Transcripción: La síntesis de RNA a partir de DNA

No sólo se refiere a la síntesis de RNA mensajero, sino también

de RNA ribosomal, de transferencia y SNRNA’s.

http://vcell.ndsu.nodak.edu/animations/home.htm
La cadena superior va en dirección 5’ 3’ y se llama cadena Watson mientras que
la cadena inferior va en dirección 3’ 5’ y se denomina cadena Crick, ambas pueden
codificar genes pero se transcriben en direcciones opuestas
La transcripción se lleva
a cabo en tres pasos:

Iniciación
Elongación
Terminación
Ver video iSwiff
La transcripción y la traducción son simultáneas en procariontes
La RNA polimerasa procarionte

s
 Componentes de la RNA polimerasa procarionte

Subunidad tamaño aa tamaño(Kd) gen función

alpha (a) 329 36511 rpoA requerida para el ensamblaje de la enzima;

interacciona con algunas proteínas
regulatorias; involucrada en catálisis

beta (b) 1342 150616 rpoB involucrada en catálisis :iniciación y

elongación de la cadena

beta' (b') 1407 155159 rpoC une al molde de DNA

sigma (s) 613 70263 rpoD dirije la enzima al promotor

omega (w) 91 10237 rpoZ se requiere in vitro para restaurar a la RNA

polimerasa desnaturalizada a su
forma funcional
El promotor es la secuencia
de DNA a la cual se une
la RNA polimerasa para
iniciar la transcripción

En 1975 David Pribnow llevó a

cabo los siguientes experimentos
para determinar la secuencia del
promotor
 Primera región consenso

Sitio de inicio de la transcripción

secuencia promotor
TGCTTCTGACTATAATAGACAGGGTAAAGACCTGATTTTTGA fd
AAGTAACATGCAGTAAGATACAAATCGCTAGGTAACACTATCAG T7 A2 promoter
GTAAACACGGTACGATGTACCACATGAAACGACAGTGAGTCA T7 A3 promoter
ACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG lambda PR promoter
GCTTCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA lacUV5 promoter
TA AT A T bases comunes que
ocurren en al menos
-10 4 de 5 secuencias
Segunda secuencia consenso

Secuencia consenso para promotores

de E. coli

TTGACA ---- 17±1 ---- TATAAT

Región -35 Región -10
El promotor de recA es fuerte:

TTGATA -- 16 -- TATAAT recA

TTGACA -- 17 -- TATAAT consenso

El promotor de araBAD es débil:

CTGACG -- 18 -- TACTGT araBAD

TTGACA -- 17 -- TATAAT consenso

 El promotor procarionte

El factor sigma reconoce las secuencias -35 y -10 del promotor

para el inicio de la transcripción
El factor sigma es esencial para el inicio de la transcripción y determina
el tipo de genes que se transcribirán

factor sigma gen función

s70 rpoD factor sigma principal

s54 rpoN (ntrA, glnF) transcripción de genes regulados por nitrógeno
s32 rpoH transcripción de genes regulados por choque térmico
sS rpoS transcripción de genes en células en fase estacionaria
sF rpoF expresión de los operones del flagelo
sE rpoE involucrado en la respuesta a estrés oxidativo y por
choque térmico; regula la expresión de
proteínas extracitoplásmicas
sFecI fecI regula los genes fec para el transporte de dicitrato férrico
 Factores sigma de E. coli

Factor
Sigma Promotores que Reconoce Promotores Consenso

Región -35 Región -10

s70 la mayoría de los genes TTGACAT TATAAT

s32 Genes inducidos por calor TCTCNCCCTTGAA CCCCATNTA

s28 Genes para movilidad y quimiotaxis CTAAA CCGATAT

s38 Genes para fase estacionaris y estrés ? ?

-24 Region -12 Region

s54 Genes para metabolismo nitrogenado CTGGNA TTGCA
Para la mayoría de los genes

Para genes de nitrógeno

Para genes del flagelo

Iniciación de la transcripción
ELONGACIÓN

Está acoplada a la síntesis de proteínas

(traducción)
Terminación
Terminación independiente de factores proteínicos
Terminación Rho-dependiente
 Transcripción en eucariontes:

No está acoplada a la síntesis de proteínas como en procariotes

La estructura de los promotores es diferente

Existen tres RNA polimerasas que leen distintos tipos de genes:

RNA polimerasa I genes para RNA’s ribosomales

RNA polimerasa II genes para proteínas (RNAm)

RNA polimerasa III genes para RNA’s de transferencia

y SNRNA’s

Las RNA polimerasas no son capaces de iniciar la síntesis de RNA

sin la ayuda de otras proteínas y se diferencian por su sensibilidiad
a distintos compuestos como la a-amantina
RNA pol I
(nucleolo)

RNA pol II
(nucleoplasma)

RNA pol III

(nucleoplasma)
Los promotores para la RNA pol I tienen 2 componentes
Promotores para la RNA polimerasa II
Promotores para la RNA polimerasa III
Complejo transcripcional de la RNA polimerasa II
Iniciación de la transcripción en eucariotes: remodelamiento de la
cromatina

VideoCromatinTranscription
Iniciación de la transcripción
en eucariotes:ensamblaje del
complejo transcripcional
Los promotores eucariontes tienen además otras secuencias río arriba
que son reconocidas por otras proteínas (factores de transcripción)
que determinarán si se ensambla o no el complejo basal de transcripción

Sut2 GLT1
TATA
Gcn4 Abf1

CAAT oct

TATA PolyAT
UGA3
GATA
La complejidad de la regulación de la transcripción en eucariontes
La elongación y terminación son procesos
muy parecidos a los de procariontes.
Procesamiento de RNA:

Capping
Procesamiento de RNA:
Poliadenilación
Video iSwiff
La edición alternativa de intrones puede generar diversidad
de proteínas a partir de un sólo gen