive
I A homme femme II B C D

III I

Hommes et femmes peuvent tre touchs par la maladie : le gne est port par les autosomes

Les parents de K et L sont normaux : ils possdent lallle normal A. Ils ont des enfants malades : ils possdent donc aussi lallle anormal a.

Malgr la prsence de a, ils ne sont pas malades. A est donc dominant. Gnotypes de F et G : Aa ; gnotypes de K et L : aa

Deuxime exemple: dun arbre gnalogique

Arbre gnalogique d une maladie dominante lie au sexe.

Les 2 sexes sont atteints Les pres transmettent la maladie leurs filles
Transmission verticale Transmission dominante lie l X

Quelques notions utiles

Allle: Les variantes dun mme gne. Autosome: Tout chromosome qui chromosome sexuel. nest pas un

Caryotype: Garniture chromosomique complte dun individu ou dune cellule, telle que lon peut observer en mtaphase mitotique.

Crossing-over: change entre rgions correspondantes de chromosomes homologues produit par cassure et rassociation croises.
Diplode: Une cellule ou un individu possdant deux jeux de chromosomes dans chacune de ses cellules. Gne: Unit structurale et fonctionnelle de lhrdit, porteuse de linformation gntique dune gnration une autre.

Gnome: Lensemble du matriel gntique prsent dans un jeu de chromosome. Gnotype: type d'allles ports par une cellule ou un individu; Ex: AA, Aa ou aa Haplode: Une cellule ne possdant quun seul jeu chromosomique, ou un organisme compos de cellules de ce type . Homozygote: personne possdant 2 fois le mme allle pour un caractre donn; Ex: AA ou aa Htrozygote: personne ayant 2 allles diffrents pour un gne donn; Exemple : Aa Locus: Lemplacement spcifique dun chromosome o se trouve localis un gne donn. Phnotype: Caractre physique observable qui est induit par le gnotype; Ex: Cheveux noirs ou cheveux bleus.

Nature du matriel gntique

Transformation bactrienne chez le pneumocoque : Exprience de Griffith 1928 En 1928, Frederik Griffith a travaill sur le pneumocoque: Diplococcus pneumoniae qui provoque une pneumonie mortelle chez la souris. Ils existent deux souches des pneumocoques, une souche virulente S (Smooth en anglais ; lisse) et une souche, non virulente R (Rough en anglais ; rugueux). Au microscope, il est possible de faire la diffrence entre les deux variants de pneumocoque : les pneumocoques S ont une capsule, faite de polysaccharides, qui leur permet de rsister aux enzymes lysantes produites par les leucocytes polynuclaires. Les pneumocoques R sont dpourvus de capsule.

Les tapes de lexprience de Grifith

Linjection des colonies de bactries S vivante entrane la mort de la souris injecte.
Linjection des colonies de bactrie R vivante nentrane aucune infection. Linjection des bactries S tues par la chaleur, nentrane aussi aucune infection. Linjection dun mlange de bactries S tues par la chaleur et de bactries R vivantes provoque la mort de la souris de. De plus partir des tissus de la souris morte, on peut extraire des bactries S vivantes.

Une substance, qui porte linformation gntique virulence) a t transfre des cellules S aux cellules R.

(la

Le caractre acquis par transformation est stable, les bactries modifies transmettent le nouveau caractre (virulence) et sont capables leur tour de provoquer la transformation. Puisque les protines sont dnatures par la chaleur, elles ne peuvent tre responsables de cet effet.

Nature du matriel gntique

En 1944, Avery, Mc Leod, Mc Carthy sparrent les diffrentes classes de molcules prsentes dans les dbris des cellules S mortes et testrent laptitude de chacune delles induire la transformation. Polysaccharides S (tue) + R aucune infection Protines S (tue)+ R aucune infection Lipides S (tue) + R aucune infection ADN S (tue) + R Infection provoquer par le mlange Un facteur transformant a t transmis de la bactrie virulente S tue par la chaleur la bactrie R vivante, lui apportant le pouvoir de reconstituer une capsule, indispensable la virulence. Si lon ajoute la solution R + S (tue) la dsoxyribonuclase, enzyme qui dgrade spcifiquement lADN, la transformation ne se produit plus.

Le facteur transformant est donc lADN. Cet acide nuclique a les deux proprits qui dfinissent le matriel gntique : la capacit dinduire un caractre spcifique; la capacit de provoquer sa propre reproduction.

Structure de LADN
L'ADN est donc le support de l'information gntique; mais aussi le support de ses variations. L ADN est une molcule, retrouve dans toutes les cellules vivantes, qui renferme l'ensemble des informations ncessaires au dveloppement et au fonctionnement d'un organisme. L'ADN dtermine la synthse des protines, par l'intermdiaire de l'ARN. Grce des hydrolyses enzymatiques, on a pu isoler les diffrents composants de lADN, il sagit de : * lacide phosphorique H3 PO4; * un sucre, le dsoxyribose, C5H10O4; * des bases organiques azotes de deux types : les bases puriques (appeles bases longues en raison de la forme de leur noyau carbon et azot)- ladnine et guanine (symboles A et G)-; et les bases pyrimidiques (appeles bases courtes)- la thymine et la cytosine (symboles T et C).

Dans les cellules eucaryotes, l'ADN est contenu dans le noyau et une petite partie dans la matrice des mitochondries ainsi que dans les chloroplastes. Dans les cellules procaryotes, l'ADN est contenu dans le cytoplasme. La distribution des bases azotes de lADN nest pas quelconque (observation faite par Chargaff en 1950) : le tableau ci-dessous montre que le rapport A+G/T+C est toujours gal 1(aux erreurs de mesure prs) : il y a donc autant de A que de T, autant de G que de C. En revanche, le rapport A+T/G+C a une valeur variable selon les espces.
Espces A+G/T+C A+T/G+C

bactrie bl drosophile boeuf souris homme

0,99 1,01 1,01 1,05 1,04 1,00

0,91 1,22 1,51 1,25 1,42 1,53

Cette distribution gale de A et T dune part, de G et C dautre part implique une structure particulire de lADN, structure en double hlice (Fig-1-).

Structure de LADN

Modle simplifi montrant la structure hlicodale de LADN. Les barreaux reprsentent les paires de bases et les rubans les squelettes des chanes sucre-phosphate des deux chanes antiparallles. (Modle Watson et Crick, 1953)

Structure de LARN
Lacide ribonuclique ou ARN est un polymre de ribonulotides une structure primaire ADN avec certaines diffrences: - le sucre est le ribose la place du dsoxyribose; - la thymine est remplace par luracile (U) qui garde complmentarit avec lAdnine; - lARN na quun seul brin; cependant, il est capable de former structures secondaires double brin, certaines peuvent complexes en sappariant avec ses propres bases. .Il a une des tre

Les molcules de l ARN dans la cellule peuvent tre divises en trois groupes: * Les ARN ribosomiques (ARNr) forment les ribosomes et jouent un rle dans leur fonction (environ 80% des ARN); * Les ARN de transfert (ARNt) sont des molcules adaptatrices qui convertissent une squence de bases en une squence dacides amins. (Elles reprsentent 16% environ); * Les ARN messagers (ARNm) qui sont les molcules dARN formes lors de la transcription de lADN et qui servent damorce la synthse protique. (Elles reprsentent 2% environ).

Reproduction sexue et Brassage gntique

Si la reproduction asexue ou (conforme) engendre luniformit, La reproduction sexue, en revanche est gnratrice de diversit. Ceci est d un important brassage des chromosomes (et des gnes quils portent) au cours de deux processus biologiques fondamentaux qui caractrisent la reproduction sexue : la miose et la fcondation. Ces deux processus complmentaires sont indispensables au maintien de lassortiment chromosomique de lespce au cours des gnrations successives. 1- La miose : La miose est une suite de deux divisions cellulaires dun type particulier qui assure le passage de ltat diplode (2n) ltat haplode (n) et qui se droulent lors de la formation des gamtes : la premire division miotique disjoint les chromosomes homologues de telle sorte que chacune de cellules filles issus de cette division ne reoit que lun ou lautre des chromosomes de chacune des paires dhomologues la deuxime division miotique spare les chromatides de chaque chromosome Ainsi, lissu de la miose, les gamtes sont haplodes ; ils nont reu quune des quatre chromatides formant les deux chromosomes homologues apparis en prophase de la premire division miotique.

Reproduction sexue et Brassage gntique (Suite)

2- La fcondation : La fcondation correspond lunion de deux cellules spcialises, les gamtes : - le gamte mle ou spermatozode est une cellule petite et mobile, adapte remplir la fonction qui est la sienne, cest--dire transfrer dans le gamte femelle linformation gntique mle ; - le gamte femelle ou ovule est une grosse cellule dont le cytoplasme trs volumineux contient les organites et les rserves ncessaires aux premires phases du dveloppement embryonnaires.

Reproduction sexue et Brassage gntique (Suite)

Un grand nombre de combinaison chromosomique Le nombre de combinaisons chromosomiques possibles dans les gamtes (et donc dans les ufs rsultant de la fcondation) est dautant plus grand que le nombre de chromosomes de lespce est luimme lev : chez une espce qui comporterait seulement deux paires de chromosomes homologues, il y aurait 4 combinaisons chromosomiques quiprobables dans les gamtes haplodes, soit 16 combinaisons possibles dans les ufs diplodes ; chez lhomme, qui possde 23 paires de chromosomes, le nombre de combinaisons chromosomiques quiprobables est de 223 dans les gamtes, soit 8.388.614 dans les ufs.

La reproduction sexue et le cycle de vie

La reproduction sexue est le processus qui assure la transmission des caractres hrditaires. Elle implique deux phnomnes diffrents: la miose et la fcondation; lalternance de ces deux phnomnes constitue le cycle de vie de lorganisme. n 2n Levure 2n n Neurospora

fcondation

Homme
n n 2n 2n
Cycle de vie

mose

Evolution du taux dADN par cellule

Transmission des caractres hrditaires chez les haplodes: Neurospora crassa

La miose: lieu du brassage gntique

La miose Fcondation rplication mioseI miose II

2n

2n (x 2)

n (x 2)

Brassage interchromosomique II
fcondation rplication mioseI miose II

quiprobable

Pour 2 chromosomes, il y a deux arrangements possibles la mtaphase de la mioses I, et 22 = 4 gamtes differents Tous les gamtes (parentaux P et recombins R) sont quiprobables

La prrduction: brassage interchromosomique

Haplode (n)

diplode (2n)

Haplode (n)

f
f

c
Positionnement alatoire des chromosomes la mtaphase I
2 asques possibles et quiprobables

Le brassage interchromosomique au cours de la mose

mose 1

mose 2

8 types de gamtes possibles

Le brassage interchromosomique au cours de la mose

Quand n = 3, on obtient 23 = 8 types de gamtes Quand n = 4, on obtient 24 = 16 types de gamtes

Quand n = 5, on obtient 25 = 32 types de gamtes

Quand n = 23, on obtient 223 = 8 388 614 types de gamtes

Brassage intrachromosomique

non quiprobable

crossing-over

Le crossing-over a lieu au niveau dun chiasma lors de lappariement des chromosomes homologues en mtaphaseI Les gamtes (parentaux P et recombins R) ne sont pas

Le brassage intrachromosomique au cours de la mose

changes de segments de chromatides = crossingover mose 1

mose 2

8 x 8 = 64 types de gamtes (8 en labsence de crossing-over)

La postrduction: brassage intrachromosomique

Haplode (n) Diplode (2n) Haplode (n)

f f

c
Crossing-over
4 asques possibles et quiprobables

Le hasard intervient 2 fois au cours de la reproduction sexue : une premire fois au cours de la mose. Chaque gamte ne reoit que lun ou lautre des chromosomes de chacune des paires de chromosomes homologues (brassage interchromosomique). La diversit chromosomique des gamtes est encore augmente par le phnomne de crossing-over.

- une deuxime fois au cours de la fcondation. Cest le hasard qui

fait que tel spermatozode plutt que tel autre pntre dans lovule. Si le nombre (thorique) de gamtes diffrents produit par lhomme

et la femme dun couple est de 223 soit 8 388 614, le nombre

thorique de zygotes diffrents est de 8 388 614 x 8 388 614 soit plus de 70 000 milliards !

Mode de transmission des caractres hrditaires Gnes

- Chez un individu, les facteurs existent par paires formant des couples dallles .

Chromosomes
- Les chromosomes se trouvent par paires (chromosomes homologues) dans les cellules diplodes.

-Au moment de la - La miose, par rduction chromosomiques dissocie formation des gamtes les chaque paire de chromosomes homologues de sorte facteurs dun couple quun exemplaire dune mme paire. sgrgent et chaque gamte nen contient quun seul. - A la gnration suivante, les couples dallles se reconstituent. Ils sont forms dun allle dorigine paternelle et un allle dorigine maternelle.
- La fcondation, en runissant n chromosomes

paternels et n chromosomes maternels rtablit dans luf le nombre chromosomique 2n diplode.

Consquences du brassage gntique (chez les haplodes)

n
2n n

1re loi de Mendel

Sgrgation monognique: 1/2 Arg+ 1/2 Argchez les gamtes de l hybride

ttrades
Arg+ Arg-

Arg+

Arg+

1/2

Arg-

Arg-

1/2

Les brassages inter et intra ny changent rien

Consquences du brassage gntique (chez les diplodes)

Graine jaune

Graine verte

J/J

v/v

100%

J/v

F2 = F1 x F1 75% 25% 3/4 1/4 J 1/2 V 1/2

J 1/2 J/J v/J

v 1/2 J/v v/v

Croisement test
J/J x v/v

F1: J/v F1 x F1 J 1/2 J 1/2 v 1/2 3/4 J/J v/J 1/4 J/v v/v v 1/2 v1 1/2 Back cross F1 x v/v

J 1/2 J/v

v 1/2 v/v 1/2

Lhrdit dignique

fcondation

Am Bm
mioses

Am

Bm

Ap Bp
Gamtes parentaux

A m Bm Ap Bp
diplode

Ap Bp Am Bp Ap Bm
Gamtes descendants

P = R indpendance gnique P > R liaison gnique

Diplode: deux gnes indpendants

Graine jaune et lisse

Graine verte et ride

J, L J, L
J, L v, r
parental J, L 1/4 J/J, L/L v/J, r/L J/J, r/L v/J, L/L v, r 1/4

v, r v, r

100%

F1

F2 = F1 x F1

recombin J, r 1/4 v, L 1/4 J/v, L/L v/v, r/L J/v, r/L v/v, L/L

9/16
3/16

3/16
1/16

J, L 1/4 v, r 1/4 J, r 1/4 v, L 1/4

J/v, L/r J/J, L/r v/v, r/r v/J, r/r

J/v, r/r J/J, r/r v/v, L/r v/J, L/r

Back-cross pour deux gnes indpendants

Graine Graine Jaune et lisse verte et ride

F1

Graine verte et ride

x
100% F1 Back-cross J, L v, r
parental

v, r v, r
recombin J, r 1/4 v/J, r/r v, L 1/4 v/v, r/L

F2 = F1 x F1
v, r 1

J, L 1/4 v/J, r/L

v, r 1/4 v/v, r/r

9/16 3/16

3/16 1/16

1/4 1/4

1/4 1/4

Post rduction: la distance gne-centromre

1- La frquence dun crossing-over est proportionnelle la distance gntique qui spare les deux positions recombines. 2- La frquence des asques post-rduits est proportionnelle la frquence des crossing-over entre un gne suivi et son centromre. 3- La moiti des spores des asques post-rduits ont subit un crossingover entre le gne suivi et son centromre. Donc:

dg-c = F (recombins) = comprise entre 0 et 33,3 cM F(recombins) = f (post-rduits) = ( post-rduit) / (pr-rduits + post-rduits)

Lhrdit multignique

fcondation

Am Bm
mioses

Am

Bm

A p Bp
Gamtes parentaux

Am Bm Ap Bp
diplode

Ap Bp Am Bp Ap Bm
Gamtes descendants

P = R indpendance gnique P > R liaison gnique: dgenet = % R

Haplode: deux gnes lis

Neurospora

Arg +

Mioses
Diplode (+)

Arg + Arg + + Pro + Pro

Arg + Arg Pro ++ + Pro

Arg Pro Arg Pro + + + +

Fcondation
+ Pro

DP
Arg et Pro sont chacun monognique
DP > DR, le gne Argl+ est li au gne

DR

Pro/+

Pro/+

= (1/2 T + DR) / (T+DR+DP) x 100

Haplode: deux gnes lis

A chaque fois quon voit un DR, un DP et deux T arrivent par double crossing-over .

a A

B b
DP

a A T

B b
T

a A

B b
T

a A

B b

a A

B b

a A

B b

DP
Une formule plus raliste serait: d

T
= ( (T+2DR)) / (DP+DR+T) x 100

a-b

Haplode: deux gnes lis

d (cM)
DP > DR 2 gnes lis: d = ( T + DR) / (T + DP + DR) x 100 0 < d < 50cM DP = DR 2 gnes indpendants: - 2 gnes sur deux chromosomes

a A

B b

B b B b

A
a

- 2 gnes distants de plus de 50 cM

Diplode: deux gnes lis

B, V B, V
X

b, v b, v b, v b, v R = (1- P)
bV (1-P)/2 bV/bv 185 Bv (1-P)/2 Bv/bv 206

B, V b, v
x F1 P=P
BV P/2 BV/bv 965 bv P/2 bv/bv 944

Test cross
bv1

965

944
d

b-v

206

185

= (1-P) x 100 = (f(b,V) + f(B,v) ) x 100 = ((206+185)/2300) x 100 = 17 cM

Distance gntique : rsum

Haplobiontiques spores ordonnes distance gne-gne :

d
g-g

= ( T + DR) / (T + DP + DR) x 100 < 50cM

Diplobiontiques distance gne-gne :

g-g

= (1-P)x100 < 50cM

Lhrdit lie au sexe: La couleur des yeux chez la Drosophile

XR/XR x Xb/Y

F1

XR/Xb

XR/Y

50% 100%

50%

F2 = F1 x F1

XR 1/2 XR 1/2 XR/XR Xb 1/2 XR/Xb

Y1/2 XR/Y Xb/Y

Lhrdit lie au sexe: La couleur des yeux chez la Drosophile

Xb/Xb x XR/Y

F1

Xb/XR

Xb/Y

50% 50%

50% 50%

F2 = F1 x F1

Xb 1/2 XR 1/2 Xb/XR Xb 1/2 Xb/Xb

Y1/2 XR/Y Xb/Y

Transmission dallles multiples Un gne peut exister sous plus de 2 formes (allles) diffrentes. Exemple: le gne dterminant le groupe sanguin existe sous 3 formes diffrentes : allle A, allle B et allle O Chaque individu ne possde que 2 de ces allles (sur les 2 chromosomes 9). Six gnotypes sont donc possibles : AA AO BB BO AB et OO Combien de phnotypes ? (A), (B), (AB) et (O)

Compatibilit entre groupes sanguins

Groupes sanguins
A
Peut donner du sang Peut recevoir du sang de

Antigne

Anticorps

anti-B

A et AB

A et O

anti-A

B et AB

B et O

AB

A et B

aucun anti-A et anti-B

AB A, B, AB et O

A, B, AB et O

aucun

Hrdit des groupes sanguins

famille 1
A B

famille 2

AB

AB

AB

AB

Interprtation la plus probable :

gnotype des parents : AA et BB gamtes des parents : A et B gnotype des enfants : AB

Le gnotype des parents ne peut pas tre AA et BB car dans ce cas ils nauraient que des enfants du groupe AB Le gnotype de 2 est AO (AA impossible). Le gnotype de 3 est BO (BB impossible). Lallle O est domin par les allles A et B. Gnotype des parents : AO et BO

AB 1

A 2

B 3

O 4

Aucun des enfants na lallle O, mais on ne peut exclure que le pre soit AO ou la mre BO.

Hrdit des groupes sanguins : bilan

Une personne peut tre:
AA Groupe A (45%) AO BB Groupe B (9%) BO AB OO Groupe AB (3%) Groupe O (42%) A et B sont codominants tous deux dominant O: A=B > O

Le facteur Rhsus
Le Rhsus (+ ou -) est dtermin par une paire d'allles situs sur une autre paire de chromosomes que les allles A, B et O. Lallle R (dominant) dtermine la prsence de la protine Rh (Rh+). Lallle r (rcessif) dtermine l'absence de la protine Rh (Rh-) Rh+ (85% de la population) = RR ou Rr Rh- (15% de la population) = rr

Quel serait le gnotype d'un homme O positif (O+) ?

OO, RR ou OO, Rr

Les groupes sanguins : exercices

Mr X est du groupe A et Mme X du groupe O. Ils ont 4 enfants dont un adoptif : Sophie et Nicole sont du groupe A, Pierre du groupe B et Michel du groupe O. Pouvez vous dterminer quel est lenfant adopt ? Prcisez le gnotype de Mr et Mme X. Gnotype de Mr X : AO

Gnotype de Mme X : OO
Mr et Mme X nont pas lallle B. Pierre est donc leur enfant adoptif Gnotype de Michel : OO. Il a reu un allle O de son pre et un autre allle O de sa mre. Mr X est donc de gnotype AO et non AA.

Interaction des gnes

- 9 :7 Le phnotype apparat chez lhomozygote pour un des allles rcessifs. - 9 :4 :3 - 9 :6 :1 Un allle du 1er gne cache les allles du 2me gne. Effet additif des allles rcessifs de 2 gnes contrlant 1 caractre. - 15 :1 Le phnotype napparat que chez lhomozygote rcessif pour les deux gnes. - 13 :3 Le phnotype rcessif du 1er gne est supprim par lallle rcessif du 2me gne.

Lalbinisme est d labsence dun pigment, la mlanine, qui donne leur coloration aux poils, la peau et liris de lil.

Je ne suis pas une hermine albinos. Voyez vous pourquoi ?