Nucleoide Citoplasma

Membrana
Cápsula
celular

Pared
Flagelo Pili celular
 Reino Animalia
Clasificación
tradicional Reino Plantae

Tres Reinos:
Sistema de Haeckel
(1894)
Protistas atípicos
Reino
Protozoa
Protistas
Protophyta
Reino Planta

Reino Animal
Esquema de Dominio Reino Bacteria
Margulis: dos Prokarya
dominios y 5 reinos Reino Protoctista
(1988-1996) Reino Fungi
Dominio
Eukarya Reino Plantae
Reino Animalia

Dominio Subdominio Eubacteria

Cuatro Prokaryota Subdominio Archaebacteria
Subdominios
Dominio
(Mayr 1990) Eukaryota

Subdominio Protista
Subdominio
Reino Metaphyta (Plants)
Metabionta
Reino Fungi
Reino Animalia
 Reino Mychota
Sistema de Copeland: cuatro
Reinos (1956) Reino Protoctista

Reino Plantae

Reino Animalia

Reino Monera

Reino Protista
Whittaker: Cinco
Reinos (1969) Reino Plantae

Reino Fungi

Reino Animalia
Tres Dominios (Woese 1990) Dominio Bacteria
Dominio Archaea
Dominio Eucarya

Cavalier-Smith 1998 Superreino Prokaryota

Reinos Bacteria
Suprareinos y Seis Reinos Superreino Eukaryota
Reino Protozoa
Reino Animalia
Reino Fungi
Reino Plantae
Reino Chromista
La línea verde indica origen bacteriano de los cloroplastos
La línea roja indica origen bacteriano de las mitocondrias
 DOMINIOS: Caracteres que los
definen

BACTERIA ARCHEA EUKARYA

Células procariotas eucariotas
Núcleo con NO SI
Membranas enlazados por enlaces eter, enlazados por
lipídicas éster, ramificado éster,
no ramificados no ramificados

organelas NO SI
ribosomas 70S 80S
La taxonomía es la ciencia de la clasificación, agrupa y separa los
organismos vivos de acuerdo a sus características fenotípicas o
genéticas. Para propósitos de clasificación, los organismos usualmente
son reconocidos en órdenes superiores, familias, géneros, especies y
subespecies.

Es una ciencia ARTIFICIAL, influida por los avances en las

técnicas.

SE DIVIDE
1. CLASIFICACION
2. NOMENCLATURA
3. IDENTIFICACION
“Es la ordenación de los microorganismos en grupos o taxones en
función de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivos”

El objetivo es el de ser ESTABLE, OBJETIVA Y PREDICTIVA

“Es la asignación de un nombres específico a los grupos taxonómicos de
acuerdo a criterios y normas preestablecidas y adminitidas
internacionalmente”
“Es la parte práctica de la taxonomía, dado que permite encuadrar un
determinado organismo en un grupo taxonómico previamente
establecido”
Las distintas categorías taxonómicas se definen por las propiedades y
características que poseen las bacterias que las integran.

Los datos reciben el nombre de caracteres taxonómicos. E incluyen

caracteres fenotípicos, genéticos y quimiotaxonómicos.
 FENOTÍPICOS

• 1) MORFOLÓGICOS
• 2) BIOQUÍMICAS/FISIOLÓGICAS
• 3) SEROLÓGICAS
• 4) FAGOTIPIA
• 5) PRUEBAS DE INHIBICIÓN
 GENÉTICOS

• 1 ) ADN / ARN: contenido de G+C, hibridación

ADN-ADN, secuenciación del ARNr
 QUIMIOTAXONÓMICOS

• 1) MEMBRANA CITOPLASMÁTICA: ácidos grasos,

tipos de lípidos polares, presencia de ácidos
micólicos
• 2) PARED CELULAR: tipos de peptidoglucano,
presencia de ácidos teicoicos
• 3) PROTEÍNAS: comparación perfil proteínas,
secuencia de aminoácidos
T
A
ENFOQUE
X CLÁSICO

O
N TAXONOMÍA
NUMÉRICA
O
M
Í ENFOQUE GENÉTICO O
MOLECULAR
A
 RASGO O CARACTERISTICA
Forma
Tamaño
Morfología de colonia
Características ultraestructurales
Tinción
Mecanismo de motilidad
Inclusiones celulares
Fuentes de carbono y nitrógeno
Constituyentes de pared celular
Fuente de energía
Productos de fermentación
Temperatura óptima de desarrollo y
rango
Tolerancia osmótica
Relación con el oxígeno
pH óptimo y rango
Sensibilidad a inhibidores y
antibióticos
Usa las características bioquímicas, morfológicas y culturales, así como
las susceptibilidad a los antibióticos y compuestos inorgánicos, para
determinar el grado de similitud entre organismos.

Se calcula luego un coeficiente o porcentaje de similitud.

Se construye un dendrograma o matriz de similitudes entre los

organismos.
 Ejemplo de codificación de datos

Estados
Característicos Cepa A Cepa B Cepa C Cepa D
1 + + - 0
2 + + + +
3 + + + -
4 - + 0 0
5 + + + +
6 + + - +
7 + + - 0
8 0 - + +
9 + + + +
10 + + + -
11 + 0 - 0
12 + + + -
 DENDROGRAMA
GRUPO

50 60 70 80 90 100

C freundii 1
Citrobacter

C diversus
2

Escherichia coli
3
GÉNERO Y ESPECIE
 El significado ideal de la identificación y clasificación debe
ser comparar la secuencia de cada secuencia de genes en una
cepa dada, con la secuencia de genes para cada especie conocida.

El método que se usa es la hibridización.

Este método puede ser usado para medir el número de secuencias

de DNA que dos organismos cualesquiera tienen en común y para
estimar el porcentaje de divergencia dentro de las secuencias de DNA
que están relacionadas pero no son idénticas.
• BRINDA UN CONCEPTO MÁS UNIFICADO
DE ESPECIE
• ES MÁS OBJETIVA Y ESTABLE
• SE PUEDEN ORGANIZAR ESQUEMAS DE
IDENTIFICACIÓN FIDEDIGNOS
• INDICA CÓMO EVOLUCIONARON LOS
MICROORGANISMOS Y CÓMO PUEDEN
AGRUPARSE
 ESPECIE

Grupo taxonómico básico

Menos definido que para organismos superiores
Rasgos morfológicos no tan importantes
Puede ser considerada como una colección de cepas que
muestras muchos rasgos en común y difieren
considerablemente de otras cepas
Una CEPA de una especie es considerada como CEPA TIPO
(comparar)
 SUBESPECIE

Basada en variaciones fenotípicas y genotípicas

menores, pero constantes. Es la categoría más baja
aceptada oficialmente
 CATEGORÍAS
INFRASUBESPECIE

Nombre preferido Sinónimo Cepas que tienen

biovar biotipo prop bioquímicas o fisiológicas

especiales

serovar serotipo prop antigénicas distintivas

patovar patotipo prop patogénicas para ciertos

animales

fagovar fagotipo lisis por ciertos fagos

morfovar morfotipo rasgos morfológicos

especiales
 TIPOS DE CLASIFICACIÓN

• 1) FENÉTICAS O FENOTÍPICAS
• 2) FILOGENÉTICAS O FILÉTICAS
Se comparan macromoléculas que se comportan como
“cronómetros evolutivos”.
Sus característcias son:
1. distribución universal
2. realizar la misma función en todos los seres vivos
3. sus secuencias deben permitir la identificación de
regiones de homología y heterogeneidad
4. la tasa de cambio de la secuencia de la
macromolécula debe estar en correlación con la
distancia evolutiva
EL USADO ES EL ARNr, Y DENTRO DE ELLOS EL 16S
A. TINCIÓN: Gram, AAR, Cápsula

B. MÉTODOS BIOQUÍMICOS: actividad enzimática, medios selectivos

C. MÉTODOS SEROLÓGICOS: aglutinación en porta, ELISA, IFI

D. TIPIFICACIÓN POR BACTERIÓFAGOS: altamente específicos (placa)

E. SECUECIACIÓN DE AMINOÁCIDOS

F. PERFIL DE ÁCIDOS GRASOS

G. COMPOSICIÓN DE BASES DEL DNA: % de G+C

H. HIBRIDIZACIÓN DEL DNA

 CULTIVO PURO

MORFOLOGÍA DE COLONIA Y GRAM

CARACTERÍSTICAS DE PROPIEDADES PROPIEDADES

BIOQUÍMICAS
CRECIMIENTO ANTIGÉNICAS

CARACTERÍSTICAS GENÉTICAS O MOLECULARES

PORCENTAJE DE G+C HIBRIDACION ESTABILIDAD TÉRMICA

 DIFICULTADES EN LA
IDENTIFICACIÓN

• Asegurarse que se trabaja con un cultivo PURO

• Trabajar desde categorías mayores a menores
• APLICAR EL SENTIDO COMÚN EN CADA PASO
• Usar el menor número de pruebas
• Comparar el aislamiento con cepas tipo o de
referencia
 DIFICULTADES EN LA
IDENTIFICACIÓN

CUANDO NO SE LOGRA IDENTIFICAR EL

AISLAMIENTO:
• Controlar pureza
• Asegurarse que se han realizado las pruebas
apropiadas
• Controlar que los métodos sean confiables
• Que se han usado correctamente las distintas claves y
tablas
 Diagnóstico Investigaciones
Clínico No microbiológicas

Tomar correctamente
Rotular y embalar adecuadamente
Almacenar y transportar correctamente

No teñidos o
teñidos con Gram u
otra tinción

Característica de colonia,
morfología, hemólisis, pigmento,
etc.

Por difusión en
discos
Serología Tecnologías
o MIC de DNA
 CLASIFICACION DEL DOMINIO BACTERIA (Bergey 2001)

El Manual Bergey categoriza a las bacterias en taxones basados en la secuencia

de ARNr
Por otra parte lista características identificatorias de las bacterias tales como:
morfología celular, coloración de Gram, requerimientos de oxígeno

las bacterias del phylum Proteobacterias son Gram negativas

Alfa Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum crecen

con niveles bajos de nutrientes (oligotróficos), algunos poseen
prostecas (prolongaciones celulares) . Incluye a fijadores de
nitrógeno, quimioautotrofos y quimioheterotrofos

Beta Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum habitan

en el agua y suelo. Algunos son patógenos humanos, incluyen
quimioautotrofos y quimioheterotrofos. Bordetella, Burkholderia,
Neisseria
 Gama Proteobacterias: incluye los ordenes Pseudomonadales,
Legionellales, Vibrionales, Enterobacteriales, Pasteurellales,
Francisella

Delta Proteobacterias: incluye los géneros Myxococcus y

Bdellovibrio, parásitos de otras bacterias y el género Desulfovibrio

Epsilon Proteobacterias: incluye los patógenos humanos

Campylobacter y Helicobacter
 Bacterias Gram negativas No-proteobacterias

Las phyla de bacterias Gram negativas no relacionadas filogeneticamente a

Proteobacteria se clasifican en varios phyla de Gram negativas no
Proteobacterias

1. El phylum Cyanobacteria corresponde a los fotoautotrofos que utilizan la

luz como fuente de energía y CO2 como fuente de carbono y producen
O2 durante la fotosíntesis

2. Los quimioheterotrofos incluyen Chlamydia (phylum Planctomyces),

Bacteroides (phylum Bacteroides), Fusobacterium (phylum
Fusobacteria) y Treponema, Borrelia y Leptospira (phylum Spirochetes).
Muchos de ellos patógenos humanos
 El Manual Bergey divide a las bacterias Gram Positivas de
acuerdo a su contenido de G+C

1. Bacterias Gram Positivas de alto contenido de G+C (phylum Actinobacteria)

incluye el importante género Mycobacterium y los géneros filamentosos
Actinomyces y Streptomyces, formadores de conidiosporas. Los no
formadores Nocardia y Frankia también se incluyen aquí. Corynebacterium,
Propionibacterium

2. Bacterias Gram Positivas de bajo contenido de G+C (phylum Firmicutes)

incluye a las bacterias del suelo, las lácticas y numerosos patógenos. Los
órdenes Clostridiales (Clostridium), Bacillales (Bacillus) Lacobacilalles
(Staphylococcus, Streptococcus, Listeria y Lactobacillus). También incluye a
Micoplasmas (todavía clasificados como Gram negativos), pero como se
tiñen débilmente por su falta de pared, se incluyen entre las bacterias Gram
positivas de bajo contenido de G+C
“El estudio científico de los tipos y diversidad de
organismos y de cualquiera y todas las relaciones
entre ellos " (Simpson, 1961)
 REINOS

Animalia
• 1753 C. Linnaeus 2 Reinos
Plantae

Animalia
• 1800´s E. Haeckel 3 Reinos Plantae
Protista
 REINOS
Animalia
Plantae
• 1969 H.R. Whitaker 5 Reinos Protista
Fungi
Monera

Eukaryotes
• 1977 C. Woese 3 Reinos Archaebacteria
Eubacteria
 REINO Procaryotae
DIVISIÓN I: Gracilicutes
CLASE I: Scotobacteria

CLASE II: Anoxyphotobacteria

CLASE III: Oxyphotobacteria

DIVISIÓN II: Firmicutes

CLASE I: Firmibacteria
CLASE II: Thallobacteria

DIVISIÓN III: Tenericutes

CLASE I: Mollicutes

DIVISIÓN IV: Mendosicutes

CLASE I: Archaobacteria
 REINO REINO

Animalia Procaryotae

Phylum: Cordata Gracilicutes

Clase: Mammalia Scotobacteria

Orden: Primates Spirochaetales

Familia: Hominidae Spirochaetaceae

Género: Homo Treponema

Especie: sapiens pallidum