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Estructura y replicacin

del material gentico


Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del


material gentico
1
1
Objetivos tema 6:
Estructura y replicacin del material
gentico
Debern
Debern quedar
quedar bien
bien claros
claros los
los siguientes
siguientes puntos:
puntos:

Cmo se
Cmo se descubri
descubri lala naturaleza
naturaleza qumica
qumica del
del
material
material hereditario
hereditario
La composicin
La composicin qumica
qumica dede los
los cidos
cidos nucleicos
nucleicos
La estructura
La estructura 3D
3D del
del DNA:
DNA: naturaleza
naturaleza
complementaria
complementaria yy antiparalela
antiparalela dede la
la doble
doble cadena
cadena
del
del cido
cido desoxirribonucleico
desoxirribonucleico (DNA)
(DNA)
La extraordinaria
La extraordinaria capacidad
capacidad explicativa
explicativa del
del
modelo
modelo del
del DNA
DNA de de la
la funcin
funcin biolgica
biolgica
fundamental
fundamental dede esta
esta molcula
molcula
La replicacin
La replicacin semiconservativa
semiconservativa
Enzimologa de
Enzimologa de la
la replicacin
replicacin
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 2


material gentico
2
La transformacin bacteriana en
Streptococcus pneumoniae (Griffith 1928)

Rugosa

Muerte por neumona Cepa resistente

Lisa

Dr. Antonio Barbadilla

No muere Tema 6: Estructura


Muere y replicacin del 3
material gentico
3
Cul es el Principio transformante?

Principio

Rugosa Lisa

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Tema 6: Estructura y replicacin del 4


material gentico
4
Colin MacLeod

El elemento transformante Maclyn McCarty

es el DNA (1944)
Oswald
Avery

Ver animacin
experimento
tranformacin
bacteriana
Dr. Antonio Barbadilla

Slo DNA produce transformacin


Tema 6: Estructura y replicacin del 5
material gentico
5
Experimento de Alfred Hershey y Martha
Chase con fagos (1952)

Bacterifago T4

El DNA es el
material
infeccioso
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 6


material gentico
6
Componentes de los cidos nucleicos

adenina

timina
guanina

citosina

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Tema 6: Estructura y replicacin del 7


material gentico
7
Reglas de Chargaff

1. Proporcin de purinas = Proporcin de pirimidinas

A+G=C+T

2. A=T

3. G=C
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 8


material gentico
8
1953. Ao culminante:
J. Watson y F. Crick resuelven la
estructura tridimensional del DNA
(Nature 171: 737-738)

Watson y yo hemos
encontrado el
secreto de la vida

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 9


material gentico
9
1953. Ao culminante:

Dos lneas de evidencia:

Reglas de Chargaff

Fotografas de difraccin de rayos X

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 10


material gentico
10
Significado reglas de Chargaff

Complementariedad de las basesy replicacin del


Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 11
material gentico
11
Difraccin de rayos X

Hemoglobina

Linus Pauling
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Tema 6: Estructura y replicacin del 12


material gentico
12
Interpretacin del patrn difraccin de rayos X del DNA

Rosalind E.
Franklin

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Crick del
Tema 6: Estructura y replicacin 13
material gentico
13
Modelo en metal
del DNA

J. Watson y F. Crick
Concluyen: La estructura del DNA es una
doble hlice, formada por cadenas orientadas
en direcciones opuestas (antiparalelas). La
estructura se mantiene gracias a enlaces de
hidrgeno entre las bases nitrogenadas que se
encuentran orientadas hacia
Dr. Antonio Barbadilla
el interior de 14las
Tema 6: Estructura y replicacin del
14 cadenas
material gentico
Doble hlice, formada La estructura se mantiene gracias
por cadenas orientadas a enlaces de hidrgeno entre las
bases nitrogenadas que se
en direcciones opuestas
encuentran orientadas hacia el
(antiparalelas).
Dr. Antonio Barbadilla

interior
Tema 6: Estructura de las cadenas
y replicacin del 15
material gentico
15
Desnaturalizacin del DNA

Separacin de las dos hebras por calor


Una mayor proporcin G-C tiene una mayor
temperatura de desnaturalizacin (fusin)
100
Porcentaje G + C

80

60

40

20

Dr. Antonio Barbadilla


70 80 90 100 110
Temperatura de fusin (desnaturalizacin)
Tema 6: Estructura y replicacin del 16
material gentico
16
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Hlices levgiras y dextrgiras
Tema 6: Estructura y replicacin del 17
material gentico
17
DNA-B dextrgira
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Tema 6: Estructura y replicacin del 18


material gentico
18
Ver
Ver artculo
artculo
Nature
Nature
1953
1953
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Tema 6: Estructura y replicacin del 19


material gentico
19
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Tema 6: Estructura y replicacin del 20


material gentico
20
La estructura del DNA suministra una
explicacin asombrosamente
simple del fenmeno de la herencia
La estructura explica:

La naturaleza de la secuencia lineal de los genes


(informacin digital cuaternaria en secuencias
unidimensionales de monmeros A,T,G,C)
El mecanismo de replicacin exacta de los
genes
La naturaleza qumica de las mutaciones
Por qu la mutacin, la recombinacin y la
expresin gnica son fenmenos separables a
nivel molecular
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 21


material gentico
21
Esencial a la relacin
ntima entre estructura
molecular y funcin
gentica del DNA es el
concepto de molde
La complementariedad de las
bases nitrogenadas permite que
la secuencia de una cadena
sencilla de DNA acte como un
molde para la formacin de una
copia complementaria de DNA
(replicacin) o de mRNA
(transcripcin)
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 22


material gentico
22
Y ahora las declaraciones de Watson y
Crick sobre el ADN. Esto es para m la
prueba verdadera de la existencia de Dios
Salvador Dal

Antes pensbamos que nuestro futuro


estaba en las estrellas. Ahora sabemos que
est en nuestros genes.
James Watson

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 23


material gentico
23
Una estructura
tan bonita tena,
por fuerza, que
existir
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Tema 6: Estructura y replicacin del 24


24
material gentico J. Watson
Una estructura
tan bonita tena,
por fuerza, que
existir
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del J. Watson


25
material gentico
25
El DNA
contiene informacin
digital cuaternaria en
secuencias unidimensionales
de monmeros A,T,G,C
Dr. Antonio Barbadilla

(cristal
26
aperidico) Tema 6: Estructura y replicacin del
material gentico
26
Hay grandeza en esta concepcin de la
vida,... que mientras este planeta ha ido
girando segn la constante ley de la
Hay grandeza
gravitacin, seen
hanesta concepciny de
desarrollado se la
estn
vida,... que mientras
desarrollando, este
a partir deplaneta ha ido
una molcula
girando segn
helicoidal la constante
asombrosa, ley de
infinidad delaformas
gravitacin,
cada vez mssebellas
han desarrollado y se estn
y maravillosas
desarrollando, a partir de un comienzo
Charles Darwintan
sencillo, infinidad de formas cada vez ms
bellas y maravillosas
Charles Darwin
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 27


material gentico
27
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 28


material gentico
28
Replicacin del DNA

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Tema 6: Estructura y replicacin del 29


material gentico
29
25 de Abril 1953

It has not escaped our notice that the


specific pairing we have postulated
immediately suggests a possible
copying mechanism for the genetic
material.

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Tema 6: Estructura y replicacin del 30


material gentico
30
Posibles modelos de replicacin

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Tema 6: Estructura y replicacin del 31


material gentico
31
Replicacin del DNA
Semiconservativa: una cadena sirve de molde para una
nueva cadena
El experimento de M. Meselson y F. Stahl (1958)
demuestra que la replicacin es semiconservativa

Mathew Meselson Frank Stahl


Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 32


material gentico
32
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 33


material gentico
33
Replicacin del DNA
Enzimas que sintetizan (replican) el DNA
E. coli
DNA polimerasa I (rellena huecos y repara)
DNA polimerasa II y III (funcin principal en
la sntesis)
Aade bases en ambas cadenas en la
direccin 5 3
Requiere un 3 OH final
Eucariotas
5 polimerasas
y principal en replicacin
, y exonucleasas
Correccin de pruebas: actividad 3 5
exonucleotdica. Sustituye bases mal emparejadas
(10-5) por correctas (10-7); mecanismos de reparacin
Dr. Antonio Barbadilla
adicionales la reducen hasta 10-10 Tema 6: Estructura y replicacin del 34
material gentico
34
3 5
Las polimerasas
conocidas aaden
nucletidos
solamente en la
direccin 5 3

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Tema 6: Estructura y replicacin del 35


material gentico
35
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 36


material gentico
36
Por qu no hay una enzima que
polimerice en la direccin 3-> 5?

No funcionara la correccin de errores por


falta de un trifosfato que suministre la
energa de enlace covalente azcar-fosfato

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Tema 6: Estructura y replicacin del 37


material gentico
37
Adicin 53

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Tema 6: Estructura y replicacin del 38


material gentico
38
P

P
P

P
OH

OH
P
P

PP

OH
3

P
5
PP + H2O
P

P
OH

PP

OH
P
OH

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Tema 6: Estructura y replicacin del 39


P

material gentico
39
Adicin 35
(hipottica)

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Tema 6: Estructura y replicacin del 40


material gentico
40
P

OH
OH

P PP

PP
OH
3 5

P
PP + H2O
P

OH
PP
P
OH
Adicin 35
OH

(hipottica)
P

PP

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Tema 6: Estructura y replicacin del 41


P

material gentico
41
Correccin de errores

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 42


material gentico
42
P

P
P

P
OH

POH
P
P

PP

OH
3

P
5
PP + H2O
P

P
OH

Adicin 53
OH

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Tema 6: Estructura y replicacin del 43


P

material gentico
43
P

OH
OH

POH

PP
3 5

P
Adicin 35
(hipottica)
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 44


material gentico
44
Replicacin del DNA (2)
Replicacin: continua (cadena adelantada, cebador
slo inicio) y discontinua (cadena retrasada)

Discontinua
Cebador (pequeo RNA 2-60 nucletidos
aadido por enzima primasa o RNA pol que
provee 3 OH.
Fragmento de Okazaki por DNA pol III
(1500 bp en procariotas y 150 en eucariotas)
Pol I elimina cebador 3 -> 5 y llena huecos
(gap)
Ligacin (DNA ligasa, enlace fosfodister)
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 45


material gentico
45
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 46


material gentico
46
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Tema 6: Estructura y replicacin del 47


material gentico
47
Polimerasa III

Polimerasa I

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Tema 6: Estructura y replicacin del 48


material gentico
48
Por qu el cebador es RNA?

El cebador es ms proclive al error, por


lo que debera eliminarse y el RNA
puede detectarse y eliminarse
fcilmente por la DNApol I

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Tema 6: Estructura y replicacin del 49


material gentico
49
Replicacin del DNA (3)
El replisoma: complejo enzimtico de la
replicacin que coordina la sntesis de las
dos cadenas, maquinaria molecular
Dmero de la DNA pol III (ncleos
catalticos)
Primosoma: formado por dos enzimas
Primasa
Helicasa (desenrolla el DNA)
Protena de unin a cadena sencilla, ssb
(Unin Y, estabiliza el DNA de cadena
sencilla)
Topoisomerasas tipo I (rotura una cadena)
y II (rotura de dos cadenas) junto a DNA
ligasa -> Relajacin del superenrollamiento
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 50


material gentico
50
El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 51


material gentico
51
El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

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Tema 6: Estructura y replicacin del 52


material gentico
52
El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

DNA pol III + abrazadera beta -> Enzima procesiva

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Tema 6: Estructura y replicacin del 53


material gentico
53
El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

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Tema 6: Estructura y replicacin del 54


material gentico
54
Topoisomerasas

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 55


material gentico
55
Replicacin del DNA (4)
Origen de replicacin:
Secuencia reconocida (Ori C en E. coli) por
protenas iniciadoras. Varios orgenes en
eucariotas
La replicacin es bidireccional

Horquilla
replicacin

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 56


material gentico
56
En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orgenes de
replicacin (~500 en levaduras y 60000 en mamferos). Cada
unidad de replicacin es un replicn. La replicacin es
bidireccional

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 57


material gentico
57
En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orgenes de
replicacin (~500 en levaduras y 60000 en mamferos). Cada
unidad de replicacin es un replicn. La replicacin es
bidireccional

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicacin del 58


material gentico
58
Links de inters
Watson-Crick original paper (1953 Nature)
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material gentico
59

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