CIENCIAS OMICAS

METABOLOMICA
Albiares Leidy J.; Castellanos
Laura C.; Rodriguez Diana C.

Que es?
Origen

anglosajn
Propuesto por Oliver et al en
1998
Anlisis de un sistema dinmico
que cambia con el tiempo
Con la finalidad de descubrir
enfermedades, factores de riesgo
y determinar biomarcadores

CONCEPTOS

*METABOLOMICA: La metabolmica cataloga y cuantifica a las molculas pequeas, productos

del metabolismo primario o secundario, que se encuentran en los sistemas biolgicos, estudia cmo
cambian los perfiles metablicos dentro de un organismo como respuesta a a alguna situacin, tal
como enfermedades, o estrs

METABOLOMA: El metaboloma se define como el conjunto de metabolitos de bajo peso

molecular presentes en un biofluido, clula u organismo a nivel cualitativo y/o
cuantitativo en una condiciones fisiolgicas determinadas

METABOLITOS :Son molculas de bajo y medio peso molecular (< 1.500 Dalton) que
intervienen en los procesos celulares y nos revelan cmo est funcionando el
metabolismo en un rgano determinado o en un ser vivo (carbohidratos, lpidos,
aminocidos, cidos nucleicos y hormonas

Metabolismo

grasos
Metabolismo

primario: Aminocidos, Azcares Alcoholes, cidos orgnicos , cidos

* Es la ltima de las ciencias micas
secundario: alcaloides, fenilpropanos, terpenos

Genmica

Nos explican lo que ha

pasado despus de un
estmulo, mutacin,...

Proteomica

Metabolomica

Explica lo que est

pasando despus de un
estmulo, mutacin,...

Objetivo
:
identificar
cambios sutiles en los perfiles
metablicos entre sistemas
biolgicos
en
diferentes
estados
fisiolgicos
o
patolgicos

Seria muy interesante poder integrar estos tres

tipos de datos para saber lo que est pasando en
un organismo
La metabolmica permite clasificar muestras, entender
mejor mecanismos bioqumicos, identificar biomarcadores,
cuantificar metabolitos en distintos entornos y flujos
biolgicos, etc

El nmero de metabolitos depende del sistema biolgico estudiado (organismos eucariotas y

procariotas )
El

metaboloma de E. coli y S. cerevisiae es de 1170 y 600 compuestos,

Reino

vegetal se considera que ste puede estar conformado por alrededor de 200,000 metabolitos
correspondientes a metabolismo primario y secundario

La metabolmica hace uso de diferentes estrategias:

Target

analysis (anlisis del blanco), el objetivo es el anlisis cuantitativo de los metabolitos del sustrato
y/o producto de una protena blanco

Metabolic

profiling (perfiles metablicos), se centra en el anlisis cuantitativo de un conjunto de

metabolitos predefinidos, que pertenecen a una clase de compuestos de una determinada ruta biosinttica o
de un grupo relacionado de metabolitos

footprinting (huella externa), anlisis de (exo) metabolitos secretados/excretados por un organismo); si

el organismo est creciendo en cultivo se puede incluir el anlisis de condiciones ambientales y de
sustancias de crecimiento

fingerprinting

(huella dactilar) anlisis de metabolitos intracelulares con importancia bioqumica; es un

anlisis global para clasificar la muestra de acuerdo a su origen o estatus (caso/control, saludable/enfermo)

ETAPAS DE UN EXPERIMENTO METABOLMICO Y

PLATAFORMAS ANALTICAS
Las principales tcnicas analticas que se emplean en
metabolmica estn basadas
En

resonancia magntica nuclear (NMR)

Espectrometra

de masas (MS)

Herramienta esencial en el anlisis de metabolitos, requiere de la

pre-preparacin de los componentes metablicos, ya sea mediante
cromatografa de gases (GC) o cromatografa de lquidos
La electroforesis capilar (CE) acoplada a masas (MS) se presenta como
(LC,
HPLC).
una alternativa prometedora, al igual que la espectroscopa infrarroja con
transformada de Fourier (FTIR).

LA ELECCIN DE LA TCNICA CORRECTA ES UN

COMPROMISO ENTRE RAPIDEZ, SENSIBILIDAD
Y SELECTIVIDAD, DEPENDIENDO DEL OBJETIVO

Medidas analticas
RMN (Resonancia Magntica Nuclear)
Es una tcnica muy robusta y verstil, que
permite la medida de un gran nmero de
metabolitos de forma fiable y repetitiva,
partiendo
de
un
proceso
de
acondicionamiento de muestra muy sencillo,
y con un nivel de automatizacin muy alto.
El campo magntico de los equipos de RMN
utilizados en metabolmica es en general
muy alto (superior a 10 Teslas) y existen
sondas que permiten la medida en flujos y
tambin en materiales semislidos (por
ejemplo, cultivos celulares, biopsias, tejidos,
etc.).

Las tcnicas GC-MS

(cromatografa de gases
acoplada a espectrometra de
masas) y LC-MS (cromatografa
lquida acoplada a
espectrometra de masas)
permiten analizar una gran cantidad
de metabolitos a sensibilidades muy
superiores a las de la RMN y
adems, eligiendo el mtodo de
separacin adecuado, se consigue
una gran selectividad. Sin embargo,
existen ciertas limitaciones en la
falta de estandarizacin de los

Aplicaciones

Agricultura: identificar y conocer las rutas

metablicas para optimizar el desarrollo de los
cultivos, la mejora del rendimiento y la resistencia a
pesticidas/herbicidas
Farmacutica: identificar metabolitos y marcadores
de toxicidad para el descubrimiento y desarrollo de
frmacos
Alimentos/nutricin: identificar la presencia o
Medioambiental: identificar
ausencia de metabolitos correlacionados con

metabolitos
relacionados con los
caractersticas importantes, como la calidad de los
efectos de las sustancias qumicas y
alimentos, la autenticidad, el sabor y el valor
otros estresores del entorno de un
nutricional, y colaborar en el desarrollo de
sistema
biolgico
Investigacin bsica y clnica:

nutracuticos
identificar y validar los biomarcadores de
Biocarburantes: identificar perfiles de
metabolitos correlacionados con los
metabolitos para optimizar los procesos de
estados de las enfermedades, as como
fermentacin y la produccin de biocarburantes
ofrecer perspectivas bsicas de la biologa

VENTAJAS

Dado que los metabolitos constituyen el producto final de la expresin de los genes, el estudio
cuali y cuantitativo de la composicin metablica de un organismo permite identificar la funcin
de muchos genes

Permite conocer el estado metablico de un organismo. La metabolmica constituye la

herramienta ms informativa a nivel funcional entre todas las tecnologas omicas

LIMITANTES

Incapacidad de estudiar el exhaustivamente todo el metabolismo

Incapacidad de estudiar el exhaustivamente todo el metabolismo