Universidad Nacional Mayor de San Marcos

Facultad de Ciencias Biolgicas

CURSO BIOQUIMICA
Capitulo I
Dr. A. Yarlequ
La Bioqumica bsica estudia la composicin molecular de la
materia viva, la estructura y funcin de las biomolculas,
con especial incidencia en aquellas que cumplen funciones
esenciales para el mantenimiento del estado vital de los
organismos.
BIOQUIMICA
Definicin

ORGANIZACIN DE LAS BIOMOLECULAS

Nivel Estructura Tipos________
1 Molculas primordiales CO
2
, H
2
0 N
2
O
2
2 Unidades monomricas Aminocidos, nucletidos,
monosacridos y ac.Grasos.
3 Macromolculas Protenas, c. nucleicos,
polisacridos y asoc. de lpidos
4 Estructuras supramoleculares Ribosomas, cromatina,
membrana.
5 Organelas Celulares Mitocondria, RE, Golgi,
cloroplasto, peroxisoma etc.
6 Clula Procarionte , Eucarionte
Enlaces qumicos de las biomolculas
Tipo Distancia interatmica
()
- G (Kcal/mol)
Covalente 0,74 50 - 110
De hidrgeno 1 3 - 7
Inico 0,9 1,2 5
Interaccin hidrofbica 1 1,2 3 -5
F. de Van Der Walls 1,3 2
Energa total de la entropa =4
Energa total de los enlaces =5
HISTORIA
-Leonardo Da Vinci (1492-1510) compar la nutricin animal con el arder de
la llama.
-Preistley 1770-1774 descubri el oxigeno, los animales lo consumen y las
plantas lo producen.
-Scheele 1770-1786 aisl la glicerina , cido rico y algunos ac.tricarboxlicos
-Roulle 1733 aisl urea de la orina
-Lavoisier 1780-1789 , respiracin es un proceso oxidativo se consume
oxgeno.
-Vauquelin y Robiquet 1806 aisla el primer aminocido Asparagina
-Wholer 1828 sntesis de urea apartir de productos inorgnicos
-Bernard 1850-1855 aisl el glucgeno y describi su transformacin en
glucosa.
-Pasteur 1854-1864 la fermentacin es producida por microorganismos.
-F. Hoppe Seyler 1864 cristaliz la primera protena: hemoglobina.
-Meischer 1869 descubri el ADN.
-Kuhne 1877 propuso el termino de enzima.
-Emil Fischer 1894 especificidad de la enzimas y efectos: llave-
cerradura.
- Buchner 1897 la fermentacin puede ser producido por extracto de
levaduras.
-Takamine, Aldrichs y Abel aislaron a la Epinefrina
-Fischer y Hotmiester 1902 las protenas son cadenas de aminocidos
-Neuberg 1903 introdujo la palabra Bioqumica.
-Warburg 1912 estudio de enzimas respiratorias y el efecto del cianuro.






-Michaelis y Menten 1913 cintica de las reacciones enzimticas
-Fleming 1921 aisl lisozima
-Warburg y Christian 1932 aislaron la flavoprotena.
-Embden y Meyerhoff 1933 aislaron varios productos de la gluclisis
-Stanley 1935 cristaliz el primer virus, del mosaico del tabaco.
- 1940: Chain y Florey extraen y purifican la penicilina
-Leloir 1948 rol de los nucletidos uridnicos en la sntesis de
carbohidratos.
-1950 Lehninger fosforilacin y transporte electrnico estn
acoplados.
Pauling y Corey teora del hlice .
-Sanger 1953 secuencia de la insulina.
-Watson y Crick 1953 postularon el modelo de la doble hlice para el
DNA.
1960 Jacob,Perrin, Schez y Monod proponen la hiptesis de Opern

Peruztz y Kendrew :datos cristalogrficos de Hb y Mioglobina

1965 Elucida el cdigo gentico (Niremberg, Khorana y Ochoa)
Monod, Wyman y Changeux proponen transicin alostrica de
protena.
1975 Baltimore, Dulbecco,y Temin: Interaccin virus que producen
tumores y el material gentico de las clulas.
1985Mullis desarrollan tcnica PCR .

-1995 Descubrimiento del control gnetico de las etapas tempranas
del desarrollo embrionario.
Venter y col. publican la primera secuencia completa del
genoma de H. influenzae.




- -2000 Se descubre transduccin de seales y fosforilaciones y
desfosforilaciones de protenas en el SN.
Estructura tridimensional de la subunidad mayor del ribosoma.
Se mapea las secuencia completa del cromosoma 21
Se publica secuencia completa del genoma de D. melanogaster

-2002 Trabajos en clula madre y manipulacin gentica en modelos
animales.
-2004 Organismos transgnicos
-2006 Seales en clulas nerviosas (IBRO)
-2008 Identificacin de seales en clulas cancerosas.
--2009 Regeneracin de Tejidos. Terapia Gnica.


AMINOCIDOS

La hidrlisis total de las protenas da lugar a veinte Aminocidos, que
son los llamados Aminocidos proteicos.
Los aminocidos son los monmeros de las protenas, que a su
vez son polmeros lineales de aminocidos. En ocasiones, la
hidrlisis de una protena da lugar a aminocidos con estructura diferente
a la de estos veinte. Se trata, por lo general, de modificaciones
postraduccionales, esto es, modificaciones qumicas de los aminocidos
proteicos llevadas a cabo sobre la molcula completa de protena. Hay
asimismo Aminocidos no proteicos, que teniendo una estructura
qumica de aminocido, no forman parte de las protenas.

ESTRUCURA Alfa Aminocido (tomo de carbono saturado )
C (central)
Grupo carboxilo
Grupo amino
tomo de Hidrgeno
Cadena lateral R
A pH fisiolgico, el grupo amino se encuentra protonado (-NH3+) y el
carboxilo sin protonar (-COO
Carbono presenta una
configuracin tetradrica
en la que C se dispone al
centroo y los cuatros
elementos que se unen a
l ocupan los vrtices.
Cuando en el vrtice
superior se dispone el -
COOH y se mira por la
cara opuesta al grupo R,
segn la disposicin del
grupo amino (-NH2) a la
izquierda o a la derecha
del carbono se habla de
" -L-aminocidos o de " -
D-aminocidos
respectivamente. En las
protenas slo se
encuentran aminocidos
de configuracin L.
Los aminocidos son compuestos slidos; incoloros; cristalizables; de
elevado punto de fusin (habitualmente por encima de los 200 C);
solubles en agua; con actividad ptica y con un comportamiento
anftero.
La actividad ptica se manifiesta por la capacidad de desviar el plano
de luz polarizada que atraviesa una disolucin de aminocidos, y es
debida a la asimetra del carbono , ya que se halla unido (excepto
en la glicina) a cuatro radicales diferentes. Esta propiedad hace
clasificar a los aminocidos en Dextrogiros (+) si desvian el plano de
luz polarizada hacia la derecha, y Levgiros (-) si lo desvian hacia la
izquierda.
El comportamiento anftero se refiere a que, en disolucin acuosa, los
aminocidos son capaces de ionizarse, dependiendo del pH, como un
cido (cuando el pH es bsico), como una base (cuando el pH es
cido) o como un cido y una base a la vez (cuando el pH es neutro).
En este ltimo caso adoptan un estado dipolar inico conocido como
zwitterin.
Aminocidos poco frecuentes en las protenas
4 hidroxiprolina, derivado de la prolina.
Hidroxilina , deriva de lisina
Desmosina y la isodesmosina
Aminocidos No proteicos
Se conocen unos 150 aminocidos que se encuentran en diferentes
clulas y tejidos en forma libre o combinada, pero no en las
protenas. La mayora deriva de los alfa aminocidos. Algunos de
estos aa actan como precursores importantes o intermediarios en el
metabolismo: Beta alanina precursor del cido pantotnico ; la
homocistena y la homoserina son intermediarios en el metabolismo
de aminocidos; la citrulina y ornitina son intermediarios de la
sntesis de arginina
-Agentes qumicos para transmisin de impulsos nerviosos : alfa
aminobutirico
Aminocidos alifticos

NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
Glicina Gly G
Alanina Ala A
Valina Val V
Leucina Leu L
Isoleucina Ile I



Aminocidos aromticos

NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
Fenilalanina Phe F
Tirosina Tyr Y
Triptfano Trp W



Hidroxiaminocidos

NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
Serina Ser S
Treonina Thr T



CLASIFICACIN
a) En base a los grupos funcionales predominantes
Tioaminocidos

NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
Cistena Cys C
Metionina Met M



Aminas secundarias

NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
Prolina Pro P



Aminocidos dicarboxlicos

NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
cido asprtico Asp D
cido glutmico Glu E
Asparragina Asn N
Glutamina Gln Q



Aminocidos dibsicos
NOMBRE Abrev. 3 Abrev. 1
Lisina Lys K
Arginina Arg R
Histidina His H



-Apolares (Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Trp, Met, Cys y Gly)

-Polares (Asn, Gln, Ser, Thr y Tyr)

-Carga negativa (Asp y Glu)

-Carga positiva (Arg, His y Lys)
b) En funcin de la caractersticas de la cadena lateral .
En la glicina, el
aminocido ms
simple, la cadena R es
un tomo de
hidrgeno



Figura: Disposiciones del enlace peptdico en el espacio.

PEPTIDOS Y PROTEINAS

Pptido: hasta 50 aminocidos.
Oligopptido: pptido pequeo.
Polipptido: pptido grande.
Protenas oligomricas: formadas por subunidades
idnticas llamadas protmeros.
Protenas sencillas y conjugadas (grupo prosttico)