Y
PROTENAS
Aminocidos
Definicin:
Unidad estructural de las protenas.
Cualquier molcula que contiene un grupofuncional cido
y un grupo amino libre.
Funcin:
Determinar muchas de las propiedades importantes de las
protenas.
Los aa reportados son menos de 300 y de entre ellos, 20
son los que sintetizan las protenas inicialmente y forman
parte de todas las protenas.
Estructura bsica:
Son -aminocidos. El grupo cido siempre es un
carboxilo y el grupo amino se halla unido al
mismo tomo de carbono.
Propiedades:
Todos los aa en solucin acuosa estn ionizados y
pueden actuar como cidos o bases.
Zwitteriones
Los cidos en la proximidad del pH neutro pierden un
protn (carboxlico) y esta disociado, entonces la
carga negativa de este se encuentra deslocalizado
entre los 2 tomos de oxigeno y el grupo amino
habr captado un protn.
En condiciones fisiolgicas los aminocidos existen
como Zwitterin.
Clasificacin
Los aa en las protenas difieren entre si por la
cadena lateral, su clasificacin se basa en las
propiedades qumica de estas y se clasifican,
segn su polaridad y/o carga a pH neutro, el tipo
de estructura qumica, su reactividad, los
elementos presentes y por su habilidad para
formar enlaces de hidrgeno.
Nombre
Carcter
de
la cadena
lateral
Grupo
reactivo
polarida
d
Forma
puente
s
de H
Nombre
Carcter de
la cadena
lateral
Grupo
reactivo
polarida
d
Forma
puente
s
de H
Cisteina
aliftica
tiol
polar
ionizable
acepta
y dona
no
Serina
aliftica
alcohol
primario
polar
sin carga
acepta
y dona
apolar
no
Treonina
aliftica
alcohol
secundari
o
polar
sin carga
acepta
y dona
apolar
no
Asparagina
aliftica
amida
polar
sin carga
acepta
y dona
aliftica
apolar
no
Glutamina
aliftica
amida
polar
sin carga
acepta
y dona
Prolina
aliftica
apolar
no
Asprtico
aliftica
cido
carboxlco
polar
ionizable
acepta
y dona
Fenilalanin
a
aromtica
apolar
no
Glutmico
aliftica
cido
carboxlco
polar
ionizable
acepta
y dona
Triptofano
heterocclo
aromtico
Nitrgen
o
armati
co
apolar
acepta
Histidina
heterocclo
aliftico
imidazol
polar
ionizable
acepta
y dona
Tirosina
aromtica
-OH
fenlico
apolar
ionizabl
e
acepta
y dona
Lisina
aliftica
amino
polar
ionizable
acepta
y dona
Metionina
aliftica
tioeter
apolar
acepta
Arginina
aliftica
guanidio
polar
ionizable
acepta
y dona
Glicina
aliftica
apolar
no
Alanina
aliftica
apolar
Valina
aliftica
Leucina
aliftica
Isoleucina
aa neutros apolares
aa neutros polares
aa cidos
Aspartato, Glutamato
aa basicos
Aminocidos no estndar.
- 4-hidroxiprolina: presente en protenas de la pared
celular, protenas fibrosas colgeno del tejido conjuntivo.
- 5-hidroxilisina.
- N-metil-lisina: presente en la miosina protena
contrctil del msculo.
- Carboxiglutamato: presente en la protombinacoagulacin de la sangre.
- Desmosina: derivado de la lisina, presente en la
elastina.
- Ornitina y Citrulina. No forman parte de las protenas,
pero son intermedios clave en la biosntesis de arginina y
ciclo de la urea
Actividad biolgica de aa
1. Actan como mensajeros qumicos. Glicina, c.aminobutrico (GABA derivado de la glutamina),
serotonina y malatonina son Nerotransmisores:
sustancias liberadas por una clula nerviosa que influye
sobre la funcin de una segunda clula nerviosa o clula
muscular.
Hormonas: mleculas sealizadoras producidas en una
clula que regulan la funcin de otras clulas (tiroxina)
2. Precursores de diversas molculas complejas que
contienen nitrgeno (nucleotido, grupo HEMO, clorofila)
3. Intermediarios
metabolicos.
Arginina,
Citrulina,
Ornitinina
Dipeptido
Protenas
- Son biopolmeros
- Ms abundantes en las clulas 50% PS, constituyendo
gran parte de la organizacin estructural de estas y
tejidos.
- Fundamentales en los procesos biolgicos.
- Expresan la informacin gentica
- Molculas extremadamente complejas, formados de 20
clases distintas de aa.
- Composicin: Todas C, H, N, O, S. Elementos
adicionales: Fe, Cu, P, Zn
3. FORMA
Globulares
Fibrosas
Clasificacin
1.Funcin Biolgica
2.Composicin
Simples
Conjugadas
Enzimas
Almacenamiento
Reguladoras
Estructurales
Protectoras
Transporte
Contrctiles
4. Estructura tridimensional
Estructura Primaria
Estructura Secundaria
Estructura Terciaria
Estructura Cuaternaria
Clasificacin
Enzimas
Reserva
Transporte
Funcin
Tienen actividad
cataltica
Almacenan nutrientes
Fijan y transportan
molculas o iones
especficos
Contrctiles o motiles Capacidad de contraerse,
cambiar de forma o
moverse
Defensa
Protegen al organismo
contra invasin u heridas
Toxinas
Defensa del organismo.
Hormonas
Reguladoras de la
actividad celular o
fisiolgica
Estructurales
Actan como filamentos
de soporte
Ejemplos:
Ribonucleasa, Tripsina
2. Composicin:
Simples.- Toda su estructura la constituye un polipptido
y por hidrlisis producen solo aa, sin ningn otro producto
orgnico, inorgnico.
Contienen: 50% C, 7% H, 23% O, 16% N, 0 3 % S
Conjugadas.- Aquellas que por hidrlisis producen aa y
algn componente orgnico o inorgnico.
Tienen un grupo adicional, no proteico que acomaan a la
molcula. Este grupo desempea un papel especifico en la
funcin de la protena y se llama. Grupo Prosttico.
Puede ser un ion metlico.
Este grupo puede separarse de la enzima con facilidad y
se llama Coenzima
Monomricas
Protenas constituidas por una sola cadena
peptdica.
Oligomricas
Protenas que requieren de la asociacin no
covalente de 2 o ms cadenas polipeptidicas
(subunidades = protmeros)
Hemoglobina
Tiene 4 cadenas polipeptdicas. 2 cadenas identicas y 2
tambin identicas, ninguna se une por covalencia.
Tiene un grupo HEM que se une con su ion ferroso por lo
que puede llevar 4 molculas de oxgeno cuando se
oxigena por completo.
Es una parte importante de la capacidad amortiguadora de
la sangre por que en su estructura tiene histadina.
Capta oxgeno en lospulmones y lo libera en los tejidos
perifricos
b) Fibrosas:
Insolubles en agua.
Actan como elementos estructurales o protectores en
el organismo.
Sus cadenas polipeptdicas estn ordenadas en
disposicin paralela y extendida a lo largo de un nico
eje, formando fibras resistentes y tenaces estructuras
laminares largas.
Contienen proporciones
secundarias
elevadas
de
estructuras
1.Queratina
Componente ms importante de la piel, pelo y otras
estructuras epidrmicas.
Contienen altas y variables cantidaes de aa que tienen
azufre y rica en aa bsicos.
Formadas por hlices
cordones
ovillo
2. Colageno
Componente principal de los tejidos conjuntivos.
Formada por 3 hlices polipeptdicas que estan enrollados
uno sobre otro para formar una triple hlice.
Hay diferentes tipos.
El ms comun es el tipo I que se
encuentra en los dientes, huesos,
piel y los tendones
4. Estructura tridimencional
Estructura Primaria.
Incluye
todos
los
enlaces
covalentes.
Normalmente definida por la secuencia de aa
unidos por enlaces peptdicos y la localizacin de
los puentes disulfuro.
No se especifica la disposicin espacial de los aa
unidos.
Estructura Secundaria.
Describe la forma en la cual la cadena o cadenas polipeptdicas se
enrollan o doblan, pero tienen restricciones.
Disposiciones regulares y repetitivas en el espacio de residuos aa
adyacentes en una cadena polipeptdica.
Estructuras:
Hlice estructura rgida y muy bien enrollada en forma de varilla que
se forma cuando un cadena polipptidica se retuerce en una
conformacin helicoidal, se forman enlaces H entre el grupo N-H de
cada aa y el grupo carbonilo del aa.
Existen 3.6 residuos de aa por vuelta de la hlice. Los grupos R de los
aa se extiende hacia fuera y 13 tomos entre el O y N que forman el
puente de H.
hlice
Lmina plegada.
Se forma cuando se alinean de lado dos o ms segmentos
de cadena polipeptidica. Cada segmento individual se
denomina cadena , cada una est totalmente extendida.
Estan estabilizadas por enlaces de H que se forman entre
los grupos N-H y carbonilo del esqueleto polipeptidico
de cadenas adyacentes.
Hay 2 tipos:
Paralelas: Estan colocadas en la misma direccin.
Antiparalelas: Van en direcciones opuestas. Son ms
estables por que se forman enlaces de H totalmente
colineales.
Conformacin
Estructura Terciaria.
Descripcin de las relaciones espaciales entre todos los
aa de un polipptido, o, dicho de otro modo, su estructura
tridimencional completa.
Sus molculas se forman por una cadena polipeptdica.
Partes de la cadena polipeptdica pueden estar en forma
de -hlice separadas por otras estructuras secundarias
como las lminas plegada.
Los polipptidos se pliegan de forma que los residuos de
aa distante en la estructura primaria quedan cerca.
La mayoria de molculas de agua quedan excluidas del
interior permitiendo a las unidades compactas que se
denominan DOMINIOS
Estructura Cuaternaria.
Relacin espacial de los polipptidos subunidades
en la protena global.
Esta formada por SUBUNIDADES cada una se
compone de una sola cadena polipeptdica.
Los tomos dentro de cada subunidad se une por
su covalencia formando una molcula, los enlaces
entre las subunidades son las fuerzas
electrostaticas mucho ms dbiles entre los
residuos de aa con carga, enlaces de H y fuerzas
de van der waals.
Estructura Supersecundaria.
Agrupamiento estable de varios elementos de
estructuras secundarias.
Este termino se utiliza para describir
estructuraciones estables que se observa en
muchas protenas.