Sasaran umum
Menjelaskan teknologi pemeriksaan mikrobiologi Dapat menggunakan teknologi mikrobiologi
sasaran khusus
Dapat menjelaskan perkembangan teknologi mikrobiologi Dapat menjelaskan teknologi untuk sterilisasi Dapat menjelaskan teknologi pemeriksaan konvensional di bidang mikrobiologi Dapat menjelaskan teknologi moderen dibidang mikrobiologi
Ilmu mempelajari makhluk hidup yang sangat kecil (mikroorganisme yang tidak dapat dilihat dengan mata biasa tanpa bantuan dari suatu peralatan khusus
Disiplin ilmu
Bakteriologi, imunologi, virologi, mikologi dan parasitologi Mikroorganisme yang berkaitan dengan penyakit infeksi
Purba : Kutukan Dewa terhadap dosa-dosa, sehingga penyembuhanya perlu pengorbanan Infeksi Hipocrates : Faktor intrinsik Faktor eksttrinsik
Louis Pasteur (1860) memanfaatkan penemuan leeuwenhoek membantah teori generatio spontanea Robert Koch (1876) dokter Jerman - Teknologi kultur (Media pembenihan ditemukan) menumbuhkan kuman Anthrax yang berasal dari Binatang percobaan - Hasil dari penemuan ini dikenal postulat Koch:
Postulat Koch
Kuman harus dapat selalu ditemukan didalam tubuh binatang yang sakit tetapi tidak pada binatang yang sehat Kuman tersebut harus dapat diasingkan dan dapat dibiakan dalam bentuk biakan murni diluar tubuh binatang yang sakit Biakan murni kuman tersebut harus mampu menimbulkan penyakit yang sama pada binatang percvobaan Kuman tersebut haru s dapat diasingkan lagi dari binatang percobaatb tersebut
Pada tahun 1900: semua jenis kuman penyebab berbagai penyakit penting akhirnya dapat ditemukan: 1. Bacillus antrachis 2. Corrynebacterium diphteria, 3. Salmonella thyposa 4. Clostridium tetani 5. Treponema Pallidum
Kamajuan teknologi selanjutnya: 1. ditemukan jasad renik yang lebih halus dari kuman 2. dapat menembus saringan kuman yaitu: VIRUS 3. Virus mosaik tembakau (Iwanowsky 1892) 4. Virus penyebab foot and mouth disease pada ternak (Loffler & Froch, 1898)
Bidang Imunologi
Orang yang sembuh dari penyakit, tidak mudah lagi kena penyakit yang sama Kemajuan bidang kekebalan tubuh (Imunologi mulai dikembangkan) Pelopor Edward Jenner (1749-1823)
Teknologi Sterilisasi
Suatu usaha untuk membebaskan alat atau bahan dari segala macam kehidupan, terutama kehidupan mikroorganisme Mengunakan teknologi tertentu (Cara fisik dan cara kimia
Sterilisasi
Zaman dulu: Membakar luka dengan logam yang membara dapat mencegah infeksi, meskipun meninggalkan jaringan parut Bahan kimia (Halogen, Yodium, klorin, Alkohol, fenol, peroksida, zat warna, deterjen dll) Gas (Oksigen Etlen (ETO), Uap formaldehida
Cara Fisik: 1. Panas : - Basah (Otoklaf) - Merebus - Pasteurisasi 2. Kering: - Pembakaran - Udara panas - Radiasi - Penyaringan Zat-zat kemotherapetik (Antimikroba)
Teknologi konvensional
Pemeriksaan menggunakan alat-lat konvensional untuk melakukan pemeriksaan mikrobiologi Identifikasi bakteri: - Pewarnaan - Media pembenihan dan reagen
Zat warna
1. Kinyoun Gabbet (Tan Thiam Hok)
2. Ziehl Neelsen
Larutan Kinyoun (Fukhsin karbol 4 %) Larutan Gabbet ((H2SO4 + alkohol + biru metilen 1 %)
- 1,5 gr basic fuchsin dalam 30 ml ethanol - 15 gr phenol dalam 285 ml Aquadest - Asam alkohol 3 % - Larutan Methileen blue 0,1%
Metode
- Mycobaterium
berbentuk batang
M.tuberculosis Cultur
M. tuberculosis is grown on a selective medium known as 1. Lowenstein-Jensen medium 2. Ogawa medium
1. Lowenstein-Jensen medium
Lowenstein-Jensen medium popularly known as LJ medium is a growth medium specially used for culture of Mycobacterium notably
Time growth (25 day)
Mycobacterium tuberculosis.
composition - Malachite green - Glycerol - Asparagine - Potato flour - Coagulation eegs - Mineral salt solution
Potassium dihydrogen phosphate
2. Media Ogawa
Komposisi media - Larutan garam : Monopotasium (KH2PO4) Sodium glutamat Aquades - Glycerol - Malachit hijau - Telur yang di kocok Lama pertumbuhan 6-8 minggu
4. Non-Conventional Phenotyping Diagnostic Methods - Phage-Based Assay - The Micro-Colony Method - Microscopic Observation broth-Drug Susceptibility Assay (MODS) - Analysis of Cell Wall Mycolic Acids
Konvensional
Mikrovact system
The vials containing the medium remain sealed through the whole culture process and the specimen is inoculated by puncturing the rubber septum with a needle
The instrumen: Once paired needles have perforated the rubber septum of the vial. The gaseous phase is aspirated and replaced with air containing 5% CO2 Aspirated gas is analyzed by -counter to quantify the eventual present of radiolabeled CO2
www. Tuberculosis Textbook.com.
When viabel mycobacteria are present in the culture vial, the radiolabeled palmitic acid is metabolized and radioactive CO2 is liberated into gaseous phase The vials, which are held in anexternal incubator, must be loaded into the instrument for reading The reading is usually performed twice a week during the first 15 day of incubation, and weekly thereafter, until the 42 day
The principle - The medium a modified Middlebrook 7H9 medium - Medium in which a supplement is added at the moment of use (OADC) enrichment: Oleic acid Albumin Dextrose Catalase - Contamination is controlled (PANTA) - Polymyxin B - Amphotericin B - Nalidixic acid - Trimethoprim - Azlocillin - As the tubes containing the medium are screw-capped, no needle is needed for inoculation
A silicon film embedded with a ruthenium salt is present at the bottom of the tube as a flourecence indicator
VersaTREK
The versaTREK use technology of previously development blood culture system and is commercialized Trek diagnostic system
VersaTREK bottle (Courtesy Diagnostic System
The principle
The medium a modified Middlebrook 7H9 To which the OADC enrichment must be added Two diffrent antimicrobial mixtures are available The first one,also known as AS include : (OADC)
The instrumentation : - Incubator and reader - Which also shakes the bottle during the incubation - The pressur within each bottle is monitored by a manometer through a proper connector - Cultures precenting a decreased headspace presure Positive
VersaTREK is a typical walk-away instrumentation Which constinously monitors the bottles, alert when they become positive and signals the end of the incubation period
Bact/Alert 3D
The tecnology of a previously developed blood culture system Medium : - modified Middlebrook 7H9 - in use suplemen OADAC - - Contamination is controlled (PANTA) - Polymyxin B - Amphotericin B - Nalidixic acid - Trimethoprim - Vancomysin - Azlocillin
If viable mycobacteria a present in the bottle, the CO2 produced by their metabolism causes a change of the color of the sensor, from green to yellow
Negative
Positive -
cc
Prinsip PCR
PCR berdasarkan pada 3 tahap yang diperlukan dalam reaksi pembentukan DNA : 1. Denaturasi yaitu : untai ganda DNA dipisahkan menjadi rantai tunggal, 2. Annealing (penempelan) primer pada rantai tunggal DNA 3. Extension : pemanjangan rantai DNA (pembentukan rantai DNA yang baru)
Kegunaan PCR
Dalam riset kedokteran maupun kedokteran klinis, kegunaan PCR secara garis besarnya terbagi 2 : 1. Mendeteksi organisme penyebab infeksi 2. Mendeteksi variasi dan mutasi gen
Kelebihan PCR
1. Sangat sensitif 2. Dilakukan secara cepat 3. Menggunakan komponen dalam jumlah yang relatif sedikit
Kultur
Kepustakaan
1.Nendrosuwito, 2000, Standard Operating Procedures (SOP) In NMicrobiology. 2. Acid-Fast (Mycobacteria) Broth-Based Culture and Smear and Susceptibility 2007 by Laboratory Corporation of America Holdings and Lexi-Comp Inc. All Rights Reserved 3. Caviedes L, Moorr ,2007, Introducing MODS: A low-coast, Low tech tool for high performance detection of tuberculosis and multi drug resistant medium tuberculosis, Indian Lowenstein-Jensen journalMycrobiology. www.ijmn.org 4. Wikipedia,2008, Lowenstein-Jensen medium, From Wikipedia, the free encyclopedia 5. Dorman SD, Kritski AL,2006, The MODS Assay for Detection of TB and TB Drug Resistance A Multy Center Study, John Hopskins University, Federal University of Rio the janeiro 6. Mycobacterium tuberculosis - Wikipedia, the free encyclopedia.htm, 2008 7. Friedland, 2007, MODS assay for the diagnosis of TB, The new EnglandJournal of TB
8. Wahongan P, 2008, Polymerase chain reaction (PCR), Parasitologi UNSRAT 9. Palamino, Leao,Ritacco, 2007, Tuberculosis from basic science to patient care, www. Tuberculosis Textbook.com. 10. Cidlia Pina-Vaz, at all,2004, Novel Method Using a Laser Scanning Cytometer for Detection of Mycobacteria in Clinical Samples, American Society of Microbiology