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Energa, Enzimas y Metabolismo

Energa, Enzimas y Metabolismo


Energa: la capacidad de hacer trabajo.

Las clulas no pueden hacer energa - la energa no es creada ni destruida, pero puede ser transformada.

En la vida, las transformaciones energticas consisten bsicamente en el movimiento de molculas y cambios de las uniones qumicas.

Energa, Enzimas y Metabolismo

Existen dos tipos de energa:


Energa Potencial es energa de estado o posicin - energa almacenada.
Energa Cintica es la energa del movimiento. La energa cintica hace trabajo que altera el estado o movimiento de la materia.

Figura 6.1 Conversiones Energticas Energa potencial y Trabajo


La energa no es creada

ni destruida
ES TRANSFORMADA

almacenada en un
embalse

Generador convierte la energa potencial en energa elctrica

Energa Potencial: Energa en forma potencialmente utilizable, que por el momento no est siendo utilizada. Llamada Energa de Posicin Energa almacenada Posee la capacidad de realizar un trabajo, en virtud de su estado Energa Cintica: Energa de movimiento Energa Potencial
Energa necesaria Piedra en reposo posee para llevar la piedra Energa potencial a la cima

Energa Cintica
Liberacin de Energa (volver al estado inicial)

Energa, Enzimas y Metabolismo


La primera ley de la termodinmica: Durante cualquier conversin energtica, la energa total inicial ser igual a la energa total final. La energa no es creada ni

destruida.

Las Leyes de la Termodinmica

La energa no es creada ni destruida

La segunda ley de la termodinmica: Cuando la energa es transformada, alguna parte de sta se vuelve no utilizable para hacer trabajo.

No hay proceso fsico o reaccin qumica

100% eficiente, lo que significa que no


toda la energa liberada puede ser usada para hacer trabajo.

Las Leyes de la Termodinmica

Segunda Ley de la Termodinmica: En todos los intercambios y conversiones energticas, si en el sistema en estudio no entra ni sale energa, la energa potencial del estado final ser siempre menor que la energa potencial del estado inicial Energa trmica

Caliente

Frio

Tibio Molculas de gas

Tibio

Estado Inicial

Estado Final

En cualquier sistema:
energa total = energa funcional + energa no-funcional

o: entalpa (H) = energa libre (G) + entropa (S) H = G + TS


(T = temperatura absoluta)

Entalpia = energa total Entropa es una medida del desorden del sistema. Energa Funcional: energa capaz de realizar un trabajo G = H TS

Como G, H, y S no pueden ser medidas de manera precisa.

Pero el cambio a temperatura constante, es


medido de forma precisa en caloras o julios. G = H TS
energa funcional = energa total entropa

Si G es positiva (+), se consume energa libre. Este es el caso de las reacciones anablicas.

Si G es negativa (), se libera energa libre. Este es el caso de las reacciones catablicas.

Si una reaccin qumica incrementa la entropa, sus productos estn ms desordenados (o al azar) que los reactantes.

Un ejemplo es la hidrlisis de una protena a sus amino cidos:


Se libera energa libre G es negativa (exergonica) S es positiva (la entropa).
energa funcional = energa total - entropia

G = H TS

Cuando las protenas son elaboradas se requiere energa libre, hay pocos productos y S es negativa.

Puede parecer que organismos complejos, como el cuerpo humano, no cumplen la segunda ley de la termodinmica, pero es solo aparentemente.

Los procesos metablicos que se llevan a cabo en

los tejidos producen ms desorden que orden.

Para mantener el orden, la vida necesita una contribucin permanente de energa.

Las Reacciones Anablicas unen molculas simples en molculas complejas reacciones consumen energa

(necesarias para almacenar energa).

Las Reacciones Catablicas rompen molculas complejas en molculas simples. Ej. pueden reducir una sustancia organizada (glucosa) a sustancias ms pequeas y distribuidas azarosamente (CO2 y H2O). Tales reacciones liberan energa para que las reacciones anablicas funcionen.

La reaccin espontnea se lleva a cabo sin una contribucin de energa, mientras que una reaccin no espontnea puede avanzar slo si existe una contribucin de energa.

Las reacciones espontneas son llamadas exergnicas y tienen valores negativos de G (ya que liberan energa).

Las reacciones no espontneas son llamadas endergnicas y tienen valores positivos de G (ya que consumen energa).

Si bajo ciertas condiciones A B es una reaccin espontnea (exergnica), entonces B A debe ser una reaccin no

espontnea (endergnica).

Figura 8.3 Reacciones Exergnicas y Endergnicas

Reacciones Exergnicas
A B

Prdida de energa

Productos (menos Energa)

Reacciones Endergnicas

Suministro de Energa D

C C

Producto (mayor energa)

Reactivos

Todas las clulas vivas usan adenosina trifosfato (ATP) para capturar, transferir y almacenar energa.

ATP: Transferencia de Energa en las Clulas

Parte de la energa libre liberada por ciertas reacciones exergnicas es capturada en forma de ATP, la cual puede ser luego liberada para llevar a cabo reacciones endergnicas.

ATP no es una molcula inusual y tiene otras funciones; por


ejemplo puede ser convertido en una unidad de construccin de ADN y ARN.

Figura 8.5 ATP

Energa y Conversiones Energticas

ATP puede ser hidrolizado para dar como resultado ADP y un ion fosfato inorgnico (Pi). ATP + H2O ADP + Pi + energa libre

La energa libre del enlace PO es mucho mayor que la del enlace HO, el cual se forma como resultado de la hidrlisis.

Los fosfatos estn negativamente cargados, as que se requiere energa para unirlos unos a otros (para adicionar un fosfato a ADP).

Figura 8.5 ATP


Luciernaga: Utiliza ATP para iniciar la oxidacin de luciferina: convirtiendo energa qumica en energa elctrica (luz).

Luciferina + O2 + ATP --------- oxyluceferina + AMP + PPi + luz


luciferasa

La formacin de ATP a partir de ADP y Pi, es endergnica por lo que consume mucha energa libre, tanto como la que es liberada cuando se rompen molculas de ATP: ADP + Pi + energa libre ATP + H2O

ATP transfiere energa de reacciones exergnicas a reacciones endergnicas.

Cada clula necesita millones de molculas de ATP por segundo para que su maquinaria bioqumica funcione bien.

Cada molcula de ATP sufre 10.000 ciclos de sntesis e hidrlisis cada da, aproximadamente.

Figura 8.7 Acoplamiento de la Hidrlisis de ATP a una Reaccin Endergnica

Enzimas: Catalizadores Biolgicos

Un catalizador es cualquier sustancia que

acelera una reaccin qumica.

Las clulas utilizan catalizadores para incrementar el ritmo de las reacciones qumicas. La mayora de los catalizadores son

protenas conocidos como enzimas.

Figura 8.8 Energa de Activacin

Algunas reacciones son lentas debido a que existe una barrera de energa entre los productos y los reactantes.

Las reacciones exergnicas prosiguen slo

despus de una adicin pequea de energa,


llamada energa de activacin (Ea).

En una reaccin qumica, la energa de activacin

es la energa requerida para que las molculas


entren en un estado de transicin

Enzimas: Catalizadores Biolgicos

Las reacciones exergnicas usualmente se inician

por la adicin de calor. Este incrementa la energa


cintica de las molculas.

Sin embargo, la adicin de calor no es la forma

ms adecuada para conducir reacciones qumicas


en sistemas biolgicos.

Las enzimas solucionan este problema haciendo

que la barrera de energa sea menor.

Figura 8.10 Enzima y Substrato

Las enzimas se unen a molculas (reactivos) especficos llamados substratos. Los substratos se unen a un sitio particular de la

superficie de la enzima llamado sitio activo,


lugar en el que la catlisis tiene lugar.

Las enzimas son muy especficas: se unen a

substratos especficos y catalizan cierto tipo de


reacciones bajo determinadas caractersticas.

La especificidad de una enzima es el resultado de

la forma tri-dimensional de sta y de la estructura


del sitio activo.

Los nombres de las enzimas reflejan su funcin:


RNA polimerasa cataliza la formacin de ARN pero no la de ADN. DNA polimerasa Hexoquinasa acelera la fosforilacin de hexosas. Todas la kinasas adicionan fosfatos. Todas las fosfatasas

remueven fosfatos.

La unin del substrato al sitio activo produce un complejo enzima-substrato (ES).

Enlaces de hidrgeno, atraccin inica o enlaces covalentes actuando de manera

individual o conjunta, mantienen a dicho


complejo unido.

El complejo (ES) genera el producto (P) y la

enzima libre (E):


E + S ES E + P

Las enzimas hacen que las necesidades (en cantidad) de energa de activacin disminuyan por lo que aceleran la reaccin; sin embargo, stas no cambian la diferencia en energa libre (G) entre reactivos y productos.

Esto significa que el equilibrio final no es alterado. Las enzimas pueden tener un efecto profundo en la tasa (ritmo) de la reaccin. Reacciones que podran suceder en aos, se dan en una fraccin de segundo.

Figura

8.10 las Enzimas Disminuyen la Barrera de Energa


Energa ce activacin

C (producto)

C
A B

En los sitios activos, las enzimas y los substratos interactan mediante el rompimiento y la formacin de enlaces.

Sitio activo: grupo caracterstico de aminocidos donde ocurre el evento cataltico del cual esa enzima es responsable.

Enzimas: Catalizadores Biolgicos

Las enzimas catalizan reacciones usando uno o ms de los siguientes mecanismos:


Orientacin de los substratos

Adicin de cargas a los substratos


Inducir estrs en los enlaces de los sustratos

Figura 8.11 Sitio Activo


Orientacin de los sustratos

Inducir estrs a los sustratos

La lisozima es una enzima presente en las lgrimas y la saliva en donde acta como una barrera frente a las infecciones.

Adicin de cargas a los sustratos

Enzima digestiva secretada por el pncreas

Las enzimas orientan los substratos.


Mientras estn en solucin, los sustratos colisionan unos con otros.

La probabilidad de colisin bajo el ngulo necesario


para cambiar las interacciones qumicas es baja. Cuando se unen a las enzimas, dos substratos

pueden ser orientados de forma tal que es ms


probable que la reaccin ocurra.

Figura 6.13 Estructura Terciaria de la Lisozima

Catalasa - otro ejemplo

La mayora de las enzimas son ms grandes que su


substrato. El sitio activo de la mayora de las enzimas es slo

una regin muy pequea dentro de toda la protena.


En 1894, Emil Fischer compar esa unin (substratoenzima) con un cerradura y su llave.

En 1965, usando cristalografa de rayos-X, David Phillips observ un bolsillo en la enzima lisozima que se ajustaba perfectamente a su substrato.

La Estructura Molecular Determina la Funcin de la Enzima

El cambio en la forma de la enzima causado por la unin al substrato se denomina acoplamiento inducido. Esto explica en parte porque las enzimas son tan grandes. El resto de la molcula tiene dos funciones:

Es el marco para que los amino cidos del sitio activo estn en la posicin correcta
Participan en los cambios pequeos de la protena que inducen al acoplamiento

Figura 6.14 Cambio de la Forma de Enzima al Unirse a su Substrato

Algunas enzimas requieren de otras molculas para su funcionamiento:

Cofactores son iones metlicos (hierro, zinc, cobre) que


se unen temporalmente a ciertas enzimas y son esenciales para el funcionamiento de la enzima.

Coenzimas son molculas pequeas que actan como


substratos. Se unen al sitio activo y cambian qumicamente durante la reaccin, luego se separan y participan en otras reacciones. (NAD y FAD) Grupos prostticos estn permanentemente unidos a las enzimas. Incluyen a los grupos heme que se unen a la hemoglobina.

Figura 6.15 Una enzima con una Coenzima

La tasa de las reacciones catalizadas por enzimas depende del pH del medio. Cada enzima es ms activa a determinado pH.

El pH puede cambiar las cargas de los


grupos amino y carboxilo de los aminocidos. Esto afecta las interacciones de los aminocidos y puede cambiar la estructura de la protena.

Figura 8.20 pH Afecta la Actividad Enzimtica

Intestino delgado

estomago

hgado

Metabolismo y Regulacin de Enzimas


La temperatura tambin afecta la actividad enzimtica.

Altas temperaturas pueden inactivar a una enzima al romper los enlace covalentes Si la estructura terciaria se destruye, la

enzima entonces est denaturada.

Figura 8.20 Temperatura Afecta La Actividad Enzimtica

La tasa de una reaccin no catalizada es directamente proporcional a la concentracin de los reactivos.

Esto es cierto hasta cierto punto para las reacciones catalizadas, pero luego la tasa disminuye.

Esto se debe a la saturacin de la enzima,


cuando todas las molculas de enzimas disponibles estn unidas a un substrato.

Figura 8.13 las Reacciones Catalizadas Alcanzan una Tasa Mxima

Tasa de reaccin: nmero de molculas de

sustrato convertidas en producto por


unidad de tiempo

La tasa de reaccin oscila entre 1 molcula cada dos segundos para la lisozima y 40 millones de molculas por segundo para la

catalasa

Metabolismo y Regulacin de Enzimas

La actividad enzimtica puede ser inhibida por competidores naturales o artificiales. Los inhibidores naturales regulan el metabolismo La inhibicin Irreversible sucede cuando el inhibidor destruye la habilidad de la enzima para interactuar con su substrato normal. Generalmente TOXICOS para las clulas (insecticidas y gases nerviosos). Ej: DIPF, inhibe irreversiblemente a la acetilcolinesterasa, una enzima que es necesaria para la propagacin de los impulsos nerviosos.

Figura 8.15 Inhibicin Irreversible


inhibidor irreversible de la enzima acetilcolinesterasa

Gas nervioso

Grupo hidroxilo en aa serina

DIPF

Metabolismo y Regulacin de Enzimas


No todas la inhibiciones son irreversibles. Cuando un inhibidor se une reversiblemente al sito activo de una enzima, ste compite con el substrato por el sitio activo y es

llamado inhibidor competitivo.

Cuando la concentracin del inhibidor competitivo se reduce, no se une al sitio activo y la enzima puede funcionar de nuevo.

Anlogos de sustratos: compuestos que se asemejan al sustrato real


pero son qumicamente incapaces de llevar a cabo la reaccin.

Omeprazol * Reduce la secrecin gstrica mediante la inhibicin competitiva * Inhibicin dosis dependiente especfica de la enzima H+ K+ ATPasa - inhibiendo la etapa final de la formacin de cido gstrico

Metabolismo y Regulacin de Enzimas

Cuando un inhibidor se une reversiblemente a un sitio distinto del sitio activo, entonces se conoce como inhibidor no competitivo.

stos actan cambiando la forma de la

enzima de forma que el substrato no


puede unirse al sitio activo.

El cambio de forma de la enzima debido a un


inhibidor no competitivo se conoce como alostria. Las enzimas alostricas son controladas por reguladores alostricos. stos reguladores se unen a un sitio alostrico, el cual es separado del sitio activo, y esta unin cambia la estructura y funcin de la enzima.

Las enzimas alostricas en general tienen

ms de un tipo de subunidad (estructura


cuaternaria).

Una subunidad cataltica tiene un sitio activo que se une al substrato. Una subunidad de regulacin que tiene uno o ms sitios alostricos que se unen a a reguladores especficos.

Figura 6.19 Regulacin Alostrica

Algunas enzimas alostricas tienen mltiples sitios activos. Cuando uno es ocupado, el otro cambia de forma y se pueden unir molculas

adicionales de substrato.

La tasa de reaccin cambia si la concentracin del substrato aumenta y si la enzima es regulada alostricamente o no.

Figura 6.20 Tasa de reaccin y tasa alostrica

No-alostrica

Alostrica

Las rutas metablicas consisten bsicamente de material inicial, intermediarios, y producto final. El primer paso en la ruta se llama etapa de compromiso Una vez este paso sucede, otra reaccin catalizada por una enzima contina hasta que se llega al producto final. Una forma de controlar la ruta completa es que el producto

final inhiba el primer paso de la reaccin.

Esto se llama inhibicin por producto final o inhibicin por retroalimentacin

El metabolismo de un organismo corresponde al total de todas las reacciones bioqumicas que se llevan a cabo en su interior. Metabolismo est organizado en secuencias de reacciones qumicas catalizadas por enzimas llamadas rutas. En estas secuencias, el producto de una reaccin es el substrato para la siguiente reaccin A B C D

Metabolismo y Regulacin de Enzimas

Metabolismo y Regulacin de Enzimas

Algunas rutas metablicas son anablicas y

sintetizan las unidas de construccin de las


macromolculas.

Otras son catablicas y rompen macromolculas El balance entre estas rutas puede cambiar

dependiendo de las necesidades celulares, por


lo que una clula debe regular sus rutas metablicas constantemente.

Figura 8.19 Inhibicin de Rutas Metablicas

Inhibicin por retroalimentacin