 Begitu

sebuah lead ditemukan, penting untuk

memahami bagaimana persisnya fitur struktural
yang bertanggung jawab terhadap aktivitas biologi
 identifikasi “pharmacophore”
 Hal ini memungkinkan kita untuk merancang senyawa baru yang
lebih aktif
 Juga memungkinkan untuk menghilangkan gugus fungsi berlebihan,
sehingga mengurangi toksisitas dan biaya produksi bahan aktif.
 Hal ini dapat dilakukan melalui modifikasi sintetik.
 Contoh : R-OH dpat diubah menjadi R-OCH3 untuk melihat apakan
gugus O-H berperan penting dalam interaksi dengan target
 Contoh lain : R-NH2 dapat diubah menjadi R-NH-COR’ untuk
melihat apakah interaksi dengan muatan positif pada amina
terprotonasi merupakan interaksi yang penting.