Nukleosida:

Basa purin / pirimidin +

ribosa/deoksiribosa

Nukleotida:
Basa purin / pirimidin +
ribosa/deoksiribosa + fosfat
Esterifikasi terjadi antara ggs OH
pada C-5 ribosa/deoksiribosa dengan
ggs fosfat
Nukleosida monofosfat contoh: AMP
= Adenosin 5monofosfat
Nukleosida difosfat contoh: ADP
Nukleosida trifosfat contoh: ATP
 Rangkaian nukleotida, contoh:
A C G

3 3 3

P P P OH

5 5 5
Trinukleotida : 5 - A-C-G- 3
pApCpG
ACG
Urutan basa ditulis dari 5 -3
 Pembentukan asam nukleat
RNA
ATP, UTP, GTP, CTP
RNA polimerase

RNA

DNA
dATP, dTTP, dGTP, dCTP
DNA polimerase

DNA
 DNA RNA
T.d. 2 utas rantai T.d. 1 utas rantai
polinukleotida yang polinukleotida
membentuk struktur
double-helix

5 3

A T G C

T A C G
3 5

antiparalel
 DNA RNA
2 utas double t.d. 1 utas rantai
helix polinukleotida

A T G C A U G C
pur pir pur pir

Rantai lebih panjang Rantai lebih pendek

Deoksiribosa Ribosa.
Ikatan Hidrogen
A T

G C
Hukum berpasangan
.
 RNA dan DNA
.
 RNA
mRNA = messenger RNA
berisi kodon-kodon asam amino yang akan
dirangkai
tRNA = transfer RNA
Berbentuk seperti daun semanggi
Mempunyai bagian yang disebut antikodon
yang berpasangan dengan kodon asam amino
yang dibawa
Bertugas membawa a.a yang akan dirangkai
rRNA = ribosomal RNA
Komponen ribosom
 EKSPRESI GEN

.
 EKSPRESI GEN
GEN --- mRNA --- polipeptida/ protein
TRANSKRIPSI TRANSLASI

Upstream Downstream
DNA 5 ------ ACTGCC ------ 3 utas coding
3 ------ TGACGG ------ 5 utas cetakan
mRNA 5 --- ACUGCC --- 3
tRNA 3-- UGA -- 5 (bgn antikodon)
Thr (a.a yg dibawa)
 Utas coding = utas sense
Urutan nt di sini menentukan urutan a.a pada
rantai polipeptida yang dibentuk.
Kode genetik: 1 a.a dikode oleh urutan 3 nt
Urutan basa N dibaca dari 5-3
Utas template = utas cetakan
Sebagai utas cetakan bagi pembentukan mRNA

mRNA
Sesuai hukum berpasangan apabila di utas
cetakan tertulis A maka pada utas mRNA
tertulis U, apabila tertulis G maka pada utas
mRNA tertulis C
Urutan basa N dibaca dari 5-3
Satu kodon t.d 3 nt 1 asam amino
 Gen: suatu segmen DNA yang berisi informasi/
kode genetik urutan asam amino dari suatu rantai
polipeptida / protein
Gen: terdapat pada rantai DNA
Peta gen: menunjukkan letak gen pd rantai DNA

mRNA:
Urutan kodon (kode genetik pada mRNA)
menentukan urutan a.a yg akan dirangkai
Satu kodon terdiri dari 3 nukleotida (triplet)

Kode genetik bersifat hampir universal

Universal berarti kodon yang sama berlaku
untuk asam amino yang sama pada semua
mahluk hidup
 .
 Total ada 43 = 64 kodon
3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon
terminasi
Kodon inisiasi: AUG
(sebagian kecil organisme GUG)
Jumlah asam amino dasar penyusun
protein : 20, jadi banyak asam amino
yang punya lebih dari 1 kodon
Kodon pada mRNA akan dikenali oleh
antikodon pd tRNA yang akan
membawa asam amino yang sesuai
dengan kodon tersebut untuk dirangkai
 mRNA urutan kodon
.
 Transfer RNA (tRNA)

.
Organisme dg materi genetik RNA
Terdiri dari beberapa macam virus
yang :
Tidak pernah mentranskripsikan materi
genetik ke molekul DNA
Dapat mentranskripsikan materi
genetik ke dsDNA (cDNA)
E.reverse transkriptase
Diintegrasikan ke genom inang

acuan ekspresi gen RNA virus yang baru

 MUTASI

.
MUTASI PADA TINGKAT GEN
Substitusi
Insersi (1 atau lebih)
Delesi (1 atau lebih)
 MOLEKUL DNA EUKARIOT
Sebagian besar di inti (dalam kromosom)
DNA terikat protein kromatin
+ DNA
+ Histon
+ Protein non histon
+ RNA (sedikit)

Di dalam mitokhondria (mengandung sedikit

gen)
Tidak mengandung histon,
Berbentuk sirkuler
 rRNA prokariota

3 spesies rRNA :

rRNA 23 S
sub unit ribosom 50 S
rRNA 5 S

rRNA 16 S sub unit ribosom 30S

S (Svedberg) : koefisien sedimentasi

PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
hn RNA (Eukariot)
PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
Capping
PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
.
REKOMBINASI KROMOSOM
PERLU PENJAJARAN KROMOSOM HOMOLOG
Organisme dg materi genetik RNA
Terdiri dari beberapa macam virus
yang :
Tidak pernah mentranskripsikan materi
genetik ke molekul DNA
Dapat mentranskripsikan materi
genetik ke dsDNA (cDNA)
E.reverse transkriptase
Diintegrasikan ke genom inang

acuan ekspresi gen RNA virus yang baru

PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
.
 JENIS MOLEKUL RNA
Messenger RNA (mRNA)
Transfer RNA (tRNA)
Ribosomal RNA (rRNA)
Pada eukariota juga ada :
snRNA (small nuclear RNA)

berperan pada proses splicing

 Messenger RNA (mRNA)
Acuan (template) untuk sintesis protein
Berfungsi meneruskan informasi genetik
dari gen (DNA).
Berisi instruksi dlm penyusunan asam
amino
mRNA eukariot :
Ujung 5 ada topi 7 mGTP
Ujung 3 ada ekor poli A (20 200 A),
kecuali mRNA histon
 Transfer RNA (tRNA)

Membawa aa aktif ke ribosom untuk

dirangkai menjadi rantai polipeptida
sesuai urutan pada mRNA
Minimal ada 20 jenis tRNA
Adaptor, memp. tempat spesifik
untuk :
mengikat aa
Mengenal nukleotida pada mRNA
 Transfer RNA (tRNA)
Terdiri dari 70 90 nukleotida
Berbentuk daun semanggi
Ujung 3 : CCA
Gugusan OH atom C-3 adenosil
berikatan ester dg gugusan
karboksil asam amino
Banyak mengandung basa yang tidak
umum pada RNA (inosin, ribotimin,
pseudourasil, dihidrourasil)
 Transfer RNA (tRNA)

Lengkung dihidrourasil (DHU) :

Pengenalan thd enzim aminoasil-tRNA
transferase
Lengkung antikodon :
Pengikatan dengan kodon (pada mRNA)
Lengan ekstra
Lengkung ribotimin-pseudourasil-sitosin
(TC) :
Pengikatan tRNA dengan ribosom
Ujung 3 : CCA
 EKSPRESI GEN

.
Aktivasi dan pengikatan asam
amino pada tRNA
Terjadi di sitosol
E.aminoasil-tRNA sintetase
2 tahap :
Pengaktifan asam amino
Perlu ATP
Pengikatan aminoasil AMP ke tRNA
Terbentuk aminoasil tRNA (charge tRNA)
 TRANSLASI

Perubahan bahasa dari urutan

nukleotida dari mRNA menjadi urutan
asam amino polipeptida
Lokasi : ribosom
Cetakan / template : mRNA
Pembawa asam amino ke ribosom :
tRNA
 TRANSLASI

Terdiri dari 3 tahap :

Tahap inisiasi
Tahap elongasi
Tahap terminasi
TRANSLASI
 Tahap inisiasi translasi

Pengikatan faktor inisiasi

(IF1,IF2,IF3) ke ribosom sub unit
kecil
Pengikatan mol.charge tRNA dan
mRNA ke ribosom sub unit kecil
Pembentukan kompleks inisiasi 70S
 Tahap elongasi translasi

Pengikatan aminoasil tRNA

Pembentukan ikatan
peptida
Translokasi
PEMBENTUKAN IKATAN PEPTIDA
.
TAHAP ELONGASI TRANSLASI
.
 KODE GENETIK
Terdapat di mRNA
Mengkode spesifisitas asam amino
penyusun protein
Terdiri dari 3 nukleotida (triplet)
kodon
Total ada 64 kodon
3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon
terminasi
Hampir universal
Akan dikenal oleh antikodon pd tRNA
TAHAP TERMINASI TRANSLASI
Situs A ditempati stop kodon
Tak ada tRNA yang mengenali stop
kodon
Situs A ditempati release factor
Memicu pelepasan polipeptida dari
peptidil tRNA, pemecahan secara
hidrolitik
Kompleks ribosom pecah menjadi
komponen semula
TAHAP TERMINASI TRANSLASI
.
 POLISOM

.
 PEMATANGAN PROTEIN
Dapat terjadi :
Pelepasan ggs N-formil pada ujung
amino
Pelepasan metionin
Pemutusan rantai polipeptida
Reaksi oksidasi
Reaksi hidroksilasi
Pembentukan ikatan disulfida
Dan lain-lain
 INHIBITOR SINTESIS PROTEIN
PADA PROKARIOT
ANTIBIOTIK CARA KERJA
A
Streptomisin Berikatan dg subunit ribosom 30S
shg menghambat inisiasi dan
menyebabkan salah baca mRNA
Tetrasiklin Berikatan dg subunit ribosom 30S
dan menghambat pengikatan
aminoasil tRNA
Kloramfenikol Berikatan dg subunit ribosom 50S
dan menghambat aktivitas
INHIBITOR SINTESIS PROTEIN
PADA PROKARIOT DAN EUKARIOT

INHIBITO CARA KERJA

R
Puromisin Analog aminoasil-tRNA, shg
terjadi terminasi dini
Actinomisin D Mengikat DNA dan
menghambat gerakan RNA
polimerase, shg mencegah
transkripsi
Mitomisin Terjadi iktan kovalen antara 2
INHIBITOR SINTESIS PROTEIN

PADA EUKARIOT

Sikloheksimid

menghambat aktivitas
peptidil transferase
ribosom sub unit 60 S