CAMINOS ALEATORIOS Y

ESTRUCTURAS DE
MACROMOLCULAS
MAURY MANUEL BAUTISTA SILVA

OBJETIVOS GENERALES
Mostrar la idea de caminos aleatorios y su utilidad en la caracterizacin
biolgica de macromolculas.
Estudiaremos estructuras desde el punto de vista estadstico
Dogma central verdadero de la biologa central (secuencia y consecuencia):

"La secuencia determina la estructura; la estructura determina la funcin"

Culminar en una densidad de probabilidad y utilizarla para calcular
propiedades de las estructuras.

CAMINO ALEATORIO
Es una formalizacin matemtica de la trayectoria que
resulta de hacer sucesivos pasos aleatorios.
Es cualquier proceso aleatorio donde la posicin de una
partcula en cierto instante depende slo de su
posicin en algn instante previo y alguna variable
aleatoria que determina su subsecuente direccin y la
longitud de paso.

ESTRUCTURAS
"LA SECUENCIA DETERMINA LA ESTRUCTURA; LA ESTRUCTURA
DETERMINA LA FUNCIN"
Es necesario estudiarlas para
comprender la dinmica funcional.
Generalmente, es mejor hacer una
descripcin estadstica de las
estructuras.
Estructura: Caja montona regular
de tomos en celdas unitarias.

Una estructura es el conjunto (r1,

r2, r3, ..., rN) donde ri = (xi, yi, zi)
es el vector de posicin del i-simo
tomo en la molcula de N tomos.

MACROMOLCULAS COMO
CAMINOS ALEATORIOS
Caracterizaremos la geometra de
una macromolcula con la funcin
r(s).
Polmeros: macromolculas
compuestas por una o varias
unidades qumicas (monmeros)
que se repiten a lo largo de toda
una cadena.
Discretizaremos un polmero en
una serie de segmentos de
longitud a, y trataremos cada uno
como una barra rgida.

Figura. Modelo de camino aleatorio

para polmeros con segmentos de
longitud a .

Correspondencia entre estructura real y la idealizacin en trminos

del modelo de caminos aleatorios.

 Haremos un anlisis de los

caminos aleatorios en una
dimensin, luego
generalizaremos estas ideas.
Imaginaremos un arreglo de
camino aleatorio confinado a
una dimensin con longitud a de
cada barra y con N segmentos.
Se construye como una
secuencia de pasos izquierdos y
derechos.

Las probabilidades de cada paso

son pi = pd = 1/2.

Total: 2^N macromolculas

diferentes, cada una con
probabilidad 1/(2^N).

- Pasos derechos.
- Pasos izquierdos.
- Combinacin de pasos derechos e
izquierdos.

 Calcularemos la distancia media

del camino aleatorio en funcin
del nmero de segmentos.
Partiremos de la varianza, dada
por la ecuacin (1), donde xi es el
desplazamiento en el camino
aleatorio debido a un paso
derecho (a) o izquierdo (-a).
Por la independencia de xi y xj, el
segundo trmino de (1) es cero.
Sustituyendo (2) en (1)
obtenemos que la distancia
media es dada por (3).

Ecuaciones para la obtencin de la

distancia media del camino
aleatorio.

 Analizaremos ahora la
probabilidad de dar nr pasos
derechos.
El nmero caminos posibles W
que pueden dar nr pasos
derechos es dado por la
combinatoria de pasos
derechos nr con los pasos
totales N:

Ejemplo de pasos derechos posibles

para cuando hay 3 barras, es decir,
N=3.

NOTA: Tenemos como objetivo llegar

a una distribucin de probabilidad.
La probabilidad de que cada
camino aleatorio ocurra es dada
por:

En trminos de la distancia media

R:
Grfica de la densidad de
probabilidad p(R; N)

DENSIDAD DE PROBABILIDAD
Para una dimensin:

Para tres dimensiones:

Obtenidas de varias manipulaciones algebraicas, estas densidades

de probabilidad describen la estructura de polmeros largos .

APLICACIONES
Usando el modelo de caminos aleatorios encontramos la relacin
entre la longitud del camino aleatorio y el nmero de segmentos
de Kuhn:
<R> = aL
L = Na
con a = 2(ji)
Clculos ver documento anexo.