TRANSCRIPCI

ON EN
EUCARIOTAS

TRANSCRIPCIN EN
EUCARIONTES
El proceso de transcripcin es ms complejo en los eucariontes que en los
procariontes. Se sabe
que en ellos existen tres ARN polimerasas con diferentes actividades. Cada una
transcribe un
grupo distinto de genes y reconoce un conjunto diferente de promotores.
1. La ARN polimerasa I se encuentra en el ncleo y sintetiza precursores de la mayor
parte de
los ARN ribosmicos, aunque no de todos ellos.
2. La ARN polimerasa II se encuentra en el nucleoplasma y sintetiza precursores de
ARNm.
3. La ARN polimerasa III se encuentra en el nucleoplasma y sintetiza los ARNt,
precursores de ARN ribosomal, y otras pequeas molculas de ARN que participan en
el
procesamiento de ARNm y el transporte proteico.
Las tres ARN polimerasas eucarinticas son de gran tamao (500-700 kilodaltones);
son protenas
complejas que constan de 10 o ms subunidades.

ESTRUCTURA DEL ARN POLIMERASA II

De las tres ARN polimerasas, la ARN polimerasa II es la ms ampliamente estudiada, y
la levadura
Saccharomyces cerevisiaie es el sistema modelo ms comn. La ARN polimerasa II de
la levadura
consta de 12 subunidades, que se muestran en la siguiente tabla:

Subunidades de la ARN polimerasa II de levadura

Subunidad

Tamao(kDa)

Caractersticas

Homologo
de E. coli

RPB1
RPB2
RPB3
RPB4
RPB5
RPB6
RPB7
RPB8
RPB9
RPB10
RPB11
RPB12

191.6
138.8
35.3
25.4
25.1
17.9
19.1
16.5
14.3
8.3
13.6
7.7

Sitio de fosforilacin
Sitio de unin de NTP
Ensamblaje del ncleo
Reconocimiento del promotor
En pol I, II y III
En pol I, II y III
nica de pol II
En pol I, II y III

En pol I, II y III
En pol I, II y III

Las siglas RPB se refieren a ARN polimerasa B porque e sistemas de nomenclatura

Alterna se refiere a la polimerasa como A, B y C en lugar de I, II y II.
Se ha utilizado la cristalografa de rayos X para determinar la estructura de la ARN
Polimerasa II. Algunas caractersticas notables incluyen un par de abrazaderas
formadas por las subunidades RPB1, RPB5 y RPB9, que aparentemente fijan el
ADN
Cadena abajo del sitio activo. Una abrazadera cerca del sitio activo es formada
por
RPB1, RPB2 y RPB6, la cual podra participar asegurando el hibrido ADN: ARN para
la polimerasa, y con esto aumentando la estabilidad de la unidad de transcripcin.

Cmo reconoce Pol II el ADN correcto que debe transcribir?

Promotores Pol II
Los promotores Pol II tienen cuatro elementos:

El primero incluye diversos elementos cadena arriba, que actan como

Potenciadores y silenciadores. Las protenas de enlace especificas activan la
transcripcin por encima de los niveles basales en el caso de los
potenciadores o la suprimen en el caso de los silenciadores.
El segundo elemento, que se encuentra en la posicin -25, en la caja TATA
que
tiene una secuencia consenso TATAA (T/A).
El tercer elemento incluye el sitio del inicio de transcripcin en la posicin
+1,
Pero en el caso de los eucariontes est rodeado est rodeado por una
secuencia
llamada el elemento iniciador (Inr).
El cuarto elemento es un posible regulador cadena abajo, aunque estos son
ms
raros que los reguladores cadena arriba. Muchos promotores naturales
carecen

Diferentes especies y genes. Algunos genes no tienen

caja TATA , por lo que se
llaman promotores sin TATA. En algunos genes, la
caja TATA es necesaria para
la transcripcin, y la supresin de la caja TATA causa
una perdida de transcripcin.
En otros, la caja TATA se encuentra ah para orientar a
la ARN polimerasa
correctamente.

INICIACIN DE LA
TRANSCRIPCIN
La mayor diferencia entre la transcripcin en
procariotas y eucariotas es el numero tan grande de
protenas que se asocian con la versin eucariotica del
proceso.
Cualquier protena que regule la transcripcin, pero
que no sea en s una subunidad de la ARN
polimerasa, se le llama FACTOR DE
TRANSCRIPCIN EUCARIOTICO.
La iniciacin de la transcripcin comienza con la
formacion de un complejo de preiniciacin y la gran
mayora del control ocurre en este paso.
El complejo normalmente contiene ARN polimerasa ll
y seis factores de transcripcin generales (GTF)-TFllA,
TFllB, TFllD, TFllE Y TFllH.

Regin promotora
Destacar la presencia de la
regin TATA boxhacia el
nucletido 25 y -100
Secuencia consenso ms
frecuente

ENLOGACIN
Esta fase del proceso de transcripcin incluye la adicin de
nucletidos mas all de 9 pb del transcrito. La RNA polimerasa no
puede proceder ms all hasta que su firme interaccin con los
promotores haya sido terminada por la fosforilacin del CTD y por
cierto cambio conformacional que transforma el complejo abierto
en una burbuja de transcripcin activa.
La burbuja o complejo de transcripcin comprende 17-pb, dentro
de ste existe un hbrido RNA-DNA de 8 bp que involucra al
transcrito creciente fijo a la hebra de DNA que le sirve como
molde.
Segn la transcripcin progresa nuevos nucletidos son
agregados al extremo 3 del RNA creciente y la burbuja de
transcripcin avanza a lo largo del DNA.
La RNA polimerasa II tiene actividad de corregir el transcrito, y
cuando la sntesis de RNA encuentra evidencia de que algn par
de bases ha sido equivocadamente formado la enzima puede
corregirlo.

TERMINACIN
La terminacin es la etapa final de la transcripcin. El
complejo de transcripcin amente debe desensamblarse una
vez que la elongacin se ha completado.
La terminacin est sealizada por la informacin contenida
en sitios de la secuencia del DNA que se est transcribiendo,
por lo que la RNA polimerasa se detiene al transcribir
algunas secuencias especiales del DNA. Estas secuencias
son ricas en guanina y citosina, situadas en el extremo de los
genes, seguidas de secuencias ricas en timina, formando
secuencias palindrmicas, que cuando se transcriben
inducen al RNA recin sintetizado a adoptar una estructura
en horquilla que desestabiliza el complejo RNA - DNA,
obligando
a
la
RNA
polimerasa
a
separarse,
renaturalizndose el DNA de la burbuja de transcripcin.

REGULACION DE
LA
TRANSCIPCION
EN EUCARIONTES

REGULACION TRANSCRIPCIONAL
En esta categora estn incluidos los promotores, la
presencia de secuencias regulatorias potenciadoras
(enhancers), y la interaccin entre mltiples protenas
activadoras o inhibidoras que actan mediante su unin a
secuencias especficas de reconocimiento al ADN.
Las regulaciones pueden ser de tipo CIS o TRANS.
Cuando el elemento regulador transcripcional es parte de la
cadena polinucleotdica donde se localiza el gen a regular,
se denomina reguladorCIS.Evidentemente se tratan de
secuencias especiales del ADN (promotores y enhancers).
Cuando los elementos regulatorios son de naturaleza y
origen diferente a la secuencia gentica a controlar, la
regulacin es de tipoTRANS(aqu se incluyen a los factores
de transcripcin generales, histoespecficos y todas las
protenas regulatorias con capacidad de unin al ADN).

REGULACIN EN CIS
PROMOTORES

El promotor es una secuencia que define el sitio

de iniciacin de la transcripcin del ARN.
Los promotores ms frecuentes son los de tipo CCAAT
y TATA , denominados motivos o cajas por su alta
conservacin evolutiva.
Si bien los promotores estn preferentemente
localizados corriente arriba (5) del inicio
transcripcional, algunos pueden ubicarse corriente
abajo (3) o bien ser de tipo intragnicos. El nmero y
tipo de elementos regulatorios varan segn cada
ARNm. La naturaleza de los promotores y la
combinatoria de las protenas interactuantes con ellos
es uno de los principales mecanismos de regulacin.

 POTENCIADORES
Existen adems secuencias del ADN que pueden
localizarse corriente arriba o abajo del gen a
regular situadas a miles de pares de bases con
respecto al promotor. Las zonas de ADN sobre las
cuales se ejercen acciones activadoras son
llamadas potenciadoras o aumentadoras
(enhancers en ingls).En trminos generales
una secuencia regulatoria potenciadora o
enhancer regula la frecuencia con la que se
realiza el proceso transcripcional.

Tambin existen reguladores de accin opuesta

(silenciadores o amortiguadores de la
transcripcin).

REGULACIN EN TRANS
FACTOR

DE TRANSCRIPCIN
Unfactor de transcripcines unaprotenaque
participa en la regulacin de latranscripcin del
ADN, pero que no forma parte de laARN polimerasa.
Los factores de transcripcin pueden actuar
reconociendo y unindose a secuencias concretas de
ADN, unindose a otros factores, o unindose
directamente a la ARN polimerasa.
Al ser activados adquieren la capacidad de regular la
expresin gnica en elncleo celular, bien
activando, bien reprimiendo la transcripcin de
diversos genes.

PROCESAMIENTO DEL RNA EN

EUCARIOTAS
El primero en formarse es el RNA generado
por accin de la polimerasa II, denominado
heterogneo; este una vez procesado se
transforma en RNAm. La conversin incluye
las siguientes modificaciones sucesivas:
1. Formacin del casquete
2. Sntesis de la cola de poli A
3. Eliminacin de los intrones