LES ENTEROBACTERIACEAE

Hortense GONSU KAMGA FMSB / CHU-Yaound

GENERALITES SUR LA FAMILLIE ENTEROBACTERIACEAE

DES

OBJECTIFS Etre capable de classer les Entrobactries Connatre les caractres gnraux des Entrobactries Etudier le profil de sensibilit des Entrobactries vis--vis des antibiotiques

PLAN

I- HABITAT II-MORPHOLOGIE III-CULTURE IV-CARACTERES BIOCHIMIQUES V- CARACTERES ANTIGENIQUES VI-CONCLUSION

I-HABITAT
-Bactries gnralement htes normaux ou pathologiques, suivant les espces microbiennes , du tube digestif de lhomme et des animaux

-Certaines sont responsables dinfections humaines parfois svres(fivre typhode ,dysenterie bacillaire ,peste ) -Dautres groupes prolifrent en abondance dans lenvironnement (sol , eau )

II- MORPHOLOGIE
-Bacilles asporuls Gram ngatif -2 4m de long sur 0,4 0,6m de large -Extrmits arrondies -Bactries mobiles ciliature pritriche -Dautres sont toujours immobiles (Klebsiella ,shigella Yersinia pestis) -Prsence dune capsule visible au microscope (Klebsiella)

III-CULTURE
- Cultivent facilement sur milieux ordinaires.

- Exigences nutritionnelles gnralement rduites.

- Sur milieux gloss , les colonies sont

habituellement lisses ,brillantes de structure homogne de 2 3mm de diamtre.

IV-CARACTERES BIOCHIMIQUES
- Arobies anarobies facultatifs. - Oxydase ngative.

- Rduisent les nitrates en nitrites.

- Utilisent les sucres par mtabolisme fermentatif,

avec ou sans production de gaz. - Catalase positive.

V-CARACTERES ANTIGENIQUES
Les Enterobactriaceae possdent: - Un antigne commun (antigne de Kunin). - Des antignes de paroi ou antigne O. tjrs prsents - Des antignes de capsule ou de surface ou antigne K. - Des antignes flagellaires ou antignes H. Ltude de ces diffrents antignes permet de classer en srotypes les bactries appartenant une espce ou un genre.

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

SENSIBILITE HABITUELLE AUX ATB

1-Rsistance naturelle certaines familles dATB hydrophobes -lactamines * PniG/V * Pni M Macrolides: Erythromycine Lincosamides : lincomycine, clindamycine Synergistines: pristinamycine Glycopeptides : teicoplanine, vancomycine

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

SENSIBILITE HABITUELLE AUX ATB

2-Mais encore nombreux ATB actifs -lactamines * Pni large spectre

* Inhibiteurs de -lactamases * Carbapnmes * Cphalosporines 1G, 2G, 3G * Monobactame Aminoglycosides Ttracyclines 1G, 2G, 3G

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

SENSIBILITE HABITUELLE AUX ATB

2-Mais encore nombreux ATB actifs Phnicols: Chloramphnicol,Thiamphnicol Quinolones: classiques et fluoroquinolones Sulfamides: Sulfamthoxazole Autres : Trimethoprime,Co-trimoxazole, Nitrofuranes, Fosfomycine Polypeptides cycliques

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLE *Intrt taxonomique de lantibiogramme *Grande diversit de sensibilit ou de rsistance naturelle selon les groupes ou espces -lactamines

* Groupe1: E.coli, P.mirabilis, Salmonella, Shigella * Groupe 2: pnicillinase (Pase) bas niveau K. pneumoniae, K. oxytoca,E. hermannii, C.koseri (C.diversus, Levinia)

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLE

-lactamines * Groupe 3: E.cloacae, E.aerogenes, S.marcescens, C.freundii, Morganella morganii Cphalosporinase(Case) avec diverses expressions * Groupe 4: pnicillinase + cphalosporinase: Yersinia enterocolitica (pathogne) * Groupe 5: BLSE de bas niveau: P.vulgaris,P.penneri, Serratia fonticola, Kluyvera ascorbata,Rhanella aquatilis, Citrobacter sedlakii. Cphalosporinase sensible lacide clavulanique

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLE
Autres ATB

* Aminoglycosides Sensibles naturellement, sauf S.marcescens * Quinolones Sensibles naturellement avec un gradient dactivit * Autres: Fosfomycine: moindre activit de K. pneumoniae et de K.oxytoca

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLE
Autres ATB

* Polypeptides cycliques:

sensibles naturellement sauf Proteus-Providencia-Morganella (rsistance homogne) Serratia marcescens (rsistance htrogne)

* Trimethoprime
faible sensibilit des Proteus-Providencia

* Ttracyclines:

sensibles naturellement sauf P.mirabilis

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

CONCLUSIONS Ncessaire connatre dans la validation biologique:

cohrence ou incohrence avec identification propose Grande difficult apparente dautant quil y a divers phnotypes de rsistance naturelle Grande difficult apparente dautant quil y a aussi les phnotypes de rsistance acquise Systmes experts avec automates apparaissent une solution davenir (labo grosse clientle)

VI-CONCLUSION
Ltude des caractres morphologiques et biochimiques permet de dfinir lappartenance la famille des Entrobactriaceae. La famille des entrobactries regroupe les genres suivants: Escherichia coli-Alkalescens-Citrobacter-Levinea; Klebsiella-Entrobacter-Serratia-Hafnia(groupe KESH) Proteus; Salmonella; Shigella; Yersinia;

ESCHERICHIA COLI

OBJECTIF: Connatre les caractres didentification des Escherichia coli.

PLAN
I- HISTORIQUE II-HABITAT III- POUVOIR PATHOGENE IV-CARACTERES MORPHOLOGIQUES V-CARACTERES CULTUTAUX VI-CARACTERES BIOCHIMIQUES VII-PROPRIETES ANTIGENIQUES VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

I-HISTORIQUE
Les Escherichia coli ou colibacilles ont t dcouverts par Escherich en 1885. Ils sont la fois de banals saprophytes de lintestin et dindiscutables agents pathognes

II-HABITAT
-Htes normaux de lintestin; -Peut galement tre retrouv au niveau de diverses muqueuses ; -Prsent dans lenvironnement

III-POUVOIR PATHOGENE
Espce la plus frquemment isole dans le laboratoire de bactriologie Infections de 2 types: Infections extra-intestinales voies urinaires+++ voies gnitales et biliaires septicmies

III-POUVOIR PATHOGENE
Infections du tractus digestif dues des souches particulires:
Les ECEP: E.coli entropathognes responsables de

gastroentrites infantiles Les ECEI: E.coli entro-invasifs qui ont la proprit de pntrer dans les cellules et de provoquer des syndromes dysentriformes Les ECET: E.coli entrotoxinognes qui scrtent des toxines de 2 types:ST (thermostable) et LT (thermolabile);possde des facteurs dadhsion la muqueuse intestinale, souches responsables de syndromes cholriformes.

IV-CARACTERES MORPHOLOGIQUES
Bacille Gram ngatif

Gnralement mobilit pritriche

2 6m de long 1,5mm de diamtre des colonies en culture

V-CARACTERES BIOCHIMIQUES
Les E. coli sont: Oxydase Nitrate rductase + Glucose + Lactose+ Ure Indole + Citrate VP-

V-CARACTERES BIOCHIMIQUES
Lysine dcarboxylase +

ODC +
ADH-

VI-CARACTERES CULTURAUX
La plupart des souches dE.coli se multiplient

rapidement sur glose ordinaire. Les colonies de 1,5 2mm de diamtre ont un aspect : -Rond bord rgulier -Lisse

VI-CARACTERES CULTURAUX
Les souches atypiques:

2 3% des E coli forment des colonies naines

; on parle dans ce cas des E coli thymine less. Dans ce cas ils ne se multiplient que sur le Muller Hinton + 5% de sang (la pousse est normale) >1% de E coli donnent des colonies muqueuses bombes avec une tendance confluer. Ces bactries sont immobiles et entoures dune capsule polysaccharidique.

VII-CARACTERES ANTIGENIQUES
Les Ag somatiques ou Ag O: ce sont les lypo

polysaccarides de surface. Les Ag flagellaires ou Ag H: valables pour les bacilles mobiles. Les Ag capsulaires ou Ag K: Les Ag communs ou Ag F1 ou fimbriae type 1: Les souches qui produisent les Ag F1 sont hmagglutinantes

VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

1) PRELEVEMENT
-

Eviter toute contamination; Respecter les rgles de prlvement Gnralement ne ncessite pas de milieu de transport : car aro-anarobie facultative

VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

2) EXAMEN DIRECT

- Etat frais (observer mobilit) -Coloration de Gram: bacille Gram ngatif

VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

3) ISOLEMENT -Choix du milieu de culture en fonction du prlvement . CLED pour ECBU Mac Conkey Drigalski EMB (reflet mtallique)

VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

4) IDENTIFICATION -Tests biochimiques: Galerie classique (en tubes) Galerie API 20E 5) ANTIBIOGRAMME Bien choisir lventail dantibiotiques 6) AUTRES PCR Tests d amplification gnique

MERCI