- Acides amins
- Peptides
II Proprietes generales
CH 2 CH COO-
PM 110 Da NH3+
Fonction amine
B ISOMERIE OPTIQUE
Les aa naturels sont de la srie L
COO- COO-
H3N+ C H H C H3N+
CH3 CH3
L-Alanine D-Alanine
C Spectre dabsorption des aa
- UV: < 230 nm
- Sauf les aa aromatiques, = 260 ou 280 nm
Absorption Trp
Tyr
Phe
pKR variable
pKa 2
CH 2 CH COOH
+
NH 3
pKb 9,5
Point isolectrique (pHi) =
pH pour lequel laa en solution
tamponne a une charge nette
nulle
Courbe de titration dun acide amin
monoamin et monocarboxylique
pH = pKb 9,5
pH 50% de Z
50% de A- COO
-
R CH
A-
pKb
NH2
Z -
COO pHi, 100% de Z
pHi 6 R CH
NH3+
pKa + pKb
pHi =
2
pKa
COOH
R CH
Equivalents OH-
A+ NH3+
pH = pKa 2
50% de Z
50% de A+
III - Les 20 aa entrant dans la
composition des proteines
Alanine Valine
Ala Val
COO- COO-
CH3
H C CH3 H C CH
NH3+ CH3
NH3 +
Leucine
Isoleucine
Leu
Ile
COO- CH3 COO-
CH3
H C CH2 CH H C *CH CH2 CH3
NH3+ CH3 NH3+
Methionine
COO- Met
H C CH2 CH2 S CH3
NH3+
COO-
Phnylalanine
H C CH2
Phe
NH3+
Phnyle
COO- Tryptophane
H C CH2 Trp
NH3+
N
H Indole
B - Chane latrale polaire mais
non charge
Tyrosine, Tyr
COO-
H C CH2 OH
NH3+
Noyau phnol
pKR 10,5
COO-
H C CH2 OH Srine
Ser
NH3+
COO-
H C CH CH3 Thronine
NH3+ OH
Thr
Asparagine, Asn, N
COO- O
H C CH2 C amide
NH2
NH3 +
Glutamine, Gln
COO- O
CH2 CH2 C amide
H C
NH2
NH 3
+
Cystine, Cys
COO- CH2
CH2
Oxydation
H C CH2 SH S
SH
NH3+ Thiol S
SH
Rduction CH
2
CH2
C - chane latrale polaire charge
- AA basiques : Lys, Arg, His
12,5 pKR
10,5 pHi
9 pKb
1,8 pKa
Equivalents OH-
COOH
pKa = 1,8
- Imidazole
COO
N
H C CH2
N pKR = 6
NH3 +
H
pKb = 9,3 NH
NH2 N +
H
pKb + pKR
pHi = 7,6
2
- AA acides : Asp, Glu
Acide aspartique, Asp
COOH pKa + pKR
pKa = 2 pHi = 2,8
COO- 2
H C CH2 COO-
pKR = 3,9
NH3 +
NH2
IV Autres acides amins
- AA prsents seulement dans
certaines protines
- Ornithine, citrulline
H CH CH2 CH2 COO- GABA
NH3+
V Methodes dtude
des acides amins
A Electrophorse : sparation par
diffrence de pHi
2) Migration pH constant ( 6)
3) Coloration (ninhydrine)
B Chromatographie liquide
Une phase stationnaire + 1 phase mobile liquide
Colonne
(phase stationnaire)
Absorbance
Photomtre
UV Volume dlution
Enregistreur
(chromatogramme)
Collecteur
(rcupration
de lluat dans des tubes)
Les aa se dcrochent
- lorsque le pH atteint leur pHi
(et/ou lorsquils schangent
avec Na+)