ralegria@conacyt.gob.sv Centro Escolar Doroteo Vasconcelos Ayutuxtepeque, San Salvador. . BIOLOGA MOLECULAR: Herramienta de la Biotecnologa Fac. de CCNN y Matemtica (UES) PROGRAMA DE JVENES TALENTO Objetivos Historia de la Biologa Molecular La Biologa Molecular: herramienta de la Biotecnologa Tecnologa del ADN Ingeniera Gentica Marcadores Reflexin Final CONTENIDO: Estimular el inters de los jvenes hacia la Biologa Molecular y sus aplicaciones en la Biotecnologa. . Promover en los educandos el espritu crtico hacia el potencial de la investigacin biotecnolgica para el desarrollo de la humanidad. . Presentar elementos de juicio que permitan comprender la importancia de la investigacin en biologa molecular. OBJETIVOS: AVANCES HISTRICOS DE BIOLOGA MOLECULAR 1941 Genes codifican las protenas 1944 Prueba que el ADN porta la informacin gentica 1953 Determinacin de estructura del ADN y de la Insulina 1956 Enfermedad monognica sustitucin de un aa cadena -hemoglobina 1961 Cdigo Gentico, ARN mensajero, regulacin gnica 1967 Wise y Richardson aislaron ADN ligasa 1970 Smith y colegas aislaron y caracterizaron la Hind III 1972 Janet Mertz y Ron Davis cortaron y pegaron mol de ADN 1973 Stanley Cohen y H. Boyer pusieron ADNr en bacterias 1974 Demostracin directa de deleccin gnica humana 1975 Southern Blotting 1976 Proto-oncogenes 1977 Fred Sanger secuenci el virus de ADN X174 1978 Biblioteca gnica humana 1979 RFPL para diagnstico prenatal, oncogenes celulares AVANCES HISTRICOS DE BIOLOGA MOLECULAR 1979-81 genes humanos clonados y secuenciados 1982 Tabaco, la primera planta modificada genticamente 1983 Kary Mullis concibe el PCR / Fred Sanger y colegas publican la secuencia del lambda 1985 Un gen de enfermedad aislado por clonacin posicional 1986 La secuenciacin del ADN es automatizada 1987 Inicia el Proyecto del Genoma Humano 1995 Es secuenciado la bacteria Haemophillus influenzae 1996 Es secuenciada la levadura Saccharomyces cerevisiae 1998 Es secuenciado el nemtodo Caenorhabditis elegans 1999 Es secuenciado el cromosoma 22 humano 2000 Es secuenciada la mosca de la fruta D. melanogaster / 26 de junio se presenta 90% borrador genoma humano 2001 Feb 2001 se completa el genoma humano. genoma Clula cromosomas genes los genes contienen instrucciones para hacer protenas ADN protenas las protenas actan solas o en complejos para realizar las funciones celulares ADN ADN
ARN
PROTENAS BASES MOLECULARES DE LA VIDA Es el medio o va de manipulacin de las formas de vida (organismos) para proveer un producto deseable para el uso del hombre. Areas cubiertas por el trmino Biotecnologa incluyen: i) Biologa Molecular: ADN recombinante, cultivo de clulas animales, cultivo de tejidos vegetales, inmunologa, mejoramiento animal y vegetal, ii) Fermentacin, iii) Sistema de Enzimas y iv) Otras. . Marcadores Ingeniera Gentica Tecnologa del ADN Frmacos Anti-cncer Diagnsticos Cultivo de Clulas Vegetales Transferencia de genes en animales Sntesis de Sondas de ADN Localizacin desrdenes genticos Clonacin Solucin de crimenes Produccin de Protenas humanas Terapia Gnica Bancos de ADN, ARN Protenas Mapas de Genomas completos Biologa Molecular Sntesis de Nuevas Protenas Nuevos Antibiticos Nuevas Plantas y Animales Nuevos Alimentos Recursos humanos qumicos raros BIOTECNOLOGA Tecnologa del ADN (Diagnstico Molecular) PCR - REACCIN EN CADENA DE LA POLIMERASA El PCR utiliza la capacidad de las Enzimas polimerasas que catalizan la formacin y reparacin de ADN (y ARN), mediante un mecanismo que permite iniciar y parar su actividad en un punto especfico de una hebra de ADN, para lo cual se emplean polimerasas obtenidas de arqueobacterias como Termophillus aquaticus que resisten temperaturas arriba de los 100C. Kary B. Mullis, de Cetus Corporation que concibi el mecanismo del PCR, en la dcada de los 80,s recibi el Premio Nobel en 1993. Tecnologa del ADN FINGERPRINTING El ADN tiene muchas regiones que son muy variables en su estructura (RFLPs) y pueden ser usadas para ADN fingerprintings. El ADN puede ser obtenido de sangre, fluidos corporales y otros tejidos incluyendo hueso, y es relativamente estable, frecuentemente sobre muchos aos. Se requieren cantidades muy pequeas y las muestras pueden ser obtenidas de manera no invasiva. MADRE PADRE NIO 1 NIO 2 NIO 3 NIO 4 Tecnologa del ADN (identificacin de paternidad) Campo convergente de la biologa, computacin e informacin tecnolgica en una misma disciplina. La meta ltima de este campo es posibilitar el descubrimiento de nuevas ideas biolgicas, as como crear una perspectiva global de la que puedan ser discernidos principios unificadores de la biologa (www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/index.html). Tecnologa del ADN BIOINFORMTICA Es el estudio del genoma y su accin. El genoma es la suma total del material gentico presente en un organismo particular e incluye el ADN presente en los cromosomas y en los organelos subcelulares (ej., mitocondrias) e incluye el genoma de ARN de algunos virus. El anuncio el 26 de junio de 2000, del borrador del genoma humano en un 90%, marc un hito histrico para la humanidad. Tecnologa del ADN GENMICA Humanos 30,000 genes GENOMAS Chimpanc 30,000 genes A. thaliana 25,000 genes Ratn 30,000 genes C. elegans 19,000 genes D. melanogaster 13,000 genes 95% idntico 70% 20% 60% De 289 genes humanos implicados en enfermedades, hay 177 cercanamente similares a los genes de Drosophila. Entre una persona y otra el ADN solo difiere en 0.2% El genoma de un organismo es el juego completo de ADN. La planificacin del Proyecto Genoma Humano se inici en 1986, previsto para el 2007. En Junio de 2000 se present el 90% del borrador con la secuenciacin de unos 30,000 genes y 3 mil millones de pares de bases (pb). Los genes son secuencias especficas de bases que codifican instrucciones para hacer protenas. Los genes son un 2% del genoma humano. IDENTIDAD GENTICA Tecnologa del ADN GENMICA FUTURA 14th International Genome Secuencing and Analysis Conference (oct. 2002), la US Genomics Inc., present un aparato que lee la doble hlice de ADN sin cortarlo. Abre la doble hlice espiral de ADN, la lineariza y la pasa por un escaner para leerla en un lector fijo (como una plicula de carrete pasa por un proyector), las molculas se mueven a 30 M de bases por minuto. En 40 minutos se pueden Leer 3 mil M de bases. Si el sistema se logra pasar a un biochip el tiempo bajar a menos de cinco minutos por la habilidad de capturar un Terabyte (1024 o 1000 gigabites, un gigabite = 1024 o 1000 Megabites) de informacin cada pocos segundos.(Uehling, M. D, Bio-It World Nov. 12 2002). La Protemica es la caracterizacin sistemtica a gran escala de las protenas presentes en una clula, tejido u organismo. Es una disciplina en su infancia limitada por la tecnologa disponible para quienes la practican. Este es un diferente paradigma del reduccionismo convencional de la investigacin cientfica que tpicamente se enfoca en un simple gen o una protena; en tanto, que la investigacin del Proteoma (conjunto de todas las protenas que intervienen en los procesos biolgicos de una especie) aborda problemas tales como el nivel de protenas o actividades que cambian entre dos condiciones experimentales (Spelcher, 2002. The Scientist 16(8): 12, Apr. 15). Tecnologa del ADN PROTEMICA Est ocurriendo la transicin de dcadas de biologa reduccionista, enfocadas a un gen o a una protena, por utilizacin de las nuevas disciplinas omicas que incluyen: Transcriptmica (espectro de molculas de ARN en cada clula tipo), Metabolmica (todos los qumicos en la clula), Fisimica (funcin de rganos, tejidos y ultimadamente el organismo completo). Crtico para el xito de esta revolucin es la bioinformtica y nuevas estrategias de computacin, para modelar las propiedades de clulas, rganos y estados de enfermedad, produciendo rganos y pacientes virtuales (Goldman, M., Bio-It World Nov.24 2002). Tecnologa del ADN DISCIPLINAS MICAS La Ingeniera Gentica o tecnologa del ADNr se inici en la dcada de los 70s. Se refiere a un grupo de tecnologas usadas para cambiar la composicin gentica de las clulas y mover genes a travs de las fronteras de las especies para producir nuevos organismos. Se pueden aislar genes, modificarlos, introducirlos a nuevos hospederos, y clonarlos para obtener una ventaja novedosa sobre el organismo natural. INGENIERA GENTICA O ADNr ESTRUCTURA DE UN GEN Promotores Exones Sitio de inicio de la Transcripcin Sitio de terminacin de la Transcripcin Realzadores < 100 Kb Los promotores pueden ser genricos o tejido especfico La funcin del gen depende de los FACTORES de TRANSCRIPCIN (FT) que activan a las ARN pol. Los FT son: los Factores de Transcripcin General (se unen a secuencias promotoras genricas) y los Activadores de Transcripcin (se unen a secuencias promotoras especficas). Los FT pueden encenderse o apagarse en respuesta a estmulos del entorno del individuo. Entre los promotores de los genes que desarrollan la capacidad cerebral o talento de los individuos estn la alimentacin, la salud, el estmulo temprano con experiencias motivadoras (el juego), el amor. Intrones 1. Agrobacterium. Uso de la bacteria Como "Ingeniero Gentico". La bacteria conteniendo el inserto, infecta las clulas de la planta produciendo la recombinacin gentica. 2. Acelerador de Partculas (Gene Gun). Un can artificial bombardea micropartculas con el inserto, sobre la clula. 3. Electroporacin. Uso de carga elctrica para que el ADN atraviese la membrana nuclear. 4. Polietilenglicol. Exposicin de las membranas al PEG, facilita el movimiento de las molculas de ADN. 5. Silicon Wiskers. Inyeccin con fibras microscpi- cas, que atraviesan las membranas con los insertos. Ingeniera Gentica SISTEMAS DE TRANSFERENCIA GENTICA Enzimas producidas por Biotecnologa mediante el ADN recombinante se usan como aditivos en dietas de aves, para digerir carbohidratos complejos como las beta-glucanasas, alfa-amilasas, maltasas, oligo 1-6 glucosidasas, xilanasas, sacarasas; lipasas; proteasas y fitasas (para la utilizacin del fsforo). En Mxico, tienen un gran impacto en la produccin avcola proporcionando 3/5 de carne de aves para el consumo de protena animal. Se considera que el mercado mundial de enzimas como aditivos en los alimentos crecer del valor actual de US $ 60 millones al doble para el 2005. (Avila G., E. Huatulco 2001). Ingeniera Gentica NUEVAS PROTENAS ARROZ con altos niveles de tolerancia a diferentes condiciones ambientales de estrs. Se insertaron dos genes fusionados de trehalosa de E. Coli y un promotor tejido especfico dependiente del estrs. Los genes de trehalosa permiten la produccin de arroz an si est estresado por frio, sequa o altos niveles de salinidad e incrementa la produccin en 20%. La composicin qumica de los granos no cambia. El azcar trehalosa ayuda a estabilizar molculas biolgicas: lpidos, enzimas y otras protenas, en organismos en condiciones de estrs (PNAS Online, 27 nov. 2002). Ingeniera Gentica NUEVAS PLANTAS 1987 secrecin de Beta-lactoglobulina en leche de ratn. Produccin de protena C humana en leche de cerdos, para desrdenes como hemofilia. Hormonas de crecimiento humano en tejido seminal de cerdo. Antitrombina humana III, anti- coagulante sanguneo secretada en leche de cabras transgnicas. Cabras transgnicas para producir BioSteel fibra hecha por el hombre con propiedades de tela de araa. Ingeniera Gentica NUEVOS ANIMALES ARROZ DORADO con beta caroteno de genes de narciso y de Erwinia uredovora, pigmentos que se transforman en pro-vitamina A al ser ingeridos. Hay 70 patentes implicadas en la consecucin del arroz dorado; acuerdo con la industria reducen a 12 las patentes esenciales y se limita su cultivo gratuito a las explotaciones agrcolas que no superen los 10.000 dlares de beneficios anuales (Gebelli, 2001). ARROZ fortificado con un gen de la ferritina del frijol de soya. ARROZ con aa esenciales. Ingeniera Gentica NUEVOS ALIMENTOS Salmn transgnico por hormona de crecimiento. Producido por AF Protein Inc. Cuenta con el promotor de la protena de anticongelamiento de otra especie de pez. Crece de 4 a 6 veces ms rpido que un salmn no transgnico. Tiene un 20% en mejoramiento de la eficiencia de conversin del alimento. Cerdo transgnico para el precursor de la hormona de crecimiento proteasa resistente (GHRH). Por tcnicas de mutagnesis sitio dirigida y terapia electrognica, se introdujo en msculo de cerdo. Los efectos de una inyeccin de 10 mg de dosis del plsmido, en cerdos de tres semanas de edad, se mantuvo sobre 60 das con un 42% mayor que los controles a los 62 das (42 kg contra 29 kg). (ISB, 2000 mar). Ingeniera Gentica NUEVOS ALIMENTOS (ISB, 2001, oct; Netlink, 2000). PAPA con la vacuna que previene la insulina dependencia de la diabetes mellitus 100 veces ms poderosa que la actual vacuna. PAPA con la sub-unidad B antignica de la enterotoxina del Vibrio cholerae causante del clera). FRIJOL de SOYA con anticuerpos que protegen contra el virus 2 de Herpes simplex (HSV). TABACO con anticuerpos que previenen la caries dental producida por Streptococcus mutans. Ingeniera Gentica NUEVOS ANTIBITICOS Ingeniera Gentica CLONACION Trmino genrico para la replicacin en un laboratorio de genes, clulas u organismos de una entidad original, con copias genticas exactas del gen, clula u organismo original. Esta tcnica ha producido avances sensacionales en medicinas y vacunas. Tambin hay investigacin en clonacin de clulas humanas, rganos y otros tejidos. Esto puede producir el reemplazo de piel, cartilagos y hueso para victimas de quemaduras y accidentes, o de rganos. CELULAS MADRE BLASTOCISTO Clulas NERVIOSAS Clulas PANCREATICAS Clulas CARDIACAS Clulas Formadoras de SANGRE MASA DE CELULAS INTERNAS Clulas MADRE para transplantes de Organos DA 4 Cavidad Masa de clulas internas (clulas Madre Embrionarias) Masa de clulas internas clulas de cubierta interna Modificado de: Scientific American, 2001 Ingeniera Gentica TERAPIA DE CLULAS MADRE Ingeniera Gentica TERAPIA GNICA Rafael Valdes del Hospital de Nios de Mxico Implant clulas de cerdo en 12 adolescentes en procura de curar su diabetes. En su mtodo, us clulas especializadas para proteger el transplante de los sistemas inmunolgicos de los pacientes hospederos, que nunca haba sido ensayado en humanos. Los implantes en los pacientes constan de clulas pancreticas de cerdo, las cuales producen insulina (hay 150 millones de diabticos en el mundo) . Para prevenir el rechazo del transplante implant clulas de Sertoli (de testculo de cerdo) que han mostrado que protegen a los tejidos transplantados del sistema inmune recipiente en algunos modelos animales. Uno de los pacientes ha dejado de inyectarse insulina y cinco otros estn tomando menos insulina que antes. Los resultados han llegado sin usar medicamentos Inmuno- supresores, los cuales tienen que ser dados por el resto de sus vidas a recipientes de transplantes (Nature/Vol. 419/5 sept. 2002). Marcadores SONDAS DE ADN COMPAA PRODUCTO GENES CARACTERSTICAS Affimetrix GeneChip Human Genoma + 12000 GeneChip Human Cancer + 1700 Seleccin de investigadores GeneChip Custom Arrays + 12000 Arreglos diseados por clientes MBG Biotech Pan Human array 30000 Genes humanos en 3 slides Clontech Atlas Human 1.0 1081 Atlas Human Apoptosis array 205 Atlas Human Cardiovas array 588 Atlas Human Neurobiol array 588 Atlas Human Oncogene array 588 El microarreglo de ADN pone secuencias de genes en una lmina. Los ARNm de una clula particular con tags fluorescentes, se hibridizan, a las secuencias cuando son complementarias. Un escner mide la fluorescencia de cada muestra sobre la lmina, para determinar la presencia o actividad de los genes. Marcadores LOCALIZACIN DESORDENES GENTICOS GEN
DROGA
CONSECUENCIAS CLNICAS NAT-2 Isoniazida, hidralazina, procainamida, sulfonamidas Neuropata, lupus eritomatoso CYP2D6 bloqueadores antidepresivos, codena, debrisoquina, antisicticos, muchos otros Arritmias, disquinecia con antisicticos, efectos narcticos, cambios en eficacia, muchos otros CYP2C9 Tolbutamida, feniltoina, anti inflamatorios no esteroideos Efectos anticoagulantes modificados de warfarin RYR-1 Halotano y otros anestsicos Hipertermia maligna G6PD Primaquina, sulfonamidas, acetanilida, otros Anemia hemoltica ACE Captopril, enalapril Modif. respuesta a tratamiento de falla cardaca, hipertensin, enfermedad renal HERG Quinadina Arritmia cardaca (sndrome QT largo) HKCNE2 Claritromicina Arritmia inducida por droga Shumin Nie y sus colegas desarrollaron un cristal superconductor a escala nanomtrica llamado punto cuntico (diez nanmetros es un dimetro 1000 veces menor que el grosor de un cabello humano). Las nanopartculas que usa pueden brillar en un espectro de seis colores visibles y cuatro infrarrojos. Variando su tamao ligeramente, se puede hacer que brillen en uno de los 10 colores disponibles. En un futuro prximo, podrn ser enlazadas a frmacos mdicos o agentes teraputicos para identificar y tratar clulas cancerosas. Una vez detectadas estas ltimas, podran actuar como "bombas inteligentes", liberando una cantidad controlada de medicamento que sea apropiado para cada tipo particular de clula (Bowie, L. Georgia Institute Technology, oct. 23 2002). Marcadores FUTURO NANOTECNOLGICO El que investiga genera nuevos CONOCIMIENTOS, que pone a disposicin de otros como DATOS, que al ordenarse son INFORMACIN, que puede llegar a ser CONOCIMIENTO til, apropiado o adaptado, por la infraestructura de investigacin de C&T que posea un pas. REFLEXIONES La incidencia positiva que las actividades de I+D tienen sobre el desarrollo de los pases ha conducido a los gobiernos de los diferentes estados a destinar una parte de sus recursos financieros a potenciar ambas actividades. De esta manera ha sido posible diversificar las lneas de investigacin con la finalidad de abarcar cada vez ms campos y, al mismo tiempo, asegurar la formacin de personal cualificado.
CHINA, actualmente a la vanguardia en el desarrollo cientfico y tecnolgico mundial, fundament en 1980 su productividad y competitividad, mediante Polticas de Ciencia y Tecnologa, que form miles de Ph.D. en todas las disciplinas de la C&T, en las ms prestigiosas Universidades del mundo.
CHILE, pas al que imitamos constantemente, ejecuta la estrategia de las tres (C) COPIAR, COMPRAR, CREAR, para lo cual cuenta con recurso humano calificado. REFLEXIONES Es de urgencia para el pas apostarle a una Poltica de Nacin de Ciencia y de Tecnologa, que identifique los nichos de conocimiento a ocupar, y promueva la adquisicin de infraestructura necesaria y la formacin de recursos humanos con capacidad de investigar, desarrollar y aprovechar tecnologas que ayuden a mejorar la calidad de vida de los salvadoreos. REFLEXIONES MUCHAS GRACIAS POR SU ATENCION BIENVENIDAS SUS PARTICIPACIONES Atentamente: ROBERTO ALEGRIA ralegria@conacyt.gob.sv www.conacyt.gob.sv llamado punto cuntico