Anda di halaman 1dari 11

STUDI IN SILIICO SENYAWA ALLISIN DARI UMBI BAWANG PUTIH

(Allium sativum L.) PADA RESEPTOR PPAR-γ SEBAGAI ANTIDIABETES

DISUSUN OLEH DOSEN PEMBIMBING


PRAKTIKUM KIMIA MEDISINAL
OKTIA NUR FALUPY 14040041
DINA PRATIWI, S.FARM., M.Si
MA’SUM 16046905
LATAR BELAKANG
Diabetes Melitus

Prevalensi penyakit Diabetes


Militus mengalami peningkatan

Diabetes Melitus

Antidiabetes Sintetik/Kimia
Antidiabetes Sintetik/Kimia

Antidiabetes Tradisional

Umbi Bawang Putih

Senyawa Allicin

Metode Molecular docking


TUJUAN
1. Untuk mengetahui nilai skor docking senyawa
allisin terhadap reseptor PPAR-γ.

2. Untuk mengetahui kekuatan senyawa allisin


dapat berinteraksi pada reseptor PPAR-γ
dibanding dengan senyawa Thiazolidinedione.
TINJAUAN PUSTAKA
Diabetes Melitus Antidiabetes
Diabetes melitus (DM) 1. Terapi Insulin
didefinisikan sebagai suatu penyakit
atau gangguan metabolisme kronis 2. Obat Antidiabetes Oral
yang ditandai dengan tingginya a. Golongan sulfonilurea
kadar glukosa darah disertai dengan
gangguan metabolisme karbohidrat, b. Golongan Biguanida
lipid dan protein sebagai akibat c. Golongan Meglitinid
gangguan sekresi insulin oleh sel-sel d. Golongan Tiazolidindion
β Langerhans kelenjar pankreas,
aksi insulin terhadap jaringan target
yang mengakibatkan insensitivitas
sel terhadap insulin, ataupun
keduanya.
METODOLOGI PENELITIAN
Alat Bahan
1. Perangkat Keras Komputer 1. Senyawa Uji
Laptop Lenovo dengan CPU intel (R) Senyawa uji yang digunakan yaitu
senyawa allisin dari umbi bawang
Pentium (R) P6200 2,13 GHz, RAM 4 GB, putih (Allium sativum) dan
Windows 7 32-bit Operating System. thiazolidinediones sebagai obat
pembanding.
2. Perangkat Lunak Komputer
Chem office 2004 (ChemDraw dan 2. Reseptor
Chem 3D Ultra). Kemudian dilakukan Data struktur 3D kristal reseptor
yang digunakan untuk analisis
optimasi geometri menggunakan molecular docking diperoleh dari
hyperchem versi 8.03 dengan metode semi Protein Data Bank (PDB) dengan situs
empirik (PM3). Proses preparasi ligan dan http://www.rcsb.org/pdb/. Reseptor
reseptor docking dilakukan menggunakan yang digunakan untuk memprediksi
Autodock 2.4.6, Autodock Tools, aktivitas antidiabetes yaitu reseptor
OpenBabel, Command Prompt. PPAR-γ dengan kode PDB 2PRG.
Cara Kerja
Pencarian Ligan dan Reseptor

Validasi Reseptor

Preparasi Ligan

Proses Docking, Analisa dan


Visualisasi Hasil
HASIL Senyawa Thiazolidinedione Allicin

Energi bebas ikatan (kcal/mol) -8.03 -4.53

Ki 1.30 uM 477.63 Um

285CYS 285CYS

286GLN

288ARG

289SER

323HIS

326ILE 326ILE

327TYR
Residu
330LEU

339VAL

340LEU

341ILE

363PHE 363PHE

364MET

449HIS
PEMBAHASAN
Hasil docking senyawa allicin dengan PPAR- γ
menghasilkan energy bebas ikatan tertinggi yaitu sebesar
-4.53 kkal/mol. Residu asam amino yang sama yang
berdekatan dengan senyawa allicin dan Thiazolidinedione
pada reseptor Peroxisome Proliferator – Activated
Receptor – Gamma yaitu CYS285, ILE326, serta PHE363.
Energi bebas ikatan yang pada senyawa allicin -4.53
kkal/mol dengan Ki (konstan inhibisi) 477.63 µM, nilai ini
lebih tinggi jika dibandingkan dengan Thiazolidinedione
yang menghasilkan nilai energi bebas ikatan -8.03
kcal/mol dengan Ki 1.30 µM.
Semakin tinggi nilai Ki maka konsentrasi senyawa yang
dibutuhkan untuk menghambat aktivitas reseptor
semakin tinggi sehingga energi yang dibutuhkan juga
semakin besar. Senyawa allicin memiliki satu ikatan
hidrogen pada reseptor Peroxisome Proliferator –
Activated Receptor – Gamma yaitu O dengan H pada
residu asam amino SER289 dengan jarak ikatan 2.109 Å.
Sedangkan pada senyawa Thiazolidinedione tidak
ditemukan adanya ikatan hidrogen.