BIOLOGI MOLEKULAR

Alfian Silvia Krisnasari,M.Sc

TRANSLASI
HOW DOES DNA
& RNA WORKS ?
Alur Genetika
tRNA

 Mengkopi Bagian Spesifik dari DNA

 Site Amino acid spesifik
 Anticodon
 Terlibat dalam translasi (sintesis
Protein)
rRNA

 Ribosom tersusun atas dua subunit

prokariot : 70S = sub unit 50S + 30S
eukariot : 80S = sub unit 60S + 40S
 Tiap subunit terdiri dari rRNA dan
protein
 Terlibat dalam translasi
Karakteristik Struktural tRNA dan mRNA.
KODON

 Kode
Triplet yang spesifik untuk
membentuk asam amino
 Terdapat pd mRNA
 20 asam amino
 Start kodon dan Stop kodon
 Copyright © The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display.

Second Base Position

U C A G
UUU
UUC } Phenylalanine
UCU
UCC
Serine
UAU
UAC
} Tyrosine
UGU
UGC } Cysteine
U
C
U
UUA
UUG } Leucine
UCA
UCG
UAA
UAG
} STOP**
UGA
UGG
STOP**
Tryptophan
A
G
CUU CCU CAU
} Histidine
CGU U
First Base Position

CUC CCC CAC CGC C

Third Base Position

C Leucine Proline Arginine
CUA
CUG
CCA
CCG
CAA
CAG } Glutamine
CGA
CGG
A
G
AUU
AUC
Isoleucine
ACU
ACC
AAU
AAC } Asparagine
AGU
AGC } Serine
U
C
A Threonine
AUA
AUG STARTfMethionine*
ACA
ACG
AAA
AAG } Lysine
AGA
AGG } Arginine
A
G

G
GUU
GUC
Valine
GCU
GCC
Alanine
GAU
GAC } Aspartic acid
GGU
GGC
Glycine
U
C
GUA
GUG
GCA
GCG
GAA
GAG } Glutamic acid
GGA
GGG
A
G

* This codon initiates translation.

**For these codons, which give the orders to stop translation, there are no corresponding tRNAs and no amino acids.
Gambaran Kodon dan pasangannya yang membawa asam amino
Sintesis PROTEIN
(translasi)

 Beberapa faktor yang terlibat dalam sintesis

protein
mRNA : kodon
tRNA : site asam amino dan site anti
kodon
Ribosom : site P & site A, large & small
unit
Interaksi ribosom, tRNA dan mRNA
 Copyright © The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display.

Interaksi kodon - anti kodon

Leucine

fMet 2

1
A
P
E 2
1

G AC G
Anticodon U AC CUG C CG
A UG
mRNA

Codon
UAG

(a) Entrance of tRNAs 1 and 2

INTERAKSI ANTARA KODON DENGAN ANTI KODON
Ketepatan sintesis protein ditentukan oleh dua system :
1. system ketepatan muatan asam amino pada tRNA
2. pasangan kodon-antikodon

Pasangan kodon-antikodon.
- 61 dari 64 kodon mengkode 20 asam amino, sehingga diharapkan ada 61
tRNA yang berbeda.
- Faktanya tRNAAla dari Yeast (ragi) dapat berpasangan dengan 3 dari 4 kodon
alanin (GCX) yaitu :
-GCU O
-GCC C N
-GCA H- N C
C-H
Antikodon tRNAAla tersebut adalah : 5’-IGC- 3’
H- C C
I = inosin adalah nukleosida ribosil hipoksantin N N

Ribosa
I dapat berpasangan U,C,A dengan ikatan hydrogen
tetapi tidak sekuat tipe Watson-Crick.
Tidak ada antikodon yg dimulai dg 5’A.
Setiap A muncul pd posisi pertama dr tRNA baru hasil transkripsi, A akan di-
deaminasi mjd hipoksantin (basa dr inosin).
Tahapan Sebelum Translasi (Preinisiasi):

: reaksi esterifikasi antara asam amino dg tRNA

Asam amino
tRNA

Aminoasil tRNA
 Tahapan TRANSLASI
Inisiasi :
 Ribosom sub unit kecil akan menempel pada
mRNA dekat dengan start codon (cth. AUG)
 Antikodon tRNA yang mengikat asam amino
pertama (inisiator) akan menempel pada start
codon
 Ribosom sub unit besar bergabung mbtk kompleks
inisiasi
 Tahapan TRANSLASI
Elongasi :
 Ribosom akan bergerak ke kodon berikutnya
(Translokasi), diikuti dengan tRNA (antikodon)
baru yang melekat pada kodon tersebut dan
menambahkan asam amino tersebut dengan asam
amino sebelumnya
 Ikatan asam amino yang terbentuk merupakan
ikatan peptida atau protein oleh enzim peptidil
transferase
Peptidil
transferase
 Tahapan TRANSLASI
Terminasi :
Stop codon menghentikan proses
translasi
Protein lepas dr mesin sintesis
Ribosom lepas dr mRNA &
terdisosiasi kembali
 Sintese Protein berakhir ketika salah satu dari ke tiga
penghentian codon dicapai. Suatu lokasi tidak dimasukkan
oleh suatu tRNA tetapi oleh suatu protein melepaskan
faktor.
 Bakteri mempunyai tiga faktor pelepasan : RF-1 yang
mengenali penghentian codon 5’-UAA-3’ dan 5’-UAG-3’,
RF-2 yang mengenali 5’-UAA-3’ dan 5’-UGA-3’, dan RF-3
yang merangsang pelepasan RF1 dan RF2 dari ribosome
setelah penghentian, di dalam suatu reaksi yang menuntut
energi dari hidrolisis GTP.
 Eukaryotes hanya mempunyai dua faktor pelepasan eRf-1,
yang mengenali penghentian codon, dan eRF-3, yang
mungkin berperan sama.
Proses Translasi.
Animasi protein synthesis
TRANSKRIPSI DAN TRANSLASI PADA
EUKARYOTA
 Mirip dengan Prokariot, kecuali :
 AUG mengkode methionin dengan bentuk yang
berbeda
 mRNA hanya mengkode satu protein (monosistronik)
 Transkripsi dan translasi tidak terjadi secara simultan
 Sebelum mRNA terbentuk terlebih dahulu berupa Pre-
mRNA yg terdiri dari :
 Introns (urutan RNA yang bukan merupakan penyandi genetik)
 Exons

 Untuk membentuk mRNA dari Pre-mRNA terjadi

Splicing (penghilangan intron).
Eukaryota vs Prokariot
 Transport protein

Transport protein dari ribosom

Ke organel atau sel target, garsi warna merah
membutuhkan signal sequence,
Garus warna hitam tidak membtuuhkan signal
sequence
Sinyal target polipeptida

Macam-macam signal sequence yang

terdapat pada beberapa protein yang akan
menuju ke retikulum endoplasma. (warna
kuning) merupakan residu asam amino
hidrofobik yang sebelumnya ada residu yang
bermuatan positif (warna biru). Dan dekat
dengan cleavage site (garis warna merah)
terdapat residu asam amino polar terutama
alanin dan glisin (Lehninger et al., 2000).
Transpor Protein menuju RE
Polipeptida
lepas
ke matriks
mitokondria
Nuclear Pore Complex
Transport protein ke Nukleus
Translokasi Protein ke peroksisom
Translokasi protein dari Badan Golgi ke
endosom
Transport protein RE ke Badan Golgi
PENGHAMBAT SINTESIS PROTEIN
OLEH ANTIBIOTIK
 Rifampisin : mengikat pada enzim
polimerase RNA bakteri dan
menghambat mRNA
 Eritromisin dan Azitromisin : mengikat
pada ribosome bakteri, dan
menghambat pelekatan pada mRNA.
 Tetrasiklin : mengikat pada ribosome
bakteri, dan menghambat translasi
mRNA
Analisis Central
Dogma