Anda di halaman 1dari 46

BIOMOLEKUL

(Struktur dan Metabolisme)


MATRI KULASI
MAGISTER KIMIA TERAPAN
PROGRAM PASCASARJANA
UNIVERSITAS UDAYANA 2013
Oleh : Dr. I Nengah Wirajana

m
Bio

l
u
k
ole

KAITANNYA DENGAN KURIKULUM


Analisis Terapan
Instrumentasi

MK Wajib

Kimia Permukaan Lanjut


Biokimia Terapan
Reaksi dan Sintesis Senyawa Organik

MK Pilihan (4 MK)
BIDANG

KIMIA BAHAN

ALAM

Green Chemistry

MK Pilihan (4 MK)

MK Pilihan (4 MK)
BIDANG
BIOMATERIAL
DDS ( Drug Delivery
Systems)

Bioaktivitas Bahan Alam


Hayati

BIDANG KIMIA ANALITIK


TERAPAN

Elusidasi Struktur

Bioteknologi Lingkungan

Teknologi Met. Sekunder

Analisis Obat, Makanan dan Kosmetik

Kimia Pertanian

Kimia Elektroanalisis Lanjut

Produksi dan Analisis


Antibiotika

Fitofarmaka

Analisis Kimia Bahan Pangan

Kimia Medisinal Lanjut

Kimia Medisinal Lanjut

Bioanalitik

Teknologi Membran

Eksplorasi dan Teknologi


Enzim

Analisis Kimia Forensik

Sintesis dan Aplikasi


Biopolimer

Topik Khusus Green


Chemistry

Kimia Industri Pariwisata

Analisis Lingkungan

Nanomaterial
Biosensor
Imunokimia

PRE-TEST

Berkaitan dengan pentingnya pengetahuan


tentang BIOMOLEKUL dalam pencapaian
kompetensi setiap mata kuliah (MK) di atas,
maka dalam kuliah matrikulasi diawali dengan
pre-test untuk mengetahui sampai sejauh mana
pengetahuan dasar Mahasiswa Baru tentang
biomolekul.
Pertanyaan :
Jelaskan dengan singkat apa yang Anda
ketahui tentang biomolekul dengan
memberikan satu contoh saja! (waktu 5-10
menit)

PENDAHULUAN
Kehidupan

dari sudut pandang kimia adalah


hal sangat menarik dan penting.
Ciri-ciri kehidupan:

Ada biodeversitas
Ada kesatuan kimia
Ada kebutuhan kehidupan
Ada mekanisme kimia

Ciri-Ciri Kehidupan
(dari segi kimia)

1.

Biodeversitas (Keragaman biologis):


mikroba, tumbuhan, binatang! ada
keragaman biomolekul tertentu (disamping
ada kesamaan)

2.

Kesatuan kimiawi: sistem kehidupan (di


bumi) mengikuti hukum fisika-kimia organik

Ciri-Ciri Kehidupan ..

3. Kebutuhan Kehidupan:

(1) ENERGI,
perlu diketahui bagaimana:

Memperolehnya
Mengubahnya
Menggunakannya

Ciri-Ciri Kehidupan.

(2) MOLEKUL SEDERHANA,


perlu diketahui bagaimana:

Mengubahnya
Mempolimerasinya
Menghancurkannya

Ciri-Ciri Kehidupan

(3) MEKANISME KIMIA, untuk:

Memperoleh energi
Mengendalikan reaksi kimia yang berurutan
Mensintesis & mendegradasi makromolekul
Mempertahankan kesetimbangan yang dinamis
Swa-susun struktur yang kompleks
Mengganda secara akurat & efisien
Mempertahankan keteraturan proses biokimia dalam
lingkungan yang berubah-ubah

Bagaimana strategi mekanisme kimianya?


Strategi 1: Mahluk hidup menggunakan pasangan kimia untuk
mengendalikan proses kimia yang normalnya tidak dapat terjadi

Strategi 2: Mahluk hidup menggunakan


memacu reaksi yang biasanya lambat

enzim untuk

Bagaimana enzim memacu reaksi?


penjelasan termodinamikanya:

Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan


mekanismenya??

Biomolekul Komposisinya?
99% dari sel tersusun dari unsur
H, O, N, and C
Unsur

Elektron tanpa
pasangan

Jumlah relatif

2/3

1/4

1/70

1/10

*
Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang
Punggung Kehidupan

Isomer Kimia

Rumus kimia sama, bentuk berbeda

Molekul Khiral
bentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan

Perubahan Biokimia

Dapat Dikelompokkan dalam 5 kategori

Reaksi pemindahan gugus


Reaksi oksidasi-reduksi
Penataan kembali (isomerisasi)
Reaksi pemotongan
Reaksi kondensasi

Latihan : cari masing-masing 1 (satu) contoh reaksi di atas

Struktur Biomolekul
Anabolik

Senyawa penyusun
Gula sederhana
Asam amino
Nukleotida
Asam lemak
Katabolik

Makromolekul
Polisakarida
Protein (peptida)
RNA atau DNA
Lipida

Biosintesis
Membutuhkan
Molekul
Sederhana
untuk Digabung
secara Kovalen
melalui
Berbagai Cara

KARBOHIDRAT
Monosakarida

dan Disakarida

Representative monosaccharides. (a) Two trioses, an


aldose and a ketose. The carbonyl group in each is shaded. (b) Two
common hexoses. (c) The pentose components of nucleic acids.
D-Ribose is a component of ribonucleic acid (RNA), and 2-deoxy-Dribose
is a component of deoxyribonucleic acid (DNA).

KARBOHIDRAT

Disakarida

Some common disaccharides. The common name,


full systematic name, and abbreviation are given for each disaccharide

Karbohidrat

Polisakarida

Homo- and heteropolysaccharides.


Polysaccharides may be composed of one, two, or several different
monosaccharides, in straight or branched chains of varying length.

Contoh polisakarida

Amilosa

Kitin
A short segment of chitin, a homopolymer of N-acetyl-D-glucosamine
units in (14) linkage
Diskusi: Siapa yang tahu amilosa (lihat gambar di atas) merupakan polimer linier dari ?

Asam Amino dan Protein

20 Asam amino dalam protein

Asam Amino dan Protein

20 Asam amino dalam protein

Asam amino dan Protein

Pembentukan ikatan Peptida dengan kodensasi

Protein

Asam Nukleat

DNA

base: thymine
(pyrimidine)

monophosphate

sugar: 2-deoxyribose

5
(5 to 3)

3 linkage

4
3

5 linkage

1
2
base:adenine
(purine)
no 2-hydroxyl

AS Biology. Gnetic control of protein


structure and function

AS Biology. Gnetic control of protein


structure and function

Lipida
Asam lemak

Lipida

Glycerol and a
triacylglycerol. The
mixed triacylglycerol
shown here has three
different fatty acids
attached to the glycerol
backbone. When glycerol
has two different fatty
acids at C-1 and C-3, the
C-2 is a chiral center

Lipida

Biological wax. (a)


Triacontanoylpalmitate,
the major component of
beeswax, is an ester of
palmitic acid with the
alcohol triacontanol. (b) A
honeycomb, constructed
of beeswax, is firm at 25C
and completely
impervious to water. The
term wax originates in
the Old English weax,
meaning the material of
the honeycomb.

METABOLISME

1
1.
2.

Cycling of carbon dioxide and oxygen between the autotrophic (photosynthetic) and heterotrophic
domains in the biosphere
Cycling of nitrogen in the biosphere. Gaseous nitrogen (N2) makes up 80% of the earths atmosphere.

Metabolisme

Energy relationships
between catabolic and
anabolic pathways.
Catabolic pathways
deliver chemical energy in
the form of ATP, NADH,
NADPH, and FADH2.
These energy carriers are
used in anabolic
pathways to convert small
precursor molecules into
cell macromolecules.

Metabolisme

Three types of nonlinear metabolic pathways. (a) Converging, catabolic;


(b) diverging, anabolic; and (c) cyclic, in which one of the starting
materials (oxaloacetate in this case) is regenerated and reenters the
pathway.

Metabolisme

Metabolism as a threedimensional meshwork.


Nelson, D.L. & Cox, M.M. 2000. Lehninger Principles of Biochemistry. 3rd Ed. Worth Publishers, New

Penutup
Pelajari

lebih RINCI tentang BIOMOLEKUL,


kemudian buat deskripsi singkat menyangkut
STRUKTUR DAN FUNGSI dari satu contoh
biomolekul yang paling menarik bagi Anda
(setiap mahasiswa biomolekulnya berbeda)

TERIMA KASIH

Amilosa merupakan polimer dari?

Amilosa

adalah polimer linier dari -Dglukosa yang dihubungkan dengan ikatan


1,4-. Dalam satu molekul amilosa terdapat
250 satuan glukosa atau lebih. Amilosa
membentuk senyawa kompleks berwarna
biru dengan iodium. Warna ini merupakan uji
untuk mengidentifikasi adanya pati.
Struktur amilosa

LIPIDA
Gliserol dan triasilgliserol a. Campuran
triasilgliserol ditampilkan di sini memiliki tiga
asam lemak yang berbeda yang melekat
pada tulang punggung gliserol. Ketika
gliserol memiliki dua asam lemak yang
berbeda pada C-1 dan C-3, C-2 adalah pusat
kiral

Metabolisme: Metabolisme adalah semua reaksi


kimia yang terjadi di dalam organisme, termasuk
yang terjadi di tingkat selular.
Hubungan

energi antara jalur katabolik dan


anabolik. Jalur katabolik memberikan energi
kimia dalam bentuk ATP, NADH, NADPH,
dan FADH2. Operator-operator energi yang
digunakan dalam jalur anabolik untuk
mengkonversi molekul prekursor kecil
menjadi makromolekul sel.

Secara umum, metabolisme memiliki dua arah lintasan


reaksi kimia organik,
- katabolisme, yaitu reaksi yang mengurai molekul
senyawa organik untuk mendapatkan energi
- anabolisme, yaitu reaksi yang merangkai senyawa
organik dari molekul-molekul tertentu, untuk diserap
oleh sel tubuh.

Biomolekul

merupakan senyawa-senyawa
organik sederhana pembentuk organisme
hidup dan bersifat khas sebagai produk
aktivitas biologis. Biomolekul dapat
dipandang sebagai turunan hidrokarbon,
yaitu senyawa karbon dan hidrogen yang
mempunyai kerangka dasar yang tersusun
dari atom karbon, yang disatukan oleh ikatan
kovalen.

Tiga jenis jalur metabolik nonlinier. (a)


Konvergensi, katabolik, (b) divergen,
anabolik, dan (c) siklik, di mana salah satu
bahan awal (oksaloasetat dalam kasus ini)
dibuat ulang dan reenters jalur tersebut.