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Taxonoma Bacteriana

Blgo. Mblgo.
CARLOS A. ESQUECHE ANGELES
TAXONOMA BACTERIANA

La taxonoma es la ciencia de la clasificacin biolgica

Comprende tres partes independientes pero relacionadas:

La clasificacin, que es la ordenacin de los seres vivos en grupos o


taxones en funcin de semejanzas o parentesco evolutivo.

La nomenclatura, que se ocupa de asignar nombres a los grupos


taxonmicos de acuerdo con normas establecidas.

La identificacin, es el proceso para determinar que un aislamiento


particular pertenece a un taxn reconocido.
(es el lado prctico de la taxonoma)
Las distintas categoras taxonmicas se definen por las propiedades y
caractersticas que poseen las bacterias que las integran.
Los datos reciben el nombre de caracteres taxonmicos. E incluyen
caracteres fenotpicos, genticos y quimiotaxonmicos.

FENOTPICOS
1) MORFOLGICOS
2) BIOQUMICAS/FISIOLGICAS
3) SEROLGICAS
4) FAGOTIPIA
5) PRUEBAS DE INHIBICIN
GENTICOS
1 ) ADN / ARN: contenido de G+C, hibridacin
ADN-ADN, secuenciacin del ARNr

QUIMIOTAXONMICOS
1) MEMBRANA CITOPLASMTICA: cidos grasos,
tipos de lpidos polares, presencia de cidos
miclicos
2) PARED CELULAR: tipos de peptidoglucano,
presencia de cidos teicoicos
3) PROTENAS: comparacin perfil protenas,
secuencia de aminocidos
Al preparar un sistema de clasificacin, se ubican todos los
microorganismos en grupos homogneos, que a su vez pertenecen a
otro grupo ms extenso siguiendo una estructura jerrquica sin
superposiciones.

Una categora de cualquier rango une grupos de nivel inferior en


funcin de propiedades comunes.

En la taxonoma bacteriana los niveles o rangos utilizados son los


siguientes (en orden ascendente):

ESPECIE
GNERO
FAMILIA
ORDEN
CLASE
REINO
DOMINIO
El grupo taxonmico bsico es la ESPECIE
Definicin de especie

Para los taxnomos que trabajan con organismos superiores


ESPECIE es un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre si
y que estn aisladas de otros grupos desde el punto de vista de la
reproduccin.

Para los microbilogos


ESPECIE BACTERIANA es una coleccin de cepas que comparten numerosas
propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de
cepas.

Una CEPA es una poblacin de microorganismos que desciende de un nico


organismo o de un aislamiento en cultivo puro.

Cada especie se asigna a un GNERO, el siguiente rango de la jerarqua


taxonmica.
Un GNERO es un grupo bien definido de una o ms especies que est
claramente separado de otros gneros.
ESPECIE
Grupo taxonmico bsico
Menos definido que para organismos superiores
Rasgos morfolgicos no tan importantes
Puede ser considerada como una coleccin de cepas que
muestras muchos rasgos en comn y difieren considerablemente
de otras cepas
Una CEPA de una especie es considerada como CEPA TIPO
(comparar)

SUBESPECIE
Basada en variaciones fenotpicas y genotpicas menores,
pero constantes. Es la categora ms baja aceptada
oficialmente
NOMENCLATURA

Los microbilogos asignan nombre a los microorganismos de acuerdo


con el SISTEMA BINOMIAL del botnico sueco Carl Von Linneo.

El nombre latinizado y en cursiva consta de dos partes:


El primer nombre, escrito con mayscula, es el nombre genrico.
El segundo nombre, en minscula, es el epteto de la especie.

Escherichia coli

A menudo se abrevia el nombre genrico con una letra mayscula

E. coli
ESTRUCTURACIN JERRQUICA EN TAXONOMA

Rango Nombre taxonmico


Dominio Bacteria
Phylum o Proteobacteria
Reino
Clase -Proteobacteria
Orden Enterobacteriales
Familia Enterobacteriaceae
Gnero Shigella
Especie S. dysenteriae
Clasificacin
Dominio
Actualmente
considerado el nivel
taxonmico ms alto
(super-reinos).

3 dominos: Bacteria,
Archaea, Eukarya

Sistema de Woese
(1990)
Dominio
Nivel taxonmico ms alto
Sistema de tres dominios
Aceptado despus de 1970
Procariota
Bacterias
Archaea
Eucariota
Eukarya
Dominio Eukarya
Se encuentran
los diferentes
reinos
Organismos
con ncleo
verdadero
Dominio Bacteria

Clulas procariotas (estructura simple)


Carecen de ncleo u organelos
limitados por una membrana
Tienen importancia positiva y negativa
DOMINIOS: Caracteres que los definen

BACTERIA ARCHEA EUKARYA


Clulas procariotas eucariotas
Ncleo con NO SI
Membranas enlazados por enlaces eter, enlazados por
lipdicas ster, ramificado ster,
no ramificados no ramificados

organelas NO SI
rbol filogentico de todos los seres vivos
Reinos
Agrupamiento
taxonmico de Filos o
Divisiones
emparentados.

Considerada la
categora ms alta
hasta finales del S. XX

Sistema de Robert
Whittaker (1969)
Sistema de cinco reinos
Robert Whittaker (1969)
Procariotas
Reino Monera (bacterias)
Eucariotas
Protista (protozoos, algas, mohos del limos, entre otros)
Fungi (hongos y liquenes)
Plantae (musgos, helechos, conferas, plantas con flor)
Animalia (vertebrados e invertebrados)
Sistema de seis reinos
Carl Woese (1977)
Procariotas
Eubacterias
Archaebacterias
Eucariotas
Protista
Fungi
Plantae
Animalia
Un sistema de 5 reinos

La mayora de los bilogos actuales


reconocen estos cinco reinos: Moneras,
Protistos, Hongos, Plantas y Animales,
que se basan en la organizacin celular
complejidad estructural y modo de nutricin
Reino Prokaryotae (Monera)
Organismos procariticos unicelulares

Incluye bacterias y cianobacterias

Habitan agua, suelo, aire, lugares extremos (ej.


Altas temperaturas) y agentes qumicos dainos

Pueden ser fotosintticos, quimiosintticos o


heterotrficos
Cianobacterias

Formando colonias o filamentosas

Llevan a cabo fotosntesis

Producen esporas

Ambientes de agua dulce, marinos, terrestres

Ej. Gloeocapsa sp., Anabaena sp., Oscillatoria


sp.
Cianobacterias
Eran conocidas como algas
azul-verdosas
Organismos fijadores de
nitrgeno
Abundantes en charcas y lagos
Bacterias
La mayora presentan pared celular
compuesta de peptidoglucano (polimero de
protenas y carbohidratos)

Material gentico encontrado en anillos-


plasmidos

Reproduccin por fisin binaria

Pueden formar colonias

Poseen varias formas: cocos, bacilos,


espirilos, entre otros
Arbol filogentico de los principales linajes de Bacteria basado
en la comparacin de secuencias de ARNr
Resumen de las principales caractersticas diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya

Caracterstica Bacteria Archaea Eukarya

- Estructura celular procaritica S S No


- ADN circular S S No
- Histonas No S S
- Ncleo rodeado de membrana Ausente Ausente Presente

- Pared celular de peptidoglicano S No No


- Lpidos de membrana Enlaces ster Enlaces ter Enlaces ster
- Ribosomas 70S 70S 80S
- Intrones No No S

- Plsmidos Si S Raro
- Sensibilidad de ribosomas a la No S S
toxina diftrica
- Sensibilidad a cloranfenicol, S No No
estreptomicina y kanamicina
- Metanognesis No S No
- Reduccin desasimilativa de S S No
sulfatos y frrico
- Nitrificacin S No No
- Desnitrificacin S S No
- Fijacin de nitrgeno S S No
- Fotosntesis oxignica S No S (en cloroplastos)
- Quimiolitotrofa S S No
- Vesculas de gas S S No
- Sintesis de grnulos de reserva S S No
de carbono (-hidroxialcanoatos)
- Crecimiento por encima de 80 S S No
SISTEMAS DE CLASIFICACIN

Las caractersticas taxonmicas de los microorganismos se utilizan


para formar un sistema de clasificacin.

Existen dos formas generales para elaborar un sistema de clasificacin:


SISTEMA FENTICO
Los microorganismos se agrupan en funcin de semejanzas en sus
caractersticas fenotpicas.
Los microorganismos que comparten muchas caractersticas forman un
nico taxn.

SISTEMA FILOGENTICO
Los microorganismos se agrupan en funcin de probables relaciones
evolutivas.
Es difcil de realizar para las bacterias debido a la falta de registros fsiles.
PRINCIPALES CARACTERSTICAS APLICADAS EN TAXONOMA BACTERIANA
Forma celular
CARACTERSTICAS MORFOLGICAS
Tamao de las clulas
CLSICAS Morfologa de las colonias
Caractersticas ultraestructurales
Tincin
GENTICAS Cilios y flagelos
Mecanismo de movilidad
Forma y localizacin de endoesporas
Posibilidad de recombinacin por Inclusiones celulares
Conjugacin o color
Transformacin

Plsmidos Fuentes de C y N
FISIOLOGICAS Y Componentes de la pared celular
METABLICAS Fuentes de energa
Productos de fermentacin
ECOLGICAS Tipo nutricional
Temperatura de crecimiento
Luminiscencia
Mecanismo de conversin de energa
Ciclo vital Movilidad
Relaciones simbiticas Tolerancia osmtica
Patogenicidad Relaciones con el oxgeno
Preferencia de hbitat pH ptimo de crecimiento
Necesidad de temperatura; pH; Pigmentos fotosintticos
Necesidad de oxgeno Necesidad y tolerancia a la sal
Necesidad de concentracin osmtica Metabolitos secundarios
Sensibilidad a antibiticos
Identificacin de una bacteria entrica
mediante tcnicas microbiolgicas
clsicas utilizando exclusivamente criterios
fenotpicos.
La mayora de los pasos a seguir
requieren que el microorganismo crezca
en cultivo puro.
PRINCIPALES CARACTERSTICAS APLICADAS EN TAXONOMA BACTERIANA

COMPOSICIN DE CIDOS CARACTERSTICAS COMPARACIN DE


NUCLICOS MOLECULARES PROTENAS
(CONTENIDO EN G+C)

HIBRIDACIN DE CIDOS NUCLEICOS


SECUENCIACIN DE CIDOS NUCLEICOS
CLASIFICACION DE LAS BACTERIAS (Bergey 2001)

El Manual Bergey categoriza a las bacterias en taxones basados en la secuencia de


ARNr
Por otra parte lista caractersticas identificatorias de las bacterias tales como:
morfologa celular, coloracin de Gram, requerimientos de oxgeno

las bacterias del phylum Proteobacterias son Gram negativas


Alfa Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum crecen con niveles
bajos de nutrientes (oligotrficos), algunos poseen prostecas (prolongaciones
celulares) . Incluye a fijadores de nitrgeno, quimioautotrofos y quimioheterotrofos
Beta Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum habitan en el agua
y suelo. Algunos son patgenos humanos, incluyen quimioautotrofos y
quimioheterotrofos. Bordetella, Burkholderia, Neisseria
Gama Proteobacterias: incluye los ordenes Pseudomonadales,
Legionellales, Vibrionales, Enterobacteriales, Pasteurellales, Francisella
Delta Proteobacterias: incluye los gneros Myxococcus y Bdellovibrio,
parsitos de otras bacterias y el gnero Desulfovibrio
Epsilon Proteobacterias: incluye los patgenos humanos Campylobacter y
Helicobacter
Bacterias Gram Negativas No-proteobacterias

Las bacterias gram negativas no relacionadas filogeneticamente a Proteobacteria


se clasifican en varios phyla de Gram negativas no Proteobacterias

1. El phylum Cyanobacteria corresponde a los fotoautotrofos que utilizan la luz


como fuente de energa y CO2 como fuente de carbono y producen O2
durante la fotosntesis

2. Los quimioheterotrofos incluyen Chlamydia (phylum Planctomyces),


Bacteroides (phylum Bacteroides), Fusobacterium (phylum Fusobacteria) y
Treponema, Borrelia y Leptospira (phylum Spirochetes). Muchos de ellos
patgenos humanos
El Manual Bergey divide a las bacterias Gram
Positivas de acuerdo a su contenido de G+C

1. Bacterias Gram Positivas de alto contenido de G+C (phylum Actinobacteria) incluye


el importante gnero Mycobacterium y los gneros filamentosos Actinomyces y
Streptomyces, formadores de conidiosporas. Los no formadores Nocardia y Frankia
tambin se incluyen aqu. Corynebacterium, Propionibacterium

2. Bacterias Gram Positivas de bajo contenido de G+C (phylum Firmicutes) incluye a


las bacterias del suelo, las lcticas y numerosos patgenos. Los rdenes
Clostridiales (Clostridium), Bacillales (Bacillus) Lacobacilalles (Staphylococcus,
Streptococcus, Listeria y Lactobacillus). Tambin incluye a Micoplasmas (todava
clasificados como Gram negativos), pero como se tien dbilmente por su falta de
pared, se incluyen entre las bacterias Gram positivas de bajo contenido de G+C

Las bacterias fotosintetizadoras verdes (sulfreas y no sulfreas) y las prpuras


(sulfreas y no sulfreas) son fotoautotrofas gram negativas que usan energa
luminosa y CO2 como fuente de carbono y no producen O2 (anoxignicas). Se las
clasifica por una parte dentro de dos sub-phyla diferentes de las Proteobacterias y
por otra dentro de las no Proteobacterias
Taxonoma: nomenclatura
1. Solamente hay un nombre correcto para un microorganismo

2. Todos los nombres son escritos en latn

3. La primera palabra del gnero en mayscula y la de la especie en


minscula, escribir en itlica

4. Debe tener el respaldo de una publicacin y aparecer en


International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB)

5. Gnero sin indicar especie spp, si el gnero solo tiene 1 especie


sp, si hay subespecies ssp

6. Cuando existe varios nombres para la misma especie, el nombre


mas viejo es el que vale ocasionalmente se cambian los nombres
debido a que se ajustan mas apropiadamente al latin que otros