GENE DISCOVERY IN THE FINGER LEATHER CORAL Sinularia notanda BY

CONSTRUCTION AND SEQUENCING OF A NORMALIZED cDNA LIBRARY

Jae-Woo Kim a, Seong Ho Kima, Min-min Jung a, Heung Soo Kima, Seock-Jung Hana, Tae Seok Moona,
Bong-Seok Kim a, Bo-Hye Namb, Chan-Il Parkc

Oleh :
Ersha Deristya Putri
NIM H1K013039
Muhammad Rifat Muharam NIM H1K013044
Guntur Gumilar Putra
NIM H1K013047

PENDAHULUAN
Disusun Oleh : Kelompok 19

0
1

Terumbu karang merupakan ekosistem

yang paling penting dalam segi ekologi
dan ekonomi.

0
2

Saat ini, penurunan populasi karang karena polusi,

penyakit dan perubahan iklim sudah mencapai tingkat
yang kritis

0
3

Berbagai kegiatan dilakukan untuk merestorasi

terumbu karang menggunakan metode transplantasi
karang atau metode asexual

0
4

Penelitian ini baru saja berhasil melakukan

transplantasi artificial dan regenerasi karang lunak
Sinularia notanda di laboratorium.

MATERI DAN METODE

Disusun Oleh : Kelompok 19

4
3
2
1
Mengumpulkan potongan polyps
selama masa penempelan dari S.
notanda dari tiga individu per waktu
(1 jam, 1 hari, 7 hari, 14 hari, 21 hari
setelah dipotong)

Sampel-sampel polyp karang

disonikasi untuk menghilangkan
mikroorganisme lain dan segera
dibekukan dalam nitrogen cair
untuk ekstraksi RNA

Sebagian jaringan dari

potongan polip ini diekstrak
dengan menggunakan reagen
TRIzol (MRCgene, OH, USA)

DNA genomik dari total RNA

dihilangkan dengan
menggunakan DNase

8
7
6
5
Poly(A)+RNA diisolasi dari total
RNA (100g) yang telah ikut dalam
DNase dengan menggunakan alat
permunian mRNA sesungguhnya.

cDNA yang telah diproses diBLAST untuk membandingkan

dengan EST dan gen yang ada.

cDNA di proses di BLAST

Reaksi sekuensing dilakukan

menggunakan primer universal
(5-CTCGGGAAGCGCGCCAT
TGTGTTGGT-3) dalam DNA
sequencer kapiler.

HASIL DAN PEMBAHSAN

Disusun Oleh : Kelompok 19

Sebanyak 3840 EST

clon dipilih secara acak
kemudian diurutkan,
dan menghasilkan
3251 EST berkualitas
tinggi (84,7%).

Mayoritas sekuen
cocok dengan anemon
laut Nematostella
vectensis.

Ditemukan 41 sekuens
terlibat dalam jalur
metabolisme purine
dan 21 sekuens dalam
jalur metabolisme
metana

Kesimpulan

Disusun oleh : Kelompok 19

Penelitian ini menghasilkan data cDNA dari karang Sinularia notanda. Data sekuen
untuk spesies karang Sinularia notanda ini nantinya akan dapat digunakan sebagai dasar
dalam studi genetik untuk transplantasi karang.

10

TERIMAKASIH

11