GENETIKA

MIKROORGANISME

Oleh :
Efrida Warganegara
 GENETIKA M.O.
Genetika dipelajari utk mengetahui
dan mempelajari :

Pewarisan ciri dan keragaman

Perubahan fenotipe dan genotipe
Pembuatan peta gen
Aplikasi genetik
 GENETIKA M.O.
Pengetahuan tentang Genetika berkembang
sejak ditemukannya TEORI MENDEL (1900)
HEREDITAS
HEREDITAS adalah suatu bentuk tetap yg di-
turunkan dari 1 generasi ke generasi
berikutnya (terkadang terdapat variasi)
Yang bertanggungjawab thdp Hereditas
(Pewarisan ciri & keragaman) adlh gen-gen
yg trdpt berderetan di dalam khromosom
 GENETIKA M.O.
STRUKTUR & FUNGSI GEN
FUNGSI GEN
GEN merupakan suatu segmen asam nukleat
(polimer / urutan asam nukleat, DNA) yg
mengkode protein (produk fungsional) dan RNA
RNA t.d. : tRNA (transfer RNA) -> translasi
rRNA (ribosomal RNA) -> translasi
mRNA (messenger RNA) -> hasil transkripsi
Ukuran Gen : Prokariot -> 1000 pb
Eukariot -> 10.000 pb
 GENETIKA M.O.
STRUKTUR GEN

Gen Prokariot -> kontinyu

Gen Struktural
DNA
transkripsi
mRNA
Translasi

Protein
 GENETIKA M.O.
* Gen Eukariot -> - Intron (tidak memspesifikasi protein)
- Ekson (yang menspesifikasi protein)

Gen Struktural

I1 E1 I2 E2 I3 E3 I4 E4

DNA

transkripsi
RNA primer
Prosesing
E1 E2 E3 E4 mRNA fungsional
Translasi

Protein
 GENETIKA M.O.
ASAM NUKLEAT
Asam Nukleat merupakan makromolekul yg
merupakan Polimer lurus dari Monomer, dimana
monomer merupakan susunan nukleotida-
nukleotida

NUKLEOTIDA : Merupakan ikatan dr 3 komponen

yaitu, 1. Komponen gula
2. Komponen Fosfat
3. Komponen Basa organik
 GENETIKA M.O.
Komponen Nukleotida
1. Gula
1.Deoksiribosa = D.N.A 2. Ribosa = R.N.A
0 0

5 OH 5 OH
OH CH2 OH CH2
1 1
4 4 H H
H H
3 2 3 2
OH H OH OH
 GENETIKA M.O.
Komponen Nukleotida (lanjutan)
2. Fosfat
0
Berikatan dengan
O P 0 Gula pada Atom
C ke 5 dan pada
O gugus OH- dr
nukleotida yg lain
 GENETIKA M.O.
Komponen Nukleotida (lanjutan)
3.Basa
organik
1.Purin : 2.Pirimidin :
Adenin (A) Citosin (C)
Guanin (G) Timin (T)
Urasil (U)

DNA : A G C T - UNTAI GANDA

RNA : A G C U - UNTAI TUNGGAL
 GENETIKA M.O.
Susunan molekul Asam Nukleat
1. Back bone : molekul Gula & PO4
2. Molekul Basa : terikat pada Gula
3. Terdapat polaritas 5 ke 3
Ujung 5 memp. gugus PO4
Ujung 3 memp. gugus OH bebas
 GENETIKA M.O.
Cara Terbentuknya Untai Ganda dari
molekul DNA :
1. Back bone di luar untai Gula dan
Fosfat
2. Basa di dalam untai
Basa Purin Basa Pirimidin
A T
G C
 GENETIKA M.O.
Cara Terbentuknya Untai Ganda dari molekul
DNA : (lanjutan)

3. Dua untai tunggal yang anti pararel arah 5 ke

3 berlawanan
5 3
3 5
5 3
A G C T T A G C C T A G

T C G A A T C G G A T C
3 5
 GENETIKA M.O.
REPLIKASI

Proses Sintesis
DNA baru dengan
menggunakan
DNA lama
sebagai templat
(cetakan)
 GENETIKA M.O.
REPLIKASI

Replikasi membutuhkan :
* Basa-basa : - d ATP - d GTP
- d CTP - d TTP
* Primer
* Templat DNA
* DNA polimerase (bekerja bila ada 3
OH bebas) dan DNA ligase
 GENETIKA M.O.
BACTERIAL CHROMOSOME REPLICATION
 GENETIKA M.O.
Proses Replikasi :
1. Denaturasi lokal ( pemisahan dari
2 untai pada ORI = Origin of
Replication )
2. Polimerisasi DNA (penambahan
basa)
3. Arah 5 ke 3
4. Penambahan basa dikatalisis oleh
DNA polimerase
 GENETIKA M.O.
Proses Replikasi : (lanjutan)
5. Untai yg baru dihasilkan disebut
Leading dan Lagging Strand
(fragmen OKAZAKI).
6. Tahap akhir dilakukan penyambungan
celah diantara basa-basa dengan
enzim DNA ligase
7. Proses Replikasi bersifat SEMI-
KONSERVATIF(1 untai induk, 1 untai baru dbentuk)
 GENETIKA M.O.
Transkripsi
Proses sintesis mRNA
dengan menggunakan
DNA sebagai templat
(cetakan)

RNA t.d. 3 macam :

1. mRNA : berfungsi mem-bawa
informasi genetik dr DNA,
templat pd proses sintesis
protein
2. tRNA : berperan mentransfer
AA pd sintesis protein
3. rRNA : komponen struktur dr
Ribosom
 GENETIKA M.O.
Transkripsi
Membutuhkan :
* DNA sebagai templat (untai sense, pengkode protein)
* Enzim RNA polimerase (t.d. FAKTOR SIGMA, yg mengenali
daerah promotor pd DNA sbg inisiasi transkripsi; CORE
ENZIM ( , , dan )
* Promotor : Tempat pd DNA utk inisiasi
+ urutan - 10 pb (pribnow box TATAAT) &
+ urutan -35 pb (TTGACA)
* Terminasi transkripsi yi : terbentuk stem-loop structure yg
dikuti UUUU, atau urutan kaya GC diikuti kaya AT
* Memp. Protein regulator (aktivator, represor & terminator) ->
bekerja pd RNA polimerase
 GENETIKA M.O.
Proses Transkripsi :
- Eukariot : transkripsi di nukleus
translasi di sitoplasma
Prokariot : transkripsi & translasi di
sitoplasma
- Faktor sigma akan mengenali promotor pd
DNA, lalu Core Enzim mulai mensisntesis
mRNA, biasanya dimulai pada basa Purin
( A atau G)
- Proses sintesis selesai bila sampai urutan
 GENETIKA M.O.
TRANSLASI

Membutuhkan :
* mRNA pembawa pesan yg dikodenya
* Ribosom : memp. 2 situs tempat pengikat
tRNA (situs A dan P)
Ribosom t.d. 2 sub unit (30S dan 50S)
* tRNA membawa asam amino yang sesuai
dengan kode yang dibawa mRNA
* Enzim peptidil transferase
 GENETIKA M.O.
PROSES TRANSLASI
menggunakan informasi urutan basa nitrogen
dr mRNA utk menyusun urutan AA suatu
protein (segmen 3 basa pd mRNA : CODON)
1. Inisiasi -> kompleks inisiasi t.d. ribosom unit
30S, mRNA (codon AUG), tRNA (membawa AA
Met.) dan baru bergab. Ribosom unit 50S
2. Elongasi -> Ribosom terus bergerak pd mRNA,
tRNA datang membawa AA yg sesuai, terjadi
ikatan peptida diantara AA, tRNA yg kosong
dilepas, demikian seterusnya sp pada kodon
terminasi
 GENETIKA M.O.
PROSES TRANSLASI (lanjutan)
3. Terminasi -> bila sampai pada kodon
terminasi (UAG) terjadi pelepasan
ribosom, tRNA dan mRNA ->
Asam-asam amino sesuai dgn
informasi yg dibawa mRNA dihasilkan,
akhirnya membentuk protein yg
fungsional
4. Protein ini merupakan enzim yang
berfungsi dalam metabolisme dan
Reproduksi
GENETIKA M.O.
 GENETIKA
KODE GENETIK
M.O.
* Merupakan hubungan antara urutan basa nitrogen
DNA, codon mRNA dan asam amino

* Terdapat 64 codon tapi hanya mengkode 20 asam

amino (1 asam amino dpt dikode oleh bbp codon) -
> disebut DEGENERACY OF CODE

* 61 merupakan SENSE CODON (mengkode AA)

3 merupakan : NONSENSE CODON (mengakhiri
translasi) -> TERMINATOR CODON (UAA, UAG,
UGA)
* INISIATOR CODON -> adalah UGA mengkode N-
formil methionin -> memulai sintesis protein
 GENETIKA M.O.
VARIASI GENETIK
Terjadi krn : 1. Mutasi
2. Transfer genetik

1. MUTASI
suatu perubahan dlm kharakteristik khusus dr
m.o. akibat perubahan urutan basa dari
material yg diturunkan

* Sel yg membawa perubahan disebut MUTAN

* Induksi dr mutasi disebut MUTAGENESIS
* Zat yg terlibat dlm proses ini adalah MUTAGEN
 GENETIKA M.O.
Mekanisme Mutasi :
1. Spontaneous mutation :
- alamiah
- kesalahan replikasi
2. Induksi oleh mutagen :
- Chemical mutagens : acridin,
5 - bromouracil, HNO3
- Physical mutagens : radiasi
U.V., X--ray
 GENETIKA M.O.
PENGARUH MUTASI PADA KODE GENETIK
bergantung pada mutasinya.

Macam..macam Mutasi :

A. Point Mutasi
B. Frameshift Mutasi

A. POINT MUTASI Hanya 1 atau

beberapa nukleotida termutasi dengan
cara Substitusi
 GENETIKA M.O.
Akibat Point Mutasi :

1. Silent Mutasi tak ada efek ok tak

ada perubahan asam amino
2. Missence Mutasi terjadi perubahan
shg AA yg dihasilkan berbeda, kurang
berfungsi
3. Nonsense Mutasi - terbentuk urutan
terminasi, terjadi terminasi prematur
dr sintesis protein, protein tak
lengkap
 GENETIKA M.O.
B. FRAMESHIFT MUTASI ->
Bila terjadi Delesi atau Insersi satu
basa menyebabkan reading
frameakan bergeser satu basa,
sehingga daerah sesudah mutasi
akan membentuk AA yg baru dan
biasanya menghasilkan poli-
peptida yang tak berfungsi
* Mutasi dapat menyebabkan
perubahan fenotip didalam sel
 GENETIKA M.O.
2. TRANSFER DNA
Terjadi transfer gen dari donor DNA ke
resepien DNA -> Pertukaran yang
terjadi disebut REKOMBINASI (hanya
pada urutan yang homolog)

Mekanisme Transfer DNA :

1. Transformasi DNA bebas
2. Transduksi bantuan faga
3. Konjugasi kontak antar sel
GENETIKA M.O.
1. Transformasi
GENETIKA M.O.
2. Transduksi
GENETIKA M.O.
3. Konjugasi
 GENETIKA M.O.
PLASMID

* adalah elemen genetik , DNA untai

ganda, sirkuler, superkoil, otonom,
* Ukuran 1 1000 kb, dalam sel tdpt
sekitar 100 plasmid, mengandung 1
100 gen
* Dapat dipindah secara konjugasi
atau dapat berintegrasi ke dalam
khromosom
 GENETIKA M.O.
Plasmid ada 2 macam :
A. Konjugatif ada gen utk
pilus -> konjugasi
B. Non-konjugatif tak ada gen
pembentuk pilus shg transfer
gen hanya mel. transformasi
atau transduksi
 GENETIKA M.O.
Kharakteristik yg dihubungkan dgn plasmid:
1. R Plasmid -> resistensi thdp Antibiotik
2. Resisten logam berat
3. Determinan virulensi penentu virulensi
shg dapat menyebabkan infeksi,
mungkin mengkode produksi toksin
4. Pembentukan Colisin dan Bacteriocin -
antibakteri
5. Aktifitas metabolik merubah kemampuan
fermentasi
 GENETIKA M.O.
GENETIC ENGINERING (REKAYASA
GENETIKA) dan DNA REKOMBINAN

* DNA Rekombinan -> berhubungan dengan

pembentukan molekul DNA dari sumber
yang berbeda

* Teknologi DNA Rekombinan disebut

Rekayasa Genetika (Genetic
Enginering)

* Perkembangan DNA Rekombinan terjadi

ok ditemukannya enzim Restriksi
 GENETIKA M.O.
PROSES DNA REKOMBINAN

Dasarnya :

1. Mengambil gen yg diminati secara spesifik dr

donor -> menggabungkannya dgn DNA
(vektor) yg mampu bereplikasi dan dapat
dimasukkan ke dalam sel dan diberi tanda
agar keberadaannya dpt dik -> pBR322,
bakteriofaga dan kosmid

2. Menyediakan lingkungan shg gen tsb dapat

bereproduksi dlm jumlah besar -> Kloning
 GENETIKA M.O.
* Metoda memperbanyak DNA
secara invivo -> Kloning
gen konvensional
* Metoda memperbanyak DNA
secara invitro -> Polimerase
Chain Reaction (PCR)
 GENETIKA M.O.
PCR (Polymerase Chain reaction)
Bahan :
- Templat untai ganda (+ DNA target)
- Enzym DNA polimerase
- Nukleosida trifosfat
- Sepasang primer oligonukleotida
( disintesis dengan alat DNA
synthesizer ) berfungsi menyediakan
gugus OH- bebas pada karbon 3
 GENETIKA M.O.
Tahapan PCR
1.Denaturasi ( 90 - 950 C )
2.Annealing ( pemanjangan primer ) ( 37 -
600 C )
3.Polimerisasi ( 25 - 30 x ) ( 720 C )
setiap siklus terjadi amplifikasi 2x,
yang baru menjadi template, setelah
siklus 30 x didapat 106 - 109 x
jumlah DNA target awal
 GENETIKA M.O.
Aplikasi genetik
1. In Vivo Tecnology

Produksi industri -> Protein,

Penisillin, Lisin, Glutamic dll
Perkembangan strain -> Generation,
Selection, Genetic Exchange,
Productie Primary metabolites
 GENETIKA M.O.
2. In Vitro

- Gene Libraries Genom,

Screening, Kontruksi gen
- Expresi vektor
- Live rekombinant vaccine -
Hepatitis B vaccin
 GENETIKA M.O.
Diagnostik :

1. PCR : Salmonella, TBC,

Chlamydia dll mem
butuhkan primer
2. Gene probes
3. Finger printing gen
4. Human genetik diseases
5. Gen therapy