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CAPITULO 2

AMINOCIDOS
BIOQUMICA APLICADA
Aminocido

Los aminocidos son los monmeros de las


protenas.

Los aminocidos estn formados por:

Un carbono unido a un grupo carboxilo.

Un grupo amino

Un hidrgeno y

Una cadena R de composicin ariable

!n los aminocidos naturales" el grupo


amino y el grupo carboxil se unen al mismo
carbono #ue recibe el nombre de alfa
asim$trico.

!xisten unos %& aminocidos distintos


componiendo las protenas.

'$cnicamente hablando" se les denomina


alfa(aminocidos" debido a #ue el grupo
amino )*+%, se encuentra a un tomo de
distancia del grupo carboxilo )-..+,.
!structura bsica !structura bsica
de un aminocido de un aminocido
/minocidos

'odos Los /minocidos


#ue forman parte de las
protenas son
L(aminocidos

La unin #umica entre


aminocidos en las
protenas se produce
mediante un enlace
peptdico
0rmula general
-arbono 1" es un carbono #uiral por lo tanto hay
enantiomeros )isomeros pticos,.
Alanina
Acido Asprtico
Arginina
Aminocidos estndar.
Hay veinte -
aminocidos,
denominados
aminocidos
estndar, que
prcticamente
se encuentran
en todas las
protenas.
Aminocidos
estndar.
Los
aminocidos
estndar
difieren unos
de otros en la
estructura de
las cadenas
laterales
enlazadas a
los tomos de
carbono .
TIPOS D P!OTINAS

2roteinas simples. solo estn compuestas de


aminocidos

-omposicin: -3 4&5" .3%65" *3785" +395"


:365.

!;plo. <luten.

/nalisis de =;eldhal. 2 3 *p)7&&>78,

2roteinas con;ugadas. !;. hemoglobina


+ay dos tipos L y ?
La mayoria de los aminoacidos con actiidad biolgica son los del
tipo @LA )forman parte de las protenas,.
!xisten algunos casos de // del tipo @?A con actiidad biolgica" los
cuales se han encontrado en ertebrados superiores" inertebrados y
bacterias.
"ig#ra$ Imgenes espec#lares de la alanina
-onfiguracin:
El comportamiento anftero se refiere a que, en disolucin acuosa,
los aminocidos son capaces de ionizarse, dependiendo del pH:

como un cido (cuando el pH es bsico),

como una base (cuando el pH es cido)

o como un cido y una base a la vez (cuando el pH es neutro). En


este ltimo caso adoptan un estado dipolar inico conocido como
zitterin.

El pH en el cual un aminocido tiende a adoptar una forma dipolar
neutra (i!ual nmero de car!as positivas que ne!ativas) se
denomina "unto #soel$ctrico.
%a solubilidad en a!ua de un aminocido es m&nima en su punto
isoel$ctrico.
COMPORTAMIENTO ANFTERO DE LOS AMINOACIDOS
Clasi%icaci&n de AA
!xisten muchas formas de clasificar los aminocidos.
:egBn las propiedades de su cadena. )caractersticas #umicas,
:egBn su obtencin.
:!<C* L/ -/?!*/
*eutros polares" polares o hidrfilos : :erina ):er":," 'reonina )'hr"',"
-istena )-ys"-," /sparagina )/sn"*," <lutamina )<ln"D, y 'irosina
)'yr"E,.
*eutros no polares" apolares o hidrfobos: <licina )<ly"<," /lanina
)/la"/," Falina )Fal"F," Leucina )Leu"L," Gsoleucina )Gle"G," Hetionina
)Het"H," 2rolina )2ro"2," 0enilalanina )2he"0, y 'riptfano )'rp"I,.
-on carga negatia" o cidos: Jcido asprtico )/sp"?, y Jcido
glutmico )<lu"!,.
-on carga positia" o bsicos: Lisina )Lys"=," /rginina )/rg"R, e
+istidina )+is"+,.
/romticos: 0enilalanina )2he"0," 'irosina )'yr"E, y 'riptofano )'rp"I,
)ya incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares,.
CLASI"ICACI'N D LOS AMINOCIDOS.
aa
*. 2.L/R!:
-.* * KJ:G-.
/LG0J'G-.:
/R.HJ'G-.:
2.L/R!: :G* -/R</
-.* <RU2.: J-G?.:
2.L/R!: -.* -/R</
NO POLA!S ALI"TICOS
(
2
N C( C
(
O(
O
(
2
N C( C
C(
)
O(
O
(
2
N C( C
C(
O(
O
C(
)
C(
)
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C( C(
)
C(
)
GLICINA
Gli
ALANINA Ala VALINA
Val
LEUCINA
Leu
(
2
N C( C
C(
O(
O
C(
)
C(
2
C(
)
ISOLEUCINA
Ile
(N
C O(
O
PROLINA
Pro
*. 2.L/R!: /R.HJ'G-.:
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
O(
(
2
N C( C O(
O
FENILALANINA
Phe
TIROSINA
Tyr
TRIPTOFANO
Trp
C(
2
(N
2.L/R!: :G* -/R</
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
O(
(
2
N C( C
C(
O(
O
O(
C(
)
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
S(
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C(
2
C
N(
2
O
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C
N(
2
O
SERINA
Ser
TREONINA
Tre
CISTENA
Cys
GLUTAMINA
Gl
ASPARRAGINA
As
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C(
2
S
C(
)
METIONINA
Me!
-on carga
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C(
2
C(
2
C(
2
N(
2
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C(
2
C(
2
N(
C
N(
2
N(
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
N
N(
LISINA
Lis
ARGININA
Ar"
#ISTIDINA
#ys
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C
O(
O
(
2
N C( C
C(
2
O(
O
C(
2
C
O(
O
ACIDO GLUT$MICO
Glu
$CIDO ASP$RTICO
Asp
BSICOS (O CARGADOS +)
CIDOS (O CARGADOS -)
Seg*n s# o+tenci&n

/ los aminocidos #ue necesitan ser ingeridos por el


cuerpo para obtenerlos se les llama esenciales.

2ara humanos" los aminocidos esenciales son:


7. Falina )Fal,
%. Leucina )Leu,
6. 'reonina )'hr,
L. Lisina )Lys,
4. 'riptfano )'rp,
8. +istidina )+is,
9. 0enilalanina )2he,
M. Gsoleucina )Gle,
N. Hetionina )Het,
7&./rginina )/rg, )Re#uerida en niOos y tal eP ancianos,
Aminocidos no proteicos
:on deriados de otros aminocidos" es decir" se incorporan a la protena
como uno de los aminocidos proteicos y" despu$s de haber sido formada
la protena" se modifican #umicamenteQ por e;emplo" la hidroxiprolina.
Propiedades

Jcido(bsicas.

-ual#uier aminocido puede comportarse como cido y


como base") sustancias anfteras,

-uando una mol$cula presenta carga neta cero est en su


punto isoel$ctrico.

:e comportan como sustancias tampn.

Rpticas.

'odos los aminocidos excepto la glicina" tienen el


carbono alfa asim$trico lo #ue les confiere actiidad
ptica.

Dumicas.

Las #ue afectan al grupo carboxilo )descarboxilacin,.

Las #ue afectan al grupo amino )desaminacin,.

Las #ue afectan al grupo R.

!n medio acido" los aminocidos estn totalmente


protonados y tienen carga positia )forma catinica,.

:olucin casi neutra" los aminocidos existen como iones


dipolares. estos iones tambi$n se conocen como
,-itteriones.

2ara p+ altos" los aminocidos se cargan negatiamente


)forma aninica, por#ue los iones hidrxido sacan los +S de
las mol$culas.
P!OPIDADS IONICAS
-uras de titulacin

2ara un
aminocido mono
amnico y mono
carboxilo

PI . /p01 2 2342
C#r5a de 5aloraci&n de la glicina
El pH controla la carga de la
glicina cati!nica por deba"o
de pH # $.%& ani!nica por
encima de pH # '.( y
z)itteri!nica entre pH # $.%
y '.(. El pH isoel*ctrico es
(.+.
El punto isoel*ctrico es el
pH al que el aminocido se
encuentra en equilibrio
entre las dos formas, como
el z)itteri!n dipolar con
una carga neta de cero.
!;emplo" la alina:

a p+ 7: carboxilo como (-..+ y amino como


(*+
6
S
. !l aminocido tiene carga positia neta.

/ p+ 9" el carboxilo se disocia )(-..(, y el amino


sigue protonado )(*+
6
S
,Q )PTitterion,.

/ p+ 76" el carboxilo sigue disociado )(-..(, y el


amino pierde el protn ) (*+
%
,Q el aminocido
#ueda con una carga

negatia.
p=a

!s una forma simplificada de obserar la constante de


e#uilibrio =

La ecuacin de +enderson(+asselbach rige la disociacin de


cual#uier cido o base d$bil a un p+ determinado.

La ecuacin implica el uso de las concentraciones de


e#uilibrio del cido y su base con;ugada. 2ara el clculo del
p+ en soluciones buffer.
?onde" +/ +
S
S /
(
=a 3 U +
S
VU/
(
V
U+/V
p+ 3 (log U +
S
V
2unto isoelectrico

p+ en el cual un aminocido tiende a adoptar una forma


dipolar neutra.

La sol#+ilidad en ag#a de #n aminocido es m6nima


en su punto isoel$ctrico.
%9
2R.2G!?/?!: DUWHG-/:

"ormaci&n de enlaces PPT7DICOS$


P!OPIDADS 8UIMICAS
a, Reacciones del grupo amino.
b, Reacciones del grupo carboxilo.
c, Reacciones del grupo R
a3 !eacciones del gr#po amino
La ninhidrina reacciona con el grupo amino" lo oxida y libera
amonio el cual se condensa con la ninhidrina reducida" y con
otra mol$cula de ninhidrina libre" para producir un producto
pBrpura.
Reaccin de la ninhidrina
!s una de la reacciones ms importantes" la cual se ha
utiliPado durante muchos aOos para detectar y
cuantificar a.a. en cantidades del orden del microgramo.
La ninhidrina descarboxila por oxidacin los (a.a. a -.
%

y un aldehdo" formndose un comple;o de color aPul(
p*rp#ra )l : 49& nm,.
Los a.a. como la" prolina e hidroxiprolina" producen un
color amarillo con ninhidrina.
Otras reacciones

2rolina e hidroxiprolina" producen color amarillo con


ninhidrina.
R!/--G.* -.* ?G*G'R.0LU.R.K!*-!*..

Principal aplicaci&n: determinacin del residuo *(terminal


de cadenas peptidicas.

!l comple;o formado es el dinitrofenil )?*2, de color


amarillo.
R!/--G.* -.* 0!*GLG:.'G.-G/*/'..

Reaccin de !dman. -on cloruro de dansilo.

Aplicaci&n principal: determinar la secuencia de cadenas


peptdicas desde el extremo *(terminal.
+3 !eacciones del gr#po COO9

-on bromohidruro de litio.


R!/--G.*!: ?!L <RU2. R.
Reacciones especficas:

Reaccin de Hillon.)mercurio en acido ntrico fumante,


'irosina( rosado

Reaccin de :ullian.)cianuro sdico al 45,. -isteina( ro;o

Reaccin de 0olin.)7"%(nafto#uinon(L(sulfonato sdico al


&"%5" hidrxido sdico al 7&5,. Hetionina. ro;o
!stereoismerismo de aminoacidos

Gsmeros: dos o mas compuestos #ue tienen el


mismo numero" clase de tomos y 2H.

Gsomera estructural.

!stereoisomera.

Gsmeros geom$tricos. -is( trans.

!nantiomeros. Gsmeros pticos. L. ?


!nantiomeros
Los aminocidos #ue tienen un centro asim$trico en el carbono alfa
pueden existir en dos formas" )? y L," las cuales son imgenes al
espe;o una de la otra.
Las dos formas enantimeras tienen las mismas propiedades fsicas
excepto la interaccin con la luP polariPada en un plano: un ismero
desa el plano de polariPacin hacia la derecha" mientras el otro
ismero lo desa en la direccin contraria.
La mePcla en cantidades e#uimolares de cada enantimero en una
solucin se denomina mePcla rac$mica y es pticamente inactia.
Las dos formas en cada par son denominadas estereoismeros"
ismeros pticos o enantimeros.
'odos los aminocidos #ue se encuentran en las protenas son de
configuracin L. *o obstante los aminocidos de configuracin ? son
encontrados en algunos antibiticos y en paredes de c$lulas
bacterianas.
P!OPIDADS OPTICAS
-romforo. Hol$cula capaP de absorber luP a cierta longitud de onda
Los aromticos absorben a %M& nm
Los dems a %%& nm
SPA!ACION D AMINOACIDOS

Los a.a. son liberados de las protenas mediante una


hidrlisis. Un hidroliPado proteico" obtenido por coccin
con +-l 8*" presenta una mePcla de a.a.
'$cnica de -romatografa:

!n todas las separaciones cromatogrficas" las


mol$culas son separadas dentro de una fase
estacionaria y una mil.

?ependi$ndo del tipo de fase estacionaria podemos


distinguir: cromatografa en papel" cromatografa en
capa fina" o cromatografa en columna" en gases" +2L-"
etc.

La separacin depende de la tendencia relatia de las


mol$culas en la mePcla de asociarse con ms fuerPa a
una o a otra fase.
Cromatogra%6a en papel

Las muestras se aplican en un punto marcado aprox. / 4


cm del extremo de una tira de papel filtro" y $sta se
suspende en un recipiente sellado #ue contiene el
solente cromatogrfico )para a.a. son mePclas de agua"
alcoholes y cidos o bases" constituyendo la fase mil,.

La fase moil asciende por capilaridad. -uando ha


aanPado hasta el otro extremo" la tira se seca y se trata
para permitir la isualiPacin de las mol$culas de inter$s
)e;.: para a.a. se trata con ninhidrina al &.45 en acetona"
seguida de calentamiento de N&(7&&X - durante unos
minutos,.
Cromatogra%6a en papel

La relacin entre la
distancia recorrida por un
a.a. con la distancia #ue
ia;a el solente" medidas
ambas desde el sitio
marcado para la aplicacin
de la mePcla de a.a." se
asigna como alor Rf
)moilidad relatia con el
sustrato, de ese a.a.

La moilidad puede
expresarse en relacin a la
de un estandar
Rf: La relacin entre las distancias recorridas por incompuesto dado y el
frente de la fase mil" desde el origen del cromatograma se conoce
como !% )rate factor," y tiene un alor constante para cada sustancia
en unas condiciones cromatogrficas dadas )temperatura"
composicin de fase mil" tamaOo de la cubeta...etc,. !l clculo del
Rf se realiPa segBn:

0undamento
Los a.a. con grandes cadenas laterales no polares )Leu" Gleu" 0en" 'rip" Fal"
Het" 'ir, migran ms #ue #ue a#uellos con cadenas laterales mas cortas no
polares )2ro" /la" <li, o con cadenas laterales polares )'hr" <lu" :er" /rg" /sp"
+is" Lis" -is,.
!sto refle;a la mayor solubilidad relatia de las mol$culas polares en la fase
estacionaria hidroflica" y de las mol$culas no polares en solentes orgnicos.
Cromatogra%6a en capa %ina
.!s muy similar a la cromatografa en papel" pero
se utiliPa como fase estacionaria unos soportes
adsorbentes como celulosa puleriPada o gel de
slica" incorporados en capa fina sobre una
placa de idrio.
La cromatografa en capa fina de adsorcin se
aplica a sustancias apolares" como lpidos" no
as a a.a. ni la mayora de los p$ptidos.
Cromatogra%6a en capa %ina
Cromatogra%6a de intercam+io i&nico
La columna cromatogrfica consiste en un tubo largo relleno de
partculas de una resina sint$tica" #ue contiene grupos cargados
fi;osQ las #ue contienen grupos aninicos se denominan resinas de
intercambio catinico )e;.: resina con grupos :.6(, y las #ue
contienen grupos catinicos" resinas de intercambio aninico.
La afinidad de cada a.a. por la resina est afectada por el p+ )#ue
determinar el estado de ioniPacin de la mol$cula, y la
concentracin de iones salinos" #ue pueda competir con la resina por
asociacin con el a.a.
:e puede" por lo tanto" conseguir la separacin ptima de los a.a.
mediante un cambio gradual del p+ o de la concentracin salina de
la solucin #ue se pase a tra$s de la columna" de manera #ue se
cree un gradiente de p+ o de sal.
Una me;ora moderna de $sta y otras t$cnicas cromatogrficas se
denomina cromatografa l#uida de alta resolucin )+2L-,.
0undamento de !lectroforesis
-uando una mePcla de mol$culas
ioniPadas y con carga neta son
colocadas en un campo el$ctrico"
estas experimentan una fuerPa de
atraccin hacia el polo #ue posee carga
opuesta" de;ando transcurrir cierto
tiempo las mol$culas cargadas
positiamente se desplaParan hacia el
ctodo )el polo negatio, y a#uellas
cargadas positiamente se desplaParan
hacia el nodo )el polo positio,.
Separaci&n electro%or:tica.
,epresentaci!n
simplificada de la
separaci!n
electrofor*tica de la
alanina, lisina y cido
asprtico a pH # (.
La lisina cati!nica es
atrada -acia el
ctodo, el cido
asprtico ani!nico es
atrado -acia el
nodo y la alanina se
encuentra en su
punto isoel*ctrico,
por lo que no se
mueve
!lectroforesis ertical
Determinaci&n de la composici&n de los aminocidos.
En el analizador de
aminocidos, el
-idrolizado pasa a trav*s
de una columna de
intercambio i!nico. La
soluci!n que emerge de la
columna se trata con
nin-idrina y su
absorbancia se registra en
funci!n del tiempo. .ada
aminocido se identifica
por el tiempo de retenci!n
necesario para pasar a
trav*s de la columna.