Git Part1 2
Git Part1 2
Sistem Gastrointestinal
dr. Dewi Klarita Furtuna , M.Ked.Klin.,Sp.MK
Departemen Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas
Palangka Raya
2019
Anatomi dan Flora Normal
Bakteri Penyebab Infeksi Gastrointestinal
Penyebab Utama:
1. Bakteri : Enterobacteriaceae
2. Virus
Klasifikasi Enterobacteriaceae
• MAJOR CATEGORY I
(GRAM-NEGATIVE EUBACTERIA THAT HAVE CELL WALLS)
• Lactose Fermenters
• Non-lactose Fermenters
Famili : Enterobacteriacae
Genus :
Lactose fermenters :
• Escherichia
• Klebsiella
• Enterobacter
• Serratia
• Hafnia
Famili : Enterobacteriacae
Genus :
Non-Lactose fermenters :
• Salmonella
• Shigella
• Yersinia
• Proteus
• Morganella
• Providencia
• Citrobacter
Pembagian Enterobacteriaceae :
• Opportunistic Enterobacteriaceae
ENTERIC PATHOGEN : Enterobacteriaceae
Gastrointestinal disease
• Salmonella
• Shigella
• Yersinia
ENTEROBACTERIACEAE
(LACTOSE FERMENTERS)
Escherichia coli
FAMILY : Enterobacteriaceae
GENUS : Escherichia
SPECIES :
Escherichia albertii
Escherichia blattae
Escherichia coli
Escherichia fergusonii
Escherichia hermannii
Escherichia vulneris
MORFOLOGI :
• Spora (-)
• Fimbriae (Pili)
• Ikatan dengan bakteri lain, faga & sel inang
• Transfer materi genetik
SIFAT-SIFAT BIOKIMIA & PERBENIHAN :
• Fakultatif anaerob
• Meragi glukosa asam (mixed acid pathway)
• Reduksi nitrat nitrit
• Oksidase (-)
• Gas (+) : H2 & CO2
• Laktosa (+)
STRUKTUR ANTIGEN :
• O Ag – 164 Epidemiologi
• H Ag – 50
• K Ag – 100
Spesimen :
• Urine
• Cairan tubuh
• Sputum
• Jaringan
• Pus
• Usapan rektal
• Tinja
Transport media :
• Medium Carry-blair
• Medium Stuart
• Medium Amies
• Antimikroba
• Shigella
• Yersinia
• Citrobacter
• Proteus
• Morganella
• Providencia
Salmonella
FAMILY : Enterobacteriaceae
GENUS : Salmonella
SPECIES :
Salmonella Group I strain
Serotype Typhi
Serotype Choleraesuis
Serotype Paratyphi A
Serotype Gallinarum
Serotype Pullorum
Salmonella Group II strain
Salmonella Group IIIa strain
Salmonella Group IIIb strain
Salmonella Group IV strain
Salmonella Group V strain (Salmonella bongori)
Salmonella Group VI strain
Klasifikasi Salmonella
• Kauffman – White
• Species – tipe antigenik
• Bergey (1984)
• 5 subgenus (I, II, III, IV, V)
• Ewing
• Hanya 3 species :
• Salmonella choleraesuis
• Salmonella typhi
• Salmonella enteritidis
• Studi Genetika
• Salmonella enterica = Genus Salmonella + Arizona
• Studi Hibridisasi DNA
• Salmonella subgroup ……….. Subspecies …………
MAJOR CATEGORY I
(GRAM-NEGATIVE EUBACTERIA THAT HAVE CELL WALLS)
• Indol Ө, VP Ө, MR , Urea Ө
• Simmon’s Citrate , kecuali :
• Salmonella serovar Choleraesuis
• Salmonella serovar Gallinarum
• Salmonella serovar Paratyphi A
• Salmonella serovar Pullorum
• Salmonella serovar Typhi
• Lysine decarboxylase , kecuali :
• Salmonella serovar Paratyphi A
• 2 GRUP :
• TYPHOID SALMONELLA
• NONTYPHOID SALMONELLA
Daya tahan :
• Toleransi terhadap empedu relatif besar media isolasi
• Brilliant green
• Sodium tetrathionate
• Sodium dioxycholate
• Endotoksin
• Bertanggung jawab atas terjadinya panas – stadium bakteremia
• Enterotoksin
• Serupa labile toxin dan stable toxin dari Escherichia coli
• Cytotoxin
• Mungkin penting dalam invasi seluler
Patogenitas :
• Diperankan oleh :
• Surface antigen – Vi Ag Salmonella serovar Typhi
• Endotoksin
• Enterotoksin
• Kemampuan mengadakan invasi
• Perforasi usus
• Perdarahan hebat
• Thrombophlebitis
• Cholecystitis
• Pneumonia
• Abscess
Sepsis
• Terutama : Salmonella serovar Choleraesuis
• Dapat oleh Salmonella serovar lainnya
• Infeksi oral invasi melalui aliran darah lesi fokal pada organ-organ
• Paru : Pneumonia, Pulmonary abscess
• Tulang : Osteomyelitis
• Meningen : Meningitis
• Jantung : Endocarditis
• dll.
• Gejala : lama, demam, menggigil, anorexia, anemia dan lesi fokal, GE
seringkali absen
Biakan darah
Gastroenteritis - Enterokolitis
• Salmonella serovar Typhimurium
• Sembuh sendiri
• NONTYPHOID SALMONELLA
• KULTUR TINJA
• DETERMINASI PARAMETER EPIDEMIOLOGIK (GEJALA DAN
MASA INKUBASI)
• ISOLASI DARI FOOD VEHICLE YANG DICURIGAI
• KULTUR DARAH - SEPSIS
• TYPHOID SALMONELLA
• KULTUR DARAH, TINJA ATAU URIN
• OBSERVASI KLINIS : RASH YANG KHAS PADA ABDOMEN
PASIEN (ROSE SPOT)
Diagnosis Laboratorium
Bahan pemeriksaan
• Darah : (+) pada minggu I – Demam enterik dan sepsis
• PCR
• DNA probe
• Serologi
Serologi
O-agglutination H-agglutination
Pengobatan
• Tanpa antibiotik
• Obat-obatan suportif
• Sulfamethoxazole-Trimethoprim
• Chloramphenicol
• Ampicillin
• Quinolone
• Chronic Salmonella serovar Typhi carriers :
• Carrier :
• Tidak boleh berperan sebagai food handler
• Diawasi kebersihannya
• Cholecystectomy
• Ampicillin
• Vaksinasi
Typhoid Mary
• Mary Mallon, the cook who became
known as Typhoid Mary, due to her
alarming tendency to spread typhoid
fever via the kitchens of 1904 New York
City. When she was first suspected to
be the cause of the outbreak, she
disappeared, becoming the subject of
an intense pursuit. Once caught, she
escaped, thus beginning the chase
anew ……
Epidemiologi
A. Sumber Infeksi
Makanan / minuman terkontaminasi Salmonella
1. Air
2. Susu dan produk sehari-hari (ice cream, cheese, custard)
3. Shellfish
4. Dried or frozen eggs
5. Daging dan produk daging
6. Recreational drugs
7. Animal dyes
8. Household pets : turtles, dogs, cats
B. Asal dari kontaminasi
C. Carirers
- Kandung empedu
- Saluran empedu
- Jarang : usus & traktus urinarius
RESERVOIR DAN TRANSMISI :
NONTYPHOID SALMONELLA1
• Salmonella gastroenteritis = Salmonella food
poisoning
• Transmisi :
• Makanan
• Ingesti air terkontaminasi tinja
• Tipikal : penanganan makanan yang kurang tepat –
makanan yang kurang sempurna memasaknya
• Resiko : pasien dengan asam lambung yang rendah
atau tidak ada (hipokhlorhidria)
NONTYPHOID SALMONELLA2
• Reservoir zoonotik :
• Poultry
• Poultry products (telur)
• Susu pasteurisasi yang kurang tepat
• Hewan peliharaan : kura, anjing, kucing
• Dosis infeksius : >106
• Penyebaran juga dari orang ke orang melalui rute fekal-oral
• Carrier
A recent Salmonella in
peanut butter outbreak
(Late 2008 through 2009)
Shigella
FAMILY : ENTEROBACTERIACEAE
GENUS : SHIGELLA
SPECIES :
SHIGELLA DYSENTERIAE - SEROGROUP A
SHIGELLA FLEXNERI - SEROGROUP B
SHIGELLA BOYDII - SEROGROUP C
SHIGELLA SONNEI - SEROGROUP D
SHIGELLA SPECIES :
- Dapat didiferensiasi berdasarkan antigen O dan reaksi
biokimia
- Penyebab penyakit gastrointestinal = disentri basiler =
SHIGELLOSIS
- BERAT RINGAN PENYAKIT
- EPIDEMIOLOGI
MORFOLOGI & IDENTIFIKASI
• TIDAK BERGERAK
• TIDAK BERSPORA
• BM. 70.000 :
• 1 SUBUNIT A – 32.000 BM
• 5 SUBUNIT B – 6. 500 BM
FAKTOR-FAKTOR VIRULENSI
• ENDOTOKSIN
• LPS – BERPERAN PADA INFLAMASI USUS
• PROTEIN Ipa
• MEDIASI INVASI
• PROTEIN Mxi-Spa
• TERLIBAT DALAM SEKRESI DARI PROTEIN Ipa
• MUNGKIN TERLIBAT PADA PERLEKATAN DARI SHIGELLA PADA SEL
HOSPES
• PROTEINS IcsA DAN IcsB
• TERLIBAT DALAM PENYEBARAN INTERSELULER DARI SHIGELLA
• SHIGA TOXIN
• HANYA OLEH Shigella dysenteriae
• BERPERAN DENGAN MENGHAMBAT SINTESA PROTEIN SEL HOSPES –
SEBUAH EFEK YANG MENYUMBANG PERKEMBANGAN KERUSAKAN
MUKOSA KOLON SELAMA SHIGELLOSIS
KLINIS
• MASA TUNAS : 1 – 3 HARI
• KAKU PERUT / CRAMPS, DEMAM, MENGGIGIL,
KEJANG, TENESMUS, TINJA CAIR, LENDIR & DARAH
• ORANG SEHAT : 2 – 7 HARI SEMBUH
• INDIVIDU MUDA / TUA / MALNUTRISI LEBIH LAMA
• KEMATIAN :
• DEHIDRASI & KETIDAK SEIMBANGAN ELEKTROLIT
• SHIGELLA DYSENTERIAE
DISENTERI
• SPESIMEN :
• TINJA
• USAP REKTAL - SIGMOIDOSCOPY
• PEMERIKSAAN MIKROSKOPIK
• ADANYA JUMLAH LEKOSIT YANG
MENINGKAT
DIAGNOSIS LABORATORIUM
• KULTUR
• DIAGNOSIS SPESIFIK
• IDENTIFIKASI DARI ISOLAT DENGAN UJI
BIOKIMIA DAN SEROLOGI
• SEGERA :
• MEDIA ISOLASI
• MEDIUM TRANSPOR BUFFER
KULTUR
• Dapat tumbuh pada
• simple media
• nutrient agar
KULTUR
• enriched media
• blood agar
• Koloni : konveks sirkuler
transparan dengan tepi
intak
• Ukuran : 1-2 mm
colonial morphology displayed by Gram-negative Shigella
bacteria on a blood agar plate (BAP).
KULTUR
• media selektif
• MacConkey’s agar
• NON lactose fermenting
colonies
• MacConkey agar : koloni
colorless
Desoxycholate Citrate Agar
• REHIDRASI
• ANTIBIOTIK
• AMPICILLIN / AMOXYCILLIN
• TRIMETHOPRIM – SULFAMETHOXAZOLE
MENGURANGI DERAJAT BERATNYA PENYAKIT DAN DURASI
DARI GEJALA SHIGELLOSIS
• PERAWATAN SUPORTIF
• PENGGANTIAN CAIRAN
• OBAT ANTISPASMODIK
• MISAL : LOMOTIL
• KONTRAINDIKASI UNTUK SHIGELLOSIS DAN
DIARE INVASIF LAINNYA – CENDERUNG
UNTUK MENIMBULKAN EKSASERBASI
GEJALA
EPIDEMIOLOGI
• Coronaviruses
• Parvoviruses
• Pestiviruses
• Toroviruses
Mechanism of diarrhea
• Watery diarrhea due to net secretion of intestinal fluid
• Prevention-
Handwashing and disinfection of surfaces
Terima Kasih