Respirasi

Kelompok 5 :
Satrya Dufa
Sherly Aulia Primayani
Vera Desmawati
 Respirasi
Respirasi adalah proses oksidasi donor elektron melalui
pembawa elektron yang terjadi di membran sel atau
organela bermembran dan mengahasilkan ATP secara
fosforilasi oksidatif (melalui ATPsintase).
Jadi, proses respirasi memerlukan 3 hal, yaitu donor
elektron, sistem transfer elektron, dan akseptor elektron.
Beberapa senyawa yang dapat dipakai sebagai donor
elektron, yaitu NADH, hidrogen, tiosulfat, sulfat, besi,
dan lainnya.
 Respirasi pada E. Coli
Escherichia coli, atau biasa disingkat E. coli, adalah
salah satu jenis spesies utama bakteri gram negatif.
Kebanyakan E. Coli tidak berbahaya, tetapi beberapa,
seperti E. Coli tipe O157:H7, dapat mengakibatkan
keracunan makanan yang serius pada manusia yaitu
diare berdarah karena eksotoksin yang dihasilkan
bernama verotoksin.
E. Coli merupakan bakteri fakultatif anaerob, dapat
hidup jika ada oksigen maupun tidak ada
oksigen.
a. Respirasi Aerob
Ketika hidup secara aerob, E.coli menyintesis 2
kompleks sitokrom oksidase berbeda, yaitu sitokrom
bo (jenis sitokrom b) dan sitokrom bd (jenis
sitokrom d), sehingga menghasilkan rantai respirasi
bercabang.
Sit b Sit O2
o
DEHIDROGENASE UQ
Sit b Sit
d O2

Gambar : Rantai respirasi aerob yang bercabang pada

E.coli
 Sitokrom bo merupakan sitokrom yang mampu
memompa proton, jadi dapat menghasilkan p,
sedangkan sit bd tidak mampu memompa atau
memindahkan proton.
Sit bo disintesis ketika kadar oksigen tinggi dan sit
bd disintesis ketika kadar oksigen rendah.
Jadi, sit bd mempunyai afinitas tinggi terhadap
oksigen, sehingga pada kadar O2 rendah sit bd tidak
mampu mentransfer elektron ke oksigten. Hal itu
tidak mampu dilakukan oleh sit bo.
 Pada kondisi aerob tinggi NADH-I dehidrogenase mampu memindahkan
4 proton, sedangkan NADH-2 dehidrogenase tidak mampu memindahkan
proton. UQ mampu memindahkan proton sebanyak 4. Sit bo mampu
memindahkan 2 proton.

Jumlah ATP yang dihasilkan respirasi aerob bervariasi dari 2 ATP sampai
3,3 ATP.

Pada kondisi mikroaerob NADH-I dehidrogenase mampu memindahkan

4 proton, sedangkan NADH-2 dehidrogenase tidak mampu memindahkan
proton. UQ mampu memindahkan proton sebanyak 4. Sit bd tidak
mampu memindahkan proton.

Jumlah ATP yang dihasilkan respirasi mikroaerob bervariasi dari 1,3 ATP
sampai 2,7 ATP.
 Respirasi aerobik adalah proses selular untuk
memproduksi energi. Elektron yang diambil dari
donor elektron dan ditransfer ke O2 sebagai
akseptor elektron terminal.
Proses ini menghasilkan potensial membran di
seluruh sitoplasma membran disebut proton
kekuatan motif (PMF). PMF tersebut kemudian
digunakan untuk menggerakkan sintesis ATP
melalui ATP synthase membran-bound (elektron
transportasi fosforilasi).
Sitokrom oksidase dengan afinitas yang berbeda
untuk O2 memungkinkan E. coli tumbuh di bawah
kondisi aerobik.
 Aerobik rantai pernapasan yang terletak di membran
sitoplasma dan digunakan untuk menghasilkan kekuatan
proton motif (PMF).
Rantai transpor elektron aerobik selalu mengandung
enzim dehidrogenase yang menyumbangkan elektron
untuk sitokrom oksidase yang mengurangi O2 ke H2O.
Ubiquinone (Q) menengahi mediator elektron antara dua
enzim.
Proton motif sintesis kekuatan drive ATP melalui
membran-terikat ATP sintase.
Sitokrom oksidase dengan afinitas yang berbeda untuk
O2 memungkinkan E. coli tumbuh di bawah kondisi
aerobik dan mikroaerofilik.
 rantai transpor elektron aerobik E. coli terdiri dari dua jenis enzim
yang berbeda, dehidrogenase yang mengoksidasi donor elektron
(D) seperti NADH, dan oksidase sitokrom, yang mengurangi O2
akseptor elektron untuk H2O. Elektron ditransfer dari satu enzim
ke yang lain melalui kofaktor ubiquinone lipofilik (Q).
E. coli berisi tiga oksidase sitokrom berbeda yang berbeda dalam
afinitas mereka untuk O2, kemampuan mereka untuk memompa
proton, konten sitokrom mereka, dan profil ekspresi gen mereka.
Setiap oksidase sitokrom dapat menerima elektron dari berbagai
alternatif elektron menyumbangkan dehydrogenases. Jenis donor
elektron yang digunakan tergantung pada ketersediaan substrat -
itu bisa menjadi organik atau anorganik di alam - misalnya,
suksinat atau hidrogen.
 How E. coli Respires with oxygen

Ketika E. coli tumbuh dengan mengoksidasi

karbohidrat seperti glukosa, NAD direduksi
menjadi NADH. Kemudian ia berfungsi
sebagai donor elektron untuk respirasi aerobik.

2 NADH + 2 H + + O2 2 NAD + + 2 H2O

 Misalnya, ketika glukosa dimetabolisme melalui
glikolisis jalur ke piruvat, dua molekul NADH yang
dibuat. piruvat ini kemudian dekarboksilasi menjadi
asetil-CoA, dan kemudian lebih lanjut teroksidasi
menjadi CO2 oleh siklus TCA.
Reaksi-reaksi yang terakhir memberikan molekul
tambahan dari NADH yang mendukung respirasi
aerobik. TCA siklus menengah, suksinat - juga dapat
berfungsi sebagai donor elektron untuk respirasi
aerobik.
Enzim yang digunakan dalam respirasi aerobik ini
adalah :
1. Sitokrom bo oxidase (CyoABCD).
The sitokrom bo oksidase pasangan oksidasi
dua elektron dari ubiquinol (QH2) dengan
pengurangan empat elektron dari molekul oksigen
ke dalam air. Ini memiliki afinitas yang relatif
rendah untuk O2 dan paling melimpah ketika sel-
sel yang tumbuh ketika dalam kondisi aerasi yang
tinggi (misalnya, kaya oksigen). Enzim membran
terikat menghasilkan kekuatan proton-motif dengan
mengkonsumsi proton dalam sitoplasma.
2. Sitokrom bd-I oxidase (CydAB).
bd-I sitokrom oksidase juga mengkatalisis
oksidasi dua elektron dari ubiquinol dan
pengurangan empat elektron oksigen ke air. Ini
menghasilkan kekuatan proton-motif dengan
mengkonsumsi proton dalam sitoplasma tetapi
tidak seperti CyoABCD, itu tidak dapat memompa
proton.
3. Cytocrome oksidase bd-II (AppBC).
Peran fisiologis cytocrome oksidase bd-II tidak jelas.
Sementara itu berfungsi sebagai kinol: oksidoreduktase
oksigen, tidak muncul untuk berkontribusi generasi dari
kekuatan motif proton. Ini mungkin memainkan peran
dalam katabolisme uncoupling dari sintesis ATP. Dua
subunit sitokrom bd-II dikodekan oleh gen APPC dan
appB secara struktural mirip dengan sitokrom bd-I
terminal oksidase CydA dan subunit CydB, masing-
masing. The appCB-Appa operon diatur oleh Appy
aktivator transkripsi dimana ekspresi gen diinduksi
pada saat masuk ke dalam fase diam, dan dengan
kelaparan untuk karbon dan / atau fosfat.
The dehydrogenases:
1. NADH dehidrogenase I
NADH dehidrogenase I (NDH-1) mengkatalisis transfer elektron dari NADH ke
kuinon kolam renang dalam membran sitoplasma, sehingga regenerasi bentuk
teroksidasi dari kofaktor, NAD +. enzim membran ini membentuk gradien
elektrokimia proton (PMF) dengan memompa proton dari sitoplasma ke periplasma.
Hal ini dapat berpartisipasi baik dalam respirasi sel aerobik atau anaerobik. Enzim
murni dapat diselesaikan dalam tiga komponen: sebuah fragmen larut terdiri dari
subunit NuoE, F dan G, yang mengkatalisis oksidasi NADH - yang merupakan
bagian masukan elektron dari enzim;
fragmen menghubungkan amphipathic terdiri dari NuoB, CD dan saya subunit; dan
fragmen membran hidrofobik terdiri dari NuoA, H, J, K, L, M, dan subunit N.
Subunit larut mengandung semua kluster zat besi-sulfur dan kofaktor FMN.
2. NADH dehidrogenase II (NDH-2).
NADH dehidrogenase II mengkatalisis transfer
elektron dari NADH ke kuinon kolam renang dalam
membran sitoplasma. Berbeda dengan NDH-1,
NDH-2 adalah enzim subunit tunggal dan tidak
memompa proton. Ini berfungsi selama respirasi sel
aerobik, dan fungsi utamanya dapat membantu
menjaga [NADH] / [NAD +] keseimbangan sel.
Suksinat dehidrogenase
Suksinat dehidrogenase juga berpartisipasi dalam transpor elektron aerobik
dengan menyumbang elektron ke oksidase sitokrom.

suksinat + O2 fumarat + H2O

Juga disebut suksinat: kuinon oksidoreduktase (SQR), suksinat dehidrogenase

mengkatalisis oksidasi suksinat menjadi fumarat dengan pengurangan
bersamaan dari ubiquinone (Q) ke ubiquinol. Sdh memainkan peran penting
dalam metabolisme sel dengan langsung menghubungkan siklus TCA dengan
rantai transpor elektron pernapasan. E. coli Sdh adalah membran terikat enzim
heterotetrameric. Subunit SdhA dan SdhB yang hidrofilik dan menempel pada
permukaan sitoplasmik membran plasma melalui interaksi dengan dua subunit
membran integral hidrofobik, SDHC dan SDHD. SdhA mengandung kofaktor FAD
dan asam dikarboksilat situs mengikat. Sebuah kofaktor heme b556 tunggal
menjembatani subunit SDHC dan SDHD. The sdhCDAB operon secara optimal
diekspresikan selama pertumbuhan sel aerobik dimana ARCA / ArcB dua
komponen sistem merepresi ekspresi dalam ketiadaan oksigen. ekspresi gen
juga dikenakan katabolit kontrol.
enzim dehidrogenase lainnya.
Beberapa dehydrogenases lainnya di E. coli juga dapat menyumbangkan
elektron untuk sitokrom oksidase.
Misalnya, L-laktat dehidrogenase, gliserol-fosfat dehidrogenase, dan prolin
dehidrogenase mengoksidasi substrat masing-masing dan menyumbangkan
elektron ke kuinon kolam renang dalam membran sitoplasma.
Schematic representation of the central anaerobic metabolic
pathways of E. coli showing involvement of the NADH/NAD+ cofactor
pair and the newly introduced NAD+-dependent pathway (shown in
red).