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Bioenergética, Metabolismo y

Regulación
Metabolismo
Actividad Celular altamente coordinada en el cual numerosos
caminos metabólicos cooperan para:

1) Obtener energía química


2) Convertir nutrientes en precursores
3) Sintetizar polímeros
4) Sintetizar y degradar biomoléculas
Características generales de la química del
metabolismo celular

• Alta diversidad de actividades químicas (¡De varios


cientos a algunos miles!)
• Altas tasas de conversión de sustratos
• Especificidad
• Interdependencia entre reacciones
Estrategias metabólicas

• El metabolismo mantiene concentraciones de


metabolitos intermedios y energía en un estado
estacionario

v1 v2
A S P

Si V1= V2 => [S] = cte


Los organismos difieren en sus fuentes de energía,
poder reductor, y fuentes de carbono
Las reacciones se organizan en secuencias o caminos
metabólicos
Las enzimas que catalizan secuencias de reacciones
están asociadas entre si espacialmente

A) Compartamentalización
Citosol
Mitocondrias/cloroplastos
Peroxisomas
B) Actividades enzimáticas asociadas espacialmente
mediante interacciones funcionales

Metabolones

Gradient of PEP. The glycolytic hyperstructure containing 56 metabolons was localized to a pole, and the
distribution of PEP and the enzymes were displayed. A freely diffusing enzyme consumed PEP. GlyC is
the number of glycolytic metabolons, other abbreviations as in Fig. 1. Amar et al. BMC Systems Biology
2008 2:27 doi:10.1186/1752-0509-2-27
B) Varias actividades enzimáticas asociadas

Polipéptidos con varias actividades enzimáticas


C) Enzimas de membranas

Schematic of the glycerol metabolic


pathway in E. coli. Protein members of
the glycerol metabolic pathway includes
glycerol facilitator (GlpF/AQP), a member of
the aquaporin family of major intrinsic
proteins. The soluble glycerol kinase (GK)
phosphorylates glycerol to G3P. Another
membrane protein constituent of this
pathway is the transporter for the uptake of
G3P (GlpT) with concomitant exit of Pi.
Oxidation of G3P to DHAP is catalyzed by
the monotopic membrane enzyme, glycerol-
3-phosphate dehydrogenase (GlpD), a
primary dehydrogenase. Concurrent with
oxidation of G3P is reduction of flavin
adenine dinucleotide (FAD) to FADH2, which
passes on electrons to ubiquinone (UQ)
forming the reduced form (UQH2) and
ultimately shuttling electrons to oxygen or
nitrate
Las vías metabólicas muestran acoplamientos funcionales.
Ej: acoplamiento de catabolismo y anabolismo
Los sistemas ATP-ADP median conversiones en dos
direcciones
Las conversiones ¨opuestas¨ están reguladas
cinéticamente. Ej: ppk1/F26BPasa
Las vías metabólicas están reguladas mediante el control de
la actividad enzimática así como de la cantidad de enzima
Selección natural de estrategias regulatorias que:

• 1) Maximizan la eficiencia de las vías.


• 2) Particionan metabolitos en caminos alternativos para
proveer distintos productos finales.
• 3) Emplea el combustible mas conveniente para las
necesidades del organismo.
• 4) Anula caminos biosintéticos cuando se acumulan
productos.
Regulación

• Rápida o “Fina”: actúa a nivel de la actividad enzimática

• Lenta o “Gruesa”: actúa a nivel de la cantidad y localización


de las enzimas
Regulación rápida o “Fina”

• Regulación por disponibilidad de sustrato


• Regulación alostérica
• Inhibición por producto final
• Metabolones
• Modificaciones covalentes
Regulación por disponibilidad de sustrato
Regulación alostérica
Regulación alostérica
Modificación Covalente

• Irreversible
– Activación por rotura proteolítica de precursores inactivos
• Enzimas de la digestión
• Cascada de coagulación
• Activación de caspasas en la apoptosis
Reversible

– Unión covalente de un grupo químico que altera las


Propiedades catalíticas de la enzima
– Fosforilación/desfosforilación
– Oxidación-reducción
– Acetilación-desacetilación
– Adenililaciones
Ejemplo de modificaciones covalentes

Puentes disulfuro
Regulación lenta o “Gruesa”

• Regulación transcripcional
• Estabilidad de los RNAm
• Traducción
• Vida media de las proteínas
• Secuestro
• Asociación con proteínas regulatorias
¿Dónde regular?

• Enzimas claves
• Pasos exergónicos
¿Desde dónde regular?

• Regulación intracelular

• Regulación externa
Regulación intracelular
Regulación externa
Y ahora…
• Lo que se pretende con esta asignatura…

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