Anda di halaman 1dari 31

SINTESIS PROTEIN

From RNA to Proteins


Dalam proses sintesis protein, translasi RNA menjadi protein, dan keterlibatan ribosom adalah merupakan tahapan yang paling penting

Teori one gene one protein

Reaksi bio kimia dikatalisis oleh enzim, dan biasanya terorganisasi dalam suatu rantai reaksi yang dikenal dengan metabolic pathways (jalur metabolik). Hilangnya aktivitas dalam satu enzim dapat menonaktifkan keseluruhan jalur. George Beadle dan Edward Tatum (1930s dan 1940s), mengemukakan hipotesis "one gene one enzyme hypothesis. Mereka menggunakan sinar X untuk membuat mutasi pada neurospora, mutasi ini mempengaruhi satu gen dan satu enzim pada jalur metabolisme tertentu.

Satu gene mengkodekan produksi satu protein. Maka kemudian "One gene one enzyme" dimodifikasi menjadi "one gene one polypeptide" mengingat banyak protein (seperti hemoglobin) tersusun lebih dari satu polipeptida.

Dogma sentral dalam Biologi molekuler


Dogma sentral: Arah informasi (kecuali reverse transkripsi) adalah dari DNA ke RNA melalui proses transkripsi (transcription), dan kemudian pembentukan protein melalui proses translasi (translation). Transkripsi adalah pembentukan molekul RNA dari DNA. Translasi adalah penyusunan DNAdari sekuen asam amino (polypeptide) dari molekul RNA.

Dogma sentral dalam Biologi molekuler

Perangkat yg diperlukan dalam sntesis protein


1. 2.

3.
4. 5.

mRNA tRNA rRNA Ribosom Enzym


Messenger RNA (mRNA) is the blueprint for construction of a protein. Ribosomal RNA (rRNA) is the construction site where the protein is made. Transfer RNA (tRNA) is the truck delivering the proper amino acid to the site at the right time.

tRNA

Transkripsi

Transcription: making an RNA copy of a DNA sequence RNA polymerase opens the part of the DNA to be transcribed. Only one strand of DNA (the template strand) is transcribed.

Transkripsi

Kodon: rangkaian tiga basa berdampingan yg berdasarkan kode genetik mampu mengendalikan satu asam amino Ikatan asam amino dengan tRNA pada ujung 3 dpt tjd krn kerja Ligase-aminoasil-tRNA. Antikodon tRNA mrpk pasangan antiparalel kodon mRNA.

Ribosom

Ribosome adalah organel di dalam sel tempat terjadinya sintesis protein. Ribosom terdiri dari, 2/3 berupa rRNA dan 1/3 berupa protein. Perangkaian AA berlangsung pd permukaan ribosom Ribosom bergerak sepanjang mRNA membaca kodon-serta mencocokkan antikodon pd t-RNA. Pemasangan kodon dgn antikodon penterjemahan kodon mRNA menjadi rangkaian asam amino rantai polipeptida. Struktur ribosom menyediakan tempat utk proses penterjemahan. Terdiri dua sub unit: kecil (1/3 masa ribosom), dan besar rRNA memungkinkan ribosom untuk dapat mengenali tRNA dan mRNA

Subunits of a ribosome.
Ribosomes consist of a small (30S) and larger (50S) subunits. The 30S unit has 16S rRNA and 21 different proteins. The 50S subunit consists of 5S and 23S rRNA and 34 different proteins.

Komponen penyusun ribosom


Komponen Ribosom total E. Coli 70S 2520000 dalton 30S 930000 dalton 16S=1541 basa 40% 50S 1590000 dalto 23S=2904 basa 5S=120 basa 70% 30% Tikus 80S 4420000 dalton 40S 1400000 dalton 18S=1900 basa 50% 60S 2820000 dalton 28S=4700 basa 5.8S=160 basa 5S=120 basa 65% 35%

Ribosom kecil

rRNA Protein Ribosom besar

rRNA Utama rRNA kecil


rRNA Protein

Situs di dlm ribosom


Satu situs untuk mRNA (pada sub unit kecil) dua situs untuk tRNA (situs A dan P, sebagian besar pada sub unit besar) Satu situs untuk enzim peptidil transferase (pada sub-unit besar). Ukuran ribososom cukup besar untuk dapat mengikat dua molekul tRNA dan sekitar 40basa mRNA.

Tahapan sintesis polipeptida

Translasi: proses penterjemahan rangkaian kodon mRNA menjadi rangkaian asam amino polipeptida. Pembacaan kodon oleh ribosom dimulai dari kodon awal/ start codon (AUG pertama dr ujung 5) sampai salah satu kodon akhir (UAA, UAG atau UGA). Tahapan: Inisiasi/ initiation (pengenalan situs awal Perpanjangan (elongation), dan penutupan sintesis polipeptida

Inisiasi

Pada E.coli, inisiasi dibantu 3 protein (Initiation factor): IF1, IF2, dan IF3. IF3 bertugas memisahkan sub-unit kecil ribosom dr sub-unit besar setelah selesai translasi sebelumnya. IF1 dan IF2: mendorong penempelan aminoasil-tRNA inisiator dan mRNA kepada sub-unit 30S aminoasiltRNA inisiasi dan kodon awal mRNA tepat berada pd situs P sub-unit ribosom kecil, kodon dan antikodonnya berpasangan. Kodon inisiator (AUG) menyandikan asam amino Nformylmethionine (f-Met). Hasil inisiasi: satu ribosom sempurna yg berasosiasi dengan aminoasil-tRNA inisiator dan mRNA. Untuk proses ini diperlukan energi yg diperoleh dg menghidrolisis GTP menjadi GDP dan P.

Two models of tRNA.

Initiation

Asam amino

Asama amino: R molekul organik yg ! mengandung gugus H2N-C-COOH ! amin (-NH2) dan H karboksil (-COOH). R1 R2 R3 Mrpk molekul dasar H2NCHCO-HNCHCO-HNCO dari protein, yg dirangkai mjd rangkaian asam aminomatau rantai polipeptida

Perpanjangan (elongation),

Diperlukan: EF (elongation factor), enzim peptidil transferase, GTP. Pd ribosom sempurna, tersedia dua situs aminoasil-tRNA (situs P dan A), dengan situs P ditempati aminoasil-tRNA inisiator. Perpanjangan polipeptida dimulai dengan masuknya aminoasil-tRNA yg kedua menempati situs A. Apabila antikodon pd aminoasil-tRNA cocok dg kodon pd situs A maka peptidil transferase akan menggabungkan dua asam amino yg dibawa oleh kedua aminoasil-tRNA yg berdampingan pada ribosom tsb. Peptidil transferase akan melepaskan asam amino dr tRNA yg menempati situs P, dan menggabungkannya pada AA yg ada pd situs A menghasilkan peptidil-tRNA pd situs A

tRNA yg tlh terdeasilasi dikeluarkan dr situs P, dan peptidil-tRNA yg tdpt pd situs A akan pindah ke situs P, yg terjadi bersamaan dengan pergerakan ribosom kearah ujung 3, membaca kodon berikutnya. Siklus akan berulang, aminoasil-tRNA baru akan masuk situs A, diikuti transferase peptidil, melakukan reaksi AA membentuk peptidil baru, translokasi peptidil-tRNA dari situs A ke P, berulang terus sampai ditemukan kodon akhir (UAA, UAG atau UGA).

Termination
Termination of the polypeptide occurs when the ribosome reaches a "Stop" Codon (UAA, UAG, UGA), Chain termination leads to the release of a polypeptide, and tRNA, and the dissociation of the ribosome into 30S and 50S subunits. Stop codons are triplets which are not recognized by any tRNA (UAA, UAG, UGA), but by two proteins: the releasing factors (R), (R1 recognizes UAG and UAA, R2 recognizes UAA and UGA). Begitu ketemu stop kodon, tidak ada aminoasil-tRNA yg dpt menempel pd situs A, krn tdk ada antikodon yg cocok proses perpanjangan berakhir.

Keseluruhan Sintesis protein