Cul es la estructura de un
aminocido?
Todos los aminocidos estn formados
por un grupo amino y un grupo carboxilo.
Amino
Carboxilo
La alta especificidad
se debe a que su
estructura terciaria
le permite formar
cavidades llamadas
sitios activos, lugar
donde se ubica el
sustrato durante el
proceso de catlisis.
La enzima se une
especficamente a las
molculas denominadas
sustratos, formando un
complejo enzima-sustrato y
favoreciendo su transformacin
en productos
sustrato
Complejo
enzima-sustrato
productos
Una Reaccin
Enzimtica:
Concentracin de sustrato
A mayor concentracin de sustrato es
mayor la velocidad.
Pero no aumenta indefinidamente, cuando
no hay ms enzima para unirse al sustrato
se alcanza la velocidad mxima
pH
Cada enzima tiene un pH ptimo en el
cual la actividad enzimtica es mxima
Temperatura
Cada enzima tiene una temperatura
ptima en la cual su actividad es mxima
De modo que
si variamos el pH o la temperatura, la
velocidad de la reaccin catalizada por
una enzima tambin vara.
Los valores de pH y temperatura ptima
son aquellos a los cuales se alcanza la
mxima actividad enzimtica o la mayor
velocidad de reaccin
Estado Desnaturalizado
Desnaturalizacin de
la ribonucleasa. En
general, la
desnaturalizacin fuerte
produce una destruccin
permanente de la
molcula
Agentes desnaturalizantes: Se
distinguen agentes fsicos (calor) y
qumicos (detergentes, disolventes
orgnicos, pH, fuerza inica).
Cofactores Enzimticos
Cofactor (Coenzima): tomo, ion o molcula que participa en el
proceso cataltico sin ser enzima ni substrato.
Los cofactores participan de dos maneras distintas:
1. A travs de una fijacin muy fuerte a la protena y salen
sin ser modificados del ciclo cataltico
2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo
cataltico y por lo general requieren otra enzima para volver
al estado original.
Aminocido
LAO
R CH COO- + O2 + H2O
Cetocido
R CO COO- + H2O2 + NH4+
NH3+
H3C
NH
NH
N
Tiamina pirofosfato
Flavinas: FAD, FMN
Piridoxal fosfato
Coenzimas cobamdicos
Ac. Ascrbico
NAD+, NADP+
Lipoamida
Coenzimas folnicos
Pantetenas (CoA, p.e.)
B1
B2
B6
B12
C
PP
2. Liposolubles
Naftoquinonas
-Carboxilacin
Hemoenzimas, citocromos
Ferredoxinas
Tr.electrnico mitocondrial y fotosinttico
Redox; transporte de aminocidos
Transf.de fosfato y/o de energa
Transf.de grupos glicosdicos
Transf.de grupos sulfato
Transf.de grupos metilo
Transportador de grupos acil-
vit. A
vit. D
vit. E
Teoras de la Accin
Enzimtica
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de
forma estereospecfica,
de la misma manera que una
llave se ajusta a su cerradura.
Modelo aceptado durante mucho
tiempo; hoy se considera
insuficiente al no explicar
algunos fenmenos de la inhibicin enzimtica.
O
R C O R'
OR C O R'
O-
Substrato: un ster
Estado de transicin:
intermediario tetradrico,
inestable
O
R C O
HO R'
Productos
Clasificacin y
Nomenclatura de
Enzimas
Nombre sistemtico:
Grupo transferido
Aceptor
Grupo Subgrupo
Nmero sistemtico
Enzyme
Comission
EC 2.7.1.1
Sub-subgrupo
Enzima
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
grupos aldehidos
gupos acilos
grupos glucosilos
grupos fosfatos (kinasas)
3. Hidrolasas
Transforman polmeros en monmeros.
Actuan sobre:
enlace ster
enlace glucosdico
enlace peptdico
enlace C-N
4. Liasas
(Adicin a los dobles enlaces)
Entre C y C
Entre C y O
Entre C y N
5. Isomerasas
(Reacciones de isomerizacin)
6. Ligasas
(Formacin de enlaces, con
aporte de ATP)
Entre C y O
Entre C y S
Entre C y N
Entre C y C
Inhibicin Enzimtica
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimtica, a travs de
interacciones con el centro activo u otros centros especficos
(alostricos).
Esta definicin excluye todos aquellos agentes que inactivan a
la enzima a travs de desnaturalizacin de la molcula enzimtica
Inhibidor alostrico:
impide la unin del
sustrato
EI
ES + I
ESI
Inhibicin reversible
(a) El inhibidor se fija al centro activo
de la enzima libre, impidiendo la
fijacin del substrato: Inhibicin
Competitiva
(b) El inhibidor se fija a la enzima
independientemente de que lo
haga o no el substrato; el inhibidor,
por tanto, no impide la fijacin del
substrato a la enzima, pero s impide
la accin cataltica: Inhibicin No
Competitiva
(c) El inhibidor se fija nicamente al complejo enzima-substrato
una vez formado, impidiendo la accin cataltica; este tipo
se
conoce como Inhibicin Anticompetitiva
S
E
I
ES
E+P
Inhibicin
Competitiva
EI
Las fijaciones de substrato e inhibidor son
mutuamente exclusivas; el complejo EI no es productivo
S
E
ES
Inhibicin
No Competitiva
S
EI
El inhibidor se fija
indistintamente a la enzima
libre E y al complejo
enzima-substrato ES; ni el
complejo EI ni el complejo
ESI son productivos
E+P
ESI
S
E
ES
E+P
I
ESI
Inhibicin
Anticompetitiva
Inhibicin Competitiva
S
E
ES
E+P
I
EI
[E] [I]
Ki =
[EI]
Caractersticas:
- Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas
- A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibicin
- Por lo general, el inhibidor competitivo es un anlogo qumico del
substrato.
- El inhibidor es tan especfico como el substrato
O
H2N
C
O-
H2 N
S NH2
O
4-aminobenzoato
4-aminobenceno
sulfonamida
H2N
N
N
N
N
H
N
CO OH
OH
CH2
c. Flico
CH2
C NH C H
O
H 2N
N
N
N
N
COOn
CH3
N
CO OH
CH2
Methotrexate
CH2
C NH C H
O
COOn
O
CH3
HN
O
Anlogos de base
NH
Timina
O
Br
HN
O
NH
5-Bromouracilo
NH2
O
HOCH2
Citidina
OH
OH
NH2
O
HOCH2
N
OH
OH
Citosina
arabinsido
Anlogos de
nuclesido
Inhibicin Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
qumico de la enzima, modificndola covalentemente
- Su accin no se describe por una constante de equilibrio Ki,
sino por una constante de velocidad ki:
E+I
Regulacin de la Actividad
Enzimtica
Regulacin alostrica
Procesos a nivel celular; regulacin de ajuste fino
de la actividad enzimtica, a travs de efectos de
retroalimentacin (negativa o positiva)
Regulacin alostrica
Retroalimentacin negativa en vas metablicas, 1
Sntesis de Isoleucina
Thr
Treonina
desaminasa
-cetobutirato
Ile
La Enzima no
La enzima fosforilada
fosforilada es inactiva
es activa