Anda di halaman 1dari 49

Biokimia

Biokimia adalah ilmu yang mempelajari


struktur, organisasi, dan fungsi materi
hidup pada tingkat molekul.
Pembagian kajian biokimia

Struktur &
Fungsi Biomolekul

Informasi
Metabolisme Genetika
BIOKIMIA II
Metabolisme :
Tinjauan umum - Metabolisme asam
metabolisme dan amino
Bioenergetika - Metabolisme asam
Metabolisme Karbohidrat nukleat
Glikolisis Jalur Informasi Genetik:
Glukoneogenesis Gen dan Khromosom
Glikogenolisis Replikasi
Glikogenesis Transkripsi
Daur TCA Translasi
Fosforilasi Oksidatif Regulasi ekspresi gen
(Fotosintesis)
Metabolisme Lipid
Oksidasi asam lemak
Biosintesis Lipid
Tinjauan Umum Metabolisme

Dr. Heni Yohandini, MSi


Metabolisme

Metabolisme adalah keseluruhan perubahan


kimia (proses) dimana system hidup
(sel/organisme) memerlukan dan
menggunakan energy bebas untuk
melakukan berbagai fungsi.
Jalur metabolik adalah serangkaian reaksi
yang dikatalisis enzim yang menghasilkan
produk tertentu.
Fungsi Metabolisme

Memperoleh energi kimia


melalui penangkapan energi
matahari atau degradasi bahan
makanan yang kaya energi dari
lingkungan
Mengubah molekul nutrien
menjadi molekul yang khas dari
sel, termasuk prekursor
makromolekul
Fungsi Metabolisme

Polimerisasi prekursor monomerik menjadi


makromolekul: protein, asam nukleat, dan
polisakarida;
Sintesis dan degradasi biomolekul yang
diperlukan untuk fungsi seluler tertentu,
seperti lipid membran, messenger intra sel,
dan pigmen.
Penggolongan Jalur Metabolisme

Jalur anabolisme: biosintesis senyawa yang


lebih besar dan kompleks dari prekursornya
Jalur katabolisme: penguraian molekul besar,
sering melibatkan reaksi oksidatif,
menghasilkan produk akhir yang lebih
sederhana dan energy bebas (mis. ATP)
Jalur amfibolisme: penghubung antara jalur
anabolisme dan katabolisme, misalnya siklus
asam sitrat (daur TCA)
Tiga jenis jalur metabolic
non linier
Lima transformasi kimia yang
berlangsung di dalam sel
Transfer gugus fungsi
Oksidasi-reduksi
Penataan ulang
Pemotongan
Kondensasi
Transfer gugus fungsi
Oksidasi-reduksi
Penataan ulang
Pemotongan
Kondensasi
Jalur pemroses produk utama
pencernaan

Produk pencernaan:
- Karbohidrat glukosa
- Lipid asam lemak dan gliserol
- Protein asam amino
Semua produk pencernaan dimetabolisme
menjadi suatu produk umum, yaitu asetil-KoA,
yang kemudian dioksidasi di siklus asam sitrat
BIOENERGETIKA

Dr. Heni Yohandini, MSi


APA ITU BIOENERGETIKA?

Disebut juga termodinamika biologis


(Greek: bios = life and logikos = reason +
Greek: thermos = heat and dynamics =
power)
Bioenergetika adalah ilmu tentang
perubahan energi yang menyertai reaksi
biokimia
HUKUM TERMODINAMIKA

1. Energi total suatu sistem, termasuk


lingkungannya, tetap konstan
2. Entropi total suatu sistem harus meningkat
jika suatu proses terjadi secara spontan
Entropy adalah tingkat kekacauan atau
ketidakteraturan sistem dan menjadi
maksimal ketika mendekati kesetimbangan
PROSES ENDERGONIK BERLANGSUNG DENGAN
MENGAITKANNYA PADA PROSES EKSERGONIK
Bagaimana mahluk hidup
memperoleh energi bebas?

Phototroph memperoleh energi bebas dari


matahari melalui fotosintesis, proses dimana
energy cahaya menggerakkan reaksi
endergonic CO2 dan H2O membentuk
karbohidrat dan O2.
Chemotroph memperoleh energi bebasnya
dengan mengoksidasi senyawa-senyawa
organik (karbohidrat,lipid, protein) yg
diperoleh dari organisme lain.
Energi bebas tsb paling sering dikopling
dengan reaksi endergonic melalui sintesis
intermediet senyawa fosfat berenrgi tinggi
seperti ATP
Untuk dioksidasi secara sempurna, nutrient
dipecah dalam serangkaian reaksi metabolic
menjadi intermediet-intermediet lain, yang
digunakan sebagai precursor pada sintesis
molekul biologis lain
ATP atau adenosine triphosphate berperan penting
dalam transfer energi bebas dari proses eksergonik
ke endergonik
Energi dilepaskan melalui pemutusan gugus fosfat (Pi)
atau pirofosfat (PPi) dari ATP, pada kondisi terhidrasi:

ATP + H2O ADP(hydrated) + Pi(hydrated) + H+(hydrated)


G = -30.54 kJ/mol (7.3 kcal/mol)

ATP + H2O AMP(hydrated) + PPi(hydrated) + H+(hydrated)


G = -45.6 kJ/mol (10.9 kcal/mol)
Pelepasan energi yang besar menyebabkan
dekomposisi of ATP dalam air sangat
eksergonik sehingga dapat berfungsi
sebagai penyimpan energi kimia
Energi bebas standar pada hidrolisis organofosfat yang
penting secara biokimia
FOSFAT BERENERGI TINGGI

Berperan dalam peredaran energi pada sel


Fosfat berenergi tinggi dilambangkan
dengan ~ P
simbol ~ P menunjukkan bahwa gugus
yang terikat, ketika ditransfer ke akseptor
yang sesuai, akan menyebabkan
pemindahan energi bebas dalam jumlah
besar
Sumber utama ~ P yang ikut serta
dalam konservasi energi

Fosforilasi oksidatif
Glikolisis
Daur TCA (asam sitrat)
ATP memungkinkan penggabungan reaksi yang
secara termodinamika kurang menguntungkan
dengan reaksi yang menguntungkan

Fosforilasi glukosa menjadi glukosa 6-fosfat,


reaksi pertama glikolisis sangat endergonik
dan tidak dapat berlangsung pada kondisi
fisiologis
Agar dapat berlangsung, reaksi harus
digabungkan dengan reaksi lain yang lebih
eksergonik seperti reaksi hidrolisis fosfat
terminal pada ATP
Jika (1) dan (2) digabungkan dalam suatu
reaksi yang dikatalisis oleh hexokinase,
fosforilasi glukosa mudah berlangsung dalam
reaksi yang sangat eksergonik dan bersifat
ireversibel dalam kondisi fisiologis
Banyak reaksi aktivasi" mengikuti pola ini.

Anda mungkin juga menyukai