Bioquimica aplicada
1. Concentracin de Enzima
2. Concentracin de sustrato
3. pH
4. Temperatura
5. Presencia de activadores
1. Concentracin de Enzima
En presencia de exceso de sustrato, la actividad es
proporcional a la concentracin enzimtica
2. Concentracin de sustrato
Las reacciones enzimaticas se saturan con el sustrato
Efecto autosaturante
3. Efecto del pH
La actividad enzimtica pasa por un mximo (pH ptimo).
El pH ptimo de las enzimas vara ampliamente; para
la pepsina, del estmago, es de 1,5, la arginasa tiene
un pH ptimo de 9,7.
La gran mayora de enzimas tienen un ptimo
alrededor del pH fisiolgico de, ~7.0
Explicacin:
El sitio activo de la enzima esta frecuentemente compuesto
de grupos ionizables que deben estar en la forma inica
para tener actividad, unir los sustratos o catalizar la
reaccin.
Una enzima que se someta a valores extremos de pH, se
desnaturaliza.
En el efecto de la temperatura
hay dos componentes:
1.Aceleracin de la reaccin
segn la ecuacin de
Arrhenius. (dentro del margen
de actividad)
k = A exp (-Ea/RT)
Al aumentar la temperatura, la
velocidad de reaccin aumenta
y, para casi todas las enzimas,
un incremento de 10C duplica
e incluso triplica la velocidad de
reaccin.
2. Desnaturalizacin trmica de
la protena.
Para muchas enzimas la regin
4. Temperatura
CINETICA ENZIMATICA
Cintica de reacciones con un slo substrato
Michaelis y Menten propusieron un modelo para
relacionar la velocidad de reaccin con la concentracin
de substrato. Suponiendo la existencia de un solo
complejo central, el esquema de reaccin sera:
Velocidad de reaccion VS
concentracion
La ecuacin de
Michaelis-Menten
describe como vara la
velocidad de las
reacciones catalizadas
por enzimas de
acuerdo a la
concentracin de
sustrato:
Parmetros enzimticos
Caractersticas de Km:
Km de algunas enzimas
ENZIMA
SUSTRATO
Km (mM)
Catalasa
H2O2
25.0
Hexoquinasa
ATP
0.4
D-Glucosa
0.05
D-Fructosa
1.5
HCO3-
9.0
Anhidrasa carbnica
Quimotripsina
Gliciltirosinilglicina
N-Benzoiltirosinamida
108.0
2.5
-Galactosidasa
D-Lactosa
4.0
Treonina deshidrogenasa
L-Treonina
5.0
Vmax
Vmax es una constante
Vmax es la velocidad mxima
terica de la reaccin. Se
alcanzara si todos los centros
activos estan ocupados.
Para alcanzar la velocidad
mxima se requiere que [S]
>> [E] y que TODAS las
molculas de enzima estn
unidas al sustrato.
Vmax se alcanza
asintticamente a medida
que la concentracin de
sustrato aumenta
CALCULO DE PARMETROS DE LA
ECUACIN
La Linearizacin de
Lineweaver-Burk .
Artificio matemtico que
permite deducir
grficamente los valores de
km y Vm.
El artificio consiste en
convertir a la ecuacin M-M
en la ecuacin de una recta.
Recta de forma Y = A + BX,
donde:
Y = 1/v,
A = 1/Vm,
B = km/Vm, y
X = 1/[S]
Ploteo de Eadie-Hostee
El ploteo se realiza vi/ vi/[S], con
ese fin se multiplica ambos
miembros de la inversa de la
ecuacin M-M por vi.Vmax
obtenindose:
Vmax (vi) = KmVmax(vi) +
Vmax(vi)[S]
vi
Vmax[S]
Vmax [S]
Vmax = Km.vi + vi
[S]
Ordenando:
vi = Vmax - Km.vi
[S]
Esta es una ecuacin de lnea
recta de la forma Y = a bX.
Pendiente= Km,
Ordenada en el origen= Vmax.
+ [S] . 1 .
Vmax
Ploteo Eisentahl-Cornish
Vmax
= vi + vi.Km
[S]
obedecen la
ecuacin de
Michaelis-Menten.
Su cintica no es
Michaeliana.
Esto ocurre con las
llamadas enzimas
alostricas, cuya
grfica v contra [S]
no es una hiprbola,
sino una sigmoide
(en forma de s)
Actividad enzimatica
Actividad enzimtica = cantidad de enzima que
transforma 1 mol de sustrato por min = una
forma comn de expresar la velocidad
Actividad especfica = unidades por mg de
protena total de la preparacin enzimtica.
Unidad ms moderna: kat = nmoles de producto /
seg
REGULACION DE LA ACTIVIDAD
ENZIMATICA
INHIBIDORES
IRREVERSIBLES.
Inhibicin permanente
Unin irreversible por medio
de enlaces covalentes.
Modificada la enzima, est
siempre inhibida.
Ejplo: efecto del mercurio,
plomo, gases neurotxicos y
compuestos arsenicales.
In cianuro, CN-: Se fija con
gran afinidad a la sexta posicin
de coordinacin del Fe del
complejo citocromo oxidasa.
Penicilinas: Inhiben enzimas
sernicas que participan en la
formacin de la pared
bacteriana
REVERSIBLES.
La unin del inhibidor y
la enzima es reversible.
Al quitar el inhibidor del
medio, se recupera la
actividad.
Se unen a la enzima por el
mismo tipo de
interacciones que se
producen entre las
enzimas y los sustratos.
Hay INHIBIDORES
COMPETITIVOS, NO
COMPETITIVOS, y
ACOMPETITIVOS.
Agentes nerviosos
Los agentes nerviosos son
esteres del cido fosfrico, con
los OH sustituidos por otros
radicales. Inhiben la
acetilcolinesterasa
Plaguisidas organfosforados
Organofosforados: malathion
Carbamatos: como el carbaril
(Sevin).
Organofosforados: Esteres de
fosfato con O sustituidos con S u
otros radicales.
Con enlace P-C fosfonato,
Con enlace P-N fosforamido,
Con enlace P-S fosfotiolato
Inhiben la acetilcolinesterasa
Neurotransmision intoxicacin
Circuito elctrico de
transmisin de seal
entre una sensacin
(nervio sensitivo) y un
movimiento muscular
(nervio motor).
Acetilcolina --- colina +
acetato
Enzima:
acetilcolinesterasa
Inhibidores competitivos
Los inhibidores competitivos tienen gran parecido estructural
con el sustrato natural.
Compiten con el sustrato por ocupar el sitio activo de la
enzima.
Esta unin es reversible y aumentando la concentracin de
sustrato aumentamos el nmero de molculas de enzima libre.
Una caracterstica de este inhibidor es que puede ser revertida
aumentando la concentracin de sustrato. Si ste predomina
en la mezcla, tiende a desplazar al inhibidor de su unin con la
enzima.
Estos han encontrado aplicacin farmacolgica.
Competitiva
En la Inhibicin competitiva el sustrato (S) y el I compiten por la
enzima libre, pudiendo unirse uno o el otro, pero no ambos
simultneamente, hay una interaccin mutuamente excluyente del S
y de I con la enzima. La unin de E a I conduce a la formacin de un
complejo no productivo.
Inhibicin No Competitiva
El inhibidor se combina con la enzima o con el complejo ES,
interfiriendo con la formacin de producto.
Se unen a la enzima en un lugar diferente del sitio activo y provocan
disminucin de la velocidad mxima sin modificar Km.
Este tipo de inhibicin no puede ser revertida por aumento de la
concentracin de sustrato.
Pertenecen a esta categora ciertos iones metlicos: Cu2+, Hg2+, Ag+
Yodoacetato. Se une a SH de cistena de una proteina y modifica el
centro activo
No competitiva
Km se
Kmax+S (1+I/Ki)
mantiene
Inhibicin acompetitiva
El inhibidor se une solo al complejo ES para dar
un complejo inactivo.
La Km se mantiene y la Vmax disminuye.
APLICACIONES:
Muchos medicamentos son inhibidores enzimticos.
REACCIONES CON MS DE UN
SUBSTRATO
Mecanismos para explicar este tipo de reacciones, la
mayora pueden clasificarse en dos tipos:
a)Todos los substratos se unen a la enzima antes de
la catlisis (en caso de dos substratos se
denomina mecanismo de formacin de
complejo ternario);
b)Se libera un producto a partir de un primer
complejo binario antes de la unin con el segundo
substrato.(ping-pong)
ENZIMAS REGULADORES
Todos los enzimas tienen forma de ser regulados por
factores externos: pH, [S], presencia de iones, etc.
Algunos enzimas ademas poseen capacidad de regular el
metabolismo celular. Enzimas reguladores.
Pueden ser:
Enzimas alostericos. Su actividad cataltica es regulada por
la union no covalente de un metabolito especfico, en un sitio
de la proteina diferente al centro activo
Enzimas moduladas covalentemente. Se unen
covalentemente y se interconvierten en forma activa e
inactiva, por accion de otras enzimas
Enzimas
alostericas
_
El propio producto de la reaccin puede
inhibir competitivamente a la enzima
RUTA
ENZIMA
INHIBIDOR
Glicolisis
Fosfofructokinasa
ATP
Neoglucognesis
FBP fosfatasa
AMP
AcetilCoA carboxilasa
Bios. Colesterol
HMGCoA reductasa
Bios. Purinas
PRPP sintetasa
AcilCoA
Colesterol
AMP,GMP,IMP
Ejemplos de cinetica.
1. En una reaccin enzimtica que transcurre con
una concentracin de enzimas de 0,015g/l, se
obtienen los siguientes datos:
[S] (g/l) 20 15 10
7.0 5.0 4.0 3.0 2.5
v(g/l-min)1.14 1.01 0.87 0.72 0.59 0.5 0.44
0.35
Deduzca el modelo que representa la cintica del
proceso.
v (g/l-min)
1/S
1/v
20
1.14
0.05
0.877
15
1.01
0.066
0.990
10
0.87
0.10
1.149
6.5
0.70
0.15
1.428
5.0
0.59
0.20
1.695
4.0
0.50
0.25
2.000
3.3
0.44
0.30
2.273
2.5
0.35
0.40
2.857
Grafica Linewaber-Burk
Interaccin.= 1/vmax=0.614
vmax = 1.628 g/l-min.
Pendiente: Km/vmax. = 5.387
Km = 8.776 g/l
El modelo ser.
V = Vmax.S/(Km+S)
V = 1.628S/(8.776+S)
Comprobar por Eadi-Hostie
Lienalizacion de Eadie-Hostfee
V = Vmax Km.V/S
Ejercicio 2
Se investig el efecto de un inhibidor I sobre la velocidad
de una reaccin catalizada enzimticamente sobre un
solo sustrato, obtenindose los siguientes resultados
INMOVILIZACION DE
ENZIMAS
Se entiende por
enzima
inmovilizada
(EI)
aquella asociada a
una
matriz
no
esencial para su
actividad.
El biocatalizador se
confina
a
una
regin determinada
a travs de la cual
se pasa la solucin
del substrato, que
sale
como
un
Operacin continua
Reutilizacin
Mtodos de Inmovilizacin
Retencin
Adsorcin
fsica
Atrapamiento o
inclusin
Inmovilizacin
Unin covalente
qumica
Entrecruzamiento
Atrapamiento
Consiste en la retencin fsica de la enzima en las
cavidades interiores de una matriz slida porosa
constituida generalmente por polmeros del tipo
poliacrilamida, colgeno, alginato, carraginato o
resinas de poliuretano.
El proceso de inmovilizacin se lleva a cabo mediante la
suspensin de la enzima en una solucin del monmero.
Seguidamente se inicia la polimerizacin por un cambio de
temperatura o mediante la adicin de un reactivo qumico.
El atrapamiento puede ser en geles o en fibras, que suelen
ser ms resistentes que los geles. En el primer caso, la
enzima queda atrapada en el interior de un gel, mientras
que en el segundo caso la enzima se encuentra ocluida
dentro de las microcavidades de una fibra sinttica.
Adsorcion
La enzima se une a un soporte mediante interacciones
inicas, fuerzas de Van der Waals y por puentes de
hidrgeno.
Los principales factores que influyen en la adsorcin, son:
1. el pH del medio: controla el nmero y la naturaleza de
las cargas que presenta la superficie de la protena y del
slido;
2. la fuerza inica: al aumentar la fuerza inica se produce
la desorcin de la enzima, ya que los iones inorgnicos se
unen con ms fuerza al soporte que la protena;
3. el dimetro de poro.
4. la presencia de iones que acten como cofactores de la
enzima.
Union covalente
Se basa en la activacin de grupos qumicos del soporte para que
reaccionen con nuclefilos de las protenas.
Los aminocidos que forman enlaces con el soporte son: lisina, cistena,
tirosina y histidina, y en menor medida la metionina, el triptfano, la
arginina y el cido asprtico y glutmico.
Este mtodo presenta las siguientes ventajas:
1. La manipulacin de los derivados inmovilizados es sencilla;
2. La carga de enzima permanece constante despus de la inmovilizacin;
3. Los derivados pueden utilizarse en reactores en continuo,
empaquetados, de lecho fluidizado o tanque agitado.
4. Una mayor resistencia a la desactivacin por el efecto de la
temperatura, de los disolventes orgnicos o del pH, al tener estabilizada
su estructura terciaria.
Inconvenientes:
1. Es necesario conocer la densidad de grupos activos por unidad de
superficie, ya que condiciona el nmero de uniones enzima-soporte y su
geometra, que puede ser distorsionante y conducir a derivados inactivos.
2. El proceso de inmovilizacin puede alterar la estructura del centro
activo. Para evitar esto la inmovilizacin se hace en presencia de un
inhibidor.
Soportes de inmovilizacin
Agarosa
Celulosa
Quitina
Dextrano
cidos naturales
Almidn
Inmovilizacin de enzimas
Aplicaciones de inmovilizacion.
Biosensores.
Enzimas: Aplicaciones
Industrias Lcteas
La lactasa es el
enzima que consigue
romper la lactosa, que
es el azcar que
contiene la leche
Mucha gente es
intolerante a la lactosa
Existen en el mercado
leches que vienen con
lactasa
Industria Panadera
La mas comnmente utilizada es la lipoxidasa, que
conjuntamente con el blanqueante, le da a la masa
un carcter mas manejable
Esta contenida en la harina de soja y de otras
leguminosas.
Para aumentar la accin de la levadura se aade
amilasa, en forma de harina de malta
Se usan para ello tambin algunos mohos que
contienen la enzima
La harina de malta, tiene un inconveniente, y es
que cambia el color del pan
Industria Cervecera
El proceso fundamental es la rotura del
almidn
Los azucares simples formados son
fermentados por las levaduras
Esto se lleva a cabo con las amilasas,
provenientes de la malta.
A veces se aaden otros almidones como
de arroz o patata para aprovechar al
mximo la actividad de las enzimas
Fabricacin de Zumos
Las peptinas provocan que los zumos sean
demasiado viscosos y turbios.
Esto se elimina con enzimas, contenidos en el
propio zumo o que se pueden aadir
En el proceso, como subproducto tenemos
metanol, que aparece en muy baja concentracin
Tipos de pectinasas
Detergentes
Estos llevan enzimas que ayudan a limpiar
Las proteasas facilitan la eliminacin de manchas de origen
proteico
Las lipasas eliminan las manchas de grasa y otros compuestos
orgnicos
Estos detergentes que llevan enzimas se denominan
detergentes biolgicos.
En el pasado, el nico mtodo por el cual se podan eliminar
manchas y suciedad de los tejidos era el uso del jabn
tradicional. Un jabn es la sal alcalina (generalmente de sodio o
potasio) de un cido graso de cadena larga. Posee dos partes,
por un lado, la cola que es lipoflica y que repele el agua; por
otro lado, la cabeza que es hidrfila o polar. La accin limpiadora
del jabn reside en la facultad que tiene la cola hidrocarbonada
de la molcula de jabn de disolver las gotitas de grasa
insolubles en agua. La repulsin entre cargas iguales evita que
las gotas de grasa se unan de nuevo. Se forma as una emulsin
que se puede separar de la superficie que se est lavando
Medicina y Farmacia
El uso de enzimas en el sector mdico y farmacutico es
potencialmente inmensa, pero su utilizacin es mnima
Se usan slo si se tiene una seguridad absoluta de su
eficacia.
Alrededor de 150 enfermedades metablicas se han
atribuido a defectos enzimticos.
En teora, y una vez conocido el defecto, debera ser
posible administrar la enzima ausente al paciente y
aliviar o eliminar los sntomas de la alteracin.
Los intentos para tratar las enfermedades metabolicas
hereditarias mediante la administracin de enzimas
tienen xito parcial. El principal problema es que la
enzima incorporada al organismo tiende a acumularse en
el hgado y el bazo.
Las enzimas proteolticas -especializadas en digerir protenasresultan de gran ayuda en caso de resfriado, gripe o cualquier
enfermedad vrica, al ayudar al sistema inmunolgico a destruir la
capa externa que sirve de proteccin al virus.
Los tumores tienen una cubierta externa de protenas, que lo
mantiene oculto al sistema inmunolgico. Enzimas lo hace visible
al sistema inmunolgico.
Las enzimas proteolticas disuelven la cobertura proteica de los
parsitos muertos, facilitando su eliminacin por el sistema
inmunolgico.
Una vez muertos los parsitos mediante el zapper o la
desparasitacin herbal, resulta imprescindible la destruccin de
los cadveres, que pueden contaminar el organismo y
comprometer la salud. Los rganos y tejidos que no forman parte
del sistema digestivo no tienen vas de eliminacin al exterior (por
eso la medicina convencional no detecta parsitos en las heces
en estos casos), con lo que dependen de las enzimas proteolticas
para deshacerse de los restos de parsitos muertos.
Enzimas digestivas
Enzimas digestivas 500mg 50 cpsulas
Contiene:
Bromelana, extrada de la pia
Papana, extrada de la papaya
Pepsina, enzima que digiere protenas
Tripsina, enzima que digiere protenas
Lipasa, enzima que digiere grasas
Pancreatina. Es generada por el pncreas y contiene
los tres tipos de enzimas para digerir las grasas, los
carbohidratos (amilasa) y las protenas (proteasa).
Menta
Enzimas en medicamentos
Las enzimas proteolticas -especializadas en digerir
protenas- resultan de gran ayuda en caso de resfriado,
gripe o cualquier enfermedad vrica, al ayudar al sistema
inmunolgico a destruir la capa externa que sirve de
proteccin al virus.
Los tumores tienen una cubierta externa de protenas,
que lo mantiene oculto al sistema inmunolgico. El tumor
se hace visible al sistema inmunolgico, cuando las
enzimas digieren dicha membrana proteica de proteccin.
Las enzimas proteolticas disuelven la cobertura proteica
de los parsitos muertos, facilitando su eliminacin por el
sistema inmunolgico. Una vez muertos los parsitos
mediante la desparasitacin, resulta imprescindible la
destruccin de los cadveres, que pueden contaminar el
organismo y comprometer la salud.