RIBOSWITCH

https://www.youtube.com/watch?v=smNb ETCHedE

QU SON?
Estructuras de ARN no codificantes autnomas

que regulan apropiadamente genes en respuesta a las cambiantes condiciones celulares. ARNm capaces de unir a algn metabolito y de esta manera controlando su misma expresin. Riboswitches son elementos que se encuentran comnmente en la regin 5 'no traducida (UTR) de mRNAs
http://molbiol4masters.masters.grkraj. org/html/Protein_Synthesis8 Regulation_of_Protein_Synt

TIPOS DE RIBOSWITCHES
Riboswitches capaces de unir: Purinas: adenina y guanina Aminocidos glicina y lisina In magnesio S-adenosil metionina Glucosamina-6-fosfato
Componente de los glucosaminoglicanos, los proteoglicanos y

los glicolpidos Actividad cataltica

Se han encontrado otros seis riboswitches

hurfanos
Se desconoce tanto al metabolito que unen como la va

metablica que regulan.

Riboswitch Purine Guanine Adenine 2-deoxyguanosine S-adenosylmethionine (SAM) SAM-I SAM-II SAM-III Thiamine pyrophosphate (TPP) Bacterial (Escherichia coli) Eukaryotic (A. thaliana) Lysine Flavin mononucleotide (FMN) Magnesium glmS (ribozyme)

Garst, A. D., Edwards, A. L., & Batey, R. T. (2011). Riboswitches: structures and mechanisms. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 3(6), a003533.

Pre-Q1
Cyclic-di-GMP

 El riboswitch tpico contiene dos dominios

funcionales distintos:
Dominio aptmero Plataforma de expresin
Secuencia de conmutacin

Garst, A. D., Edwards, A. L., & Batey, R. T. (2011). Riboswitches: structures and mechanisms. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 3(6), a003533.

Estructura del aptmero

Como cualquier otro ARN

Adopta formas tridimensionales precisas para

llevar a cabo sus funciones moleculares. La secuencia del dominio de aptmero de la riboswitch purina.
Contiene tres elementos helicoidales (P1, P2 y P3).
Garst, A. D., Edwards, A. L., & Batey, R. T. (2011). Riboswitches: structures and mechanisms. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 3(6),

Distribucin filogentica de diez clases riboswitch El riboswitch AdoCbl es la clase ms extendida en bacterias Glicina y lisina riboswitches tienen distribuciones ms fragmentados Barrick, J. E., & Breaker, R. R. (2007). The distributions, mechanisms, and structures of metabolite-binding riboswitches. Genome biology , 8(11), R239. Los miembros de la
clase riboswitch TPP son los nicos ARN de unin de metabolitossabe que se producen fuera de las eubacterias.

Figure 1. TPP Aptamers Are Conserved and Widespread in Plant Species. (A) Alignment of TPP aptamer sequences from various plant species reveals high conservation of sequence and structure. Nucleotides forming stems P1 through P5 are highlighted in color, and asterisks identify nucleotides that are conserved between all examples. Wachter, A., Tunc-Ozdemir, M., Grove, B. C., Green, P. J., Shintani, D. K., & Breaker, R. R. (2007). Riboswitch control of gene expression in plants by splicing and alternative 3 end processing of mRNAs. The Plant Cell

MODO DE ACTUACIN
La unin a aptmeros riboswitch Metabolito

tpicamente causa una reorganizacin alostrica en estructuras de ARNm cercanos que resulta en una respuesta de control del gen. Por ejemplo, riboswitches bacterianas situadas en las regiones no traducidas 5 '(UTRs) de ARN mensajeros pueden influir en la formacin de una horquilla terminador intrnseco que termina prematuramente la transcripcin o la formacin de una estructura de ARN que bloquea de unin al ribosoma. La mayora de riboswitches inhiben la produccin de enzimas biosintticas o transportadores innecesarios cuando un compuesto que ya est presente en niveles suficientes. Sin embargo, algunos riboswitches activan la expresin de salvamento o de degradacin de las vas cuando sus molculas diana

Biology of the Cell (2008) 100, 1-11 Jane N. Kim and Ronald R. Breaker | www.biolcell.org

Miranda-Ros, J., & Sobern, M. Cronologa del descubrimiento de los riboswitches (ARn que regula la expresin gentica).

Ejemplos
Bacillus subtilis lleva al menos 29 riboswitches

que controlan aproximadamente 73 genes. E. coli tiene 6 riboswitches (tres TPP, uno AdoCbl, uno FMN, y uno de lisina) de los diez clases examinados, que regulan un total de diecisis genes.

 Regulacin de genes involucrados en la sntesis y

transporte de cobalamina, vitamina B12, y de la riboflavina, vitamina B2. No se identific protenas que regularan su produccin. Presentaban secuencias conservadas en la regiones no traducidas que podan formar estructuras secundarias muy complejas
B12-box

B2-box

La B12-box y B2-box son capaces de unir a las

vitaminas B12 y B2 La B12-box y B2-box pueden reprimir la expresin de sus genes biosintticos y de transporte.

RIBOSWITCHES COMO RELIQUIAS

poca en la que el ARN era el portador de la

informacin gentica. ARN tenia actividad cataltica Por las caractersticas de los Riboswitches, podran ser reliquias moleculares de aquel mundo del ARN

Bibliografa
Barrick, J. E., & Breaker, R. R. (2007). The distributions,

mechanisms, and structures of metabolite-binding riboswitches. Genome biology, 8(11), R239.

Garst, A. D., Edwards, A. L., & Batey, R. T. (2011).

Riboswitches: structures and mechanisms. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 3(6), a003533.
Miranda-Ros, J., & Sobern, M. Cronologa del

descubrimiento de los riboswitches (ARn que regula la expresin gentica).

Wachter, A., Tunc-Ozdemir, M., Grove, B. C., Green, P. J.,

Shintani, D. K., & Breaker, R. R. (2007). Riboswitch control of gene expression in plants by splicing and alternative 3 end processing of mRNAs. The Plant Cell Online,19(11), 3437-3450.