Bioqumica

Docente Diego Quiroga rea de Qumica Politcnico Los Alpes 2013

Carbohidratos
H H HO H H O OH H OH OH OH

OH C HO H H O H OH OH OH

Son compuestos abundantes en la naturaleza.

Son compuestos polihidroxilados que poseen caractersticas aldehdicas (aldosas) y cetnicas (cetosas), de confinacin relativa D o L; son pticamente activos.

D-Glucosa

D-fructosa

Llamados comnmente azcares

Clasificacin de los carbohidratos

Simples (monosacridos)
H O

OH O

Complejos (Polisacridos)
CH 2OH H OH H H O H OH O H CH 2OH O H HO H

H H

O
H OH OH OH

OH OH

H H

OH OH OH

HO OH H

CH 2OH

aldotriosa

aldotetrosa

cetopentosa

Triosas
OH O H H H OH OH OH OH

Tetrosas
H H H H H

Pentosas
O OH
CH 2OH

sacarosa

CH 2OH O H H OH O H H O H OH H O H H OH

CH 2OH O H H H O OH

OH OH OH OH

H OH O H OH H H

cetohexosa

aldoheptosa

amilosa

Hexosas

Heptosas

Serie de las D-Aldosas

H H H O OH OH OH

H H

O OH OH
H HO H O H OH OH

D-gliceraldehdo

D-Eritrosa
H H H H O OH OH OH OH H HO H H O H OH OH OH H H HO H O OH H OH OH

D-Treosa
H HO HO H O H H OH OH

D-Ribosa
H H H H H O OH OH OH OH OH H HO H H H O H OH OH OH OH

D-Arabinosa
H H HO H H O OH H OH OH OH
H HO HO H H O H H OH OH OH H H H HO H

D-Xilosa
O OH OH H OH OH H HO H HO H O H OH H OH OH H H HO HO H

D-Lixosa
O OH H H OH OH H HO HO HO H O H H H OH OH

D-Alosa

D-Altrosa

D-Glucosa

D-Manosa

D-Gulosa

D-Idosa D-Galactosa D-Talosa

Serie de las D-cetosas

OH O OH

Dihidroxiacetona
OH O H OH OH

OH O H H OH OH OH

OH O HO H H OH OH

D-Eritrulosa

D-Ribulosa
OH O H H H OH OH OH OH
HO H H OH O H OH OH OH

D-Xilulosa
OH O H HO H OH H OH OH HO HO H OH O H H OH OH

D-Psicosa

D-Fructosa

D-Sorbosa

D-Tagatosa

Estructuras cclicas de los monosacridos: formacin de hemiacetales

O H R catlisis cida OH H R OR
1

OH

Si los grupos carbonilo e hidroxilo estn en la misma molcula, se puede llevar a cabo una adicin nucleoflica intramolecular, que da origen a un hemiacetal cclico: H O Proyeccin de Haworth
OH

H HO H H

OH H OH OH OH H

CH2OH OH H OH OH HO OH H H O
H H OH HO H OH H OH O H

- D-glucopiranosa
HOH2C

D-Glucosa

O
4H- pirano

HO

O OH OH

HO

Conformacin tipo silla

Proyeccin de Haworth

Por convencin, los anillos se dibujan colocando el tomo de oxigeno del hemiacetal arriba a la derecha. Un grupo -OH a la derecha en la proyeccin de Fischer esta en la cara inferior del anillo, mientras que un grupo OH a la izquierda se encuentra en la cara arriba del anillo.
H H CH 2OH O HO H H H OH OH OH H OH H b H HOH 2C a b OH H HO O CH 2OH HO a HO OH H OH H H OH OH O OH

80%

Forma piranosa
O HO OH OH H

20%

D-fructosa

Forma furanosa

O
4H- pirano furano

Anmeros de los monosacridos

OH

CH2OH OH HO OH H H OH H H C OH O
H H OH HO H OH H O H C* OH

trans

D-Glucosa

-D-Glucopiranosa (36%) (Anmero : el -OH y -CH2OH estn en posicin trans)

OH

Centro anomrico

cis
O OH

CH2OH OH HO OH H H OH O H C OH H
H H OH HO H OH H

C* H

D-Glucosa

-D-Glucopiranosa (64%) (Anmero : el -OH y -CH2OH estn en posicin cis)

Disacridos
Contienen un enlace acetal glicosdico entre el carbono anomrico de un azcar y un grupo OH en alguna posicin del otro azcar.
OH

OH H H OH HO H OH H O H OH O H H H

OH
OH

H H OH O O H OH HO H H H OH H OH H

O OH

O H
H

H OH OH

Maltosa, un -glicosido 1,4 [4-O-(-D-Glucopiranosil)--D-Glucopiranosa] Mutarrotacin de disacridos reductores

OH H H OH Glu O H OH H H OH Glu O O OH H H

Celobiosa, un -glicosido 1,4 [4-O-(-D-Glucopiranosil)--D-Glucopiranosa]

OH OH H H Glu O O H OH OH H H H OH OH O H

OH

Maltosa o celobiosa ( anmeros)

Maltosa o celobiosa ( anmeros)

OH O OH H OH HO H OH H H OH H H O O H OH H H

OH

Lactosa, un 1,4--glicsido [4-O-(-D-Galactopiranosil)--D-Glucopiranosa]

OH H H OH HO H OH H O OH OH H H O H HO O OH H

Sacarosa, un 1,2-glicsido [2-O-(-D-Glucopiranosil)--D-fructofuranosa]

AMINOCIDOS Y PPTIDOS

Los aminocidos (aa.) son las unidades estructurales que constituyen las protenas y estn unidos por enlaces peptdicos dando lugar a: Son solubles en H2O. Son inicos. Funden con descomposicin Reacciones qumicas propias del grupo NH2 del COOH y de R

REPRESENTACIN QUMICA DE UN AMINOCIDO

Las valencias del carbono se saturan con un tomo de H y con un grupo variable denominado radical R. Segn ste se distinguen 20 tipos de aminocidos que son constituyentes de protenas.

Los Ocho (8) Esenciales

isoleucina: Funcin: Junto con la (L)-leucina y la Hormona del Crecimiento intervienen en la formacin y reparacin del tejido muscular. leucina: Funcin: Junto con la (L)-isoleucina y la hormona del crecimiento (HGH) interviene con la formacin y reparacin del tejido muscular. lisina: Funcin: Es uno de los ms importantes aminocidos porque, en asociacin con varios aminocidos ms, interviene en diversas funciones, incluyendo el crecimiento, reparacin de tejidos, anticuerpos del sistema inmunolgico y sntesis de hormonas. metionina: Funcin: Colabora en la sntesis de protenas y constituye el principal limitante en las protenas de la dieta. El aminocido limitante determina el porcentaje de alimento que va a utilizarse a nivel celular.

Los Ocho (8) Esenciales

fenilalanina: Funcin: Interviene en la produccin del colgeno, fundamentalmente en la estructura de la piel y el tejido conectivo, y tambin en la formacin de diversas neurohormonas.

triptfano: Funcin: Est implicado en el crecimiento y en la produccin hormonal, especialmente en la funcin de las glndulas de secrecin adrenal. Tambin interviene en la sntesis de la serotonina, neurohormona involucrada en la relajacin y el sueo. treonina: Funcin: Junto con la con la (L)-metionina y el cido asprtico ayuda al hgado en sus funciones generales de desintoxicacin.
valina: Funcin: Estimula el crecimiento y reparacin de los tejidos, el mantenimiento de diversos sistemas y balance de nitrgeno.
Debemos recordar que, debido a la crtica relacin entre los diversos aminocidos y los aminocidos limitantes presentes en cualquier alimento. Solo una proporcin relativamente pequea de aminocidos de cada alimento pasa a formar parte de las protenas del organismo. El resto se usa como fuente de energa o se convierte en grasa si no debe de usarse inmediatamente.

Enlaces peptdicos y puentes disulfuro

Enlace planar puesto que posee carcter de doble enlace lo que impide su libre rotacin.

ENLACE PEPTDICO
Cuando reaccionan el grupo cido de un aminocido con el grupo amino de otro, ambos aminocidos quedan unidos mediante un enlace peptdico. Se trata de una reaccin de condensacin en la que se produce una amida y una molcula de agua. La sustancia que resulta de la unin es un dipptido.

REACCIN DE FORMACIN DEL ENLACE PEPTDICO

+ H2O AMIDA

Un Pptido es una molcula formada por la unin de un bajo nmero de aminocidos mediante enlaces peptdicos. Oligopptido cuando el nmero de aa. que forma la molcula no es mayor de 10. Polipptido cuando el nmero de aa. que forma la molcula es superior a 10 .

Protena. Cuando el nmero de aa. que forma la molcula es superior a 50 aa.

Pptidos
Insulina: Es producida en el pncreas en una forma proactiva conocida como proinsulina y se encarga de reducir la concentracin de glucosa en la sangre a travs de la incorporacin de glucosa de la sangre hacia las clulas. Su dficit provoca la diabetes mellitus y su exceso provoca hiperinsulinismo con hipoglucemia.

Pptidos

El glucagn, Acta cuando el nivel de glucosa disminuye en la sangre aumentando los niveles de la misma, los efectos principales del glucagon sobre el metabolismo de la glucosa son: Desintegracin del glucgeno (glucogenolisis). Aumento de la gluconeognesis.

LPIDOS

LPIDOS
LPIDOS
Sustancia qumica Insoluble en agua Soluble en disolventes apolares

Clasificacin

Naturaleza Qumica

Funciones

Saponificables

No Saponificables

Estructural

Saponificacin

Esterificacin

Simples

Complejos

Esteroides

Transportadora

Protectora
Acilglicridos

Fosfolpidos

Colesterol

Energtica Ceras Glucolpidos Vitamina D

LPIDOS
FUNDAMENTOS Son un conjunto muy heterogneo de biomolculas cuya caracterstica distintiva aunque no exclusiva ni general es la insolubilidad en agua, siendo por el contrario, solubles en disolventes orgnicos (benceno, cloroformo, ter, hexano, etc.).
Los lpidos, pueden ser separados fcilmente de otras biomolculas por extraccin con solventes orgnicos y pueden ser separados por tcnicas experimentales como la cromatografa de adsorcin, cromatografa en capa delgada (CCD) y cromatografa de fase reversa.

LPIDOS
CARACTERSTICAS DE SU ESTRUCTURA QUMICA
Es una cadena hidrocarbonada
Hidrofobicidad Unidos covalentemente con otras biomolculas: glicolpidos, las protenas aciladas (unidas a un cido graso) o las protenas preniladas (unidas a lpidos de tipo isoprenoide). Asociaciones no covalentes de los lpidos con otras biomolculas: lipoprotenas y de las estructuras de membrana

LPIDOS
HIDROFOBICIDAD DE LOS LPIDOS
molcula de agua lpidos

dispersin de lpidos en medio acuoso

agregacin de lpidos en medio acuoso

Entre el aceite y el agua no existen fuerzas de atraccin. Se establecen interacciones hidrofbicas entre las molculas de aceite.

LPIDOS
IMPORTANCIA EN EL VALOR NUTRICIONAL
Las guas alimentarias como la pirmide nutricional sugieren que las grasa se consuman con moderacin.
Las grasas son esenciales para numerosas funciones del organismo (linoleico, linolnico) se requieren para el crecimiento. Contienen 2 veces ms de caloras que las protenas y los carbohidratos. Se podrn usar mtodos convencionales y biotecnolgicos para la creacin de grasas y aceites ms saludables .

LPIDOS
FUNCIONES BIOLGICAS
FUNCIN ESTRUCTURAL

LPIDOS
FUNCIONES BIOLGICAS
FUNCIN INFORMATIVA Los organismos pluricelulares han desarrollado distintos sistemas de comunicacin entre sus rganos y tejidos. As, el sistema endocrino genera seales qumicas para la adaptacin del organismo a circunstancias medioambientales diversas. Estas seales reciben el nombre de hormonas. Muchas de estas hormonas (esteroides, prostaglandinas, leucotrienos, calciferoles, etc) tienen estructura lipdica.

LPIDOS
FUNCIONES BIOLGICAS
FUNCIN INFORMATIVA

LPIDOS
CLASIFICACIN La heterogeneidad estructural de los lpidos dificulta cualquier clasificacin sistemtica. El componente lipdico de una muestra biolgica puede ser extrado con disolventes orgnicos y ser sometido a un criterio emprico

LPIDOS
Los lpidos se clasifican en dos grupos, atendiendo a que posean en su composicin cidos grasos (lpidos saponificables) o no lo posean ( lpidos insaponificables ).
Lpidos saponificables Simples Acilglicridos Cridos o ceras Lpidos insaponificables Terpenos Esteroides Prostaglandinas Complejos Fosfolpidos Glucolpidos

LPIDOS
CLASIFICACIN
Los lpidos se clasifican basados en la Reaccin de Saponificacin

LPIDOS SIMPLES SAPONIFICABLES

acilgliceroles

LPIDOS SIMPLES SAPONIFICABLES

Grasas y aceites

LPIDOS SIMPLES SAPONIFICABLES

Cridos o ceras

H3C

OH

+
H3C Esterificacin

O OH

O H3C H3C O

Palmitoato de miricilo cera de abeja

LPIDOS
CLASIFICACIN ACIDOS GRASOS
Segn la naturaleza de la CADENA HIDROCARBONADA

CIDOS GRASOS SATURADOS CIDOS GRASOS INSATURADOS DERIVADOS DE CIDOS GRASOS

LPIDOS
CLASIFICACIN

Cadena hidrocarbonada saturada, (enlaces simples), lineales.

Cadena hidrocarbonada Insaturada, (enlaces dobles). presentan un ngulo en la(s) zona(s) del doble enlace.

LPIDOS
DERIVADOS DE ACIDOS GRASOS
HIDROXICIDOS GRASOS: contienen grupos hidroxilo en la cadena hidrocarbonada. Ejemplos son el cido cerebrnico (2-hidroxi C24:0), el hidroxinervnico (2-hidroxi C24:115), ambos presentes en esfingolpidos de cerebro, y el cido ricinoleico (12-hidroxi C18:19), presente en el aceite de ricino.

cerebrnico hidroxinervnico ricinoleico

LPIDOS COMPLEJOS SAPONIFICABLES Igual que las ceras, las grasas y los aceites, los fosfolpidos son steres de dos cidos carboxlicos, adems de ser disteres del cido fosfrico

fosfoacilgliceroles

LPIDOS COMPLEJOS SAPONIFICABLES

LPIDOS COMPLEJOS SAPONIFICABLES

esfingolpidos

LPIDOS COMPLEJOS SAPONIFICABLES

esfingolpidos

LPIDOS COMPLEJOS SAPONIFICABLES

esfingolpidos

LPIDOS INSAPONIFICABLES Terpenos

LPIDOS INSAPONIFICABLES Terpenos

LPIDOS INSAPONIFICABLES Terpenos

LPIDOS INSAPONIFICABLES Terpenos

LPIDOS INSAPONIFICABLES.

Esteroides

LPIDOS INSAPONIFICABLES
Prostaglandinas

LPIDOS INSAPONIFICABLES
Prostaglandinas

LPIDOS INSAPONIFICABLES
Prostaglandinas

LPIDOS INSAPONIFICABLES
Prostaglandinas

cidos nucleicos: Introduccin Bases, nuclesidos y nucletidos

NH2 N O
-

N N

O P O CH2 OH OH H

O H

OH Base

Pentosa Fosfato

Nuclesido Nucletido

NH2 N O P O CH2 O
-

Polinucletido

N N NH2 N

OH O P O CH2 O
-

N N NH2 N

Enlace fosfodister

OH O P O CH2 O
-

N N

Enlace b-glicosdico
O OH

Purinas
6 1 2 5 7

Pirimidinas
4 3 8 2

N N
3 4

N NH
9

N N
1

5 6

NH2 N N N NH

Adenina: 6-amino purina

O HN H2N N N NH

Guanina: 2-amino 6-oxo purina

NH2 N O N O HN O N O HN O N
Timina: CH3 2,4-dioxo 5-metil pirimidina
Uracilo: 2,4-dioxo pirimidina Citosina: 2-oxo 4-amino pirimidina

Nuclesidos, 1
Unin de una base a una pentosa a travs de un enlace de tipo b-N-glicosdico:

H 2N N HOCH2 N N N

Enlace b-N-glicosdico

H 2N N N N

HOCH2

OH

OH

OH

Adenosina (pentosa es ribosa)

Desoxiadenosina (pentosa es desoxirribosa)

Purinas: enlace entre carbono anomrico (1) y N9 de la base

Nuclesidos, 2

NH2 N HOCH2 O O N HOCH2 O O N N

NH2

OH

OH

OH

Citidina

Desoxicitidina

Pirimidinas: enlace entre carbono anomrico (1) y N1 de la base

Numeracin
H 2N 6 7N 5' HOCH2 4' 3' OH 8 O 2' OH N9 1' 5 4 N 3 N1 2

Nomenclatura

Base Adenina Guanina

Nuclesido Adenosina Guanosina

Citosina Uracilo Timina

Citidina Uridina Timidina

Numeracin de tomos en los nuclesidos

Uridina 5 4 3 2 1

Conformacin de nuclesidos

Adenosina (anti-)

Adenosina (syn-)

Antibiticos nucleosdicos
NH2 N N O N N
Puromicina Antibitico inhibidor de la sntesis de protenas

NH2 N HOCH2 OH N HOCH2 O N N

Cordicepina Medicamento contra el cncer; es un tipo de antibitico antitumoral.

NH H 3C O CH2 CH NH2 C O

OH

Antivirales

Citosin arabinsido (Vidarabin) Activo contra herpes y varicela

Antirretrovirales, ej. VIH

O HN HOCH2 O O N CH3 HN HOCH2 C O O C N

O CH3

N3 AZT, Zidovudina

D4T, Estavudina

Nucletidos (ribonucletidos)

5-nucletido (5-CMP)

3-nucletido (3-CMP)

2-nucletido (2-CMP)

Nucletidos (desoxirribonucletidos)

5-dTMP

3-dCMP

Nucletidos cclicos

3,5 Adenosin monofosfato cclico, cAMP

5-Adenosina monofosfato, AMP

5-Adenosina difosfato, ADP

5-Adenosina trifosfato, ATP

Nuclesido polifosfatos

Propiedades de los nucletidos

1. Carcter cido debido al fosfato 2. Solubilidad incrementada respecto al nuclesido 3. Misma reactividad que bases y nuclesidos

ATP como donador de energa

Polinucletidos

Extremo 5

Enlace fosfodister

Polinucletido

Extremo 3

Formas de representacin de polinucletidos

5- CpApTpTpGpCpGpGpApApTpGpCpCp -3 5-CATTGCGGAATGCC-3 3-GTAACGCCTTACGG-5

3 5

Polinucletido en doble hlice

Modelo de Watson - Crick, A

3.4 nm

1. El DNA es una doble hlice plectonmica y dextrgira, con un paso de rosca de 3.4 nm

Modelo de Watson-Crick, B
5 3

2. Cada una de las dos hlices es un polinucletido entrelazado con el otro de manera que su polaridad es opuesta (es decir, corren en sentido antiparalelo)

3. El eje ribosa-fosfato se sita hacia el exterior de la doble hlice, en contacto con el solvente

Modelo de Watson-Crick, C

4. Mientras que las bases nitrogenadas (anillos planares) se sitan, apiladas, hacia el interior de la estructura, en un entorno hidrofbico

Modelo de Watson-Crick, D

0.34 nm

5. Las bases estn situadas en planos aproximadamente perpendiculares al eje mayor de la doble hlice. La distancia entre planos es de 0.34 nm

Modelo de Watson-Crick, E

6. Cada base interacciona con su opuesta a travs de enlaces de hidrgeno, y de manera que:

(a) Adenina (A) slo puede interaccionar con timina (T) (y viceversa), a travs de dos puentes de hidrgeno, y

(b) Guanina (G) slo puede interaccionar con citosina (C) (y viceversa), a travs de tres puentes de hidrgeno

Modelo de Watson-Crick, F 8. La desoxirribosa en forma furansica

7. La base est situada en posicin anti-

5 4 3

2 9. El anillo furansico est en conformacin endo-2

Surco estrecho 10. El eje de la doble hlice no pasa por el centro geomtrico del par de bases. Esto determina que la hlice presente un surco ancho y un surco estrecho Surco ancho

Modelo de Watson-Crick, G

Geometra de la doble hlice (DNA-B)

Paso de rosca 3.4 Distancia entre planos de bases

3.4 nm 0.34 nm

0.34
Pares de bases/vuelta Anchura 10 2.4 nm

2.4

DNA-A
1.Doble hlice plectonmica y dextrgira 2. Planos de bases oblicuos respecto al eje de la doble hlica 3. Propio de RNAs en doble hlice, o de hbridos DNA-RNA

4. Ms ancha y corta que DNA-B

DNA-Z
1. Doble hlice plectonmica y levgira
2. Zonas de secuencia alternante -GCGC3. Conformacin de G es syn- en lugar de anti4. Ms estrecha y larga que DNA-B